XLOC_034192 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_034192
Unique NameXLOC_034192
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000348_pilon:957..11753-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034192 ID=XLOC_034192|Name=XLOC_034192|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10797bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000348_pilon:957..11753- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGAAGTTGCATGTTTGACGGCGAGCCTTGTGACCCTGGTGATTTCTTAGA AGTGGTATCTGCACATTACGGTCTTTGTTATCAATACAACTCAATCTATC TTGACAAAGAACCGTTTAAAGTATCCAGAGGTGGAGAAGGTATTATAGGT TCAAAGAGGCCCCCCATCGGTAAGTCCGATCATGATATCACGCAACTTTT TGTCTTCAATCATGATCGTGAAAATTTAGATAATCACGCATCCCTTTGAA TCACGACTCAAAAAAATCGAATCAAAATTCCAAATCTAGCAATCACGCTA GAAAAAAGTACCTATCATGTCATCACGAAAACCGCTTGGGGGACTCACCA AAATCTGGTCACGATGAATGTGTACTCTTCTTTTCCGTGGAAACCATTCT CAAGGAAATGAGTTTAACATGGTTTCCATACGAAAGCAAAAGAGATTGGA TTCCTTCTTTTGAAGAGATCCTAAAAAGTTTTGGTTTACTGCTAAAGAGA AATATCGCAAATTCAGTCTGATTTACTTGAGAAATTAGTAGAAAGTCGTT TACTATATTTTGACGTTTTTATCCAGATTTAAAGTCTATTCAAGAAAAGT GTGCTCTCTTTTTCTTGGGAAACTCTTCACAAAAATTTTTTTTGATTCCT ATGAGAGATTGGTTTCCAAATGAAAGTCATACTGAACCATTGAGTTTAGC AGTAGAAACTTTTGGATGGGAAATGAAGCTACTTAATTTCTCATACAAAA AGCCCACGCGTGGTTTTTACACAAACGCTGGATTGAAAGTAAAATCTCTC GCTAAATTCCAAAAAATGCAGTCCTCAAAAACAAGGGAACCCCTAGATAC ATTCCGTCGTCATGATTGCGGCGTTTTCTAGGCGCGTTCTAGGCGCGTTC TAGATGGGAAATAAATGGCTTCACTTTTTCTTGCCTGGGAAAGGTAGAGA 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TCATACTTAAAAAGAGGATGGACGAACTGAAATCAATCTTTTACCCTGTG GACATTTTGGAATACATTTTACTCCCTTGGAAAAATGAAAAAGGCCCCCC CAGGAAATTTTTTCTCGGATTATTACCCTCTGGAAATGTTCGTCCACACC ATGAACATATAAACGACTGGACATCCATCTCCTTTGTCTTTTTGTAGAAA GGGCTGCTAGCTTCGTTGCCGCCTCGTTAAAAGCATAAAATGAAACAATA GATTTTGATGATATACCACTTAGGAATACCTTGCTAACAACGTCAAAACT TTGACAAAAGTCTCTGTTGTTCTACTCTTCTCAAGTCTTTTATCTATATC ATAAAAAAGATAACAGAGGCAAAATCATCGTCAGCTTGTCAAAACTCCGA CTAATTTATCTAATTTTTGACTTAAAGTGTCTAATAATTTTAGAGAGTGT CACATTCTAATTTCGATATTCTTATTACACAGGCTCTCAACTTTGGCAAG CTATTTTTTTCAAGTCATAAAAAAAATTATTGGAGTGACAAAAGGGATTC