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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000022_pilon:1998099..2001149- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033540 ID=XLOC_033540|Name=XLOC_033540|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3051bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000022_pilon:1998099..2001149- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGGTCAAACAGGTCACAAAAAATTGTGCCATTGCTACATTGGTATT
TGGTGTGCTTCATGTTGTCATTGGTATCACACTTTTCGCATGTTGTTTTG
TCTTCTCGGCCACCATAACAGGTGGCAGTGTGGTGGCCCCTTATTGGACA
GCACTACCAGTAAGTCTTAGTTGTAAAATACAGTTGACGCTCTCTAGTTA
CTTTAATGGGATAAAATTTCGCAGGGATTAAATTTCGCAAGAATTAAATT
TCGCGGGGATTAAATTTCGCGGGGATTAAGTCCCAATAGAAATTTGAAAA
AGGCCTTATTGGCGAAATATTTTTAAACAAAACTCACAAAATGTAAAATA
AACTACTATTTGAACGTTTAATGGCATCAAAGAAGCGCTGATAATGTGTA
TTTCAACAACCAACACAAAAACGATTTTGCAGCAAAAGGCACAAATTGTG
AAAATATTGTCTCCCGGTAGTGCCATCCGCACTACCTAATTTAATCCCCA
CGAAAACTTATCCCATTAAAGTAGACGTTCTACTATTCGCTGCACTCCAC
TATTCGATTATTGGAACTCACCGTCAAGAAGAAACTCTCATAAAAGACTC
TCTGTTATTTGATATACTCTCTAATTCGATGAATATCTAATCCCCTCTTT
AAAATCGAATCAGAGAGCGTTAACTGTAGTAAAATAATACACCGACCTCA
AATCAGTTTTTTTTCACAACCATTTTGGGAAACAAACTGACTTGATGAAA
TCGCAAATTGACCTATGCTTGGCGAAAGAACAACCACCAAATCTAACTCT
AACAGACAGTTTGAACGTGTAAAGTATTTTAACCATTCCGTCTATCATAT
TTTTGTAGATAGTCATTCTGAGCATTATGGAAATCGCGCTTGGAATCACA
AAGAACCACTGTTTGGTAAGAGCATCTGAATTAATTTACTGGCTTAAAGG
CCCGGGGGGGGGGCTACCTAGGTAGGTGAGGGATACTTATATGTCCCACA
CTTAAGAGTACCTTTTTGGAACCTGGCAGTCACAAAAATAGGAAGATTTC
AACTTTTTAACCGTTAAATGATCGAAATTTGGTAAAATTGGTTTCAACAA
GAGTTTTTGCCTTCTCTTAGTCTAACTGAAGTCTGAGGGCAAAAACTCAA
TTGGCACCTAACCTTCAGTTCTCCAAGTTCAATCTAGTAACCACCCCTTT
CCAAACGATAAGTTACACCCGACGTCTCAAATTCAACAATACAAGATTAC
TCACATAATTCGATTCCTGACTATTCATAGTTCTTTTTTTGCAGATGATA
GCGGTAATGGTATTAAACATTATATTTTGCCTTCTATCATGGATTGCAAC
AGCCGTGATGGCAGTGGCAGCTGGAGTGTACAGCTTAGCGTTGGATAAAT
TGGAACACTTTGGACATTGCATGGAATTCAATAATAAATGTTATTGCGAT
GGATCCACTTATAGTAAGTTCCTTTCATTCGAGCCGATTCGAGCCAATAC
GATTCTAATAAGGACGTCAAAAACTTTCTAGTCTTTTTGGGTTTTCATGC
CTAAAATGTTTTTAAGATGTTCTTATTTTTCAGTACTTTTTGTGTTCTTA
AACTTTTGACCTCGTAGTGCTAAAAAAACCTTTCACTGTCTTTAAAACCC
TCCAAGTGTCAATAGGATGAATGACTTATTAAATTTCATTGGTACGACTA
CTGAGTATCTTATGAGAAATTATTATTTATTCTCATCAACATAATTTGAT
ACCATAAGATAATTAGAGTTACACAGTGGATCCTCCAGAACTCGAACATG
CATTGGAAACTCGAGATTTCGAGTTACGGAGTAAGGCTAATAAGGCATTG
TTAACTGAAGGGAACATGAAACTTGTTCGAGTTAAGGAGACATTCGAGAT
ATAGAGGTTCGAGTTATAGTGTTAATAGGGGTTCGATCTGTTTAAAGGAC
TTCAAATTTTAAGGGGAGGGGACACTTTGTCCCAGCCTGCATTTTGATCA
ACCGTTTATTTTTATTGCAGACACCCCTTGCAGGGACCTTAATACCATTT
CAACACTGTTGGATTTATTTGCTGCTTTCAATGCTTTGGCAGCCATTGTT
TGTTTGTGTGTCTCAATCACAGGATGTGTGGCTGTTTGTTGTAAGCCTGA
AGATGAGGCATCAGAGGTGAGAAGTCTTTAATAATGTGTATCTGTATGAA
TGCGGGTAGGGTTCTTTTGCCTGCGTGAATGCGTAAATTGAAAAAACTTA
TGCGTGAAGGTGAAAATCCACTTTTTGATTGCGCGAATGTGGAAATATGC
TCTGTTTTGCATAAAATACGTGAATTTTCTCTTTTTTCCATCGATTTTGT
GAAAATTTCCCCGATTTTCAAACGTTTGAACGATTTTTCCCGAAAAAAAT
