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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000257_pilon:507267..515272+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_032420 ID=XLOC_032420|Name=XLOC_032420|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8006bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000257_pilon:507267..515272+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACAGcgaattccttcaaaagaaaCAGGTAATTAGTaaacagaaaaat
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tcatgattctagattcttttcaactttttttaatgacTAGTATTAGAAAT
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caactatcgaattttttttgcgtcaatttcacttaccgtcgcctgatatc
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CAGTAGAATTAGGTTTTTACCTTGAAGGAAAATGACctgtggctgaaatt
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ATTTCCAAACCAGGCTCAAAAGATTAGCaaagcattaaaaaagtaactaa
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TAGTGTTTTATGCCTAAAAGAAGCCAGAGTTAATCCCCGGGGGGAatagg
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agtaccccccccccctgggagtTAATCTTTCCACAACTGCAGCATGCTAA
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TATTCTATGGTAATTATAGAACCATACAAGACATCAAAGTCAGCAAGGAT
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TTTTATAGCAGACATGTCTACATTATACGACGATTCGGAtattattttga
agcaaataggATGGTATGATCGGCTTcagtttccaaaaaaatcaaaggaT
AATTATGTGAAAGGAGCAGTTGATATTGCTCCAGAATACATAAACAGACT
TTCAGATAAAATCTTGAacaaagtttatgaaaaattccgaGATGACTTTG
AAGCTTTTGGGTATAAATTTGACATCAAAGAAATTAGGAAGGGTACTTTT
TATTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000257_pilon:507267..515272+ >XLOC_032420 ID=XLOC_032420|Name=XLOC_032420|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2298bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000257_pilon:507267..515272+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACAGcgaattccttcaaaagaaaCAGATGACAGcgaattccttcaaa
agaaaCAGattgATTGTCCTCTTTCTACTTGGTTTCGTGTTTGCTTTGCT
ATTTGTAAAAGattgATTGTCCTCTTTCTACTTGGTTTCGTGTTTGCTTT
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GACAACACCACCCCCAAATTTACCAGAACACCAAAGACAAGTATGACTAC
ATTAGACAACACCACCCCCAAACAGTGGTCAAAATAGCAAAGAATATCTT
CGAATTaaattcgaaagaaactcaGCAGCTGAAAACAGCAGTGGTCAAAA
TAGCAAAGAATATCTTCGAATTaaattcgaaagaaactcaGCAGCTGAAA
ACAGatgcaacaaaagaaatagaaaagaatgaaaagaaaatagaagaaaa
gataatagaagaaaagcaagaagaagaaaagcaagGAGCTGGAGATATGa
tgcaacaaaagaaatagaaaagaatgaaaagaaaatagaagaaaagataa
tagaagaaaagcaagaagaagaaaagcaagGAGCTGGAGATATGCTAGCG
CAAGATGACAGTTGGATAAAAATTCAACACCAAAGACAGCAAAGATTGAG
AGAATTTTGCGCTAAAaaggatttgaaaaaattacctAAACCAAAATATG
AACACAATTGGATCTACAGTGATAAAGCGAGGGTTTCTTATTGTTCAATA
CCGAAAGTGGCATGTACAacgtggaaaaaaatttttcagCTAGCGCAAGA
TGACAGTTGGATAAAAATTCAACACCAAAGACAGCAAAGATTGAGAGAAT
TTTGCGCTAAAaaggatttgaaaaaattacctAAACCAAAATATGAACAC
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AGTGGCATGTACAacgtggaaaaaaatttttcagGTATTCTATGGTAATT
ATAGAACCATACAAGACATCAAAGTCAGCAAGGATGATGTTCACGAACTC
AAGTACCAATATCACATGGGATTGAATATCTATaaagcaaatttaaaaac
cgAGCAGTATTTCAACTTCATCATTGTCAGGCATCCTTTAGAAAGATTGG
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GCAAGAATACAGAGCAGGCAAAGGAGTCACGTTTCATGAATACATCAACT
ACATAATCAAAACACCAATGAATAAAATTGATGAACATTTTGGGGGCATG
CAAGAGCTATGTCATATTTGTAACACAAAATATGATTTTATAGCAGACAT
GTCTACATTATACGACGATTCGGAtattattttgaagcaaataggATGGT
ATGATCGGCTTcagtttccaaaaaaatcaaaggaTAATTATGTGAAAGGA
GCAGTTGATATTGCTCCAGAATACATAAACAGACTTTCAGATAAAATCTT
GAacaaagtttatgaaaaattccgaGATGACTTTGAAGCTTTTGGGTATA
AATTTGACATCAAAGAAATTAGGAAGGGTACTTTTTATTAGGTATTCTAT
GGTAATTATAGAACCATACAAGACATCAAAGTCAGCAAGGATGATGTTCA
CGAACTCAAGTACCAATATCACATGGGATTGAATATCTATaaagcaaatt
taaaaaccgAGCAGTATTTCAACTTCATCATTGTCAGGCATCCTTTAGAA
AGATTGGTCTCGGGGTACAGAAATAAGATTGAAAAACCATttaatgcaaa
ttttcaaagaagGTTCGGTAGCTTAATGCTTCGTTTTAACCGTAATAATT
TAACCGAGCAAGAATACAGAGCAGGCAAAGGAGTCACGTTTCATGAATAC
ATCAACTACATAATCAAAACACCAATGAATAAAATTGATGAACATTTTGG
GGGCATGCAAGAGCTATGTCATATTTGTAACACAAAATATGATTTTATAG
CAGACATGTCTACATTATACGACGATTCGGAtattattttgaagcaaata
ggATGGTATGATCGGCTTcagtttccaaaaaaatcaaaggaTAATTATGT
GAAAGGAGCAGTTGATATTGCTCCAGAATACATAAACAGACTTTCAGATA
AAATCTTGAacaaagtttatgaaaaattccgaGATGACTTTGAAGCTTTT
GGGTATAAATTTGACATCAAAGAAATTAGGAAGGGTACTTTTTATTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000257_pilon | genome | sc0000257_pilon:507267..515272 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 493-1149:7350 |
| Aaloc | 298-492:4467 |
| Aaloc | 205-297:3650 |
| Aaloc | 139-201:3151 |
| Aaloc | 85-135:2527 |
| Aaloc | 31-81:876 |
| Aaloc | 1-27:1 |
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