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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000265_pilon:326722..335192- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033055 ID=XLOC_033055|Name=XLOC_033055|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8471bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000265_pilon:326722..335192- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTGATTAAAACATTGGATAATCAATTTGCCATCAATAGCATGTGTTC
AACGTCGACAGGGGAAATGACTTTTCCAGTGCCCCCTCGATTGTCTCATT
TACCTCAAGAAGTACTCAGTGGAAGTGACACACCACAACACTGTCACCAA
CAGCCACAGTACAATCAATACCACGATCATTTGGCGATACCGAGCGCAAC
AGGCATTCCATGCAACATCGTTGAATACACGTCATCGTTAGTGTCCCGTC
AATACGCTTACGATCCAAGTACGTCGGATGTTCCATCGCCTCCCGAACGC
AACATGTACAGCAGTGCAGATGATATCGGTGTAAACGGCTCCATTAGTTA
CACGGCCGCTTTAACGCAAGACCAATCACCGCAACAACCACCCGCTACGC
AATCGTTACCGTCACCCGAACATGCGACTTTACCTTCGACTACATCAGAT
TCAGATCCTACAGTACACTCGACTACCGCTCCGCCACCCAACATGGCAAC
TTACTTTGAAAACACTTACACAAGAACAATGTCTAGCATTTATTTACCGC
CACCGCCGACTAGCTACCGACAGAACGATGGCATGTACCCTAGAGGTATA
CCGGGGATGCAGCCATCGGATTATATGTCTCCCGAAGCTAGCGACACTTA
CAAAAACTATATACGACCTTCTTACGAAAGTTATCTACATAGCGGAGGGG
CAGAACAGGACGGCCAGGTTTCATCGGCCGGTTTAAGTTCACCCTTTTAT
TCAGCACCAAATCCGTTCAGTCTGTATCGTAACGGTTTCAATAATGCGAC
AGATTCGAATATGGCGTTCAATAACTCCTCAAAATTCGGTGGTAAGTTTC
CGTTTCCTTTTCATTTTAATTTATTTATAACAAGCTATCTAAAGGGAAGT
AAAATCTAGCGAGTTTGGTCAAAATTAATTCTCGTAAACACTTTAAACAA
TGCTACCTCGCCAAAATAGATTATCGCCAAAAATTAATAAATCTTCAAAA
ATAATACCATGATTGGTGTCAACACAAAAAGCGTAGCTAAAAATAGTAGC
TCCTTCGCCAAAATAAGTTTTTTCCAAATTAATTTTTTTCATGATATTCA
CTGATCGCCAGAATAAGGAAACTATCGATACTCAATTCAATTGTATGATA
TATCTAGAGTCAACCAAAATTTGGATGGGGTTATCTCTGGGAACGGCGGG
AGGGGTGTAGGGTGTACAGGTCACCCTTGATGAAAATATCTATCAAACGC
AGGTCGTGTAATAACGGCGAACTAAAGGGTTGTGTCCTGTCAACGATATT
ATATCAATTATTAACAATTCTTTTTTAACAAAAATCTCAACTTTTTCCCA
TACCGTTCTGAGAAAGCTTTTGGTGTGATCGGGATCGAAACAAAATGAAG
GGAGATGGTACAAAAAAAATATTGTTTAACATTTTTTCCTTTTCAAGTAG
AATTTTATGTCACTGGGATTTCATCATTTACAGCATGGCATAAAATGACG
TTCATGCTCTTTTCTAGCTTTTTTAATCCTGAAAAATCACAAGATCTTTT
TTGAAGTATTTGAAAAAAAAACTCTTATAGAGAAAATGAAACTCAAATTT
GGAAGTGTTTTAAAGGTTTTGGTGTAAACTAACAACTGATTAAAATGGTG
CAAATCTATTTATTTGTCAGTCAAAAAATTAACACCAATTTGGACAGCTA
ACAGTAGAACATAATTATTTGATGACACTTTTCAGTAACTTTTCTTATTA
TTCACAGAAATGTGAAGGGTCTTGCAAAATCATGCATATACATATACAAT
GGTGACTGGAGACCTCAATTTTGAATGTCAACCCTTGTTTTATTTTTCGT
