XLOC_031557 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_031557
Unique NameXLOC_031557
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000112_pilon:864171..876134-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_031557 ID=XLOC_031557|Name=XLOC_031557|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11964bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:864171..876134- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCTATAACTGACTAGTGTAGAGGCCTTTATGTTTCGTGATCAATCATGAA TGTTATTTACTTTTCATTATAAAAGGAAGAAAGTGTTGTGTAAACACAAT TGATCTTTTTTCTTAGGTTTCCACATTCCATGGAGTTTCCGCGTAGCAAT ATTAACAGGGGTCACTACCCCCCCTACCCTAGAGCTACCCCCCCTACCGT AGGTTCTTCCCCCTTTTAAAATTTGATGCTACCCCCTCAAAATTTTAAAA TCCTACAAAAGAAAATAGAACACACTGCATTGCGAAAAAAATAGAATCAT TTTGAATCGAATGTTTCAAACATACTAAACAATTAATAAAGAAGACGTTG CATTGTAAATTAAAAATAAAACTTCTAATTTGGGAAAACACAAAAAAAAA CATACATCTTACCACTGACATCTTACCCCCCCCCCTTTCTAGATGAACCC CCCCCCCTTTCTAAAAACTTCCCCCTTTCTAGAAAAAATTCTCTTACCCC CCCCTTTCTGAGATTTTCTGAACATCGCTACCCCCCCCCTTTATAAAGGG GGGAGGGGGTGCGAACTATGATAATGTTTGGGATCTATCAAGGAATCAAA TATTTTTTGGCTTACTTCCAGCAGTCGAAACCAATGCAAAGAATGAAAGA AATCAATCAATCAATCAATATAGCCTGATGGAGAGTTTTTTCGATTTTAT ATCAACGTTCTAGTGATGTTCTTATTTGATGAAAGTTAATCTAGGAAAAA ACGTTCGATCTCAAGTAGATTTCAGTATTGGACCCATTTATGACTATTTT TCAGATTCCAGATGTTGATGTTCCGAATTTGAAAAGGAAGATAAGTGTCG GAGGAGCTGAACGAGATGGTTGGTTGCCGATGCACTCGTTAATGAGAAAT GCATCACCAGAATTCAAGGTATTGTTTATTATTAGCAAAGTTAAGGGATC TATGGCTAGATTCTTTCGCGGGATATCCGCAAAGTTACGGGTTAAAAGGC ACGAAATCTTTTACATGAAATTACCGAAACTCACATCATAGATAATTCGA TTTGTGAAGATTTTCAAGGTTGGGGTTGAATCGATTAGGTCGTAAATCAA ACTTTATCTCTAAAAATACGTTGTGAATAGTTTCACACTTAAGGGCTGCA TACACTACACAATATATTGCCAGGTAAACAATATATTGCCAGGTAATATA TTGGCAATATATTGAAGATATATTGCTGAGTGTCAGCAATATATTGATAA GGTGTCCGCAATATATTGTCAGCTCGATTTGCAATATTCCAACAATAAGG GGGGATTGTTTACAGAAAGAAAATTCCTTCTTATAATAAAGTAACTGTTG TTTACTCTGTACATTACGGTCCGGAAACCATATTGTCAAATATTGTTCGT CAATATATTGTGTAGTCTAAGTAGCCCTTTAAACCTTGCTTTTAACTGCG AATGATGCGTACTGTACATACACAGGCAGGGATTCTTATAAGTACTTTGA GCTGGGGTCGTTTTTGTAAACTTAGATTGAATTTCTAACATGCCTGAAAG GGAACTTGCTCAGCAAAGCTGTACATTGATGAAATTGGGGGTCTTGCGGG TGTTCAGAGGGCAAAGCTCCCAAAAACTCGCGAATGTGTAGATAATAATT