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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000079_pilon:867975..870366+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034598 ID=XLOC_034598|Name=XLOC_034598|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2392bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:867975..870366+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAATACAAGAGGATTTGGTCTGGAACAAACATACTGGAGAGTTGAT
TGGCTTTATTGATCTTGGTGATGATGAGCTCAATGAGGGTCTGCTTGAAG
ACAAAACTAAACTAGCAACACACATCATGGTATTCATGGCCAAGAGCCTT
ATGAACCCCCTTTCGTTTGCCTTTGCTAACTTTGCTACTGATGGAGCATC
CAGTGAAcaaattttctctttattttggAAGGCAGTGAGTATCTTGGAGA
TCACATGTAACCTAAAAGTTGTTTCCACTGTTGCTGATGGGGCTTCAATT
AACAGAAAATTCATGCAGATGAATAGGGTAAGatatttaaagttaaaaag
taGCACACTTTCTACCCTGATGATGGGTGGACTTTTAGTgaggattttta
atttttttttagaaaaattagattttgaatttttttaaagaattcaagtt
tttCTTATTATAAATAAAAGAGCCTAGAAATTTATTGGaaaaaaaGAATA
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AATAAGAATTATTTTTAGCCAGGATTTGATCGTTACTCAATTCTGATATA
TTGATGGTGAGAGAGTCAAGTATCACCTACACACTTGTATCTTAAAAGGT
TATGAAGTGATATGCAATATTAACAAGCATTCAGTTGAAAAATGTCTGTT
TAGGTATTCAaccctcaaaaaatatttagtcaTTTGTGTACTAGAGGTTA
ACTACCAAGTGTCGGATAATTACCCTTTCGAGATTTATCAGTCATTGAAA
TTAATGCAAATTGGTTGGATTTATTGAATTGTCTTTCAATTTGCCTATGA
ACTTTTGAAAGCtttggaaaatttatattttccagGTTGCAAATTcataa
agttatatttcaaaaatcaccatgTAAAATACATGTAATTTACatggtga
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TTTAATTCATCTATTCAGGATTCAGACGGTAAAAATGGTTCAGAGTTGAT
TTACAAGGTCAAGAACATGTATTCAGAAGAAGAACGTTACATATTCTTTT
TTGCCGATGTACCTCATCTCATCAAGACAGCACGAAACTGCCTTTGGTCA
TCAGGCTCTGATTTTTCTCCAAGATTCATGTGGAACAATGGTAATTTAAG
TTTTTATGTCATTAAGTTATTGGGGGATTTTTGCAACATCACATGGTGCA
AAGTTATACGGGGATTCTTTTTGGAAAAAGGAAAGGTATTCAATAAGGGA
TGGGTAAATTTTAAAAGGGAGGGGGTACAGATCTCTCTGCACACTATGAG
GCTAACCTGGGTAAACCTGGATTTTTTCTTGCCAAGTGAACTAACAATCT
AATCTAGTTGCTTGGTCTTTGCAAACCAACTTGGACAGTAGGAATTGTCC
tttagaaattgaaaaactAAAAGTGTTAGTTATCCCTTACTCTTGATCTT
TCCCTGATCaaattgatggttctggaaTACTGGCATAGTCAAACATTTGC
TTTGGTACGTTTATATTTTTACCTCTTTTAACTTTTCTTTCAGGTTCTTA
CTTGCTTTGGCAGCACATTAAAACTATGTTTTATGAAGACATGGACAATG
GATTGAAGTTAATGCCAAAACTTACCACAGACCACATTCTTCTCAACTCC
TACTCTAAAATGAGAGTTTACTTAGCTGCTGAAATTCTCAGTAATACAGT
TGGAAACATGTTGTTGAAATTCGGTCCAGAAGAGGCTAAAGGAACTGCTG
GATTCTGCTTACAAATGGATCagttttttgattgttttaacgTGCGAAAT
ACCAAAGAACACAAAAAGACTGGAAAACCTTTTTTAGCTCCATATACCAC
AGTTGATCCTAAAAAGGATGAACGGTTTAGCTTTCttgacaaatttttga
aatatctagATGATTGGAAAAAGAGTACAATGGAACGCCCTGGGGAATTT
TCCCAAACCAACCGAAACAATATGTTTTTATCTTTACCAACATATAATGG
TATCAAAATTAGCATCAGTTCCCTCAAAGAAATCATACCATTTTTACTTG
ACCAATGTGGATTTGACTATGTTCTAACAGAAAAGTTTTGCCAGGATGAC
ATTGAAAATTACTTTGGGAAACAGAGGGCAATTGGTCGTTTTAAGGACAA
TCCAACTGCAAAAGATTCTATCTACaatgacaatataataaaatcaCAGT
TTGACACACGACCGATTGCTGGTAATGTTAGAAAGGCTGAGTTTGATCCC
