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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000358_pilon:36472..44366+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_029537 ID=XLOC_029537|Name=XLOC_029537|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7895bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000358_pilon:36472..44366+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGAAGCGAGTGATGGCAGGTGCACCTGGACCCACCACTTCTGCCGA
AGTATTGATCTCACTTTACAACAAAGCACAATTTGTAAGCAACCAACCTG
AAGGCTGGATAGTTGATCAAGGCTCTGGCAAATTGCGTTGTTTCAATGAT
GCAGTGAATGTAATGGTTCATAGTGCTGAGAAAAGAATTATGGGTCAAAA
GACATTCATTGAGGTAGGTATACACTCtcgctataattcgaactaatcgG
GTCTTGTTCATTATTAAAAGTTCTTCCTTCTCAAGCGAAGGTTCGTTTCA
ATGAAGCTTATAAAAACCCCTTTCTGTATCACCAAATTCACCAAAGTTTC
AGGAACACGCTTCATagatccattttttcaaaaaccttgctttgaccatT
GTTAGATCGATTTACAGCATTGAACTATTTGCCGAGGATTTGTCTTTTTG
AGGCACTTAGAATTAGTTCAATTCAAATTTAGAATGACCCGAGTGATTTC
AACAATGAGCATCGATTTTTAATCATGAAAGCTGAATTTTACCATTCGAC
TGTTTTTGTTTCAGATTCGAACGCAAGCTGATTTAGACGCCTTCATGCAT
CAAATTCGCTCCAAACCTCTGTTAACGACAGCTCTTTGCAGCAAACCGTA
CTCAGTAAATCGAGACCGTTACCAAAATGAGTCAGCCAACGTTGAAGATA
CTCAGCACACGGAAGAATATGTTGCCATGGTGAATACAGCTCATCCCCAG
ATTTCCCAAATGTTCCAAGAGGCGTACGATAAAACATCACAATTGTTAAG
AGAAGACAAAAAGTTTAGAGTGACGGTaacagaattttatttttattttc
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GGGTAAGGTTTTCTTCCCTAACAACGGTTTTACTTTTATTAGCTAATATC
GTCTGGACCCTGGATTTAGGGATGTGGCTTTTGCTTCATGGGAGGAAATA
AATTTGAAGGCCTTTAGAGGCTATTTATAGACTATTTTTGAGTGAGATTT
TCTTTGTTACAACACGGTGGGAAAAATAATAATGATTGATGCTTTGGCTA
GCCGTTACATGGCAATACATGAATTTGCTATTAGCAGATTCGTGTAAAAA
AGTCATGAAAACGTCGAGTAATGCtttgattggctaaaaaatttattgaa
atatccaaagtatgaggtaatcttagCACTCAGCCAATCAAATATTTACT
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ATCTCACTCAGTGAATCGATCAAGACATGGTTCATTAATAATGTTCGAAT
GCCCAATCAAACAGATTCGGTGACTTATGCAACACATTGTGATCTTTACT
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GAAGTGATCACGCAAAAATGCTTCTGGTGTGTTTGCTTCCCGCTGTTCTT
ATTGTGTTTTGTACCCTTCCACATCTACAAGAAGTGTGTACTGTAAGTCA
CGAAACTTTATTTTAATCTTAGTGCTaaaaaaaGTTCTATCGTCTCAGAC
GAATGTTTGTCTTAGCGAGGAATATAAAGAGGTTTTTCCGTCTTAAAATT
CTGTATTCTTCACCAAAGTCtcaagaatatgtgctaatttgctgtgtaaa
atacATTTGCCGTCTCAAATCTTGCTTTGACTGAATCGTTGTTATTGATA
