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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000267_pilon:136370..141975- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033516 ID=XLOC_033516|Name=XLOC_033516|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5606bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000267_pilon:136370..141975- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAAATATGGCACAAAATGAAACAGTAACACTAGAATGCATCAGAAAAGA
AATCGGAGATGAGAATTTACCAGTAAAAGGTGTTATGTTTGGTGGTGATG
GAGCTGTCGGTAAAACCTCCATGTACCTTTATTATTTCCTTGAGAAAAAG
GAGCCTAAATACATACCTGTTAAAGTTGAAACTGACTATGGACCAAAAAT
ATACACATATAAAAAAACTGGAGAAAAAGTAGGGATTTATTATGATGATC
ATGAAGGAGGCGGCGAGGACTGGGATCGGCTACGTCATCTTGGTTATGAA
AGAGCTGACGTTGTAGTTCTTTGTTTTTCTATTGGATCTAGAAAGAGTTT
TGATAACATTGAAGAATATTGGTACCCTTTTGTACAAAAACATGCATCAA
AAGCACCCATTGTGTTGTGTGGTACACAAACAGATATGAGAACTGACCAG
TTCTATCTTGATAGGTTAGCAGAGCATAATCAAAAACCAATAACTAATGT
TGAAGGTAAAAAGCTGGCTCAAAAAATTAAAGCTGTAGGTTATTTTGAAT
GCTCGAGTGTTGAAGGAAGAGGAGTGAAAGAACTTTTTGATGCAGCTGCC
GAAGCGACGAACCCAAATGTTACAACTAATTCTAAGCCAGGAAAATGCTT
TTTAATGTAGACTAACCAAACTCGCACTATGCATCAATTTTGACGGTTAT
TAAATCGATTTGCAACATCCTATATAGAAAAGCAAATCGTCACGAGGACG
AAATTACGAAATTGACTTCATTTCCCTTTGAAAGTACAAAGAGCACTTAA
AAATTGTCATTTAAAGTAAGGTGGATAGAGATTTCTTTTTACATTGGACA
GGATAAAGACGAATGAAGTTTATTTCTCCTTTATTTCCCTTTAAGAAATT
TAAGGTTTAAACCTCTTTTTCCTTTAGAAGTACAAAGATTATAACTTATT
CTCTTTTGAAACTCTTCATTTATTTTGAAATACAAAGAATATAGTTTGCT
CTCCTTGGAATATACAAAGGTTAGACTTAATTTTCCTTTAAAAGTTTAAA
AGTTAAAAAAAATAAACTTCCAATGATTTTCCTTACATTTATCTTCCTTT
GAAAATACACAAAATTTTCTTTCAAGAAATGAAATTCGCTTAGATTTTAC
TTTACCTTAAATCGTTGAATAATTCTATGATTAACGTATACGATGTTGTG
TTTCCATATGACCCTTTGACGACAACATCATAAAATGCATAAAACGTTAC
TATCATAATTCAATCATATCAAACACGTTTCATATTTCTCATTTAAAGTT
AAGCAGTCCATCTTAACTTTATATAAACCACAAGCTGAAAAACACAAAAA
TGCTTTACTCTACACATTATAAAACATCATTAGAGAAATGTGTGGTCCGT
TGAGGGTTGGTTATTAGGAATTTCTCTCGTAGAACGCGCACGGCCTTTGG
TTAGTCGTACAGGGTTCGGTGTGACCCAAATACACTGCCCGACTCTAAGC
CTTCATAGGATTGACCATACATCTCTCTTTTCCATCATTTTTTAAGAATA
