XLOC_031553 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_031553
Unique NameXLOC_031553
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000112_pilon:946683..961493-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_031553 ID=XLOC_031553|Name=XLOC_031553|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14811bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:946683..961493- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATATCCGACCTGCATTTGTTACAAAAGCTTTAGAAAAGTTAGTTGAAAT AAATAAATTTTATGAAAATGTTGTACCTAATGCGAGATGGGAAGATGAAA GTTTAAGAAGAGACCCTGAATTATGGTCACTACTTACTGATAAAAATGCA CAACCTCAGCAAGATGATGAAAGTGATAGTGATGATAACATTGAAGGCAA TGATAAAAATCACGAAAAACAAATTAAAGATAACAATTCCTCCCAGCCAA CTCTAATGTATGAAATTGAAGGCGCAAATATTACTTCAGAACAAGCTATT GAGATTGCTCATAAACAACCCACCCCTATATCATCTGATGAAATTGTCAA TATTGCACCGTGCGAAAACGAATTGCCTGTGTCATTCTATTCTGAACCAG ATTGGGAAGCATTAGCTTTTCCAGGGCATTATCCTGATGCTAAGAATTAC TTCAATACGCCTAGAGATAGGAATATAACTCCAATAAAATATGTCCATGC CAGGCTGAAATCGTCAGATGATAGATTTGCTTCAGATCCTCAGTACATAT TTCATTCTTTGCATTGGACGGAAAGCTCGAATGTTGCTAGTGCAATCAGT TTTTCACAGCAAAAACACTTTCAAAGTGATATTTCTGCAGGATCATTGAC CAACCCTGATAACGTTAGACAAATGATAAATGATGACCAAATTTTTCCAA AACTCATTCAAGAATATTAGAGGAACTCCACAGTGGTGCCATAACATGAT GTTGGATGTTTTAGCTAAATGTCGTGTGTTTGGACCTAGCACATACTTTC TTACATGGAGTGCAGCATTATTTAAATGGACTAATATTATCAAAGTAGTC GCTACACAATACGGAGAAACTCTAACAGATGAAGAGGTGAATAATATGAG CTGGAGTGAAAAAGTTCAATATTTAAAAAGAAACCCTGTCACAGTAGCCA 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GCTACTACGATTCACAAAGCACAAGGTAGTACATTGGAATACGCTAGTGG GAATTTAGATCAATCAACTAGAAGTGGGAAAGGGTTAACACCAGTTGGAC CAGGGCTTCTATACACGCTACTTTCTCGTGCCACATCTAGTAACAATATA CATTTATTGAATTTCAAGCCTGAAAAACATATTGTTGTAAATAATAAGGC CCTAAAAGCAATGGAGGAAATGAGATCGAATAAGGCTTTATTGTTAACTC ATCCGTTGGAAAGAATGCACGGTCCAAACTTGTGTCTTTTCAATATTAGA TCATGGAATATGCATATTGAGCATTTCCTATCTCAAGAAATTTACACCTC TACATGCTGCTTGCTATGTTTTACAGAAACTGGTAGAAATACTGCCAAAA GGGTAGAGGATAATCCAAACTTATCTACTTGGAAAACATTACACAAACAA ACTGAACATGGACTAGCAATAACTTATGATACGAATCATGTTCAAATAAT TCAGTTATTAAATACAGTTAGTAACATAGAATTACTTCCGTCTTTGGTCA TGGTCAATGGTGAATATATTTTACTCGTTTTAATTTACAGACCTCCGGCA AGTTCAATTCCTTTGTTTATACAGTCGCTGCAAATCGAACTCGATCAAAT TGGACAGCAAATTGATGTTGCCACATACTCGACAGTAATTCTTGGTGATT TCAAACTTGCCTGATAACAGAAATGATCTGAATGAATTATTACCACCGCA TATCTTTCACCAGCGTTGTCAATATCCCACTCATATCGATGGAAATATTT TAGATCTCATCTTCCAAAATAATTGCTCCGATGCAGCAGGGTGGATGCCA TCTCCTTTCAGTGATCACTTTGCTATTTTTGTTAACCTCATTCCATACTC TTAGAATTTTCATAATTGATAATTAAAAATTCGGTAATTCATCTGTATAT TTTAATGTATATTTTGTTTAAATGTAAAATGTATATATAGGACTTTTGTA