GGGAAGCATGAGATTAAATTTGGGTTGATCAAATTGATTTCTAGGATGAA
AAGTCCTTGCAATATCGGCTATTCAAAGGTGCGACTTTTTTAGGTCACCT
ATTTAGACACTTCTAAATGAACGaaaaaaaTTATGGACAAATTCGGACGA
AAAAGGGGTTGGTTGATAAAAGTGAGACATGATAAGATTTTCTGCAGAAT
GAGTATATTTATAGAATTAAATATGGGGAGGGTGTATTTTTGTGTTTAAT
ATTGCTTTTTTCGAGGTAAAAGGTTGTTGAACAGAAACGCTCTTCAGTGG
TGGAGATTcgttgatttcttttgttggcTATTTGATGACGCTGGGAAATG
GTGAATTTTCGCTTTTTGATGTTGAAAGTACAAGTTTTATTCACTTGGAC
GAGAAGAGCTTCGTTGAGTTAGGGTTCGATGTGTTGCCTTAGGGTGTAGA
AAATGGCGGTGTTTTGGGCGGTTGTAGGTTTTCAATGGTTTCGAGGAGAG
TATGTAAGGTTGATCAATGGTTGTTTGTAGATGTTGAATAAAGATTGTGG
TGGAGCAAAAGATACGCGTTTTCGTTGGAAAGATGTTTTGTGAGTGGATT
TTGGTGAAGGTGGTGTTGGAAGGAATGAGGTTGTTTCTTTAACTTGATGT
TTTTGTGtggtttgtatttttttgattgGTGTGTTGGTTGGTGGTCGAGG
AACGCGTTTTAATGTTGGCTTATTAATTTGTAATCtttttgatagcattt
tatattggttggtttgttgtttgggaggatttgttgtgatgttttgattt
tcttggaGTGTTACTATTGATGGCAATATCTTTGATTGTGATGATAGCTT
TTGATCATTCAGGTCTTTCAGAGttgttttctttggaaaatcttgaggta
aatattttactttttttgttggGCGTTGTGGTAAAAGTTTTCCTCGGGTT
GGTTTTTCTTCGTTACTGGGAATGTTCAAGCTTTTCTTCTCTTCTTCGGC
ATTATGTTCATGGGTAATCAATTTCGAATTCTTTGCCgagaaagatattt
ttgttgATAATCTGCTCGGTTCAAAGTTGTCAatggaaattaattttctt
tttttcactgactttattttttgaggcgatttcttttgttctgagtctga
tttcgaatctttGCTGGCTCTCTGAGGACAAACTGAACGCTTCCGATGGT
TGACTGACTTAGTCTTTCTTGGCCTTGTTTTACGTCCTCTGGTAGACTCC
TCTTGAACACGTGATCCAGATCCCAATTTATTTGAGGTTGTCTTTACAAG
CTCTTTTGAATGAGATGTCTTCTCTCGAATGGTAGACATTGTGCTCGCGT
TGCCGTCTTCCTCGGAAATCACAGAAGGCTTAGGAGATTGTCCAATATTT
TGTTCTATCTGTTGTGGAGAATCGGTTCTGCCTCCTTCAAAACCTTCTAA
GATTACTGGCAGCTCGGAAGCTTCACGGTGAACATCTGCATTTTCACCAG
ATAGTAATCGTTCTAACTCCTCGTCTCCTTCCAGACTAAGAGAATCATCA
TAATCCTCAATGGACGTTCGAGATGATTGTTCGTCATCACTGCATACTGA
TGTTTCATCTAAGCCTTTGTATTCCAAATGATCTTTATAAAGTTGTGATT
GTAATTCATGGAAGCTCATATTCTTCTCTAATTCGgcgaaactgaaagaa
aaaataggTTAGGATGATCAAAGAGTAATTATCAATGTTGTCTCACTAAT
TTCAGCGATCAGACGTTCTTAAAGAGGTAAATAGTTAGCGTTATGCAAGT
GAGTAAtctaaaatttatatttctttttctaaatggTTGTGTTGCAGGAG
GCTCTGAGGCCCATTTTGCAACTATCGACCCTTTGAACGAGCACCCCATT
AGCACCCTTGAACTGACTACACAATtctcctcacatggcatggtTCATTT
GTCAAGTGAGTCGCTGCAaatgggaatcgaacctcagtcgcctgtgcagc
aagcAAGgttaatgaccactataccacggtGCCTTATAAGTTCAAGTTTA
TGACTGTAAGCTGATATCAGTGATTCTTCAATGTAAGGTAAGTGACCCTT
GCCCGCTGGAtgaaatgaattcaaaaaggttttgttttcctTCACTTACC
