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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000228_pilon:156841..164324- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033778 ID=XLOC_033778|Name=XLOC_033778|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7484bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000228_pilon:156841..164324- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGACTCACAGACAACGTTATCCGTGCTTTCAAACCAGCCAAGATTTT
TCGTGACAACACAGACAGGATAAACCACATCGATTACACTTCCAACGGTG
AAACATTGATCACAAGTAGCGATGATGACTCCATCACCCTTTACGATTGT
TTTGATGGAAAGTAAGATTTTATTTTAACATCATCAATTGTCATTATTGA
CATGCTGATGAAGTCACGTAAAAATGATGAAAATTTCAAGTTAAAAGTGG
TTGCTTCATTTTTCTGTCTTATCAATTTGCTGCTTCTAAACTTCAGAATT
TTCTATCATTATGAGAAGATCTTACTAGTAGAAGTAGTAAAATAATTTTT
TTCTTTTTTTAAACAAACGTTCTTATTGGCGGTCATACTTTTCTTAAAAG
AACTGAATGAAAACGGAATTTTGATCGGATCGTATCGCTTTGTCATTGGA
TTGTCCGTATTTTAGAGTGAGTTCTGTTACAATTATCCCTGGCCTAAAAT
CTCAGGTTGGCAGCAATATCATGTATATAGAATTCATTCTTTCAAATAAA
TGTGTTTCTCTCCTTTTTTAGACAGAAGAAGACATCAAATAGCAAGAAAT
ATGGAGTATCGCTCATTCAATTCACTCACGCATCAAACACTGTTATACAC
ACCTCAACCAAAGTCGACGGTAATAGATCTCGTTAATTTCTTAGGTTTTA
TTTTATTAATAAAATTTGTTTTTAAAAAGCTATTTGGACGATATACCATC
TATGTTTATAACACTTCCTAAATAAAACACGCATAGATTCGTATTCGTAT
CGTACTCCGAGTACGAAAAAATTAAGAAATGGGATTAAGATTTACAGATT
TAGTTGTCATTTTTCACTTTCATCTATTTAGATACCATTCGATACTTGTC
ACTGCACGATAACAAATATCTGCGCTATTTCTCTGGACATACCAAAACGT
AAGTATTGGCATACAAATCTCCATAAAATTTGATTGCATTGAGTCTTGTC
TAACATGAGATTTACGAATTAATTGATGTTGTTTCTTGACCTTCTCCATA
GCCTTTGTTGACTGCTCTGTCAAGCGAAATAAATATTTCTCAATATTTGT
TTCAGTGTTGTCTCCCTTCACATGTCACCTGTAGATGATAGCTTCATATC
CGGTTCACTGGATCGTACCATCAGATTGTGGGATCTTCGCTCCAACAACT
GTCAGGTAACTACTTTCGAAAAAAATAAGTAACCATATTTTACTTTTGTT
GCTTAAAGATTTATCTTCGATCAAGTTTATCGCTCATTCCATTCGAATAA
ATTGAGATTCCAAATTAATACAATTTTGTAGTTCAATCGTTCTTTTATTT
CTTCGAAAATCTCTGATCAACGTGTGTGTCCATGCAAAAAAATTTCAAAG
AAAATCGTCTAAAAATTATCGACCTTTAGTCATCATAATAAAAGACAGAC
AATAATTTCGTTTGTATTTGTGTTTTGTTATTCAGGGTTTGATGCATGTG
AGCAGTCGACCGGTGACATCTTTTGATCCTGAAGGTCTCATCTTTGCCGC
TGGTGTTGATGCTGAAATCATCCGTCTCTATGATCTAAGAACGTTTGATA
AGGTTGGTATTTCCCTCAATCTTACAAGTGTGAATAGTTTGATAAAAATA
TTTCGTTTAATCATTCTTTGCCACGGCATGACGTCACAATTGGGGAAAAC
AGAACACTTACTAAAGATAATTATGTGTAATCATCAAACAAAATCTTTTA