TCTATTTCTACCTGAAGCACAACTTATTATAAAGAAAATTGAATTCGATT
TTCTTTGAACCCCTTTTTCAGCATTTTTCATATTCCTAGCACCCACAAAT
TCATATTACATTTAAATTAGAAAATCCCCCCTCCCCTTCAGTTTCAGTAC
CCAAAATCAGTTTTTATAGTCTTCAATCATTCATGCATTTTTAGCAAAAA
ATAAGAATGATGTTTATTCCCGAACACTAATACCCCTAAAAAGCGAAAAC
AAAGGATTTTGTTCTCGTAATAGAGACTAAAAGGAAAAAAGGACTAAAAT
AAATGCAGGGCATAAGTAGAATTTTTCTTCAACAACAGTTTTGGATATTA
GTTTTTATAAGCAATCCCATTTTTTTGGAGGTCAAAGGCTGGGGTTGCTT
GCTCTTCGATTCAATATTGAAGGAAATCAATTTTAGGAATTCCCGAAATA
AACCCCCTTATTATTTTGAAGTTCTAGAATCCCTAGTTTAGCAAAACAAA
GGTATGTTTTTTGATGGCAATAACATCTCTCTTTATTTTGGCTACCCAGC
TGGCACACAACGTTCTTTTAAAGTTCAAATAACGTTATCTGGACGTTATG
AATGTCACATGGACGTTGTTTTGACGTTATGTGCCGTCTGGGTAGAGCTT
GATCTGTTGGCATTTTTAGGGTAGAATCCTTAGTAACCAGTTGTTTGTTT
AGGAACAGTCCTTGATGTGTACGTTTTACGTTTTTCTTCTTTCTTCTAAA
ATAAGAACATCCCACTGGAACACAGCACTGTTTCAATGCTCAACTGGGCG
TTGTGGATGTAAGATGGATGCTAAAGCAACGTTTCGTATCAACGAAAAAG
GCTTGGAGTCTTGAGCATGAAGCTTTTAAGGAAATTATGTCAAAATACTT
ACAGGATGCTGAAAATGAAGACAGTCCTAAGCATCAAAAAGTTATGAATA
TCCCTAAGGCTTCAGCAATTCGTAATGTTCTTATACAGCGAGTATATCAT
GGTATTGGGTGAATAATATGACAAACAAACAAATATGACAGGTCTATAAG
AAAACCAAACCGGACCTTTTGATGCAGAATCACCTCAAAGGTGTCGTTAG
AACTTTTGCAGGATTTAGAATGAAACGCCAACTTTCTAGCGCTATTTCGT
TTTCACAGTAGGGATCATCTTTTTTAATCATTGTTTTTCCAAAAACAAAC
TTTCTTTCGATGTTGTGCTCGAAAAACAAACTTATATTTTGTTTTCATGT
TTTGTTTTAATGTCACGTTTTCGCGTTGATGTTTTTGTTAGAGTTTTTGT
ACCCTTGAAACAAAGATTTTTTTGTTAACCTTAAGGTGTAGAAAGACACC
CTAACCTTAATAGATTTAGAAACTCTTCAGCCTTAGAGAATTAAGAGGGC
TAAAAAGGGCCTGGGATCGATAGGGGGCGAGTATGCCGGGAGAGGAAAGT
CTAAATACATCGTAATTTGGAAGATTTTTCGACGCTTCTATACCCTTGAA
CATTATTTTTGAACAGTCAAAATTTTACTTGTTTCAGGTGAACAAATTAC
TTGATTTTATAACTTGTAGCGATAACTTAGAATGAAGAATTCTATTCATT
TTTTCAAATAAATTTAATGGTAAAAATCTTTATTCCTTTTTTCAAACTAA
GAATCATTTAAACTTGACGACGATACTAGTAGATCATACCAGTATGCCAG
TGTAATAAATAATCCCCTAAACTGCAACTCTTGGATCTAAAATTAGTTTT
GACTCGTAAACAATTAGATTTAGACTTTTATCTCATACAGCATCATTATT
TTCAAAAACAGAAAATTCTCACTCTGGGATTTTGTAATACCTCTTAGTGA
TAAATAATAAATTATGAATTTGTTTTTCTGAGTAATTTTTTTTATAAAAA
CAAGTATGTTATTTTTGCGAGTACTACTCTAATTGAATTAAATTTCGAAA
GATTATATTTTGAGAAATTAAAAAGTTGATTTTGTGACTCAACATAATAA
TGAGCGTAAAACTAAAATTGTCGCGAAAATTCATTCTGCACATATTGAAG
TGGTTCTTGAGTTTAAAATTGATTAGACTTCACATGTAGGTGACCTGGGA
CCTTTGCCAAAACTTTTTATCAGAAAAACGTGACATCGGGCAAGGTGATA
AGGGGCAAGAGACAGACGTTATTTGATACTGAGTCTATATGGGCAACCTG
TATAAATTACTTGCACATATGCCCTATAGTCAAATTCAAATTGAAATGGA
