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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000007_pilon:3329498..3335823- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034674 ID=XLOC_034674|Name=XLOC_034674|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6326bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:3329498..3335823- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAGAGTACCAATTCCAGTATCAAGTCGAGAAGCTGTTCTCAGAGTTCT
ACGCTCAATATCTGCTACGGGGTATGACCATTATACATTTTGTTGCTTTA
TCTCTGCATGTAAGCTTTGTAGATTAAGATATAAGAAATAACGATATTTT
ATAATTTTCAATGTTTTTCTGTCTAAGATTGTCTCTGTTTAACAGCTGCG
GTTGGCTTAAGTAAATCAATTTTTGTCCGAGACAAAAACTTTGCTTTGAT
ACTTTTTATAAATAGTACAATAAAGCTGAATAGACCTAAGAATAGGCCTA
AAATTAATGTTCTTCTTTTTATTAAAAATAGATGTCAATGTCCAGCACAT
TCCCAAAGTTTTTCTGGATCACCAGTTCATAAATGTTCGGCACATGCTTC
AAATGATGTCGAATATGCTGTTGAAGTAAGAATTATTCTACCCCACAGCT
TGATGTCTAAAGGGATGGGACAGAGCACCTACTTTGATGGGATTTAATTT
TTGCAGGGATTAAATTTTACAGTTTAGCTCATCTGCAAAATTTTAAGATT
TTGCGGAGACTTAATTTCGCAGATGATGTCTATTATGAGATAATATTTTC
ATGACTTCGTGCTTTATTTGCAATTTACTGCCAAACTATGCATTTTGGTT
GTGAAATACACATTATTAGGGCTTCTTTGATGGCGATAAACATGTTAAAA
GTGGTCTTTTGTCAATTTTGGAATTTAATTCAGAAAACTGGATAAGACCT
TTTCAAATTGCTATTGGGACTTATTTTTGCGGGTAATAACCAAATCTGCG
AAGTCCACAAAATTTAATCCCCAAGAAAGATAACTCCATTAAAGTAACTA
ACCATAGTATTTGTTTGCCTACTGAAAAATTGATGAAATTCTGTTGGTTT
AAACTTGACATGGCAAAGAATTTGTTTGATTCATTCTTCTTTTTTTGTTT
TTTGTTGATTTTGTTTCGTTTTTTTCTCTAATTTTTTGCACGCCTGCTCA
GTCTTGTGTGTAGGCTCATACAGTTCCACCCCTGATATCCATAGCAGGAA
AAAACTTTTCCCCCATACAATGTTGAAAACAGCTCATTAATTATTAAGCT
CAGTCAAATAAAATTGATATTATTTTAATAATTATATTAATTCAATAGAT
GGCTGCTTCCAATGTGAGATATGGAAATGGTGTTACTGCTGAAGTTGGAA
TGGTATGAAGTTGTTGTTTTTTTATTAAAAGTCTTTCTTCTATCAAGTTA
TTTGTATGTTTTGGGGGCACTCCAGGAGACTCAAAAGTCAAATATTTCTA
AAGCCCAAGTTTTTGACTCTGAAATAAACAAAATTTATTCCTTCTCTTCT
TCGAAAAAACTCATTGACCTGCTGTTATAAATGGTGATTTGTTTTTCTTA
TTATTTTATCTTCTATGTTTCTTCATCAGGATTTAGCAAATATGAAAGCA
CAGAAAGTCGGTGTTTTCACAGATAAAAATGTGAGTATTATTTTTCTTTG
GTAATGGAAAGTAGATTAAAAAGTTTTTATTAGAATCATGATTACATGAC
CATTGAAAAAACATTGCTTTTTCTTGGTGCTGATTTTTGTTTTGAATACG
CTAATTGAATCCTGGAAAGTACTTTTTTCAAATTAACTCTTTCAGCTTGC
AAAGCTTCCTCCTGTCCTTGAGACGATTAAATCATTAGAAAGAAGCGGAA
