XLOC_033055 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_033055
Unique NameXLOC_033055
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000265_pilon:326722..335192-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_033055 ID=XLOC_033055|Name=XLOC_033055|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8471bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000265_pilon:326722..335192- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGATTAAAACATTGGATAATCAATTTGCCATCAATAGCATGTGTTC AACGTCGACAGGGGAAATGACTTTTCCAGTGCCCCCTCGATTGTCTCATT TACCTCAAGAAGTACTCAGTGGAAGTGACACACCACAACACTGTCACCAA CAGCCACAGTACAATCAATACCACGATCATTTGGCGATACCGAGCGCAAC AGGCATTCCATGCAACATCGTTGAATACACGTCATCGTTAGTGTCCCGTC AATACGCTTACGATCCAAGTACGTCGGATGTTCCATCGCCTCCCGAACGC AACATGTACAGCAGTGCAGATGATATCGGTGTAAACGGCTCCATTAGTTA CACGGCCGCTTTAACGCAAGACCAATCACCGCAACAACCACCCGCTACGC AATCGTTACCGTCACCCGAACATGCGACTTTACCTTCGACTACATCAGAT TCAGATCCTACAGTACACTCGACTACCGCTCCGCCACCCAACATGGCAAC TTACTTTGAAAACACTTACACAAGAACAATGTCTAGCATTTATTTACCGC CACCGCCGACTAGCTACCGACAGAACGATGGCATGTACCCTAGAGGTATA CCGGGGATGCAGCCATCGGATTATATGTCTCCCGAAGCTAGCGACACTTA CAAAAACTATATACGACCTTCTTACGAAAGTTATCTACATAGCGGAGGGG CAGAACAGGACGGCCAGGTTTCATCGGCCGGTTTAAGTTCACCCTTTTAT TCAGCACCAAATCCGTTCAGTCTGTATCGTAACGGTTTCAATAATGCGAC AGATTCGAATATGGCGTTCAATAACTCCTCAAAATTCGGTGGTAAGTTTC CGTTTCCTTTTCATTTTAATTTATTTATAACAAGCTATCTAAAGGGAAGT AAAATCTAGCGAGTTTGGTCAAAATTAATTCTCGTAAACACTTTAAACAA TGCTACCTCGCCAAAATAGATTATCGCCAAAAATTAATAAATCTTCAAAA ATAATACCATGATTGGTGTCAACACAAAAAGCGTAGCTAAAAATAGTAGC TCCTTCGCCAAAATAAGTTTTTTCCAAATTAATTTTTTTCATGATATTCA CTGATCGCCAGAATAAGGAAACTATCGATACTCAATTCAATTGTATGATA TATCTAGAGTCAACCAAAATTTGGATGGGGTTATCTCTGGGAACGGCGGG AGGGGTGTAGGGTGTACAGGTCACCCTTGATGAAAATATCTATCAAACGC AGGTCGTGTAATAACGGCGAACTAAAGGGTTGTGTCCTGTCAACGATATT ATATCAATTATTAACAATTCTTTTTTAACAAAAATCTCAACTTTTTCCCA TACCGTTCTGAGAAAGCTTTTGGTGTGATCGGGATCGAAACAAAATGAAG GGAGATGGTACAAAAAAAATATTGTTTAACATTTTTTCCTTTTCAAGTAG AATTTTATGTCACTGGGATTTCATCATTTACAGCATGGCATAAAATGACG TTCATGCTCTTTTCTAGCTTTTTTAATCCTGAAAAATCACAAGATCTTTT TTGAAGTATTTGAAAAAAAAACTCTTATAGAGAAAATGAAACTCAAATTT GGAAGTGTTTTAAAGGTTTTGGTGTAAACTAACAACTGATTAAAATGGTG CAAATCTATTTATTTGTCAGTCAAAAAATTAACACCAATTTGGACAGCTA ACAGTAGAACATAATTATTTGATGACACTTTTCAGTAACTTTTCTTATTA TTCACAGAAATGTGAAGGGTCTTGCAAAATCATGCATATACATATACAAT