AATAAATAGAATTGAGTTTGTAATTTTATTGCTCCCCCCTTCCCCATCCC CAACTCCGCCACATGAATCGCAATCTATGATGAAATGAAAACTGAAAAAT GTAATCAAGTTTATTCTTACTTCAGTTTTAATTTATTTCTGAACGATTGT TTACAGTGTCAGTATTTTTTTGCTTTTAATAAACACTGTCTCTTTCAAGA TTTTATGCTCTGTGGATTTATACCTTTCATGTTTTAAAGAATTTATTGCT GCCTTAAATTTTCATTCTTTCATTATAATGTTCATAGTTAAATGTACATG TTTTACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATCGCTTGTTAACTAATCAAATTTA ATTCACTTGATTTTTTTTCACGTACATGATATGAAATCAAAACAAAAAAA TGATTTGAACCCCTCCCCCCTGTATTGTAAATAAAGTGGGTAGAAAGTTG GCTGTCTTTTGACGTCAATGCAAATGAATTCCTTTAATCTCAAACGCTAA GTAAACATTGATAAGCCGATAATACGCTGGGAACAAGGTTGGTGTCCTTT AAATTCGCTTGGTATGATGACAAACACCCAAAGAGCCATCTATGTAATTT TTTTTTCTCTTTTTTTTTTATATCCAGGAACACAACATGTTCATTCGCTG ATTCATTCGATTGTCACGTGTTTTCATCACATGATCCATTCATTGTGAGT TGGAATTTTTTATTGAAAATTGTAGATTAGGCGAGACCAATTTGATTAGT TGTTTAATAAAACAACATAAAACAACAAATTTAATTGGCTACGTAGATAA AAAAAATGAAAATTCTCGTATGATTTAATAATCAATGTAATAAATTGAAT TTAATTATGGCACATGAGAACTTTAAGAGTAACTTTTCTTCAAGAGAATG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:946683..961493-

>XLOC_031553 ID=XLOC_031553|Name=XLOC_031553|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=906bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:946683..961493- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACCGCCACTGAATTTCAACAAAGGAAAAGCGAATCTCACGAAACTGA
CAGTGAAAAAGTATGACCGCCACTGAATTTCAACAAAGGAAAAGCGAATC
TCACGAAACTGACAGTGAAAAAGTAACATCGCAACATACATTCACAATAG
ACTATTTAGGTTTTCATAATGTTGGAGAAAACATCGCAACATACATTCAC
AATAGACTATTTAGGTTTTCATAATGTTGGAGAAAATGGTAGCTGTATTT
ACGTTCAAGACGGCATCGATAATGTTCTCAAAGCTGACAACCAGAAGAAT
GGTAGCTGTATTTACGTTCAAGACGGCATCGATAATGTTCTCAAAGCTGA
CAACCAGAAGAGAACAGTGAAGATGCAATTGCTGGAAAGAGATATACTGG
TCATGTTTTCCGACACTGGAGAGAGAACAGTGAAGATGCAATTGCTGGAA
AGAGATATACTGGTCATGTTTTCCGACACTGGAGAGGTGCTAGGTCGTTT
CTCGTATACGGAGACTTCTTCGTGCGGTATCAAAGATGATCAAACCAACA
TATTTGGTTTCATAGCTGGGTGCTAGGTCGTTTCTCGTATACGGAGACTT
CTTCGTGCGGTATCAAAGATGATCAAACCAACATATTTGGTTTCATAGCT
GGGAACACAACATGTTCATTCGCTGATTCATTCGATTGTCACGTGTTTTC
ATCACATGATCCATTCATTGAACACAACATGTTCATTCGCTGATTCATTC
GATTGTCACGTGTTTTCATCACATGATCCATTCATTGCGAGGACAATTAT
AGATGGTATTGGTAAAGGGTTTGACCGTTCAATTTATTGTGTGTAGGCGA
GGACAATTATAGATGGTATTGGTAAAGGGTTTGACCGTTCAATTTATTGT
GTGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_031553XLOC_031553-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000112_pilongenomesc0000112_pilon:946683..961493 -
Properties
Property NameValue
Aaloc394-453:61
Aaloc328-393:834
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Aaloc1-60:14812