XLOC_034674 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_034674
Unique NameXLOC_034674
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000007_pilon:3329498..3335823-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034674 ID=XLOC_034674|Name=XLOC_034674|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6326bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:3329498..3335823- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAGTACCAATTCCAGTATCAAGTCGAGAAGCTGTTCTCAGAGTTCT ACGCTCAATATCTGCTACGGGGTATGACCATTATACATTTTGTTGCTTTA TCTCTGCATGTAAGCTTTGTAGATTAAGATATAAGAAATAACGATATTTT ATAATTTTCAATGTTTTTCTGTCTAAGATTGTCTCTGTTTAACAGCTGCG GTTGGCTTAAGTAAATCAATTTTTGTCCGAGACAAAAACTTTGCTTTGAT ACTTTTTATAAATAGTACAATAAAGCTGAATAGACCTAAGAATAGGCCTA AAATTAATGTTCTTCTTTTTATTAAAAATAGATGTCAATGTCCAGCACAT TCCCAAAGTTTTTCTGGATCACCAGTTCATAAATGTTCGGCACATGCTTC AAATGATGTCGAATATGCTGTTGAAGTAAGAATTATTCTACCCCACAGCT TGATGTCTAAAGGGATGGGACAGAGCACCTACTTTGATGGGATTTAATTT TTGCAGGGATTAAATTTTACAGTTTAGCTCATCTGCAAAATTTTAAGATT TTGCGGAGACTTAATTTCGCAGATGATGTCTATTATGAGATAATATTTTC ATGACTTCGTGCTTTATTTGCAATTTACTGCCAAACTATGCATTTTGGTT GTGAAATACACATTATTAGGGCTTCTTTGATGGCGATAAACATGTTAAAA GTGGTCTTTTGTCAATTTTGGAATTTAATTCAGAAAACTGGATAAGACCT TTTCAAATTGCTATTGGGACTTATTTTTGCGGGTAATAACCAAATCTGCG AAGTCCACAAAATTTAATCCCCAAGAAAGATAACTCCATTAAAGTAACTA ACCATAGTATTTGTTTGCCTACTGAAAAATTGATGAAATTCTGTTGGTTT AAACTTGACATGGCAAAGAATTTGTTTGATTCATTCTTCTTTTTTTGTTT TTTGTTGATTTTGTTTCGTTTTTTTCTCTAATTTTTTGCACGCCTGCTCA GTCTTGTGTGTAGGCTCATACAGTTCCACCCCTGATATCCATAGCAGGAA AAAACTTTTCCCCCATACAATGTTGAAAACAGCTCATTAATTATTAAGCT CAGTCAAATAAAATTGATATTATTTTAATAATTATATTAATTCAATAGAT GGCTGCTTCCAATGTGAGATATGGAAATGGTGTTACTGCTGAAGTTGGAA TGGTATGAAGTTGTTGTTTTTTTATTAAAAGTCTTTCTTCTATCAAGTTA TTTGTATGTTTTGGGGGCACTCCAGGAGACTCAAAAGTCAAATATTTCTA AAGCCCAAGTTTTTGACTCTGAAATAAACAAAATTTATTCCTTCTCTTCT TCGAAAAAACTCATTGACCTGCTGTTATAAATGGTGATTTGTTTTTCTTA TTATTTTATCTTCTATGTTTCTTCATCAGGATTTAGCAAATATGAAAGCA CAGAAAGTCGGTGTTTTCACAGATAAAAATGTGAGTATTATTTTTCTTTG GTAATGGAAAGTAGATTAAAAAGTTTTTATTAGAATCATGATTACATGAC CATTGAAAAAACATTGCTTTTTCTTGGTGCTGATTTTTGTTTTGAATACG CTAATTGAATCCTGGAAAGTACTTTTTTCAAATTAACTCTTTCAGCTTGC