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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000243_pilon:58793..66834+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_031516 ID=XLOC_031516|Name=XLOC_031516|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8042bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000243_pilon:58793..66834+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTTAAAGCACTTTTTTGGGTATTTCTTTTGTACTTTGAAGTCCAAGG
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AACAGGAATataatccatcaaaaatgaatttaaaacatattCCCAAGTTA
GTTCAAGAAATGTCGTTTGATGTTTGAGCTCTGAGTTTGGGAAGAAGCAC
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gggtttctgatcagaaactctttcatttggtgggttcgaaccccggtcgG
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GTTTCGCTTAGCTTGCAAGCgtgcaaaatatatatttaaaggtatttcaa
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GGTGAGTAATGCAATAGTTTAAGTTTCGCATAGCTAAGTAAAACTTCAAG
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AGTTGCGTATAAGTAAGTACAACTGTTAACTTTTATTTAAATGTGAGCAA
AGGATAACATGCAAAGTCAGATattcaatagatattcaatttcccgaaat
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TTTTTGCAACACAATGTATATGGTAAATAGCAATGGGCCCGCGGTATCCC
CGACCTAGAAAGAGCCCTTATGATGAAAAAGAGCTTCGAAAGATAAGGAA
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caatagaattcaaaagaatactgcaagcaattacaaatgccaggctggtc
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TGACTTATAAACCTTAGGTGGAAAGATATTCAACTAtgatcaaacaagaa
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GTACATTTTATCGAGGTAAATATAATAAATCTATATTTCACGAGCATAGA
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GAAGACCATGAGAATTCAACGTGTACAAGTTTTGTATTGCCATTAGAACT
GTTAATAGACATTTCTAATTGATGACTCGATTGGTGGTCTACTTGATGAt
tgttttgtaatattttgatatttactCGTTATAGTGAAATCTGTAAAACT
gtattgtccggggggggggggtagggggggggggggggggggtaataggg
gtatgtgcggacgggacctccgaaaaccgaaccttagagagactgatatt
tgctgaaaaggtgacccttagagagacattttgaatttttttttcgattt
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ttttctctggaaatcaaaaaattttctaaaaatcctgaattttccgaccc
ttagagaaactaatttaaaactttctgatttttccgacccttagagactt
tgaaaggtgaaaaaaccgacccttaccgtccgcacatacccatcatccat
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TTATTTTTCTATTATTCTACACAGATGGTACCCTACCTACCGTTTACAGG
GGATACCATTGAAGCTGCAAAAACTGGTCAGTTGGTTGCTGCTATGGTAA
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GTTTGGCTCACCTGGTTTGTTATTCCCAAAAGCTGTCTACGTAAAGGAAT
TCGAAAAGGCGGGCGAACTTTCCCGCCTTACTGGAGCGCCCAATCCTTTC
ACAGCCATTGAGCAATGTATTAAAGATTCTCCAGACAGCACTGAAGAGTT
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CTTTCCTTGGTCTTGATTTTCCAGTTTACCAAAGAAATCCAAAGTTGTTG
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GTTGTATGATCAGGAAAAGAGTGAAGACCAGAACAAGGTTGATGAGAAGA
CGTTGTTACGATTATTGGCCGATCGAAAGGGGACATTGCAACGCATCTTG
