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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000373_pilon:207286..214594- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_032059 ID=XLOC_032059|Name=XLOC_032059|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7309bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000373_pilon:207286..214594- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTAGAAAGAGACACAGAAGTCAGCATTTGCGTCAAATACCTTCTGTT
CTTCTTCAATGTTTTCTTCTGGGTAAGAATTTTCATTTTACTCAATCTTT
GTTGATGGTTTTTTTTACCAATAGTAAAAGCTCGCCGATAGTAAAAGTAG
CACAGTGCGTAACCATTTAGGCCCATTTAATGATATCGAAACTCATATAT
TTTAAGATTGTTGTCTTATTACGAGACCTTAAAAATGTATCAAGAGTTGA
CTAAGTTCGTATTTCATACTCAGAGTTTCATGGCGTCTCTGAGCCAATCT
TCAGTGAAATTGTAATTAGTTCCAAGTCTAGACTATAAAATATACACTAT
AGAATGCTGAATTATTTTGTTTTAGTTACTTGGTGGTTTCCTTTTGGGAG
TTGGACTATGGGCTCGCGTTGTATACGCACAAGAAAATGAATCTCTTGGC
TTATTCGGTGGTTGGCATTTAGATCCAGCTGTGCTTTTCATTATCGTGGG
TGTGATCATGTTTTTATTGGGGTTCTGTGGATGTATTGGTGCTTTGCGTG
AGAATATCTGCTTGCTCAAATTCGTAAGTTTTTCATTTGTTTCAAATGTG
ATTTCTCTACGCTATCACGAGGATTGAATTTAATTTACAAGTTTAAAAGT
GTTGAAATCTGCCATCATAGTATCCTTAAAAATACGTTAACAAGATTAGA
CACTTCCAATAAAACTCGACAAATTTTTATGGTCATTCTTCTTAATCTTA
ATGCAGAGAAAGTGCAAAGGGAAAAAATGATATTTAATTTTTTTTTATTA
TGATGATATATAAATGACTCTTTAGAAAATTTACAAAATGTCAGTTCCTG
TGGAAATCAATCCTATACAATATTTTGAGCTCCAAGGTTTGACTGATCTT
TGCTAAAGACAGTAGAAATAGATTTGAAAGGTGATGTTTTCCTTGTTTAC
TTTTAGTTTACGATTTCATTATCGATCATTTTCTTCACTCAACTTGCTGG
TGGAATCATTGGTTTTGTCTTCAGAGCTAAGGTAAAGTTTTCCGCATTTC
TTTATGGTTGTAATAACTCTAATAAATTCAACAGTATGCTGTTCTAAAGT
TTCTGTCCAGCTAGTTATTCTGTTACAGTTTTAATTTGATTTTTGCTTAG
GTAATTACATACTTCAATGAGCTATTGACGTTTTTAAACTCTTTAAGATT
GTACGCGGTAATTCAGAAACATTTTCAACATCAGGGAAAATTTATTACGA
AATTGATTTTCGATGAATAATTGCAGGTGAAAGAACTGGTCAAGACGAAG
TTACATGACACCATCGTCCACTATCGAGACAATGCAAACCTTCAAAATCT
CATCGATTTTTCACAAGAAACTGTAAGTTCAAAAGGGTATCTTTTGTTTC
AGAAAACAAACGAAAGCACAAAATAAAATGATGCGCTTTATTAAGAGCTT
GTTGCTCGAAGATCGCGAGACAGAAATTCAACGTCAAATCGAATACACGT
ATTTCTTATGGTAGATAGCAGATTCATGTAAAAAAGTTACACAAAAAGAC
GTAAAGTAAAGCTCTGATTGGCTGATCATTCTTTTTCAAAATGTCCAGAG