AAAGCTTCCTCCTGTCCTTGAGACGATTAAATCATTAGAAAGAAGCGGAA TCAACTTCTCGGTTTTCGACGATGTCAGGATTGAACCAACTGATGCAAGG TGTGGAATTTGAATGATCTCTAGAATGTCATTAGTTAACTCCAAGAGTTA ACACTTTTTTGCTGGACAAGGTGTTTATTCTAGCCTCTGAACTAATTTTT GTAATTTTTCAAGGAAATACTTCAATTCTTACATATTATATACCTTTGAA AAGATAATTCCAAACACTATAATTTTGTTAAGAAAAATAAAAGGACTTTA AAATCATATTTGATTTTTGATAGAAGAATCGAGACAGTGCTTTCTTTTTC AGTTTCCAAAAAGCTATCAACTATGCAAGAGCAGAGAATTTTGATCATTT TGTTGCAGTCGGTGGTGGGTCAGTAATTGATACAGCGAAAGCAGCAAATC TGTATTTGTGTCATCCAGAGAATGAGTTATTGGATTTTGTTAATGCTCCC ATTGGCAAGGGACTTCCCATCAAGAAGGCTTTGAAACCATTAATTGCTAG TATGTCTGTTCGTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGTATCCACTATGATTAGAA GTCCTCTTTGTATTGGTATGACTGTTTAAATATGGGTTAGCTGACTGACT TTTTAAAAGAAACTACGAGTTGCAGAGAAATTAACCCTTAGACCACGAGG GACGTGTATATGCGTCCAAAACAAGCCAAAAGTCTCAGACTTGAGGCCAT AGCTCCTGACCATATAATTCAAAGGGGCATAAAACGAATGTTTTTAGAAA GAATATAAAAATAGCTTTCCAATGGTACCAAAACCATCTTTTAATTAAAA GCTACAAGCTTTTATGGCACTTTAAAGTTTTGAGTTCCAAAAAACAAATT TAGAAAAAATGTTTAACTTTTTCAACAAAAAAACAGCGCGCACAAAGGGT TAACAAAAAAGAAAATTTGATTTTGTGTTTTATGATTTCATTTACTTTCA GAACTTCATCAGAATAATCAGATGAGTATTTTTGCATTTGAATTTCTATT TTTGTCTTTTTCTAGTTCCTACAACTGCTGGAACAGGTAGTGAAACAACT GGTGTTGCCGTTTTTGATTACACTCCATTACAAGCTAAGACTGGTAAGAG TTCAGCTCTTTGGTCAAATTAATTAATAACGAAAATTAGAATTTGTTTTA GTTACCTTATTACACTTATAACTACTCAAGTTATTAACGCAAATTGGTTA CACTACTAATTTATACTGCTTGATTAGTTATGGAAGTGTAATAAGGTCAT TGGGAATTTTCAAGTGGTTAAATCTTCTTTCTCAAAACTTTGGCAATGAA TGATACAGTCAAATGGGGAAAAATGAAACAGACTTATTGTATTTTGATTT TTGTTTCAGGTATTGGAAACCGTGCCATCAGACCAGTCCTTGGTATTGTG GATCCTTTACATACATTACACATGCCAAAACATGTCACTGCTTACAGTGG TCTCGATGTTTTCTGGTAAGTCCCTGTATATAATGTAGCTTAAATATACA AAATCCAAAAACAGACTCAGAGATGCTTAGGTTGAGGGCTTAACAGGCTG AAAAATGCTTAAAGGATGCTCATTTCCTAAAAGAACTTTTGGAGCATGCT TACAAAGTGATGGCTTGTCATATGCTTAAATTTGCTTAGGACATAGTGTC CTTCAGGGTCTCTTCCCCCCCCCATGCCTAGAATGAAAATTTTCCATTCC CCCCCCCCTCATTTTTCCCCACCCTGCCTCCAAAAATTTTTCTGTCCCCC CCCCTCAAGCATAAAATTAAAAAGCTGTAATTTGATGAACTTAACGCTTA TTGTTTTCCCTAAGGTAGTTCTAATTCAAGAATATATGGAAAGGATGGTT GTTTTTAAACCATAATATTAATAAAACTAAGCATTATGCTATATCATCTC ATAAAACCAGATGTTTTTCAATTTTGAATTGATTTTGGCGAGTTCCCCCC CCATGCCTGGAATGAAAATTTTCCATTCCCCCCTCCCTCGTTTTCCCCCC