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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000152_pilon:554311..562826- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033278 ID=XLOC_033278|Name=XLOC_033278|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8516bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000152_pilon:554311..562826- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCTTTAAAAAGGATAACAAAGGTTGGTTAATATATACATTCAATTTT
TGTTATGACAAATCGACTAAGGAAAGACCAGAGTCGTTTCAACTTTTGAT
TTGAATATTTTTTTGTTACTGCTCTGGGGCTCCATTCTTTGACTGTTCTG
AATGTCGCTCGTCACTGATTGCTGATTAATAAGTCTATACAAACTAGTTT
AGATTTTCAGCCATTCAGGGATAGTGACAATTTTTTTAACTAAGCCTCCT
GGAAATCAGGGGCTGAACAACTTCCCTGGGAAGTACTTTTTGAGTGACAA
AGCAAAAGGTGCTGAAAACAAAAATCTATGCCTTTAAACTAGAGTAACCA
CTGGATACGTTGATAATCTAGAACATGTTAAAAACCCCTTGGACGGTCAT
GTAAATTGGGCTGTTCAAAAAATTGATAAAGTTTTTATGAGGAAAGCATC
CCCTATAAAAGCTGACAACCTTCAATGACAGACTTGAAAAGTCAAAGATT
TATTGACCCCTCCCCCTGAAAAAGTTGGTGAATACCCCCTGTATGGTTTT
GAAAATGGAATAGCCCATCCCATGCAAATTTCCAGGATAACGGTGGCAGA
AACTCGATCTTTGCTTGAATCATGAAACTTAATCCTATTTTTTGTACATG
AGTCATGAGAATCATGACAAAAATTTGATGTCCTAGGCCCTTATTAACAG
AACAAGCCCATTCTGAAGTTAATTCTTTGTGTTACTTACTTGTGTAGGTG
TTCGAGCATAGTGCTCAGGTAAGATTCTTGGTGAACCACGCCTCTATTTG
ATTAATCTGTCGAGGGAAAAAGAATCGCAGTATATATTTTTCATGTCAAG
TATTGAATTTAAATTAGGTCTCATGCACCCAGTATATCCATGAATTTGGG
GTTCATCCGGGATCGACTTTAAGTGAGTGTCAAGGGCATTTTTTAATTTT
TCAGTTGAAGTGTTTGAAGTTGAAGTTTCTTATGCTCTTTGGCATTACAT
TGAATAGTTTTGCACCTCGTTCAGAAAGAGTGCAATCTCTAAGGTAGGAT
GTTTGATTCTTGAAGATAGACAGTTGGCACAGCCGGCCGAGCCGGGGATT
TTCGTAAGCTTTTATACTGCTATTCATGTTAGGTACTATCCCTTCTAACA
CCTTCCAAACATAGATGATGCGATATAGCGTTCCCTTCTTCTTTGAAGGG
AATAGATTTTGGATTGCTTGAGACACTCCCAATACCTTACCTTGAGTTAC
CTTGAGCTTGTTTCGTAATATCTTTACGCATCCATCCTGTGAGGACCGAT
GTAAATTTTCATATTGATGATGCTGTTTGTTTCAGCTCGTCTCATCATAG
TGTAGCCAGTCACGAGTGGCTCGTCGGGAACTGTAAAAAGATATTTATCC
AGCTCAGTTTTGAATTTCAATTTCTTGCATCCAGTGAGATCCCTCAGACG
TTTTGGCAGCGAGTTGAAAAGCCTTGGTCCTTGGACTTTAAAACTTGAGT
ATATGACTTTTTGCCAGGGCCCCCTTTTCACTAGTGGTATGTGACATTTT
CTTCCTTGTCTGGGATTGGCATAGAACGTGATTGTCCCAGGATTTGGGAC
AAGCTTCTCAATAATACACCAAGTGTATATGATAATATATCTTTCACGCC
TTCTCTGCAGTGAAAACAGTTTTAATGTTTGTAGTCTTTCCCAATAGTTT
