XLOC_033178.2 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_033178.2
Unique NameXLOC_033178.2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000228_pilon:19386..42035-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_033178.2 ID=XLOC_033178.2|Name=XLOC_033178.2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=22650bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000228_pilon:19386..42035- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTGGAAAAGGGGTTTAGTTTTAGTCCTGCTTTTCGCTTTTTGAAAATTCT CTTTTGTTGCCAAGCTTTGAAACTGAAAGATTTAGGCTGTTGTTTTAACA ATCTCCTTTTCGCCTGTTACTTCATCATACCATGTACGGCTTCATTGGTT TATACTTTGAGCAATCATTTCCAATCTTTAAGCTAGCTTTTGGTTTGTTA ACGTTTCGTGAAATGCAAATTTTGTCATTGCCTTGAAATGTTTTTCACAA TCATCTTCGTTCTTTTTCTTTTTTTCCCTTCACACCCACATTTCATTGTC TATGTCAGACTTTTCACATTTCCGAAATCTGTTGTTAAAAATAAATATTT GTGGTCAGAAGAAAGCGCTAGATTTTGAGTTTTTTTTTCTCTTTATTCAA GAAAAAAGTTGATCTCCTTGGCCTCGCATGTTTTTATCATAACATCCCTT GTAGATAAAAAGTTAAGGTCTCTACTGAAGGCGACGTGTAAGGCTTAAAA ACTCAAAGAAAAGCTAAGCATTTTAGAGGATGTCCCTTCCAATAAAAACC TTTGACAAATTTATTCAGCCCTAGGATGCTTCAATTAAAAGCACTCCATA CTAAACACCAAGGTTGAAAAAAAAATACAATAGCTATTTAATGTACTCTT TCAAATTTTAAAGGTACATACCGTAAGAATAGACCTTTTCATGAATTACG TCACACGAACATCACTTGCCTCGAATTCAAACAATTACCATGGTGATTAT GTCCCTTGACACATTAAATGATTTTTTTATGAATAGATAGTAGTTTTTAT AAAATCCGCTGGAAGTTAATCACCATGGCAATAATTTCAAAACGAGGCAA GGGATGTTCGTGACGTAATTTATGAAAAGGTCTATTAAAATGTCAGTTAT TGATTTTCTTTGAAACTAAATTTCCTTTAATACATTCACTGCCAGCCCCT TTTCAGGAGTTAAGCCCAATGAAGTATAAGCCCGAAGGGCTAGAAGTCAA TCTCTTTGGTAGGATTTGAAGCCAACAAATCCTACCAAAGTTGCGCGGCC TTGAGCGACCCGCCTGGTTTTTACACAAATGACAGATTGAAACTAAAATT TACCGCTTAATTTCGAAAAATATATCACTCGAAAACAAAGGAATTGCTAG ATTCAATCCGTCATCAAAAATACGGCGCATATTTTAAGGCTTCAATTTTT CTTGCCTGAGAAAGGTTAGAGATTGACCTCTAGCCCTTCGGGCTTGAAAC TCAATGGTTAAGCCCTTGGAATGTTATCGACGGTTTGTCTTTCCCAATTG TGATGGAAGTTATGGCCGTTAGAAGTACTTGTTGTCAGCTGTGAAAAAGT TGCATTTTGTCCTGTCAAAGCCATCAGTTTTAATTAATATTTTCAAACTA AACCTTGAGGATGGGTTTGATCTTATGAAAAAATGTCAGTCTCACTGTTA TTTTCCATAAACTTTCAAAACGCTGGGCCTGACCTTTCTGTTTCGCTGTT TTTTTGAAATGTCACTTGGCCCTGTACGCCCTTTCGTACTTGTATACGTA CCTTATTTAAAGGTTTTCTTTTCAAATACAAGTGGTATCGTTTGCTTACT CATCAATTTTAGTTTACAAGCTTTTCCACATTGATATGACACGGATGTGG AACAAGATTGGTCAGAATGGGTAAAAGAAAAAACAATGCTTTGTTATTCA GCACGAAATCGAACGCAATAAACAATAGGACAGAGACACTGGCCTGATAT GAAACGGGAACAGTTATGTAAAACTAAAACCTTTAAAAAGGTACCTCTTG CTCGTCACATTTAAAAGCGTCAAAACTATGTAATGCTAATTCTCAAATAA AACAAATGTGGCAAATCAATGTTTATATAGTTTTATATCGGCTTAAGAGC AAACGCCTTCAAACAAAGATGGTACGGACATAAACACACCTTCAAATATG