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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000267_pilon:136403..141969- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033508 ID=XLOC_033508|Name=XLOC_033508|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5567bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000267_pilon:136403..141969- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCACAAAATGAAACAGTAACACTAGAATGCATCAGAAAAGAAATCGG
AGATGAGAATTTACCAGTAAAAGGTGTTATGTTTGGTGGTGATGGAGCTG
TCGGTAAAACCTCCATGTACCTTTATTATTTCCTTGAGAAAAAGGAGCCT
AAATACATACCTGTTAAAGTTGAAACTGACTATGGACCAAAAATATACAC
ATATAAAAAAACTGGAGAAAAAGTAGGGATTTATTATGATGATCATGAAG
GAGGCGGCGAGGACTGGGATCGGCTACGTCATCTTGGTTATGAAAGAGCT
GACGTTGTAGTTCTTTGTTTTTCTATTGGATCTAGAAAGAGTTTTGATAA
CATTGAAGAATATTGGTACCCTTTTGTACAAAAACATGCATCAAAAGCAC
CCATTGTGTTGTGTGGTACACAAACAGATATGAGAACTGACCAGTTCTAT
CTTGATAGGTTAGCAGAGCATAATCAAAAACCAATAACTAATGTTGAAGG
TAAAAAGCTGGCTCAAAAAATTAAAGCTGTAGGTTATTTTGAATGCTCGA
GTGTTGAAGGAAGAGGAGTGAAAGAACTTTTTGATGCAGCTGCCGAAGCG
ACGAACCCAAATGTTACAACTAATTCTAAGCCAGGAAAATGCTTTTTAAT
GTAGACTAACCAAACTCGCACTATGCATCAATTTTGACGGTTATTAAATC
GATTTGCAACATCCTATATAGAAAAGCAAATCGTCACGAGGACGAAATTA
CGAAATTGACTTCATTTCCCTTTGAAAGTACAAAGAGCACTTAAAAATTG
TCATTTAAAGTAAGGTGGATAGAGATTTCTTTTTACATTGGACAGGATAA
AGACGAATGAAGTTTATTTCTCCTTTATTTCCCTTTAAGAAATTTAAGGT
TTAAACCTCTTTTTCCTTTAGAAGTACAAAGATTATAACTTATTCTCTTT
TGAAACTCTTCATTTATTTTGAAATACAAAGAATATAGTTTGCTCTCCTT
GGAATATACAAAGGTTAGACTTAATTTTCCTTTAAAAGTTTAAAAGTTAA
AAAAAATAAACTTCCAATGATTTTCCTTACATTTATCTTCCTTTGAAAAT
ACACAAAATTTTCTTTCAAGAAATGAAATTCGCTTAGATTTTACTTTACC
TTAAATCGTTGAATAATTCTATGATTAACGTATACGATGTTGTGTTTCCA
TATGACCCTTTGACGACAACATCATAAAATGCATAAAACGTTACTATCAT
AATTCAATCATATCAAACACGTTTCATATTTCTCATTTAAAGTTAAGCAG
TCCATCTTAACTTTATATAAACCACAAGCTGAAAAACACAAAAATGCTTT
ACTCTACACATTATAAAACATCATTAGAGAAATGTGTGGTCCGTTGAGGG
TTGGTTATTAGGAATTTCTCTCGTAGAACGCGCACGGCCTTTGGTTAGTC
GTACAGGGTTCGGTGTGACCCAAATACACTGCCCGACTCTAAGCCTTCAT
AGGATTGACCATACATCTCTCTTTTCCATCATTTTTTAAGAATAGCCTTT
