XLOC_034199 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_034199
Unique NameXLOC_034199
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000203_pilon:151831..161074-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034199 ID=XLOC_034199|Name=XLOC_034199|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9244bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000203_pilon:151831..161074- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGAAAGAAAAAAGTCCTAAAAGGCAAAAGAATGCAGAGGAACCAGA ATCATCACCAGGATTGTGGTATGAAATCTTTTCTCTAAATCTCTAAAGAA AAAACAACACTTCATTATCTCTGCTTTGGGCTATTTTAGAAACAAATAAT TACCTTAAAGGAAGAAATTTTGGCGGGAATTTAATTTAGCGGACGGCCGA AAAAGTTTTTTAGATGGAAATTAATTTGGCGGATGGACGAAAATACTAAA TTTGGTGGGAATTTAATTTGGCGTTTGCTGAAAAATTTATCCTTAAAATA GCGTAAAAACAGCGAAAAAAATGCAAAAACGCCTTAAAAGAGATCATATT TTCAAAAAGTTTAATTTAGCGGGAATTTAATTTGGCGGATGGCGGAAAAA ATAAATTTTGGCGGCCAAATCCGCCAAATTTTGTTTCCGCCAAATTTCTT CCTTTAAGGTAGGAAATTTGCCATGGGAATTTTGTACCCCCTGAACCCCA GGGATGTGTCCCCTATACTAACCCCTCCCCTTGAACTTGACATATATCCT TGGAATGTCTAACTAAACGACATAATTATATCCGGTATGTTTAAGATTGC TTTACCGAATATTTTAATATCTTTGAGTTTAAACATTATTTTACCTCCAT TTTGAAAGAATAAGAATCTTTAAATAATTTGGAAAAAGGACTGGAATTCA AGCGTCGAAATCGCTCAGCTCGGTACAAAGATAACATTGTTATATTTTCA AAGGGATTAAATCCAGGATTGTTCAAAGGATAAAGTATTTTTCTGTGTCG ATTGTGTTAAATATGCTTTTTATCTCAATCATAGCCAATTTTTCATTTTT TTGTAAGGAGGGGGTGACAAATTTCTCGGGTTTTGGGGGCGGCAAATTTC TTATTGAAGTTTTTTATGAGATAGCCAAGTAGCCTTAGCTAAAGTTCAAA 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TTATCTAATTGTAACGAGTTTGGCATCGTCAAATGTGAAAATATAGTTCT CGATGGTGGTCAAGGAAAGATTGGGGCATGGTAACTATGGATGGATTAAG CTTTTCATAATTATTTTCTTTATTGATTCTTCCCAATCTGACATTTTACT GTTCAAATCTTAAGCATCTTACAACACACCTTGCGAAAGAAAACAGCCTA ACATCTAAGCCGATCTGTTCAGCCAGATTCTTTGGCCTCGATAGTTCCTC TATTACTTGACATAGATATGAGCAACTTCTACTTTGTGAGGACAGAAATC TACCGTTCACAAACAAGAAGGGCTCATATTATTACCCTGTATGTACACCA AACTTTTAGAAGATCGAACAATCCCTTTTTTAGGATGATCTCTCCATCCA CCGACCAATATATAACCAAAGAAGCATATATTCTCTATCTGCATGGTAAT