XLOC_033818 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_033818
Unique NameXLOC_033818
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000036_pilon:1477721..1486234-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_033818 ID=XLOC_033818|Name=XLOC_033818|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8514bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000036_pilon:1477721..1486234- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CATTACGTTACTGGCAATTGTTGCTGTTTGCAGCTGCACAGAGATTTTGG GTAAGATGGTTGCAAGCATTGAGTTTAAAGCCCGAAGGGCTAGAGTAGAA TCTCTAACCTTTCTCAGGCTAGAAAAAGTGAAGCCCTAAAAAATGTGCCG TATTTTTAAAGACAGATTGAATCTAATCTAGCAATACACCTTTCCCGTAA TTCGTAAAACTAATGCGCGCGCATTATTTTGATGCTCTCCACTGTTTGGT CTCTGGAGGTAAACAAACCCGTTTTTGCTTGCGTTCCCTTAGCTTAGGGG AAGTTGGTTTTTTGAGCTTTTCTTAAGTTCTGTGTCGAACACAAAACCCC CTCAAATTTTAGTATGTTCAATCTATTCATGATATTATACCACCCTGAAA ATATTTTGCCAAAAGAAGGTCGCTGTCAAAAGTTAGAGGCTCAAATCCCA CTTTCCCTTTTTTCGAAATTTAGCGGTAAATTTTCCACAGATTTTTGGTT CTAGACTGGATAAAGTCTATGTAAGGCTGAATGTACCTCGAAACCCATAT TTGATGTATTTTTATAAATTTTACCAGCTTTTTTGGCTTTTTTCGACGAA TCTTCTGCCTTTTATTGAAATTCAATCCTCCTTTATATAACAAACGGTCA ATTAGACAGCTAATTATCATTTTTAATGACTGAAACGAAAATACTGATGC ATCAGGCGAACCCTAAAAATATTTTTGTTTCCGGTCCACCGGGTGACAAA AAAAACACTCACCTTGCCGGCCGCAAAAATTTTTTTTTTTCTAAATTTCG ATCCCAAAACTCGATTTTTTAAAGCACTCGTAGAAGTTAAAATGATGGTC TTTCTTTACCTTAAATCTGTAGTAACTTGACACCGCTACAGGCTTTGGCA TAAGAAAAATTCACGTGTGATCATCGCACGCCTAGATTTTGATTTACAGT GGTCTAGGCGTGCGATTATTCAAATACTTAATTTTCATCGTTTATATTTT CAATAGACCTTTTTTCAAAGAGGACGTCCTGTTGAATAATTATGTAGTCC AGCCATAAAAACAATGATAGAGCCATGCATAATTACTGTATCATGTATAT TTTAATAATTATGCATGGTTTTATCATTGTTTTTCTGCTGGACTACATAA TTATTCAACAGGGTGGCCTCTTTGAAAAAAGGTCTATTGTGTTACAATAT CTCTCAGAACTGGCACTCTCTTTCATTTTGAATATTTATCTTCAATTGCC AAGGCTCCAAACTGTGATTACGAAGTGAACTTTTTTGAGAAAAAAGTAGA GTGAGAGAAACATTTCCCCAATTTTTTAAATCCTCACTTTGTGAATGTTT CTTTTTATTTTACTCACAAGTCAGCATGATTCCTTTTATAAAAACAAAGC TGTTTACTTACTGAAAAGTCCCCACTTTGTGAATGTTTCTATTTATTTTA CTCACAAATCAGCATGATTCTTCTATAAAAACCAAGTTGTATATAAAAAA AACATCTTAAAAGTTGAGTTGCAAGCAAGAATTAACAAAAAACAATGCAG