GCCTTTGAGTTCCTAAGATATGCTTCTTTCTGAAAGACTTACCTTTCCTT
CTTAATTTTGTGTTTCTGTTTCAAGTTACAAGTCACTTTAAAATCATCTA
AATCAAAGCATATGCAGGAATCAGAGCTTCCGTGGCGCAATTGGTTAGCG
CGTTCGGCTGTTAACCGAAAGGTTGGTGGTTCAAGCCCACCCGGGAGCGA
TGATTTTTCTTAGTTAAATGATCAGTATGTAGTAAGTAAAATCAGCTTGG
TCGCTCCGGAGTTTTAACAGGGCCTTCGCGACCTGATTGTTAATGGCTTT
CTAGCCATTACATTAGAAATGATAATATTAAATGTTGAAAGTGATGTCCA
TTGTCTGACTAAGAAATTTCGAAATTTTCGTTATAGAATCAGTTAACATG
GCTGGATTAATGAGATGCATGTACATCATTTTGTATATGTGTATAATGTT
CATTTATAAAAAAGGTTCGTTATGTTTTTCACTACACGCTTTTTATTGTA
AGAATATTCATGATGAAATTGGCCAAAAATGTTAAGAATACGCCTTTAAA
TCTCGGAGTTTTTTTCCCGAAATATTTAGTGATATTTTATCTTATAAGAA
ATCTTATAAGAAATGTTTGTATTGTTTAAAAGTACTTTGTACGTATTAAC
TTATTTTGTTAAATTATTATTATCGTTACGTACATTGTTAAAAAAATATT
CGCGCGGCATATTCTATGAAATACTGCTATAATTACCGTATCACTTTGAA
TAAACGCCCACTACTTTTAAATAACCCTCCCCTTTTAATAAACATCCCTC
CTAATAGGAAAATTATCTAATAAAGATCCCCTCAAATAAACGTCCCTCCT
AAAATCGAAAAAATGAAATAAACGCCCCTGGCGTTTATTCGAAGTAATAC
GGTATTACATTTGAGTCTTTTCCGAGACTAGTTCCGTTTTTTGTAATATT
AGGAAAATCAGAAAGAATATGTTCCCATTATACATGCAATAACTGTTACT
CGTTACATTAATTTTTAGAAATAATTATATCTAAAAATATTGGACGATGA
AAGTAACCGAGGATATGAAATGGCACCTCATTGGATATTGACTTTTGGAA
GGAATTGATAATGCATTGAGACCAGAGAAAGTTATGAACCAATGAACGAC
AAATGAAAACGTAAGCAAAACTTCTTTATCCTACATTATTGTTCTGGTGC
TGTGTGTCTATTTGAACGTCTGTGTTTCAGTCAATACACTATAAAGTCCG
AAAGAGTCTTATAATGCTGCCTTAAGGGCTCTGACCATAGTGAATTTTTC
ATAATTGCCGTGCTTAAAATGTGTTTCCTGACTGATATAACCAACAAAAC
TATGGCATGTTATACATTTTCTGTTAGAAAAACTATTCCTGAATCTGAAA
ATTCAAAAATTGCATTGAAAAAATTTGATGAAGAAGAAAATGAAGTCTTT
TGCGAGGAAGAGTATTTCAACTTTGAAGAGCTTAGTTTCGGCGAAGAAAA
AACATTTTGAAAAATTTTTCGCATTACCTGGTGTATCTTTTACCGAACAA
TAAAAATTTTTGCGGAAAATTTTTGTAAATGCTTCTTTGTCTCGAAATCT
TCAAAATAGTGGTTTTTCATCAATTTTTCATCTGGATTTTGCTTAAAAAA
ACAGTCATAACTTTTGACACATCATTTTAGAAAAATTTTCCGCAAAATTT
AAAATAGTTCAATTCTTTGCGGACAGTGTAAAGAAATTTTGAAACAAAAA
AGTTAATTACCCATTAAAACTAAGCACTTTTTGTAAAAGAGGGTGATGCA
ACATATTATTAACATCGTTTTAAAGTTCATAACGTCATTTTTGCAATTAA
ATTCTTAATTACTCCCTTAATTCGATTAAAAAGCAATTTATAAAGGCAAT
TCTTTGTTAAAAGTGTTAAGGAACCTGAAATATAACTTTTATGTTCAAAT
ACCAAAATCAACTTTTGGACTATGGTCAGAGCCCTTAATGGGGAGCTTAT
