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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000010_pilon:1847917..1853429- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034059 ID=XLOC_034059|Name=XLOC_034059|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5513bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000010_pilon:1847917..1853429- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCACCGACAACGACATCAACGTCAAAACCTTCGACAACCCAACATCCTTC
GACAATACCTCCGCCATCAGAACTGGTCAACCTTTTAACGAGATTGATGT
CAATCTATTCCTTTGATCCAATAAATGATGATCTTTTTTGTGACGCAGGT
GGGTTTAACTTTTTGGGTACACGTTTTCTTTTATAAGAGCAAACTATATA
AGAACATAAGGCTTCGATGGCCAAAATCTTAAAAACCTGTTAAGAACATT
TGAAGGCTTCGCGGACTCTAAAACACCCGATTTCTTAAAAACTGGACAAA
AATACTCAAAAATTGGCACAAATAAAAGAACATTTTAATTTTGGGTGGGG
GGGGGTCAATGTAAAGTGATTCTGGGGTGATTTTCCCAAAAACCCAAAAA
AGGTTTTGGCACTTTTTGGCACTTTTTCAGGAAAATTTCATAAAATGGTA
TTGGGTGAGGGTGAGTGAACCCTCCCCTATCAATTAAGCACAAGAGTACT
AGGTTTCTGAGGTTACTCTTAGGTGTCAAATAAACGGGGGAGTTCGAATA
AATGGGGGGGGGGTTGCAAAATTTTTTCAAGTTAAATAAACGGCGGGGAC
CTAATTACCGGGGGGGGGGGGTTGGAAAATGGACCTTTAAAAACCCTAAA
AAGGGTCAAAATAGACAAAATTTAGGCTTTATAGAGTAAAACAAGGAATT
TTCCTTTTTGGAGCTGGGAATTTTTTCAAAAATTAATAAACGGGGGTGTC
CTAATAAGGTCCGGGGGGGTTGGAAAAAAATCGAAAAATTAACAAGCGAG
GGGGCCCGTTTATTTGGCACCTAAGAGTAAAGCCTTTAAACCTTAGAGTA
GTTTTCTCCTCAAATTATTCTCGCAACTTTGCTTGTTTTAAGTTCTTTAA
AATAATGATCCTTTGAGGACATAGATTTTCTCTTTCGTGATACACACGCT
TTTTTAAGAATAGTGTACTTTGGATGAGGATCAAATTATATTATTAAGAA
ATTGCCAAAATTGAGGGTGAAATATTCTTCACGTATTCTTACTTTTTTAG
ACTTGACTTTTATACAAATATGAGAAATGATCAATTTGAGACTTTTTTTG
AGTACACATTAAAATCATATTTCTGCCTCGAACTTTCAATTTAAGTCTAA
CAAAAGAAGCTAACGAAATACAAAATTGACACGGATATGTGAAGCAAGAT
TGGTCAGAAAGAAGAAAAGAAAAACATTTTTTGCTTATATCAGCATAATA
TAACAATAGCAAGACACTGTCCTGATATGAAATATGTGTCTGATATGAAA
CGGAAATAATTATGTAAAAAAAACCTTTATTAAAGTTATGTGTTTTAACT
CGATGTGCTCATTTATTCTTCTAGGGTATTGTGTCAGGTTAATATCAAAG
GATCCTGTTTGTTACCAAGCGAAGGATGACAAACCTGGTAAATTTGAAGC
AACTTACAGTGGAGAGATCGTTATGGTGATCCTCAAACATTTTTCTGGAT
CCATTTCATGTTACCCTGGTACAAATTATTTCATTACTTAGGGACCACCA