TCAACTTCTCGGTTTTCGACGATGTCAGGATTGAACCAACTGATGCAAGG
TGTGGAATTTGAATGATCTCTAGAATGTCATTAGTTAACTCCAAGAGTTA
ACACTTTTTTGCTGGACAAGGTGTTTATTCTAGCCTCTGAACTAATTTTT
GTAATTTTTCAAGGAAATACTTCAATTCTTACATATTATATACCTTTGAA
AAGATAATTCCAAACACTATAATTTTGTTAAGAAAAATAAAAGGACTTTA
AAATCATATTTGATTTTTGATAGAAGAATCGAGACAGTGCTTTCTTTTTC
AGTTTCCAAAAAGCTATCAACTATGCAAGAGCAGAGAATTTTGATCATTT
TGTTGCAGTCGGTGGTGGGTCAGTAATTGATACAGCGAAAGCAGCAAATC
TGTATTTGTGTCATCCAGAGAATGAGTTATTGGATTTTGTTAATGCTCCC
ATTGGCAAGGGACTTCCCATCAAGAAGGCTTTGAAACCATTAATTGCTAG
TATGTCTGTTCGTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGTATCCACTATGATTAGAA
GTCCTCTTTGTATTGGTATGACTGTTTAAATATGGGTTAGCTGACTGACT
TTTTAAAAGAAACTACGAGTTGCAGAGAAATTAACCCTTAGACCACGAGG
GACGTGTATATGCGTCCAAAACAAGCCAAAAGTCTCAGACTTGAGGCCAT
AGCTCCTGACCATATAATTCAAAGGGGCATAAAACGAATGTTTTTAGAAA
GAATATAAAAATAGCTTTCCAATGGTACCAAAACCATCTTTTAATTAAAA
GCTACAAGCTTTTATGGCACTTTAAAGTTTTGAGTTCCAAAAAACAAATT
TAGAAAAAATGTTTAACTTTTTCAACAAAAAAACAGCGCGCACAAAGGGT
TAACAAAAAAGAAAATTTGATTTTGTGTTTTATGATTTCATTTACTTTCA
GAACTTCATCAGAATAATCAGATGAGTATTTTTGCATTTGAATTTCTATT
TTTGTCTTTTTCTAGTTCCTACAACTGCTGGAACAGGTAGTGAAACAACT
GGTGTTGCCGTTTTTGATTACACTCCATTACAAGCTAAGACTGGTAAGAG
TTCAGCTCTTTGGTCAAATTAATTAATAACGAAAATTAGAATTTGTTTTA
GTTACCTTATTACACTTATAACTACTCAAGTTATTAACGCAAATTGGTTA
CACTACTAATTTATACTGCTTGATTAGTTATGGAAGTGTAATAAGGTCAT
TGGGAATTTTCAAGTGGTTAAATCTTCTTTCTCAAAACTTTGGCAATGAA
TGATACAGTCAAATGGGGAAAAATGAAACAGACTTATTGTATTTTGATTT
TTGTTTCAGGTATTGGAAACCGTGCCATCAGACCAGTCCTTGGTATTGTG
GATCCTTTACATACATTACACATGCCAAAACATGTCACTGCTTACAGTGG
TCTCGATGTTTTCTGGTAAGTCCCTGTATATAATGTAGCTTAAATATACA
AAATCCAAAAACAGACTCAGAGATGCTTAGGTTGAGGGCTTAACAGGCTG
AAAAATGCTTAAAGGATGCTCATTTCCTAAAAGAACTTTTGGAGCATGCT
TACAAAGTGATGGCTTGTCATATGCTTAAATTTGCTTAGGACATAGTGTC
CTTCAGGGTCTCTTCCCCCCCCCATGCCTAGAATGAAAATTTTCCATTCC
CCCCCCCCTCATTTTTCCCCACCCTGCCTCCAAAAATTTTTCTGTCCCCC
CCCCTCAAGCATAAAATTAAAAAGCTGTAATTTGATGAACTTAACGCTTA
TTGTTTTCCCTAAGGTAGTTCTAATTCAAGAATATATGGAAAGGATGGTT
GTTTTTAAACCATAATATTAATAAAACTAAGCATTATGCTATATCATCTC
ATAAAACCAGATGTTTTTCAATTTTGAATTGATTTTGGCGAGTTCCCCCC
CCATGCCTGGAATGAAAATTTTCCATTCCCCCCTCCCTCGTTTTCCCCCC
CCTGGCTTCAAAAAAAATTCTTTCCCCCCTATACGTCCTTTTGACCTCAA