ATGGGTAGCAGGTACTTGTTATAATTGACGTGCTTGACCTGTTTTAAAAC CCGGGACAAAAAGACGCTACACCTACCATCTTTGAGGACTCTTTAAGTTT AAAAGGGCGGAAGTGTCAAATGTTCGAACATCAGTTCACCTCCGAAAAGA ACACCTTTTTTGAGTGCCGTTTTGACACCAAAATCCTATGAGAGCAATGG ATGATTAAAGCTATTAAATAGCTTTATTTGATTGTGTATAATTAATGTGT GCTTAATTCATGATATTCATGTTGTGATCTTTTATACGGAAGCACACAAA ATGATCCGGTACTAGTGGCAAAATTTGCCACTAGTCTTTTGTTATTTTGC AACTAGTTCCGGGTTATCTCGGGTGCTTCCGTATAAAAGATTACGTCATG AATATCATGAATGGCGCTACTAAGTGCTTTAGTCTTTACCCGTATTCATT TATAAGGATGCAGAATGATTTTTTCATTTTTGTATTTTTAGAGCATTAGG TCACCGAGTTGAAATGTACAAGGTGAGAAGTATATTTGCACTTACTTTAA CGGAGCGGACGGCTTTTAAGAGGAGCTAGGGAAATAGGAAATTTATCTTT GGCGTTGGTATCAAAAACCAAAGCGTCGGAGTCAGATTTTAAGCCATATA AAACATATCTGAAAATCAAGAAGAGGTGCTAATACTTAATCGGATGAATT TTCTGCGAGATATTTTCTGGATTTATTTCGATGAATTAGCGTTTTCAAAT ATTTTTCGCGGATTTAATTTTGCAAATCAGCTGAAAACAAAAATAGCAAA TTTACGAGGAACTTTTAGCCAAAAAAACTGAACTTTGAAAACAAGAAATT AAATCTTGCCAGAATTAACACTAAACAAATTGCGTTCATTTTGAGGGTAA ACAAAACAAGATTATGTCCTGATCTCTGTCATTTCTTTCAAATACTAAAT ATTTCTTTTTTTTCAGAAACTATCAAGAATGGGGTATCATATTTTGACAA TCGATTATAGAGGTAATCAAATGGGGTTCTATTCTTAGTTTGCTATAAAG AAAGCGAAGCCCTTTAAAATGGATTTGATCTGAACTATTGGAGATTGGGC TTTTCCAGAAAAAGATTGAATATGGGGGTGGAGGATATAACATTTTTAGG TAATTTACCCCCGGACATAGTGAATTATGACCCCCAGACAACAGATCTTA CACCCCAGACAAGCATCAATTGGCCCCCAGACATTCAAAATTACCCCTAA ACAGAGCAAGTTTGCCCCCCAAAACAAGGCAAATTTTGCAGATTTTTCAC AAATTATATCCTCCACCCCCACGTACAAAAATTCTCTGGAAAAGCCCATT GCACACTTCTTCTTCCATGTGATTTTCTTCAACTTTGTCAGTGCTAGAAC TCTTGTCTTCTTTTTGTATGCTCACTACTCAAGTCACCTGAAAGTTTTTC TTTTAGGTTCCAAGCACCATTGTTCTTTCAACAAAGATCTCCAATGATTT TTTGTAGGTTTCGGTGATTCAGATGGCTCTCCAACAGAATTCGGTAAGTA TTTAATGTTTTAAAAGTGGCGAAACCTTCAAAGATTGAGTCAGTAGAACT CAAATATCCATAACTTGTATTTAATGTTGTAAAAGTGCCAAATCCTCCAA AAGGAAAAATAAAACTAAATTCACAAATCTACATCAAATGGTAAAAAGTA GAGAATAATTACTGTGTAAAATGTACACGAATTATATAGATATTTTCTTG CATCAAACTTTCTTCGTTATTTTTCTGATCAAGACTGTGATGGTGAAATC TTTCGGAATTTCATTTGTATTAGAAAATAAAGAATATGGTATAGCATTGT AACCTTTCTCTATTATTTCTCTTTATTGTTTCAGGCCTTTTGGAAGATGC AAAGATTGGTTACAAGTATTTGAAAGAAAGAGCGCACGGTCATGCCACCT