AAACCAAAAGAGCGTCAACAGAGTTATCCAACCACGTTTGGGACCTACAA ATTAAAAAATATACAGCCGAAATTGTCATGGAAAATTATCGACCACGCCC ACCCGTATGTTAATGGCTCAAAAAAATGTAACCTCTGTCTCACAGAAAAA TTTTATATAATTACGTCAGAACTCGATCTCGTTAACAAAAGATCTGAACT TATTTCTAAATGTCGTCATAACAACAAATTTATTCTAAAATTCGAATCGA ACCTCGAATCGGTCCCCCCGGACAAATCATGAATTTTATTTTCAATACTT TTTAATGGTAATGATTTCATCATTGTTTTTATTACCTAGTTTTATTGCAC CAATTATCCAGTTTTTTAACTGTTTACGTCGAATTTCAATTTTTTTCAAT CATTTTGTACATATGACTAGTGTGAAAACACGAAACTCAGAGTAATGTAC TTTACTTAGTTTTTTTTAAATGGAAGACAACTTTTAAAAATATTAATGCT AATTCTCTTGAGAAATGGTCCAAAATGTTGAAAGGTTGCGGTTGCTTTTA CATATTGCGTACTTTCTTTCCGCTCATCAAAAAAGGCTTTAAAATGTAGA GTATATTCAACCTTCTGTTAAAAAGAAAATCTTCAAAATTTCTTCCTCTA TGTGAAATCAAGTGCGTATTACTTGTAGGTGACGAATCGACGGATCCTGC ACTAATGCACTTCTCAGTTTTCTCAAAGGTAACGAATCGAGAGTCTTCCT ACATGTAATGGTTAAGATTGTTTCCTTAGTTACCGCCTCAAATTTTTAAG TTGCGTAAATCCTGCATAGATTTAGATTTTTTAAATATATTTTGAATACA TTTGACCTTGAAAATTTTTTTTTTTTATGAGTTCGTGAAAATTATCGTTA GAACACCTAATAGTACAATCAGTGCCATAATATATTGGCACTTTTGGCTA ATTTACCATTTTTTGAAAATTGAAGTTCGAGCGAGAATGTCAATTTTTAG GCCTTCAACTTGATTCCATCGATTATTTCGATCTGGGAGGGATTTATTGG TTTCTAGGCTATATTTCAAGCCCTACTGGACCATTTTTGAGCTTTTGGAT CCTCAGATCCTAAGGTCCTAACTAAGCCTTAAGTCTAGCGTTAAAACTCA GAATTAAAACTCTACCCTTCGAACCTACTTTAGAGCACTTACAAATCGAT TGTGGTTTCAAAACACCCCGGTGAAGTTCCCTTTAGTGCCAAGCATTTTG TGACTGATTGTAGGGACAAACCCTTAGGACCCGCGAGTTTTTCCCGAAGG GGGGGGGCTTCCGCAAAGGCCCAGGAAATTTTTTAGTACTCAAAAACTGT CGTCACAGGCAAAGCCCCTTGGCCCCAAAAATTTGACCAAATTTCAAAGT CAATAAAACCATATGTAATATGCTATACTTATGCAATACTTATACCAATC GAAAGCACTCGAAAAACGATATAGAGGACTTTTACAGTCGATTTTTCAAC CTATCTCGAGAAAATTAACGTCAAAGTTGCGTTTTGACGTCATTTCTAGT CGATTTTCCCGAGTCGACTATATCTTATATCTCAAAAAGCTAATTAAAAT TCAGAAACAACGCATATCAAGCTAAAGGTAAAAACATTCAAACCGAAGAG CTAAGGGATCGCCCCTACTATAACAACAATGTGACCCTACTTTAGCGACA AAGTACTAACTAACACCATCATGTATTTCTTTAACCTGTTTAGAATGGTA ATAAGAATTCATGTTCTCTAAGTACAAATCACGATCGACTAACATCAATT CAATCAGATTGTTTAACGAATCTTATTAATCTGGGGAAAGTTTTCGATGT GTTTTACGGTCACTTGTTTGACCACATCCATATGCAATACATGGATTTAT AGTGATTAATTTGTTTCATCAACCTAGTCCAAAATTCTCATAGTTTCAAA ATTTAAATTGAAAATTTTGAGGTTTCTTATGCTAAATTTCGGGGAGAAGA ACTATTAGACGAGCTGTTAAAAAAGAGACTACTCCGAAAACAAAAAGACA AAAACTAACACCGTACTTGTTTTGTCATTTACTCCCAATGTATGAAGCGT TTAGAATCAAGTCAAAATATTATCTTATTATTTTTATGTTCAGGTTAAAG GTGATCCCGAAAAAACGCTCATGGTTCGTCATTTACCAAACCAAACCAAA GAAATCAGTTTACGCAACGTTTTCTCACGATACGGGGACCTACAAAATTG CCGGTTAGTCCGTGACGCCATCAGCGGGAAGAGCCGTGGTTACGCTTTCG TGGAATACAAGTGTGTGCGTGATTGTGAGGAGGCGCTTCGTGATTCAGGT GATTTAGTTATTGATGGACAAAAAGTAGTCGTGGATAGGGAATGTGAACG CACACTAAAAGGTTGGATACCGAGGCGGTTTGGGGGTGGGTTTGGCGGTA AGAAAGAATCAGGACAGCTCAGATTTGGTGGCATAGAAAGGCCTTTCCGT CGCCCGATTCCTGTCAATTCAAAACCCTTAGGAAGACAACACTCGTCAAC TGAGAGTCGTGACGGAAAAAGGCGTTTCCCATCAACGAGCGACGCACCAC GCTACAAACGAACGCCTCACGACGACGATAAACGCTCACGAATGAGGTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000228_pilon:19386..42035-

