XLOC_030336 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_030336
Unique NameXLOC_030336
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000066_pilon:828507..842815-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_030336 ID=XLOC_030336|Name=XLOC_030336|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14309bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:828507..842815- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTTAGTTCGAGAGCGCATCTTCATCATTCGTCATTCGAAACAGCTTTGAC CGCCACAATCGCTAAGACTTGTTAATGAGGAGCAACACTTTACAACCTAA GCATTAAAGCAAAAAAAGTCCGTTACAAGAAATTTCCCAGAAATCTGCTT GGATATCTTGTCGAACAACCCGTACGATACAGTTCCTTAGACATGAAATA ATTAATTTGGACCCAACTTTTCCGCCCGATAAAAATCAACTTTCTATACG GTCAATTGCGAACCCTGAAAACAAAACGTTGAAGCGAACCATAGTGTAAA GATGGAATACTTGGCTACGATGCGCGAGGTCGTAGGTTCAATCCCTGGTC GGGTCATTTGCACTTGATACCTCACTGCTTAATGCCCAGTATTAAAAAAG ATAAGGTAAGAGTGGAATAGTCCAGGAAAAGAGTATGGCACCTTCCTCCA CCTTTGGGTTGATAGCCAAGCTTTCGGGTCGCATTCGAATGCAGTCATGG TTTATTAATACAAGTGCATATCGTAACAAATAAATAAATCATATTCTTGT AAGAGTAATTACCATGATGCCACATTTTTTTCAATTCAACAAACATTGTG TTGAACTCATGCAGGTCAGTAAAAAAATGACCTAGATCTTTATATCATTA AGAAAGAATTGTTGAAAATAAATGACCAGACAACGAAATTAGCGAACGTG AGAAAAAAAAACAGATATTATGTTCAAACTTACCGGTAGAGGGAATACTG ACACCAAAACATCACCTCAATCAGAATATGACTACCGTGAAATCACATGT CGAAATCAAATTCCGACCTGTGACAGCGAATATCAATTCTATTCAGCGCG CATTCAACGCTGTGAAAAGTAAGCATGACGAAAATCTAAGATCTTGGATT AAGTTTTTTTCACGTCGTGGAAAGCATATCTCAAAAATATCATCGACGCT 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AGACAATGACAACAGACCCTCTACGACAATGAATTTTGAAATTAGCCGTA GATACTGGGTTGGTGTACAGACAAATATACCATAAGCTGCTCAAGAAAAT ATTTGTTTCTCCCACCCAAAACAACTGCATCACCACGAAGATTTTTGTCA ATTATTTTGCCAATGTTTTTCCTGCTGGCACGAAAAAATGTTAATTTTCT TTCTACATTACTTTTTGTAGGAAAACAAGAAACCCTACTTATCAACTTTC ATCGAAAACAACACAAATAACAATAACAACAATTTTACGACCACTGTCAA TTTCAAGACAACAACGTTACCGAAAATCCCTGTTGCCACGACAACGGCAA CAACCACTTTGGACGGAAAAACCTTGAAAAAGAAACAATTACCACCCACC TTCTTTCCATCTATATTACAAGAGAAAGATAAATTTACGAAGGTAATTAT CACCAGAACTTTTGTATTTGGGTATAAAAAATGACTCTCTTCGAAAGGCT CTAAACAATTGGGAATATTAGAATTTTAAGGAGCCCCCCTCCAATCACCT TTCGAATCACGTAATCACGCAAAGAAAATTTCCAAATCACGTTATCGCGA GTTAAATTTCCTTTTTATCACGATCACAATGATTCTTCCGATCATACAAT CACTCACTTTAATAAAATCTCAAATTACGGAAATACACCATACGTATACG CCAATCACGCCATCACAAAAACCGCTGGGGGACCTCTTCAAGGGGTTTGT TTTAGATGAGGTTCGTTTGTTCCAATTTTTACCAATTTTTTCCAGCACTA TAAGCGTCCAGTTTTTTAAAGCCTAGTTTTAGCTGTTTCCCCATCGCATC GGATAATTCTTTTCTCGTGGTCAATCGCAATCAATAATTATTGTGAAGTA TCTTTTCTTTATTGCTTTACAGATGAAAGGAGACAAAAGTAAACGTCTTG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000066_pilon:828507..842815-

>XLOC_030336 ID=XLOC_030336|Name=XLOC_030336|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2622bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:828507..842815- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGTGCAGTAAAGAGCATGCAAAATGTGTGCAGTAAAGAGCATGCAAA
