XLOC_031933 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_031933
Unique NameXLOC_031933
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000329_pilon:89594..102609-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_031933 ID=XLOC_031933|Name=XLOC_031933|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13016bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000329_pilon:89594..102609- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCTCGGCATATCACGTAGACAGATCTAACTCTTTTATAAAATATCACATC ATCCAGTATCCAACCAGGATTACTCCCGGTAGGATAAAGTTGGTGTGATA TTTCGGGACATTTGCGATCGTTATCCTAAAACAGCTATGTAATTTGTAAA ATATCAGTGGATGAAATTGATGGACCCCTCAAAGTGTTCGAAATTATGTT AAGTTTTAGAATTTTTAAAGGTTTCGAAGTTTGTTGAATATAATATGTTT CAGAGTTACATCAATGAGGATATTTTGTAAATGAAGTATTTTGTGGAGTA TGTAAAAATATTTTATTTTAATCGGCTTTTGGAAAAGTCCCAAGGCCAAG AGAGTTAAAAGTGAGAATATTTTGAGTCTATGTGAAAAATCGAAAATTAA AATAAGAAAGGAACCTTCTGTGCTCTGGAGGTGGAGTATGCACAATATTT GCATATTTATTTGGTTAACTTGAGCGCCCCAAGACTGTGTAATTGAATAG AGCTGCGAAAGAAAAAATCTGGTAGAATGTCTTTGGGGTGAAAATAGACT AGAATTGCAGATTTTATGCAATGAAGACTGCTGTAGCAGAAGATCTCTTA ATGTTAAAATGTGAAATTAAAATGAACAACAGATGAGATGGAGACACCCC CACAAAGGGGGTGCCTGGAGACAGGTGCGGATCCTGGAGTAAGCTCTCCT TGCCACTCTAGAGTCACCCACCAACCATCTCATCCTGGTAAATTTATTTC TGTAGTGCTGCAGCCACTACAGTGTGAACAAAAATAAAAATCGATTGATT GATTTGCTACTTGATTGATTGGCTACTTGATTGATTTGCTAATTGATTGA CAGGTTGGATGACATGCATCAAAGATGTTAAATCAAGAATTGATTTTATT AATTCTATTAATTCTAACTGTTATAAAATGGTTTTATAGGGGAGGTGTAG 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AAAAACATTAATTCTTCTTGGCGAAACCGTAAGAAATACTCAAACACAAC ACGGTGAGGTGGGATCCAACCCTCTGAAATACAAAACCTGGCATCACAAA GAAATATAATATTCCAGTTTTTGTTTTCTTGTAATTCTTGCAGCTTGAAC AGAAGATTGGTGTTCAGGTTTCCTGTCATCTGATTTGCCATCAAAAGCAA TGTTTTATCCGCATTTTTCGGCCCATTCATTGCTAGATAGGAGTGAAGGA AGTTGAAAACCAAAAATCACGGTTACATAAGTTGTTTTTTTATAAGAATT CTTTTAATAATAAGAATTGCAAGGCTCAAATTTGAAAAAAAAAATTGATA ATACACCTTTTCGACCGTAGTCGCGTGGCCAGGCGCGTGTCACTTATTTA TTTAATTATCCTCCTAAACTCGATCCAATCCTTTTTTGACACATTTTTCT ATTGTCTATAGGTTCGAAAAAAGGACTGGAACGGCTTTAGTGGGATAAAG CGGACAAAAATGCCCGCGCGGCAATTAGCGGCTACGGTCGAAAAGGTGTA TTACTTTTAAGGATTACTCGCAGTCACAAATTATTTTTACTTCATCATAA TGATGAAGATTCTCAACTTCAGTTGAGCTAGAATCTGAGAATGGGCTTTT CCAGAAAGAATTTTACCCTCACAGTTGAGGATATTGATTTTTCGAAGTAT