XLOC_033278 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_033278
Unique NameXLOC_033278
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000152_pilon:554311..562826-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_033278 ID=XLOC_033278|Name=XLOC_033278|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8516bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000152_pilon:554311..562826- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTTAAAAAGGATAACAAAGGTTGGTTAATATATACATTCAATTTT TGTTATGACAAATCGACTAAGGAAAGACCAGAGTCGTTTCAACTTTTGAT TTGAATATTTTTTTGTTACTGCTCTGGGGCTCCATTCTTTGACTGTTCTG AATGTCGCTCGTCACTGATTGCTGATTAATAAGTCTATACAAACTAGTTT AGATTTTCAGCCATTCAGGGATAGTGACAATTTTTTTAACTAAGCCTCCT GGAAATCAGGGGCTGAACAACTTCCCTGGGAAGTACTTTTTGAGTGACAA AGCAAAAGGTGCTGAAAACAAAAATCTATGCCTTTAAACTAGAGTAACCA CTGGATACGTTGATAATCTAGAACATGTTAAAAACCCCTTGGACGGTCAT GTAAATTGGGCTGTTCAAAAAATTGATAAAGTTTTTATGAGGAAAGCATC CCCTATAAAAGCTGACAACCTTCAATGACAGACTTGAAAAGTCAAAGATT TATTGACCCCTCCCCCTGAAAAAGTTGGTGAATACCCCCTGTATGGTTTT GAAAATGGAATAGCCCATCCCATGCAAATTTCCAGGATAACGGTGGCAGA AACTCGATCTTTGCTTGAATCATGAAACTTAATCCTATTTTTTGTACATG AGTCATGAGAATCATGACAAAAATTTGATGTCCTAGGCCCTTATTAACAG AACAAGCCCATTCTGAAGTTAATTCTTTGTGTTACTTACTTGTGTAGGTG TTCGAGCATAGTGCTCAGGTAAGATTCTTGGTGAACCACGCCTCTATTTG ATTAATCTGTCGAGGGAAAAAGAATCGCAGTATATATTTTTCATGTCAAG TATTGAATTTAAATTAGGTCTCATGCACCCAGTATATCCATGAATTTGGG GTTCATCCGGGATCGACTTTAAGTGAGTGTCAAGGGCATTTTTTAATTTT TCAGTTGAAGTGTTTGAAGTTGAAGTTTCTTATGCTCTTTGGCATTACAT TGAATAGTTTTGCACCTCGTTCAGAAAGAGTGCAATCTCTAAGGTAGGAT GTTTGATTCTTGAAGATAGACAGTTGGCACAGCCGGCCGAGCCGGGGATT TTCGTAAGCTTTTATACTGCTATTCATGTTAGGTACTATCCCTTCTAACA CCTTCCAAACATAGATGATGCGATATAGCGTTCCCTTCTTCTTTGAAGGG AATAGATTTTGGATTGCTTGAGACACTCCCAATACCTTACCTTGAGTTAC CTTGAGCTTGTTTCGTAATATCTTTACGCATCCATCCTGTGAGGACCGAT GTAAATTTTCATATTGATGATGCTGTTTGTTTCAGCTCGTCTCATCATAG TGTAGCCAGTCACGAGTGGCTCGTCGGGAACTGTAAAAAGATATTTATCC AGCTCAGTTTTGAATTTCAATTTCTTGCATCCAGTGAGATCCCTCAGACG TTTTGGCAGCGAGTTGAAAAGCCTTGGTCCTTGGACTTTAAAACTTGAGT ATATGACTTTTTGCCAGGGCCCCCTTTTCACTAGTGGTATGTGACATTTT CTTCCTTGTCTGGGATTGGCATAGAACGTGATTGTCCCAGGATTTGGGAC AAGCTTCTCAATAATACACCAAGTGTATATGATAATATATCTTTCACGCC