|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000036_pilon:1477721..1486234- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033818 ID=XLOC_033818|Name=XLOC_033818|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8514bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000036_pilon:1477721..1486234- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CATTACGTTACTGGCAATTGTTGCTGTTTGCAGCTGCACAGAGATTTTGG
GTAAGATGGTTGCAAGCATTGAGTTTAAAGCCCGAAGGGCTAGAGTAGAA
TCTCTAACCTTTCTCAGGCTAGAAAAAGTGAAGCCCTAAAAAATGTGCCG
TATTTTTAAAGACAGATTGAATCTAATCTAGCAATACACCTTTCCCGTAA
TTCGTAAAACTAATGCGCGCGCATTATTTTGATGCTCTCCACTGTTTGGT
CTCTGGAGGTAAACAAACCCGTTTTTGCTTGCGTTCCCTTAGCTTAGGGG
AAGTTGGTTTTTTGAGCTTTTCTTAAGTTCTGTGTCGAACACAAAACCCC
CTCAAATTTTAGTATGTTCAATCTATTCATGATATTATACCACCCTGAAA
ATATTTTGCCAAAAGAAGGTCGCTGTCAAAAGTTAGAGGCTCAAATCCCA
CTTTCCCTTTTTTCGAAATTTAGCGGTAAATTTTCCACAGATTTTTGGTT
CTAGACTGGATAAAGTCTATGTAAGGCTGAATGTACCTCGAAACCCATAT
TTGATGTATTTTTATAAATTTTACCAGCTTTTTTGGCTTTTTTCGACGAA
TCTTCTGCCTTTTATTGAAATTCAATCCTCCTTTATATAACAAACGGTCA
ATTAGACAGCTAATTATCATTTTTAATGACTGAAACGAAAATACTGATGC
ATCAGGCGAACCCTAAAAATATTTTTGTTTCCGGTCCACCGGGTGACAAA
AAAAACACTCACCTTGCCGGCCGCAAAAATTTTTTTTTTTCTAAATTTCG
ATCCCAAAACTCGATTTTTTAAAGCACTCGTAGAAGTTAAAATGATGGTC
TTTCTTTACCTTAAATCTGTAGTAACTTGACACCGCTACAGGCTTTGGCA
TAAGAAAAATTCACGTGTGATCATCGCACGCCTAGATTTTGATTTACAGT
GGTCTAGGCGTGCGATTATTCAAATACTTAATTTTCATCGTTTATATTTT
CAATAGACCTTTTTTCAAAGAGGACGTCCTGTTGAATAATTATGTAGTCC
AGCCATAAAAACAATGATAGAGCCATGCATAATTACTGTATCATGTATAT
TTTAATAATTATGCATGGTTTTATCATTGTTTTTCTGCTGGACTACATAA
TTATTCAACAGGGTGGCCTCTTTGAAAAAAGGTCTATTGTGTTACAATAT
CTCTCAGAACTGGCACTCTCTTTCATTTTGAATATTTATCTTCAATTGCC
AAGGCTCCAAACTGTGATTACGAAGTGAACTTTTTTGAGAAAAAAGTAGA
GTGAGAGAAACATTTCCCCAATTTTTTAAATCCTCACTTTGTGAATGTTT
CTTTTTATTTTACTCACAAGTCAGCATGATTCCTTTTATAAAAACAAAGC
TGTTTACTTACTGAAAAGTCCCCACTTTGTGAATGTTTCTATTTATTTTA
CTCACAAATCAGCATGATTCTTCTATAAAAACCAAGTTGTATATAAAAAA
AACATCTTAAAAGTTGAGTTGCAAGCAAGAATTAACAAAAAACAATGCAG
GGTTTAGTTTGAGATGAATAAAATTTCATTTCTATAACAATGATCAGGAT
AAAACCTTCATTCCAAGTGATTTCTAGGCGTGCATTTTACAGTAGAATAT
AAAATATCACGTGCGATAAAATCACACGCCTCAAAGACTAATTCACGAAA
GTTTTCCAAACAAACAAAATAACCCGAACCCTAACGATGATGTACGAAAA
AAAAAATGCGGCCGGGTGACGACGAAATAAATTTTCACCCGGCCGGTGGA
