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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000265_pilon:221984..230373- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033057 ID=XLOC_033057|Name=XLOC_033057|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8390bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000265_pilon:221984..230373- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAAGCACCCTACAAGCTTTTCTATTAACAGTATGGTTAAATGCGTTTT
AATGGTCGTGACGTTTAACATAATAGCGTTGAGTATAACGGACGGTTTGC
CAGGACAGAAGCGCGTTTATCTGACGCCAACAGGCCGTGAGAAGGTCAAA
CGATACCTACAGCGCCGGCATAGAGAATATTTACAGAATGAGTTTCCAGA
GAACAATAAACGTCAATTTTATACAAACACATGGGCGGTGAAAGTTGATC
CACCTTCAAAAGAAATAGCCGATACTATCGCCAAGAAACATGGCTTTATC
AATATAGGAAAGGTATGGAGTAGTGGGTGGTATTGTTGGTGGTGGTAATA
ATGAAGTTCCCTGGTGGTATCATTAGATTAGCAAGTTTTACCCTAAAATA
TGTAGTCTAATTCCAGGTCTAATACACTCTTGTATTGTACTTATAAGAAT
CAGTAAGCTTTTGTTGAAAGGCTCGGCTGTTCTTATTTTATGACACTTTG
AGCCTCAAATTGTTCTTAAAATCCTACTCTTACTTTTGCTGCAAAAATGA
AACTACTTAGTACATTAACCAAAATGAAGCAGCTACTTGTGGGCTACTTA
CCCATAAGCCATTAAAGAATTTAGAAAATTTTCTGACACGCTTCCTGAGC
ATACTCCTCAATATAGTACTCAACACTTTTTAAACGAAAGTCAGATATCT
CTCACCATAATTAACCTAATCATTGCTAAATGGGTTTGCATTTTCAACAA
AAACTAAACCACAAAATCCTGAAACCGTTCACATTTTCATTTTAGATTGG
TAATCAAGACGGATATTTCCACTTCAAGCATGTGGAGACATCCAGTAAGA
TTGAAAAGCGAGATCACATCAAGACTGGTTTGTTAACCAATGAAAAAGAA
GTACTGAAAGCTACACAACAGAAAGTTTTGGAAAGGTTTAAACGAGATGG
TTATCCAACAGATCCTGAATTCAAAAAAATGTGGTACTTGGTAGGTACAC
CGGGGAGGGGTTTGTACTTTTACGGTGTCACGGAATTGGCCCTTTTTTAG
TACGGTATTACGGGATTTGACGAAAAAAAAGACGGGAAAACGGTGTTTCA
AAATCAGACGGTGACGGTATTTGGCCTTATTTTTTGTCATTATGCCGGTA
TTTGAACCTGTACAAACGTGTGACGGTGTTATTTTTCAATTTTCGGGATT
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AAACCCCCCCTACACTGTTCTCTCGTTGATGGAAATTAAGCTCCATAAAT
GAAAAGTAAACTCAAATCTAAAAGGTTGAAGAAAATGACATCTTCATGAA
AGAATGTACAACCCTGTTTTATAAAGAAACGGTTCACCACTGTCTCATAA
ATGTAATGTAAACCTATATTTTGCGTATTTAAAATACACCAATGTCTCAT
TAATGCAAATTACACCCCTGACTCATGACGGGACAATAAACCCATGTCTC
TCGAATGGAAAAACACCCCTGTCTCACAAAGGGACAGTGACCACTGTCTC
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GTTTCACCAACGGAATTACATCACTTATGTCTCCTGTTTTATGAATGAAC