TTCTCTGCAGTGAAAACAGTTTTAATGTTTGTAGTCTTTCCCAATAGTTT TGGTTGTGCAGGTTTTTAATCCTCCTTGTGAATGATTTTTGGAGATCTTC GATCTGCTGGATCAGATTAACTTCATTGGGTGACCATAGTTGAGAACAGT TGTCGATGTGTGGTATGACTAAAGACTTCCAAAGAGTGAGCATGACATCA TGTTCTCTTGAGCTGAATGTTCTCAGAATCCAACCAATGAGTATCTGTAC TTTTTCTACAATGGTTAGAATATGTTGGTTGAATTTCGCATCGTCTGACA TGGTAACACCAAGATCCCTTGTTGAAGATTTGGTTTGGATTATCTTTCCT TCACCTGTGAAATAACTGGTGGCTGGTCCGTTTCCATAATGGAGATGCTC GAACTTTTTTCCATTTAACATCATTTTGTTTATGGTCGACCATTGATAAA CATTGTTAAGGTCGTTTTGTAGGTGAAACTGGTCAATGATGTTTTGGATT CCTTTCTTTACTCGTGTGTCATCAGCAAAACTTGCAAGTTCTGCTTTGGT TGTCCCTTCATCAATGTCTGATATCATGATGATGAAGAATAATGGCCCAA GAAACCGATCCTTGAGGTACTCCTGATTGAATTTTTGCCTGGTACGACTT GTGACCGTCTACAAATACTACTTGGTTTCTATCTTGAAGAAATGACTTAA TCCATTTAAGTAGTTTGTGTCTGTTATTCCAATAGATTTCAGTTTTGATA GCAGTATCCTGTGGTCGACTTTATCAAATGCTTTTGAAAATCGAGATATA CAACATCTACATCCAATCCTTCTTCTAGTTTTGATAGGATACTGTCATAG TGGCTGAGTAATTGACTAAGGCATGATCGCCCTTCCCGGAAACCATGCTG TGTTGGGTTGAACAAGTCATTGTTGTTGATAAATTCGACTATCTTCTTTC GAACTATTTTTTCAAACACCTTGGTGAGATGGGACGTAAGTGATACTGGC CTGTAGTTAGATGGCTCTCCTTGATCTCCACCCTTTGATATTGGTGTGAT ATGATTTCTTTTGTGAATCTCCTCTGTTACTCCATGGTTCAGACAGTTCC TCCAGAATATTGCGAGTGGCTTAGCAAGTTCTTCTTTGCAATTTTTCAGC AAAATCGCAGGAAATCCATCAGGACCGGGAGCAGAGTTTGGTGGAATAAT TGTTTGAGATGCCTTTTATCCTTCTCAGAAAGGATTTTTGAATGTCTTTG TGTCTCTAAATGGGCCATTCCGGAAAATTTTTGTTACCCCCTGTCGGACA ACGTGTATTTTTTTATTTTTTTCTAGCCTCGGAAATAATTTCTCTTTTCC AGTGGTGGTTGGAAATTCCATTAAAAATTCATGTACTTTTGCAAAATGCA TCGGAAATTCCACTCTTTTTTGGCCTTTTTAACTCGATTGCCTTGGAAAT TCATACATTTTCTTCTCTCGCCTTGGAAATTTCGAATTTTAATGAAAACT TTTACCCTCGGAAATCCTGTGTCGTCCGCCCCCCTGTTACAGACAAATTC TGGAATGGCCCAATGAGACCAACAGTATTTGGACTCCATAGAACGGAGCA ATATTCTAAAATTGGTATCACCAACGATTTGTAGAGTCAAACATTCAAAT GACCGCGATGAAAAAGTTCGCAGCATCAATGAAGCTTTTTGAATGGTTGA AATTAATTGTTCTTTAAACAAGCAATCATTACTCATCAGGATTCCCAAAT CTTTTACAACAATTTTGCTTTCAATGATATTGCCTGATGGTGATGTATAG TTTGTTTGGTCCTTGATAAATTGATTTTGACCATATCTCAACAGTTCAAG TTTCATGTTATTGTCATCTGTCCATTTGTAAATTTTCTCTAAGTCAGATT GAAGTAAGGGAACATCTTCAATTGTCTTGACTTATTTTGATGCACGGGTG TCATCAGCAAAGGACTTCACAAAGCTGTTTAAGATATCTTTGTCAATATT GCCAATGAGTATAAGAAAGACCAAAGGACCCAGGACACTTCCTTGAGGGA CTCCTGATAAGACCTCTTGTGGTTTTGACTTCACACCATTTACAAGCACT