AGTTATTGTTCCTCATAAACAACAAAAAAGGTTAATTTTGCTAGAAAAAT CTAATTTAGATTGAATATTTTGGCCGGTATACGGGCATAAAAAAGTGCTA GAACTGACAGGAACAAATTAGTAAATCGCCAGGATTGTGAAAGGTGCATT TTCTGATCTAATTCTCATTCCAAGGGTGGCCCATACTCCAAAGGTCCAAG GAAACCCAAGAACGTCAAAAGATCTCAAAGGAAAGTGGGTTAACAGTTAG 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TGGCTTCATTTCTAATCCAGAAGTCTAGCCCTTCGGGCTTGTCAATGGTT GGACCATGTATAAATATTTTATGTGGGAGCGTTAATATGTGTTGGCGCAC TGTGCTTCACATCGTCATACTGGAACGTTTCCATTCTTCAAAACCATTTT TTTTAGGTGAAACAAATTAACTTTTGTCGTTCTACGGGCCGGACCAACGG ATTAGAATAGGTGGATTAACTTCTCTCGTTGCTCCCAAGAGAGATCCATT GTCTTCTCATTGTTACAAGAAAAATCTGTAAATGACTCTGCGCACTCCTC GTTTAATTTTTTCATTGTTTTTATAAGAACAATTTTCCAATTTATACAGT TTCGAAAACGAATTTGTCCTATGATTCGATCAATTTTGATGATTTTGAAA ATATTTTAAATCCTGCACTTAAGTTTTAGCATCAACAAACGCTAGACCAG TTTTAATGTAAATTTTTAATCTTTTGTCAATGGCAATCTTCAGATAAGTG AAAATTAACGTATGGTCTATAACTAAGAAACTATCGATGGGTCACGAATG GGTTGCATACTGGTGAAAGAAGACTGTATTTAGAATTAGGAAAATAAATT TCAAATTATTTGGCTAATTTCTGCATTGGATAGAAAGGGCTAAAAAAGTG CATTTTCTTATTTAAAATGTACCACGTGATACGTAATGACCAATGAAAAT GTTGAAAGTAATGATTTTTTACAACTTTTTTACAACTTATCAAGTTTTAA TTGCTAGCAAACTCGTAAAAAAGTTTGATAACCTAACGAGGAGTGTTTTC TATGAGTTCTTAATCCACCTATTCTAATCCGTTGGCCGGACCAACTCTGT TTTTGATGAAGTAAAAAAATAAACAATATTCTAACTTCAACACTGCTTTC TTTTTAGCACATCTTACTATACTAAATGAGTTTATGAAAAATGTCTGTAA 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AAATTAAATTAGGTTTATTTAAGATCCGTACAAAATCCAAATCCTGAAAA GGCATACCTTATCGGGGAAAACTTCGTCGGGGAAAAGTGATGAACTTTTG GCCAAGTGACGAATATTTTTCCCCGACGAAAACTTTCCCCGACGAAGTTT TCCATGATAAGGAAATAGGCAACTTTCCCTGGTTATTTCATATCATCAAT TATAATTTCTTTCAAATATTCTTGACACAGGTATTGGTTGGACTTGACAG AGAACGATACAATGTGGAACCTTTCAGATACTGGATGGGCGAAATCCGCC TACTCTTCAGTTTACGCCCCGTGGTGGCAGGGCTCTTGCGTTTTCGTTTA TAATGCACCGCGATTCGATGCTAAAGAGACGTTAAGAGTTCTTGAGAAAT ACTCAATATCGGTCACTTGTTTACCACCTACTGCTTATCGCATGTTTGCA AATGAAGACGTGTCTTCCTATAAATTTAAAGGTACTTTGCGAAGGTTATC TGCTGACATGTATTTATAACTTTGGACCCTTATAAGTTACCTTATTGGTG GATATTTCGTCGGACAGAAGTGACGAAATAATCGTCTAGTGACAAAATCT TTTACTGACGAAAACTTTTGGCCGACGAAATTACTGTCCGACAAGATCTT CGTCGATAAGGTAACCTCCCCTCTTTGAACAGACAGGCATAAATGTACTC TTGTATCAAATACAAGATGAAGTAACGTCAATTTATCTAGTCGAGCTTAG