AACCCATTCCCCCCCTGAATCCAGGGGGGGAGGACACTATGTAGGATTCT
TGGCTTAGTTTTAACAAACGAAATTGGGAAAAGAGGTAAAGCTTCACAAA
AAAGTGTACTGAAAAAACAAAAAGTACAACAAAGTAACTTTTGTATTTTT
TTGTAGGATCGACGTATCAATGCATAGCATGCTTAAATTCTTCCCATCTT
TGAGACTAGATATAAGTGCAATGCTTATGAATAAAAAACATCTACTGAAA
AAGATCATTCTTAAAATTATTGAATCGGAAGTATCAAAAAAAACATTCAG
CGCCAGGCTTCATATTATTTCAAATGATTATTTTTGCTGTTTAAGTGAGG
AAGTTGAAATTTACATTTTAATTTATTTATATGTTGATCTGAAATGTAAG
CTCAATTTCAACTCTTATTCTAAATATTAAAACATAATTTCCTTTTAGTC
ATGCTCTTGAATCCTACACAGCGATCCCATACAACCAAAGAAGCCCGCGA
CCAACAAATCCTATCTTGAGACCTGCCTACCAAGGAAGTAATCCCATCAG
TGATGTGTGGTCTAAATACGCTTTCAAAGTAACTGCAAAATATCTCAAGA
GGTGTGTACCAATTTGATATTTTTTGGATACTAAGTAATTAGTGAGAGAA
AATTTTAATCCCTCTATCAATTCTCAAGTTGAGCTTGAATCTGACAACGT
GTGTCTGTCTGTGTGTCACAAAAACTTTAGGGCAGCCTGGAGACAGAATT
TGCGGAAATTTTGCGCACCTGTTCCTTGGGTTAATATCCGAGGGTGCTTT
TTTCATTTTTTCTTTTCCTTAGGATCTCAGGATTTAAAAGCTCAAATTTG
CTCCAATTAGGCTGGGAATATAGCCTAGAAGCCAACGGACCGCTCCAAAA
TCGAAATATTCAATGAAAGAAAGTGGAAGTGCTAAAATAGCAATTCTCGC
CCAAACTTTAAAATCTGGAAAAGGTTAAAATACTAAAATCTAAAATATAT
TTCGACCATGATTGTAGATAAAACATACACTAAGTGTGAGTTTATTCCAA
TTTTGCTCTCAATACCTTAATTTTCATCAAGCTGCGGTAACATTATTGAT
TTATCTAATTCTATTTTAGAGCCATGGAAAGCCCAGATGATGTCGAAGCA
AGGTCAGAAATGCATTTAGCAAGTGTCTTTGCCGGTATTGGGTTTGGAAA
TGCTGGCGTTCATTTATGGTAGGCTATTTTATTCTTTGAAAGAGACTGAA
ATTATGAGCTAGCATTTTATCTACATTTAGAAATAAAAACTGCCATAAAG
AAAATTTTGAAAAAAGTATGTGTTGTTATTTACACAATTTCACTTCATCT
CAATTTGGTTGTTATTTGCTTTTCTAAGAATGTTTTTTTGTCTTACAGCC
ATGGATTGTCATATGCACTTTCTGGAAACATCAAGAATAAAACTTACAAA
GCAAAAGATTATGATGTCGACTATCCTTTGTTGGTAAGGAAATGGACATT
AAAGAGATAATTAGATGGTTTGTAATATTTGGCATGTGGGATCCTTCTAT
TGTCCTGAGCAAAATCGCAAATTATTTTTGCCTGACTATTTTTCAAAGTC
GAGATATTTAAGTTGCAAGTTTTTGGCTTTTAGGATTAAAACAATAGAAT
TTCAAGAAAGAACCGTGTAAGAACCCATATCTCGATTTTGGAAAATTGTT
GCACAAAAATACTTCGAGATTTTACCAAGGGCCACAAAAGTTTTCTGTTA
ATCTAAATATCTCAAACCATCTGATTATCCCTTTAAATCAAATTCAAATG
TCCAAATCATGTTTACTATTGACTTTGCCATACTTATGGAATAATGTTCA
TCAAACTAAGGAAATGCATCTGGATAATTTATTTCTTTGTGTATTAAATG
CTTTTTTGAGAATTTTAAATGATTTAATTATTTTTACTATTTTAGCCACA
TGGTCTTTCAGTTATTATCACAGCACCTGCTGTTTTTAACTTCACTGCCC
CTTCAAATCCTGAACGTCATCTTGAATGTGCTGAAATCCTTGGTGAGATT
TTTTTTTTATTTTGAGTTATTTGGAATGGCTACATATTGATTAGAGCAGC