GGTGACTGGAGACCTCAATTTTGAATGTCAACCCTTGTTTTATTTTTCGT TCTATTTCTACCTGAAGCACAACTTATTATAAAGAAAATTGAATTCGATT TTCTTTGAACCCCTTTTTCAGCATTTTTCATATTCCTAGCACCCACAAAT TCATATTACATTTAAATTAGAAAATCCCCCCTCCCCTTCAGTTTCAGTAC CCAAAATCAGTTTTTATAGTCTTCAATCATTCATGCATTTTTAGCAAAAA ATAAGAATGATGTTTATTCCCGAACACTAATACCCCTAAAAAGCGAAAAC AAAGGATTTTGTTCTCGTAATAGAGACTAAAAGGAAAAAAGGACTAAAAT AAATGCAGGGCATAAGTAGAATTTTTCTTCAACAACAGTTTTGGATATTA GTTTTTATAAGCAATCCCATTTTTTTGGAGGTCAAAGGCTGGGGTTGCTT GCTCTTCGATTCAATATTGAAGGAAATCAATTTTAGGAATTCCCGAAATA AACCCCCTTATTATTTTGAAGTTCTAGAATCCCTAGTTTAGCAAAACAAA GGTATGTTTTTTGATGGCAATAACATCTCTCTTTATTTTGGCTACCCAGC TGGCACACAACGTTCTTTTAAAGTTCAAATAACGTTATCTGGACGTTATG AATGTCACATGGACGTTGTTTTGACGTTATGTGCCGTCTGGGTAGAGCTT GATCTGTTGGCATTTTTAGGGTAGAATCCTTAGTAACCAGTTGTTTGTTT AGGAACAGTCCTTGATGTGTACGTTTTACGTTTTTCTTCTTTCTTCTAAA ATAAGAACATCCCACTGGAACACAGCACTGTTTCAATGCTCAACTGGGCG TTGTGGATGTAAGATGGATGCTAAAGCAACGTTTCGTATCAACGAAAAAG GCTTGGAGTCTTGAGCATGAAGCTTTTAAGGAAATTATGTCAAAATACTT ACAGGATGCTGAAAATGAAGACAGTCCTAAGCATCAAAAAGTTATGAATA TCCCTAAGGCTTCAGCAATTCGTAATGTTCTTATACAGCGAGTATATCAT GGTATTGGGTGAATAATATGACAAACAAACAAATATGACAGGTCTATAAG AAAACCAAACCGGACCTTTTGATGCAGAATCACCTCAAAGGTGTCGTTAG AACTTTTGCAGGATTTAGAATGAAACGCCAACTTTCTAGCGCTATTTCGT TTTCACAGTAGGGATCATCTTTTTTAATCATTGTTTTTCCAAAAACAAAC TTTCTTTCGATGTTGTGCTCGAAAAACAAACTTATATTTTGTTTTCATGT TTTGTTTTAATGTCACGTTTTCGCGTTGATGTTTTTGTTAGAGTTTTTGT ACCCTTGAAACAAAGATTTTTTTGTTAACCTTAAGGTGTAGAAAGACACC CTAACCTTAATAGATTTAGAAACTCTTCAGCCTTAGAGAATTAAGAGGGC TAAAAAGGGCCTGGGATCGATAGGGGGCGAGTATGCCGGGAGAGGAAAGT CTAAATACATCGTAATTTGGAAGATTTTTCGACGCTTCTATACCCTTGAA CATTATTTTTGAACAGTCAAAATTTTACTTGTTTCAGGTGAACAAATTAC TTGATTTTATAACTTGTAGCGATAACTTAGAATGAAGAATTCTATTCATT TTTTCAAATAAATTTAATGGTAAAAATCTTTATTCCTTTTTTCAAACTAA GAATCATTTAAACTTGACGACGATACTAGTAGATCATACCAGTATGCCAG TGTAATAAATAATCCCCTAAACTGCAACTCTTGGATCTAAAATTAGTTTT GACTCGTAAACAATTAGATTTAGACTTTTATCTCATACAGCATCATTATT TTCAAAAACAGAAAATTCTCACTCTGGGATTTTGTAATACCTCTTAGTGA TAAATAATAAATTATGAATTTGTTTTTCTGAGTAATTTTTTTTATAAAAA CAAGTATGTTATTTTTGCGAGTACTACTCTAATTGAATTAAATTTCGAAA GATTATATTTTGAGAAATTAAAAAGTTGATTTTGTGACTCAACATAATAA TGAGCGTAAAACTAAAATTGTCGCGAAAATTCATTCTGCACATATTGAAG TGGTTCTTGAGTTTAAAATTGATTAGACTTCACATGTAGGTGACCTGGGA CCTTTGCCAAAACTTTTTATCAGAAAAACGTGACATCGGGCAAGGTGATA AGGGGCAAGAGACAGACGTTATTTGATACTGAGTCTATATGGGCAACCTG