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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000253_pilon:332842..346993+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_031832 ID=XLOC_031832|Name=XLOC_031832|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14152bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000253_pilon:332842..346993+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ttttctcaaatttcagtTGATGGTAATTACACGGAATGGTCATCATGGGG
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GTTCCATACAAAAGGATCGGTTGTTTCAGAAACCATCCAGCAAACGGAGA
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GCCCCAGACTGTATTCTAAGAACTTCTCATAATTCCTCTCGCTTTTCGAT
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GTGGCCACCCTCTAGCTCAATATGGCGGAAAAGAATGTGAAGGACCTGTA
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TTTAAAGCGATCTCGCTCACTGTAGCAAAATTATTTGTAACTTGGTATAT
GTGTAAGTAAGTCTAATCTTTGTACCATCCGGTGATGTCGTCTTTTTATC
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ACCCGAAAAggcttttttgataaattattttgataaatgttACTTCCCAT
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TGCAAATCTTACCAAAGGAGATTCGATTCGACATTATAGCCTTTGGTACG
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GACGGCGGTTTATCCGAATGGACATCTTGGTCAACCTGTGACGTCACTTG
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TAAAAGTTCGTTCGTttccctaaaaatttgacgagTTTCACATGTTGTCc
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TCGCAGCAAAGATTGGTTGCCGATGCCTCTTTTAGGCAGTTTTTTACTAA
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TTTTACATGTACCCGAACCATGTTATATAATGTCTCTAACAGGTACAAGA
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AATAATTCAGGAAAACCTTGCTCCGGTGGAAATAACACAAATTTTGTCTA
TGTTTTGGAAGGTAAGAAAGGTTCTTCAGAATGGCAGTTAACAAAAAGAT
TGTAAATATTGAAAGGTGAATATGTTGAAAATTGAGATGAAATAAAAAAG
CCCTGAAAGGCTAAACATCTTATCTACTTCTGTCATAAAATTATAAACTC
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taattaattaattttcacCCCACCTTTTTTACAGAGAGACCGCGTGACGG
TAATTTTAGCCAATGGTCATCGTGGAGTAATTGTTCAGTGACGTGCGGTA
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GGTGGGAAGACATGTGAAGAATTGAACCTTGGAAATAAAGAAGAAGTCAC
CAGTTGCACATTGCAAAGTTGTCCTGGTAGGTTTGAATTAATATGCAGCT
ATATCCAAAAATATTAGAACGATTCTAATTAGATCTACTTGTTTTCTGGT
AAAGAGCGCTTTGCACTACAGAGATTACATTTATCCGTCCATCCGAAACT
ATTGCTTGGATTACTGTTATCAAAAAGGTAACTTATATTAATCaaaaaaa
TAGTCCGAGTCACTTTTTGAGCCGCGTTTCGTCTTGCCAGAGACTTCCTa
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agtGGATTGTGCTTTCACGGACTGGTCTGATTGGTCAGTTTGCAGTGTCA