ACACTCTGTCAATAATAGTTTTGTCAGTTCAGCATAGTTTCTATTTGAGC
AACAAAAGTCAATGCTCTGCGAATCGAATACTACAGTGCGACTTTTTTTG
TAATTATTAAAAATTTCGAAACGAGTGTATGTGACAATTTCTTTGCTAAA
AGACTTGTGACTATGTCTCTTTTCTTTCGCATTTGAATGTTAATCTTTGC
TCTGACTCGAAAAATGGAGTCTGTATATAGGAAAGTTCGCAAGGTATTGT
CACATAGACGTTTCAATTTTAGCGCCCTTTTTTATGAGCTGATTTAAATT
TGTCCCCCTTGTCATCGTTGGGTTTACGGGGTTTTAAAAGAAGGCTAGCG
ACTAAACTGAAAGACAATATTAAGTTTTGATAATAATATTCAACATAAAC
TCCCATTTTTTATTAATTAAATTTAGGAATTATTTTCTGACTATCAGCAG
TAAAGCAAAGGTCTAAAAGAATAGGAAATGCCAATTAGGCCTTTTTCTCA
GGGTCTGGGAACAAATTTAAGCACTTAAACCATACCAAAAGTCTTGAATT
TGATGATTTTGAATTTGAAGCTCTTTTTTGTTTGCCATTTATTTATAAAT
ACATGACAGCATTACAATAAAAAATTTTTATCAAATTGATTTGAAATTTT
TAAGGTTTTTAAACTTAAAACCTATATTCGGCCTTTAAAATCGTATGAAA
GTTTTTCTTGACATAAATATTTGAAATACGGTATCTGATTTCTTATTTCA
TAATATTTAGCCTCTTTTCAGAAAAAGATATTCCATTTTGGTAAAATTAA
ATGAAAAATACAAAATAGTTTTAAATCCGTTTTTCTTACAGAATTTTCTC
AAAGTGGGAAGTCTTATTTTTGAAGAAGGAAGGTTTTGAGCTGGCTGATC
CAGTTCTAAGTCCACGCCCCTTCTTGATTTTCTTTAGTAAAAATCTGATT
CTTAAATTTATGACTTTTTATTTACAACACAAAAGGTTTCAGCAAATTAA
TCTACTTGTTGCAAAAAAAGTCTTAACTAATTAAGCATATGAGTCTTCGT
GTTATTTGTCTGAATGTAAAAATATTTTCGATGCCTCTATTCAGTAATTT
TAAAATAAAAATATTGATACCCAAATGTAAAAATTCGAAAATAACATCAT
CAAAAGCTTTCTCCCTTTGTTTTATTTTGTTGATGCTATTGTGTAATAGA
TTTCCGTGGTGAAATGAAATCAGCAAATAAATACCAAGAAATTAGTTATC
GTATGAAATTACTTTTTAATGAAAACATTTCAAAAAAAATAAATATTGGT
AAAAATCTATTTTTACTAAAATCTTTCAAGATATGTTACTGTACTTTTCT
TAGCCTGGAGATCCATACTATGATTTCTTATTCTATACACCGATGATGAA
ATATATAGCATGGTATGGGCTGATGGTTTGAATTTCTCAGATCCTAATAA
CGGTTGAAAACATAGCCGATCAAATTTTGTTATTTTTTTACTGGTCACAC
TTTCTTAGAGAAAGCGCAACTTCCAAAATTTGGTTTTTATTTTAGTAAGT
GAGGACAGCGCTTAATTCGAATTTCCCACTGTAATTTTTTTGAGGAAGAT
TTGTGCCTCACAGGTCATACCCGTCCTGTATACATCAGATTATAAAAGAA
ATACAGGACGGTTCTCCTGTCTATACTTTTCTAGACCCTACACAGTAACT
AGGTAGTAATCTGCAAAAATCAAGGCTTCTCGTAAAGAGAACATTTGCAC
AGTTGATATGTTACATCTCACACAGCCAAGCTATTAATTTCAAAAAAAGG
TTTGATACAAGACAAGTGGAAGGCTTAACCTTTTTCAATGGTGTTGGTAA
GATAGGCCACGCAAACTTATGATGACATTTTCACATATCAAACAATTACT
TCATCATTCCAAATAAATTGGCATGTTTTAAGAAAAACGATACTTCGACA
CTTAGATTTGTTTGTTTACTGAAGGTATCGAGTTTTTTTGTTGTCATGAA
GTTTTATGTCGTATCTTCAGGGTCAAGTGACTTTGATGTTTTTGAGGTTT
AGATTAATTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTATTTGTTTTAAGGTCAGCT
GGTGTAATTTTAGATGCTGAATTAATATCTTATCGAAATTCGTTTTCAAA
TAATTCCATTGTTTCGTGCTATAAGAAATTTCCCACGGGAATTTATTTTC
GATTTCGATTTACTCTTGCGTCTTTGTTTTCTTTGTATGGTGTCAGTGTG