TGGTTGTGCAGGTTTTTAATCCTCCTTGTGAATGATTTTTGGAGATCTTC
GATCTGCTGGATCAGATTAACTTCATTGGGTGACCATAGTTGAGAACAGT
TGTCGATGTGTGGTATGACTAAAGACTTCCAAAGAGTGAGCATGACATCA
TGTTCTCTTGAGCTGAATGTTCTCAGAATCCAACCAATGAGTATCTGTAC
TTTTTCTACAATGGTTAGAATATGTTGGTTGAATTTCGCATCGTCTGACA
TGGTAACACCAAGATCCCTTGTTGAAGATTTGGTTTGGATTATCTTTCCT
TCACCTGTGAAATAACTGGTGGCTGGTCCGTTTCCATAATGGAGATGCTC
GAACTTTTTTCCATTTAACATCATTTTGTTTATGGTCGACCATTGATAAA
CATTGTTAAGGTCGTTTTGTAGGTGAAACTGGTCAATGATGTTTTGGATT
CCTTTCTTTACTCGTGTGTCATCAGCAAAACTTGCAAGTTCTGCTTTGGT
TGTCCCTTCATCAATGTCTGATATCATGATGATGAAGAATAATGGCCCAA
GAAACCGATCCTTGAGGTACTCCTGATTGAATTTTTGCCTGGTACGACTT
GTGACCGTCTACAAATACTACTTGGTTTCTATCTTGAAGAAATGACTTAA
TCCATTTAAGTAGTTTGTGTCTGTTATTCCAATAGATTTCAGTTTTGATA
GCAGTATCCTGTGGTCGACTTTATCAAATGCTTTTGAAAATCGAGATATA
CAACATCTACATCCAATCCTTCTTCTAGTTTTGATAGGATACTGTCATAG
TGGCTGAGTAATTGACTAAGGCATGATCGCCCTTCCCGGAAACCATGCTG
TGTTGGGTTGAACAAGTCATTGTTGTTGATAAATTCGACTATCTTCTTTC
GAACTATTTTTTCAAACACCTTGGTGAGATGGGACGTAAGTGATACTGGC
CTGTAGTTAGATGGCTCTCCTTGATCTCCACCCTTTGATATTGGTGTGAT
ATGATTTCTTTTGTGAATCTCCTCTGTTACTCCATGGTTCAGACAGTTCC
TCCAGAATATTGCGAGTGGCTTAGCAAGTTCTTCTTTGCAATTTTTCAGC
AAAATCGCAGGAAATCCATCAGGACCGGGAGCAGAGTTTGGTGGAATAAT
TGTTTGAGATGCCTTTTATCCTTCTCAGAAAGGATTTTTGAATGTCTTTG
TGTCTCTAAATGGGCCATTCCGGAAAATTTTTGTTACCCCCTGTCGGACA
ACGTGTATTTTTTTATTTTTTTCTAGCCTCGGAAATAATTTCTCTTTTCC
AGTGGTGGTTGGAAATTCCATTAAAAATTCATGTACTTTTGCAAAATGCA
TCGGAAATTCCACTCTTTTTTGGCCTTTTTAACTCGATTGCCTTGGAAAT
TCATACATTTTCTTCTCTCGCCTTGGAAATTTCGAATTTTAATGAAAACT
TTTACCCTCGGAAATCCTGTGTCGTCCGCCCCCCTGTTACAGACAAATTC
TGGAATGGCCCAATGAGACCAACAGTATTTGGACTCCATAGAACGGAGCA
ATATTCTAAAATTGGTATCACCAACGATTTGTAGAGTCAAACATTCAAAT
GACCGCGATGAAAAAGTTCGCAGCATCAATGAAGCTTTTTGAATGGTTGA
AATTAATTGTTCTTTAAACAAGCAATCATTACTCATCAGGATTCCCAAAT
CTTTTACAACAATTTTGCTTTCAATGATATTGCCTGATGGTGATGTATAG
TTTGTTTGGTCCTTGATAAATTGATTTTGACCATATCTCAACAGTTCAAG
TTTCATGTTATTGTCATCTGTCCATTTGTAAATTTTCTCTAAGTCAGATT
GAAGTAAGGGAACATCTTCAATTGTCTTGACTTATTTTGATGCACGGGTG
TCATCAGCAAAGGACTTCACAAAGCTGTTTAAGATATCTTTGTCAATATT
GCCAATGAGTATAAGAAAGACCAAAGGACCCAGGACACTTCCTTGAGGGA
CTCCTGATAAGACCTCTTGTGGTTTTGACTTCACACCATTTACAAGCACT
GACTGGGCACTTAAGCCATTGTAGTATTTTTCCATCAATTCCTAGTTGCA