AAAAGTATACACGCAGTTGAAATTCTGCATTTCAAAGTTGAAAATATTGA TAAAATATATTACAAACTTGTAAAAAAATTCGAAAATAATTTCTTTGTAC ATTAAGAGTAATGTTCAAGCTCTATCAATCCTTTTACCTAAATAATTCGA AGAAATAAAATTATGACGGAATATTGTCGGATTTTTCATACCAATTTTGA AATACAGGCGGCAACGAAGCTCGCTTCAAAGAGACAACAAAAGATAGATG TCCAGTTGTTTATATGTTCATGTCCACACCTAGTCTAGCAAGCTAGACGA CTAATTCAGACATAGTAGAAATAAAGCAAAAAGTAATAGAGGGACCAATT TTAGTTTATACAAACTAAATCCCGTAACAATAATCGTATTATCATATAAC 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AAACTTTCTAAAAAGTATAATTGGACCCACGATGAAGCTCGTCACTTTAT GAGGTACATCTCAGTAGCGTAGGCAAGGGGCACAAAATTTGTGTAGGAGA GCAGATTTTTATGCCACAGTAATATCTTTTTTATATTATAAATAGATAAT TGCAGTGTCATAAAAATCTGCTCTCCTACACAAATTTTGCGCCCCTTCTG CCCACGCTGCTGCATCTTCAAACTATGACGACTCACACATAATCTACGGC GCGAGTTTGTTTACAACCAATGGGGACTAATGTTTTTGTTTCTGTAATTT CTAATCGATTCTATGTCGTAATCTCTATAGCAATCTCTATAGCTATATAG AGGCTATAGCGAATGGCAATGTAATTTAGCTCCTTTTTACCTAAAATCGT AAAAAAAATTATAGGCTGAATTTCAAAAATAAAAATTTTATTTATTTTAT TTATTCTTTATTTAAAGTTGGGTAATAAAAATAGATTTACATAAAGTAAC TCTAATAAAGTCCAACTATTATAATTTCAAAAAATAAAAAACAATTTAAA AACAAAATTAAGATAATTTATGTACAAGCCTTACATGTGCAGATTGGTGT AATAGATGTTAGAGCGTTTTTAAAAGAGACTAAAGAGTTCTCATTTTTAA TTGATGAGGGTAATTTATTCCAAGTGGATACAGCTCTAAAATCGAATGTG TTTACACCAAAAGCTGTGTTATATCGTTTGTATAATGGCAAAGCTAGGGA TTGACCGTTACGGAGCTGATAGACTGATTGTCTAATTGTGAAAATTTCAT GCATAATCTTTGGACCAAGATTATGAATAGATTTGAAGACTTCACAAAGA AGGAGTTTTAAATTACGAGAATGTATGGTTTGAGTATTACAATCAGTCAA GAGAGCTTCGTAATCCAACCCACTATTGGACATAACTCGAAGTGCCCTAT GGTGGCATTTCTCAATCATGTTGCTAGCCCCTTTTCCACAGAACATCCAA ATAAGTGGGCAGTAATTAAAAGGTGATAGAATATAAGCATTGACGAGAAA TTTTGTTTGTTCATCAGTCAGGAATTTTCTCAGTCGTCTCAGTGCTCTAA GTTTTTGATTAGATAGTTTACAAAGTTCAGTGACGTATGGCATGAAGGAA AGGTTGATATCTACCTGAACACCCAGTAGTTTAACAACCTCCACACTGTC AATCTTTATGTTATTTATGCACAAAGACGAACTGGCATTGGTAATTCCTG GATAGATCAACTGAAATTTAGAGGGGTTAGCAACTAAGGAGTTATGTTTG ATCCAGTCTAAGACTATGGTCAATTTATAAATAAGATTAGAATTTACATC ATCAATAGTGGGTCCAAAGGAAGATAAAGTGTTGTCATCTGCAAAATTTG AGATTTCCTTAACAATATAAAATAGGTCATTAATAAATACATTAAAAAGT AGCGGGCCAAGGATAGAGCCTTGGGGAACACCTAAGAATACATCAAGCCA AGGGCTTAAGTGTGAGCCTATACGGACTCTGTGCTTTCTATTGCTGAGAT