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AATAAACGTAATCGCTAAGATTTAAAACGACATCAATGTAACAAGGATTT
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GAGTGGAGTGAATGGGCGTGGTGGAGCGCCACCTGTGGATCTGCCTCACG
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ttttcattttcacagaAGATGGGAACTGGGGCGAATGGTCACCATGGAGC
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TAATAATCCTTCGCCTAAGAGTGGTGGACAAGTGTGTATAGGGGCTAATG
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TTATAACTCGAGTTTTTTCCTTATTCGAAGAGAAGTCTTcgtccttgaaa
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AAAAACTTTGATCAACCTTTTAAGTAGTAATTACCACTAATTTTTACACC
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TGATCATTCACCGGAATTTTTCTACAGCAACCGTTTTCTAATCTAATAGT
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TGCTGTACTTCTTAGTGTGCTTGACTCAAAATCAATCAGTTCTTTTTTAG
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ATAAATAATAGCTCATGCACATTTCTACTTTTAACTTGAGTTTTTCTGAT
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ATCACAAGAACGTTCCCGAGAGGACAACAACCCACCGGCAGCTTTCGGTG
GCGCTGTTTGTAATGAAACGTTATTTGAGAATCGGACCTGCTTTTTACAG
CCTTGCCCAAGTAAGATattcttctttcaaatttcTCGAAGTTTAACGCG
ACCTGAGCCCTTTCGTCTACCTCCAAGAAGCGATATGAGTTACTTCTCCT
TTTACAACTCAatattttcagtgtttttaCGTTGCTTAACCGTTGAATTG
AGCCATAACGTGCTTTTAAACAGTACACAATATCTATTTCAAGGgatttt
tatttacctttccatTTTGATTTACTCAACCTAAGAAATATCTCTTACTC
CCTTTCACAAATGTTCTTTATCTTACAGTTCCAGGGAACTGGGGCCCATG
GACAGCTTATACCACGTGTTCAGTGTCGTGTGGAGAGGGTGTTATGAATA
GAACAAGAGAGTGCAATAACCCGTCGCCAGCGTATGGAGGTGCACCTTGT
CCTGGAAACGATACCGAAATGCAGAAATGTCAAGAAGGACCTTGCCCAAG
TATGTACTTTCATTTTCTAAACATGCTGTGAAGTTATTCTAACGGAGTAA
TGATCGAATTGTCGAGGTTTCAGCGCCTCAAATCAGAGATCGTGGTACGA
ATTCTCGCTTCTTTCGATGTCCCGTTTAGTTCTTAGATATTCGAACGGAC
TGTAGAccatgtgaaaaaaaaacaatcgaaaaccaCCACTTTAGATATCC
TTATTTCTTTAAGACACATGTCCTTAAGAatatctgaaaaatttcatttt
tatttttcccagTTGACGGTAACTGGAGTGAATGGACGGCGTGGACGGGT
TGTTCCGTATCTTGCGGTTACGGATCACGTGACCGGGAACGTCAATGCAA
TAATCCGGAACCACAAAATGGCGGGAAGAGCTGTGAAGGGGAAAGCAAAC
AAAACATCGATTGTATACTACAGAACTGCACTTGTAAGTTTTATTCTGTC
ttgattattttgttctttGTCCGTAAAAGAAAGCAAAACATTCGGAAATA
GGAATTTATGTGGGATATTAACACGACATTTGATAtgcgaatgttttttt
ttcataatagcTCAACCAAAATAAACTATTTACATTGATTTCTTTTCGGT
TCGCAGAATATTATACTGAAAATTAACTCAGCGCTTATTTTTCTCGTTTC
TAGACCCACCAAGTGAATGGGGACCTTGGGGACCCTGTCTACCGGCATGC
GGCCCTGGAGTGCGTCAGCGATCACGCGATTGCCCGAAATCGCCATGTCA
CGGTGATCTGGTTGAAACAGAAGAATGTGAAAATCGACCATGTCCTATAC