TTATCTTGTGTAGGACAATTGCATGGTCAACTTTATCAAAGGCTATCGAG
AAATCTAGGTAGACAACATCTACAATTGCTTCTATGTCAAGAATATTCAA
TATCAAGTCATATTGTTCATCAAGCAATTGACTTAGACATGATATACATG
TCATCTTCCATCGAAAGAGCAAACCTAGCTATATTTTCCTTTTTACTGTC
ATTCAGGAGAAGGGAAGAATACATTAAGCATATATTTGGCTTGGAACCAT
CAATAGTGAGACCCATGCACTTAGACAATACAGACTTATCATGGTTTAGA
TCTCCGAAATTTTGTAAACATTCAATTCAAAAAGCATTCAGATTTTGGGA
GCAGTGGAATGTCTTTTTTACTTCAACTTGACCACATTTCCAAACCTTTT
TGAACTGAAAAAAATGGTTGATATGAACAGACCATTTTTCATCCCCTTTT
AGTGTCCGGTTATCGAGCGCTGCCGCTCCTGAAATCGTTAGAATTTAGGT
AAATCAGCATTTTTGATAAAAGGGTAATTTTCGCAGTTTTGTCCTATTTT
GGACACATTTCTTTCAATTTCCTTGGGATCTTTTAAATTTTTTGATGAAA
AATGGCAAAATTTATAATTTGAGTATTCTAATTTTTCATGGTTTTGCCGA
AAAACCACCAAAAAAGTTAAAAATAGTTCCCGCAAAAATTAGTGCTTATT
AAAGACATGTACTTATTCTTTGTATTCTGCAGGAAAATATATCACGTTTG
ATCCCAGCCCAGGGATTTTTCTAAGCACTTTGAGCTAGCTGTGGCCATTT
TTGTAAATTTGGCTCTGTTGGGGGCTTAGAGGGCAAAGCTCTCAAAAAAT
TTTGAAAATGTAGATAGTATTTTAGGCTTGTAAACAATGAAAAAGTCAAA
TTTTGCTAGAAAATGTTTTTTCTACATTAAAAGAAGAAATTTTTGCGGGA
ATTTAATTTAACGAATGGCTGAAAAAAATTTTTCAGAGGGAATTTAATTT
GGCAGATGATGGATACTGACGGAACTTAATTCCGCACATTTTGGCCAAAT
CCGCCAATTGTCTCCTTCTTTTTACATCAACTTGTATGAATTGTGTTTTG
TATTATCAGGGGGTTTTTGCCATGCATAACTTTTGATCTAGATCAGCAAC
TTTTTGTACCAAATTTGGAACAGTTGTTTCTTCCATGATATACTCATAAA
ATCCTTTCAACTTGATGATGTCATCATGAAAATGACATTGGCAGCCAACC
TATAGAAGACCTCAGAAAGGCGTCAATTAAAAAGCAACTAGAAAAGATTT
GTTAATTCTGTTTTGATTTTCTAAAAGTTAATAGAAAACTCAATAATATA
TTTGCTGGTTTATCAATTTTGAATTTTGAAATCTATGCTGAAGATGAGTA
AAATCAATTTAAAGGGACATAAAAGTAGTAAAATTTAAACATTGCGCAAG
CCACGTGTCATTAAAGAGAACAATTAAAATCACGTGTCCAAAACAAACTT
GTAAAACAATGGAACAATCAAAATTAGCCATATTTGTTTTGATTTTGTAT
CTGCTGCATACAGTTTGTTTACAAATTTCACAAGTACTGTTATGTCCCTT
TAAATGATATGTCATCATTTTTTGCAAATTTTTTTAGTTAGTATCTAAGA
CCGTTTTATTTAACACAATTTGGGTTTATGGCCAATGTTGGTAATAAAGT
CATAAAATATGACCCGGCTGTTTTTTTTTTACTTAAACTTTGGTTGGCTT
ACACATTATAAATTTTGTTAATATCCTATTCTAATAGAATTTCAGGGAGT
TTTAAGCAAAAGTGCCAGGGAACATGTAAAATACCTCCTCCCCCCCCCCC
CCCCGTCCTGATAAAAATAGGGTTTAAACTTTGAAATGAAAGGTATTTGG
CAGAAAAAAAATCAGATATTGCATTAATAAGATTATAGAAATATTGATAA
AAATCCACCCCTGGATATCTTTTCAGAAAGCACAAGATCGATATGTAGTT
CAAACTCTATCTAAGATGGAGACTTATGTCTATGCTGAAAATTATATTTA