ATATTTGGGGTCATTCTTTAGGCTCTGCGTAAGTAAAAGAAGTATCGCTA TTTATTTGATGAAATAACTGATGTTGATGGTTCTCTCTTACATGATTTCC TCGCATGAAAGCTAATTCTCCACCCTGGTTTTATTTTTCGAAAAAAAGAA GTATTTAACGCCATCGGGTATTTTGGATAACTTTTCTCCTATAGCGAATA AAAACTTCAAATACGGAACCTGTGGTGTATTTATGTAGTTTCCCTTATAA TCGCACGATGGGTTATTTTTTCTTATTTGGCGCGCCCTCAAAGGGAGCAA TTAATCGTTAATTGCATCCTGTAGAGAGCAATTAATCGTTAATCACACTC TTCAATGCCGCGCCAATGTTAACAAAATTGATTTTAATGTTTTTTTTACA TTTTTTTTGCATCGAACGTTTTAATTGCATTCGAAATTTATTTTGTGAGA AAGAAAATCAATGGGGCAAATTGTTTCGCTTACACTTTTGCCACTTTTGC CCTTGTTCCCACTTCTGCCACCATCATGTTGAAACATTTTTAAAAAGTGT GAAAAGTAGCTCCTTCAGCTAGCTTGTGTCAGGCAATGTGTAAAAACGAG ACCACGTTCCTTCTAATACGGGCCCGAAACAGTGGTCCTTCTAGGTAAAA TTCCGACGGCAACAGAGCCTTATTCTAGGTCTTTATATTACATTTTCAAT CGGTACAACATAAATTATGCCTTCTGCCATCTTTGAATAAATTTATTCTC TAGTTACATAGCGACGGATAATTAATGCAAAATTAAAATCAAATTTATGC ATTCGAAAGCTGCCATTTTGTTTACCACTTTTCACACAAACTGCGCGAAA CAAAACAAATTTGTTTTTTGCTTGGTGGAGATTGAGAATTTACCACTTTT AACACAAAGGACACAAACGATCATTTGGAATTAGGTGGTAAAAAATGTAA GCACTTTTGCCACTTTTAGACACATTTTGTAGAAACAATTTGGAACCTGG TGGCACTTGGGGCAAAGATGTGAAAAATAGCAGCGAAACAATTTGCCCCA ATAAACAACAATAAAAGAAAGACATAAAAAGAGAAGAGAAAAATATAAAA CTCTCAGTGTAATTTCTGTAAATTACTTTCCTAACTGGGAAAAAGTAGGG AAAGCCATTGTGCAATTAGCTTGTAATCACATAATAACTCGTACAATTCG AAAATTGCACTCGTGATTTTTTTGTTTCGAATTTTAATTGATAACAAAAA AATCACTCGTGCAATTATATTCGAATTGCACTCGTTATCATGTGATTACA TATACTAATGATTTCTTTTAAATTCTAATTTTCCAGGGTCGGAGTGCAAT TGGCAGCTTGGTTGAATACAGAAAGTAAACCATAGTATTACTAATTGATA ATTTATCTACAACATCAGCCCCTCTTTTCTTTAAAGTCCGCAACAGTCAA GCATAGCGTGGTTTGCAAAGATACTTTTTTTAACTCATATCTAGTTTTTG TAATATCTACCTCGAAATTAGTTTGACTTCAACTTGTTTTGACCGTTTTT AAAGGGGATACGTAGATTATGATGTTCAGTCAATAATAGAGACTAGTTTA TTTTCCGATACTCGGAGTTTCGTGCCGTTTCAGGCAGATTTTAAAAAAAA TTACAAAAACGACATTCGCAATGTCAATCTTCAATTATACAGTATGGTGT CTTCATTTGTCAAAATTGACGTCATTTCAGTCTTTGCTGTCAAACAAGGC GAGAGTGTGCTTGTTGACATGTCTACATTTTGATATCAGTTCAGATTTTG ATTTCTCGCCTTGTTTGACAAATAGATAATGATGTTCCATGCTTTATATT CTCAAGCTTTCTCACCAAAATCCCTTACAAATTCTGACAGCTTGACACCA