TATAAATTACTTGCACATATGCCCTATAGTCAAATTCAAATTGAAATGGA ACACTCTGTCAATAATAGTTTTGTCAGTTCAGCATAGTTTCTATTTGAGC AACAAAAGTCAATGCTCTGCGAATCGAATACTACAGTGCGACTTTTTTTG TAATTATTAAAAATTTCGAAACGAGTGTATGTGACAATTTCTTTGCTAAA AGACTTGTGACTATGTCTCTTTTCTTTCGCATTTGAATGTTAATCTTTGC TCTGACTCGAAAAATGGAGTCTGTATATAGGAAAGTTCGCAAGGTATTGT CACATAGACGTTTCAATTTTAGCGCCCTTTTTTATGAGCTGATTTAAATT TGTCCCCCTTGTCATCGTTGGGTTTACGGGGTTTTAAAAGAAGGCTAGCG ACTAAACTGAAAGACAATATTAAGTTTTGATAATAATATTCAACATAAAC TCCCATTTTTTATTAATTAAATTTAGGAATTATTTTCTGACTATCAGCAG TAAAGCAAAGGTCTAAAAGAATAGGAAATGCCAATTAGGCCTTTTTCTCA GGGTCTGGGAACAAATTTAAGCACTTAAACCATACCAAAAGTCTTGAATT TGATGATTTTGAATTTGAAGCTCTTTTTTGTTTGCCATTTATTTATAAAT ACATGACAGCATTACAATAAAAAATTTTTATCAAATTGATTTGAAATTTT TAAGGTTTTTAAACTTAAAACCTATATTCGGCCTTTAAAATCGTATGAAA GTTTTTCTTGACATAAATATTTGAAATACGGTATCTGATTTCTTATTTCA TAATATTTAGCCTCTTTTCAGAAAAAGATATTCCATTTTGGTAAAATTAA ATGAAAAATACAAAATAGTTTTAAATCCGTTTTTCTTACAGAATTTTCTC AAAGTGGGAAGTCTTATTTTTGAAGAAGGAAGGTTTTGAGCTGGCTGATC CAGTTCTAAGTCCACGCCCCTTCTTGATTTTCTTTAGTAAAAATCTGATT CTTAAATTTATGACTTTTTATTTACAACACAAAAGGTTTCAGCAAATTAA TCTACTTGTTGCAAAAAAAGTCTTAACTAATTAAGCATATGAGTCTTCGT GTTATTTGTCTGAATGTAAAAATATTTTCGATGCCTCTATTCAGTAATTT TAAAATAAAAATATTGATACCCAAATGTAAAAATTCGAAAATAACATCAT CAAAAGCTTTCTCCCTTTGTTTTATTTTGTTGATGCTATTGTGTAATAGA TTTCCGTGGTGAAATGAAATCAGCAAATAAATACCAAGAAATTAGTTATC GTATGAAATTACTTTTTAATGAAAACATTTCAAAAAAAATAAATATTGGT AAAAATCTATTTTTACTAAAATCTTTCAAGATATGTTACTGTACTTTTCT TAGCCTGGAGATCCATACTATGATTTCTTATTCTATACACCGATGATGAA ATATATAGCATGGTATGGGCTGATGGTTTGAATTTCTCAGATCCTAATAA CGGTTGAAAACATAGCCGATCAAATTTTGTTATTTTTTTACTGGTCACAC TTTCTTAGAGAAAGCGCAACTTCCAAAATTTGGTTTTTATTTTAGTAAGT GAGGACAGCGCTTAATTCGAATTTCCCACTGTAATTTTTTTGAGGAAGAT TTGTGCCTCACAGGTCATACCCGTCCTGTATACATCAGATTATAAAAGAA ATACAGGACGGTTCTCCTGTCTATACTTTTCTAGACCCTACACAGTAACT AGGTAGTAATCTGCAAAAATCAAGGCTTCTCGTAAAGAGAACATTTGCAC AGTTGATATGTTACATCTCACACAGCCAAGCTATTAATTTCAAAAAAAGG TTTGATACAAGACAAGTGGAAGGCTTAACCTTTTTCAATGGTGTTGGTAA GATAGGCCACGCAAACTTATGATGACATTTTCACATATCAAACAATTACT TCATCATTCCAAATAAATTGGCATGTTTTAAGAAAAACGATACTTCGACA CTTAGATTTGTTTGTTTACTGAAGGTATCGAGTTTTTTTGTTGTCATGAA GTTTTATGTCGTATCTTCAGGGTCAAGTGACTTTGATGTTTTTGAGGTTT AGATTAATTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTATTTGTTTTAAGGTCAGCT GGTGTAATTTTAGATGCTGAATTAATATCTTATCGAAATTCGTTTTCAAA TAATTCCATTGTTTCGTGCTATAAGAAATTTCCCACGGGAATTTATTTTC