TCCAATACTGAAAATAGTTTGCGATCCAACGTAGAGAAGCAATTGGGTTT CAGCTTGGTTTATTTTGGATATTGTGTAAAAAAAAACCGTACACCGGTCG CTAATGGTCCTTGTTGCTGAAGTATTAACATACCGTGAAAAGCACAGGCC AAAATCATTTATTGACCTGTGCCGACCAATCAAGATTCTATTCAGCGTGC AATCAACACAGAGAAAAGTAACCATGACGACCATCCAAGATCTTGGATTA AGTTCAAAGTTGATATTTTTATTCTCGTCGTTGAAAACACAACTTAAAAA TATCATCAATGCTTTTCAAAAAGAGTCAGTGATAGAGAATCATTCAATAT TTTCACTTTTTAGCTCTACGTCACTGTGTATCAGCCGGTGAACCTCTGAA CCCGGAAATCATCGACTATTGGTACCGGACGACCGGAATATCTATCCGGG AGGGCTACGGACAAACTGAAATGACGTTATCATGTGGGATGTTTCGCTGT TTGGATATGAAGGCAGGATCAATGGGAAAACCGACCCCAGGATATGATAT ACAGGTTCAATTTTTACAAGTCTGTTAAATCGTTTTCAAATCAAGTTGTC AAATTTCGTGCTTAAAAAGTAAGTTTTTTAAGTATACCACTTGGAAATGA AATTACTCTAGCGAAAGTGTGATAGGGTTTTCCATAAAAAATTGCTACCA TAAACCAACCTCATCCCCGTGTATCCCAAGCTTTATTCGTGTTTCTTGTG GAAGGTATCAATAAGCATCAAAAAGCTGATAATACGCAGGGAACGAGGTA GATTATGAACGTGGTAGAAACCTTTACGCTTTGAATACTGATTTAACATT GAGTCCAACTGCTATTTTGAGGTGGTTAACCCATTAAGTGCCACTAGCAT CACATTTTCAATCCTGTACGAGCAGGTTTGGACCTAGGAGCACTGCAACC CATGCAGTACTGTTACTAGTTGGAGTATGCATTTGAAATCAAAATATATT TGAAAATTTGAAGTTACGTTGTAGTTGCACTTAATGGGGTAAGAAGCCAC TCCTTGCTTATGAAAGTCATTTATTCTTCCAGATCATTGACAACAAGGGA AACAAAATGAAACCAGGTGAGGAAGGGAATGTAGCTGTTAATTGCTCCCC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:864171..876134-

>XLOC_031557 ID=XLOC_031557|Name=XLOC_031557|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2886bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:864171..876134- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTAACATGCAGAGGTTCATACAGAGACATGTTGGTAATAAAATCAAGAA
GTATGTTTTTCATTACAAGACCACCCGTTTAAATACCTCAACACTGAGTT
CAGCTGCTGGTTTTAATAATTATGACGAAGCTGTAAAGAATTATACATGT
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ATAAAATCAAGAAGTATGTTTTTCATTACAAGACCACCCGTTTAAATACC
TCAACACTGAGTTCAGCTGCTGGTTTTAATAATTATGACGAAGCTGTAAA
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GACCTCGGTATTCAAAAAGGAGAATGTGTTATTGTTGTGCTTCCACGAAT
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ATCGGTGCCATCTTGTGTCCAGGGACTACATCATTGACAGCAAAAGATTT
GTTTGGACGCCTGAACGCTTCAAGAGCAACATGTATTATAACAACTCCTG
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TGTATTATAACAACTCCTGAAATAGCATCTCTCGTTGATCAGATTCCAGA