GT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000253_pilon:332842..346993+ >XLOC_031832 ID=XLOC_031832|Name=XLOC_031832|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=10146bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000253_pilon:332842..346993+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ttttctcaaatttcagtTGATGGTAATTACACGGAATGGTCATCATGGGG TGTTTGTTCGACCACGTGTGGCAATGGAACACGTGTTCGTTCGCGCATGT GCAGTAACCCTAAGCCAATGTACGGTGGCAAAGATTGCCAACACTATGGA GAACCTGAAGAAATTGGTGCATGTCCTGATCAAAAACCATGCCCTAtttt ctcaaatttcagtTGATGGTAATTACACGGAATGGTCATCATGGGGTGTT TGTTCGACCACGTGTGGCAATGGAACACGTGTTCGTTCGCGCATGTGCAG TAACCCTAAGCCAATGTACGGTGGCAAAGATTGCCAACACTATGGAGAAC CTGAAGAAATTGGTGCATGTCCTGATCAAAAACCATGCCCTATCAATGGA ACCTGGACCCCATGGTCACCTTGGTCGAATTGTTCACGCCCGTGCGGTGA AGGTGTTCGCACGCGCGTTCGCCAATGTATTGAACCTCAGTATGGTGGAT ATCCTTGTGAAGGTGTTGCTGTTGAAAATATCTTCTGTAAAATGAGAGAT TGTTTCAATGGAACCTGGACCCCATGGTCACCTTGGTCGAATTGTTCACG CCCGTGCGGTGAAGGTGTTCGCACGCGCGTTCGCCAATGTATTGAACCTC AGTATGGTGGATATCCTTGTGAAGGTGTTGCTGTTGAAAATATCTTCTGT AAAATGAGAGATTGTTGTGATGTTCCATACAAAAGGATCGGTTGTTTCAG AAACCATCCAGCAAACGGAGATATAGGCGAAGGAATCCCTCCAGCTTTCC AAGAACAGCTATTCCAAGAAGATAAAACGATATATTTGAGAGAACATGAT CTGACTGATGTTATGGATGACATCATTTGCAGGTGATGTTCCATACAAAA GGATCGGTTGTTTCAGAAACCATCCAGCAAACGGAGATATAGGCGAAGGA ATCCCTCCAGCTTTCCAAGAACAGCTATTCCAAGAAGATAAAACGATATA TTTGAGAGAACATGATCTGACTGATGTTATGGATGACATCATTTGCAGGT GTGCCAAAGCAAGTTTAGCTAAGAAGTATACTCACTTTGCGATGCAAGAT TTCTCTTCCTGTTGGTCTGGTCAGAACGTTGCTCAAACCTACAACAGATA CGGCGCCGAGATTAATTTTACACCAAAACCAAACCCCTTTCTACCTCCAC CACCAAGTTCGGAACCAGTTGCGCCATCCAAGGGATGTATGAATGGTCAT TCAGAAAAATGTGGAGAAAAAACATTGAATTGTCTTGGAATGCATGATAC AAACTTTGTTTATGGCTTGGAAGATgGTGTGCCAAAGCAAGTTTAGCTAA GAAGTATACTCACTTTGCGATGCAAGATTTCTCTTCCTGTTGGTCTGGTC AGAACGTTGCTCAAACCTACAACAGATACGGCGCCGAGATTAATTTTACA CCAAAACCAAACCCCTTTCTACCTCCACCACCAAGTTCGGAACCAGTTGC GCCATCCAAGGGATGTATGAATGGTCATTCAGAAAAATGTGGAGAAAAAA CATTGAATTGTCTTGGAATGCATGATACAAACTTTGTTTATGGCTTGGAA GATgTTACACCAGTCCATTGTAACTATAGTGAATGGAGTCAATGGGCACC GTGTACAATTACTTGTGGTACAAATGGTCTAACTTCACGCATGCGTGAAC CAAATAATCCATCGGCATCATTCGGAGGAGAAGATTGTTCACGTCTTGGA CCAGCTACCGAAcagaaaaattgtccaaatattCCTTGCCCAATTACACC AGTCCATTGTAACTATAGTGAATGGAGTCAATGGGCACCGTGTACAATTA CTTGTGGTACAAATGGTCTAACTTCACGCATGCGTGAACCAAATAATCCA TCGGCATCATTCGGAGGAGAAGATTGTTCACGTCTTGGACCAGCTACCGA AcagaaaaattgtccaaatattCCTTGCCCAATTGATGGCATCTGGAGTC CATGGACATCTTTCAGTAATTGCTCAGTCACTGTGGGTGAGGGTGTACGT