GACAGACTTCGTGTTACAAGTGATATGACTGGCCCCTACATAAAATATGT
AAAGGGAATGAGAAAGTGAGAAAGGAAAATTAAACTTTTCAGTTTTTTGA
AATAAATGATAGCATATTGATCATCAGCTAGACAGGTTTCAAGTTTGAAC
TGTCTTTCTTTTTTAGGAATTGACAGATTTAGGGAGGGATCCACCAGCAC
AATGTTCAGCTGGACCTATAGATGAAAAAGATAGTAAGTATTCATCACAG
GAAAAAATCCTTGAATCACATGCGTGTGAAAAACAATTTCCGAGCATGTG
ATCCTGCAAAAAATCACATGCGTGTGAAAATGTAATTCACAATCCATCTT
TTCTCACTTGTTAAATAGAATAGAAGTGAGTTACTTTCAGGGTATTAAAC
CTTTCTCTCTAAGAAAGACAAACAATCCTATTTGTGATTTTAAATCTAGT
CACACCCCATTTAATAAGTCGAGAAACGATGGCTTGTGAATTGTATTTTC
ACACGCATGTGATTTTTTGCAGGATCACATGCTCGGAAATTGTTTTTCAC
ACGCATGTGATTCAAGGATTTTTTCCTGTGCATATGGTTTGTAATCTCAG
TGGTTTATGATATTGACACTAATTTTTTACAAAAGTCTCAAAAGCTAAGT
TAACTATGATGTTTCTTTCCAGGCCCCTCAATCCTCAATGTAATTATTAC
ATGGCTTCCATCTGGAAGTTGGAGGCTGATAATTGTTGCTCATACCAAGG
GCATAAAACCTTCAAGAAAACTACACACAATTCTTAATAATCTTTGTTTT
CAATGTTTAACAGCTCTGATCTAGTATCAAGCACCTGCGACATAGTGTAG
CTATCTTCAAAAAAAAAGTCTGTAATTCTGTGTAATTATGCAAACTAAAA
ATCGCTTGATAACAAACAAATTGCAAGAGTTTGCAACAAAATCAGTTAGA
ACTGAGTTTTTTTAGGCACTTGCAAATTTGTCTGCAATTTTTTAATAACA
TTACAGAAAGACTTTACTTGCGACATGTGTGCAATTTCCCATATGCTTGC
AACGAAATGTAATTGCAGCTGTATGCAAAACCTTTGTTGCCTCTGCTTTA
GGCTATACAAGACTAGCAGGCAGGAATTTTGTAAATTTTTGTGAGTTATT
AACATTTAGCATTTTGTGTTCATTTTCCTTTCAGTGTTTAAATGGCAAGC
TACTATAATGGGACCAGTAAGTGTTAAGCTCTTATATAAGTTCATTTTAT
TTTTATTTTAATGGTCTGTTTCAAGATAGTTGAAATTTAAATTTTTTAAA
CTGTAATTTAAAATTAATTATTGGATTTTATATTAGGATTGCATTATGAC
TAGCAAAATATTCCTTTTTTCAGACGGAAAGTCCATATCAAGGTGGCGTA
TTTTTTCTTACAATCAACTTTCCACCAGATTATCCTTTCAAACCACCAAA
AGTAAGTGATCAATTTTTTTTTTCACTTTGGTCTTCAACATGCATTGATT
GATATATTAAATGGAAATGCAGATTGATTACCATAGTTTTTCTTTAAGTT
TTAAAGATTTCCATGCCTAAACCTTTTGATGTTTTTAGCGCTTAACCATT
TGCTTAATCTCTCACCTGACTTAATAATCTCTGTGAATGCTAATTGTAGA
ATTTACAGGATTTATTTTGGTTTTGTTAAGAACAGACACGTCTTGTGACA
GTTTTGCACTGTCGTTAAAGCAAACAAAATTCAATATCTATTTTGTACTT
TAGGTCACATTTGTTACAAGAATATACCACCCCAATATTAATAGCAATGG
AAGTATCTGTTTGGATATTCTAAGACAACAATGGAGTCCTGCTCTAACAA
TATCAAAAGGTATTTATGACTTTTATCATTTTGGATTCTCAGAAAAACTT
GTTAAACTTTGATAAATTCATTGTAAACTTTTGCTTTGTTAGCATGATTA
AACATATGCGTGAATAGAACGCCTTTATAAGAACGCGAGGCTCAATTTTG
GCAAAAACCTAATAAGAATTAAGAACAATTTAAGCCCCATATGTCTGAAA
TGGCTAAATAAACCCAAGTCGATAAGTTGATACTACAAGCACGTTAAGAA