AAAGATATACCAGACACTCCAATCAAAAAACGTAAATGTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000079_pilon:867975..870366+ >XLOC_034598 ID=XLOC_034598|Name=XLOC_034598|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2496bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079_pilon:867975..870366+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAATACAAGAGGATTTGGTCTGGAACAAACATACTGGAGAGTTGAT
TGGCTTTATTGATCTTGGTGATGATGAGCTCAATGAGGGTCTGCTTGAAG
ACAAAACTAAACTAGCAACACACATCATGGTATTCATGGCCAAGAGCCTT
ATGAACCCCCTTTCGTTTGCCTTTGCTAACTTTGCTACTGATGGAGCATC
CAGTGAAcaaattttctctttattttggAAGGCAGTGAGTATCTTGGAGA
TCACATGTAACCTAAAAGTTGTTTCCACTGTTGCTGATGGGGCTTCAATT
AACAGAAAATTCATGCAGATGAATAGGATGAAAATACAAGAGGATTTGGT
CTGGAACAAACATACTGGAGAGTTGATTGGCTTTATTGATCTTGGTGATG
ATGAGCTCAATGAGGGTCTGCTTGAAGACAAAACTAAACTAGCAACACAC
ATCATGGTATTCATGGCCAAGAGCCTTATGAACCCCCTTTCGTTTGCCTT
TGCTAACTTTGCTACTGATGGAGCATCCAGTGAAcaaattttctctttat
tttggAAGGCAGTGAGTATCTTGGAGATCACATGTAACCTAAAAGTTGTT
TCCACTGTTGCTGATGGGGCTTCAATTAACAGAAAATTCATGCAGATGAA
TAGGGATTCAGACGGTAAAAATGGTTCAGAGTTGATTTACAAGGTCAAGA
ACATGTATTCAGAAGAAGAACGTTACATATTCTTTTTTGCCGATGTACCT
CATCTCATCAAGACAGCACGAAACTGCCTTTGGTCATCAGGCTCTGATTT
TTCTCCAAGATTCATGTGGAACAATGGATTCAGACGGTAAAAATGGTTCA
GAGTTGATTTACAAGGTCAAGAACATGTATTCAGAAGAAGAACGTTACAT
ATTCTTTTTTGCCGATGTACCTCATCTCATCAAGACAGCACGAAACTGCC
TTTGGTCATCAGGCTCTGATTTTTCTCCAAGATTCATGTGGAACAATGGT
TCTTACTTGCTTTGGCAGCACATTAAAACTATGTTTTATGAAGACATGGA
CAATGGATTGAAGTTAATGCCAAAACTTACCACAGACCACATTCTTCTCA
ACTCCTACTCTAAAATGAGAGTTTACTTAGCTGCTGAAATTCTCAGTAAT
ACAGTTGGAAACATGTTGTTGAAATTCGGTCCAGAAGAGGCTAAAGGAAC
TGCTGGATTCTGCTTACAAATGGATCagttttttgattgttttaacgTGC
GAAATACCAAAGAACACAAAAAGACTGGAAAACCTTTTTTAGCTCCATAT
ACCACAGTTGATCCTAAAAAGGATGAACGGTTTAGCTTTCttgacaaatt
tttgaaatatctagATGATTGGAAAAAGAGTACAATGGAACGCCCTGGGG
AATTTTCCCAAACCAACCGAAACAATATGTTTTTATCTTTACCAACATAT
AATGGTATCAAAATTAGCATCAGTTCCCTCAAAGAAATCATACCATTTTT
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CTTACTTGCTTTGGCAGCACATTAAAACTATGTTTTATGAAGACATGGAC
AATGGATTGAAGTTAATGCCAAAACTTACCACAGACCACATTCTTCTCAA
CTCCTACTCTAAAATGAGAGTTTACTTAGCTGCTGAAATTCTCAGTAATA
CAGTTGGAAACATGTTGTTGAAATTCGGTCCAGAAGAGGCTAAAGGAACT
GCTGGATTCTGCTTACAAATGGATCagttttttgattgttttaacgTGCG
AAATACCAAAGAACACAAAAAGACTGGAAAACCTTTTTTAGCTCCATATA
CCACAGTTGATCCTAAAAAGGATGAACGGTTTAGCTTTCttgacaaattt
ttgaaatatctagATGATTGGAAAAAGAGTACAATGGAACGCCCTGGGGA
ATTTTCCCAAACCAACCGAAACAATATGTTTTTATCTTTACCAACATATA
ATGGTATCAAAATTAGCATCAGTTCCCTCAAAGAAATCATACCATTTTTA
CTTGACCAATGTGGATTTGACTATGTTCTAACAGAAAAGTTTTGCCAGGA
TGACATTGAAAATTACTTTGGGAAACAGAGGGCAATTGGTCGTTTTAAGG
ACAATCCAACTGCAAAAGATTCTATCTACaatgacaatataataaaatca
CAGTTTGACACACGACCGATTGCTGGTAATGTTAGAAAGGCTGAGTTTGA
TCCCAAAGATATACCAGACACTCCAATCAAAAAACGTAAATGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000079_pilon | genome | sc0000079_pilon:867975..870366 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 502-1248:1646 |
| Aaloc | 328-498:1069 |
| Aaloc | 1-327:1 |
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