AAACCTAACTTCATTGGTCAATATTTCATTCTACCCTGATAATAATACTA TAATAGATTATTCTAAACTGAATGGTTGAACCATTTTTTTTAGATTCTCG ATTGAATGGGTTGATATTAGAAGCACCGTTCAACAATATGTTTGATGGGA TCAAGCATAGTCATCTTGCCGCAGTGAGTACAAAATAACATTTTACAGTA TCTTCTGAATCAAGGTTTTTTTTAATGGTTTTGATTAGATATTCTTAGCC CTACCCTACTTTTCTATGATAGACATTCTAATGAGGCTACTCTCGGTTAC CTAATAGCCAGGGGGTCGGAATTTTTGAAAAGGAGGCTAATACAGCAGAA TTAAGACAAAAGAAGGAAGTTTTAAAAATATTTTCCCAAAAATTAATAAG CGGGGAAGTTAGAATAACAATGTCCTGGTTGGAAAATTTTTGAAAAATTA ATTAGCAGGGGGGATGGCTATTAGGTACCAGAGAGTAGAAGTCTTACTGT TCTTTTCAATCTGAAAGAAAATGTGTAATCGTTTACTTTTTTTTATATTT GCTTTTTGAGCTATTCCGCACTGTTTACCCACATTGATGCGGGTGAATGT GGGTCAATGTAAAACTTTTTGTTTGTTTTTCTTTAGCCCGTGATCCCATT CATTCCAAATTTCGACAGTTACATTGAAGATGTTAAAGAAGTTTTCAAAA GTGATTATTGGTATGTCAAACAAGGGTCCAGAAATTCGATCAATTATTTT ATTTTATTTTGTGGAACCTATTTTTCTCTTGGAGAACCGTCTCGTCATGA TTAACATTAGATAGTTGACTCTCGGTAATTCGTACACGAACGGGAAATCT TATTTGTTCGAATTACAGAGAGATTCGAATCATGGAAAGTATTTGTAAGA GGGTTTCTCCTTGAGGACGACTGGGAATAAGTTTGACTTTGAAGATTTGA ATGATAGAAGTTCGAATAAACGAGAGTTGACTATATACGCAAATACACCA GTGTCGTAGCTATCGGAAAAGGAAAGGGAGGGAATTTTACACCCCCTATA ATCTTTCGAGAAATGTTTTTTAAATATATTTCTCTGATGAATTACTGCTT TCTCTAAATAAAATGAGAATTTTGGGTGCATTTTCCAACTATTTCGAACT TAAAATTGCCCTCTTCTTGTCACTAAACCTCGACACTGTTACATTATTAA CTGTTACCTTCTTTCAGAGTGGTCAAAAATCAGTTCACCGCGCTTCAAAA GCCAATTTGATATTCATTAGTGTTAAAAGTTTTTTCCGTCTCAGACGTAT CTTCTGTCTCAGCGAGTTACAAAAATTGGCTTATTTTTATTTGAGGAACC TTGTCTGATTTGTTGCTCATAGACTATTTTCCTTTTGAGAAAAAAAACTT TATTTTTGCCACTGGTATCTATGTACAAAATTGAATAAAAAACTTGCTTG TGTGGTGTCAAGGCCCTTGGGACAAATTTGACTAATTTTGACCAAATTTT GAAGAGTGAAAAGTTGCAATTTTCCTATTTCTCTGACCCTCAGCGGGACT GAAATTTGATTTTGTGATTTTTTCCGACCCAGAGCGGGACTTGGATTAAA TAAAAGATCAAATATTATTTCTATTTTTTTAGGATCAAGAAAGTGTTTTC TTCAACTCTCATATTACATGATATTAGCGATCATATCTTAAATATCAAAT TAGCGAGAAAGGTAAACCTCGTGCTATTTTGATTATCCTATACAGCATAT TAACTCTCAAGCCAAGTAGGTTAAATTTACTTGAGGGAGTTATAATACGT CCAACTCTTTGGTAATCCATACAACCTAATAGCACTCGTTTAGGGGTACT TATTCATACATTAAAAGAAGCAAATTCCGATGTACTTTAACGAAATTGCT TTGTTGAAGATAATTTCTCACTTAGAAATATTATTAACCAAAATCATGGT