AAGACTAGGTTGCTCATTTCCTACTGCCTCGTTTGCTATGGCCCCTATAA
CTTATACAATTAACCCTATTCGGCCTAGGGGGGCTGTTTCTGTTCGGAGG
TCAAATAATTGGTAATAGCTCCTGAAATAATAGAGCTTTTGTCATGAAAT
TTTCTGTAAATTCCTAACTTTTATTTAGCTTCAAAATAAATAAAAAATTG
ACACCTAAAAATTTTCACACCTTGAACATGATGACATTTCTGATAGTAAG
GTGTCACAAAAATTGACACTTTTCCAATACAAATTTATTTTCTATGTCAA
ATTCATCGTTCAAACCGTAATTTATTAAATATTTAGGATAAAATAAGCAT
TTTTTTAAAAATAAAATAAGCATTTTAAACCTTTGTTAGAATACAAAAGC
TATTTTTGTGAACAAAGGAAATTTTCGGATTTTGCTCACTTTGGGCATGA
TGAGTGACGCCATCAAAAAAATGTTTGTCAAAAGTTACCTTATGTGACAA
GAATCTTGTGTGTCAAATTTCATCCAAAACGACCCACTAGATCAAAAGTT
AAGGGGTGGTACAGGAAAAGTTTTTTAGTTTTGAACCACCCCTAAAAGCC
TAGTATGAATAGGGTTAAAGTAAAATTATTTCTCTCATTTAAAAATCACA
TAAATAAGGTTGTCCGTAGGAGTAAAAAAAACAGCAAAAAATGGAGTTTT
TCGACCACTATTTATCTTCAATTTCTAAAAATTCTTTGAGTTATTTTTCC
CAAAGCTTAAAGTACTCTGAATTATCTTTTAAACGTCATATGATTTGCTA
GATTTGGAGGATTAATCGGAAAATAAAAAGCAAAACAAACACTGGGCGAA
ATAAGAGATTTCCAATCCTGGAAATATCTTGAAAATATGATATTTCCATT
CACTTTTGTAAATATGGAAATATGACTTTTCTATATTTCCAAAGTTGGAA
ATATTTTGAAAATATGATATTTCAATGAATTTCAGAATTGGGAACATCAT
GAAATATGATATTTCCACAGCTTTCCAAGATATTTCCAGGATTGGAAATC
TCTTATTTCAACCAGTGAAAGATTAGTACACATTTGAGGCGAATGAACTA
TGAATCTAAATTTAAATGAAATAGTTTTAACGGCCATCAAATGAGCAAAA
AATCTGTTTAGGTCTGAATTAACACAAATCTATACATGTATTCAAGTAAT
TTAATAAAGTCTAGTGGGGATTCAATTCAGTCCCGGGGGCGGGGGGGGGG
GGGTACTATGGTTGCAAGCTGACGAGGGGTGCCGCCCATCTTTCGACCCT
CGGACCCTTACCGAGAGGAGAAAACAAAGGAAAGTTTTGTGAATTTTACG
ACCCTTACCGGGACAAATTTGACGAATTTTGACCAAATTTCGATCTTTCA
GGGGGTAAAAAGTTGAAATTCTCCTATTTCTCCTACCCTTAGTGGGACTG
AAATTTGATTTTCTGATTTTTCCGACCCTTAGCGGGACTTTGGAAATCCA
AAAAAGGTACCCTTAAGGGCGGCACATACCGTACCCTCCATTTGTCTAAG
TTGTCTAAGTAGCCCGCCCCCGCGGGCGAGAAAAAAAATTAGCGAAAACC
TTTTTCTATAAATCTGAAAAATTCTGATTCGCGAAACAGAAGAATTATAT
CAAATTAATATTAAATACTTAATGGGGATGGATATCAAATATTAAGATCA
GATTTAAGGTAAATTTGTCCTTTTTAGGCCAATATTTGTTTAAAATTCTA
TTTTTCGAAATCTAAAAATCCCGACAGTTTATGCTCGTGAGAGTAAATGT
CTTCAATTTAGCAAGTTTTTCGAACGACATAAAATATATACGCCTAAACT
AATATAGTTGACTCTATCTAATTCGATCTTCATGGGGCCAAAAACTTTCC