CCGGAAACAAAAATTTTTTTCGGGTTCGCCTCATGTTATTATGCTTCTGT
TTAATTTGATAGGTCGATTTTTAACGTTTTCGGGCACTTTCTGAAAGTAA
CTTTTTTATTCAATTGAGCATAACTTTTGATCCAATGAATCGAATTTAAT
AAATGACCCATCAAAATTTAAGTTCATCTTTCTTCTTTCTGATGGAATAG
GAATTGTTGTTTCTTAATTCTTAGATTTCGAAAAAATCAGTTTCAAAGAG
AGAAACTTTTTTGTGGCGCACCTGGTATAACACCCCTTTCTTAAATAAAT
GGGCTCTTAAAGTCTTTCGTTTGCCGCAAGAAGGGAGAAAAATTTAATTT
GACCCCCGTTTTTTTCTCTCTTTTTCTAGCTAGTTCCCGCGTGTTAGTGT
GGACACAACTTTAAACCAGGGAAATGAAGCGTTTTCATTGGTCTAAAATT
ATGGATGGTCACGTGACCAGAATTTTTATCATGGTTTCAGCCCCCCAGAA
ATCTGAAGGGCACCTAGGCCAGGTTAGTAGAGGGGGGCTAATGTTTTGCA
ATTCTTTGGGGTTACCTATTCATTAAGGGTACCTAGCTGTCTTGATGGAG
GCTCTGGGGGCTGGTTGTATTTTCCAAATTGAATATTTCAAAATTTTCAA
ATTACAGTTTTTTTACCCCAGCACCCAGTTTCCCATCCGATTCTCTTGTT
TCTTTTGTTTCCCATCACGTCATCTTTAGACGATGCTATATCGTCCTTAT
AATATATTATGATATAACATAGTTTGTATATTATAAAACGTAATATGTTT
CGCGGCAGATAGAGTTTGTGTTTAAGACAACAGCTACCCCCAAAAAAATT
CCCGTCTTCACGTTTGTTCCTCTTAGATGAAACTCGTGTTAGACTATAGC
ATAGTCTACGTCATCTTTTGCTATATTTTTCAAATGTGATTGTTTTTATT
TATAGCCGCCATCTTTATAGCATAAAAACAAAGCTTTTCTCATGCGAGTG
CGCTTCTCGTGCTAGCATAGAGAAGCTAAAACCTCAGGATAAGAGTAAGC
AAACATGATAGCTATTTGTGTTTTTGGCTCTGTTTAACCGTTTAACACTC
ACACTCATAACTGATTACAATCTTCTGGTATACAAAGAACAAAAAGTGTC
AATTCAAAAAATTATCAGCTGAATGGGGGTAAGAACTCAAAGCAATTTCT
CAAGGGGACCTAACTCGTTGGGGGCACCATGCTTCAATGGGGGCACCTAA
AAAGTGGGCTGAAACCATGTTTTATCCAGGGAAACGCTGTGGCGGCAATG
TTTTGCTTTAGTGAGATTGAACATTTTGTTGTTTTGATTTGATCGGGGGA
AATTTCTGTACAAACCAAAATATGGCTTCGTTGGAATACCGGTTGAAACA
CTTGTGTTTTAGGGTACCTTTTTGGGAGATTTTGGGAAAAAAATAGAAAA
TTTTGAGTATAATCCTGGAGTTTTTTAGTTCCGTGCCATTCAGGGTCACT
TTTCGCAAATTTTTAAAATGTATGTGCGTCGTCCGACGGGGGTATATAAC
GAAAACTTTCTGGATTGGCCCAATTACTCCACCACATTAATTTCCCTCAG
CCAATTAAAATGTGATATAAGTTATCTTGTCTCTAGGTAACTGCTGTGAA
GTAATTAGTTATTCAAAAGACTGTTGTGTTCGCCAAAACATCTATCATAA
CTCAGGGTGTCTACGGGACCTTGAAAACCTTGAAAATGAACCACCCAACC
TTGAAAACCTTGAAAACTATCAATTTTCTGGAAAAAACCTTGAAAACCTT
GAAAATCGTTAAAAACCTTGAAAAGCACTATCCAGTCATTCAAAAAGTAA
GAATAAGTAAAAAACCCGCCTGCGGCGCTAAACCTTTAAAACATTTAGAG
AATTGCATATTCACCTGTTTCTGTTGCGATTCTGTCGCAACGAATGCAAC
ATATTCTTTTATCATTAGCTGAGTTTTTGTCACTAATTTTCCGTTTGCAT
GAGCCCTAAGAAATCGACTGCTCCCCAATTTTCAAATCGCTTCAGGGCGT
CTTGGAATAATGGCTGTTCATCAATAAAATTTCGAGGATTCCTTAAAACA
ACTCTTTTGGAAATTGATTTTTGTAAAAAACAAAATTATTTTTCTTTCAC