CTGACGTACGTATTCAGAGAAATGCAGTCGAAAAGTTTTGTTAGTCTACG
AGGCATCAGTTTTCACTCGACAAGACCAGCAACGAGGGTTTTTTACAGAA
TATCTTAAAATAACTCGTGAAAATCTATTTCGAATCTATTTTCTTGAAAA
TTATCACATCCATTTTCCTATAAGAGCAAATGAATCTTTCCAGGAGTAAA
AAATGCAACTCAGAACAGTTTTTAATTTTCAGGAAAGCTAATTTTATCAA
AAAATAGATGCCTTTATCCAGGTGCCGGCTGAAAAAAAAACGGATACGAT
TTTCCACGGGAAATTAAACCTTTCAGAACATAATTGGTAAAAATTTAAAA
AATGTTTTTAATTAAATTTATTTATAGCGTTCGAACATTTTTATCTTCAT
TCAGCTTCTTTCCAACTATCTATCAGGTAGGTCTATTCAGCATTTTGCTT
GTTAGTTTTGCCATGATTTAATTAAGTTTCTTGAATTGAATTTGAGGCGT
AGTAGTGTAGTGGTTATAAACCTTGATTCCTATCTGAGTGGTCAGGGTTC
GATTCTTACTCGGTGCTTTGATTCGCTCGGGTCGACCCATGCCTTGTGAG
GGGAAATGGGTGCCGTCACTCTGATAAAGGAGTATGGGGAGTATCATATG
TTCGACACCTGCGAAGATATATGTCCTCCCGTGTAGTTCGAGTATTATCG
TCTACACTAATAACTCTGTCTTGTCGCGAGCGCAGGGTTAGCAGTGTCTA
CTAAGCGTAGTAATTTCCCTATTCTAGGGTAGGTATCTATCCAGGGATAG
AGCCCATTCTGGATGATTTTGAGGGTTCATTTCTCCTCTTTCTTGACTTT
TTTCATCGTTTATTCATTTCATTTATATTCATTCATTTCATTTCATTTAT
TTATTTCATTCGTTTATTCATTCATTCATTCATTGGCCCAGCGCGCAGCG
GTATGGGCCTTTAAAACGCAACTGGTCGAAAAGATTTGACTTTGTCGGGG
CCTATGCGCGCGATTATCAATTGACGCATCGAGGCTATGGAATTATCTGG
CTTTCTATTGTGAGCATGCGTAAGAAAAACACATATAATAATTAATACCT
CCAACTTATCTGGTCAAATCTTTTTTTCTCTCAAAATATTAAAGTAATTA
AATTTTTTTTACTCGCGCAACTTGAGTAAATAAATCAAAAAATTTACTCC
TGTAAATTTGTACAGCGACTCTTTAACGAAAAAATATGTTGACACTGCCA
ATACTGCTGGGCCTTTACGCCGCTTAGGCTTTCTTGTTCCTTTTGATTTC
ATTTCTATTTCATTCAAATACGTCGACTCGTTCATTTGTTGGAACAATTA
GGTAAGGTAAATATCTGTTAAACATGAAATATTAAGTAAATAATAACATA
AGAATACTTCTTTATTTTAGACGATTAAATATAAAAAAATGTCAGATACT
GAAAAAGAAATCGAAGATGAGAAAATTCAATTAAAACGTGTTTTCTTTGG
TGGTGATGGAGCGGTTGGTAAAACTTCGATGTTTCTTTATTATTTCGCGG
AAAAGAAGCCCAACTTGAAGCATGAATATATTCCTTCTACAGTTTCGGAC
GCCAATGGATCTAAGATATACACTTATAAAAACACTGGAGAAAAAATAAG
AATTTATTATATCGATTGGGGAGTTGGCAAGGACTGGGAGAGAACAAGCC
ACCTTGGTTACAAAGGGGCTGCCGCTGTTGTACTTTGTTTTTCTATTGGA
TCTAGGAGCAGTTTTGAAAACATTGAAGAGTATTGGTACCCATTCATGAA
AAAATATGCATCAAAAGCACCCATTGTGTTGTGTGGTACAAAAACAGATA
TGAGAACTGACGAGTTAGCAAAGCATAATCAAAAACCAATAACTAATGTT
GAAGGTAAAAAATTGGCTCAAAAAATTAAAGCTGTAGGTTATTTTGAATG