CGAATCCCCTGGATATCCTACTTTATTAGTAAAAACCCCCGGGATATCTA CTCTAAAAATTATGCTCAACCCCCCTGGCCTGGATATCCTCTCTTATAAA CAGGCTTACCCCTGAAAACGTATTTTTTACTTGAAAAGACACTTTACCCC CTGGATATCCGCTCCTTTGTAGATATTTAACCCCCTGGATATCCACTTTT GTACAAAAATCGTTAACCCCCTGGATATCCGATATCCTCAACAGGGGGGG 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TCACTGGCAGTGTGAATGCCCTCATATCTCCACTCTTAAAAGTTTTTCCA TCTGGTGTTAGCAGTTCTTTGACAACTTGAAAATTTTCAAACAAAGTTTA TTGTGGACTTTTAAAACTGCTTTTACCGTATGACAACTTTCACATTTCCT CAAAATTTGGGATTTCTCATCTTGATTTGAATTGTCAAGAAGTTCATTAT CTAGTTAAAAGTTCAAGTTTTAGGTACTATTTAAAAATTATCAGATTATT ATTCTAAATTATTATTATTTTAGGTAAGCTAAAAATCAGAAATTGGACTG TTGGATGCATGGGAAAATAATGAGAATGTTTGTCAGTAATTTGCAGAGAG CACGATACCGAAATAAAATATTTGGCACAGCATCCTGATATATCTTTGAG ATTGAGACATAATATTTCAATCGACGTTCTGAATTTGACTGGAATATACT TACGTCCTGGTTGAGATTATAACTTGGAAATATTTCACTTCACGTCCTGG TTTAAATTTGGATTATAACTTGGAATATTTCACTTGACGTCCTGGTTTAT TTGGGCTTATAACTTGGGAATATTTTCACTTGACGTCCTGGTACAATTTT GAGATATAACTTGGAATATTTCACTTCACGTCGTGGTTTAATTTGGGATT GTAACTTGGATAATTTCTTGACGTCCTGGTACAATTTGAGATTATAACTT ACAATATTTCACTTGACGTCCTAGTTTGATTTGAAATTATAACTTATTTC ACTTGACGTCCTGGTACAATTTGAGATTATGATTTGGAATTAGGAATTTA CATCAGCCTTCTGGAATTAGTCGAGACTGTAATACAGTATTGTCGGAAGG CAGTTTAGAATCATTTGTTTATCATGATTGAATTACCTATTTATCAGTTT TTGTAAATAAGAAATTTAATGTCATTTAAATCTGCCTCAAGGTTTTTACT GATTGGTACTTTTCCATTTTTAAAGCTAATTTCTGGGGATTTCTTAACTT TTCTCCTATTTCATTCATCCTCATTTTTAATGTCTCTTTTTGGGTAGAAA GAAATTCAAGCTCAAATCAAAGCAAGATCAACATACTGCAAAGCTTACCA AGCTGGAACTTTTTTACTTTTTTTCCCTGCAAAAGTTATCATAAGATTTT CATCCACTACTGTAAATTTTTTATCAAACAGGAAAGTCACAAATTCGAGA TTGCAAGTATTTAAACTGTCAATGATTTGTATACATATCCTTTGTCTTTG AGCAAATGGTGGTGGGGAGAATATACTATAGCTTTTTATTTACATGGACT TTAATATATAAAAGGGGTAAATATAAGGATAAAATCCTCAGGCAAAAAAA CAACAAACAAACAAACTTACATGATTTGATGTTTTTTAAGAAATTTATAA CGTGAAAGTTTAGATAGATATCCTTGTTGCAAAGAAATTACAAAACTTAT TTAAACGAATGATTGTTTATAAAATTGTTTTCTAAGAAAGTGCGTTCTAA GAAAATATAAAAGGAATAAAAGGAAGAGGGTCTCCAAAGAGAACTAAAAT ATTCTTGGAATCCCTCTTTTATCTCAGTTTCTCTCCCGCCTCTTTTTTTT TGTTTTGATTTTTTCGAATACCGAACACAGTTGGCCTCGCATACGGAAAC TCGAATTCGTACGATTTGGGCAGTTTCTGTATTTTGTACCAAAATCGTAT AGTCTAAGACTGGCAACTCTACCGACTGTTAACTCTTTTCGGCAAAAAAA CCCGTTTGCGAATTTTCTTCGGCTTTGGGCTTTTTTCTTAGATAGTGATT CGTCTTAGACTATAACATAGTCTACTCAACCTATAAGATAAAGAATATGT ATCACAAATTTCCAATTTACTCACCTTTATGTAACAACTCATCTACAAAA