GAGTTCCTAAGATATGCTTCTTTCTGAAAGACTTACCTTTCCTTCTTAAT
TTTGTGTTTCTGTTTCAAGTTACAAGTCACTTTAAAATCATCTAAATCAA
AGCATATGCAGGAATCAGAGCTTCCGTGGCGCAATTGGTTAGCGCGTTCG
GCTGTTAACCGAAAGGTTGGTGGTTCAAGCCCACCCGGGAGCGATGATTT
TTCTTAGTTAAATGATCAGTATGTAGTAAGTAAAATCAGCTTGGTCGCTC
CGGAGTTTTAACAGGGCCTTCGCGACCTGATTGTTAATGGCTTTCTAGCC
ATTACATTAGAAATGATAATATTAAATGTTGAAAGTGATGTCCATTGTCT
GACTAAGAAATTTCGAAATTTTCGTTATAGAATCAGTTAACATGGCTGGA
TTAATGAGATGCATGTACATCATTTTGTATATGTGTATAATGTTCATTTA
TAAAAAAGGTTCGTTATGTTTTTCACTACACGCTTTTTATTGTAAGAATA
TTCATGATGAAATTGGCCAAAAATGTTAAGAATACGCCTTTAAATCTCGG
AGTTTTTTTCCCGAAATATTTAGTGATATTTTATCTTATAAGAAATCTTA
TAAGAAATGTTTGTATTGTTTAAAAGTACTTTGTACGTATTAACTTATTT
TGTTAAATTATTATTATCGTTACGTACATTGTTAAAAAAATATTCGCGCG
GCATATTCTATGAAATACTGCTATAATTACCGTATCACTTTGAATAAACG
CCCACTACTTTTAAATAACCCTCCCCTTTTAATAAACATCCCTCCTAATA
GGAAAATTATCTAATAAAGATCCCCTCAAATAAACGTCCCTCCTAAAATC
GAAAAAATGAAATAAACGCCCCTGGCGTTTATTCGAAGTAATACGGTATT
ACATTTGAGTCTTTTCCGAGACTAGTTCCGTTTTTTGTAATATTAGGAAA
ATCAGAAAGAATATGTTCCCATTATACATGCAATAACTGTTACTCGTTAC
ATTAATTTTTAGAAATAATTATATCTAAAAATATTGGACGATGAAAGTAA
CCGAGGATATGAAATGGCACCTCATTGGATATTGACTTTTGGAAGGAATT
GATAATGCATTGAGACCAGAGAAAGTTATGAACCAATGAACGACAAATGA
AAACGTAAGCAAAACTTCTTTATCCTACATTATTGTTCTGGTGCTGTGTG
TCTATTTGAACGTCTGTGTTTCAGTCAATACACTATAAAGTCCGAAAGAG
TCTTATAATGCTGCCTTAAGGGCTCTGACCATAGTGAATTTTTCATAATT
GCCGTGCTTAAAATGTGTTTCCTGACTGATATAACCAACAAAACTATGGC
ATGTTATACATTTTCTGTTAGAAAAACTATTCCTGAATCTGAAAATTCAA
AAATTGCATTGAAAAAATTTGATGAAGAAGAAAATGAAGTCTTTTGCGAG
GAAGAGTATTTCAACTTTGAAGAGCTTAGTTTCGGCGAAGAAAAAACATT
TTGAAAAATTTTTCGCATTACCTGGTGTATCTTTTACCGAACAATAAAAA
TTTTTGCGGAAAATTTTTGTAAATGCTTCTTTGTCTCGAAATCTTCAAAA
TAGTGGTTTTTCATCAATTTTTCATCTGGATTTTGCTTAAAAAAACAGTC
ATAACTTTTGACACATCATTTTAGAAAAATTTTCCGCAAAATTTAAAATA
GTTCAATTCTTTGCGGACAGTGTAAAGAAATTTTGAAACAAAAAAGTTAA
TTACCCATTAAAACTAAGCACTTTTTGTAAAAGAGGGTGATGCAACATAT
TATTAACATCGTTTTAAAGTTCATAACGTCATTTTTGCAATTAAATTCTT
AATTACTCCCTTAATTCGATTAAAAAGCAATTTATAAAGGCAATTCTTTG
TTAAAAGTGTTAAGGAACCTGAAATATAACTTTTATGTTCAAATACCAAA
ATCAACTTTTGGACTATGGTCAGAGCCCTTAATGGGGAGCTTATCTGACG