CTACCACTCTGAAAAAAAACTAAATTCCTGTAAAATGCCATGTCAACTGA
GTATCAAAAAATCTTGAAAAGTGCCAAAGTTTTTGCCAAAAAACCTTGAA
AAACCACTTAAAAATGACCAAAAAAACCTTGAAAACCTTGAAAATCCTGA
AAAAAATCCGTAGACACCCTGCAAGCTTTTCTTTATTTGACATCATGGCA
AGTATAATCAATTTATTATTTGAAGTAAAAGGGATGGTTATTTAGATAAG
AACATAATTTCTCAATCAAGATTGATTCATTATCATCGTTGACTAGCACA
CCATGTACATACACACATGATCTTTCATATTATTCTAATAATATCTTGAT
TTAAACTGATTTTTACAAGTATCAAAGCAAATTTTCAAGGACCATGAAGA
AGACAAATATTGGAGTAGCAGCTGCCAGATGCAGGCTAAGAGGCTCACAA
AAAGAGTTAAAAGGTCAAGGTCCCATGGTATATTTGATGAGAAGAGATGT
ACGTGTAGATGATAACTGGAGCCTTTTACGATGCCAAGAAGAAGCTCGTC
CAGTCAGAGTTGTTCACGTAGTGGAGGAAAGCCATCCCACTTATCGTTTA
GCTTGGTTCTATGCTAAAGGTTTGGAAGATGTACAGAATGGTTTGAAAAA
GCTTAAAATTCCATTTGATACAGTACCTGATATCAAATCATTAAATGATT
ATTTTGTTGAAATTGATCCATCAGGCATAGTGGCTGATATGCACACCTTA
AGGGAATTTGATCTCAAACCTGTTATTGATATGTGTAACAAGCAAAAATT
ACCACTTTGGGAGGTGGACAGCTACAATGTCATTCCAGTATGGGAAACAT
CAGATAAACAAGAGTATGCAGCTAGGACCATAAGGTCTAAGATAAACAAA
AAACTTGATCAGTACCTTACTGATATTCCTCCCACTTCTTCAAACACTCA
AGATTTGAAGGGTTATGGTAAAGAGTTTAATGCCATAGAAATGCTTGAAG
AAAGGTGGAAGCAATCAAATGAAATACATTTGAGATTCACTCCTGGTACT
AATGCTGGTAGGGAAGCTCTTGAGGAATTCTTGAGCTCTCTTGCTATTTA
TGACAAACTGAGGAATGATCCTTCAAAGGATGCCACTTCTAACCTGTCTC
CTTGGTTTAGACATGGTCATTTGAGTAAACAAAGAGCTGCATATGCTGCA
CGAAAAAGCAAAGGTTCATCTGATGGATTCATTGAGGAGCTAGTAGTGAG
AGGTGAACTTTCTGAGAACTTTGCTTTTTACAACAAAGATTATGACAACT
TAAATGGTGGTCCAGCTTTTGGAAAGAAAACTTTAGAGGATCACAGGAAT
GACAAACGACCTCACACTTATTCATATGAGAAGTTTGAAAATGGTGCAAC
ACATGATCAACTTTGGAATGCAGCTCAAAAGCAGTTAGTGAAGGAAGGAA
AAATGCACGGTTTTATGAGAATGTACTGGGCAAAGAAAGTCTTAGAATGG
ACACAATCTCCTGAGCAAGCAATTGAATTTGCTGTGCGACTGAACGATAC
TTATGGATTAGATGGCCGTGATCCGAGAGGCTACAATGGAATCTTGTGGA
GTATCACAGGTTTGCATGATCAAGGTTGGAGAGAACGTCCCATTTTTGGT
AAAGTGCGATACATGAACTATGATGGTTGTAAAAGAAAGTTTGATATCCA
ATCCTACATCAAACAATATCTCAAGTAGTTGTTTCTGAGTTTTATCTTTG
AAGTATCAATTACTTCAATTGTTATATTCATATTTGTTATACGAACCATT
TTATTTTGAACTTGACTTCTCGCCAACTTGTTAATTTTAGTTCCTAAGGT
TTTTAATGACTATCATATCAAAGAGATAATTTTTACAAAATTTCATCTGC
TTCGTTTTCTTGGAGTATGTCCTGTCGAGGTGATCTTTTACATGTACCCG
AACTAGAAAAAAATGCAAATCTCGACTTTGTTATTTGGACAGGCCAGGAC
AGGCTGAATAAACAGGGCGACATTGGAGTGGCGCTCTTATAGGTTCAGAA
CTATCAACCAGTAAAAAATCTAAGCGATCCCACATTTTTTTATTTCTATC
AGATTTACTAAAGTTTTCACAGATGACCCAAACTAATTCTCATACTTGGC