CTCGAGATTTGTTGGTTTCTCGTTCTAATCATACTGAAATCCTTCCCAGG CCCCCTCCTTTCAGTCCCGGCCATCAATTTTTTCCAATCGTCATTGGTAC CCTTCCATCGGACCAACTTATTAACTTTGGGTGAGAAAAGGTTGAAGGTA TAATAAGCCTCATTATTGACCAAGTCGTCCAAATAGACCTTATCGGAGTT TTTTATTTTCTAAAAAAACGATGCATTGTGGGATTGTTTCGAGTGTATCA AAATAGAATTCCCTCGAGGAATTTCTAAGAGATCTCTATCGTAATACACT CGAAACAATCCCACAATGCATCGCTTTTTTAGAAAAATCAAAAACTCCGA TAAGGTCTATTGTGAAAGAAGATCACCGCCTTGTCAAACCATGAACATAT AAACGACTGGACATATATCTTTAATTGTCTCTTTGAAGCGAGCTTCGTTG CCGCCTGTATTTCAAAATTGCTATAAAAATCCGACAATATTCCGTCGTAA TTTTATTTCTTTGAATTGTTTAGGTAAAATGATTGATAGAGCTTGAATAT TACTCCTAATGCACAAAAAAATTATTTTTCAAATTTTTTCACAGTTTGCA TATATATTTTATCAACATTTTCAACTCTGAAATGCAGAATTTCAACTGCG TGTATACTTTTGAATCCCTTTTGTCACTGCAATAATTTTTTTTATGACTT GAAAAAAATAGCTTGCCAAAGTTTAGAACCTGTGTAATAAGAATATCGAA ATTAGAATGTGACACTTTCTGAAATTATTAGACACTTTTAAGTCAACATT TGAAAATATTAGTCGGAGTTTTGACAAGCTGACGATGATTTTGCCTCTGT TAACTTTGTTATGATATAGATAAAAGACTTGAGAAAAGTAGAACAACAAA GACTTTTGTCGAAATTTTGACGTTGTTAGCAAGGTATTCCCAGGAGGTAT 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ATCTAAATTTTCTAAATTAATAAGACTTTCTAAATTGATACATCAAAATT TATGACTGTTTTTATACAAAACATTGGAGTGGAAAATTAAAATTTTTTAA AGATTTTGAGACAAGAAAGCCAACAGAAAATTTTCCGAAAATCTACTTTT AGTTCCAACTGGGCCATTCCATTAAATTTCTATACAGTGGGGTGGCCGAA CCTTTTCAAGTCAAAAATGGCAAAATTTCAAAAAGCCTTAGAAAATTTGT CTCTTCGTCATCAATTTGATTTATGGTGATTTTAAAATTTTCATTTCCAG GAATAATTTTCCTAACAAAATAATTTATGCTATTGCTAAATTAGCAATTT ACAATAAGTGCAAATGTGAGAAATTCACTATGTTTAGAGATCTCAAACAC CAATCAATTCTACGATATGCTTGATTGAAACACACATTGGTATCTTTCTC CGGGTTAAGACAAACCGGGATTAAACTTCCTTTCCATATGAGACTAATAA TGTTTCCAGACAAACTTTATTAAAATGAACAAGGAAGGAAGGGGGCAAAA TATTTTTTCTCATTTTTGTTTAAAAAAAAAAACCGAAAGGATAGTTCCTG ATTGACGATCGGCAATTGTTTCTCGTTTCAGGTTTTCAAAGACCGATTTA CATTTTGAAGAAGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000329_pilon:89594..102609-

>XLOC_031933 ID=XLOC_031933|Name=XLOC_031933|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2052bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000329_pilon:89594..102609- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTGTAAAAGAAACACAAAAAAGAAGTTCCGTAGAGACAACACATGC
TTCGTCAAAAAAACAAAAGACTGACACAACACCAACACAGATCACCAAAC
AGAAGATCTTTCAATATGGAAATTATAACCGTTACTATGGCTATCGAAAT