AGCTATGCATTAATTTTATACTTTTTTCCCCAAGACCGTAAGCTGATAAT TTAGCCAGCAAAAGGTCATGGGGAAGGCAATCGAAGGCCTTTGACAGATC GATCAATACAGCTCCCACTTTTTGTTTATCTCCTAGAGCACTCTGCCAAC CTCTGATCAAATTCAGAATCGTATGCTGAGTGCTGTGGCCTTTTCGAAAT CCACATAATAATTTGGAGAAGGATGGTTCAAGAAAAGTAGTAAGTTGGTT TGTTAGGAGACGCTCAAAAATTTTTGATATCACAGGGAGAAGACTTATGG GTCTGTAATTGGTCTTGTCTGTCAGAGCACCTTTTTTGAAAGTAGGAATA ATGTCAGCTAGTTTCAACCTATCCGGAAAAGTTCCAGATATTAAGGATTC GTTGAAACAAGAAGTCAAGAATGGAGTACACGAAGCTGCAGCAATTTTAA GCACACGAGTCGGTATATTCCCACTGACAGATTTTGAGCTGTTCAAACTT AAGATGGCTTTAAAAACATCTTGTTCTCCAACCTGACTGAAGTCAAAAAC CACCCCAGAACTCTTGTTAGATCTTATTTCTTTAATACTGGGATGATCTT CAAATTTAGTTTTCAGAGAATCATCAGAGTTCAGAGGTGATTCGCCATTC TCCCAGCTTGGAATTTCAAGACTATCGGTGATCCTATTAAAATAAGAATT GAATATATCAGCTACCTCCACGTCAGATGTATGCAAAGTTTCTTTTTCCA GCAATTGAATTCTACTTTCAGAAGCACAAGATTTATTAGAAAACAGGGGC TTTACAGCATCCCAGAAATGTTTTGGTTTGCGTGTAGTGCTACTGAAATA CGTTTTCTTTGCCTTCTTATTTAACTTTACAACCAAATTTCTTTGTCGCC TATAGTTAACTCCATCTTCAGGTTTGTTAGATTTTATTGCCAAGGCTTTA AGATGTGATCGCTTCATTATAGCTTTCCTGAGTTCTTTGGAAACATGGGG TTTATTATTGGCTCTAAGATATTTAGTTTTAAGAGGTGCATGCCTATTTA AAATATTAGTAAAGATATTCTCAAATTCATTATAATTTCCTAAAATATTA TTGGCCATACAATAGTCTAACTCATATAAAAAATGGTTCTCATTGAAATT TCTATAATCACGATATTTAATAATCTTTGGAGATAATTTGACATATTTGA TCTTGAGCATTGAGTATATCAGATGATGGAAGTCACTCAACCCTGTTTCC ACTGTTCCTTTATGTTTGATAATTTTTGGTGTGTTTGTTATTATGAGATC AATACATGACCCTGATATTGATTTAAAACAAGTTTTTGATTTAATGACGT TGATCATGTCGTTTAATTCAAGAAAATTCAAAACTTTTGGATCAGTGGGT TCAAGGTTGAAGTCACCTATAATAAAAATATTATCATAATCTACTTCATA AAAATGAATAGCTTCAGACAGTGTTTCAAAGAATATGTCTATACTAATCC TATCTGGCCGATAAATATTAAAAATGAGTATTTTTGTTTTCCTGAATCTA ACCTCAATGGGTAAGATATGCAAAGATGGATCAAGCTTGAATTTAATTAG TTTACGTGCAGGGATATCAGATTTTACATAAGTCAGTAAGCCTCCACTAT TGGATTTACAATCTAGACGAAAAGGGGGAAAGTGATAGCCCTGCCATTTG AATTGGGAGCTAGGAAAGGATTCGTCGATCTTTGTTTCAGCGATAGTAAA TATATCAAAAGAGTTTTCAAGCAGAATTTTCAGGTCAGAGAACTTATTTC TGATAGAGTTAATATTCAAATAGCCCAATAATATATTCGAAGGATTTTTA GACTTGATATTGAAAATAACATTAACATCAATTTCTCTTCCCAAATTAGG AAGCTCAGCATCATCATTATCAGGTCGGTCAATCAAATTGCCATCAACAT ATCAACAGTTACCACACACAAACTTTTTAAGATTTTGAGCAAAGGTCGAG