GACTGGGCACTTAAGCCATTGTAGTATTTTTCCATCAATTCCTAGTTGCA TTATCTTGTGTAGGACAATTGCATGGTCAACTTTATCAAAGGCTATCGAG AAATCTAGGTAGACAACATCTACAATTGCTTCTATGTCAAGAATATTCAA TATCAAGTCATATTGTTCATCAAGCAATTGACTTAGACATGATATACATG TCATCTTCCATCGAAAGAGCAAACCTAGCTATATTTTCCTTTTTACTGTC ATTCAGGAGAAGGGAAGAATACATTAAGCATATATTTGGCTTGGAACCAT CAATAGTGAGACCCATGCACTTAGACAATACAGACTTATCATGGTTTAGA TCTCCGAAATTTTGTAAACATTCAATTCAAAAAGCATTCAGATTTTGGGA GCAGTGGAATGTCTTTTTTACTTCAACTTGACCACATTTCCAAACCTTTT TGAACTGAAAAAAATGGTTGATATGAACAGACCATTTTTCATCCCCTTTT AGTGTCCGGTTATCGAGCGCTGCCGCTCCTGAAATCGTTAGAATTTAGGT AAATCAGCATTTTTGATAAAAGGGTAATTTTCGCAGTTTTGTCCTATTTT GGACACATTTCTTTCAATTTCCTTGGGATCTTTTAAATTTTTTGATGAAA AATGGCAAAATTTATAATTTGAGTATTCTAATTTTTCATGGTTTTGCCGA AAAACCACCAAAAAAGTTAAAAATAGTTCCCGCAAAAATTAGTGCTTATT AAAGACATGTACTTATTCTTTGTATTCTGCAGGAAAATATATCACGTTTG ATCCCAGCCCAGGGATTTTTCTAAGCACTTTGAGCTAGCTGTGGCCATTT TTGTAAATTTGGCTCTGTTGGGGGCTTAGAGGGCAAAGCTCTCAAAAAAT TTTGAAAATGTAGATAGTATTTTAGGCTTGTAAACAATGAAAAAGTCAAA TTTTGCTAGAAAATGTTTTTTCTACATTAAAAGAAGAAATTTTTGCGGGA ATTTAATTTAACGAATGGCTGAAAAAAATTTTTCAGAGGGAATTTAATTT GGCAGATGATGGATACTGACGGAACTTAATTCCGCACATTTTGGCCAAAT CCGCCAATTGTCTCCTTCTTTTTACATCAACTTGTATGAATTGTGTTTTG TATTATCAGGGGGTTTTTGCCATGCATAACTTTTGATCTAGATCAGCAAC TTTTTGTACCAAATTTGGAACAGTTGTTTCTTCCATGATATACTCATAAA ATCCTTTCAACTTGATGATGTCATCATGAAAATGACATTGGCAGCCAACC TATAGAAGACCTCAGAAAGGCGTCAATTAAAAAGCAACTAGAAAAGATTT GTTAATTCTGTTTTGATTTTCTAAAAGTTAATAGAAAACTCAATAATATA TTTGCTGGTTTATCAATTTTGAATTTTGAAATCTATGCTGAAGATGAGTA AAATCAATTTAAAGGGACATAAAAGTAGTAAAATTTAAACATTGCGCAAG CCACGTGTCATTAAAGAGAACAATTAAAATCACGTGTCCAAAACAAACTT GTAAAACAATGGAACAATCAAAATTAGCCATATTTGTTTTGATTTTGTAT CTGCTGCATACAGTTTGTTTACAAATTTCACAAGTACTGTTATGTCCCTT TAAATGATATGTCATCATTTTTTGCAAATTTTTTTAGTTAGTATCTAAGA CCGTTTTATTTAACACAATTTGGGTTTATGGCCAATGTTGGTAATAAAGT CATAAAATATGACCCGGCTGTTTTTTTTTTACTTAAACTTTGGTTGGCTT ACACATTATAAATTTTGTTAATATCCTATTCTAATAGAATTTCAGGGAGT TTTAAGCAAAAGTGCCAGGGAACATGTAAAATACCTCCTCCCCCCCCCCC CCCCGTCCTGATAAAAATAGGGTTTAAACTTTGAAATGAAAGGTATTTGG CAGAAAAAAAATCAGATATTGCATTAATAAGATTATAGAAATATTGATAA AAATCCACCCCTGGATATCTTTTCAGAAAGCACAAGATCGATATGTAGTT CAAACTCTATCTAAGATGGAGACTTATGTCTATGCTGAAAATTATATTTA