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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000022_pilon:1944466..1951128- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033543 ID=XLOC_033543|Name=XLOC_033543|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6663bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000022_pilon:1944466..1951128- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACAGAAAAAGCCTACCAAAAACAACCCACTATCTTCCAAAACAAGAAACG
TGTTGCTGGTAAAGTAACAAAAGCCAAAGAACAACGTTTTGTCAAATCTG
TTGGTTTGGGATTCAAAACTCCAAGAGAGGTATTATTTTTCTTTTAACCT
TTCAAACTAATTAAAATCTCTTTTTCACCCAATTTCTTTCATTTTCCTAG
CGTAGGGCTTTTGGCCAAAATTTAGACTTTTAAATCTAAGAGAGGACTAA
ATTTAACGAAAATGGCCAGAATTTGGAAAATTCTCATTGTCACTCTCCTC
CTTGTTGTTGTAAGAATAATTGTATGTAAAAATTTCCTGGCTTGGGATCA
ATGACCATTGACTGGAACTTGCAAGTATTTTTGGACCTACCTCCGGGTGC
CCCGGTGGAGGTCCTATAAATTAACCCACGTTCGTTCGTCTGTTACCAGC
TTTTCTCAGGATTGGCTCATTAGTTTTTTTTGATTTTTGGCACAATGATG
CAAAATGGTAATGCCCAAAATGTGACAGAGCCCGATTTTTGAAAAAAAAT
TCATTTTCATTGGATTTTTTCCCTATATTTCCAATTTTTTCACACAGAAA
CATTATTGATAACAATGCTCACCATCAAGCATGATTCAATTGTCGGGAAG
TCTGCAATCTATGGTGGACTGAAAAACACTTCGAAAAATACTTCACTAAT
ACACGTAATCAAGTAATGTTACATTTGTCACGAATGATGACATGTGGCAT
TCCCTATCTACTTTGTGCTATACAAAGCGTAACAAGCGACGACTTACACA
TTTCATACTACACTTCCATGACTATTTGAAACATAACCACACTTTATTAT
GAATGCGTGTCATACTATCATACTAAACTTACACATCACTCTCTACCATG
ATAACATAATACAAAGTGAGTATTGCAATATACCCCTCAAGTAATGGTAA
TTGCAGTAATTTCGGTAATCACGGTAATCACGCCCTTACGCCACAATATA
TCGCCCTTTATAGCGCCACACCATAATAAGACCTTGTATACAATATACCC
CTCAGGTAATGGTAATTGCAGTAATTTCGGTAATCACGGTAATCACGCCC
TTACGCCACAATATATCGCCCTTTATAGCGCCACACCACACCATAATAAG
ACAATGTATACAATATACCCCTCAGGTAATGGTAATTGCAGTAATTTCGG
TAATCACGGTAATCACGCCCTTCCGCCACAATATATCGCCCTTTATAGCG
CCACACCATTATAAGACAATGTATACAATATACCCCTCAGGTAATGGTAA
TTGCAGTAATTTCGGTAATCACGGTAATCACGCCCTTAAGCCACAATATA
TCGCCCTTCATAGCGCCACACCATAATAAGACAATGTATACAATGTACCC
CTCAGGTAATGGTAATTGCAGTAATTTCGGTAATCACGGTAATCACGCCC
TTACGCCACAATATATCGCCCTTTATAGCGCCACATCATAATAAGACATT
GTATACAATATACCCCTCAGGTAATGGTAATTGCAGTAATTTCGGTAATC
ACGGTAATCACGCCCTTACGCCACAATATATCGCCCTTTATAGCGCCACA
CCATAATAAGACAATGTATACAATATACCCCTCAGGTAATGGTAATTGCA
GTAATTTCGGTAATCACGGTAATCACGCCCTTCCGCCACAATATATCGCC
CTTTATAGCGCCACACCATTATAAGACAATGTATACAATATACCCCTCAG