ATACCTCCCCCGTTTAAGTGAAGCTTTTTTGATGCCAACATCTTTCGTGA AATGTTGTTGTGTTCAATAAAATGTAAATTGTACCTTTCACAGAAATTTC CAATGATTTTGTTCTTTTCTTTCACCAAGCTTTGAGAATTTATTCTATCT TCCCTTAAAAGCACCTCAGAGAATATGAGCTCGGTCGAAGGACTAGTTTC CGTGACAAGATTTCTTATAGTTTCCAGATTTTCTTTAGTTTGGCAACCAG ACGTAATGTCGTTTGTACCAGCATGAACAATCAAAAATTTTGGTGACTTC TTCAAAAGAGGTTTCACAAAATCTATCATATCTTCCGTATCTGCACCAGG AAAGTTTTTAACACGAACCCTTGCTTGTTTAGACGATAATCCTTTCCCAT CGATATTGTTCAACAAGCTATCTCCACACACTATAACTTCATTACACAAA TTGGCGTTTTTTGCAGTTTCTGGTTTCTGTTTGAAAGAAACCTTTTTCTT AACAGTTGTCTTTTGCGAGTTAGCAGTTTTTGTTAAGAAATCATCCTTCA TCTTTTGTCGAAAATCTTGAAATTTGATTTTCATAAGTGTAAAAGTCATT AGGCTGAGTTATAGAGATGTCATTATTGATACTGCTATCTAATGGTATTT CATTGATAATTTCGTTAATGTCTTTATCAACTTTTTCATGATCTTTATTC AAAACAGGAACATTTTCGATAGTGTTTTTTGAAAGAGAGAAACTTTTGAT AAGTTGAGCGTTGTTATCGAGAGCGATTTTTAGATTTTCTTGAGAAGTGT TAAGCTGTTGTTGCAAAAGATTAATAACAGTGTCTTTCAGTTCAAGGGTG GAATCCATTTTTATGACTTTTTCATTCAGAGCACTCAAAGTTTCGGTCAC ATATATTTTAAAATCCACAAAGTCGGAGTAGTACATATCTTCCTCTCGCT CGTGTAAAATTGGAGTAGGAACTACAGCTTGCAGCAATGAAAACGTTACC TTTCCTGCTCTTGTAGATTGTTTGATGCATCCCATGGACTTTAGCTTGTT AATGGTAGTTTTGAAATCATCCCCATCCATTTTAAATCTCTCCCAGCAAT CTTTTAGAAGAGTGTCAAAATCACAGCTCTTCTTTTTGTCTTTCCTCTCC TTGATCAGAGCGAGTAATGCATCTCTGTTATCAACAGCTTTATCATTAAC TTCAGGAGGCTCAGTTATTGTTACATTATCCAGTTTATCAGTGACATTTT GAAGAGTTAATTTTTGCGAGAAACTAATTTTGGGAATTTTGTCGAAATTT AATCAATGACGATAACCTTTTCATAAATCAAGTCACGAACATCACTTGCC TTGTATTCAAACAATTATCACATGGTGATTATGTCTCTTGAGACATTAAC ATTAAATGATTTTTTTATCTATAGGAAGTAGTTTAAATGAAATCCGCTTG GAATTAATCACCATGGCAATCATTTCAAAACGAGGCTAATGATGTTTGTA ACGTAATTTATGAAAAGCGGTTTATTCAACATAAAAATATATTTTCCCAC TTGGTATAAGGTTTTGATGTACTTTCTGTGGTATTTCATTACGCATAGAG GATTTTTTACATTTCTGTTTTAGAGAGAATATCTTTGGTATCGATGTTTC ATACACAGATGTTGTTTATATGATGGAATCATTATCTCCTGCTCAAAATT GGATATCGCTTCTCAGTAAGATTGTAATTCTGGCTGAAACTTCCGTTTTA TAATTTATGATGACGGCTATTGGAGGAGTTGACAAGGTTATCAAGGTCTC CGATGAGAATCCAACAGATTTGCAATACCCTATCAGTTACATCAATATGC CTTCTTACCTGTCTTTAAAAATATAAATAAAAGTAATCACGGAAAAGGAC GCGAAAAAAAAAGACATAAGTGTGAGAACAGAGTAATCAAACTCGTTAGA AAAAGTACCATTAGAAGTCATAAAAAATCAACCTGAATAAATGCAATCGA