GGTTTAGTTTGAGATGAATAAAATTTCATTTCTATAACAATGATCAGGAT AAAACCTTCATTCCAAGTGATTTCTAGGCGTGCATTTTACAGTAGAATAT AAAATATCACGTGCGATAAAATCACACGCCTCAAAGACTAATTCACGAAA GTTTTCCAAACAAACAAAATAACCCGAACCCTAACGATGATGTACGAAAA AAAAAATGCGGCCGGGTGACGACGAAATAAATTTTCACCCGGCCGGTGGA CCGGAAACAAAAATTTTTTTCGGGTTCGCCTCATGTTATTATGCTTCTGT TTAATTTGATAGGTCGATTTTTAACGTTTTCGGGCACTTTCTGAAAGTAA 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AAACATGATAGCTATTTGTGTTTTTGGCTCTGTTTAACCGTTTAACACTC ACACTCATAACTGATTACAATCTTCTGGTATACAAAGAACAAAAAGTGTC AATTCAAAAAATTATCAGCTGAATGGGGGTAAGAACTCAAAGCAATTTCT CAAGGGGACCTAACTCGTTGGGGGCACCATGCTTCAATGGGGGCACCTAA AAAGTGGGCTGAAACCATGTTTTATCCAGGGAAACGCTGTGGCGGCAATG TTTTGCTTTAGTGAGATTGAACATTTTGTTGTTTTGATTTGATCGGGGGA AATTTCTGTACAAACCAAAATATGGCTTCGTTGGAATACCGGTTGAAACA CTTGTGTTTTAGGGTACCTTTTTGGGAGATTTTGGGAAAAAAATAGAAAA TTTTGAGTATAATCCTGGAGTTTTTTAGTTCCGTGCCATTCAGGGTCACT TTTCGCAAATTTTTAAAATGTATGTGCGTCGTCCGACGGGGGTATATAAC GAAAACTTTCTGGATTGGCCCAATTACTCCACCACATTAATTTCCCTCAG CCAATTAAAATGTGATATAAGTTATCTTGTCTCTAGGTAACTGCTGTGAA GTAATTAGTTATTCAAAAGACTGTTGTGTTCGCCAAAACATCTATCATAA CTCAGGGTGTCTACGGGACCTTGAAAACCTTGAAAATGAACCACCCAACC TTGAAAACCTTGAAAACTATCAATTTTCTGGAAAAAACCTTGAAAACCTT GAAAATCGTTAAAAACCTTGAAAAGCACTATCCAGTCATTCAAAAAGTAA GAATAAGTAAAAAACCCGCCTGCGGCGCTAAACCTTTAAAACATTTAGAG AATTGCATATTCACCTGTTTCTGTTGCGATTCTGTCGCAACGAATGCAAC ATATTCTTTTATCATTAGCTGAGTTTTTGTCACTAATTTTCCGTTTGCAT GAGCCCTAAGAAATCGACTGCTCCCCAATTTTCAAATCGCTTCAGGGCGT CTTGGAATAATGGCTGTTCATCAATAAAATTTCGAGGATTCCTTAAAACA ACTCTTTTGGAAATTGATTTTTGTAAAAAACAAAATTATTTTTCTTTCAC CTACCACTCTGAAAAAAAACTAAATTCCTGTAAAATGCCATGTCAACTGA GTATCAAAAAATCTTGAAAAGTGCCAAAGTTTTTGCCAAAAAACCTTGAA AAACCACTTAAAAATGACCAAAAAAACCTTGAAAACCTTGAAAATCCTGA AAAAAATCCGTAGACACCCTGCAAGCTTTTCTTTATTTGACATCATGGCA AGTATAATCAATTTATTATTTGAAGTAAAAGGGATGGTTATTTAGATAAG AACATAATTTCTCAATCAAGATTGATTCATTATCATCGTTGACTAGCACA CCATGTACATACACACATGATCTTTCATATTATTCTAATAATATCTTGAT TTAAACTGATTTTTACAAGTATCAAAGCAAATTTTCAAGGACCATGAAGA AGACAAATATTGGAGTAGCAGCTGCCAGATGCAGGCTAAGAGGCTCACAA AAAGAGTTAAAAGGTCAAGGTCCCATGGTATATTTGATGAGAAGAGATGT