GTGAGTTAAACCATAGTGTTTGTTTTCCCCTCGCAATACCTTAACCCTAT
TCGGCCTAGGGGGGGGGGCTCTTTCTGTTCGGAGGTCAAACTATTGGTAA
TAGCTCCTGAAATAATAGAGCTTTTGCCGTGAAATTTTCTGTAAATTCCC
AACTTTCATTTTGCTTCAAATTAAAAAAAAAATTGACACTTAGATATTTT
CACACCTTGAGCATGATGACATTTGTGACAGTAAGGTGTCACAAAAGTTG
ACACTTTTGCAATACAAATTTATTTTTAATGTCAAATTATATCGTTTAAA
CCGTAATTTATTGAATATTCAGGATAAAATAAGCATTTTAAACTCAGGCA
ACTTTTCTCCAAAGCCTTTGTTAGAATACAATATCTATTTATAAGAACAA
AGGAAATTTTCGGTTTTTGCTCACTTTGGGCATGATGAGTGACGTCATCA
AAATTTTTTTGTCAAAAGTTACCTTACGTGACAAGGATCTTGTGTGCCAA
ATTTCATCCAAAAAGACCCATTAGATCAAAAGTTAAGGGGTGGTACAGGA
AAAGCCCCCTCCCCTAATTCTGAACCGCCCCTAAAAGCCTAGGTTGAATA
AGATTAAAGGAAGAAATTTTGGCGGAAAGAAAATTTGGCGGATTTGGCGG
TTCCCGCCAAAATTTATTATTTCCTTCATCCGCCAAATTAAATTCCCGCC
AAATTTATTTTATTTAACGCATTCCCCAAGTTGGTGCTATTTCAGGCCTT
AAAACAGGTTTTTTTACTTATTTGATATAGATTTTGGCCAAAAATATCCT
GCAACCGCCAAATTTAATTCCCGCCAAATTTAATTTTTCCAGCCATCCAC
CAAAGTAAATTCCCTCTGAAAAATTTTTTTCGACCATCCGCCAAATTAAA
TTCCCGCCAAAATTTCTTCCTTTAAGGTAATTAAATTAAAAGATGTCACA
TGACTTTCCGTGGCAAAGAATCATCGTCATCATTGAGAACGTTTTGGACC
CTTTTTGGTTCTTGGATAGAACCTATATTCTCTGATTGGCACTCCTTTCT
GATGCCCAAAGTTTCAAGCTTTCAAAGAAAAAGCTCTATTCACCACCAAA
ATCCCCATAGTTCAAAACCACTCCCTATCTCGACTAGTCCATAATCACGT
TACGAAGGTTATGACTTATTAAATGTCTACCCTACTTTTGATTAATGAAG
TAAATATGAAAATCTTTCTTCATTCCGAAATTTAAAGGGTCCATTCGCTA
CATTCAATCTACCGCAAGCAGACAATGGCGTTGAACTTTCTAGTATCAAG
TTCAGTAACGACGGTAAAAAGATATTGGTCTCAACAACATCAGGATTGGT
GTATCTGTTAGATGCTTTCCAAGGCAATCTTCTTCATACGTTTATGGTAA
GATAGTTTGGTGTATTTTTGGTGTCGCTTGCTTAGAAGTTTCATTTACCT
AGAAGTATGTGGTATGTGGTTCAGAACCTGGAATTTTCCGGTTAATTTTT
AAGTTAAATCCTCACATGTGTGCTTAGTGAATAACCTGGGATCTTATCTG
AATTTTAATAAAAAGTACCTGGAACTTTCGGGTTATATGTGAGTTTATAC
ACTGTTGTTGAATTTTTTTTCAAATTTGAAAATTGTATTTGTTCGTGTTG
TTGTGCCACATTGTATTTTGCGTACTTTTAGGGTCTCTCTACACCAGGAA
GCGGTGCTGTTTTCTTGGAAGTATCCTTTTCTCCAGATTCACAATACGTT
TTGTCAGGTTAGAAAAACTTCGTGTATACATAGCTCTTCTCTGTGCTGAT
TACTATAATCCATACAAACTTGAATTAAATATTGCCACCACCTTGTAAAT
CTTCAAAATAATGCTTGTACATATTTTTACAACGAATTAATAGTCTTTTC
CAAGAAACCAAGGAATTAGCAGTTAATCTATACACCCCCCCCCCAAAAAA
AAAGCTGAATTAAAAGTGATTGGGCTCCAGGTTACCTGCTTCTAATAGCG
TTTGATGTCTTCTAAAGACATTTTACGCCTTTCCACACTGGTGAACTCAA
ACCTGATTCAATTTATTGGACCTACCCCGGTGGGGTAGAGGTCCTATAAA
