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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000199_pilon:433641..442273- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034395 ID=XLOC_034395|Name=XLOC_034395|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8633bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000199_pilon:433641..442273- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCAGGTCCATATCGATTACTTTGTTGCTTTTGGCAAGTTTTGTTTGTAT
GCATTCCGCAAATCCTGTTCTTTCAAGTAAGTCTTTTCTGTTTTTCAAAT
TCCTTATTGATAATTTATGTATCTTATCGTCCCTTTTAATACAGATCCAT
AGTAAACACCAACCCTATTGCTGGTAAAGTTTGGCCATTTTAAAATAGAG
TGTTAAAAATGTAAAAAATGGTCATTGAGACGGGCTTAGAAAAAAAGGTT
TAAATTGGAGTGTTTGACTCAAAACCGAAAACAACCTTGTATTCCTGAAA
CCCAAAAATCTATATATAATCAAATGGTTTGAGATTTTTGCCTGAAGAAA
CCCTCTGTGGTTTCGAGTAAAATCCCTAAGTATTTTTGTCTAACTAGAGT
CATATCACCAGTGCACGAACGGCCCCAGTGCACGAACGAGCGGCTTTGAA
CTTGAAAAAAACAACCAAAAACAAACTTCTATAGAACTTCCTTTGTGCAG
CAGAATCCTCAAACTATTCCTTGCAATCTCTCCAAAAATTACAGCTAAAG
GTCGATTAGAATTCCTATAACTCAAGATCTTGTAGAGGTACCCATAAAAA
TAGACTTTTTGAAGAAATATGACAATACTGCCTGTTAGATACTTTGCAGA
ACAACTATATTGACTTCCGTAGCATATAGATGAATGTATAGCCTAGCTTA
AAACCAAAAACCATCGCCTTTAAAGGTTTCTTTGATATCATAATCAACCA
GTGTATGATTGCCACCATCGTCCAACAGTAAGGAACCAAAGGGCGAACGA
AATTCGCGCCAAAAAAAAATAGATAGATAAAGTTTGCCGTTCGTGCACTG
GGTACCCCCCTCTATATTCTAAAGTCAAGATATCACAATTTAAAATTTCT
GAAATTGGGTTCTCACACGGTTTGAAATCCTATTGTTTTTTACTAAAAGT
CAAAAACTTGTAACTTCAAGACTTAACAGAACTTAATTATCTCGACTTTT
GGAAATATTTTGAGGTTTTGCTCAGGAAAATTAGAAGTAGGGTAGATCGT
CAAATACCATTTTTAGCATGATGTCAAAAAATTCAAAGTGTAATACTTTT
TTGTGAAAATTTAATCTATTGTAAGACATTTTGCACAATTTTTAACCTCC
TAGGTCAAAAATCCAGCATTCCCCAGGGGGGTCTTTGATTCGCACTAAAG
CGAAAAATGAGTAAAATGGCATTTTTTGCCCATTTTAAGACTATGAAAGC
CCAGTAAAGGGTCAAAATGGTTTCTAAATGGTGTCTTGTACTAATATTCA
ACATAAAAAGACAAAATAACCCCAGCGAGATCGCTCAATGTTTCAATTTC
AAGCTAAAAAGGCTGATTTTCTTCGATTCTGGGTAGCAAAATACATAAAA
GCAGCATTTTTGAGGACCCACAACTTTTAAACTTTTTAAGGTATACACTT
GAAATTTTCAGTAATTAAACACTTCAGAGAAAGCTCCAGGAAAAATCAAA
CTTGAGTTTTCAAAAATTTCCTATAAATCCGTAATGGCGCGCTAGAAATT
GAGTTTTCATGCTAAATACCAATATTTCAAGCTAAAACTTGGTTTTCTCA
GGCTAAAATCTCAAAAATGGTTTCAAATGGTGTCCTGAAATCTTTGGGTG