ACGTGTAGATGATAACTGGAGCCTTTTACGATGCCAAGAAGAAGCTCGTC CAGTCAGAGTTGTTCACGTAGTGGAGGAAAGCCATCCCACTTATCGTTTA GCTTGGTTCTATGCTAAAGGTTTGGAAGATGTACAGAATGGTTTGAAAAA GCTTAAAATTCCATTTGATACAGTACCTGATATCAAATCATTAAATGATT ATTTTGTTGAAATTGATCCATCAGGCATAGTGGCTGATATGCACACCTTA AGGGAATTTGATCTCAAACCTGTTATTGATATGTGTAACAAGCAAAAATT ACCACTTTGGGAGGTGGACAGCTACAATGTCATTCCAGTATGGGAAACAT CAGATAAACAAGAGTATGCAGCTAGGACCATAAGGTCTAAGATAAACAAA AAACTTGATCAGTACCTTACTGATATTCCTCCCACTTCTTCAAACACTCA AGATTTGAAGGGTTATGGTAAAGAGTTTAATGCCATAGAAATGCTTGAAG AAAGGTGGAAGCAATCAAATGAAATACATTTGAGATTCACTCCTGGTACT AATGCTGGTAGGGAAGCTCTTGAGGAATTCTTGAGCTCTCTTGCTATTTA TGACAAACTGAGGAATGATCCTTCAAAGGATGCCACTTCTAACCTGTCTC CTTGGTTTAGACATGGTCATTTGAGTAAACAAAGAGCTGCATATGCTGCA CGAAAAAGCAAAGGTTCATCTGATGGATTCATTGAGGAGCTAGTAGTGAG AGGTGAACTTTCTGAGAACTTTGCTTTTTACAACAAAGATTATGACAACT TAAATGGTGGTCCAGCTTTTGGAAAGAAAACTTTAGAGGATCACAGGAAT GACAAACGACCTCACACTTATTCATATGAGAAGTTTGAAAATGGTGCAAC ACATGATCAACTTTGGAATGCAGCTCAAAAGCAGTTAGTGAAGGAAGGAA AAATGCACGGTTTTATGAGAATGTACTGGGCAAAGAAAGTCTTAGAATGG ACACAATCTCCTGAGCAAGCAATTGAATTTGCTGTGCGACTGAACGATAC TTATGGATTAGATGGCCGTGATCCGAGAGGCTACAATGGAATCTTGTGGA GTATCACAGGTTTGCATGATCAAGGTTGGAGAGAACGTCCCATTTTTGGT AAAGTGCGATACATGAACTATGATGGTTGTAAAAGAAAGTTTGATATCCA ATCCTACATCAAACAATATCTCAAGTAGTTGTTTCTGAGTTTTATCTTTG AAGTATCAATTACTTCAATTGTTATATTCATATTTGTTATACGAACCATT TTATTTTGAACTTGACTTCTCGCCAACTTGTTAATTTTAGTTCCTAAGGT TTTTAATGACTATCATATCAAAGAGATAATTTTTACAAAATTTCATCTGC TTCGTTTTCTTGGAGTATGTCCTGTCGAGGTGATCTTTTACATGTACCCG AACTAGAAAAAAATGCAAATCTCGACTTTGTTATTTGGACAGGCCAGGAC AGGCTGAATAAACAGGGCGACATTGGAGTGGCGCTCTTATAGGTTCAGAA CTATCAACCAGTAAAAAATCTAAGCGATCCCACATTTTTTTATTTCTATC AGATTTACTAAAGTTTTCACAGATGACCCAAACTAATTCTCATACTTGGC TTTCTTGGGATTTCATATTTTTATCTTCACACTAACAATTTTCTAATTTT ATTTATTTTAGTTTTGACAAAATCTTAATGATAAAATGGTTGACCAAAAG AATGAATGTGCAATCTGTTTAAGTCCCATTGATAGTAAATGTACCCTAAA ATGTTCTCATAGTTTTTGTGAGTTGTGTATCAAAAGAATAATTAATCATT CTTCAAAAGTGAAATGTCCATACTGTCGACAAGACTCAGAGGGTTCTGAA ATCACTCTTGAAAATGGAGAAAGTGGTGAGTCACTCTTTGCACTTCCAAC CTTAACAACCATAGCTGATGGAGTTTATGTTCAAGGTGGTACCATTGGAT