CCTGGCTTCAAAAAAAATTCTTTCCCCCCTATACGTCCTTTTGACCTCAA AACCCATTCCCCCCCTGAATCCAGGGGGGGAGGACACTATGTAGGATTCT TGGCTTAGTTTTAACAAACGAAATTGGGAAAAGAGGTAAAGCTTCACAAA AAAGTGTACTGAAAAAACAAAAAGTACAACAAAGTAACTTTTGTATTTTT TTGTAGGATCGACGTATCAATGCATAGCATGCTTAAATTCTTCCCATCTT TGAGACTAGATATAAGTGCAATGCTTATGAATAAAAAACATCTACTGAAA AAGATCATTCTTAAAATTATTGAATCGGAAGTATCAAAAAAAACATTCAG CGCCAGGCTTCATATTATTTCAAATGATTATTTTTGCTGTTTAAGTGAGG AAGTTGAAATTTACATTTTAATTTATTTATATGTTGATCTGAAATGTAAG CTCAATTTCAACTCTTATTCTAAATATTAAAACATAATTTCCTTTTAGTC ATGCTCTTGAATCCTACACAGCGATCCCATACAACCAAAGAAGCCCGCGA CCAACAAATCCTATCTTGAGACCTGCCTACCAAGGAAGTAATCCCATCAG TGATGTGTGGTCTAAATACGCTTTCAAAGTAACTGCAAAATATCTCAAGA GGTGTGTACCAATTTGATATTTTTTGGATACTAAGTAATTAGTGAGAGAA AATTTTAATCCCTCTATCAATTCTCAAGTTGAGCTTGAATCTGACAACGT GTGTCTGTCTGTGTGTCACAAAAACTTTAGGGCAGCCTGGAGACAGAATT TGCGGAAATTTTGCGCACCTGTTCCTTGGGTTAATATCCGAGGGTGCTTT TTTCATTTTTTCTTTTCCTTAGGATCTCAGGATTTAAAAGCTCAAATTTG CTCCAATTAGGCTGGGAATATAGCCTAGAAGCCAACGGACCGCTCCAAAA TCGAAATATTCAATGAAAGAAAGTGGAAGTGCTAAAATAGCAATTCTCGC CCAAACTTTAAAATCTGGAAAAGGTTAAAATACTAAAATCTAAAATATAT TTCGACCATGATTGTAGATAAAACATACACTAAGTGTGAGTTTATTCCAA TTTTGCTCTCAATACCTTAATTTTCATCAAGCTGCGGTAACATTATTGAT TTATCTAATTCTATTTTAGAGCCATGGAAAGCCCAGATGATGTCGAAGCA AGGTCAGAAATGCATTTAGCAAGTGTCTTTGCCGGTATTGGGTTTGGAAA TGCTGGCGTTCATTTATGGTAGGCTATTTTATTCTTTGAAAGAGACTGAA ATTATGAGCTAGCATTTTATCTACATTTAGAAATAAAAACTGCCATAAAG AAAATTTTGAAAAAAGTATGTGTTGTTATTTACACAATTTCACTTCATCT CAATTTGGTTGTTATTTGCTTTTCTAAGAATGTTTTTTTGTCTTACAGCC ATGGATTGTCATATGCACTTTCTGGAAACATCAAGAATAAAACTTACAAA GCAAAAGATTATGATGTCGACTATCCTTTGTTGGTAAGGAAATGGACATT AAAGAGATAATTAGATGGTTTGTAATATTTGGCATGTGGGATCCTTCTAT TGTCCTGAGCAAAATCGCAAATTATTTTTGCCTGACTATTTTTCAAAGTC GAGATATTTAAGTTGCAAGTTTTTGGCTTTTAGGATTAAAACAATAGAAT TTCAAGAAAGAACCGTGTAAGAACCCATATCTCGATTTTGGAAAATTGTT GCACAAAAATACTTCGAGATTTTACCAAGGGCCACAAAAGTTTTCTGTTA ATCTAAATATCTCAAACCATCTGATTATCCCTTTAAATCAAATTCAAATG TCCAAATCATGTTTACTATTGACTTTGCCATACTTATGGAATAATGTTCA TCAAACTAAGGAAATGCATCTGGATAATTTATTTCTTTGTGTATTAAATG CTTTTTTGAGAATTTTAAATGATTTAATTATTTTTACTATTTTAGCCACA TGGTCTTTCAGTTATTATCACAGCACCTGCTGTTTTTAACTTCACTGCCC