TTGAAAGTATTCTGGAAAAACTCTGGGAGAATCAAAATGGTTTGGGTTGG
AAATCTACCAAAGTCCGCCATTATGGAATTGCATTTCCACTTAAAACGCG
ATATTTAGAGTTAAAGTCTAATTTTCTCAGGCTAAAATCTCAAAAATGGT
TTCAAATGGTGTCCTGAAATCTTTTGGTGTTGGAAGTATTCTGAAAATAC
TCTGGGAGAAACAAAATGGTTTGGGTCAGAAATTTGCCCAAATCTGCCAT
ATGGTATTGCATTTCCCACTAAAACGCGATATTTAGAGTTAAAGTCTTAT
TTTCTCAGGCTAAAATCTCAAAAATGGTTTCAAATAGGGTCCTGAAATTT
TTTGCTGTTGAAAGTATTCTGGATATCCTCTGGGAGAACCAAAATGGTTT
GGGTTTGAAATTTGCCTAAGTCTGCCAATATGGTATTGCTTTTCCTACTA
AAACGTGATATTTAGAGTTAAAGTCTAATTTTCTCAGGCTTTAAATCTCA
AAAATGGTTTCAAATAGGGTCCTGAAATCTTTAGGTGTTGAAAGTATTCT
TGGAACAATCAAGGAAAATCACAGTGGTTCACAATGGACATATGTATGCC
AAAGTCTGCCATTATGAATTTTATTTCTTTAGGAAGAACACTCAAGCTTA
CTCAAAACATTGTGTTTTAGAATGAAATACAATTCCATAATGGCAGACTT
TGGCAAATTTCTGACCCAAACCATTTTGGTTTTCCCAGAGTATTTCCAGA
ATACTTTCAACACCAAAAGATTTCAGGACCCTATTTGAAACCACTTTTGA
GATTTTAGCCTGAGAAAATCAGACTTTAACTCTAAATATCGCGTTTTAGT
TGGAAATGCAATGCCATAATGGCAGACTAAGGCAAATTTCTGACCCAAAC
CATTTTGGCTCTGCCAGAGTATATCCAGAATACTTTCAACACCAAAAAAT
TTCAGGACACCATTTGAAACCATTTTTGAGATTTTAGCCTGAGAAAATTA
GACTTTAACTCTAAATATCGCATTTTAGTGGGAAATGCAATACTATAATG
GCAGACTTGGGCAAATTTCTGACCCAAACCATTTTGATTCTCCCAGAGTA
TTTTCAGAATACTTCCAAGATCCAAAGATTTCAGGACATCATTTGAAATC
ATTTTAGAGATTTTAGCCCAAGAAAACCAAGTTTTAGCTTGAAATATTGG
CATTTAGCATGAAAACTCAATTTCTAGGGTGCCATTATGGATTTATAGGA
AATTTTTGAAAACTCAAGTTTGATTTTTCCTGGAGCTTTCTCTGGAGTGT
TTAATTACTGAAAATTTCAAATGTGTACCTTAAAAAGTTTAAAAGTTGTG
GGTCCTCAAAAATGCTGCTTTCATGCATTTTCCTACCCAGAATCGAAGAA
AATCAGCCTTTTTAGACTGAAATTGAAACATTGAGCGATCTCGCTGGGGT
TATTTTGTCTTTTTGTGTTGAATATTAGTACAAGACACCATTTAGAAACC
ATTTTGACCCTTTCCTGGCCTTTTATAGTCTTAAAATGGGCAAAAAATGC
CATTTTTACTCATTTTTGGCTTTAGTGCGAATCAAAGACCCCCCTGGGGA
ATGCTGGATTTTTGACCTAGGAGGTTAAAAATTGCGCAAAATGTCTTACA
ATAGATTAAATTTTCACAAAAAAATATTACACTTTGAATTCTTTGACTTT
GCCATTTGACGATCTACCCTATAGAAGGATTCCACATGCCAAATATCCCA
AACAACCTGATTATCCCTTTAAAACTTTTGGGTTTTCCCCCAAGACTTTC
AAGAAAATTTTTTTTACGGTCGCCAGATCCGGAATGTCCCGGAAAAAAAC
GGTTTGTCGGGATTTTCTCGAGGTTTCATCATTGGTTATTACTGATTTTT
TTTCAATTGGCTTGATTATTTCTTTACACAACTTTACAGGAAAAGGTATT
TCATGGTGATGCCCAAAACTTTGCACTGATTGATTACCAATCCGGAACTC
CTTAAAAATAACCGGAACAGCCGAAAACCGGTGGAAAACGGATTTCCTTG