GATTTCGATTTACTCTTGCGTCTTTGTTTTCTTTGTATGGTGTCAGTGTG GGGAAGGATGTGAAAAAGGGAGGGAAACTTGATCCAATGTAAACCAATCA TTTTTAAAACATTATGGTGGATTTCTTAAATACAAAAGACGTTATAAAAC CAAAATTGAGAGAAAACTGAAACTGTTTCAAAAACGCGTAGACCGCCGTA CTGTCTCTCATATAGTCAATATTGACTTTTAAAAATAGATAAAGAATGAA ACATCTGTCCTTTTGAATTTCTTTTGTGTTGAGAATTCGCTTTCATTACT TGAGGTCTTAAAAATCCCCTTATCTTTGATTCGACATCTTTCGTCTTGTG CGAACAATACCGTCTTACTTTGTTCAAAATCTTTTTGACAATCGCATTCA TCAATCATCTGTATTTTTACACCCCTGTCTCACTCCCAGGATAAGAGTCT AGGATTGTTTGTTTGTAATATTTAGGGATATTTATTCCCAACTTTTCTCA CAATGTTTTAGCAAAATTTAACTTTCCACTTTTCAAGTAAATTAAACTTT ATCGGCCAATTTTACTCCGGCCAAAATGACACATATACAAAGGGCCAATA AAAGGTTACAATAACACTGTTGAGGAGAGCTGCCTTGCATTGGCTTGAAA ATTCGTCATTTCTTGAAGTAATTTTTTAAAATGTTTTTCAAGCCAAATTT GATCGATTTTATCCCTTTGATTTTCGTTCTGCCGCGAAAACTTTGAATAT TACTTTGAATATTTTTCATTTTCTCATAAAGAGTGGGAAGAATTCAGTTT TAAATAATCTTGAAATGTAAAAAAATTCTTATCGCTTATAAAACTGAAGG GTTTTTCTTAAAAAAAGGCTAAAACAAGATGGCCAACTTTTTTTAATCTG ACAGTTTGATCCATTTTGATGAAAAAGGACGTTCGCACTATAATCAAAAT GTCACTTATGAAATCCTCCATCACAAAACTACTTAAAAAATAATACCCCT ACAATCTAATACAAAATTTATACTCTTGAAAAAAGAATTGGTGAAAATGA GGCTGTTTATGAACAGGGGTGGGGCCAGAGAGTAAAGTTTATTGTTTTAA TCGTAGCGATAATATTTTACAGATCTTTACCCACTTAAAAAATATGACAG ACTTTTAGAAGCGGTTCTTTTTATCTGCCACGCGGCTGAGTATCGTTTAT AAAATAGCGCTCAATAAGAATCTCTTAAACAAAGGGATTTTGAATATAGC ATGACACAACTTGAAACTTGTATCAATTTCTATGAAGATGATAAGACCCC TTTTAACGAAAGGTCAAGCACATATACAGATAATTTGTTTTTGAAACTGC TTGTAATATGTGAAAATCTCTTGAAACGGTTGACGCCCAGCTCCGCCCTC CAACTAAACCACTAATGTTTTTCAACCCAAAGGTGTCGCATTTGTTTTTT CTCATAACCAACTATCATTACTTAAAATTTTAAATATGTTCAAAAACTTC AATTTCTATTCTAAATTAAAGCGTGTGGACCTCCTAAAGCCTCGAATCCT TATTTGATCGTTGAAAACCATTGATTCTACCCATTTCCTATCCATTAGAA AATTTATTAAAGTAAACCGCCTTGATAAACCTCGATAAAGTTTTTTGTGT TTGTATTTTCAAATTACGTTGCACTATTAAAACTCGATCTCAGTTATAAA TTGTTCAGCCTGCACACATTTCAACCATTTCGTCAAAAACTTTATGAAAG GTGCCGAGAACTTCAAGGTTGAATGGCGTCAAATGTATTAGAACGCTCAC TGGCGCACTAATCTGACGTTATCAGGCCTTGAAAAACTCGGTTCCAAACC CCATTTAACGTTAGTGTTGAAAGTTGTATTTGAAAATCTCAGATATAGGG ATTATCTGGTACCAGATGTGGAAATATGCTACGACACGCTTTGCTCTGAA GGTCGGGCATATTGGCCCGCTCCTTCAGAGCTTTAGCGTGGGCGGCCGCC AATACGCCATCGGAATATCAGATAAATATAGGGGTGAACCGAAATGCAAA ATGATCACACTTTCCATTTAGTTTAATTGACCTTTCGTTGTTTTTGTTTT TCACAGACTCGGCAGTTTCGACGACGACTCCTTCAAAATCGCGAAAAGAA AGGACGGCATTTACAAAAGAC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000265_pilon:326722..335192-