TATGAGGTAATCTTTGCATGTCTCAGTCAATTAATGCTTTACTCGACGTT
TTTTCGTGACTTTTTTATATGAATCGGTTTCGTGTTTTTCAATAAGAGCA
TCGAGAATTCACTCATTATCTGATAAATTTTTCACGCTGTCTTTTTTTAG
TTCAAATGCTGTGGTTTGGATAGCTACCAAGATTGGCAGCAAAATGCTTA
CTTCAATTGTACGCAGATTGGACCAGAAGCTTGTTCTGTACCTTACTCCT
GTTGCAAAACTGTAAGTTGATACACAGACCCGATGTCTACGGATAATTTC
AAAATTCATTGCTGTAGAGGATCTGTTGTCACATGGTTTCAGCCCCCCCC
TTAAAATAAGGGGTGATTTAAAATTTAGAGAAAAACACAAAGGGCAAAAA
TGTTAAAAACTGAGAAATAAGGGGGGACTTGGTCTCAAGGGTCAAATGGA
AGCCCTTGCTACTTGAGGGGGGAGTAATCTTGTTCCTTTCTGTTCCAACA
GCTGATATTTCTTCGTCACTTTTTTCATTTTTACCTCATTCTAAAATAAT
TTTGTTCCTGCTGTGTCCCGATCTTGCAAAGCATCTAAGGCTCCAATCAC
ATTTCAGCTATGGAATTTTCTATTTCGGTTCCTTGGGTGAATATCTGGGG
GTTTCATTTTTTGAAAATTTTGATTTTTGGTGCCTGGGGACAAGGCTAAA
ACTTTGGAGTAGCCTGGAGACTTGAAAAAGACTTCCAATATTTGGGGCCT
GGAACAAGTTTTTCACAACTGCTACAATTTGGGCCTCCAAAAAGTTTGAA
AAATGCTGAAGTTGAGCCCGGTGCGTTGCGCACGTTGGACTATACATTAC
TGATCCTAAATTATGAAAAATTTATTTTTATTTGACGGACCAACCGACCC
ATATTCTTGAAAAAATTTGCCCATAGAACAATTAATTAAATTGAAAATTG
AAATTGAAATTGAAAAAAATGTTTATCAAATTTGACAGAAATTTGTCACT
TTTGACTTTGAGCCAAAAAACCTGAGCCTGAAAACTTTGTCTGAAATTTT
TGTCAAAAATTCGAGTTTTTAAAGTTTTTTCCGGAGTTTTTTGCTGAAAA
TTTAGTGTCTGAATCGTCCGAATACATAATTTTCTTTGTATTTTTGTTCT
TTAAGCAGCTAAAAATTAAAATTTCCCTATATTAAAATTATAATAAAAAT
TTTCAGAAATGTTTTATTAACCTGATGTAACAGCTATAACTTAAAGGGCA
CCTCAAAACCATCTTTAAGCTTTAAGGGGGGATAAATTGATAAGGGGTGA
TTTGTGTTTTAAGGGGGGACTCAAAATCATGGATGAAACCATGTGTCATA
GTCTGGAGATCCATACTCTATTCAAACTCACACTACTTAAGTAAATCCCA
TCAAAAGCTACTCATTGAGAGTATGGTATTTTTGACCCAGTTTGAATTTG
TTTACATTTGGTTTGAATTTCGTGCCAAAAAAGCCGTTGATAACGTTAGC
CAATCAGGCTCGCGCACTTCCAATCAAAACAACAATAATATCACGTGATT
TCAACAATTGTTTAACAGCCAATAAAATTCTGCGACCAGATTTGGCATCT
TAAAAAATACCCGGCTACTCTGTTATTTCTATATTATTAGTACTAGTAAT
CGTATGGTTTGGAGTGCAATTAACGATTAATCACGAGTAACAAAGGAGAA
AAAAGTAATTTGCACGAGTCCGAAGGACGAGTGCAAATTACGGTATTTTC
TCCTTTGTTACGAGTGATTAATCGTTAATTGCACGACAAAACATACGATT
CCGAGGTAATCGTCAGTAAATAATCATTAGTAAATCATATACCGGGTGCA
CCAAAAAAAAGTATACAGGTTTGTCAAGATATTGTGAGCTTCAGGATTTA
AATTTTTTGTTCATTCTTTTTTTATCGTATAGAGGACGCTCTAACTTGAA
TCTTGAGCTATCATACATAAAGTTTGAAAAATTAGTTCGAAAATTATTTA
AAAAAAACTGACTTTTTTTTAATGTCGAAATTTCAAAAAATCATCAAAAA