ATTTTTTTGATTAAACTCGATAGATTTTCATTACTTTTTAATTTAAGGAA
AATAGTTATTTCCAAAATGTAATGGGGCCCAATTTCGAAGAAAAATTATT
TCTGGCCGCCAAATCCAGAAATGTCCCGAAAAAAATTCCTCGAGATTTTT
TCATCACAGTGGAGTCTCCATAACTCGAACACGCACAGGGAACACGAATT
TGTTCGAGTTGGAGAAAGGCAACCGGGCATTGTTAACTGAAGGGACTACA
AAAGTTGTTCGAGTTAAGGAGACATTCGAGTTAAAGAGACTCCAGTGTAG
TTTTTTCTGACGTTTTGTTTATTTTGAATTTAATGTTTGCTGTTGATCAG
CCAAGTACTGTAGGTCCATAAAAGTATCACTTGTTTCTATGATGTGAAAT
CGATTTCACGCCCTAAAGTATTGACCATAACTATGCAAAATACGGTTCTA
AATTCTTGATAGGTTTTATTATGGTTTTTTGAGAGGCCCGGAATCTTCGA
GTTATAGAACTTCGAGTTAGCGATTTTCGAGTTAGGAATTTTCGAGTTAG
CTAAATTATGACGTCACAATTTGCACTTTTATGACGTCATAATTTAGCTA
ACTCGAAAATTCCTAACTCGACTCTAACTCGATTTTTTATTTTCAAAAAG
TATTTTTCCGAGTTAAAATTAACTCGAATTTTATTTTTCGAAAAAACTTT
TTCGAGTTAGCTAACTCGAATTTCTTTTTTCACAAAACCTTTTTTCGAGT
TAGCTAACTCGGAATTTATTTTTCGCTCACAAGTTTTCGAGTTAGAGGCA
CATAATCTTCGAGTTATATGATCGAGTTATATGGCCTCGAGTTATGAAAT
CTTCGAGTTAAGGTCCGTAACTCGAAATAAAAATGAAGCATTTTCATTTC
GAGTTAATTTTTTAACTCGGTTTTTTTATTGACCATTTTCCTCTCGAGTT
AAATCAAGCAAATTAACTCGAAACCATTTATACAGCATTTTGATTTCGAG
TTAAATAACTCGAAATGAAAATTTCGTCAAAATGATTTCGAGTTATATAA
CTCGAAACTAAAATGCCATCAAAATGATCTCGAGTTATATAACTCGAACT
CAAAATGTTACAATATTGGTTTCGAGTTACGTAAATAGGGTTAGTTGTGT
CTGTCAGTTAGGTACATGTTGGATGGAAAAATTGACTTTTCAAATAACAA
TTTCAGCCGTTTAAAACCATGGAAGCAAATGGATTTTGTGTTGAGTAATC
AAGCAATGTTGCGGATTTTTAGCCATTTTTTCAGCCATTTTAGGGGTTCT
AAACGACGAAGTTTTACAATTGACCCCAGTTTCGTCATCTGCTTTTCGTC
ATAAAATAGTCAGAATTGAATCGTTAATTAGATTGCCTTTCGAGAACTTT
TTGAAAATCTTATTTATAGGAATTTGTATTAAAAAGTGACGTCATCAAAA
AATGCCCCAAACTTTATCAATCGACTATTCTTTCTGCATTCTGGTGGTTC
TAGAACCCTTAAAGCCTAAAGTACCCCCAGTTAGACAAAATGGGTGCCAG
GTATGTGCGAGCCATAATAAGGGTTCTTGTCAGACGCCCTCGAAAGTTCC
TCAAAGGAGTACAAAAACCATTAAAAAACAATTAAGTCTCTGTAAGGGTT
CCAAAATTACCGAAATAAGAAAAACTGACTCCATCAAAGGGTCATAAATT
CTTGAATCTTAGACTAAAATTTATGAACATTCTGGCTGAATTTTGAGGGA
ATAGTCTCTCTTTTCTTAGCGTGAGAAAATGTCCAAAAATGGGCAGAATC
TTCGAAAGGCAGCCTCTCTAAGAGCCCAGGAGGTGTAGTCGGATTTTGGA
CTGACGGTATGTACGGGCTAAAAATCGCAGTGGTTTTCCCGAACACCCTT
ATAGTGCATTTTTTCACCAAGTCGAATAACCTTACAGCGTAGTCTAGTTT
TTGTCCCTGAGGTGATTGACAAATAAAAAAAAGACACGCTTGGTGCGATG
