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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000112_pilon:1100685..1107626- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_031546 ID=XLOC_031546|Name=XLOC_031546|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6942bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:1100685..1107626- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAACGTTTATTTGATGAAATCCGTTGCCTTGATATTGTTGCAAAAGAA
TTTGAAATGCACGATCACTACCGTAAGAGATTCGGAGAATGGATTTGGCG
AAGAAGCAAAAAATTATAACAACCAAATTTTCATTAACCAGGTAAAATTC
ATTTATTTTTATCAACACCTTCAGCCATTGATCGGATAAATATACTTTTA
GTTTTAGTAAAAGGGCTGCAAATATGAAGGGCAGAAAGTTTCGCGGGCAA
AAATGTTTCGCAGAGTCAAAAAATCGCGAAATTTAGCGAATTTAAGTATC
GCGAATTATGGTTTCGCAGATAGAACTTTCGCTAATTCATATAAAATTTA
CCTTTTTTGGTAACAAAAACTCACATAACACGCAAAAATTTAGCAAAGAG
TGCAAAACTGAGTAGGAAAGTTTATTTTTCGCGAAAAAAAAACTTTTGCG
TTTTTCAGGTTTAATTTCTTACCTTGCAGAAACTTTTGTGAAAAAGGATC
ATAATCGCGAAAAACGCGAAAGTTTCTGCCCTTAAAGTTATAAGTCAAAT
CTAAGCGCAAGACCTTTGTTTTTTATTTCTTTTTTCGTCTTTCACTTCCT
ATCCACCATTGCAAGTGGACGAAATGAAAAAGCCGAAAACTGATTTCACC
TCATTGAAGCTCTATATCGATCGTAACATAATCGAAGAAAGCAAAGTTTT
CTATGAAGGTCTAGAAGTAGCATTTCCGTACTCAAAATAGTCGTTTTTTC
GTGTTTTACTACCTGAAACTTTCCAAATATGTTACATGTCAAATACAATT
TTCCAAAAAAACACCCGTTTTCTTTTATACAGGATTCTCCGGTCAACTTT
TTGAAAAATGTTTTTGGAGAATTTTATTTGACATGTTATTGTGACATATT
TGGAAAGTTTCAAGTAGTAACAGGGGGGGTCGGTAGTAAAATCTCAGACA
TATATGAGTAGTAAAAGGATTTTTACGAATTTTTACATACCACCACCCAG
ACTCTTGGAAGAGTTATTTTACTACCCTGGTAGTAAAAGTTTTTGGGATA
ATTTGTCATGGAGACCACCTATTTTTTGGTTGCTTTTCGGACTGATTTTA
CAAAAAAAGCTAAAAAATGATTATTTCTGTGACACAATTTTCACTTAGTG
CAAAAAATAATGTTTTGCCCTTAGAATTAGTCTTTTTTATATTGACGAAA
AATTTTTTGTTTGCAGCAAACAACTTTCCAACAAAAAAAAAATTTCAAAT
TATAAAAATTCTCAGATTTTTTCAGAAAAATTGTCCAAAAAATTAAAAGA
ATTACAAAAATAGCTAAAAGTTGCTAATTTTACCAGTTTTAACTACCCAG
GTAGTAAAATTTTTTCAACAATTAACACATAGATACCACCCATTTTAGTA
TTTAACTACACTGGGTAGTAAAAAAAATTTTCGATTTTTCGTCACACCAC
CACCGTAGTAAACGTCATTATGTCTGAGATTTCCTAGAGACCCCCCCCCC
CTGGTAGTAAAACATTCTAGATGGTGCACAATCACACTATAAAGTTGTCA
TGGTGTTTTAGCTCTCAGGCAAAATCCCTTACAAATTGGTATTTTCACAA
AAGACACCTCCACTTTGATAGGCTACCATTTTAGATATCGGCCTGCTCAG
CCCATTTACCTTCTCATTCCTGAAAATATAGCAATCCAAAATCACCATCA
TCAAATATTTTTCATCTCTTTGGGGACGCACACCTCCCAACTCGATCACC
ATCATGGAATTAGGTAACTGAACCTAAAGAATGTCATTATTTTCAGGCAA
TTTCCCTATAAATTGCTAATTATCCTCTATAATCACCCTCGAAATATATT
GAGATTTTAGTGTATTTTAACGTTTTTGAGAATTTAAAGTTCGGGCGAGA