TTTTGACGTCATATAACGATGACGTCAAAAATTACAAGGGTAGGGGTGTT TTCGCCTGAAAAAAGTATATCGAGGGCTAAAACAAGCTCGCATCTAAAAG ATATCTGTCATCTGTACTTTTTTAAGGGATTTTCTCGTATAAATTAAGAA TCACTATTGCTATTCCTAATACCTTAAGGAGTCAGTCAACGGGTTGACCA TGAATTGATCTGTGTCTGTCAACGTTTCCACCAAGATCTGTGTTAAGAAA CATTCGGTCCAAATAAACTAGTGGATGAAATATGTGAATGAATCCCGGGG GTACTAGGGTTGAGGGATGCTGGTATGTGCGTGTGGAGGTCCATCCAAAC CCTGACCCCTAGAGAGAGTTTTTTGAAAAAAGTCCTACCCTTTAAGAGAC TCTATCGAAGTCAAAAATAAATCTTCCTTCAGAGAGACTTTGGAAGGTGA AAAAACCGACCCTTAAGGCACGCACATACCCAGCACCCACCCCCCCCCCC CCCGGATTGAATATGAATCCAAATATGCATGTAACTATTGATCACAATTT GATATTTATCTTTCGCCTTTCAGCTTTATTTCTCAGCAAAAGAGACTGGC TCTAGTAATGTTCACATGATCGAGCTCAACGAAAAACTCTATCACAATGA CATTTATAAAGCTAAACATTTCATTAAATATATTGAGTAAGTAAAATCCT ACCTGAGGCACTCGTTTTCTAATGTTTCTTCTGGTTATAGTCAGAGGGCG AAAAGGTGCACTAGGACTACGGCACATGTGTTTGTTTTCTCAATTGGGAT GGCAACTGCTGAACTGAAAATTTTCTTTAGATGAACTCTAAGAACAGGCG ACCTTTGGAGGAGGCGACGACACTAATCCTGTTTTTTGAGGCTAAGGACG GGTTTTTTTTCTCATTTTCAAAACTTGAAAAGCTCTAGTAACCTTAAGCT ATTGAAGTCAGCCCCCCTATTTAGAACTATAGTACCTTGCTAGATCTAAA GCACCATTTACAAATTTGAAACTCAACGCCAGTTGACTTTTTTTCAACAA TCTATCTTCCTACTTGTAGGGAATTCATGGAGCATACGGGATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000203_pilon:151831..161074-

>XLOC_034199 ID=XLOC_034199|Name=XLOC_034199|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1998bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000203_pilon:151831..161074- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGAAAGAAAAAAGTCCTAAAAGGCAAAAGAATGCAGAGGAACCAGA
ATCATCACCAGGATTGTGATGGTGAAAGAAAAAAGTCCTAAAAGGCAAAA
GAATGCAGAGGAACCAGAATCATCACCAGGATTGTGCTCATCACTTTTCT
CAACGATATTTTGGTCTTTGTGGACTTTATTGGCGATAGTGACAATTTCG
TACATTTCATTTGGTTTGTTGATGTTGTACTCCACTCAAATGAAGATGGA
AGTCATTTTCATGAATAGATCTCATCACTTTTCTCAACGATATTTTGGTC
TTTGTGGACTTTATTGGCGATAGTGACAATTTCGTACATTTCATTTGGTT
TGTTGATGTTGTACTCCACTCAAATGAAGATGGAAGTCATTTTCATGAAT
AGATTAAATCAACCATTCTTTGTCAATTTATCTAATTGTAACGAGTTTGG
CATCGTCAAATGTGAAAATATAGTTCTCGATGGTGGTCAAGGAAAGATTG