GTAATGGTAATTGCAGTAATTTTGGTAATCACGGTAATCACGCCCTTAAG
CCACAATATATCGCCCTTCATAGCGCCACACCATAATAAGACAATGTATA
CAATGTACCCCTCAGGTAATGGTAATTGCAGTAATTTCGGTAATCACGGT
AATCACACCCTTACGCCACATTGTCTTATTATGGTGTGGCGTTATTAAGG
GCGATTTATTGTGGCGTAAAGGCGTGATTACCGTGATTACCGAAATCACT
GCAATTACCATTACTTGAGGGGTATAGTGTATACATTGTCTTATTATTGT
GTGGCGTTATAAAGGGCGATACATTGTGGCGTAAGGGCGTGATTACCGTG
ATTACCGAAATTACTGCAATTACCATTACCTGAGGGGTATATTGTATACA
ATGTCTTATTATGATGTGGCGCTATAAAGGGCGATATATTGTGGCGTAAG
GGCGTGATTACCGTGATTACCGAAATTACTGCAATTACCATTACCTGAGG
GGTATATTGTATACAATGTCTTATTATGATGTGGCGCTATAAAGGGCGAT
ATATTGTGGCGTAAGGGCGTGATTACCGTGATTACCGAAATTACTGCAAT
TACCATTACCTGAGGGGTACATTGTATACATTGTCTTATTATGGTGTGGC
GCTATAAAGGGCGATATATTGTGGCGTAAAGGCGTGATTACCGTGATTAC
CGAAATTACTGCAATTACCATTACCTGAGGGGTATATTGCAATACTCACT
TTGTATTATGTTATCATGGTAGAGAGTGATGTGTAAGTTTAGTATGATAG
TATGACACGCATTCATAATAAAGTGTGGTTATGTTTCAAATAGTCATGGA
AGTGTAGTATGAAATGTGTAAGTCGTCGCTTGTTACGCTTTGTATAGCAC
AAAGTAGATAGGGAATGCCACATGTCATCATTCGTGACAAATGTAACATT
ACTTGATTACGTGTATTAGTGAAGTATTTTTCGAAGTGTTTTTCAGTCCA
CCATAGATTGCAGACTTCCCCAATTGTCAATAAAACTGATTTTTGCAACC
AGAACTTTCTATTTTTTTTTTCCTTGCAACCCTTTCCTCTCCCCCCCCCC
CCCCATCAACAATCAATGATGAATTTTTTGCGTTATGCATTTTCACTAAA
CGCTATATTTTCTGACTGATTTTTTTCATTTTTCTCCTTGCATTGCTATC
TAACTTTCATCATCAGGTAGGTCCATTCAGCATCTAGCTTGTTAGTTTTA
AAAAGAGCATTTCTCAACTTCAGTTGAGCTAGAATCTGACAATTGTGTAT
GTAAAACTTTGGGGCAGGCTGCTAACTTCATCCTCAGGCGAATCCCTGGC
AGTCGGTACCACTACTCTCAGGTACCTAATAGCCGGGGGTTTGGAATAAG
CAGGGGGGTTGGAAAAAATCCTAAAATTTAATAAGCGGGGGGGGGTCGGA
ATCAAAATGTCCTGGGTGGAAAATGTTCGAAAAGGAGGCTAATACAGCAG
AATTAGGGCAAAAGAGGGGACTTTCAGAAAATTTTTTCCTAAAAATCAAT
AAGCGGGAGGGTTGGAATAAGAATGTCCTGGGTGGAAAATTTTCAAAAAA
TTAATTAGCGCCCCCCCCCCCCCGGCTATTAGGTACCCGAGAGTACATGA
AAAAGGCAACTATGTTCGGGAAATACTACCCCAAACAGGAAGGTGAAAAT
AACCTGAAAAGGAAACTGTTTCCAGATTGAAAATTTCATCACTTTTTTGT
TTCCCGTTTCTGTCAAGAACTTTTCATCGTTCCCGAACAGGAAATAGTAT
TTTTGTAAACAAAGCAAGTTTTTGTTTCCCTATCAAGAAAAAGTTTCCAA
ATAGGGAAGTTTTTTAATTGGGAATAGGGAAAGAGGAATTAAGAAGCGAT
TACCAGGTGGATTTCTTAACTACCTGGTGAATATTATTTGTTTTCCTTTC
CCAATTTGGAAAGTCTAGTCATTTCGGGAAGTTTTCCACCTTCCCGTTCG
AAAAATATTTCCTGTTAAGGCAATAGTTGCCTTTTTCATATAGTGTTCCC
GACTGCCTGGTGTTGGTATTTTCATTCTTTCAAAATTTCCATTTAAAAGG
TGTGATCATGAGTTTTTAGCACCAAAACAAGGCTAATAAACTTTGGGGAG