ATTGCTATTTTAGCACTTCCACTTTCTTCCATTGAATATTTCGATTTTAG
AGGGGTTTTAAAGCTTTTAAATCCTGAGATCCTAAGGTCCTAAGGCTTAA
GTCTCATGTTAAAACTCAAAGTTAAAACTCTTCTTTCCAACTGTAGTTTA
AGGCGCTTAAAAATCAATTGTGGTGTTCAAAATTACACCGGGAACTCCCC
TTTGTCTCAAATATTTAGTGGATGATTGTAGCAATGCTAAAAGCTTTCAA
AAAATGTCATTTTCTTTGCTTGAGGTATACATTGAATGCTAGCTTTAACC
TCGTTTTAGATCTCAACCTATAAAAATAACGTAAGAATATTTTTGGATGA
TTTACCCCAAAAAAGTTAAGAATATCTATGATGAAATGGAAAAAACACCA
TTCTTATAACAAAAATCGTGTACACTTAGAGATGCAGTTGACCTTTAAGG
CTTTTTGAGGCAACTTATAATGCTTTTCTATTAGTTAAGTAGGTTATTAA
AAGGTAGGATTTCAAAGGATGACTTATAACATTGAACCAATTAGAATGAC
AATCTAATGTTTGGCATGAACACCGGGGGGGGTGTACTTTTACGGTGTGA
CGGGATTGGCCCTATTTTAGTACGGTATTACGGGATTCGACGAAAAAAGA
GACAGGAAAACGGTATTTCAAAATCAGACGGTGACGGTATTTAGCCTTAT
TTTTTGTTATTATGCCGGTATTTTAACCTCTACAAACCGGTGTGACGGTG
TTATTATTTTTTCCAATTTTCGGGATTTCGGGATTTTAGCAAAAATTTTG
ACGGGAAAACGGTATTGCGAACACCTACAACCCCCTATAGAAGGTATTCT
TATAAAAATAGCGTGTATTTCATTGTTTAGGTAAATTTATAAGTTCTCTT
GTTATTTATTGTCGGATTATCGAAAAATTCTAGTTGTTGAGTTTTGAGTT
TTGAAGACGCTCGAATTGCAGAAAATATAGAGAAATTCAATGTTCGAGTT
ATGGACAGGCTCGACCTGTAAAGCTTCGAGTTATGGAGAAATTGGAATCA
CAGAAGTTCGAGCTATCTTAAATAGAAATTATCATTTATTCTGCCCTTGC
AGTTTGATTATTAGCTCTCTAGTGCTATTTGCGCAATGACACTCTCAGGC
TAATAACCAAACTGCGCGGGCAGAAAATAACAACAACAACCTCAAACTGA
ACGCTATATTGTTATATTCGAAATTGCGAAAGAAGTATATACTGCCCTTA
AAGAGGGAAAGTGTGTTTATTGGCTTATTCATAAGCTTAACTTTTGAATA
TGCAATTAAAAAGATGTAGGCTATAGGATGTAAGCAAATGATAATTAAAA
CATGATAAAAATATGGTATTCAGTAATGGAGTAGTAATTAGCTTAATTGC
TTTGTGCTCTCGATGCAGCCGAATACAATTTTTTTTAACATCAAGAAGTT
TTATTTAGTAATAATATTCTGTTGTGTAAAGAATCGCGCTGATAGAACTA
AGTTGTAGTGAATAGCACACCGTGGTGAATCTAAAAATAGACATCACTTT
CTTTATTTGCCCGAGTTTCAATCCCATCGTTCATTGCGTTAATTTCTTGT
GCACATTAATTACACTTATAACAAAGAAAATGTAACAACTCTCACGATTT
TGAAATCAAAGTGAAAGGGATTATGGGATTGAATGTCGGACAAATTTGAA
AAGTAATAATTATGACGTTTGCATAACGGAGCGCTATTGTATTAGAGGCT
CAGCGGTCGGTTTGAAAAATCTCAAATGAAAAACAACAGACCCTCTACGG
CAATGAATTTTGAAATTAGCCGTACATATCGGGTTTGTGTAAAGACTAAC
TAGCACGAGGTGGCACTATATTTTAGGCTTTCATTGTGTAACATTTGTGT
GGTATTTTTCACAGTTGTGTTGAAGTTTTTATAAGATGCTCATATATTTG
GGTATTCAAAACAATAGAGATGACGCGTTCTTTAGAAAAATATAATAAAA
GTTTTTGTTTGAATAGTTAACGACCAATCCAATGACAAAAATTCTTGTAA
AATGTTCATCTTGACCCATTTTTCATGTAGTTTGACTTTGCAGAATGATA
CATTTTTTTGATTTGTATTCTGTTCTGTTCTGTCATAGATAAATATTTAA
AAGTTAAGGAGTGATACAAAATAAACTATGCTGGGTTGATATTTATTTTC
ATCCCGAAAGAATCTGCTTAGCGATCAATAAAGGTTGGATTTAGAAAATT
GTTTTTAAAAGAGAAGTCTTTTACGTTACAGAAAAAGATGTTTTCTCGAT
TAATACTTGCATCACTGATCATAATCTTTGTTCTTTCATGGGTTATCGAG