TACCGGTAAAAAGAATGCATGAATGTGTGAAATTTGAGTCATCGAGGAGG
AGGGGAGGGGAGGGGAGCTCAATAATATGGTGGTAATATTTGTTTTGATT
GTTTGGTTAAGACAGACAGTGCTGAGTGAGATTCTCACTTTGCCGTTTTG
TAAGATTCGGTTCAATTTGGGGGGGGGGGGGGGACACGGGATGTAAAAAC
TATAAAAATACAGTGAAGTCTCCATAAATCAAACCCGAAGGGGGGGAGGG
ACACAAATTTGTTGATTTCGAGTGATGGAGTTTGGTTCATAAGGCATTGT
TAACTGAGGGGAAGAAAAAACTTGTTCGAGTTAAGGAGACATTCGAGTTA
TTGAGGTTCGAGTTAATGAGACTTAACTGTATACTAATTTTCTTCATAGG
GTCAAGTGGTACAAGCAGGTCAAGTAAGGTACAATGCTCGTGGAGGACAG
ACCGTTATCATCAATACAGCTCCACCTTCTGCTCCACCGCAGCCACCTCC
GTATAGTTACCAAGGACCCAGTAGTCAAGACAACAAGAATCCAACAATGC
CCATGCAACCGATGCAATTCAATTCGAATTTTCAACAACAACAACAAACA
CCCGCTTATCAACAGCCTCAAAATAACCAGCTTATTATGTACCAACAATA
A Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000022_pilon:1998099..2001149- >XLOC_033540 ID=XLOC_033540|Name=XLOC_033540|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1566bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000022_pilon:1998099..2001149- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGGTCAAACAGGTCACAAAAAATTGTGCCATTGCTACATTGGTATT
TGGTGTGCTTCATGTTGTCATTGGTATCACACTTTTCGCATGTTGTTTTG
TCTTCTCGGCCACCATAACAGGTGGCAGTGTGGTGGCCCCTTATTGGACA
GCACTACCAATGATGGTCAAACAGGTCACAAAAAATTGTGCCATTGCTAC
ATTGGTATTTGGTGTGCTTCATGTTGTCATTGGTATCACACTTTTCGCAT
GTTGTTTTGTCTTCTCGGCCACCATAACAGGTGGCAGTGTGGTGGCCCCT
TATTGGACAGCACTACCAATAGTCATTCTGAGCATTATGGAAATCGCGCT
TGGAATCACAAAGAACCACTGTTTGATAGTCATTCTGAGCATTATGGAAA
TCGCGCTTGGAATCACAAAGAACCACTGTTTGATGATAGCGGTAATGGTA
TTAAACATTATATTTTGCCTTCTATCATGGATTGCAACAGCCGTGATGGC
AGTGGCAGCTGGAGTGTACAGCTTAGCGTTGGATAAATTGGAACACTTTG
GACATTGCATGGAATTCAATAATAAATGTTATTGCGATGGATCCACTTAT
AATGATAGCGGTAATGGTATTAAACATTATATTTTGCCTTCTATCATGGA
TTGCAACAGCCGTGATGGCAGTGGCAGCTGGAGTGTACAGCTTAGCGTTG
GATAAATTGGAACACTTTGGACATTGCATGGAATTCAATAATAAATGTTA
TTGCGATGGATCCACTTATAACACCCCTTGCAGGGACCTTAATACCATTT
CAACACTGTTGGATTTATTTGCTGCTTTCAATGCTTTGGCAGCCATTGTT
TGTTTGTGTGTCTCAATCACAGGATGTGTGGCTGTTTGTTGTAAGCCTGA
AGATGAGGCATCAGAGACACCCCTTGCAGGGACCTTAATACCATTTCAAC
ACTGTTGGATTTATTTGCTGCTTTCAATGCTTTGGCAGCCATTGTTTGTT
TGTGTGTCTCAATCACAGGATGTGTGGCTGTTTGTTGTAAGCCTGAAGAT
GAGGCATCAGAGGGTCAAGTGGTACAAGCAGGTCAAGTAAGGTACAATGC
TCGTGGAGGACAGACCGTTATCATCAATACAGCTCCACCTTCTGCTCCAC
CGCAGCCACCTCCGTATAGTTACCAAGGACCCAGTAGTCAAGACAACAAG
AATCCAACAATGCCCATGCAACCGATGCAATTCAATTCGAATTTTCAACA
ACAACAACAAACACCCGCTTATCAACAGCCTCAAAATAACCAGCTTATTA
TGTACCAACAATAAGGTCAAGTGGTACAAGCAGGTCAAGTAAGGTACAAT
GCTCGTGGAGGACAGACCGTTATCATCAATACAGCTCCACCTTCTGCTCC
ACCGCAGCCACCTCCGTATAGTTACCAAGGACCCAGTAGTCAAGACAACA
AGAATCCAACAATGCCCATGCAACCGATGCAATTCAATTCGAATTTTCAA
CAACAACAACAAACACCCGCTTATCAACAGCCTCAAAATAACCAGCTTAT
TATGTACCAACAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000022_pilon | genome | sc0000022_pilon:1998099..2001149 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 532-783:253 |
| Aaloc | 388-531:1030 |
| Aaloc | 217-384:1758 |
| Aaloc | 160-216:2194 |
| Aaloc | 1-159:3052 |
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