TTAACCGATGTCCGTCCGTTCGTTCGTTCGTTCGTCCGTCCGTCTGTTAC
CAGCTTTTCTCAGGATTGGCTCATTAGTTTTTTCTGATTTTTGGCACAAT
GATGCAAAATGGTAATGCCCAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAA
AAATCATTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAAAACCGGTTTT
TTGGCATTTTCTCGAGATTTCATCATTACTTTTATCAGATTTTTTGCACA
AAGATGCGTATTAGCAATGCCTAAAACATGGCAGAGTCCGATTTTTGAGA
AAAATTCTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAATCGCCGTT
TTTGCAGATTTTCATCGGACTTTTTCCTTATATTTCGTTGTTTTTTCACA
CAAAAACATTATTAATAGCAATGTCCACGATTAAGCATGGTTCAATTGTC
GATAAAACTGATTTTTGAAGCCGGAACTTTCTAAAAATCGCCGGAACAGC
CGATTTTCTCCGGAAAAACGGTATTTCTTGAATTTCTCGAGCTGTACTTT
ATATTTTTTTATGAAATTTTGCACACTGATGGAAAATGACAATACCTAAA
AAGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAACATTTTTTTCCGGCCGAAAGTGC
CGGAAACATGCCGGAAAAACTGTTTTTTTGGCATTTTCTCGAGATTTTAT
CATTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCTCTAAGATGCGTATTAATATTGCCCA
AAACATGGCTGAGTTCGATTTTTGAGAAATTTTTTTTTCCGGTTGAAAAT
GCCGGAAATCGCCGTTTTTGCAGATTTTCATTAGATTTTTTCCTTGTATT
TCTATGTTTTTGACACAAAAACATTATTGATAACAATGCTCACCATCAAG
CATGATTCAATTGTCAATAAAACTGATTTTTGCGACCAGAACTTTCTATT
AATTTTTTCCCTACAACCCTTCCCTCTCCCCTTATCAAGAATCAATGATG
AATTTATTGCGTTATGCATTTTCGCTAAACGCTATGTTTTCTGAATGATT
TTTTTTCATTTTTCTCCTTGCATTGCTATCTAACTTTCATCATCAGGTAG
GTCCATTCAGCATGTTGCTTGTTTTGTTTTTGCTCCCATCATCTCTAGGT
TCATCGAACGGCAAGATCTACGTGTGGTCATCGGACAGCGGTAAACGGAT
AACCGTGCTGGATGGTATGCACCCTGGAAGCACGCAATGTGTTGCTTTCA
ACCCCAAATACATGATGTTCGCTTCTAGCTGCTCTAACCTTGTAAGTGTA
CCTTTCGACATAATTTGCTTTAGGACTATTTTCTAACACAACAAATCAAT
GATGAAATAAGAAAATTAGATTTGAATTTTGGTGTTTTTCAAGAAGGGGC
TGGGAAATTTTCGAGAATGTCTCTATTGTCTGTCACTATCAGTATGTTGG
GCAAATTCGGGGGAATAAAGAAATTGAGGCAAGAGATATGATACTTTCTC
TTTTTCACTCTTCAAAACAAAAGACATACAATCTAAAGTCCTACTGCATA
GAACAAATATTTATCATGTCCAATTGACATTTATATTGTAAAAATGTATA
TTTTTTTGATTAAAGTAAAACCAAAGAGCGTTAAATATTTCTAATGTAAA
CCAAAAACAGAAATTGAATGTGTAATATTTCGTTAAGAAAACTAAGCATT
TTCATTCAGCCATTTTTCAAGTTTATTCAAGTCATACCCGACTGGGCCTA
TGCCTCCATCATACACCACTTTCCCATTCTGGATCCCATACAAACGATCT
GGGAGAGCAGCGTATGCCTTGTTAGCTTCGTTCGTCATGAAGTCAACCAG
CATTGGACAGTACTCTTTCAGTTTGGTTGGAGCAGATTCGATCATCATTT
CAGCTGCTTGGATTCGTTCCTCCAACTTTGTTTGTTGTTTGATTTGTGGT
ATGTGAGGAAGATCTTCGTTCAAATCGACCGGGTGTGCTTCTGTGATATA