TACGTATTCAGAGAAATGCAGTCGAAAAGTTTTGTTAGTCTACGAGGCAT
CAGTTTTCACTCGACAAGACCAGCAACGAGGGTTTTTTACAGAATATCTT
AAAATAACTCGTGAAAATCTATTTCGAATCTATTTTCTTGAAAATTATCA
CATCCATTTTCCTATAAGAGCAAATGAATCTTTCCAGGAGTAAAAAATGC
AACTCAGAACAGTTTTTAATTTTCAGGAAAGCTAATTTTATCAAAAAATA
GATGCCTTTATCCAGGTGCCGGCTGAAAAAAAAACGGATACGATTTTCCA
CGGGAAATTAAACCTTTCAGAACATAATTGGTAAAAATTTAAAAAATGTT
TTTAATTAAATTTATTTATAGCGTTCGAACATTTTTATCTTCATTCAGCT
TCTTTCCAACTATCTATCAGGTAGGTCTATTCAGCATTTTGCTTGTTAGT
TTTGCCATGATTTAATTAAGTTTCTTGAATTGAATTTGAGGCGTAGTAGT
GTAGTGGTTATAAACCTTGATTCCTATCTGAGTGGTCAGGGTTCGATTCT
TACTCGGTGCTTTGATTCGCTCGGGTCGACCCATGCCTTGTGAGGGGAAA
TGGGTGCCGTCACTCTGATAAAGGAGTATGGGGAGTATCATATGTTCGAC
ACCTGCGAAGATATATGTCCTCCCGTGTAGTTCGAGTATTATCGTCTACA
CTAATAACTCTGTCTTGTCGCGAGCGCAGGGTTAGCAGTGTCTACTAAGC
GTAGTAATTTCCCTATTCTAGGGTAGGTATCTATCCAGGGATAGAGCCCA
TTCTGGATGATTTTGAGGGTTCATTTCTCCTCTTTCTTGACTTTTTTCAT
CGTTTATTCATTTCATTTATATTCATTCATTTCATTTCATTTATTTATTT
CATTCGTTTATTCATTCATTCATTCATTGGCCCAGCGCGCAGCGGTATGG
GCCTTTAAAACGCAACTGGTCGAAAAGATTTGACTTTGTCGGGGCCTATG
CGCGCGATTATCAATTGACGCATCGAGGCTATGGAATTATCTGGCTTTCT
ATTGTGAGCATGCGTAAGAAAAACACATATAATAATTAATACCTCCAACT
TATCTGGTCAAATCTTTTTTTCTCTCAAAATATTAAAGTAATTAAATTTT
TTTTACTCGCGCAACTTGAGTAAATAAATCAAAAAATTTACTCCTGTAAA
TTTGTACAGCGACTCTTTAACGAAAAAATATGTTGACACTGCCAATACTG
CTGGGCCTTTACGCCGCTTAGGCTTTCTTGTTCCTTTTGATTTCATTTCT
ATTTCATTCAAATACGTCGACTCGTTCATTTGTTGGAACAATTAGGTAAG
GTAAATATCTGTTAAACATGAAATATTAAGTAAATAATAACATAAGAATA
CTTCTTTATTTTAGACGATTAAATATAAAAAAATGTCAGATACTGAAAAA
GAAATCGAAGATGAGAAAATTCAATTAAAACGTGTTTTCTTTGGTGGTGA
TGGAGCGGTTGGTAAAACTTCGATGTTTCTTTATTATTTCGCGGAAAAGA
AGCCCAACTTGAAGCATGAATATATTCCTTCTACAGTTTCGGACGCCAAT
GGATCTAAGATATACACTTATAAAAACACTGGAGAAAAAATAAGAATTTA
TTATATCGATTGGGGAGTTGGCAAGGACTGGGAGAGAACAAGCCACCTTG
GTTACAAAGGGGCTGCCGCTGTTGTACTTTGTTTTTCTATTGGATCTAGG
AGCAGTTTTGAAAACATTGAAGAGTATTGGTACCCATTCATGAAAAAATA
TGCATCAAAAGCACCCATTGTGTTGTGTGGTACAAAAACAGATATGAGAA
CTGACGAGTTAGCAAAGCATAATCAAAAACCAATAACTAATGTTGAAGGT
AAAAAATTGGCTCAAAAAATTAAAGCTGTAGGTTATTTTGAATGCTCAAG