GCAAACGTTTCAAATATAAACAACCAAACTGAATTTCCTTTGGAAGAATT
CATCCAATCTGCGTTTACGTACCCTGTGAATTTTACCGGAGACTTCATGG
AAATAGCGAAAGAGACTTTTCTATGCGGCTCCGATTGTTGTGATTGTGAA
CCAGACTGTTTCAGAAAACAAAGTTGCTGTATTGACAAATTATGGAACAC
TTCGAACCCAATTCCCTTATCAGAATACATGAAAAACTTTAAAAAAGAGG
TTGACAAGACTCTGCCCCTGCAATGTAAATTCTTCGAACCATTCGGTAGT
TTACCAATATTTAAACAGATGACTATAGCTAAACCAGATAGTAGATTGGA
ATATTTCTTGGTCAATTCTTGCCCGCCAGACTCTTCATACGCGACAGAAT
GTATAAAGGACGAAAGTTTACCAGATATTGAAAGACTACCAGTTATCGAT
AAACGATTCTATATCTTCAAGAACAAGTATTGCGCAATGTGTAATAATGT
TGAAAGTTTCGTTAACTTGAACTTGACTGTAAAATGCACCACGCCAGTAA
TTACTGGACAACCAACTGTAATTATAACCGCACCGCCTAACCCGCCCTTC
ACCAATCCATCTGTACTGCCAAAGGAAACATTCACTGTTCCTACCCTCCC
GCCCAATCCAGGATTCACTGTTCCACCCCTTCCGCCACTACCAGGATTCA
CTGTTCCACCACTCCCGCCAAAGCCAGAAGTTACTGTTTCAACCCTCCCG
CCCAATCCAGAATTTACTGTTCCAACCCTTCCGCCACACCCAGGAGTTAC
AGATCAACCCCTCCCGCCACAACCCGAAATCACTTCACGGCCAACCCTTT
CACAACCAGAACCAGAACACACTGGTCCGCCCCTCTCGCCTAATCCCGAA
TTTACTATTCCACCCCTCCCGTCACACCCAACCGAACCAGAGGTCAAAGC
TAAAGATTTAATGAATGAATTCCAAGAATGTTTGGTACAAGTCAATCCAA
ACCCTCAACAAGCACCTCATAACCGTATGGACAAACTCAAATGCAACGCT
CGCAAAGTACTAAAACGAAGATGCCAAGACCCAAATTCTTATTGTCATTT
ATATAAAAGTTCCATTGCAGGTTACCAGAACCTCCATTGTCATCAATGCA
ATGGAGAGTTGTTTACGGAGAGCATTCTTCAGAACCAGTGTGTTGCCTTA
CCTGACGAACATATTATATGGTCAATTCACTTAAGCTTCACGCGGACGTC
CACAAGACTGACATTGGATACACAGGATGAAAATGTCGGTGAACAGGTAA
TGGGCTCTTCTTGAAAATGTTCGTACATGGGGGATGGAGGATATAGTGTC
CGGGGGTAGTGAAAAATTCCACAAAATTTACCTTGTCCGGGGGGTAAACT
TGCTCTGTTTTAGGGTAAATGTCCAGAGGGTCAACTGATGCTTGTCGGGG
GGGTTAGACTTGCTGTTCGAGGGTCCGAGGGGTAAATTTCCAAAAAAAGT
TATATTCTCCACCCCCCCCCCCATATTCAATTTTTTTTCTGGAAAAGCCC
AATGAATATGCACGTTTTTTTTTTTTCAGTATTGAAACTTTTCCGTAAAT
AGAAAATCTATCCAGTTGAGATTATTACTTAGGTTTCTGCGGTGTAAGCC
ATGCAGATTCACCAGGGGTGTTGCAGCACTGTTCAGTTATCTTATAAGGG
CAGAAGTAGTAAATTTAGCCTGATGCTTGCTGTTCTTATTTTTCGTGATT
TTCAGGCTTAAATGTTCTTAAAATATTCTTAGTTAAGTTAAAAGAGGATA
GAATCAGTATTTTTTATGCCGTTTCTAAAATCTGAGACTTGGTTTGTTTT
TAATTTGTTATTTATACAGTTTAGTCTCTATAAATCGAACCCACACGGGA
AACACAAATTTATACAAGTTAAGGAAATTTATGTACCCAGCTGGCACACA
ACGTTGTTTCAACGTTCATCTAACGTTATATGGACGTTGTGAAACAGTGC
CAGCTGGGTAAGCTTTATAAGCATCGTTAACTGAAGGGACGAGAAAACTT
GTTCGAGTTAAGGAGATATTCGAGATATAAAGGTTCGAGTTAAAGAGACT
CTAATGAACATACCTTATATTTCCCTTGTAAAATACTTTTTTTTCTTTTT
AGGTCCATTGCAGCTCTGGACAATTGTACAATATTCTGAAAGGCACATGT
GAAAAATTCACTTGCTCAGCTGGCTACTACGCAAGAGAAAAATATTGTAT
CAAAAATAACTCATCCTTTCCTCATTCACAAGACTACCAGTGGTATCGAG