AATCATGACAAAGTCAGCTCTATCTTTGAAGTGTTCACTAAGTCCGGCCA
GGCGTTTAAGAACACCAACTAGCGGGAATCAGGTGATATTTCCAAAAGTC
AATACTAAAGGCCGGTATTGGCGTTGGAAATCTAGTATTTTCTTCTCTGT
TTCGTCCTGTAGATCATACACTTTGACGCTGGGTGCCTCTTTGTTGATGA
ATGCTTCTCTACGAGCGTCCGCTAACGCGATTCTGAAGCGTTTTAAAGTT
TGTTGTGGTCTGCCAAGAAAGTGATGTGTTTTGTTTTTGTCAAAGATGTA
AACTATTTTATGGTAGAGTGTTGTCAAAATCAACATTGGTAGGGTGATGA
GATATGTTTTGAGTGTGCGGACCCATTGTTGTGGGTCGTCATAACTCTGT
ATGTAGTTTATAGTCCAACTTGTTTCTAAGGTGAATAACATTTTAACACT
CGCACGAACCACTAAACCATTTCTTTTGTCCCTCCTTGTCAACTTCTTCC
TCGCTGAGTAAAAAGCAAAGGCTGAATAAAATAAACGATTATTTTCAACG
AAATAAAAAATGCGGACTAACGTCTCTTGATTGAAAAGAAATTATACTAC
ATAAATCAAAGTATTGACATTTGGTAATTACCATTTACATTTGGTTATTT
TTAATGTTATATAGATAGATTCTTCACATTGCCAATGTTGTAGAATCTTA
TATTGTGATACTGTGTGTTAGTTTTCATCGTCACAAGACAATAAACCGTA
AAGCTTAGATTACTTTTTGGACATACCCCGGTGGAGGTCCTATAAATTAA
CCCGTATTTGTTCGTGCGTTCGTATGTTAGTTACAAGCTTTTCTCAAGAT
TGGCTCATTCAAATTTTCTGATTTTTGGCACAAAGGTACATGACTCCCTC
GAAGGTGACGGAGCCCAATTTTCGAGAAAAAAAACGGCTAAAAACGGTTT
TTTTGGACTTTGTGAAAAATCGGACCATTAGTTTTCTCTGATTTTTTTTG
CATGAAAGTAGGGTACCATCAGAGGTAAAACATGGCTTAAGCAGATTTTT
GCAAAAAAAATTTTCGGCTCAAAAAACGCAACTTTATCTATAAGAATACT
ATTAATAAGCATACATCAATGTTCTTAGCCGAATTAGTCAATTTTTGATG
AGACAGATGTTTTTCTGCTCATAAAGGCTAACTTTTGAAGAATATGTGTG
TTTAGACATGAAGTTTTGGTTGCAAGACGTGTTTTTATAGAAAAAGTGAC
CAAATTCGATATTTTGTTATAAGCCTATTATTATTACTATTATTACCAAT
TACTTAGTTATTAGCTTTTCTCGAGATTGGCTCTTTCATTCTTTATGATT
TTTTTGCACAAAGATGCATAACTATAAACCCTCGAATGTGACGGAGCTCG
ATTTTCGATTTTCTAAACGTGTTTTTTATAAGAAATAAACGACGAATTTT
AATATATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTGTTTAATGGTCACGCTC
ACGTAAATATCAATTATATATGTGTTAAATGCATAACCAGGTAGGTCCAT
TAAAGTATCGCTTGTTTGTCATTTATTTGCTCTTTTTATCTACAGGCATT
TTGGATACCAGATTTGAACGAAGTTGACAAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000228_pilon:156841..164324- >XLOC_033778 ID=XLOC_033778|Name=XLOC_033778|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1920bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000228_pilon:156841..164324- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGACTCACAGACAACGTTATCCGTGCTTTCAAACCAGCCAAGATTTT
TCGTGACAACACAGACAGGATAAACCACATCGATTACACTTCCAACGGTG
AAACATTGATCACAAGTAGCGATGATGACTCCATCACCCTTTACGATTGT
TTTGATGGAAAATGAGACTCACAGACAACGTTATCCGTGCTTTCAAACCA