TTCGAATTAGAGAAAAATTCAAATTACAGAGAGTAAATTTAACCACTTTC
CACCTGAGGGAACCAATATTTTAGTTCAAATTACAGAAAGATTGCAACCT
TTTTCTACCATTTCTAGGTTATAAAAGTTATTGGTTTTGCAAGAAACTTG
GTACGGGAGCACACATGAGCCTTTTGCTAACTAATAAAGCAGATCAGAAA
CTCGATTTCGACTCCGTGTTTATTCGTAAGTTTTAGCAAATTATTTTCTT
ACTGATTATAATCCCTGGGTCATTAGATTAAATTCGTCTATACTTCGCAG
GCAGTAATATAGGCGCTTTAAAATAATATGAGAGTTTGTGTTGAACTACA
ATCATGGTCGAAACAATTTCAGAATTTAGTGTTTTTCAGAATTTAAAGTT
CGGGCGACAATTGTTGTTTTAGCACTTCCACTTTCTTTCATCGAATATTC
CGATTTTGGAGGGGTTCGGTGGCTTCTAGGCTATATATTCCAAGCCTTAT
TGGAGCTAATTTGAGCTTTTAAATCCTGAGATCCTAAGGTCTTAAGTCTT
AAAACTTAGAGTTAAAACTCTACTTTCCAACTGTAGTTTAACCCGCTTAA
AAATCTTTTGTGGTGTTATTTGAAATTTCGCCGGGAAATCTCCTTTGTCT
CAAATGTTTTGTCCATGATTGTATGGTTTTTAGTTTTCGCAGCATACCCT
ACTTAGGCCCGTCTAAGGCAGAACAAAGGGAGGATGGTGGGTTGGGAAAA
TCTTCAAATTTTAATAAATTGTGGGTCCTAATTGTTCCTCTAAATACCTC
CAAAATAAGGTAATTATAGACTAAAACTTGGCTATTTAGCGCAAAAGAAG
ACAGCTGAAAATATTTTCAAACATTAATTGCCGGGGGTCCTAATCATAGA
TTTATAAAGCCCCGAAGGGCTAGATGTCGTGCTTTCGCTTAAAAGTGTGC
CAAGGTTAAGTAGAAAATCCTACCTAGGTCACGTGACATTACAATAGACT
TTCAGCGCTTGACCAATAAGAAGCTTCGCGGGTTTTCGAAAGCAATAGCA
GCAATCTTTTTTGAGATATTTACTTTTTTTTGCTTGGAAGAGCTTAAAGC
ACAACATCTAGCCCTTCGGGCTTTATAAGTCTATGGTCCTAATAAGGTCC
GGGGTTGAAAAAATCGAAAACTTATCAAACGGGGGGGGGGGGGATATTGG
ACTTTTTTGAACTCAGTTGAAAATTATGTTCTGTTTTTTTTATTTTCAAG
CGAGACTTTTAGCTATAAGATCATCTAAAATTAACAATTTTCTTTTGAAA
TTTTAGGAGCTTTCCTCCTGATATTTTGAGGGAGACATTTCAGATCTTCG
CAATTTTGGAGCCTGTAATAGAGACTGATTTGCTTTTTTATAGATTTTGC
ACCCCCTTTGTGAGGCTTGTGAGGGTTTTGATGAATTCTCCCGTGCAAAA
TGATTTCATAGTTATCACACATTATTGTTTTCAGTTTTTAGATGACATAA
CTATCAAGAAAGAAAGAAACAACAATCTTTCATTTTTGTACAACTCTAAG
TTCATGTCTTTAGATAATGATCAGCTACTGAATAGCTTTTATCAAAATGA
AATACAGTAAACTCTCTCTAATTCGAACCTCTATTATTCAAATCTTTCTA
TAATTCGAACTAAAATTTTAGTCTCAACTTCAAAGTAGTATAAAATTGTC
TCTGTAATTCGAAAAAAATCCCTGGTCCCTTGAAGATCGAATTAGAGAGA
GAAAGTCAACTCTAGTTGTTTTTTTCTTAATGATTTTGTAAAAGCTCGTT
ACAGTTGAAGCACTATTTCAAACACTTGCAAACTTGATATTTTAGGCGAT
ATAAATCCAGAAATATTTGCATTCAAAAACGAATTGGGTTATGAAGTCAC
AGAAGGTGATGAATTACGAATCTGGTTTTATGAAGATCGAGAAAATCATT