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ACAACAATTTGAAAGAATATCGTATTCTTGGCAAAAAAGGCGAAGGTACA
TTTTCTGAAGTTTTGAAATGCCAGAGCATAGAAGATGGCCAATATTATGC
TTGTAAACGAATGAAACAACAATTTGAAAGTATTGATCGTGTGAATAATC
TGAGAGAAATACAATGCATGAGAAGATTAAGTCCTCATTTAAATATTGTC
GATCTCAAAGAAGTGATATTTATTGATCGTGTGAATAATCTGAGAGAAAT
ACAATGCATGAGAAGATTAAGTCCTCATTTAAATATTGTCGATCTCAAAG
AAGTGATATTCGACAAGAAGTCAGGAACACTGGCTCTGATCATTGAGTTA
CTGGATATGAACCTTTATGAAGTTATAAAAGCGACAAGAAGTCAGGAACA
CTGGCTCTGATCATTGAGTTACTGGATATGAACCTTTATGAAGTTATAAA
AGGGAGAAGGAATTACTTAACAGAATCGAAATGTCGCCAATATATTTATC
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AGAATCGAAATGTCGCCAATATATTTATCAAACGTTAAAAGCATTGGATC
ACATGCATAGGAACGGAATATTTCACAGAGATATCAAGCCAGAAAATATA
CTTTTAAAGGAACGGAATATTTCACAGAGATATCAAGCCAGAAAATATAC
TTTTAAAGAATGATGTTGTAAAACTAGCAGATTTTGGTTCGTGCAGAAGT
GTATACTCTAAACAACCCTATACTGAATATATCTCAACAAGATGGTACCG
CGCTCCAGAATGTTTACTAACGGATGGCTGGTATACTTATAAGATGGACC
TGTGGTCTATCGGATGTGTTTTTGCTGAGATAGCCAGAATGATGTTGTAA
AACTAGCAGATTTTGGTTCGTGCAGAAGTGTATACTCTAAACAACCCTAT
ACTGAATATATCTCAACAAGATGGTACCGCGCTCCAGAATGTTTACTAAC
GGATGGCTGGTATACTTATAAGATGGACCTGTGGTCTATCGGATGTGTTT
TTGCTGAGATAGCCAGCCTGAAACCGTTGTTCCCTGGATCGAACGAGTTG
GACCAAATCACGAAAATTCATCATGTGATAGGCACACCCACGCCCGAACT
ACTTAACAAATTTAAAAACCTGAAACCGTTGTTCCCTGGATCGAACGAGT
TGGACCAAATCACGAAAATTCATCATGTGATAGGCACACCCACGCCCGAA
CTACTTAACAAATTTAAAAAGTCGAAACATATGGATTTTAATTTCCCTCC
ATGTCGAGGATCTGGACTATCCAAGGTGTTATCACATCTTACCAAAGATA
CGTTGAGCATGGTAGAATCTCTATGTATTTATGACCCCGATGAAAGGTCG
AAACATATGGATTTTAATTTCCCTCCATGTCGAGGATCTGGACTATCCAA
GGTGTTATCACATCTTACCAAAGATACGTTGAGCATGGTAGAATCTCTAT
GTATTTATGACCCCGATGAAAGACCTTCGGCAAAGCAGGTTCTTCGCCAT
CAATATTTCAAACAGTTAAGACCTTCGGCAAAGCAGGTTCTTCGCCATCA
ATATTTCAAACAGTTAAGGGATATGGACAAACGAGAGAGACGGGCAACGG
TGACCAAAGCTGACCCTGAATCTTCATCAAATAATCATACGCATGCGCAC
GATGAAGCCAATGCCGTCAAACATCATAAAACTAAGGGATATGGACAAAC
GAGAGAGACGGGCAACGGTGACCAAAGCTGACCCTGAATCTTCATCAAAT
AATCATACGCATGCGCACGATGAAGCCAATGCCGTCAAACATCATAAAAC
TAAGGAAAACAAGAAACCCTACTTATCAACTTTCATCGAAAACAACACAA
ATAACAATAACAACAATTTTACGACCACTGTCAATTTCAAGACAACAACG
TTACCGAAAATCCCTGTTGCCACGACAACGGCAACAACCACTTTGGACGG
AAAAACCTTGAAAAAGAAACAATTACCACCCACCTTCTTTCCATCTATAT
TACAAGAGAAAGATAAATTTACGAAGGAAAACAAGAAACCCTACTTATCA
ACTTTCATCGAAAACAACACAAATAACAATAACAACAATTTTACGACCAC
TGTCAATTTCAAGACAACAACGTTACCGAAAATCCCTGTTGCCACGACAA
CGGCAACAACCACTTTGGACGGAAAAACCTTGAAAAAGAAACAATTACCA
CCCACCTTCTTTCCATCTATATTACAAGAGAAAGATAAATTTACGAAGAT
GAAAGGAGACAAAAGTAAACGTCTTGGATATGCTGAATATAATCTACCAT
CTTTACATCGATTACGTCACGGAAACCAGTTATGAATGAAAGGAGACAAA
AGTAAACGTCTTGGATATGCTGAATATAATCTACCATCTTTACATCGATT
ACGTCACGGAAACCAGTTATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_030336XLOC_030336-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000066_pilongenomesc0000066_pilon:828507..842815 -
Properties
Property NameValue
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