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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000066_pilon:703573..709178+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_030353 ID=XLOC_030353|Name=XLOC_030353|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5606bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:703573..709178+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgTCAACAACATACTTCCCATCAATGTTTATCATATtggctttgatatt
ttttcaacaaaaattggtCATGTCTTCAGATTGCACAAGTCGTGGTACCA
ACTGTACTTCATGTTTAAGCGACGGACATTGTGGATTCTGTGACTCCTGC
GGTGATTACTGCCATCAGTCAAAAACATTACATTCTTTTGAGAATTGTAC
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GTTTCAAAGGCACCACCCTTGGGTCAGttctaaaatctcagacatatttT
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CTATTATTAATCTATTTTCAGTTGGTACATAAAGTAAAGAACCTAACGTC
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ATCGTTTGGCAACATTTTTAATTTGCCCCTAAATGTATTAAACGTTGCAG
AGCTTTTCACAGAGAGACGATCCCAAATGAGGGAGCCAACAAAACTTAAA
GGTTGTAAGCCAAACTTAACTCTGTTAGCTGGAGGTAACATAAGTTGCTC
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TATGCTTCTACTTAAATGTTACAATCTAAATTTGTTTGGCGAATCCCGTt
atgaaaagaatttcttaCATGGaacaaaatttgagattttgaaaGTCCAT
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TGCCATATAAAATAGAAATCAACGTGCGAAAATTCTCTACAATgatttca
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GCTTAGGTATAACTATTTTCCTCACGTAAGGGTTCAATGGGGGCTTATAT
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GCCTTTTGGAGGTAATTTAATCACATTCGGCTTTAAATGTCGTTGAATCA
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GTTTGAAGATCTGCAATGTAGCTCAAAGAGAGAAAGTCGTTCTGGAcaat
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CGTGGTAATTAGTTCGTTGGATTTGGGAGTAATTATTCCATTTAAACTAT
GATAACTTTCCCTACTTATGAACTATAATCAATTTACACTattaattttt
gctaaaaaattttaaaattttcttaggaCATTTTTGCTCAGCTTTGTGGG
CTCTACCACGTAGTGCAGGTCTTTTTTGTTATAAAGATCACCCACCATCA
CATCCACTGGAAGTTTAATGTTGCGGGAATAACATCATTGAATTTCGtaa
aaataagtatttttttaGCTATTCATGCAACAAGAAACCAAATTGAGATT
TAttctttcaacaatttttcccaatttttttttcttttttatagtcTACC
GTTGATCAAGACCGTCCATTCAAATTCAAGAGTGGAATTTCACCGACATT
GAATTACACAGGGTGGGTCTTTGACCCTTATTCATGGACTCAAATTGTAT
ATGAAAGGTACTCATTCTTTTTCATCCTTTCTTCaagggtacacgttttt
ttataa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000066_pilon:703573..709178+ >XLOC_030353 ID=XLOC_030353|Name=XLOC_030353|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1644bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:703573..709178+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgTCAACAACATACTTCCCATCAATGTTTATCATATtggctttgatatt
ttttcaacaaaaattggtCATGTCTTCAGATTGCACAAGTCGTGGTACCA
ACTGTACTTCATGTTTAAGCGACGGACATTGTGGATTCTGTGACTCCTGC
GGTGATTACTGCCATCAGTCAAAAACATTACATTCTTTTGAGAATTGTAC
GCATTGCGCTCAATGTGTACCTGGAACATTATCTGGACCAAAGAAAGGAC
ATACTTGCAGACATGAGTGatgTCAACAACATACTTCCCATCAATGTTTA
TCATATtggctttgatattttttcaacaaaaattggtCATGTCTTCAGAT
TGCACAAGTCGTGGTACCAACTGTACTTCATGTTTAAGCGACGGACATTG
TGGATTCTGTGACTCCTGCGGTGATTACTGCCATCAGTCAAAAACATTAC
ATTCTTTTGAGAATTGTACGCATTGCGCTCAATGTGTACCTGGAACATTA
TCTGGACCAAAGAAAGGACATACTTGCAGACATGAGTGGTATTATTATGA
GAAATGTCCTGAAGTGGTTAGTGTCAAGAAAACAGTTTATGTTGGAATAG
CTTTGTATTTGGTCAATTTACATTCTGTTGATATGAAGGGTGGCACATTT
CATGCAGATTTCTATCTTTATTTTAAAGGTATTATTATGAGAAATGTCCT
GAAGTGGTTAGTGTCAAGAAAACAGTTTATGTTGGAATAGCTTTGTATTT
GGTCAATTTACATTCTGTTGATATGAAGGGTGGCACATTTCATGCAGATT
TCTATCTTTATTTTAAAGTTCCACCTGGTCAAACTCTATACACGAaacag
aaatgcaaaaatattggtttGAATGGAGCCTGTTTTGATCTTGTTAATGC
AGCAGGAGCAGCGGAGTTCCACCTGGTCAAACTCTATACACGAaacagaa
atgcaaaaatattggtttGAATGGAGCCTGTTTTGATCTTGTTAATGCAG
CAGGAGCAGCGGAGGTTTCATTGCACGAAGGAAAATACTTCAGAGTGAAA
GGAAAATTCAATTTTGCTGCTGATCTTGCAAACTTCCCGTTTCATTGCAC
GAAGGAAAATACTTCAGAGTGAAAGGAAAATTCAATTTTGCTGCTGATCT
TGCAAACTTCCCTTTTGATAATCAGACATTGAAGATTGAAGTTCAAGATA
TGGAGATGACAGCCAAAGAACTAAGATGGCGCCTTTTGGAGTTTTGATAA
TCAGACATTGAAGATTGAAGTTCAAGATATGGAGATGACAGCCAAAGAAC
TAAGATGGCGCCTTTTGGAGtcTACCGTTGATCAAGACCGTCCATTCAAA
TTCAAGAGTGGAATTTCACCGACATTGAATTACACAGGGTGGGTCTTTGA
CCCTTATTCATGGACTCAAATTGTATATGAAAGGTACTCATTCTTTTTCA
TCCTTTCTTCaagggtacacgtttttttataatcTACCGTTGATCAAGAC
CGTCCATTCAAATTCAAGAGTGGAATTTCACCGACATTGAATTACACAGG
GTGGGTCTTTGACCCTTATTCATGGACTCAAATTGTATATGAAAGGTACT
CATTCTTTTTCATCCTTTCTTCaagggtacacgtttttttataa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000066_pilon | genome | sc0000066_pilon:703573..709178 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 661-822:5445 |
| Aaloc | 583-660:4784 |
| Aaloc | 508-579:2431 |
| Aaloc | 412-507:950 |
| Aaloc | 271-408:560 |
| Aaloc | 1-267:1 |
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