TTTCTTGGGATTTCATATTTTTATCTTCACACTAACAATTTTCTAATTTT
ATTTATTTTAGTTTTGACAAAATCTTAATGATAAAATGGTTGACCAAAAG
AATGAATGTGCAATCTGTTTAAGTCCCATTGATAGTAAATGTACCCTAAA
ATGTTCTCATAGTTTTTGTGAGTTGTGTATCAAAAGAATAATTAATCATT
CTTCAAAAGTGAAATGTCCATACTGTCGACAAGACTCAGAGGGTTCTGAA
ATCACTCTTGAAAATGGAGAAAGTGGTGAGTCACTCTTTGCACTTCCAAC
CTTAACAACCATAGCTGATGGAGTTTATGTTCAAGGTGGTACCATTGGAT
TAGCATCCTATCATTTTGGAAATCTTTCGACCCCATACATTTCCTATGAA
AGTCCCCATTGTGATGAGTGGCCAAATTTGGAGGATGGCTCCAGACCAGC
TCCAAAAAAGTATTTTGTGCAACATCATTATGACCCTCAAACAAGAACAT
TTACAGGAAATATTGATTGGTCACCAACTTATTGGCAAGGTGATGTGTTG
TGGAAATACACCATGGAATTTTCAGAGGATTTCTGGAAAATTGAATCTGG
AAATGTCAAACATTTCAGCGAGATCAATGGTGCAGAACAAGGGGAAAGTT
TGTTTGGTGTTTCATTGAAATATAAGAGATTGAAGCCAGGATATCTTGAG
GAGGATGAAGAATAAATTGCAAACATTATATTATTTTAACTTTTCATTAT
TGGTAATTTTGCCTTTATAATATTGTGATTGTTGAAGTTTGTGAGTCATT
TTTTGCAAAGTTCCCTCATAGGAGAACCCTTCGAAAATTGATTCTTTATA
ATGGTGATGAATAGCATTTATCTACAATGTTTAAGTGCAACAAGTTTACA
ATTAATTTTCTCTTTGAAAAAGTCATTTTCTACGAGTTAGATAGCTGCAG
AGGGTGACAGGGGTTTATTAAATCATTTTGCTTGCTTTAGCCTGGTGCTA
ATTCGTCAGAGTCTTATTATCTTTTAACTCTATTATGTGTAAAATATTTA
TTAATTATAATTTCTTTTGGTTTATTTGTAAGAATTCAATATATTTTTAA
TCTTAAATGAGGCCCCTCAAGTGGACCTTTAATTCACACTATCACGGAAA
TTTATTTGGGAATTTGTGTATTCTCGCAAACTTTTCTTGAGTTTCACACA
AATACCCAATTTTTCTGAAAATAATAAAGTTTCTCGGGAAAATCAGGGAA
ACGTTTGAAATCTTGAAATTTACGCATAATCAGCGGGAAAAGAGAAAATT
TGCATTCAAAATAGTGCAGATTCAAGCATTCACTCAATCAAAAAGTGGAT
TTTCATACATTCACGCAACCAAAAAAGTCCATTCATGCTTTCACACAACC
CGCTGGGGGGAGGGGGTAGCTTAAATTATTTTTAGATTTTTTTAATGGAT
GGACACACGTCATAGAATTCTTTCAATTCTTTCAATTTTTTTTGTAGATA
AGAGTATGTTTTTAATTTTTATTTGCATCCTATGACTACGTGAAACTTTT
TATAAAAAAAACTTGATAAAATATACTTGTTACAAATTTTTTTTTGATAA
ATAAAAATATATATATATGTGCAATTCCATTTTTAATCATTTGCGCTGGT
GCTAAAAAACTTTTTAGTAATCTTTTTCTTAAAGATTATATACAACAGGT
TAGATCTGGGAAAAATGTGATCTATTTCAATTGTTTTATAGGTTTTGACT
TTTTATTCATATTTCTTTCAGTTCCAAAATGACGGATAAGAAAAAGGAAT
GTTGTTTATGCAAGGGACCTATTAAAAACAAATGCACTTTGAAATGCTCT
CACAATTTTTGTAGGGCGTGTATCAAAAAGGTTATCAACCATCCTAATCA
GGTTAAATGTCCCTATTGTCAGCAAGATTCTGAATCATCAGATATTATAC
TTGAAAGTGGTGAAGATGCTTCAATATTGTTTAATGTCAAACTAACAAAC
ATACTTGGTAGCGTTTACATACAATGTGATACCATTGGTTTAGCATCCTA
CCACTTTGGAACTCTGTCAAACCCTTATATATCATATGAGAGCCCTGAAA
GTGACGAGTGGGAGCTAGATGATGGCTCTAGACCCTGTCAGAAGAAATAT