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ACAGACATCAAAATCTTCTACCAATTCACTGGAACGAACAAACGTTTTTG
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TTTTGAATTAAGTGGTCCGTGTATTGTGTTAAGAGTTGAAGGATTTCTTC
GTAATGGGTTCGGCACTCATCTAACTCCATATATCTATTTGAGAATTTAA
AGGAATTGAGTTGAAGTATGCTGGATATTTTCATATCAAGCTGCTTTGCA
TACTTATCTTACTCCATCCCTGATATTCATAAATTAAAACGTTTAATACG
GAAGCACCCCAAATAGTccgggcgtttgccactagttttattgcttaaat
ttaaaattgatggcAAACATCCGtttttttATGGGTGTTTCCGTTTAAAA
CATTACGTACTCACAAATTAATGTTTTGCTACGTCTCTGGCGAAATCAAC
CTGTAAATTAGTTGTGTGGTGGAAGGGTGCAGGGGCGGTGTTAaaaagta
agtctgcgaccgcagtcggaggcgacccgaaggctcctcttttgatagct
atctatccgaaggtaggggagggcgccactctttctcacTGGATttttcc
acttacccttgatccttctcttaattgctgagcatatcaagcagagaggc
atcaggtaccattttgagaatctttggtatgacccggctgggggttgaac
ccacaaccttgtgaaccgtagccggatgttataccactgcactacggtta
CTACATTGCACATTGCACATTGCACAATGTTTAGTCAATCCACCATGCTA
TCGCCGTCAATATTTCCTGTTAATAAAAGGACTGCTAAGGTCGAATTCAT
CTCAAACTGACCTTAATCTGAGAAAGCAATAAGCCTCTTGTAAATCTTCC
ACATCCGTCATTCGGTGCACCCCTTCACTATCTTCTTCGATTCTCAGCTC
ATGATCCTCTGTTGACAATCGGAAATTCTCATCATAAGAGATGAGATTGT
GAATCAAAGTGTTCAATTCTTGCCACGTGTTTTTGTAAAGGGATTCGTTA
CCAAGGTGAATTGCTTCTTCTTGGACGAGAATTGAATGTTGTCGAAATGG
GGAAAGTGATGTCTGACTTCCTGAAATTAGATTATATATAAAATTCTTGT
TTATTTTGCGATCGCAGTGATTGATAATTAGAGGCAACCATTGGTCACCT
CTTGTGttaactaccttatcggccctttttacgccggtcctaatttaacg
ccggcccttatttctattatggttgagttacaggaggctctgggagccca
ttctcgcaactatagatgctttgagtaagcatcccgtcagcaccttgaac
tgactacccaattcccctcacatggcatgcaatcatggacaaaagatttg
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tcccaagaggttctgggtgctttaCAAACCCATTCAAATctgttcaaagt
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ttacaccagtatcaaaacgctgattttttgcttgtggttccttcaaaagc
aattcaaaagcaattcaaaagcaatgcaacgactttgaaagtgtttttct
taacttccctcctttttcagacacattgaagagtcattttgctctatttc
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gagtgggaatcaaACCTTGGTCGCCTGcacaggaatcaaggttgatgtcc
actataccacaacgcctTTTTTCATTATTACCACAACGCCTTATTTCATT
ATTATCACGCCTAAgctcaatgtttttcatttttagcccggccctaattt
aattcTGACCCCTTatgccggcccttattacgccagcgGCaaaaaaaaTA
ACgtcaataagggccggcgtaaaaagggccgataatgTATCTACCGCTGT
GGGCACGAATACATCATTTTTTGAGTCTTTTAAGGCTTTTTTGGCCAGGG
CTTGAGCCaggactaattcagacataagcaaaagaagcaaaaagttATAA