GTGAGGGAACGCTTCTGCACTCCACCGCAGTACGGAGGTCGACCATGCCC AGGAGAAGCCAAACAAACGGAGAGTTGCACTATTGCCCCTCCACCAGTTG ATGGCATCTGGAGTCCATGGACATCTTTCAGTAATTGCTCAGTCACTGTG GGTGAGGGTGTACGTGTGAGGGAACGCTTCTGCACTCCACCGCAGTACGG AGGTCGACCATGCCCAGGAGAAGCCAAACAAACGGAGAGTTGCACTATTG CCCCTCCACCAGTCGATTGCGGCTTCACTGAATGGTCTGAGTGGGGTGCT TGCGATAAAACATGCGGTGAAGGGAAACAAGAACGCCATCGAGAAGGTGG CCACCCTCTAGCTCAATATGGCGGAAAAGAATGTGAAGGACCTGTATCAG AAGTTCAAGAATGCTCAACTAATGTTCCGTGCCTCGATTGCGGCTTCACT GAATGGTCTGAGTGGGGTGCTTGCGATAAAACATGCGGTGAAGGGAAACA 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AATTTTGTCTATGTTTTGGAAGAGAGACCGCGTGACGGTAATTTTAGCCA ATGGTCATCGTGGAGTAATTGTTCAGTGACGTGCGGTACTGGATCCCGTA CCAGGTACCGAACATGTACGAACCCGTCACCCGCGTTCGGTGGGAAGACA TGTGAAGAATTGAACCTTGGAAATAAAGAAGAAGTCACCAGTTGCACATT GCAAAGTTGTCCTGAGAGACCGCGTGACGGTAATTTTAGCCAATGGTCAT CGTGGAGTAATTGTTCAGTGACGTGCGGTACTGGATCCCGTACCAGGTAC CGAACATGTACGAACCCGTCACCCGCGTTCGGTGGGAAGACATGTGAAGA ATTGAACCTTGGAAATAAAGAAGAAGTCACCAGTTGCACATTGCAAAGTT GTCCTGtGGATTGTGCTTTCACGGACTGGTCTGATTGGTCAGTTTGCAGT GTCACGTGTGGTTCAGGAACAAAAGACCGCCAACGAACGCCCACAAATCC ACCCGCATCGAATGGCGGGAAAAATTGTTCCCGTGATGCATTGCAAACGG TTCCATGTGAACTACCTTTATGTCCAGtGGATTGTGCTTTCACGGACTGG TCTGATTGGTCAGTTTGCAGTGTCACGTGTGGTTCAGGAACAAAAGACCG CCAACGAACGCCCACAAATCCACCCGCATCGAATGGCGGGAAAAATTGTT CCCGTGATGCATTGCAAACGGTTCCATGTGAACTACCTTTATGTCCAGTT GACGGTGGTTACAGTGAGTGGAGTGAATGGGCGTGGTGGAGCGCCACCTG TGGATCTGCCTCACGCACTCGGTTACGCTATTGTAATAACCCTTCACCAA GCTCTGGTGGCGCGCCTTGTTCCGGAAGTGCACACGATGTCGATTCGCAA AACCTGGGAGAATGTAAAGTTGACGGTGGTTACAGTGAGTGGAGTGAATG 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ACGGGATAACGACGCGTGAACGAAATTGTTCATCCTCAGCCGGTTGTCCT TTAAACGAAAACCCAGGGACGTTCGCAACTACTGAAAAGTCGGCAGAAGT CTGCAGAATGCCGCCTTGTTCAGGTTGGGCATCATGGAATGAGTGGTCGC AATGTTCAGTTACTTGTGGTGACGGGATAACGACGCGTGAACGAAATTGT TCATCCTCAGCCGGTTGTCCTTTAAACGAAAACCCAGGGACGTTCGCAAC TACTGAAAAGTCGGCAGAAGTCTGCAGAATGCCGCCTTGTTCAGTTCTCG AACCTGATATGGAGCCACTTTTCCCATGGGGTTCATGGAGCGCTTGTTCT TCTACGTGTGGCGTAGGAGAGAAACATCGCTCAAGAAACTGTACACAAGC AAACAGCCAAAATCTCGTCTGTCCATGCCCGAAAATGGAATCCATCAAAT GTGACCAAGGTCCCTGTCCAATTCTCGAACCTGATATGGAGCCACTTTTC CCATGGGGTTCATGGAGCGCTTGTTCTTCTACGTGTGGCGTAGGAGAGAA ACATCGCTCAAGAAACTGTACACAAGCAAACAGCCAAAATCTCGTCTGTC CATGCCCGAAAATGGAATCCATCAAATGTGACCAAGGTCCCTGTCCAATC GACGGTTCATGGGGCCAATGGACGGCATTTACTGACTGTTCAACGACGTG CGGGTCAGGCACCATTTCCAGACAACGCCAATGTGATTCACCCTCACCTA AGAATGGAGGGAAAAATTGTGCTGGTAAATCAACTGAGAATCGAAATTGT