GGCTGTAGACTTCAAAAATGGTTGGATTTGATCGGAATTTTGCACACTTG
ATCATTGTGGGTGTTTTTTTTCTTCATATTTTCAAAATTTCCATTTTAAA
GGCTTAGTCATAATTTTTAGCCTCACAACTGAAGTTGAGCCCAGTGCGGT
TAGCACGTTCGACTGCGCTTGACAGTGTTTTTAAGTTTTGCTTTAAAATA
AACAACATTTTGTTATTGAACATGGTGGGCCAGCCAAACTAGAAATACTT
GGATATAATATAGGAAAGAAATTGTGACCCATTTTCAACGTCTTTATAGT
GGGGTCGTTTAGCATAATTTACGGGAAAACAATAAGATCTAGCTGAAACT
TTCTCCAGACCTTCCCTATAGGATGGTTATGCCTCAGGAAAAATTCCCCT
ATAATCCCACTGGTGGAACATCCCTTTTTTGGGACATTTCTTTTTTCCCC
AGGCAAAACCCTAAGGGCGAAATTTTTTGAAAATTTCAAACTCATTTTCA
GACATTATCAAGTATACCATTCGAAAGCTCTCGAAAAACTATATAGAAGA
CTTTTAAACGGTTATAGCTGATTTCCTTACCTAACTCGAGATATTTCATG
CGCAAGTTCCACTTTTCGCCACACTTTGGTCAAAATTGACCATAAATAGC
ATCTTCTGCGTGAATTATCTTGAGTTAGGTAATGAAATCGACTATACCCG
TTTAAAAGTCTTCTATATAGTTTTTCGAGAGCTTTCGAATGGTATACATG
ATATTGTCTGGAAATAAGTTTGAAATTTTCAAAAAATTTCGCCCTTAGGA
TTTTGCCTGGGGAAAATAGAAATGTCCCAAAAAAGAGATGTTCCACCAGT
GGGATTTTAGGGGAATTTTTCCTGAGGTATAAGCATCCTATAGAGAAGGT
CTGAGAAAGTTTCAGCTAGATCTTATTTTTTTCCTACAAACAGCCTGTAT
TTTTGTAACACGACCACACTATTAATCAGATGTTAATCATAGTGTCCTCC
CCCCCCTTTATAAAGGGGGGGGGAAATCAATTTTCCAGTTTTGAATGGGT
GAGGGGGAGAAATGAAAATTTGGATAGTAAAGGGGGGGAAAAAAGAGGGG
AAAAACATCGATAGTTGGCAAATTTGGTGGGGGGAAGTGTGAAATCACTT
CAATTTTATCTCAGCAACCAGTCAGTCCACTACATGATATCATGTGATTA
GATCATGATTGAAAATTAACCAATTTTCGTTCTATTTTGTCTAGTATTCC
TTTTGCAGCAAAATTTTACGTCTGCGTCAGGTTGAAATTTGAGAAATTTA
TACGGGTATATGGGGGGGAAATGATATTTTCAGAATTTTCTAGGGGGAAA
GCAAAAAAGAGGGGGGAAACTAAAAAACTGAAAAGTCATAGGGGGAAAAA
AAAGAGGGGGGAGGTTTAAAAAAATCAAGAATTTGGTGGGGGAACAAACC
CTGGAGGACACTATGCTGTTTAGAAATGCTTGAGAGTTTTGTAATTTGGG
AAGTAGATATCCTAACTAAAAATTTGATCTATCACTTGGTTCTTTGATAC
TTAGTTCTTTAATTGTAAACTTTTAAGTCGTCGATATTCACTTTGCGATA
AATTTGAATAAAAGTATCAAATTCATACTAACAATCCAAAAATTGCTTCT
TATTCTGTCTTATTAATCAGTTTCTTTTTTCTGTCAGGCCATCGAAGGTA
CTTTCATCGATAAAAAATGTCCATTTACCGGAAACGTTAGCATCAGAGGA
CGTATTTTAACTGGAATTGTTCAAAACATGAAAATGAAGAGAACTATTAC
CCTCAGACGTGATTACCTTCATTTCATCAAAAAATACCAAAGATTCGAAA
AACGACACAAAAATCTTGTTGCACACATGTCACCCTGCTTCCGGTAAGTT
TTATTTCTTTGGGTTGGCACCAATGAAGTCTAAGCCCAAAGGGCTAGAAT
CGAATCTTTAACCTTTCTCAGGTAAGAAAAAGTGAAGCCTGGAAATATGC
GCCGTATTTTTGACGACGGATGATTCTAGCGATTCCTTTGTTTTCGAGTG
ATATCATTTTCGAAATTTTGGTGTAAATTTTAGTTTCAATCTGTTATTTG