TGTTGATGTTCCGAATTTGAAAAGGAAGATAAGTGTCGGAGGAGCTGAAC
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TTCAAGATTCCAGATGTTGATGTTCCGAATTTGAAAAGGAAGATAAGTGT
CGGAGGAGCTGAACGAGATGGTTGGTTGCCGATGCACTCGTTAATGAGAA
ATGCATCACCAGAATTCAAGACGTTACCATGTAAAAGTGAGGATCCAATG
TCTTGGTTCTTCACCAGTGGAACAACAGGTTTACCAAAGATGACTGAACA
TACCCATGCAAGTTATGGTTTCGCTCATCGTGATACAGGAAGACGTTACC
ATGTAAAAGTGAGGATCCAATGTCTTGGTTCTTCACCAGTGGAACAACAG
GTTTACCAAAGATGACTGAACATACCCATGCAAGTTATGGTTTCGCTCAT
CGTGATACAGGAAGGTATTGGTTGGACTTGACAGAGAACGATACAATGTG
GAACCTTTCAGATACTGGATGGGCGAAATCCGCCTACTCTTCAGTTTACG
CCCCGTGGTGGCAGGGCTCTTGCGTTTTCGTTTATAATGCACCGCGATTC
GATGCTAAAGAGACGTTAAGAGTTCTTGAGAAATACTCAATATCGGTCAC
TTGTTTACCACCTACTGCTTATCGCATGTTTGCAAATGAAGACGTGTCTT
CCTATAAATTTAAAGGTATTGGTTGGACTTGACAGAGAACGATACAATGT
GGAACCTTTCAGATACTGGATGGGCGAAATCCGCCTACTCTTCAGTTTAC
GCCCCGTGGTGGCAGGGCTCTTGCGTTTTCGTTTATAATGCACCGCGATT
CGATGCTAAAGAGACGTTAAGAGTTCTTGAGAAATACTCAATATCGGTCA
CTTGTTTACCACCTACTGCTTATCGCATGTTTGCAAATGAAGACGTGTCT
TCCTATAAATTTAAAGCTCTACGTCACTGTGTATCAGCCGGTGAACCTCT
GAACCCGGAAATCATCGACTATTGGTACCGGACGACCGGAATATCTATCC
GGGAGGGCTACGGACAAACTGAAATGACGTTATCATGTGGGATGTTTCGC
TGTTTGGATATGAAGGCAGGATCAATGGGAAAACCGACCCCAGGATATGA
TATACAGCTCTACGTCACTGTGTATCAGCCGGTGAACCTCTGAACCCGGA
AATCATCGACTATTGGTACCGGACGACCGGAATATCTATCCGGGAGGGCT
ACGGACAAACTGAAATGACGTTATCATGTGGGATGTTTCGCTGTTTGGAT
ATGAAGGCAGGATCAATGGGAAAACCGACCCCAGGATATGATATACAGAT
CATTGACAACAAGGGAAACAAAATGAAACCAGGTGAGGAAGGGAATGTAG
CTGTTAATTGCTCCCCTAAACCACCTGTTGGTCTGTTCTCAAAATACGTG
ATCATTGACAACAAGGGAAACAAAATGAAACCAGGTGAGGAAGGGAATGT
AGCTGTTAATTGCTCCCCTAAACCACCTGTTGGTCTGTTCTCAAAATACG
TGGATGATCCTGAAAGAACATCTGCTGCTTTTTGCGGAAACTTCTATTTG
ACGGGATGATCCTGAAAGAACATCTGCTGCTTTTTGCGGAAACTTCTATT
TGACGGGTGATCGAGGCTACATGGATGAAGACGGTTATTTATGGTTCGTT
GGTCGAGCTGATGACGTCATTGTGATCGAGGCTACATGGATGAAGACGGT
TATTTATGGTTCGTTGGTCGAGCTGATGACGTCATT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_031557XLOC_031557-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000112_pilongenomesc0000112_pilon:864171..876134 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1381-1443:64
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