ACTACTATAATATAGGCCAATCTTAAGACAAAGTAATGCAAAAATTTCAA
ACAATTTATGGTAAAGCCTGCTCACCATTAAAAATAGCTTGAAACAAAAC
TAAAGTAATTCCTGAAATATTTTGTAACCTTGATTATGAGGATAGAATAT
TAAAAATACAGGGGTTGCATTTGGATATTGGTAAATCTGTAAACTTTTTG
CTATTTATTTTATTTATTTTAAACTTTTTAGGAGCTGATATCACCAATGC
TAGGAAAGAAGATGCCGGCCCAATCCTTGCTGATGCAATCCGTAAATTCA
TGGATGGTCTTGGTATTGACGACGGTATCTCCGCCTTTGGTTACACCTCT
GAGGATATCCCTAAACTTGTAGAGGGTACCTTGCCACAACACAGAGTCAC
AAAACTTGCTCCTGACGGTGAGCCAACAGCAGAGGAGTATGCTATGATCT
ATGAGCAGTCCATGAAAATTTATTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:3329498..3335823- >XLOC_034674 ID=XLOC_034674|Name=XLOC_034674|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2868bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:3329498..3335823- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAGAGTACCAATTCCAGTATCAAGTCGAGAAGCTGTTCTCAGAGTTCT ACGCTCAATATCTGCTACGGGATGAGAGTACCAATTCCAGTATCAAGTCG AGAAGCTGTTCTCAGAGTTCTACGCTCAATATCTGCTACGGGATGTCAAT GTCCAGCACATTCCCAAAGTTTTTCTGGATCACCAGTTCATAAATGTTCG GCACATGCTTCAAATGATGTCGAATATGCTGTTGAAATGTCAATGTCCAG CACATTCCCAAAGTTTTTCTGGATCACCAGTTCATAAATGTTCGGCACAT GCTTCAAATGATGTCGAATATGCTGTTGAAATGGCTGCTTCCAATGTGAG ATATGGAAATGGTGTTACTGCTGAAGTTGGAATGATGGCTGCTTCCAATG TGAGATATGGAAATGGTGTTACTGCTGAAGTTGGAATGGATTTAGCAAAT ATGAAAGCACAGAAAGTCGGTGTTTTCACAGATAAAAATGATTTAGCAAA TATGAAAGCACAGAAAGTCGGTGTTTTCACAGATAAAAATCTTGCAAAGC TTCCTCCTGTCCTTGAGACGATTAAATCATTAGAAAGAAGCGGAATCAAC TTCTCGGTTTTCGACGATGTCAGGATTGAACCAACTGATGCAAGCTTGCA AAGCTTCCTCCTGTCCTTGAGACGATTAAATCATTAGAAAGAAGCGGAAT CAACTTCTCGGTTTTCGACGATGTCAGGATTGAACCAACTGATGCAAGTT TCCAAAAAGCTATCAACTATGCAAGAGCAGAGAATTTTGATCATTTTGTT GCAGTCGGTGGTGGGTCAGTAATTGATACAGCGAAAGCAGCAAATCTGTA TTTGTGTCATCCAGAGAATGAGTTATTGGATTTTGTTAATGCTCCCATTG GCAAGGGACTTCCCATCAAGAAGGCTTTGAAACCATTAATTGCTATTTCC AAAAAGCTATCAACTATGCAAGAGCAGAGAATTTTGATCATTTTGTTGCA GTCGGTGGTGGGTCAGTAATTGATACAGCGAAAGCAGCAAATCTGTATTT GTGTCATCCAGAGAATGAGTTATTGGATTTTGTTAATGCTCCCATTGGCA AGGGACTTCCCATCAAGAAGGCTTTGAAACCATTAATTGCTATTCCTACA ACTGCTGGAACAGGTAGTGAAACAACTGGTGTTGCCGTTTTTGATTACAC TCCATTACAAGCTAAGACTGTTCCTACAACTGCTGGAACAGGTAGTGAAA CAACTGGTGTTGCCGTTTTTGATTACACTCCATTACAAGCTAAGACTGGT