TTTGAGCACCATCATTATGATCAAGAATCTAGAACCTTCACTGGCAATAT
TGATTGGACACCAACAAAATTCTACGGTGAAGCATTGTGGAAATACACAA
TGATCTTTTCAGAGGATTTTCTCACTATTGAAAGTGGAAATGTGCAGGGT
TTTAAAGAAGTCAACGGGCCACCTGATGGTGAATTGAATATCTTTGGTGA
GGATCTAGTTTATGAAAGAGTTTTATCAGCAGATTTTGATTCTGATGATG
CCAATGAAGATTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000036_pilon:1477721..1486234- >XLOC_033818 ID=XLOC_033818|Name=XLOC_033818|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1386bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000036_pilon:1477721..1486234- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CATTACGTTACTGGCAATTGTTGCTGTTTGCAGCTGCACAGAGATTTTGG CATTACGTTACTGGCAATTGTTGCTGTTTGCAGCTGCACAGAGATTTTGG TTCCAAAATGACGGATAAGAAAAAGGAATGTTGTTTATGCAAGGGACCTA TTAAAAACAAATGCACTTTGAAATGCTCTCACAATTTTTGTAGGGCGTGT ATCAAAAAGGTTATCAACCATCCTAATCAGGTTAAATGTCCCTATTGTCA GCAAGATTCTGAATCATCAGATATTATACTTGAAAGTGGTGAAGATGCTT CAATATTGTTTAATGTCAAACTAACAAACATACTTGGTAGCGTTTACATA CAATGTGATACCATTGGTTTAGCATCCTACCACTTTGGAACTCTGTCAAA CCCTTATATATCATATGAGAGCCCTGAAAGTGACGAGTGGGAGCTAGATG ATGGCTCTAGACCCTGTCAGAAGAAATATTTTGAGCACCATCATTATGAT CAAGAATCTAGAACCTTCACTGGCAATATTGATTGGACACCAACAAAATT CTACGGTGAAGCATTGTGGAAATACACAATGATCTTTTCAGAGGATTTTC TCACTATTGAAAGTGGAAATGTGCAGGGTTTTAAAGAAGTCAACGGGCCA CCTGATGGTGAATTGAATATCTTTGGTGAGGATCTAGTTTATGAAAGAGT TTTATCAGCAGATTTTGATTCTGATGATGCCAATGAAGATTAATTCCAAA ATGACGGATAAGAAAAAGGAATGTTGTTTATGCAAGGGACCTATTAAAAA CAAATGCACTTTGAAATGCTCTCACAATTTTTGTAGGGCGTGTATCAAAA AGGTTATCAACCATCCTAATCAGGTTAAATGTCCCTATTGTCAGCAAGAT TCTGAATCATCAGATATTATACTTGAAAGTGGTGAAGATGCTTCAATATT GTTTAATGTCAAACTAACAAACATACTTGGTAGCGTTTACATACAATGTG ATACCATTGGTTTAGCATCCTACCACTTTGGAACTCTGTCAAACCCTTAT ATATCATATGAGAGCCCTGAAAGTGACGAGTGGGAGCTAGATGATGGCTC TAGACCCTGTCAGAAGAAATATTTTGAGCACCATCATTATGATCAAGAAT CTAGAACCTTCACTGGCAATATTGATTGGACACCAACAAAATTCTACGGT GAAGCATTGTGGAAATACACAATGATCTTTTCAGAGGATTTTCTCACTAT TGAAAGTGGAAATGTGCAGGGTTTTAAAGAAGTCAACGGGCCACCTGATG GTGAATTGAATATCTTTGGTGAGGATCTAGTTTATGAAAGAGTTTTATCA GCAGATTTTGATTCTGATGATGCCAATGAAGATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000036_pilon | genome | sc0000036_pilon:1477721..1486234 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 52-693:643 |
| Aaloc | 1-48:8515 |
|