ATGTAATATAAATTTTTGATGCTTCACAGGTGGTTTTTTACAACACAAAA
GTTTGAGCTTAATTACGCTCTGAACAGTTAAACCCCCCCCTTAGGAAAGC
CATACTTTTAACACCACCCTTGTTCATCAAAGCCCAAGCCCCCCTAAATG
TAGGGGGGTAGAAACTATGTTGGTAATTAACAAATTGTAACCATCGATGC
TGTAACTCATTCGTTAACCCCCGTCTTTTCGTCTTTTCTTGTAGAACTAA
AAAACTTTGGAAAAGCCTACCTAGCCTCCTTTCGTGTCAAATATCTTTCG
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ATAAAAAGCTAATTTTTTTATTTTTCGTTTTTCATCTTCGTGTTTGAAAA
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AAAAGTATAAAATCGCTATCTAATTCGAAATCTATCAAAATTACGCAATT
GAAAATTTACCACTAGCTAATTTGAAATGTACTTTAGCTTGCTGATTCAA
TCTCGTAATCTATAATCTGATTTCGGCTGGTAATACCAACAAATTAAATT
GACTATGATTATTTAGTCATTAAAAATCATCCTGTCCAATTAAGTAACTT
CTCGTTTTTTATAGCATAACAATGGACAGGGCCACAGTCCAGGAGGAGTT
GATTTGAAGGTGTCCAATGTTTGGAAACAAGGATATACTGGCAAGGGTAT
TGTCATCAGTGTTCTAGATGATGGTAAGCCAAGTTCTTTATGGGGAACTA
AGTTTTAACCATTTAATTGTTTTCAGAAAGTTGTCTTCATGCTTAGAGGA
AAGGTAAGCCAAGTGAAAATAAAGATATTCTTTTTTATGACATTGAAAGG
ATGCGCGCCTCTATGCTGACAAAGCAAAATAAACGATATAATTTCTCATT
ATTGGTGGTCACGGTGTGGCTATCTTTATATTTGAAAATGGAAAATGGAA
GGAAATACGTTTTTTTTTAATAAGGAACACGTTTATAAGGAACTCGAGGC
TGAAAATGGTTCAAAAAATAAGGAATTGTTAAGGAACTGCTCAGGCTGAG
AATAAGTGGATTTGAAAATAATGTACCTTATTGGGACTTATTTGACCAAA
TTTTGATCTTTCAAGGGGCAAAAAGTTCAAAATTTCCTATGTCGTAAGGA
ACTCGATAAGGAACTTTGAGACTGAAATTCTCTGTAAAAATAAGGAACTC
CAGGCTCAGAGCAAAGTTAAGGTTCCTTATAAAAAAAAAACGTGTATCTA
AAAACATTGAAATTTCTTCAGAAACTTGTTATGCTTAGAGGAAATGTTAG
TCCCTATCAATATCTATAAAACTTTGAGCTTCGTTGGGGAAGTATTTCAA
TGAAAATAGAGAACCTTTTGATAGCATACTAGGAGTAAGGTATTTTTATT
AAATCTAAAACCTAGCTTTCAAAAGTTTGGAATTTTTCAATTTTTTTTAA
GAGCACAAACTTTCTGCTTTCGAACCAACAAAGGGTGAAAACTTTCGGTT
TTCACTAAATCAATTTTTCTCATTCATAGGACTTGATCACACACATCCAG
ATCTACAACCAAACTATGTAAGTTTTAATTAGTTTTCATAAAAATCTTAA
GAAAATTAACCTCTAATCGAGACAAAAAACGATTGATATGAGAGCTGTAA
CTACACGCTTTTTTATAAGATAATGTGCTTTGGCTGAGGGTGAGCATTAT
TTTAATTTTTCAATTGTTCTAAACAATAGATTGTTAAGGCCTATTGTTCT
AACTCCGAAATCTCACCCTGATATCCTTATAGAAGTTATTTCTATAAAAG
AATCGTGTATTCGTAATATGCGTAAGTCATTTTTAATGAATAAAATACCG
AATACCGTCGAATTCTTATTTTCGTCCGTGAAATTACAGTACAAGATTTC
AAAATTTCAAAACTTCAAAACTTTCACTCAGTAAAACACAGACTACTAAC