ACCGATGATGTTCCAAGACTACGTAGGCTTTTATGTGTTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000243_pilon:58793..66834+ >XLOC_031516 ID=XLOC_031516|Name=XLOC_031516|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2274bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000243_pilon:58793..66834+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTTAAAGCACTTTTTTGGGTATTTCTTTTGTACTTTGAAGTCCAAGG
GCTGGATTCGAAAATCATTCGAAAAGGTGGACGTTTAAGAAATGTTTAAA
GCACTTTTTTGGGTATTTCTTTTGTACTTTGAAGTCCAAGGGCTGGATTC
GAAAATCATTCGAAAAGGTGGACGTTTAAGAAGAAAATATCCTGCAAGCT
GTCATCAATTGAATTTGAAAGTACAACCTGTCTCGCCAAGTCATCTATTT
CTGCGTACGGCTAGACCAGTCATAATATCAAAACGAGGGCGAACTGACCT
gtttcaagaaaacacaaaaGAAGGCGTAATAAGCGCTATTTGTGATCTCG
GTGTTGAAGCAGTTGAGTACGATGTAGCCAAGACCAAAGATGATAAGCTG
ATTCTTTTCAATGATGGTAACACAAAAGAAAATATCCTGCAAGCTGTCAT
CAATTGAATTTGAAAGTACAACCTGTCTCGCCAAGTCATCTATTTCTGCG
TACGGCTAGACCAGTCATAATATCAAAACGAGGGCGAACTGACCTgtttc
aagaaaacacaaaaGAAGGCGTAATAAGCGCTATTTGTGATCTCGGTGTT
GAAGCAGTTGAGTACGATGTAGCCAAGACCAAAGATGATAAGCTGATTCT
TTTCAATGATGGTAACACAAAACGTATGACGGGTGTTAATAAAGTTGTAG
CCGAGAGTACTTACGAAGAGCTTCAAAAACTTGACATCATGAAAGAAATA
CATTTCGCGTATGACGGGTGTTAATAAAGTTGTAGCCGAGAGTACTTACG
AAGAGCTTCAAAAACTTGACATCATGAAAGAAATACATTTCGGTGGAAAG
ATATTCAACTAtgatcaaacaagaaaaattccACTATTTGAAGATGTTCT
TTTGGCAACTCGCCAGTATAAAGTTGTACATTTTATCGAGGTGGAAAGAT
ATTCAACTAtgatcaaacaagaaaaattccACTATTTGAAGATGTTCTTT
TGGCAACTCGCCAGTATAAAGTTGTACATTTTATCGAGATGGTACCCTAC
CTACCGTTTACAGGGGATACCATTGAAGCTGCAAAAACTGGTCAGTTGGT
TGCTGCTATGGTAACACGACTTGGTATGGTAAATAACGTTTTCGTTATGT
CAAGTGATTTCCGTAAAGTTGCAGCTGCCAAAGCTGCTAATCCACAAATT
TCCACAGTTGCATTGTTTGGCTCACCTGGTTTGTTATTCCCAAAAGCTGT
CTACGTAAAGGAATTCGAAAAGGCGGGCGAACTTTCCCGCCTTACTGGAG
CGCCCAATCCTTTCACAGCCATTGAGCAATGTATTAAAGATTCTCCAGAC
AGCACTGAAGAGTTTTTCGACTTTGTTGTTAATCATGGAATCATTTTTAA
AGCAATTGGGGTCTCTTTCCTTGGTCTTGATTTTCCAGTTTACCAAAGAA
ATCCAAAGTTGTTGAGAATTTTCCGTCGGAATTATGGGAAGAAGATCAGC
GCTGGTATTGGCACGTTGTATGATCAGGAAAAGAGTGAAGACCAGAACAA
GGTTGATGAGAAGACGTTGTTACGATTATTGGCCGATCGAAAGGGGACAT
TGCAACGCATCTTGACCGATGATGTTCCAAGACTACGTAGGCTTTTATGT
GTTTAAATGGTACCCTACCTACCGTTTACAGGGGATACCATTGAAGCTGC
AAAAACTGGTCAGTTGGTTGCTGCTATGGTAACACGACTTGGTATGGTAA
ATAACGTTTTCGTTATGTCAAGTGATTTCCGTAAAGTTGCAGCTGCCAAA
GCTGCTAATCCACAAATTTCCACAGTTGCATTGTTTGGCTCACCTGGTTT
GTTATTCCCAAAAGCTGTCTACGTAAAGGAATTCGAAAAGGCGGGCGAAC
TTTCCCGCCTTACTGGAGCGCCCAATCCTTTCACAGCCATTGAGCAATGT
ATTAAAGATTCTCCAGACAGCACTGAAGAGTTTTTCGACTTTGTTGTTAA
TCATGGAATCATTTTTAAAGCAATTGGGGTCTCTTTCCTTGGTCTTGATT
TTCCAGTTTACCAAAGAAATCCAAAGTTGTTGAGAATTTTCCGTCGGAAT
TATGGGAAGAAGATCAGCGCTGGTATTGGCACGTTGTATGATCAGGAAAA
GAGTGAAGACCAGAACAAGGTTGATGAGAAGACGTTGTTACGATTATTGG
CCGATCGAAAGGGGACATTGCAACGCATCTTGACCGATGATGTTCCAAGA
CTACGTAGGCTTTTATGTGTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000243_pilon | genome | sc0000243_pilon:58793..66834 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 520-1137:7425 |
| Aaloc | 424-519:6670 |
| Aaloc | 337-420:5046 |
| Aaloc | 94-336:3841 |
| Aaloc | 1-90:1 |
|