AATTGCTTCAGAGAATGCCCAGTCGACGGTTCATGGGGCCAATGGACGGC ATTTACTGACTGTTCAACGACGTGCGGGTCAGGCACCATTTCCAGACAAC GCCAATGTGATTCACCCTCACCTAAGAATGGAGGGAAAAATTGTGCTGGT AAATCAACTGAGAATCGAAATTGTAATTGCTTCAGAGAATGCCCAGtgaa tGGTAATTTTACTGACTGGTCACCATGGAGCTTGTGCGATAAAACGTGTG GACCAGGGAATCGTGCACGAAGTCGCTCCTGTACCAATCCATCACCAAAG TTCGGTGGAGCTCCTTGTCAAGGCAATACTACAGATCTGCAAGAATGTAA AGTCGTGGATTGCCCTGtgaatGGTAATTTTACTGACTGGTCACCATGGA GCTTGTGCGATAAAACGTGTGGACCAGGGAATCGTGCACGAAGTCGCTCC TGTACCAATCCATCACCAAAGTTCGGTGGAGCTCCTTGTCAAGGCAATAC TACAGATCTGCAAGAATGTAAAGTCGTGGATTGCCCTGTGGACTGTCTAC TGGACGAATGGAGCGCCTGGTCACAGTGTAGTGTGGATTGTTATTACGGC AAACAGATCAGAGAGAGGAAGATCATTCAAGAAGCTGCTTTTAATGGAAC ACAGTGTGCTGGTGATCGAAACCAAACAAGAAATTGTTATATAGAATGCT TGGACTGTCTACTGGACGAATGGAGCGCCTGGTCACAGTGTAGTGTGGAT TGTTATTACGGCAAACAGATCAGAGAGAGGAAGATCATTCAAGAAGCTGC TTTTAATGGAACACAGTGTGCTGGTGATCGAAACCAAACAAGAAATTGTT ATATAGAATGCTGTAAGACGGACTATCAACGCAAAGGATGTTTCCAAGAA CGTCCGGAATCCACATCCAATTTCAAATTCGATGCACCACGCgttctttt caaccaatcagcagAAGCCAGAACCCGATATTCCGATTGGAATACTTATA TGCCCGAATTGGTTTGCAAATGTGCAGAAGAAGCGAAGAAAGAGAAATTC TCACATTTTGCCATTAGAGATCTTGGCGTTTGTGTTTCCAGCTCCACCGT 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CGTGTTCAGTGTCGTGTGGAGAGGGTGTTATGAATAGAACAAGAGAGTGC AATAACCCGTCGCCAGCGTATGGAGGTGCACCTTGTCCTGGAAACGATAC CGAAATGCAGAAATGTCAAGAAGGACCTTGCCCAATTCCAGGGAACTGGG GCCCATGGACAGCTTATACCACGTGTTCAGTGTCGTGTGGAGAGGGTGTT ATGAATAGAACAAGAGAGTGCAATAACCCGTCGCCAGCGTATGGAGGTGC ACCTTGTCCTGGAAACGATACCGAAATGCAGAAATGTCAAGAAGGACCTT GCCCAATTGACGGTAACTGGAGTGAATGGACGGCGTGGACGGGTTGTTCC GTATCTTGCGGTTACGGATCACGTGACCGGGAACGTCAATGCAATAATCC GGAACCACAAAATGGCGGGAAGAGCTGTGAAGGGGAAAGCAAACAAAACA TCGATTGTATACTACAGAACTGCACTTTTGACGGTAACTGGAGTGAATGG ACGGCGTGGACGGGTTGTTCCGTATCTTGCGGTTACGGATCACGTGACCG GGAACGTCAATGCAATAATCCGGAACCACAAAATGGCGGGAAGAGCTGTG AAGGGGAAAGCAAACAAAACATCGATTGTATACTACAGAACTGCACTTAC CCACCAAGTGAATGGGGACCTTGGGGACCCTGTCTACCGGCATGCGGCCC TGGAGTGCGTCAGCGATCACGCGATTGCCCGAAATCGCCATGTCACGGTG ATCTGGTTGAAACAGAAGAATGTGAAAATCGACCATGTCCTATACGTACC CACCAAGTGAATGGGGACCTTGGGGACCCTGTCTACCGGCATGCGGCCCT GGAGTGCGTCAGCGATCACGCGATTGCCCGAAATCGCCATGTCACGGTGA TCTGGTTGAAACAGAAGAATGTGAAAATCGACCATGTCCTATACGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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Properties
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| Aaloc | 3127-3150:8567 |
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| Aaloc | 1-195:1 |
|