>XLOC_033055 ID=XLOC_033055|Name=XLOC_033055|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1812bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000265_pilon:326722..335192- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGATTAAAACATTGGATAATCAATTTGCCATCAATAGCATGTGTTC
AACGTCGACAGGGGAAATGACTTTTCCAGTGCCCCCTCGATTGTCTCATT
TACCTCAAGAAGTACTCAGTGGAAGTGACACACCACAACACTGTCACCAA
CAGCCACAGTACAATCAATACCACGATCATTTGGCGATACCGAGCGCAAC
AGGCATTCCATGCAACATCGTTGAATACACGTCATCGTTAGTGTCCCGTC
AATACGCTTACGATCCAAGTACGTCGGATGTTCCATCGCCTCCCGAACGC
AACATGTACAGCAGTGCAGATGATATCGGTGTAAACGGCTCCATTAGTTA
CACGGCCGCTTTAACGCAAGACCAATCACCGCAACAACCACCCGCTACGC
AATCGTTACCGTCACCCGAACATGCGACTTTACCTTCGACTACATCAGAT
TCAGATCCTACAGTACACTCGACTACCGCTCCGCCACCCAACATGGCAAC
TTACTTTGAAAACACTTACACAAGAACAATGTCTAGCATTTATTTACCGC
CACCGCCGACTAGCTACCGACAGAACGATGGCATGTACCCTAGAGGTATA
CCGGGGATGCAGCCATCGGATTATATGTCTCCCGAAGCTAGCGACACTTA
CAAAAACTATATACGACCTTCTTACGAAAGTTATCTACATAGCGGAGGGG
CAGAACAGGACGGCCAGGTTTCATCGGCCGGTTTAAGTTCACCCTTTTAT
TCAGCACCAAATCCGTTCAGTCTGTATCGTAACGGTTTCAATAATGCGAC
AGATTCGAATATGGCGTTCAATAACTCCTCAAAATTCGGTGATGGTGATT
AAAACATTGGATAATCAATTTGCCATCAATAGCATGTGTTCAACGTCGAC
AGGGGAAATGACTTTTCCAGTGCCCCCTCGATTGTCTCATTTACCTCAAG
AAGTACTCAGTGGAAGTGACACACCACAACACTGTCACCAACAGCCACAG
TACAATCAATACCACGATCATTTGGCGATACCGAGCGCAACAGGCATTCC
ATGCAACATCGTTGAATACACGTCATCGTTAGTGTCCCGTCAATACGCTT
ACGATCCAAGTACGTCGGATGTTCCATCGCCTCCCGAACGCAACATGTAC
AGCAGTGCAGATGATATCGGTGTAAACGGCTCCATTAGTTACACGGCCGC
TTTAACGCAAGACCAATCACCGCAACAACCACCCGCTACGCAATCGTTAC
CGTCACCCGAACATGCGACTTTACCTTCGACTACATCAGATTCAGATCCT
ACAGTACACTCGACTACCGCTCCGCCACCCAACATGGCAACTTACTTTGA
AAACACTTACACAAGAACAATGTCTAGCATTTATTTACCGCCACCGCCGA
CTAGCTACCGACAGAACGATGGCATGTACCCTAGAGGTATACCGGGGATG
CAGCCATCGGATTATATGTCTCCCGAAGCTAGCGACACTTACAAAAACTA
TATACGACCTTCTTACGAAAGTTATCTACATAGCGGAGGGGCAGAACAGG
ACGGCCAGGTTTCATCGGCCGGTTTAAGTTCACCCTTTTATTCAGCACCA
AATCCGTTCAGTCTGTATCGTAACGGTTTCAATAATGCGACAGATTCGAA
TATGGCGTTCAATAACTCCTCAAAATTCGGTGACTCGGCAGTTTCGACGA
CGACTCCTTCAAAATCGCGAAAAGAAAGGACGGCATTTACAAAAGACACT
CGGCAGTTTCGACGACGACTCCTTCAAAATCGCGAAAAGAAAGGACGGCA
TTTACAAAAGAC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_033055XLOC_033055-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000265_pilongenomesc0000265_pilon:326722..335192 -
Properties
Property NameValue
Aaloc844-906:64
Aaloc1-840:8472