GACAGACTTCGTGTTACAAGTGATATGACTGGCCCCTACATAAAATATGT AAAGGGAATGAGAAAGTGAGAAAGGAAAATTAAACTTTTCAGTTTTTTGA AATAAATGATAGCATATTGATCATCAGCTAGACAGGTTTCAAGTTTGAAC TGTCTTTCTTTTTTAGGAATTGACAGATTTAGGGAGGGATCCACCAGCAC AATGTTCAGCTGGACCTATAGATGAAAAAGATAGTAAGTATTCATCACAG GAAAAAATCCTTGAATCACATGCGTGTGAAAAACAATTTCCGAGCATGTG ATCCTGCAAAAAATCACATGCGTGTGAAAATGTAATTCACAATCCATCTT TTCTCACTTGTTAAATAGAATAGAAGTGAGTTACTTTCAGGGTATTAAAC CTTTCTCTCTAAGAAAGACAAACAATCCTATTTGTGATTTTAAATCTAGT CACACCCCATTTAATAAGTCGAGAAACGATGGCTTGTGAATTGTATTTTC ACACGCATGTGATTTTTTGCAGGATCACATGCTCGGAAATTGTTTTTCAC ACGCATGTGATTCAAGGATTTTTTCCTGTGCATATGGTTTGTAATCTCAG TGGTTTATGATATTGACACTAATTTTTTACAAAAGTCTCAAAAGCTAAGT TAACTATGATGTTTCTTTCCAGGCCCCTCAATCCTCAATGTAATTATTAC ATGGCTTCCATCTGGAAGTTGGAGGCTGATAATTGTTGCTCATACCAAGG GCATAAAACCTTCAAGAAAACTACACACAATTCTTAATAATCTTTGTTTT CAATGTTTAACAGCTCTGATCTAGTATCAAGCACCTGCGACATAGTGTAG CTATCTTCAAAAAAAAAGTCTGTAATTCTGTGTAATTATGCAAACTAAAA ATCGCTTGATAACAAACAAATTGCAAGAGTTTGCAACAAAATCAGTTAGA ACTGAGTTTTTTTAGGCACTTGCAAATTTGTCTGCAATTTTTTAATAACA TTACAGAAAGACTTTACTTGCGACATGTGTGCAATTTCCCATATGCTTGC AACGAAATGTAATTGCAGCTGTATGCAAAACCTTTGTTGCCTCTGCTTTA GGCTATACAAGACTAGCAGGCAGGAATTTTGTAAATTTTTGTGAGTTATT AACATTTAGCATTTTGTGTTCATTTTCCTTTCAGTGTTTAAATGGCAAGC TACTATAATGGGACCAGTAAGTGTTAAGCTCTTATATAAGTTCATTTTAT TTTTATTTTAATGGTCTGTTTCAAGATAGTTGAAATTTAAATTTTTTAAA CTGTAATTTAAAATTAATTATTGGATTTTATATTAGGATTGCATTATGAC TAGCAAAATATTCCTTTTTTCAGACGGAAAGTCCATATCAAGGTGGCGTA TTTTTTCTTACAATCAACTTTCCACCAGATTATCCTTTCAAACCACCAAA AGTAAGTGATCAATTTTTTTTTTCACTTTGGTCTTCAACATGCATTGATT GATATATTAAATGGAAATGCAGATTGATTACCATAGTTTTTCTTTAAGTT TTAAAGATTTCCATGCCTAAACCTTTTGATGTTTTTAGCGCTTAACCATT TGCTTAATCTCTCACCTGACTTAATAATCTCTGTGAATGCTAATTGTAGA ATTTACAGGATTTATTTTGGTTTTGTTAAGAACAGACACGTCTTGTGACA GTTTTGCACTGTCGTTAAAGCAAACAAAATTCAATATCTATTTTGTACTT TAGGTCACATTTGTTACAAGAATATACCACCCCAATATTAATAGCAATGG AAGTATCTGTTTGGATATTCTAAGACAACAATGGAGTCCTGCTCTAACAA TATCAAAAGGTATTTATGACTTTTATCATTTTGGATTCTCAGAAAAACTT GTTAAACTTTGATAAATTCATTGTAAACTTTTGCTTTGTTAGCATGATTA AACATATGCGTGAATAGAACGCCTTTATAAGAACGCGAGGCTCAATTTTG GCAAAAACCTAATAAGAATTAAGAACAATTTAAGCCCCATATGTCTGAAA