CAATTGAGCTTGGGGATCACAAGACAATTAGAAATAGCAGATCCTGATGA
CAAATTACCTGGTTCTTATAAAAAGTGTGTATTAACTCTGTGCTTGAATC
ATTTTATTCTCTAGATAATCCTAGCGGATACAAATACTTACCTATTATAT
AATTGAAATACAGCTACCGTTTTAATTAATTGCTTCATGAGCATTCTAGA
CCATTCTGGATCAGACAATGACCTTTGTTTTACTTTTTTTATTTTAAAAT
ATGCTTAAAGCACGCAGGATCACGTTATTCTTTATCATGATGTTTGGTAT
TAAACAACTCATCTGCGTATCAGATATTTGTAGGGAGCTTAGTTTTTGCT
CAAAATGGCAATACTTTTCACATCACACCGCGCTTCATTATAAGACCTTT
TCACCATTCTTTTTTCTAATTTTTAGTACTATTATCTATATGTTCACTAC
TGACGGACCCTAATCCTGAAGATCCATTGGTACCAGAAATAGCAAGAATC
TATAAAAGTGATCGTTCTCGATACAGTGACCTTGCAAAAGAGTGGACCAA
GAAGTATGCCATGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000152_pilon:554311..562826- >XLOC_033278 ID=XLOC_033278|Name=XLOC_033278|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=894bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000152_pilon:554311..562826- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCTTTAAAAAGGATAACAAAGATGGCTTTAAAAAGGATAACAAAGGA ATTGACAGATTTAGGGAGGGATCCACCAGCACAATGTTCAGCTGGACCTA TAGATGAAAAAGATAGAATTGACAGATTTAGGGAGGGATCCACCAGCACA ATGTTCAGCTGGACCTATAGATGAAAAAGATATGTTTAAATGGCAAGCTA CTATAATGGGACCATGTTTAAATGGCAAGCTACTATAATGGGACCAACGG AAAGTCCATATCAAGGTGGCGTATTTTTTCTTACAATCAACTTTCCACCA GATTATCCTTTCAAACCACCAAAAACGGAAAGTCCATATCAAGGTGGCGT ATTTTTTCTTACAATCAACTTTCCACCAGATTATCCTTTCAAACCACCAA AAGTCACATTTGTTACAAGAATATACCACCCCAATATTAATAGCAATGGA AGTATCTGTTTGGATATTCTAAGACAACAATGGAGTCCTGCTCTAACAAT ATCAAAAGGTCACATTTGTTACAAGAATATACCACCCCAATATTAATAGC AATGGAAGTATCTGTTTGGATATTCTAAGACAACAATGGAGTCCTGCTCT AACAATATCAAAAGTACTATTATCTATATGTTCACTACTGACGGACCCTA ATCCTGAAGATCCATTGGTACCAGAAATAGCAAGAATCTATAAAAGTGAT CGTTCTCGATACAGTGACCTTGCAAAAGAGTGGACCAAGAAGTATGCCAT GTGATACTATTATCTATATGTTCACTACTGACGGACCCTAATCCTGAAGA TCCATTGGTACCAGAAATAGCAAGAATCTATAAAAGTGATCGTTCTCGAT ACAGTGACCTTGCAAAAGAGTGGACCAAGAAGTATGCCATGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000152_pilon | genome | sc0000152_pilon:554311..562826 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 310-447:139 |
| Aaloc | 202-306:914 |
| Aaloc | 124-201:1294 |
| Aaloc | 94-123:1481 |
| Aaloc | 25-90:2501 |
| Aaloc | 1-24:8517 |
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