TGCGATTATTCTATGTATTTATGTAATTTTGCATCTAATAGGGATCCAAA
AATGGGAATCGAATCCCTTATAAAAATTTTGACTGGGCAATTTCATTTTT
GTGAGAACTTAGAAATTTGTACCCTTACAGTGCAAGCGGCAAAAAAAGGG
AATAAAGGCTTTAAAGCGATCTCTGTGTATCACAGTGATTTTACTCGCGC
ATCTTTAGGGAGTGGTCAGAAAGTATCTACTAGGGGGGGGGAGGGGGTTT
GAGAAAGAGGGTGTCGAAAAAATATTTTTCAATCTTGCCTCCCCCAAACC
GAAAACTCGTGGCTACGCCTCTGGCAGTTGCTAAATATTATTGTAGCTTT
AAATCGTCCATTTTGAGAGGTTAAAGAACATTCTAAGTGACATTTATTAG
GAGTGGGTACCAAAAATATATTGACTGGTTATGAGGTGGCTTGAAATTTT
TTCGAGGATATCAGGGAGGGGGTGCGAAATTTAATAATAGATACTTTCTG
ACCACTCCCTTATTGGTGAAATTCTAAATCGCTAAAAATCACAATGTCTA
GTGCAGTATATTTGCCTCTCCAATTAAGTATTTAACAGTCCTTCTTCTCG
AAATTTATCATTTATCCCACAGCACTACCTCACATTGAAAAATCTATACT
CCACAGAGTGAATCTAGCTAGATATATTCCCTCTCACAGTTCCCTCTCCA
GTTCATCCCGGCAGTCGGGATATTAACATAAAAATATTTGACGTCAATTA
TTTAGAATTTTATGACGTTTAATAAACGCAAGATATCGGTAATTCCGGGG
ATAACTCGCAAAATAAATCGAAATAAAAAAAAAAGAAAAAACTACCCCTA
AGTTTTGACCTAAGGAAGGTGTATGCTAAAACTTTTCAAAGGGTTCTCTT
CTGTTCACAATTTGACAATTCGGTCCTTATTGACTCTACTACTATAAGAA
AGCTATAGCCCATCCACAATCCGTGGAAACCGACGACAAAAGAGCCTGTC
ATCATTAACTCGATGGAAAAATTTGCCTTTTTTCTTTCGAGTTAAAATAC
GTTATATAACTCGATGAAAAAATTTGCCATTTTGATTTCGAGTTAAAAAC
AACATTTTAACTCGATGGAAAAAATCATTATTTTTCTCTCGAGTTAAAAT
GAGGAATATAACTCGATGAAATTATTTGCAATAAAAAATCCGAGTTATAT
AACTCGAGAGGAAAATGGTCAATAAAAAAACCGTGTTAAAAAAATAACTC
GAAATAAAAATGAAGCATTTTTATTTCGAGTTATGGGCCTTAACTCGAAG
ATTTCATAACTCGAAGCCATATAACTCGATCATGTAACTCGAAGATTATG
TGCCTCAAATCCTGAATGGTTTTATTCAAAATTCGAATGTTTTTATTTAT
AATTCGAATATTTTAATTCACAATTCGAATGTTTTTATTCATAATTCGAA
TGTTTTTATTCATAATCTGAATGTTTTTAATCATAATTCGAATGTTTTTA
TTCATAATTCGAATATTTTATTCAAAATTCGAGTTTTAGTTTGGAAATTC
GAATTCTTAGCTCTACCATCTACGGTCGAAGCTCCAAAAGGAAAGGAAAG
AAAACAAAAAAAACACTTCAATCTCTTCAATGGAATTGAAGCTGAGCAAG
AAGCTAATCACCTGCGTACCTGAAAAAGATAAACACAAAGGCCACGCAGT
ATCGAAAAGTGAAATACCAAAGCTGAAGAAAAGTTATTGGTTTGTTTTAA
CATCTTTAAAAAGGAACAACGACACTCTCTTTTGAATTTGTAGAATCACA
AAGAAGTAATGTTAGAAATATTCAATATAACTCTCAAATGTATTGTATAT
ACATAACTAACATACCTTGAAATAATCTGCAACATATCTGTAGAACTGAC
AAAACAATTATCTGGATTTTTGTTGGTGCACACATAAGATACATCAGGGC
ACTTAAATTCAATAAATCTAATTTCTCATCTTTTACAAAATCTCCACTCC
ACATTAAACAAGAAGAAAGGAGGAAGAAAAACGAGCAAACTTCCTTCCCC