GTAATCATTTTCTTAAATAATCGTACTCATATTTCATTTTCAATAATTTC
AGGATGAGAAAGCCAGTTGTGATTTGAATGACAATGACGAAGATCCGATG
CCCAGGGACACCGATCCCGATAATTGGTAAGATATTCATACAAATATTTG
CACTGAGCGATCAAAGTGAATCAAACTTGGGGAAATAATTAGACAGGATG
TGACCATTATTCTATTGACAGGTGGATACAGTAAAATCTACAAAACTCGA
ATACGAACGAATAACTCAAATTTGTTCGATTTAAGGGAATTTGGATAATT
ATAGTTAGTTATTGATTTATACAATTACTTATAGTGTGGTCGTGTTACAA
AAGTATAGGCTATTTGTAGGAAAAAAATAATATCTAGCTGAAACTTTCTC
CAGAACCTTCTCTATAGGATGCTTATGCCTCAGGAAAAATTCCCCTAAAA
TCCCACAGGTGGAACATCCCTTTTTTGGGCAATTTCTTTTTTCCCCAGGC
AAAACCCTAAGGTCGAAAATTTTTGAAAATTTCAAACTCATTTTCAGACA
ATATCATCAAAATCATTCGAAAGCTCTCAAAAAACTATATAGAAAACTTT
TAAACGGGTATAGCCGATTTCATTACCTAGCTCGAGATAATTCACGCAGA
AGATGCAATTTATGGTCAATTTTAGACCAAAATGTGGCGAAAAGTGGAAC
TTGCGCATGAAATATCTCGAGTTAGGTAATGAAATCGGCTATACCCGTTT
AAAAGTTTTCTATATAGTTTTTTGAGAGCTTTCGAATGAACGAAAGGAAA
TTTAAACCAATCTTTCAAAAAATTACCACACAAATCTTTTCTTTTAGCCA
CGGTACACGATGCGCCGGTGAAGCAGTTGCGGCCGCAAACAATTCAATCT
GCGGTGTGGGCGTCGCTTATAACGCTAAAGTTGGAGGTGTCCGAATGCTT
GATGGTCAAGCTACGGATGCGCTAGAAGCTGCTGCCTTGGGATTTAAAAA
TGATCATGTCGATATTTATATCAATTGTTGGGGACCCAAAGATGATGGGA
AAACGTTTGGAAAGCCGGGTCCTATTGCTACGAATGCTCTCAAAAAAGCA
GCTATCGAGGTATGTATGTATTTTCTATGGTTTTGTTTTCATAATTTTTG
GTAATAAGGTAAAGCTAGGACCGATAGATTAGCCTTTAGAAGATGAAGTA
TATAGTCCACAGTAAAACGGGGCCTTAAAAAACCTTGAGACAAAGTCACT
GCAAAATAGTTAGCTGTAACACTCGAATGAATTTAATGTTTTCTTGCTCA
TAGGGTCGAGACAAAAAAGGCAACATATTCGTTTGGGCGACGGGCAATGG
AGGGCTGACGGACGACGATTGTAATTGTGACGGATATACGACGTCAATAT
ACACTATTTCTATTGGTTGCATTGGTGATCACGGTACATCAGCCTACTAC
ACAGAAAAATGTTCGTCCACTCTTGCTGTGACATTCAATGGAGCTTCTCA
TAGAGAGGGTAGAGAAAACCCCATGGTAAGTCTGTCCTTCTGAATGAATG
AATGAATGAATGAATGAATAAATGAATGAATGAAAATTTGGTTAAAAAGC
AGAAACAACCTGTTGTAATAGCGTTTTTAAGCTCAACTTTGTTTTACAGA
AATCATTTGGCTGAATGATGTATATGATAATATACGAAATATAGCTGTTT
TTTAATCAAAATTTTCATCTTTTGCTTTGAATATCTTGGCCTGATGAATT
TTCTCGGACTTGCTTTTATCCTTTATTAGCTTAACATGTGTTGGTGATGT
CAAGAAGCCAAACGCATACGCTGTACAAGTTGACTAAGTTGAACTTGTTA
ACATTACAGCTGGTAAATTCCTTAAACATCTCTACTTTTATAATTTTAGG
TGACAACGGATTTATATCATGGTTGTACAGAAGAGTTCAAAGGGACTTCT
GCATCGGCCCCTCTTGCTGCTGGTGTTATTGCTCTCCTTCTTGAATCCAA