>XLOC_033178.2 ID=XLOC_033178.2|Name=XLOC_033178.2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1626bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000228_pilon:19386..42035- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAATTCTACGTCCTACAGACTACAATTTTGTCCACATTTGTGATTAATGA
TCAATTGTACTCCAAAAATGTGCGATGCCCGGAAATTCTACGTCCTACAG
ACTACAATTTTGTCCACATTTGTGATTAATGATCAATTGTACTCCAAAAA
TGTGCGATGCCCGGTGAAAAAAAAAACTTACCCAACCACATTTTTCAAAA
TGTATGATGAAGATGAAGACCCGAATTCAGTTCCCTTACCTTACGAATTA
CCAACTTCTTACAAATGGCATCAACATGCGACATTTTATCATCCAATGAT
GGCTGGTTCTATCGATGGTACAGATGTTGTGCCGCACGACCGCGCTATCG
TACGCGCCACGAGAGCGAAGTATAAACCTAACAAACAGTGAAAAAAAAAA
CTTACCCAACCACATTTTTCAAAATGTATGATGAAGATGAAGACCCGAAT
TCAGTTCCCTTACCTTACGAATTACCAACTTCTTACAAATGGCATCAACA
TGCGACATTTTATCATCCAATGATGGCTGGTTCTATCGATGGTACAGATG
TTGTGCCGCACGACCGCGCTATCGTACGCGCCACGAGAGCGAAGTATAAA
CCTAACAAACAGGTTAAAGGTGATCCCGAAAAAACGCTCATGGTTCGTCA
TTTACCAAACCAAACCAAAGAAATCAGTTTACGCAACGTTTTCTCACGAT
ACGGGGACCTACAAAATTGCCGGTTAGTCCGTGACGCCATCAGCGGGAAG
AGCCGTGGTTACGCTTTCGTGGAATACAAGTGTGTGCGTGATTGTGAGGA
GGCGCTTCGTGATTCAGGTGATTTAGTTATTGATGGACAAAAAGTAGTCG
TGGATAGGGAATGTGAACGCACACTAAAAGGTTGGATACCGAGGCGGTTT
GGGGGTGGGTTTGGCGGTAAGAAAGAATCAGGACAGCTCAGATTTGGTGG
CATAGAAAGGCCTTTCCGTCGCCCGATTCCTGTCAATTCAAAACCCTTAG
GAAGACAACACTCGTCAACTGAGAGTCGTGACGGAAAAAGGCGTTTCCCA
TCAACGAGCGACGCACCACGCTACAAACGAACGCCTCACGACGACGATAA
ACGCTCACGAATGAGGTAGGTTAAAGGTGATCCCGAAAAAACGCTCATGG
TTCGTCATTTACCAAACCAAACCAAAGAAATCAGTTTACGCAACGTTTTC
TCACGATACGGGGACCTACAAAATTGCCGGTTAGTCCGTGACGCCATCAG
CGGGAAGAGCCGTGGTTACGCTTTCGTGGAATACAAGTGTGTGCGTGATT
GTGAGGAGGCGCTTCGTGATTCAGGTGATTTAGTTATTGATGGACAAAAA
GTAGTCGTGGATAGGGAATGTGAACGCACACTAAAAGGTTGGATACCGAG
GCGGTTTGGGGGTGGGTTTGGCGGTAAGAAAGAATCAGGACAGCTCAGAT
TTGGTGGCATAGAAAGGCCTTTCCGTCGCCCGATTCCTGTCAATTCAAAA
CCCTTAGGAAGACAACACTCGTCAACTGAGAGTCGTGACGGAAAAAGGCG
TTTCCCATCAACGAGCGACGCACCACGCTACAAACGAACGCCTCACGACG
ACGATAAACGCTCACGAATGAGGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_033178.2XLOC_033178.2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
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