CAGCAAGCAAACTTTTCTCTTGACACTTACCTTCTTTGCACATAAAAATA
CCAAAAAATGCAACCGTTTTCATCAAAACTCGTTACGGAATTTAGAAATA
TGGTAAAAAAAGCTATTCCCATGTGGAATGATATTTTTGGAAAAGCTAAA
AAAAAGTTTTGAAAATCTCAAAGAGAGGTTTCGATATTATGTGTGTGCTA
TGTGAGAAAACTTTTGAAAAGATAGATCACTATTCCTCGACTAGTTGCCC
AAAGAATTTGGGTCTGCATCGAGTTTGCTCGTGTTGGAAATGTTTCATGA
CTTGCAAATAAGATGGAGAAACTGTTGGTAAAATTTAAATAAGAAAAAAA
CCACCAAAAAAACAATAAAATTATGTTTTTGTCATCTTGTCTTATTGATA
GCTTGATTGCTGTTTTTAATGATTTTTTGAAATTTCGGCTTGGAAAAAAA
GTCAGTTTTTTAAAAATAACTTTCGAACTACTTGTTCAAATTTAATGTAT
GATAGCTCAAAATTCAAGTTAGAACATCCTCTATACGATAAAAAAAGAAT
GAACAAAAAATTTTAATCCTGAAGCTCACAATATCTCGATAAACCTGTAT
ACTTTTTTTTGGTGCACCCGGTATTTTTGTTAACATTCGAAAACCTCCTT
TTTTTCTTTTGTTTTTTCTTTCTTTTCAATTAAAAGAAGCTATTGTAACG
TAAAATTTCTTTGTTCTTTTTTATATTGAAGAAAAAAAATGTCTTTGTTT
TTATTATATAGTAAAAAAAAGTCTCTGGAGAGAAAAGAATAAGGGGACAA
AAGTGTCCCCCCGCCGAAGAGTGCAAAAAGTGGTAATAGTGCAATTAACG
ATTAATTGCACTCCTCTAAACCAATCAGATTCGAGTAATTTTGCACGGCT
GACGATTATTCGTTTTAATTAAATGCTATACTTCGAAATCACACGAACAG
AGTAGATGGGTACTCCCAGCTACTGTTTTCATTGTCTTTTCTGGTTTGAA
ATTCATCAAACTGAACCCTGTGATGGAGTGTGGGTGAGAGAGGGGAGACG
ACGAGAGAAGTTTTGCTATTTTTAAATCATACTTAATAGCAGAGAATTCC
TTACGGGAATTTTTATATCAAACAGACAATGCTCACAGAGTGTACTACGA
AACGATAAACGTGAGAGATACAGTCTGATACAACATCAACTCTTAAGGTC
ATTAAAAGTCTTAATGGATTTTCTAGTGCCCTCTAAGTATGTCTCTCCCT
TGGTATATACAAAATCAAAGTTTAATAAAGTTTTAAAAATTAAAATCGTA
GTTGTTTGACCTAGCAGATTTTATGATGAAAGGCTCTTTCTTTCGTTCAA
AACCTTACATTTTATTTTCTTGGATCTAGAGCAGAAATTGATTGAAGTCG
TATCAACTTAATTTTATTACCCTTGATCTATCTAGGACATGTTAAATACG
CAATGTGGATATGGTGTCAACAAAGCTTCAATGCCGGTAAACAAATTTGT
TTCATCTATTACAACTCTCGTTATTATTCTTCATCTCAAATGTTCCTGGG
TAGTTTTCTTAATTATTTGGTTTCTCTCAACAATCGTCATTGTCCTTTGC
TCGAACCCTGTTATTTTGGTACATTGTCGAAAGATCTGATATCATCTTAT
TATTTTGCCCGTGTTTACAATTTTACCACATCAAACAGGCTTCAATGAGG
TTCAAGCGGATATATACGGACGGATGTGTGGATGGGATCACCGGATGGTT
TTATGAACATATACAAGTTGTTGGAGGTTTAGCTGTCGGAGTAGCCGTCA
TGCAGGTCAGTGCTATTTGTTATTTCTTCTCTTCTATGAATAGACCTTTT
TTACTGCATCTCCTTCATAGATCAATAATGTAATTAAATTTGTTTTATTG
ATTTTTGGACCTACTTCGGAGGTCTTTTGATTTAATCTTCGTTCGTTCGT
TTGTCCGCGCTCGTTCTTCTGTTTGTCCGTTCGTTTGTTCGTCCGTCGTT