CATGGCCAAATTGATATTATCCTGTTACAATTATTGTTTTATTATAAAAC
ACCAATATTTGTATTACTTGATTATAAACGACCCCAGTCTAAGATTTAAC
CCACAacttatcaacggcttttttcGTTATCATATCAAGAGTAGTGCTAG
CATTTTTCATCTCAACTTGTTTTAAATAGCATATCAACTTCGGGTATCTT
TTTCCCCTGTCAGCACATTTgtccaaaagaaaaatgaaacaaatatctta
cCTTGGAAGTCTTTAACATCCATACTATTTTCTAAACTCGATGAATTTGC
TGAATCAACATAAGAATTCATTACTTTACTTCTTTTAAACTAttctttat
caatgttttttattaaaatctcaatAAAATTGGCTTTCTATCAATTTTAT
CGAGAAATAAGTGAGTACTACTGACGCTAGTAACCGCACTTTTCAGAATC
TAAATTCCTACCTAATCTAAAATGAATCGTGTTATCCTTTTTATCgatct
tgaaataaaaatatttgacgtcagatATTATTTGATAACGTcacttttgt
ttaaaaactaCATTATCGTTAAAGGTTGGCTTACATCTAGACAAGAAGAC
TTCttcttctggctgaactttgctttctgataattttttttgatttcttg
atGATGTTAGcaaaaaaaagcagaaaatggAATGTTTGCATTTTCTGTCT
ATCGACCCCTTGCGACCCTTCTGACGAACTTTACTCATTTCAGACGGTCT
CTTGTGTTGCGTTCCACAGTGAGGAGCGGCAATCTTGTGTTTTGATCGAA
CCATCTCTTAGGTGCCTTCCTCTTGGTCTCTTATTTGCAGAATCTTGCTT
AAAGCTTTGGTACACAAGCCATGGGAACCCCTGACAGCTTAGAGATCGTC
GTTAACAAAGGTGGTTTTCGACTCAAAGGACCATCTCTTTGGTGGTCTTC
CTCTTGGTCTTTTACTCTAGTGAAACCAGAGTTTTCTCTCTCCATTTTTT
AGGGGTGTGGTTGAAAGTTCGATCAAGAGAGTTCAGCCTGTTATTTACCA
TAATGCAGTGTTCCAAAATGGTAAGTTAGTTTAATTACTCTGATTTCTTC
TTGATAAAGATCTGTAAAGGTCGATGTGTTTTACGTTGTAATATCTCTGT
TCACACAATCATTGGCTACAGTATGTTTGATTCTTTAATGATTTTGTATG
CTGGTgtattttttaaaatgtttttttgctcaaaaactCATTCAAGCAAG
TATGAAAACATTTTCCGTTCTATCTCTTATTTCACACATAAGCCGAACAG
AGAAATTTCTCAGATTTTTTACTCTTCATCAAAATTAGTACGGTATATAC
CAAAACACGAATTCGGCTTTTAAGGCTATTGGGAGTAAAGAAGGAAAGTC
GCTCTGTGCCAATGGGTTCTCTCTGGAAACCTGACCTTGTGGCCTAAATT
ATTTTCTAGGTTTCAATATCATGAGTTTACTATGGCCACCTGGCACCTCC
TTTACTACTGTTGTTAGTACTAGTTACTACCCACCTGGAGTGGTCCAGCA
ACAGCCTGGTATGTaccagcaacaaccagcagggtaccagcaacaaccag
cagggtaccagcaacaaccagcagggtatcagcagTCTGCTGGGTACCAT
CAACCTCAATACCAGGGTAATGCACCACCACCTTATCAACAGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000358_pilon:36472..44366+ >XLOC_029537 ID=XLOC_029537|Name=XLOC_029537|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2040bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000358_pilon:36472..44366+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGAAGCGAGTGATGGCAGGTGCACCTGGACCCACCACTTCTGCCGA
AGTATTGATCTCACTTTACAACAAAGCACAATTTGTAAGCAACCAACCTG
AAGGCTGGATAGTTGATCAAGGCTCTGGCAAATTGCGTTGTTTCAATGAT
GCAGTGAATGTAATGGTTCATAGTGCTGAGAAAAGAATTATGGGTCAAAA