GCCAAGATTTTTCGTGACAACACAGACAGGATAAACCACATCGATTACAC
TTCCAACGGTGAAACATTGATCACAAGTAGCGATGATGACTCCATCACCC
TTTACGATTGTTTTGATGGAAAACAGAAGAAGACATCAAATAGCAAGAAA
TATGGAGTATCGCTCATTCAATTCACTCACGCATCAAACACTGTTATACA
CACCTCAACCAAAGTCGACGACAGAAGAAGACATCAAATAGCAAGAAATA
TGGAGTATCGCTCATTCAATTCACTCACGCATCAAACACTGTTATACACA
CCTCAACCAAAGTCGACGATACCATTCGATACTTGTCACTGCACGATAAC
AAATATCTGCGCTATTTCTCTGGACATACCAAAACATACCATTCGATACT
TGTCACTGCACGATAACAAATATCTGCGCTATTTCTCTGGACATACCAAA
ACTGTTGTCTCCCTTCACATGTCACCTGTAGATGATAGCTTCATATCCGG
TTCACTGGATCGTACCATCAGATTGTGGGATCTTCGCTCCAACAACTGTC
AGTGTTGTCTCCCTTCACATGTCACCTGTAGATGATAGCTTCATATCCGG
TTCACTGGATCGTACCATCAGATTGTGGGATCTTCGCTCCAACAACTGTC
AGGGTTTGATGCATGTGAGCAGTCGACCGGTGACATCTTTTGATCCTGAA
GGTCTCATCTTTGCCGCTGGTGTTGATGCTGAAATCATCCGTCTCTATGA
TCTAAGAACGTTTGATAAGGGTTTGATGCATGTGAGCAGTCGACCGGTGA
CATCTTTTGATCCTGAAGGTCTCATCTTTGCCGCTGGTGTTGATGCTGAA
ATCATCCGTCTCTATGATCTAAGAACGTTTGATAAGGGTCCATTCGCTAC
ATTCAATCTACCGCAAGCAGACAATGGCGTTGAACTTTCTAGTATCAAGT
TCAGTAACGACGGTAAAAAGATATTGGTCTCAACAACATCAGGATTGGTG
TATCTGTTAGATGCTTTCCAAGGCAATCTTCTTCATACGTTTATGGGTCC
ATTCGCTACATTCAATCTACCGCAAGCAGACAATGGCGTTGAACTTTCTA
GTATCAAGTTCAGTAACGACGGTAAAAAGATATTGGTCTCAACAACATCA
GGATTGGTGTATCTGTTAGATGCTTTCCAAGGCAATCTTCTTCATACGTT
TATGGGTCTCTCTACACCAGGAAGCGGTGCTGTTTTCTTGGAAGTATCCT
TTTCTCCAGATTCACAATACGTTTTGTCAGGGTCTCTCTACACCAGGAAG
CGGTGCTGTTTTCTTGGAAGTATCCTTTTCTCCAGATTCACAATACGTTT
TGTCAGGTTCATCGAACGGCAAGATCTACGTGTGGTCATCGGACAGCGGT
AAACGGATAACCGTGCTGGATGGTATGCACCCTGGAAGCACGCAATGTGT
TGCTTTCAACCCCAAATACATGATGTTCGCTTCTAGCTGCTCTAACCTTG
TTCATCGAACGGCAAGATCTACGTGTGGTCATCGGACAGCGGTAAACGGA
TAACCGTGCTGGATGGTATGCACCCTGGAAGCACGCAATGTGTTGCTTTC
AACCCCAAATACATGATGTTCGCTTCTAGCTGCTCTAACCTTGCATTTTG
GATACCAGATTTGAACGAAGTTGACAAATAAGCATTTTGGATACCAGATT
TGAACGAAGTTGACAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000228_pilon | genome | sc0000228_pilon:156841..164324 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 922-960:40 |
| Aaloc | 781-921:2485 |
| Aaloc | 703-777:4054 |
| Aaloc | 544-702:4498 |
| Aaloc | 427-543:6000 |
| Aaloc | 328-426:6379 |
| Aaloc | 262-324:6602 |
| Aaloc | 163-258:6913 |
| Aaloc | 1-159:7485 |
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