AATTCCAGAGACCTTCATAATTCCCCAAACAACATTACATTACTATGTCA AACTCCTATCACATAAATTTTACAATTACGTCAGAGTAGACTACGCTCGC CACCGAAGAGGTTTATTTGGAAAGGGTAATTATATTTTATTGTTCGCTTC TTTTTTAAAGATTTGCCAAGTTGGAAAAGTATGAATTTCTTTGTACATAT TTTACCTACCCCAAATATTTGGGACGCTGAGTTTTAAACGAATGGTCAAG TTGAAACGAATGATAAATGTATCAAGGTCTGTTTTATTTACCCCCTGGTG ACTTAACAAAAGAGACTTAACTCGATGTTACAATCCAATTATTGAAAGTT TGTATCGGCCTTTTTATAATGAGCGAGACATACGTTCTCTGATTACGCAA TTTTCATATCAACATTTCCGAGGCATTTTGATGTAACTGCCTATTCTCAA ATAAAAACATTGCCTATCCATTTTTATTTTTTAAACCTTCCAAAAACATA CTCCCTGTTTCAACATAATGCTCGGACTTGATTTCTCATTTTTAATTGGT AAGTAAGTAAGTCTGCGACCGCAGTCGGAGGCGACACGAAGGCTCCTCTT TCGATAGCTATCTACCCAAAGGTAGGGGAGGGTGCCACTCTTTCTCCCTG GATTTCTTCACTTACCCTTGATCCTTTTCTTAATTGTTGAGCAACAAGCA GAGAGATCAAGTACAATTTTGAGAATCTTTGGTATGACCAGGTTGGGGGT GGAACCCACAACCTTGCAAACCGTAGCGGGATGCACTACCACTGCACTAC AGCCAGATTTAAAAAAAAGGTGGGGGTTATAATCAAGGTCACAATATTTG AGAAAAAAGGGAAATTCCCGAGGAAGTTTTGAAACCACAATCGATTTGTA AGTGCTCTAAAGTAGGTTGGAAGGGTAGAGTTTTAACTCTGAATTTTAAC GCCAGCCTTAAAACTTAGGATCTGAGGTTCAAAAATAGTCCAATAAGGCT CAGAATGTAACCTGGAAGTCTGCCGACCCCTCCCAAATTGAAATATTCAA TTACATTAAAGAGATCAAAATCGACTTTCTCGCTGGAACTTTAAATCTTG AAAAACGTTAAAATAACCGGAATTCTCAATATATTTCAACAATGATTGTA GGTTGATAAGTGATTTAAGGTGGGGGGTGACCTTTTTTCAGGTGGGGGTT GGAGGGGTGCTGCCCACTATGGACGTGAACTAAACATAGACACCGTTTTA ATGTATTTTCTTTCCTTATAGATGCTATTGGAGGTGGTTTGGGTCTTTGC ATGGGTTGCAGTCTCATTACTTTCATTGAGTTCCTGGTGTTTGGCATCCA GTCTATATATTTGTATGTCACCAGTAAATGTAAGGGCGATTGTCAATCTC AAGTTGAGAATGATAATTCGGAAAAAGACATGAAAAATAAACTATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000348_pilon:957..11753-

>XLOC_034192 ID=XLOC_034192|Name=XLOC_034192|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1956bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000348_pilon:957..11753- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGAAGTTGCATGTTTGACGGCGAGCCTTGTGACCCTGGTGATTTCTTAGA
AGTGGTATCTGCACATTACGGTCTTTGTTATCAATACAACTCAATCTATC
TTGACAAAGAACCGTTTAAAGTATCCAGAGGTGGAGAAGAGAAGTTGCAT
GTTTGACGGCGAGCCTTGTGACCCTGGTGATTTCTTAGAAGTGGTATCTG
CACATTACGGTCTTTGTTATCAATACAACTCAATCTATCTTGACAAAGAA