TGGAAGATGATAACAGTGGAGAGCATTGTGTTTATGTTCATGTCGCATAT
AAACGTGATACGATGACGGGTACAAATGTGGTTACAAATTTGGTTACAAA
TTTGGTTACATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000010_pilon:1847917..1853429- >XLOC_034059 ID=XLOC_034059|Name=XLOC_034059|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1236bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000010_pilon:1847917..1853429- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCACCGACAACGACATCAACGTCAAAACCTTCGACAACCCAACATCCTTC
GACAATACCTCCGCCATCAGAACTGGTCAACCTTTTAACGAGATTGATGT
CAATCTATTCCTTTGATCCAATAAATGATGATCTTTTTTGTGACGCAGTC
ACCGACAACGACATCAACGTCAAAACCTTCGACAACCCAACATCCTTCGA
CAATACCTCCGCCATCAGAACTGGTCAACCTTTTAACGAGATTGATGTCA
ATCTATTCCTTTGATCCAATAAATGATGATCTTTTTTGTGACGCAGGGTA
TTGTGTCAGGTTAATATCAAAGGATCCTGTTTGTTACCAAGCGAAGGATG
ACAAACCTGGTAAATTTGAAGCAACTTACAGTGGAGAGATCGTTATGGTG
ATCCTCAAACATTTTTCTGGATCCATTTCATGTTACCCTGGGTATTGTGT
CAGGTTAATATCAAAGGATCCTGTTTGTTACCAAGCGAAGGATGACAAAC
CTGGTAAATTTGAAGCAACTTACAGTGGAGAGATCGTTATGGTGATCCTC
AAACATTTTTCTGGATCCATTTCATGTTACCCTGGTTATAAAAGTTATTG
GTTTTGCAAGAAACTTGGTACGGGAGCACACATGAGCCTTTTGCTAACTA
ATAAAGCAGATCAGAAACTCGATTTCGACTCCGTGTTTATTCGTTATAAA
AGTTATTGGTTTTGCAAGAAACTTGGTACGGGAGCACACATGAGCCTTTT
GCTAACTAATAAAGCAGATCAGAAACTCGATTTCGACTCCGTGTTTATTC
GCGATATAAATCCAGAAATATTTGCATTCAAAAACGAATTGGGTTATGAA
GTCACAGAAGGTGATGAATTACGAATCTGGTTTTATGAAGATCGAGAAAA
TCATTTGGAAGATGATAACAGTGGAGAGCATTGTGTTTATGTTCATGTCG
CATATAAACGTGATACGATGACGGGTACAAATGTGGTTACAAATTTGGTT
ACAAATTTGGTTACATAAGCGATATAAATCCAGAAATATTTGCATTCAAA
AACGAATTGGGTTATGAAGTCACAGAAGGTGATGAATTACGAATCTGGTT
TTATGAAGATCGAGAAAATCATTTGGAAGATGATAACAGTGGAGAGCATT
GTGTTTATGTTCATGTCGCATATAAACGTGATACGATGACGGGTACAAAT
GTGGTTACAAATTTGGTTACAAATTTGGTTACATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000010_pilon | genome | sc0000010_pilon:1847917..1853429 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 403-618:217 |
| Aaloc | 295-399:1945 |
| Aaloc | 151-291:4138 |
| Aaloc | 1-147:5514 |
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