CTGATACTAGTTTTTCTGGAGCTTGGTTCATTAGGTTTTTTTTATGCACA
TAGATGCGAATTAGCAATACCCCAAAATATGACATAGTCCGATTTTTGAG
TAATTTTTTTTTCAGCCGAAAATGCTGGAAATATGCCCGAATTCGCGACT
TTTTCCATATATATTACTTTGTTTTTTTTGGACCTACCCCGGTGGGGTAG
AGGTCCTATAAATTAACCTGTGTTCGTTCGTCCGTTCGTTCGTCTGTTAC
AAACTTTTCTCAGGATTTAATCATAGAAATCCTTTGATTTTTGGTACAAA
GGTGCAAAATAGTGGTGGGAAAAATGTGACGGAGTCCGGTTTTCAAAAAA
AATTGGGGGGCAAATTTGGGCCAAAAAACGGATAAAAAACGGGTTTTTTG
GACTTTGAAAAATTGAATCATTAATTTTTTCAAAATGATTTTTTGTATGA
AAGTAGGGTACCATCAAAGGTAAAAGATGGCTCAAGAAGATTTTTGCAAA
AAATTTTGTTGGCTCAAATAAAACGCATGTTTATCTATAAGAATCACTAT
TAATAAGCATACATCAATGTTCTTAGTCAAATTACTCAATTTTTTTTATG
AACTGGACAAATTCGACATTTCTTTATAAGCACATTATCAATTACTTAGG
TATTAGCTTTTCTCGAGATTGGCTCTTTCAATCTTTATGATTTTTCGCAC
AAAGATGCATATCATAAACCCTCGAATGTGACAGAGCCCAATTTTCAAAA
AAAAAGATTTTGGGCAAATTTGGGCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGATTT
TTTGGATCATTAATTTTTTCTGATTTTTTGTTTGAAAGTAGGGTACCATC
ATAGGTAAAAGATGGCTCAAGAAGATTTTCGCAAAAAACGCATGTTTATC
TATAAGAATCGCTATTAATAAGCATACATCAATGTTCTTAGTCAAATTAC
TCAATAGTTTTTATGAGATAGATGTTTTTTTTTGCTCACGAAGTCTTGAA
TATATGATGCATAACTATAAACCCCCGAATGTGACGGAGCTCGATTTTTG
GGAAAAAATTTGTTGGGTAAATTTCAGCTAAAAAAACGGCTAAAAAAAGG
ATTTTTTGGACTTATTGGAATTATTGGATCATTGCTTTTTCCTGATTTTT
TGCATGAAAGTAGTTAAAAGATGGCTTAAGCTGATTTTTGTAGAAAAAAG
AATTTTTCAGCTCAAAAAACGCATCTTTATCTATAAGAATCACTATCAAT
AAGCATACATCTATGTTCTTAGCCAAATTACTGAATTTTTTGATGAGATT
GATATTTTTTTTTTTGCTCACGAAGTCTTGAATATAAAAAAATATTTCAA
GAGCATCAATAAAACTGATTTTTACACCCGGAACTTTCTGAAAATTGCCG
GAACAGCTGATTTTTTGCAGAAAGCGGTGGCTTTTTTATACTATAGTTAA
ATAAGCCCGAGTTTATAGGGATGAAATAGAATAAACTTTGCAATAGTCTA
GGTGCAGAAATTGTAGTCTCTTAGGCTAACTGTTTATTTTTACAGATCAT
TGTCATTGCGTTTGCTTCTTCAATGATCGCTGATGTTCGTCGACAGAAAG
CTAAATGGGAGACGCCAAGGAATCAATTCAATGAACCATTATATCCTCTC
AATATGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000373_pilon:207286..214594- >XLOC_032059 ID=XLOC_032059|Name=XLOC_032059|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1668bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000373_pilon:207286..214594- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTAGAAAGAGACACAGAAGTCAGCATTTGCGTCAAATACCTTCTGTT