CCGTTTAAAGTATCCAGAGGTGGAGAAGGTGCTGGACTTCGTTTGTACAT
GGCTATTCCAGAGGATGAATTTCTGGTCAGTCGCGTTCCTTTCAATGGCC
TACAAATCTTTGTACATCCTTATGGGGAACCTTTCGAATCTGCTATCGCC
AAAAGGGTTGCTATTAGCCCTGGAACAATGCAATTTATCCATGTTGAATA
CCGAAAGGTGCTGGACTTCGTTTGTACATGGCTATTCCAGAGGATGAATT
TCTGGTCAGTCGCGTTCCTTTCAATGGCCTACAAATCTTTGTACATCCTT
ATGGGGAACCTTTCGAATCTGCTATCGCCAAAAGGGTTGCTATTAGCCCT
GGAACAATGCAATTTATCCATGTTGAATACCGAAAGTCGGAACTATTGGA
AGACCCTTATCCATCAAAGTGTTCTACAAAGGAGTACGATCTAGTCAAGA
AATTTGTTCCTTACTCACAATCAATGTGTTCTATGGATTGTTTGATGAAA
GAAATGCTCCAAGATTGTGGTTGTATCCCTGCAGAATTCGCACATCATTA
TGTCGGAACTATTGGAAGACCCTTATCCATCAAAGTGTTCTACAAAGGAG
TACGATCTAGTCAAGAAATTTGTTCCTTACTCACAATCAATGTGTTCTAT
GGATTGTTTGATGAAAGAAATGCTCCAAGATTGTGGTTGTATCCCTGCAG
AATTCGCACATCATTATGATGGCGGAAGTAAACCATGTCGTTTTCGTCAA
ATTGAATGTATTGGACCCAAGCTTGATGGCGGAAGTAAACCATGTCGTTT
TCGTCAAATTGAATGTATTGGACCCAAGCTTGCGAATGCTGATAACTTGG
TGCATAGATGCAGGCGTGATTGTCCAAAAGAATGTACCAGCATCCAGTAT
GGAATATCTGTTGGCCAGACCAACATGGGGAATTCAAAAATCATTAGTAA
ACTTTCTAAAAAGTATAATTGGACCCACGATGAAGCTCGTCACTTTATGA
GCGAATGCTGATAACTTGGTGCATAGATGCAGGCGTGATTGTCCAAAAGA
ATGTACCAGCATCCAGTATGGAATATCTGTTGGCCAGACCAACATGGGGA
ATTCAAAAATCATTAGTAAACTTTCTAAAAAGTATAATTGGACCCACGAT
GAAGCTCGTCACTTTATGAGAGAGAATATCTTTGGTATCGATGTTTCATA
CACAGATGTTGTTTATATGATGGAATCATTATCTCCTGCTCAAAATTGGA
TATCGCTTCTCAAGAGAATATCTTTGGTATCGATGTTTCATACACAGATG
TTGTTTATATGATGGAATCATTATCTCCTGCTCAAAATTGGATATCGCTT
CTCAATGCTATTGGAGGTGGTTTGGGTCTTTGCATGGGTTGCAGTCTCAT
TACTTTCATTGAGTTCCTGGTGTTTGGCATCCAGTCTATATATTTGTATG
TCACCAGTAAATGTAAGGGCGATTGTCAATCTCAAGTTGAGAATGATAAT
TCGGAAAAAGACATGAAAAATAAACTATGAATGCTATTGGAGGTGGTTTG
GGTCTTTGCATGGGTTGCAGTCTCATTACTTTCATTGAGTTCCTGGTGTT
TGGCATCCAGTCTATATATTTGTATGTCACCAGTAAATGTAAGGGCGATT
GTCAATCTCAAGTTGAGAATGATAATTCGGAAAAAGACATGAAAAATAAA
CTATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_034192XLOC_034192-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000348_pilongenomesc0000348_pilon:957..11753 -
Properties
Property NameValue
Aaloc805-978:175
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