GGGAAGGATGTGAAAAAGGGAGGGAAACTTGATCCAATGTAAACCAATCA
TTTTTAAAACATTATGGTGGATTTCTTAAATACAAAAGACGTTATAAAAC
CAAAATTGAGAGAAAACTGAAACTGTTTCAAAAACGCGTAGACCGCCGTA
CTGTCTCTCATATAGTCAATATTGACTTTTAAAAATAGATAAAGAATGAA
ACATCTGTCCTTTTGAATTTCTTTTGTGTTGAGAATTCGCTTTCATTACT
TGAGGTCTTAAAAATCCCCTTATCTTTGATTCGACATCTTTCGTCTTGTG
CGAACAATACCGTCTTACTTTGTTCAAAATCTTTTTGACAATCGCATTCA
TCAATCATCTGTATTTTTACACCCCTGTCTCACTCCCAGGATAAGAGTCT
AGGATTGTTTGTTTGTAATATTTAGGGATATTTATTCCCAACTTTTCTCA
CAATGTTTTAGCAAAATTTAACTTTCCACTTTTCAAGTAAATTAAACTTT
ATCGGCCAATTTTACTCCGGCCAAAATGACACATATACAAAGGGCCAATA
AAAGGTTACAATAACACTGTTGAGGAGAGCTGCCTTGCATTGGCTTGAAA
ATTCGTCATTTCTTGAAGTAATTTTTTAAAATGTTTTTCAAGCCAAATTT
GATCGATTTTATCCCTTTGATTTTCGTTCTGCCGCGAAAACTTTGAATAT
TACTTTGAATATTTTTCATTTTCTCATAAAGAGTGGGAAGAATTCAGTTT
TAAATAATCTTGAAATGTAAAAAAATTCTTATCGCTTATAAAACTGAAGG
GTTTTTCTTAAAAAAAGGCTAAAACAAGATGGCCAACTTTTTTTAATCTG
ACAGTTTGATCCATTTTGATGAAAAAGGACGTTCGCACTATAATCAAAAT
GTCACTTATGAAATCCTCCATCACAAAACTACTTAAAAAATAATACCCCT
ACAATCTAATACAAAATTTATACTCTTGAAAAAAGAATTGGTGAAAATGA
GGCTGTTTATGAACAGGGGTGGGGCCAGAGAGTAAAGTTTATTGTTTTAA
TCGTAGCGATAATATTTTACAGATCTTTACCCACTTAAAAAATATGACAG
ACTTTTAGAAGCGGTTCTTTTTATCTGCCACGCGGCTGAGTATCGTTTAT
AAAATAGCGCTCAATAAGAATCTCTTAAACAAAGGGATTTTGAATATAGC
ATGACACAACTTGAAACTTGTATCAATTTCTATGAAGATGATAAGACCCC
TTTTAACGAAAGGTCAAGCACATATACAGATAATTTGTTTTTGAAACTGC
TTGTAATATGTGAAAATCTCTTGAAACGGTTGACGCCCAGCTCCGCCCTC
CAACTAAACCACTAATGTTTTTCAACCCAAAGGTGTCGCATTTGTTTTTT
CTCATAACCAACTATCATTACTTAAAATTTTAAATATGTTCAAAAACTTC
AATTTCTATTCTAAATTAAAGCGTGTGGACCTCCTAAAGCCTCGAATCCT
TATTTGATCGTTGAAAACCATTGATTCTACCCATTTCCTATCCATTAGAA
AATTTATTAAAGTAAACCGCCTTGATAAACCTCGATAAAGTTTTTTGTGT
TTGTATTTTCAAATTACGTTGCACTATTAAAACTCGATCTCAGTTATAAA
TTGTTCAGCCTGCACACATTTCAACCATTTCGTCAAAAACTTTATGAAAG
GTGCCGAGAACTTCAAGGTTGAATGGCGTCAAATGTATTAGAACGCTCAC
TGGCGCACTAATCTGACGTTATCAGGCCTTGAAAAACTCGGTTCCAAACC
CCATTTAACGTTAGTGTTGAAAGTTGTATTTGAAAATCTCAGATATAGGG
ATTATCTGGTACCAGATGTGGAAATATGCTACGACACGCTTTGCTCTGAA
GGTCGGGCATATTGGCCCGCTCCTTCAGAGCTTTAGCGTGGGCGGCCGCC
AATACGCCATCGGAATATCAGATAAATATAGGGGTGAACCGAAATGCAAA
ATGATCACACTTTCCATTTAGTTTAATTGACCTTTCGTTGTTTTTGTTTT
TCACAGACTCGGCAGTTTCGACGACGACTCCTTCAAAATCGCGAAAAGAA
AGGACGGCATTTACAAAAGAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000265_pilon:326722..335192- >XLOC_033055 ID=XLOC_033055|Name=XLOC_033055|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1812bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000265_pilon:326722..335192- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTGATTAAAACATTGGATAATCAATTTGCCATCAATAGCATGTGTTC AACGTCGACAGGGGAAATGACTTTTCCAGTGCCCCCTCGATTGTCTCATT TACCTCAAGAAGTACTCAGTGGAAGTGACACACCACAACACTGTCACCAA CAGCCACAGTACAATCAATACCACGATCATTTGGCGATACCGAGCGCAAC AGGCATTCCATGCAACATCGTTGAATACACGTCATCGTTAGTGTCCCGTC AATACGCTTACGATCCAAGTACGTCGGATGTTCCATCGCCTCCCGAACGC AACATGTACAGCAGTGCAGATGATATCGGTGTAAACGGCTCCATTAGTTA CACGGCCGCTTTAACGCAAGACCAATCACCGCAACAACCACCCGCTACGC AATCGTTACCGTCACCCGAACATGCGACTTTACCTTCGACTACATCAGAT TCAGATCCTACAGTACACTCGACTACCGCTCCGCCACCCAACATGGCAAC TTACTTTGAAAACACTTACACAAGAACAATGTCTAGCATTTATTTACCGC CACCGCCGACTAGCTACCGACAGAACGATGGCATGTACCCTAGAGGTATA CCGGGGATGCAGCCATCGGATTATATGTCTCCCGAAGCTAGCGACACTTA CAAAAACTATATACGACCTTCTTACGAAAGTTATCTACATAGCGGAGGGG CAGAACAGGACGGCCAGGTTTCATCGGCCGGTTTAAGTTCACCCTTTTAT TCAGCACCAAATCCGTTCAGTCTGTATCGTAACGGTTTCAATAATGCGAC AGATTCGAATATGGCGTTCAATAACTCCTCAAAATTCGGTGATGGTGATT AAAACATTGGATAATCAATTTGCCATCAATAGCATGTGTTCAACGTCGAC AGGGGAAATGACTTTTCCAGTGCCCCCTCGATTGTCTCATTTACCTCAAG AAGTACTCAGTGGAAGTGACACACCACAACACTGTCACCAACAGCCACAG TACAATCAATACCACGATCATTTGGCGATACCGAGCGCAACAGGCATTCC ATGCAACATCGTTGAATACACGTCATCGTTAGTGTCCCGTCAATACGCTT ACGATCCAAGTACGTCGGATGTTCCATCGCCTCCCGAACGCAACATGTAC AGCAGTGCAGATGATATCGGTGTAAACGGCTCCATTAGTTACACGGCCGC TTTAACGCAAGACCAATCACCGCAACAACCACCCGCTACGCAATCGTTAC CGTCACCCGAACATGCGACTTTACCTTCGACTACATCAGATTCAGATCCT ACAGTACACTCGACTACCGCTCCGCCACCCAACATGGCAACTTACTTTGA AAACACTTACACAAGAACAATGTCTAGCATTTATTTACCGCCACCGCCGA CTAGCTACCGACAGAACGATGGCATGTACCCTAGAGGTATACCGGGGATG CAGCCATCGGATTATATGTCTCCCGAAGCTAGCGACACTTACAAAAACTA TATACGACCTTCTTACGAAAGTTATCTACATAGCGGAGGGGCAGAACAGG ACGGCCAGGTTTCATCGGCCGGTTTAAGTTCACCCTTTTATTCAGCACCA AATCCGTTCAGTCTGTATCGTAACGGTTTCAATAATGCGACAGATTCGAA TATGGCGTTCAATAACTCCTCAAAATTCGGTGACTCGGCAGTTTCGACGA CGACTCCTTCAAAATCGCGAAAAGAAAGGACGGCATTTACAAAAGACACT CGGCAGTTTCGACGACGACTCCTTCAAAATCGCGAAAAGAAAGGACGGCA TTTACAAAAGAC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000265_pilon | genome | sc0000265_pilon:326722..335192 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 844-906:64 |
| Aaloc | 1-840:8472 |
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