GCGAACAAAGAGAAAGACAAACGAATTGATGTTTTCAAATGTGAATGGTT
TGAAGGAAAGTCTTGTTTGGATATTGGTTGCAATGTTGGCCATCTGACTT
TATGGATTGCGAAATATTTCAAAGTTGGAAAGATGAAAGGAGTGGATATT
GATTGCCATTTGATACAAGCTGCCAAAAATAACATTTCACATTATACCCT
TGATGATAATGAAGATGTTGAAAATAATGACAATGAACAATCAAACAACT
GCGAAAAATCTGAAAGCTGTGGAAATTCGGATAATACAAAAGCAGAATTC
TTTAGCCATGATAGGAATTGTATAAATCCATCTAGTGTTGAAACTGAAAG
TGATAAATTAAAGAACAATGATATTAATGAAAAAGAAACTTTGGAAAAAA
GCAACAGTCCAAATGAAACGAAACCGGGCAGTGAAAAATGTATAAAAGAC
ATAAATATGGATGATGAGTTTCCAAACAACGTGACATTCGTCACAATGAG
TGTAAAAGAAACACAAAAAAGAAGTTCCGTAGAGACAACACATGCTTCGT
CAAAAAAACAAAAGACTGACACAACACCAACACAGATCACCAAACAGAAG
ATCTTTCAATATGGAAATTATAACCGTTACTATGGCTATCGAAATGCGAA
CAAAGAGAAAGACAAACGAATTGATGTTTTCAAATGTGAATGGTTTGAAG
GAAAGTCTTGTTTGGATATTGGTTGCAATGTTGGCCATCTGACTTTATGG
ATTGCGAAATATTTCAAAGTTGGAAAGATGAAAGGAGTGGATATTGATTG
CCATTTGATACAAGCTGCCAAAAATAACATTTCACATTATACCCTTGATG
ATAATGAAGATGTTGAAAATAATGACAATGAACAATCAAACAACTGCGAA
AAATCTGAAAGCTGTGGAAATTCGGATAATACAAAAGCAGAATTCTTTAG
CCATGATAGGAATTGTATAAATCCATCTAGTGTTGAAACTGAAAGTGATA
AATTAAAGAACAATGATATTAATGAAAAAGAAACTTTGGAAAAAAGCAAC
AGTCCAAATGAAACGAAACCGGGCAGTGAAAAATGTATAAAAGACATAAA
TATGGATGATGAGTTTCCAAACAACGTGACATTCGTCACAGAAAACATAG
TACCAGCATCTGATAACGTATTGAAATACACCAAACCTCAATATGACGTC
ATCATGTGTCTCAGTGTTACCAAATGGGTACAACTCAATGAAGGAAAACA
TAGTACCAGCATCTGATAACGTATTGAAATACACCAAACCTCAATATGAC
GTCATCATGTGTCTCAGTGTTACCAAATGGGTACAACTCAATGAAGGAGA
TGATGGTTTGAAACGATTATTCAAGAAGATATACAAATTATTGAATGAAG
GAGGAATGTTCATCTTGGAGCCTCAACCTTTCCCTGGCTACAAACGAAGG
AAAAATCTGACGGAGATGATGGTTTGAAACGATTATTCAAGAAGATATAC
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TGGCTACAAACGAAGGAAAAATCTGACGCCCATCATTTGCAAGAACTTTG
ACAATATGAAGTTCTATCCGGCCAAATTCATCGATTATTTGCTTTCCGAC
GAAGTGGGATTCAAAAGCGCGGAACCAATCGAAACTACGAACCATGACAA
AGAAGCCCATCATTTGCAAGAACTTTGACAATATGAAGTTCTATCCGGCC
AAATTCATCGATTATTTGCTTTCCGACGAAGTGGGATTCAAAAGCGCGGA
ACCAATCGAAACTACGAACCATGACAAAGAAGGTTTTCAAAGACCGATTT
ACATTTTGAAGAAGTAAGTTTTCAAAGACCGATTTACATTTTGAAGAAGT
AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_031933XLOC_031933-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000329_pilongenomesc0000329_pilon:89594..102609 -
Properties
Property NameValue
Aaloc994-1026:34
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Aaloc1-411:13017