TAGCATCCTATCATTTTGGAAATCTTTCGACCCCATACATTTCCTATGAA AGTCCCCATTGTGATGAGTGGCCAAATTTGGAGGATGGCTCCAGACCAGC TCCAAAAAAGTATTTTGTGCAACATCATTATGACCCTCAAACAAGAACAT TTACAGGAAATATTGATTGGTCACCAACTTATTGGCAAGGTGATGTGTTG TGGAAATACACCATGGAATTTTCAGAGGATTTCTGGAAAATTGAATCTGG AAATGTCAAACATTTCAGCGAGATCAATGGTGCAGAACAAGGGGAAAGTT TGTTTGGTGTTTCATTGAAATATAAGAGATTGAAGCCAGGATATCTTGAG GAGGATGAAGAATAAATTGCAAACATTATATTATTTTAACTTTTCATTAT TGGTAATTTTGCCTTTATAATATTGTGATTGTTGAAGTTTGTGAGTCATT TTTTGCAAAGTTCCCTCATAGGAGAACCCTTCGAAAATTGATTCTTTATA ATGGTGATGAATAGCATTTATCTACAATGTTTAAGTGCAACAAGTTTACA ATTAATTTTCTCTTTGAAAAAGTCATTTTCTACGAGTTAGATAGCTGCAG AGGGTGACAGGGGTTTATTAAATCATTTTGCTTGCTTTAGCCTGGTGCTA ATTCGTCAGAGTCTTATTATCTTTTAACTCTATTATGTGTAAAATATTTA TTAATTATAATTTCTTTTGGTTTATTTGTAAGAATTCAATATATTTTTAA TCTTAAATGAGGCCCCTCAAGTGGACCTTTAATTCACACTATCACGGAAA TTTATTTGGGAATTTGTGTATTCTCGCAAACTTTTCTTGAGTTTCACACA AATACCCAATTTTTCTGAAAATAATAAAGTTTCTCGGGAAAATCAGGGAA ACGTTTGAAATCTTGAAATTTACGCATAATCAGCGGGAAAAGAGAAAATT TGCATTCAAAATAGTGCAGATTCAAGCATTCACTCAATCAAAAAGTGGAT TTTCATACATTCACGCAACCAAAAAAGTCCATTCATGCTTTCACACAACC CGCTGGGGGGAGGGGGTAGCTTAAATTATTTTTAGATTTTTTTAATGGAT GGACACACGTCATAGAATTCTTTCAATTCTTTCAATTTTTTTTGTAGATA AGAGTATGTTTTTAATTTTTATTTGCATCCTATGACTACGTGAAACTTTT TATAAAAAAAACTTGATAAAATATACTTGTTACAAATTTTTTTTTGATAA ATAAAAATATATATATATGTGCAATTCCATTTTTAATCATTTGCGCTGGT GCTAAAAAACTTTTTAGTAATCTTTTTCTTAAAGATTATATACAACAGGT TAGATCTGGGAAAAATGTGATCTATTTCAATTGTTTTATAGGTTTTGACT TTTTATTCATATTTCTTTCAGTTCCAAAATGACGGATAAGAAAAAGGAAT GTTGTTTATGCAAGGGACCTATTAAAAACAAATGCACTTTGAAATGCTCT CACAATTTTTGTAGGGCGTGTATCAAAAAGGTTATCAACCATCCTAATCA GGTTAAATGTCCCTATTGTCAGCAAGATTCTGAATCATCAGATATTATAC TTGAAAGTGGTGAAGATGCTTCAATATTGTTTAATGTCAAACTAACAAAC ATACTTGGTAGCGTTTACATACAATGTGATACCATTGGTTTAGCATCCTA CCACTTTGGAACTCTGTCAAACCCTTATATATCATATGAGAGCCCTGAAA GTGACGAGTGGGAGCTAGATGATGGCTCTAGACCCTGTCAGAAGAAATAT TTTGAGCACCATCATTATGATCAAGAATCTAGAACCTTCACTGGCAATAT TGATTGGACACCAACAAAATTCTACGGTGAAGCATTGTGGAAATACACAA TGATCTTTTCAGAGGATTTTCTCACTATTGAAAGTGGAAATGTGCAGGGT TTTAAAGAAGTCAACGGGCCACCTGATGGTGAATTGAATATCTTTGGTGA GGATCTAGTTTATGAAAGAGTTTTATCAGCAGATTTTGATTCTGATGATG CCAATGAAGATTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000036_pilon:1477721..1486234-