CTTCTTCAATGTTTTCTTCTGGATGTTAGAAAGAGACACAGAAGTCAGCA
TTTGCGTCAAATACCTTCTGTTCTTCTTCAATGTTTTCTTCTGGTTACTT
GGTGGTTTCCTTTTGGGAGTTGGACTATGGGCTCGCGTTGTATACGCACA
AGAAAATGAATCTCTTGGCTTATTCGGTGGTTGGCATTTAGATCCAGCTG
TGCTTTTCATTATCGTGGGTGTGATCATGTTTTTATTGGGGTTCTGTGGA
TGTATTGGTGCTTTGCGTGAGAATATCTGCTTGCTCAAATTCTTACTTGG
TGGTTTCCTTTTGGGAGTTGGACTATGGGCTCGCGTTGTATACGCACAAG
AAAATGAATCTCTTGGCTTATTCGGTGGTTGGCATTTAGATCCAGCTGTG
CTTTTCATTATCGTGGGTGTGATCATGTTTTTATTGGGGTTCTGTGGATG
TATTGGTGCTTTGCGTGAGAATATCTGCTTGCTCAAATTCTTTACGATTT
CATTATCGATCATTTTCTTCACTCAACTTGCTGGTGGAATCATTGGTTTT
GTCTTCAGAGCTAAGTTTACGATTTCATTATCGATCATTTTCTTCACTCA
ACTTGCTGGTGGAATCATTGGTTTTGTCTTCAGAGCTAAGGTGAAAGAAC
TGGTCAAGACGAAGTTACATGACACCATCGTCCACTATCGAGACAATGCA
AACCTTCAAAATCTCATCGATTTTTCACAAGAAACTGTGAAAGAACTGGT
CAAGACGAAGTTACATGACACCATCGTCCACTATCGAGACAATGCAAACC
TTCAAAATCTCATCGATTTTTCACAAGAAACTTTCAAATGCTGTGGTTTG
GATAGCTACCAAGATTGGCAGCAAAATGCTTACTTCAATTGTACGCAGAT
TGGACCAGAAGCTTGTTCTGTACCTTACTCCTGTTGCAAAACTTTCAAAT
GCTGTGGTTTGGATAGCTACCAAGATTGGCAGCAAAATGCTTACTTCAAT
TGTACGCAGATTGGACCAGAAGCTTGTTCTGTACCTTACTCCTGTTGCAA
AACTGACATGTTAAATACGCAATGTGGATATGGTGTCAACAAAGCTTCAA
TGCCGGACATGTTAAATACGCAATGTGGATATGGTGTCAACAAAGCTTCA
ATGCCGGCTTCAATGAGGTTCAAGCGGATATATACGGACGGATGTGTGGA
TGGGATCACCGGATGGTTTTATGAACATATACAAGTTGTTGGAGGTTTAG
CTGTCGGAGTAGCCGTCATGCAGGCTTCAATGAGGTTCAAGCGGATATAT
ACGGACGGATGTGTGGATGGGATCACCGGATGGTTTTATGAACATATACA
AGTTGTTGGAGGTTTAGCTGTCGGAGTAGCCGTCATGCAGATCATTGTCA
TTGCGTTTGCTTCTTCAATGATCGCTGATGTTCGTCGACAGAAAGCTAAA
TGGGAGACGCCAAGGAATCAATTCAATGAACCATTATATCCTCTCAATAT
GTAAATCATTGTCATTGCGTTTGCTTCTTCAATGATCGCTGATGTTCGTC
GACAGAAAGCTAAATGGGAGACGCCAAGGAATCAATTCAATGAACCATTA
TATCCTCTCAATATGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000373_pilon | genome | sc0000373_pilon:207286..214594 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 721-834:115 |
| Aaloc | 604-720:1972 |
| Aaloc | 553-603:2225 |
| Aaloc | 442-552:5560 |
| Aaloc | 346-441:6034 |
| Aaloc | 271-345:6354 |
| Aaloc | 73-270:6935 |
| Aaloc | 1-72:7310 |
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