GTATGTCTTCCTTAGAAAATTCATAGTTCTTGGATTGATATTGAAGCTGC
CTAATCTGTTATCTGGTGCAATTTATTCATTCGAAATAACACAAGCTTTT
GATTGATTAAGTAATGAGATTGTAGTCAGAGGCGACTTGAAGGCTTTTCT
TTCGATAACTGTCTTCTCGTACGTAGGAAGCCACTCTTTCTCCCTGGATT
TCCCAGCTTTCCCTTGATCATTTGCTTTAATTGCTAAGCATTTAGCAGCG
AGGTTTTAAGTGCAAGGGGTTTGAACCTATGACCTTGCACACCATAGCCG
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AATCTCTAAACAAATTGTTTCCAAATTTTAGTCCAGACTTGAATTGGCGC
CAAGTACAAGATGCAATAGTGCGTTCAGCTCAAATCACTTCACCCGTAGA
TGATGGATGGAAAAGAAATGGAGCTGATTTTCATTATAATCTAAAATTTG
GTTTCGGTCGTTTGGACGCAGAAGAACTGGTCAAAGCTGCTAAAAATATG
AAGCCGTTAGGAAACCATGTCAAATGTGTTATCGCAAAAAATAATGAAAA
AGCGTAAGTTTTTCTGCGTAGAAGATATTTACGATTTTGATTTGGGATAC
CATAACTTTTTCTCGAGATTTCTTAGATAGGTCGTTACATCGTATGTATA
TCACCATAAAAACTAAAACGGTTTTTCTGTGAAGTATTTGTTCCAAAAAG
TCTCCGACCATCTCATTTTACCTTAAATACATTACGTCAACTTATTTTTG
CGGTTGATCATTTAATTTGGCGTATGCAAAATTGATCTAAAAAGACTGTC
TTAAGTAAATTTTTGAGCTGAAATAATAACGTAAATTTTAACGGGTATTT
AAAATGTGAGGCGTACTGGTCCTTTTTGAGAATCTTAGAGGATTTACCTT
AAAACTGGTAAAATCAGCCAAATTTAATCCAACATAAATCAATAAACCTA
AGTCATAATCAATCAACTTACTTTGAATGCTCCAATAAATCCTTTTTTAT
AGAAATATTCCATCCAAAGCAGGCGCCATCCGTTTCTCAGCACGAGCCAC
AGAATGCTTGGAAGATGAGGATGACGCTGATGTTAAACGAGGAATGCCCG
AAAGATTAGAACACGTCGTTTTGACCGTCAGCTTTGTCCATAAACGACGT
GGCGACGTCTCTGTAAAGCTTTTCTCACCTGCAGGGACAGAAAGTGAAAT
GTTGAGTACTCGAAAATATGACGATTCGACTGAAGGTTTGGATAAATGGA
ATTTCATGAGCGTCTTTTATTGGGGTAAGTGTTTTTTTTATATATATCAT
TGAATTGGTAGAGAGATGGGAAAACAGACTCGTACATTGTTAAATTTCCT
TATCTACCCTTCATCATTCTATTTAGTTTATTTCATGGTAGGGAATGTGT
GTTCCAAATCTGTTACAAAAAACAACTTCTAGTCTAGATCAAAAGTGATT
ATGGGTGGTGTAAAAAAACCCTGGCAATCTGAAAGGGCCTGGTTATATAG
TGTCAAAAAGTTAAGATGTTTTTTTGTTATTGAGTCCTTAAACCGTATAA
CAGCGAGTCTTCAAGCCCCCAAATCGTCTCAATTCAAATCTTTAATAAGT
TGTAGTTCCATTTTGTTTCAGGTGAGACGGACCACAAAAAAGGATCATGG
CACGTGGTAGTAGCCAATAATCCGGAAGATGATGTAGAGGCGGCCTCCTT
CGGTTCTGATTCCAACAACGACGTTGAATCTCTTGAAGAAGATGTGATTG
ATGCTCAAATGAAAAGCAAACATAAAGAATGGGACCAACGAAGAGAAAAG
GTACATAAATAATGAACTTCCTTCAAATGGATTCATTAAAAATTACCATA
AGTCCAGGGAATTTGAATTCCCAAAAATCTTCTCATCAACATAGGGGGCA
AAATCTTGATTTTTTGTAATTTGTTGTCAGGCGCTCTTATCTTTAGCTTG
AATCTCAAATACCATCTGAAGTTAAACCAAGCTGCGATCCCAGTGAGCAC