CTTCAAATCCTGAACGTCATCTTGAATGTGCTGAAATCCTTGGTGAGATT TTTTTTTTATTTTGAGTTATTTGGAATGGCTACATATTGATTAGAGCAGC ACTACTATAATATAGGCCAATCTTAAGACAAAGTAATGCAAAAATTTCAA ACAATTTATGGTAAAGCCTGCTCACCATTAAAAATAGCTTGAAACAAAAC TAAAGTAATTCCTGAAATATTTTGTAACCTTGATTATGAGGATAGAATAT TAAAAATACAGGGGTTGCATTTGGATATTGGTAAATCTGTAAACTTTTTG CTATTTATTTTATTTATTTTAAACTTTTTAGGAGCTGATATCACCAATGC TAGGAAAGAAGATGCCGGCCCAATCCTTGCTGATGCAATCCGTAAATTCA TGGATGGTCTTGGTATTGACGACGGTATCTCCGCCTTTGGTTACACCTCT GAGGATATCCCTAAACTTGTAGAGGGTACCTTGCCACAACACAGAGTCAC AAAACTTGCTCCTGACGGTGAGCCAACAGCAGAGGAGTATGCTATGATCT ATGAGCAGTCCATGAAAATTTATTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:3329498..3335823-

>XLOC_034674 ID=XLOC_034674|Name=XLOC_034674|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2868bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:3329498..3335823- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAGTACCAATTCCAGTATCAAGTCGAGAAGCTGTTCTCAGAGTTCT
ACGCTCAATATCTGCTACGGGATGAGAGTACCAATTCCAGTATCAAGTCG
AGAAGCTGTTCTCAGAGTTCTACGCTCAATATCTGCTACGGGATGTCAAT
GTCCAGCACATTCCCAAAGTTTTTCTGGATCACCAGTTCATAAATGTTCG
GCACATGCTTCAAATGATGTCGAATATGCTGTTGAAATGTCAATGTCCAG
CACATTCCCAAAGTTTTTCTGGATCACCAGTTCATAAATGTTCGGCACAT
GCTTCAAATGATGTCGAATATGCTGTTGAAATGGCTGCTTCCAATGTGAG
ATATGGAAATGGTGTTACTGCTGAAGTTGGAATGATGGCTGCTTCCAATG
TGAGATATGGAAATGGTGTTACTGCTGAAGTTGGAATGGATTTAGCAAAT
ATGAAAGCACAGAAAGTCGGTGTTTTCACAGATAAAAATGATTTAGCAAA
TATGAAAGCACAGAAAGTCGGTGTTTTCACAGATAAAAATCTTGCAAAGC
TTCCTCCTGTCCTTGAGACGATTAAATCATTAGAAAGAAGCGGAATCAAC
TTCTCGGTTTTCGACGATGTCAGGATTGAACCAACTGATGCAAGCTTGCA
AAGCTTCCTCCTGTCCTTGAGACGATTAAATCATTAGAAAGAAGCGGAAT
CAACTTCTCGGTTTTCGACGATGTCAGGATTGAACCAACTGATGCAAGTT
TCCAAAAAGCTATCAACTATGCAAGAGCAGAGAATTTTGATCATTTTGTT
GCAGTCGGTGGTGGGTCAGTAATTGATACAGCGAAAGCAGCAAATCTGTA
TTTGTGTCATCCAGAGAATGAGTTATTGGATTTTGTTAATGCTCCCATTG
GCAAGGGACTTCCCATCAAGAAGGCTTTGAAACCATTAATTGCTATTTCC
AAAAAGCTATCAACTATGCAAGAGCAGAGAATTTTGATCATTTTGTTGCA
GTCGGTGGTGGGTCAGTAATTGATACAGCGAAAGCAGCAAATCTGTATTT
GTGTCATCCAGAGAATGAGTTATTGGATTTTGTTAATGCTCCCATTGGCA
AGGGACTTCCCATCAAGAAGGCTTTGAAACCATTAATTGCTATTCCTACA
ACTGCTGGAACAGGTAGTGAAACAACTGGTGTTGCCGTTTTTGATTACAC
TCCATTACAAGCTAAGACTGTTCCTACAACTGCTGGAACAGGTAGTGAAA