TGTTGAAGGAAGAGGAGTAAAAGAACTTTTTGATGCAGCAGCAGAGGCTA
CTCATCCTGATATTACC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000267_pilon:136403..141969- >XLOC_033508 ID=XLOC_033508|Name=XLOC_033508|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1356bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000267_pilon:136403..141969- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCACAAAATGAAACAGTAACACTAGAATGCATCAGAAAAGAAATCGG
AGATGAGAATTTACCAGTAAAAGGTGTTATGTTTGGTGGTGATGGAGCTG
TCGGTAAAACCTCCATGTACCTTTATTATTTCCTTGAGAAAAAGGAGCCT
AAATACATACCTGTTAAAGTTGAAACTGACTATGGACCAAAAATATACAC
ATATAAAAAAACTGGAGAAAAAGTAGGGATTTATTATGATGATCATGAAG
GAGGCGGCGAGGACTGGGATCGGCTACGTCATCTTGGTTATGAAAGAGCT
GACGTTGTAGTTCTTTGTTTTTCTATTGGATCTAGAAAGAGTTTTGATAA
CATTGAAGAATATTGGTACCCTTTTGTACAAAAACATGCATCAAAAGCAC
CCATTGTGTTGTGTGGTACACAAACAGATATGAGAACTGACCAGTTCTAT
CTTGATAGGTTAGCAGAGCATAATCAAAAACCAATAACTAATGTTGAAGG
TAAAAAGCTGGCTCAAAAAATTAAAGCTGTAGGTTATTTTGAATGCTCGA
GTGTTGAAGATGGCACAAAATGAAACAGTAACACTAGAATGCATCAGAAA
AGAAATCGGAGATGAGAATTTACCAGTAAAAGGTGTTATGTTTGGTGGTG
ATGGAGCTGTCGGTAAAACCTCCATGTACCTTTATTATTTCCTTGAGAAA
AAGGAGCCTAAATACATACCTGTTAAAGTTGAAACTGACTATGGACCAAA
AATATACACATATAAAAAAACTGGAGAAAAAGTAGGGATTTATTATGATG
ATCATGAAGGAGGCGGCGAGGACTGGGATCGGCTACGTCATCTTGGTTAT
GAAAGAGCTGACGTTGTAGTTCTTTGTTTTTCTATTGGATCTAGAAAGAG
TTTTGATAACATTGAAGAATATTGGTACCCTTTTGTACAAAAACATGCAT
CAAAAGCACCCATTGTGTTGTGTGGTACACAAACAGATATGAGAACTGAC
CAGTTCTATCTTGATAGGTTAGCAGAGCATAATCAAAAACCAATAACTAA
TGTTGAAGGTAAAAAGCTGGCTCAAAAAATTAAAGCTGTAGGTTATTTTG
AATGCTCGAGTGTTGAAGGTAAAAAATTGGCTCAAAAAATTAAAGCTGTA
GGTTATTTTGAATGCTCAAGTGTTGAAGGAAGAGGAGTAAAAGAACTTTT
TGATGCAGCAGCAGAGGCTACTCATCCTGATATTACCGTAAAAAATTGGC
TCAAAAAATTAAAGCTGTAGGTTATTTTGAATGCTCAAGTGTTGAAGGAA
GAGGAGTAAAAGAACTTTTTGATGCAGCAGCAGAGGCTACTCATCCTGAT
ATTACC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000267_pilon | genome | sc0000267_pilon:136403..141969 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 562-678:118 |
| Aaloc | 1-558:5568 |
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