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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000112_pilon:1064981..1071447+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_031570 ID=XLOC_031570|Name=XLOC_031570|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6467bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:1064981..1071447+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTATTCAATAGACGTCATGTTCCCCTAAGTCCCCAAGTCATTCCTTTTTG
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CCTCTTCTAAGTGATAGAGTATGAAAacagttggcagttaaaatctaaAC
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TTGAAAATACCACGAAAAAGGTAAAATTgcagcaaaaaaattttaaggtc
tatacccagctgacacacaacgttgtttccaCGTTCATCTAaagttatat
ggatgttgtgaacgttagatgaacatcGAAACAGCGTTGTGTTTCAGCTG
GGTAATATCCTAAGGTCCATAAGAGAGTCGAAGAGAATACGTAGCTTCTC
AATATCAAGATACAATTAATCTTAGATATCGTAAGGCTgaagttgaattt
gaaatggAATTATATATAATTGCCAGTAAAATTTAAGGCAATATCATTAA
TGTGTCTGCACAGTGGCCTGCGAATTAGTAAGATTATATTATTTAAAATC
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GAATTGAATTCAATAAATATGACCAGGTAATAcgaggaaaataaaagaat
tttatattaccgttagttgttttttttaggTGATTGATAGAAGAAAAGCT
GCAATACCTCAAAATTTCATGATCAAAATTTAAGGTTTTTTCAGCATCAA
TAAATTTCAAAGGGAACCCCCTAGAGAAGGATGCTTTTTTCCATGGAATT
GAATAGCCTGGTTAATCAAGCTCAAACTCGCTTTGCTAAGAAGTAACCTT
GAGTTATTGAGTTCTCAGAAATTCTCCAGCAAACCAGTATGATTGACATT
CCATCTTTTCTTACTAGGAACACAATATACGTAAAAACTTCGTGGCAGCT
TTGGAAAAACGATTTCCTGATTCAGGGCTGAAATATTCAATTGGTGGACA
AATCAGTTTCGATGTGTTCCCAAAGGGTTGGGATAAAACATACTGTTTAC
GTTTCATTGATACAAGTAAAATCAAAACGATTCATTTCTTTGGCGATAAA
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TTCTAAATCGTATAATTATTTAGGCTACgtctaggctgcacgcatcccca
gaatttattttgttataggggatgcgtatcgtgtatgaaattctcgtccg
agagttacctcaaatttggggtaaccgaaagttgcataaatttacataat
tttgttACATCCAAtcacagaaagagaaaaatgacgtcattgtgctATTG
CtttcataattataaattttcattcattaaacAAAGAGAAGTCGTTGTAC
AGCTGTGacacataatcaaaaaagagaaaagaaaagacgggggtaagctG
GGACAGGAATATCttagacgatacgcatcccctatatcaaatcatatcag
aggggatgtgtgcagcctaggctacgtcatatcttcctccgttttgagcg
taaaactcctactcaagagtaaggcctaaaagactggagctgtctattgt
gtagactaatgAttttatgtttatgtctcaggaaaaacagttttttaaaa
agttttgaaacttttcgttttgttGAAGGAGAATTCCACGatcctgaaaa
atttttttagtaaCGTTTAACGTAAACGTACCACGTGACAGCTGGAAAGA
GacataaatattttgaattacAATTTATTTACGCCCTTTATGTTTCACTT
TGATGACCCACACTTTAAGATACCTATATTAACTTTATCATATGATTCTG
CTCATGTTTCAGGGTGGCAATGATTTCGAAATTTTCGCTGACAAACGTAC
GCTAGGCCACACTGTCACAAGTCCAGAAGATACGAAAAAGCAGTTAACTG
AACTCTTTTTCAAGTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:1064981..1071447+ >XLOC_031570 ID=XLOC_031570|Name=XLOC_031570|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1656bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:1064981..1071447+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTATTCAATAGACGTCATGTTCCCCTAAGTCCCCAAGTCATTCCTTTTTG
TTTAGatcttgaaaaattaagaaaaatggGAGAAGCAAGGGATGAATGTA
CAATATGTTTATTTGATGTTGATGGTACATTAACCATGCCAAGACAGCTA
TTCAATAGACGTCATGTTCCCCTAAGTCCCCAAGTCATTCCTTTTTGTTT
AGatcttgaaaaattaagaaaaatggGAGAAGCAAGGGATGAATGTACAA
TATGTTTATTTGATGTTGATGGTACATTAACCATGCCAAGACAGGTCATT
ACATCAGATATGGAGGATTTTATAAAAGAGCTTCAAAAGAAAGTGTTGGT
TGGTATAGTGGGTGGTTCTGATCTCAAGAAAATTAAAGAACAAATGGCTG
GAGAACATTGTCATTACATCAGATATGGAGGATTTTATAAAAGAGCTTCA
AAAGAAAGTGTTGGTTGGTATAGTGGGTGGTTCTGATCTCAAGAAAATTA
AAGAACAAATGGCTGGAGAACATTGTATAAAGATATTTGATTATGTGTTT
GCAGAAAATGGATTAGTAGCTTACAAAAATGGTGAACTACTTGAAATACA
GGTATAAAGATATTTGATTATGTGTTTGCAGAAAATGGATTAGTAGCTTA
CAAAAATGGTGAACTACTTGAAATACAGAACCTCTCAAAGTATGTTGGTG
ACGATAAACTTCAAGAATTCATCAATTATTGTTTAGAATATATGTCAACA
TTGAAAATACCACGAAAAAGAACCTCTCAAAGTATGTTGGTGACGATAAA
CTTCAAGAATTCATCAATTATTGTTTAGAATATATGTCAACATTGAAAAT
ACCACGAAAAAGGGGAACCTTTGTAGAATTTCGCAATGGGATGTTGAATA
TTTGTCCTGTTGGTAGAAGTTGTAGTCAAGAAGAAAGAATTGAATTCAAT
AAATATGACCAGGGGAACCTTTGTAGAATTTCGCAATGGGATGTTGAATA
TTTGTCCTGTTGGTAGAAGTTGTAGTCAAGAAGAAAGAATTGAATTCAAT
AAATATGACCAGGAACACAATATACGTAAAAACTTCGTGGCAGCTTTGGA
AAAACGATTTCCTGATTCAGGGCTGAAATATTCAATTGGTGGACAAATCA
GTTTCGATGTGTTCCCAAAGGGTTGGGATAAAACATACTGTTTACGTTTC
ATTGATACAAGTAAAATCAAAACGATTCATTTCTTTGGCGATAAAACGTG
GGAGGAACACAATATACGTAAAAACTTCGTGGCAGCTTTGGAAAAACGAT
TTCCTGATTCAGGGCTGAAATATTCAATTGGTGGACAAATCAGTTTCGAT
GTGTTCCCAAAGGGTTGGGATAAAACATACTGTTTACGTTTCATTGATAC
AAGTAAAATCAAAACGATTCATTTCTTTGGCGATAAAACGTGGGAGGGTG
GCAATGATTTCGAAATTTTCGCTGACAAACGTACGCTAGGCCACACTGTC
ACAAGTCCAGAAGATACGAAAAAGCAGTTAACTGAACTCTTTTTCAAGTA
GGGTGGCAATGATTTCGAAATTTTCGCTGACAAACGTACGCTAGGCCACA
CTGTCACAAGTCCAGAAGATACGAAAAAGCAGTTAACTGAACTCTTTTTC
AAGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000112_pilon | genome | sc0000112_pilon:1064981..1071447 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 727-831:6363 |
| Aaloc | 535-726:5418 |
| Aaloc | 436-534:5028 |
| Aaloc | 343-432:4579 |
| Aaloc | 268-342:1397 |
| Aaloc | 151-264:254 |
| Aaloc | 4-150:1 |
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