>XLOC_033818 ID=XLOC_033818|Name=XLOC_033818|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1386bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000036_pilon:1477721..1486234- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CATTACGTTACTGGCAATTGTTGCTGTTTGCAGCTGCACAGAGATTTTGG
CATTACGTTACTGGCAATTGTTGCTGTTTGCAGCTGCACAGAGATTTTGG
TTCCAAAATGACGGATAAGAAAAAGGAATGTTGTTTATGCAAGGGACCTA
TTAAAAACAAATGCACTTTGAAATGCTCTCACAATTTTTGTAGGGCGTGT
ATCAAAAAGGTTATCAACCATCCTAATCAGGTTAAATGTCCCTATTGTCA
GCAAGATTCTGAATCATCAGATATTATACTTGAAAGTGGTGAAGATGCTT
CAATATTGTTTAATGTCAAACTAACAAACATACTTGGTAGCGTTTACATA
CAATGTGATACCATTGGTTTAGCATCCTACCACTTTGGAACTCTGTCAAA
CCCTTATATATCATATGAGAGCCCTGAAAGTGACGAGTGGGAGCTAGATG
ATGGCTCTAGACCCTGTCAGAAGAAATATTTTGAGCACCATCATTATGAT
CAAGAATCTAGAACCTTCACTGGCAATATTGATTGGACACCAACAAAATT
CTACGGTGAAGCATTGTGGAAATACACAATGATCTTTTCAGAGGATTTTC
TCACTATTGAAAGTGGAAATGTGCAGGGTTTTAAAGAAGTCAACGGGCCA
CCTGATGGTGAATTGAATATCTTTGGTGAGGATCTAGTTTATGAAAGAGT
TTTATCAGCAGATTTTGATTCTGATGATGCCAATGAAGATTAATTCCAAA
ATGACGGATAAGAAAAAGGAATGTTGTTTATGCAAGGGACCTATTAAAAA
CAAATGCACTTTGAAATGCTCTCACAATTTTTGTAGGGCGTGTATCAAAA
AGGTTATCAACCATCCTAATCAGGTTAAATGTCCCTATTGTCAGCAAGAT
TCTGAATCATCAGATATTATACTTGAAAGTGGTGAAGATGCTTCAATATT
GTTTAATGTCAAACTAACAAACATACTTGGTAGCGTTTACATACAATGTG
ATACCATTGGTTTAGCATCCTACCACTTTGGAACTCTGTCAAACCCTTAT
ATATCATATGAGAGCCCTGAAAGTGACGAGTGGGAGCTAGATGATGGCTC
TAGACCCTGTCAGAAGAAATATTTTGAGCACCATCATTATGATCAAGAAT
CTAGAACCTTCACTGGCAATATTGATTGGACACCAACAAAATTCTACGGT
GAAGCATTGTGGAAATACACAATGATCTTTTCAGAGGATTTTCTCACTAT
TGAAAGTGGAAATGTGCAGGGTTTTAAAGAAGTCAACGGGCCACCTGATG
GTGAATTGAATATCTTTGGTGAGGATCTAGTTTATGAAAGAGTTTTATCA
GCAGATTTTGATTCTGATGATGCCAATGAAGATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_033818XLOC_033818-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000036_pilongenomesc0000036_pilon:1477721..1486234 -
Properties
Property NameValue
Aaloc52-693:643
Aaloc1-48:8515