ACACCAACCAGGTGGAATACTACCTCACACACGTCTGTGTCAGTATCAGT
GTCTTAGGAGGTGTCCTCCTGATTGTGACACATACCCTCTTTAAGGAGCT
ACGGAACCGTGGTGGTTTACTTCTAATAGGACTCTCATCTGCTATTCTCT
TCACAGACATCCTGTTTTTCATTTGTGAGCAAAATAATAAAGTTGTTGGT
ATCTTATTACATTGGGGACTATTGGTTATCAATCTGTGGACCATCATAAT
TGCCGTAGATCTTTGTGCAACATTTTTGAGGAAAGGATTTAGAACTTTCC
GCAATACAGTTTCATGGATGGATTATTTTTACTTCAGTTTGGTTGCTTAC
GTCACACCATTGCTGATTGTTATTTTATGTGTGATTCTGGAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:1100685..1107626- >XLOC_031546 ID=XLOC_031546|Name=XLOC_031546|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1362bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:1100685..1107626- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAACGTTTATTTGATGAAATCCGTTGCCTTGATATTGTTGCAAAAGAA
TTTGAAATGCACGATCACTACCGTAAGAGATTCGGAGAATGGATTTGGCG
AAGAAGCAAAAAATTATAACAACCAAATTTTCATTAACCAGATGAACGTT
TATTTGATGAAATCCGTTGCCTTGATATTGTTGCAAAAGAATTTGAAATG
CACGATCACTACCGTAAGAGATTCGGAGAATGGATTTGGCGAAGAAGCAA
AAAATTATAACAACCAAATTTTCATTAACCAGGTCCATTGCAGCTCTGGA
CAATTGTACAATATTCTGAAAGGCACATGTGAAAAATTCACTTGCTCAGC
TGGCTACTACGCAAGAGAAAAATATTGTATCAAAAATAACTCATCCTTTC
CTCATTCACAAGACTACCAGTGGTATCGAGACACCAACCAGGTGGAATAC
TACCTCACACACGTCTGTGTCAGTATCAGTGTCTTAGGAGGTGTCCTCCT
GATTGTGACACATACCCTCTTTAAGGAGCTACGGAACCGTGGTGGTTTAC
TTCTAATAGGACTCTCATCTGCTATTCTCTTCACAGACATCCTGTTTTTC
ATTTGTGAGCAAAATAATAAAGTTGTTGGTATCTTATTACATTGGGGACT
ATTGGTTATCAATCTGTGGACCATCATAATTGCCGTAGATCTTTGTGCAA
CATTTTTGAGGAAAGGATTTAGAACTTTCCGCAATACAGTTTCATGGATG
GATTATTTTTACTTCAGTTTGGTTGCTTACGTCACACCATTGCTGATTGT
TATTTTATGTGTGATTCTGGATGTCCATTGCAGCTCTGGACAATTGTACA
ATATTCTGAAAGGCACATGTGAAAAATTCACTTGCTCAGCTGGCTACTAC
GCAAGAGAAAAATATTGTATCAAAAATAACTCATCCTTTCCTCATTCACA
AGACTACCAGTGGTATCGAGACACCAACCAGGTGGAATACTACCTCACAC
ACGTCTGTGTCAGTATCAGTGTCTTAGGAGGTGTCCTCCTGATTGTGACA
CATACCCTCTTTAAGGAGCTACGGAACCGTGGTGGTTTACTTCTAATAGG
ACTCTCATCTGCTATTCTCTTCACAGACATCCTGTTTTTCATTTGTGAGC
AAAATAATAAAGTTGTTGGTATCTTATTACATTGGGGACTATTGGTTATC
AATCTGTGGACCATCATAATTGCCGTAGATCTTTGTGCAACATTTTTGAG
GAAAGGATTTAGAACTTTCCGCAATACAGTTTCATGGATGGATTATTTTT
ACTTCAGTTTGGTTGCTTACGTCACACCATTGCTGATTGTTATTTTATGT
GTGATTCTGGAT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000112_pilon | genome | sc0000112_pilon:1100685..1107626 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 148-687:541 |
| Aaloc | 91-147:6859 |
| Aaloc | 1-84:6943 |
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