CTCAAGTGTTGAAGGAAGAGGAGTAAAAGAACTTTTTGATGCAGCAGCAG
AGGCTACTCATCCTGATATTACCAAAACCAAATCAGAAGAATGCTCAGTT
ATGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000267_pilon:136370..141975- >XLOC_033516 ID=XLOC_033516|Name=XLOC_033516|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1314bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000267_pilon:136370..141975- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAAATATGGCACAAAATGAAACAGTAACACTAGAATGCATCAGAAAAGA
AATCGGAGATGAGAATTTACCAGTAAAAGGTGTTATGTTTGGTGGTGATG
GAGCTGTCGGTAAAACCTCCATGTACCTTTATTATTTCCTTGAGAAAAAG
GAGCCTAAATACATACCTGTTAAAGTTGAAACTGACTATGGACCAAAAAT
ATACACATATAAAAAAACTGGAGAAAAAGTAGGGATTTATTATGATGATC
ATGAAGGAGGCGGCGAGGACTGGGATCGGCTACGTCATCTTGGTTATGAA
AGAGCTGACGTTGTAGTTCTTTGTTTTTCTATTGGATCTAGAAAGAGTTT
TGATAACATTGAAGAATATTGGTACCCTTTTGTACAAAAACATGCATCAA
AAGCACCCATTGTGTTGTGTGGTACACAAACAGATATGAGAACTGACCAG
TTCTATCTTGATAGGTTAGCAGAGCATAATCAAAAACCAATAACTAATGT
TGAAGAAAAATATGGCACAAAATGAAACAGTAACACTAGAATGCATCAGA
AAAGAAATCGGAGATGAGAATTTACCAGTAAAAGGTGTTATGTTTGGTGG
TGATGGAGCTGTCGGTAAAACCTCCATGTACCTTTATTATTTCCTTGAGA
AAAAGGAGCCTAAATACATACCTGTTAAAGTTGAAACTGACTATGGACCA
AAAATATACACATATAAAAAAACTGGAGAAAAAGTAGGGATTTATTATGA
TGATCATGAAGGAGGCGGCGAGGACTGGGATCGGCTACGTCATCTTGGTT
ATGAAAGAGCTGACGTTGTAGTTCTTTGTTTTTCTATTGGATCTAGAAAG
AGTTTTGATAACATTGAAGAATATTGGTACCCTTTTGTACAAAAACATGC
ATCAAAAGCACCCATTGTGTTGTGTGGTACACAAACAGATATGAGAACTG
ACCAGTTCTATCTTGATAGGTTAGCAGAGCATAATCAAAAACCAATAACT
AATGTTGAAGGTAAAAAATTGGCTCAAAAAATTAAAGCTGTAGGTTATTT
TGAATGCTCAAGTGTTGAAGGAAGAGGAGTAAAAGAACTTTTTGATGCAG
CAGCAGAGGCTACTCATCCTGATATTACCAAAACCAAATCAGAAGAATGC
TCAGTTATGTAAGTAAAAAATTGGCTCAAAAAATTAAAGCTGTAGGTTAT
TTTGAATGCTCAAGTGTTGAAGGAAGAGGAGTAAAAGAACTTTTTGATGC
AGCAGCAGAGGCTACTCATCCTGATATTACCAAAACCAAATCAGAAGAAT
GCTCAGTTATGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000267_pilon | genome | sc0000267_pilon:136370..141975 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 508-657:151 |
| Aaloc | 1-504:5607 |
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