CTACCTTTTCGAAATTTTCTGGATTTTTCTACTACCATACAAAAAATTCC
AAGATAGCTAACTCGAAAACTTGTGAACGAAAAATAAATTCCGAGTTAGC
TAACTCGAAAAAAGGTTTTGTGAAAAAGAAATCCGAGTTAGCTAACTCGA
AAAGGTTTTTTCGAAAAATAAAAATCAAGTTATTCCTAACTCGAAAATCC
TTTTTTGAAAATAAAAAATCGAGTTAGAGTCGAGTGACGTCATAATTTGC
ACTTTTATGACGTCATAATTTAGCTAACTCGAAAATTGCTAACTCGAAGT
TTTCTTACTCGAAGATTCCGGGCCTCGTTTTTTGATGTTTAAAAACATAT
TCTTGTTGTTAGGGGTTTACTTACCTTGTCGATATTTGAAATTTGCATTT
ACTTGCTACATTCCATATGCTACTCTACTTTGTATTTTAAGGCTCGGTGT
ACACCTAAAGCTTGTTATTGTAAAATCGACATTTCTAATATTTCGAACGT
TTTAATCAAAGGCGGGAATTATCGACCAATCAGAGAAAAGAATTTGCTTT
GTTTGTGTTTTTAAACAAAAGCAAGAGATTTTTTGCTCTTATGCTCACAT
TTTGGAGATTTTGAGAGAAAGGCTTGCGGACACGTTTTCTTTCATTTCAG
CCCAAGACTATTCGGGAAAAGATGCAAGAATAATCACAGGAGATATCATG
ACCACAGCAAACTTTTTGTTTAAAAGACACATTCATGAAATAGCAGAATT
GAATGCTGCAGAAGCTGCCAAATTGAAATCAGATACTATTCAACAAGCTA
TCGACCGTTATCTCAAATTCGAAGAGGAAATGGGCCAGAAGAACCATTTC
AATGCTATTCCACCTAAAGGTTCACAACCCTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000199_pilon:433641..442273- >XLOC_034395 ID=XLOC_034395|Name=XLOC_034395|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=618bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000199_pilon:433641..442273- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCAGGTCCATATCGATTACTTTGTTGCTTTTGGCAAGTTTTGTTTGTAT
GCATTCCGCAAATCCTGTTCTTTCAATTCAGGTCCATATCGATTACTTTG
TTGCTTTTGGCAAGTTTTGTTTGTATGCATTCCGCAAATCCTGTTCTTTC
AACCCAAGACTATTCGGGAAAAGATGCAAGAATAATCACAGGAGATATCA
TGACCACAGCAAACTTTTTGTTTAAAAGACACATTCATGAAATAGCAGAA
TTGAATGCTGCAGAAGCTGCCAAATTGAAATCAGATACTATTCAACAAGC
TATCGACCGTTATCTCAAATTCGAAGAGGAAATGGGCCAGAAGAACCATT
TCAATGCTATTCCACCTAAAGGTTCACAACCCTAACCCAAGACTATTCGG
GAAAAGATGCAAGAATAATCACAGGAGATATCATGACCACAGCAAACTTT
TTGTTTAAAAGACACATTCATGAAATAGCAGAATTGAATGCTGCAGAAGC
TGCCAAATTGAAATCAGATACTATTCAACAAGCTATCGACCGTTATCTCA
AATTCGAAGAGGAAATGGGCCAGAAGAACCATTTCAATGCTATTCCACCT
AAAGGTTCACAACCCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000199_pilon | genome | sc0000199_pilon:433641..442273 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 79-309:232 |
| Aaloc | 1-75:8634 |
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