GGGCATGTAAATCAACCATTCTTTGTCAATTTATCTAATTGTAACGAGTT
TGGCATCGTCAAATGTGAAAATATAGTTCTCGATGGTGGTCAAGGAAAGA
TTGGGGCATGGATGATCTCTCCATCCACCGACCAATATATAACCAAAGAA
GCATATATTCTCTATCTGCATGGTAATATGGGTAGCAGGATGATCTCTCC
ATCCACCGACCAATATATAACCAAAGAAGCATATATTCTCTATCTGCATG
GTAATATGGGTAGCAGAGCATTAGGTCACCGAGTTGAAATGTACAAGAGC
ATTAGGTCACCGAGTTGAAATGTACAAGAAACTATCAAGAATGGGGTATC
ATATTTTGACAATCGATTATAGAGAAACTATCAAGAATGGGGTATCATAT
TTTGACAATCGATTATAGAGGTTTCGGTGATTCAGATGGCTCTCCAACAG
AATTCGGTTTCGGTGATTCAGATGGCTCTCCAACAGAATTCGGCCTTTTG
GAAGATGCAAAGATTGGTTACAAGTATTTGAAAGAAAGAGCGCACGGTCA
TGCCACCTATATTTGGGGTCATTCTTTAGGCTCTGCGCCTTTTGGAAGAT
GCAAAGATTGGTTACAAGTATTTGAAAGAAAGAGCGCACGGTCATGCCAC
CTATATTTGGGGTCATTCTTTAGGCTCTGCGGTCGGAGTGCAATTGGCAG
CTTGGTTGAATACAGAAAGGTCGGAGTGCAATTGGCAGCTTGGTTGAATA
CAGAAAATTCTCGATTGAATGGGTTGATATTAGAAGCACCGTTCAACAAT
ATGTTTGATGGGATCAAGCATAGTCATCTTGCCGCAATTCTCGATTGAAT
GGGTTGATATTAGAAGCACCGTTCAACAATATGTTTGATGGGATCAAGCA
TAGTCATCTTGCCGCACCCGTGATCCCATTCATTCCAAATTTCGACAGTT
ACATTGAAGATGTTAAAGAAGTTTTCAAAAGTGATTATTGCCCGTGATCC
CATTCATTCCAAATTTCGACAGTTACATTGAAGATGTTAAAGAAGTTTTC
AAAAGTGATTATTGGATCAAGAAAGTGTTTTCTTCAACTCTCATATTACA
TGATATTAGCGATCATATCTTAAATATCAAATTAGCGAGAAAGGATCAAG
AAAGTGTTTTCTTCAACTCTCATATTACATGATATTAGCGATCATATCTT
AAATATCAAATTAGCGAGAAAGCTTTATTTCTCAGCAAAAGAGACTGGCT
CTAGTAATGTTCACATGATCGAGCTCAACGAAAAACTCTATCACAATGAC
ATTTATAAAGCTAAACATTTCATTAAATATATTGACTTTATTTCTCAGCA
AAAGAGACTGGCTCTAGTAATGTTCACATGATCGAGCTCAACGAAAAACT
CTATCACAATGACATTTATAAAGCTAAACATTTCATTAAATATATTGAGG
AATTCATGGAGCATACGGGATGAGGAATTCATGGAGCATACGGGATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_034199XLOC_034199-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000203_pilongenomesc0000203_pilon:151831..161074 -
Properties
Property NameValue
Aaloc976-999:25
Aaloc862-972:522
Aaloc784-861:1412
Aaloc709-780:2409
Aaloc631-708:2950
Aaloc592-627:3608
Aaloc499-588:5009
Aaloc463-495:5386
Aaloc415-459:5929
Aaloc385-414:6403
Aaloc307-381:6961
Aaloc205-303:7366
Aaloc70-201:7751
Aaloc1-66:9245