TGGCTAAATAAACCCAAGTCGATAAGTTGATACTACAAGCACGTTAAGAA CAATTGAGCTTGGGGATCACAAGACAATTAGAAATAGCAGATCCTGATGA CAAATTACCTGGTTCTTATAAAAAGTGTGTATTAACTCTGTGCTTGAATC ATTTTATTCTCTAGATAATCCTAGCGGATACAAATACTTACCTATTATAT AATTGAAATACAGCTACCGTTTTAATTAATTGCTTCATGAGCATTCTAGA CCATTCTGGATCAGACAATGACCTTTGTTTTACTTTTTTTATTTTAAAAT ATGCTTAAAGCACGCAGGATCACGTTATTCTTTATCATGATGTTTGGTAT TAAACAACTCATCTGCGTATCAGATATTTGTAGGGAGCTTAGTTTTTGCT CAAAATGGCAATACTTTTCACATCACACCGCGCTTCATTATAAGACCTTT TCACCATTCTTTTTTCTAATTTTTAGTACTATTATCTATATGTTCACTAC TGACGGACCCTAATCCTGAAGATCCATTGGTACCAGAAATAGCAAGAATC TATAAAAGTGATCGTTCTCGATACAGTGACCTTGCAAAAGAGTGGACCAA GAAGTATGCCATGTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000152_pilon:554311..562826-

>XLOC_033278 ID=XLOC_033278|Name=XLOC_033278|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=894bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000152_pilon:554311..562826- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTTAAAAAGGATAACAAAGATGGCTTTAAAAAGGATAACAAAGGA
ATTGACAGATTTAGGGAGGGATCCACCAGCACAATGTTCAGCTGGACCTA
TAGATGAAAAAGATAGAATTGACAGATTTAGGGAGGGATCCACCAGCACA
ATGTTCAGCTGGACCTATAGATGAAAAAGATATGTTTAAATGGCAAGCTA
CTATAATGGGACCATGTTTAAATGGCAAGCTACTATAATGGGACCAACGG
AAAGTCCATATCAAGGTGGCGTATTTTTTCTTACAATCAACTTTCCACCA
GATTATCCTTTCAAACCACCAAAAACGGAAAGTCCATATCAAGGTGGCGT
ATTTTTTCTTACAATCAACTTTCCACCAGATTATCCTTTCAAACCACCAA
AAGTCACATTTGTTACAAGAATATACCACCCCAATATTAATAGCAATGGA
AGTATCTGTTTGGATATTCTAAGACAACAATGGAGTCCTGCTCTAACAAT
ATCAAAAGGTCACATTTGTTACAAGAATATACCACCCCAATATTAATAGC
AATGGAAGTATCTGTTTGGATATTCTAAGACAACAATGGAGTCCTGCTCT
AACAATATCAAAAGTACTATTATCTATATGTTCACTACTGACGGACCCTA
ATCCTGAAGATCCATTGGTACCAGAAATAGCAAGAATCTATAAAAGTGAT
CGTTCTCGATACAGTGACCTTGCAAAAGAGTGGACCAAGAAGTATGCCAT
GTGATACTATTATCTATATGTTCACTACTGACGGACCCTAATCCTGAAGA
TCCATTGGTACCAGAAATAGCAAGAATCTATAAAAGTGATCGTTCTCGAT
ACAGTGACCTTGCAAAAGAGTGGACCAAGAAGTATGCCATGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_033278XLOC_033278-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000152_pilongenomesc0000152_pilon:554311..562826 -
Properties
Property NameValue
Aaloc310-447:139
Aaloc202-306:914
Aaloc124-201:1294
Aaloc94-123:1481
Aaloc25-90:2501
Aaloc1-24:8517