ATTGGAAACCGTGCCATCAGACCAGTCCTTGGTATTGTGGATCCTTTACA TACATTACACATGCCAAAACATGTCACTGCTTACAGTGGTCTCGATGTTT TCTGGTATTGGAAACCGTGCCATCAGACCAGTCCTTGGTATTGTGGATCC TTTACATACATTACACATGCCAAAACATGTCACTGCTTACAGTGGTCTCG ATGTTTTCTGTCATGCTCTTGAATCCTACACAGCGATCCCATACAACCAA AGAAGCCCGCGACCAACAAATCCTATCTTGAGACCTGCCTACCAAGGAAG TAATCCCATCAGTGATGTGTGGTCTAAATACGCTTTCAAAGTAACTGCAA AATATCTCAAGAGTCATGCTCTTGAATCCTACACAGCGATCCCATACAAC CAAAGAAGCCCGCGACCAACAAATCCTATCTTGAGACCTGCCTACCAAGG AAGTAATCCCATCAGTGATGTGTGGTCTAAATACGCTTTCAAAGTAACTG CAAAATATCTCAAGAGAGCCATGGAAAGCCCAGATGATGTCGAAGCAAGG TCAGAAATGCATTTAGCAAGTGTCTTTGCCGGTATTGGGTTTGGAAATGC TGGCGTTCATTTATGAGCCATGGAAAGCCCAGATGATGTCGAAGCAAGGT CAGAAATGCATTTAGCAAGTGTCTTTGCCGGTATTGGGTTTGGAAATGCT GGCGTTCATTTATGCCATGGATTGTCATATGCACTTTCTGGAAACATCAA GAATAAAACTTACAAAGCAAAAGATTATGATGTCGACTATCCTTTGTTGC CATGGATTGTCATATGCACTTTCTGGAAACATCAAGAATAAAACTTACAA AGCAAAAGATTATGATGTCGACTATCCTTTGTTGCCACATGGTCTTTCAG TTATTATCACAGCACCTGCTGTTTTTAACTTCACTGCCCCTTCAAATCCT GAACGTCATCTTGAATGTGCTGAAATCCTTGCCACATGGTCTTTCAGTTA TTATCACAGCACCTGCTGTTTTTAACTTCACTGCCCCTTCAAATCCTGAA CGTCATCTTGAATGTGCTGAAATCCTTGGAGCTGATATCACCAATGCTAG GAAAGAAGATGCCGGCCCAATCCTTGCTGATGCAATCCGTAAATTCATGG ATGGTCTTGGTATTGACGACGGTATCTCCGCCTTTGGTTACACCTCTGAG GATATCCCTAAACTTGTAGAGGGTACCTTGCCACAACACAGAGTCACAAA ACTTGCTCCTGACGGTGAGCCAACAGCAGAGGAGTATGCTATGATCTATG AGCAGTCCATGAAAATTTATTAAGAGCTGATATCACCAATGCTAGGAAAG AAGATGCCGGCCCAATCCTTGCTGATGCAATCCGTAAATTCATGGATGGT CTTGGTATTGACGACGGTATCTCCGCCTTTGGTTACACCTCTGAGGATAT CCCTAAACTTGTAGAGGGTACCTTGCCACAACACAGAGTCACAAAACTTG CTCCTGACGGTGAGCCAACAGCAGAGGAGTATGCTATGATCTATGAGCAG TCCATGAAAATTTATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000007_pilon | genome | sc0000007_pilon:3329498..3335823 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1192-1434:244 |
| Aaloc | 1093-1188:632 |
| Aaloc | 1009-1092:1178 |
| Aaloc | 910-1005:1457 |
| Aaloc | 757-906:2128 |
| Aaloc | 652-753:3266 |
| Aaloc | 574-648:3610 |
| Aaloc | 376-570:4324 |
| Aaloc | 271-372:4682 |
| Aaloc | 220-270:4898 |
| Aaloc | 166-219:5179 |
| Aaloc | 73-165:5995 |
| Aaloc | 1-69:6327 |
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