TGTAAAAAAACAGGTGGACCGTGCTAGGCCGCGTAACTTGAGTTTAAAGC
CCTAAAGCGCTATTGAGAACTTTTTATCCTTTCTCCACAAGGAAAAGTTT
GAAGCTTTAAATTTATGCCGAATTTATAATGATGGATCTATGATGAATCT
AGCCCTTTGTTTTTAATCGGCATATTTTTCAAAATCTGGCAATAGGTTTC
ACTTTAAATCTGGCGCTCAATTTTAAGTGTACGATAGCAAGATTATCTTA
AAATATCAGGCTGTTTGATAAGACTGGTTCAAATGCACTCCAATGTTTGT
TCCGTTTAAACTGGTTTAAATGCACCCATGAGTGTTGGATGAAGTTTAAT
CGCAGTAAAACTATCCTTTGATCCTTCAGCATTTTTAAGAGACTGACGTC
AGTATTATTGCTTTCAATCTTGGATGCATTTGCGTGGCTATGTTAGTATT
TGACATTGGCGCAATACAAATAGTTGGATGAATTTGTGCTGGCCTTTAGT
TTTACTTGGTGTGTAAATTGTATTTTGTTTCTTTTTTAGTGACGTACAAC
ATGGAGATTTAGTGACAGTCGGTCAATGCCGTCCACTCAGCAAAACTGTT
CGATTCAACGTACTAAAGGTCGCCAAAACAAACAGTGCAAAAAAATCTTT
TGAGAAATTTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000022_pilon:1944466..1951128- >XLOC_033543 ID=XLOC_033543|Name=XLOC_033543|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=918bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000022_pilon:1944466..1951128- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACAGAAAAAGCCTACCAAAAACAACCCACTATCTTCCAAAACAAGAAACG
TGTTGCTGGTAAAGTAACAAAAGCCAAAGAACAACGTTTTGTCAAATCTG
TTGGTTTGGGATTCAAAACTCCAAGAGAGACAGAAAAAGCCTACCAAAAA
CAACCCACTATCTTCCAAAACAAGAAACGTGTTGCTGGTAAAGTAACAAA
AGCCAAAGAACAACGTTTTGTCAAATCTGTTGGTTTGGGATTCAAAACTC
CAAGAGAGGCCATCGAAGGTACTTTCATCGATAAAAAATGTCCATTTACC
GGAAACGTTAGCATCAGAGGACGTATTTTAACTGGAATTGTTCAAAACAT
GAAAATGAAGAGAACTATTACCCTCAGACGTGATTACCTTCATTTCATCA
AAAAATACCAAAGATTCGAAAAACGACACAAAAATCTTGTTGCACACATG
TCACCCTGCTTCCGGCCATCGAAGGTACTTTCATCGATAAAAAATGTCCA
TTTACCGGAAACGTTAGCATCAGAGGACGTATTTTAACTGGAATTGTTCA
AAACATGAAAATGAAGAGAACTATTACCCTCAGACGTGATTACCTTCATT
TCATCAAAAAATACCAAAGATTCGAAAAACGACACAAAAATCTTGTTGCA
CACATGTCACCCTGCTTCCGTGACGTACAACATGGAGATTTAGTGACAGT
CGGTCAATGCCGTCCACTCAGCAAAACTGTTCGATTCAACGTACTAAAGG
TCGCCAAAACAAACAGTGCAAAAAAATCTTTTGAGAAATTTTAATGACGT
ACAACATGGAGATTTAGTGACAGTCGGTCAATGCCGTCCACTCAGCAAAA
CTGTTCGATTCAACGTACTAAAGGTCGCCAAAACAAACAGTGCAAAAAAA
TCTTTTGAGAAATTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000022_pilon | genome | sc0000022_pilon:1944466..1951128 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 349-471:124 |
| Aaloc | 142-345:1077 |
| Aaloc | 13-141:6664 |
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