TCCTATCGAGTAATAGAGAAAAGCTTTACTTTTAACCAACATTTCGGTCC
TTTTGACGCCGACAATAATTGGCGATATTTTGGACCTGTGGCGGATTAAG
AGCTGGCGTTGAAAGCGCTATTATGAAGATTGGTTGATAAGGTATTTTCT
AATAACACTAAACTGACAGCTGAAATTCGTTTTATTTTAGGATCCATTCT
TCACCTTACCATACCCTAAAGGAGTGAAACGAAGCGATATCCCAAATATC
GAAAGATCTAAAGATGGCAATACGGTAGAGAATAACAAAGACTATAGAAA
TGAACTCTTAGAAGAATTAGATGATTTGATATCACGTAAAAGCACTATAC
CACGGCCGCGCGGCGAAACAGTCGGTCGCTTATTAGAAGTAAATGAACAA
AACAGAGTACAAGAGGTTTCTATAGAGAAGGATTCAAGAGCTCGAATTCC
ACACCGTCATAATAAAAAGACTTCACATCTTTTCAAGAAGGTGCAAGTTC
AAGAAGAAGAAACGGGTGAACCACGTGTTCAAATTAACGCTGGTTATGAA
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ATTTAAAAATGATCATGTCGATATTTATATCAATTGTTGGGGACCCAAAG ATGATGGGAAAACGTTTGGAAAGCCGGGTCCTATTGCTACGAATGCTCTC AAAAAAGCAGCTATCGAGCCACGGTACACGATGCGCCGGTGAAGCAGTTG CGGCCGCAAACAATTCAATCTGCGGTGTGGGCGTCGCTTATAACGCTAAA GTTGGAGGTGTCCGAATGCTTGATGGTCAAGCTACGGATGCGCTAGAAGC TGCTGCCTTGGGATTTAAAAATGATCATGTCGATATTTATATCAATTGTT GGGGACCCAAAGATGATGGGAAAACGTTTGGAAAGCCGGGTCCTATTGCT ACGAATGCTCTCAAAAAAGCAGCTATCGAGGGTCGAGACAAAAAAGGCAA CATATTCGTTTGGGCGACGGGCAATGGAGGGCTGACGGACGACGATTGTA ATTGTGACGGATATACGACGTCAATATACACTATTTCTATTGGTTGCATT GGTGATCACGGTACATCAGCCTACTACACAGAAAAATGTTCGTCCACTCT TGCTGTGACATTCAATGGAGCTTCTCATAGAGAGGGTAGAGAAAACCCCA TGGGTCGAGACAAAAAAGGCAACATATTCGTTTGGGCGACGGGCAATGGA GGGCTGACGGACGACGATTGTAATTGTGACGGATATACGACGTCAATATA CACTATTTCTATTGGTTGCATTGGTGATCACGGTACATCAGCCTACTACA CAGAAAAATGTTCGTCCACTCTTGCTGTGACATTCAATGGAGCTTCTCAT AGAGAGGGTAGAGAAAACCCCATGGTGACAACGGATTTATATCATGGTTG TACAGAAGAGTTCAAAGGGACTTCTGCATCGGCCCCTCTTGCTGCTGGTG TTATTGCTCTCCTTCTTGAATCCAAGTGACAACGGATTTATATCATGGTT 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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000265_pilon | genome | sc0000265_pilon:221984..230373 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1987-2436:451 |
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| Aaloc | 655-726:4639 |
| Aaloc | 619-654:5110 |
| Aaloc | 508-615:6027 |
| Aaloc | 313-507:7596 |
| Aaloc | 1-312:8391 |
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