CAACTGGTGTTGCCGTTTTTGATTACACTCCATTACAAGCTAAGACTGGT
ATTGGAAACCGTGCCATCAGACCAGTCCTTGGTATTGTGGATCCTTTACA
TACATTACACATGCCAAAACATGTCACTGCTTACAGTGGTCTCGATGTTT
TCTGGTATTGGAAACCGTGCCATCAGACCAGTCCTTGGTATTGTGGATCC
TTTACATACATTACACATGCCAAAACATGTCACTGCTTACAGTGGTCTCG
ATGTTTTCTGTCATGCTCTTGAATCCTACACAGCGATCCCATACAACCAA
AGAAGCCCGCGACCAACAAATCCTATCTTGAGACCTGCCTACCAAGGAAG
TAATCCCATCAGTGATGTGTGGTCTAAATACGCTTTCAAAGTAACTGCAA
AATATCTCAAGAGTCATGCTCTTGAATCCTACACAGCGATCCCATACAAC
CAAAGAAGCCCGCGACCAACAAATCCTATCTTGAGACCTGCCTACCAAGG
AAGTAATCCCATCAGTGATGTGTGGTCTAAATACGCTTTCAAAGTAACTG
CAAAATATCTCAAGAGAGCCATGGAAAGCCCAGATGATGTCGAAGCAAGG
TCAGAAATGCATTTAGCAAGTGTCTTTGCCGGTATTGGGTTTGGAAATGC
TGGCGTTCATTTATGAGCCATGGAAAGCCCAGATGATGTCGAAGCAAGGT
CAGAAATGCATTTAGCAAGTGTCTTTGCCGGTATTGGGTTTGGAAATGCT
GGCGTTCATTTATGCCATGGATTGTCATATGCACTTTCTGGAAACATCAA
GAATAAAACTTACAAAGCAAAAGATTATGATGTCGACTATCCTTTGTTGC
CATGGATTGTCATATGCACTTTCTGGAAACATCAAGAATAAAACTTACAA
AGCAAAAGATTATGATGTCGACTATCCTTTGTTGCCACATGGTCTTTCAG
TTATTATCACAGCACCTGCTGTTTTTAACTTCACTGCCCCTTCAAATCCT
GAACGTCATCTTGAATGTGCTGAAATCCTTGCCACATGGTCTTTCAGTTA
TTATCACAGCACCTGCTGTTTTTAACTTCACTGCCCCTTCAAATCCTGAA
CGTCATCTTGAATGTGCTGAAATCCTTGGAGCTGATATCACCAATGCTAG
GAAAGAAGATGCCGGCCCAATCCTTGCTGATGCAATCCGTAAATTCATGG
ATGGTCTTGGTATTGACGACGGTATCTCCGCCTTTGGTTACACCTCTGAG
GATATCCCTAAACTTGTAGAGGGTACCTTGCCACAACACAGAGTCACAAA
ACTTGCTCCTGACGGTGAGCCAACAGCAGAGGAGTATGCTATGATCTATG
AGCAGTCCATGAAAATTTATTAAGAGCTGATATCACCAATGCTAGGAAAG
AAGATGCCGGCCCAATCCTTGCTGATGCAATCCGTAAATTCATGGATGGT
CTTGGTATTGACGACGGTATCTCCGCCTTTGGTTACACCTCTGAGGATAT
CCCTAAACTTGTAGAGGGTACCTTGCCACAACACAGAGTCACAAAACTTG
CTCCTGACGGTGAGCCAACAGCAGAGGAGTATGCTATGATCTATGAGCAG
TCCATGAAAATTTATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_034674XLOC_034674-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000007_pilongenomesc0000007_pilon:3329498..3335823 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1192-1434:244
Aaloc1093-1188:632
Aaloc1009-1092:1178
Aaloc910-1005:1457
Aaloc757-906:2128
Aaloc652-753:3266
Aaloc574-648:3610
Aaloc376-570:4324
Aaloc271-372:4682
Aaloc220-270:4898
Aaloc166-219:5179
Aaloc73-165:5995
Aaloc1-69:6327