GACATTCATTGAGATGAAGAAGCGAGTGATGGCAGGTGCACCTGGACCCA
CCACTTCTGCCGAAGTATTGATCTCACTTTACAACAAAGCACAATTTGTA
AGCAACCAACCTGAAGGCTGGATAGTTGATCAAGGCTCTGGCAAATTGCG
TTGTTTCAATGATGCAGTGAATGTAATGGTTCATAGTGCTGAGAAAAGAA
TTATGGGTCAAAAGACATTCATTGAGATTCGAACGCAAGCTGATTTAGAC
GCCTTCATGCATCAAATTCGCTCCAAACCTCTGTTAACGACAGCTCTTTG
CAGCAAACCGTACTCAGTAAATCGAGACCGTTACCAAAATGAGTCAGCCA
ACGTTGAAGATACTCAGCACACGGAAGAATATGTTGCCATGGTGAATACA
GCTCATCCCCAGATTTCCCAAATGTTCCAAGAGGCGTACGATAAAACATC
ACAATTGTTAAGAGAAGACAAAAAGTTTAGAGTGACGATTCGAACGCAAG
CTGATTTAGACGCCTTCATGCATCAAATTCGCTCCAAACCTCTGTTAACG
ACAGCTCTTTGCAGCAAACCGTACTCAGTAAATCGAGACCGTTACCAAAA
TGAGTCAGCCAACGTTGAAGATACTCAGCACACGGAAGAATATGTTGCCA
TGGTGAATACAGCTCATCCCCAGATTTCCCAAATGTTCCAAGAGGCGTAC
GATAAAACATCACAATTGTTAAGAGAAGACAAAAAGTTTAGAGTGACGAT
CTCACTCAGTGAATCGATCAAGACATGGTTCATTAATAATGTTCGAATGC
CCAATCAAACAGATTCGGTGACTTATGCAACACATTGTGATCTTTACTTA
GTGAACGGTGTTGAGGAACCAACATTTTTCGATCGTTGTTGTGCATGTGA
AGTGATCACGCAAAAATGCTTCTGGTGTGTTTGCTTCCCGCTGTTCTTAT
TGTGTTTTGTACCCTTCCACATCTACAAGAAGTGTGTACTATCTCACTCA
GTGAATCGATCAAGACATGGTTCATTAATAATGTTCGAATGCCCAATCAA
ACAGATTCGGTGACTTATGCAACACATTGTGATCTTTACTTAGTGAACGG
TGTTGAGGAACCAACATTTTTCGATCGTTGTTGTGCATGTGAAGTGATCA
CGCAAAAATGCTTCTGGTGTGTTTGCTTCCCGCTGTTCTTATTGTGTTTT
GTACCCTTCCACATCTACAAGAAGTGTGTACTGGGTGTGGTTGAAAGTTC
GATCAAGAGAGTTCAGCCTGTTATTTACCATAATGCAGTGTTCCAAAATG
GGGTGTGGTTGAAAGTTCGATCAAGAGAGTTCAGCCTGTTATTTACCATA
ATGCAGTGTTCCAAAATGGTTTCAATATCATGAGTTTACTATGGCCACCT
GGCACCTCCTTTACTACTGTTGTTAGTACTAGTTACTACCCACCTGGAGT
GGTCCAGCAACAGCCTGGTATGTaccagcaacaaccagcagggtaccagc
aacaaccagcagggtaccagcaacaaccagcagggtatcagcagTCTGCT
GGGTACCATCAACCTCAATACCAGGGTAATGCACCACCACCTTATCAACA
GTGAGTTTCAATATCATGAGTTTACTATGGCCACCTGGCACCTCCTTTAC
TACTGTTGTTAGTACTAGTTACTACCCACCTGGAGTGGTCCAGCAACAGC
CTGGTATGTaccagcaacaaccagcagggtaccagcaacaaccagcaggg
taccagcaacaaccagcagggtatcagcagTCTGCTGGGTACCATCAACC
TCAATACCAGGGTAATGCACCACCACCTTATCAACAGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000358_pilon | genome | sc0000358_pilon:36472..44366 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 787-1020:7662 |
| Aaloc | 718-783:7204 |
| Aaloc | 475-714:1351 |
| Aaloc | 214-474:565 |
| Aaloc | 1-213:1 |
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