XLOC_029280 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_029280
Unique NameXLOC_029280
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000269_pilon:173171..187072-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_029280 ID=XLOC_029280|Name=XLOC_029280|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13902bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000269_pilon:173171..187072- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGGCTATGGGTAATTCCTTTGTTCTTTTGCTATTTTATATTGTTCTATGT GAGGTAAAGACACTTCACAAATCAATGTACTTGCACTAAGGGATCGTCAA CAAAAAACTTTTGGCATTGGGTTGATAAGGGGGTGAGGGGGTCCAACTAC ATACCGATAAAAAAAAAAGTATTGGGACGAAAATCTTTTCAGCCAATTTC TTTCTGATTTCGTCCACAAACTCCACTGGCACTGAAAGCATACAATTTCA CTTTAAATTAATTTTGACCTATTTCTATCTCTCTAAAATGACTTATTTCT ACTCAAAAAATAATGAAAGGACCCAGGACCAAATGAAGGTCCCAATTTAT TAATATTAAAGAAGCCTAGTTACAGATTATTTGATTAATGTCCCCTTCTG CTAAATGGTGCACTCAAATAAACCCCTCCTAAAAAAGAGATAATGCAGAA TAATCTAAAAAATATCTAGATATAGATACATCTTTGAAATTATCCAGGTA TATTACCTACCATTCTACGTGGTTGTCCACGGCACAAATGATTCAAAATT ATCCCAGAATTTACTCATTGAACATGTTTCCAGATGTTTCTGAAATATCT AATCTAATATCTCACTACTTTGTTACTAACCATTTTCTAATGGTTCATGT AGCTAACTACAAACTTTTTTTTCTTTTAGATACCGATTGGATCACCAGCC CCACGTGTTTTGCAAATCAGAAGAGTAAGAATTTTTTTTATATTAGTTAG GTGACCAGTAAAATATGAAAATCAACAACTAAGCCTGGCCTGGACTCTCT TGCAATCAATCTGACTCTCTTAATATCCAAAACAACAAGTCTGAAATTAT CTGTTTGTCTAGAAATCATATGTCAAAATCACGTTTTTGAGCCACCCCGC AAAGTTTTTAGCATTTGAGTGCCTGATAAGAAAAATCTAGTATGTTAGGC 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CCTCTTGGCCAGTTAGGTGCTCGAGCAATTTTGTAAATCTTCTTAGAGAT TTTCAAGGCCAAATTTGTTGTAAATATGAAATTAGTTTGTTTTTAATTTG CTTAATGGATTTTTTCATGACTTGCAAACCTAGTTATTGAGTTTTATTCT AACAGATCAGGAGGTAAATGAACGAATCAAAATTTGACTCTATATAAAAA GCATGGAAATGCTTGGAAGATTAAATTATTTTTTACTTTAGTCTATCATC CTCGATCATGTTTTTGTCTTCCTTATGCGAAAAATATTCTTCTTAAAATG AGACTTTACACCAATAATTGCACCAATTATAATTTTTCAAAAAAAATAAA GAATTGGTGGTCATCTTCCTTTGTTCGCTAAGAAGAGAAATTGGAGGGTC ATCCCGATTGTGGCCTTGTTATGTGGTTACTATTTTAGTTGAGGGGTTTA AAAAGTTTATAAGCTTTTGGTTGCTTTTATCATAACATCCTTATGCACGT GACTATAAGAGATAAAAAAAGTTGAACTGTAGTTACATAATCCCTTGTGG CGTATTTGGCAGAAGTGTTATAACCTGTTTCAACCGGAGGGAAATTAGTC CAATCGGATGAATTTTAATTTCATGAACAGACTCCTGAAAACCCAATTGT TTTTGATAGCATTATTGGTCAAAATCTTGAAAGGACTGTTTTATTGTCTG ATTCGCCGACATTTATAGATATATTTCCTATATCTGAGGGGGTCTATCTA ATAAATATGCATTACTAAAAATAGACAAAAAGAACGACAAATTTCATATT TCACTGTCCATAACCCCGACCGAAAGTGACTGTACCAGTGCCACCCCTAT TCGGATTCATTCCTCTTTGTTTATCACGGGAATTAACTATGTAGTTAAAA AGAACGACAAATTACGCATGCGTGTTATTAATGCAGTGGTGGTCCATACA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000269_pilon:173171..187072-

>XLOC_029280 ID=XLOC_029280|Name=XLOC_029280|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2628bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000269_pilon:173171..187072- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTGGCCTTTGTACTCTATCCATACGTTTCAAGTGTTTCGAAAGCTTTTCG
GGTTTTGAGATTGAGAGCTAATCGGAATAGGCTAGAAGTAAAGATGGCGG
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ACTGAGGAAAATATTGTAAAGGATGAGTTATCCGTTGCTGATAAATTGTT
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ATGCTGTTTTTTCTCCAGTCATCCAAGCTAGTTCATTTCAGCGTCAACGA
AGTGGAAGTTTGAATGGTTACGAATCAACACCAGAATCATCAACAATTCA
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ATGATGAAAGAGTCTTAAATTTGAGTCCTCATATCAGAAGACCTCGCACA
CATTCATTTTCAGACAGTTTGAATGTTGACTGCAGCTCTCCTTCTCCATC
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TTCGGGTTTTGAGATTGAGAGCTAATCGGAATAGGCTAGAAGTAAAGATG
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GGAAACTGAGGAAAATATTGTAAAGGATGAGTTATCCGTTGCTGATAAAT
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ACGAAGTGGAAGTTTGAATGGTTACGAATCAACACCAGAATCATCAACAA
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TCTGATGATGAAAGAGTCTTAAATTTGAGTCCTCATATCAGAAGACCTCG
CACACATTCATTTTCAGACAGTTTGAATGTTGACTGCAGCTCTCCTTCTC
CATCGCCGATACCGATTGGATCACCAGCCCCACGTGTTTTGCAAATCAGA
AGAATACCGATTGGATCACCAGCCCCACGTGTTTTGCAAATCAGAAGAGA
AGAGAGTGTCGATGAATTAACAAGGGAAAGAAACAAAGAATGGAAGAGAG
TGTCGATGAATTAACAAGGGAAAGAAACAAAGAATGGGAAAATAACTCTG
CTATAAATTTGTCAAGAAGCTGGGACGAAACCTCATGGCTGGGAAAATAA
CTCTGCTATAAATTTGTCAAGAAGCTGGGACGAAACCTCATGGCTGGGTG
ATAAGAATTTCGCAGTGACGAATGAGCAACGTGAGAAACGTGACAGTTTA
GATGAATTTGTTTTCAATACTGGATCCATCAGCCCCTCCCTATCCTCTCC
TGTACGAATCATTGATAAAGGTGATAAGAATTTCGCAGTGACGAATGAGC
AACGTGAGAAACGTGACAGTTTAGATGAATTTGTTTTCAATACTGGATCC
ATCAGCCCCTCCCTATCCTCTCCTGTACGAATCATTGATAAAATCCAACA
CAATCGAAGTTTAACACCAAGTCCCATTGGTGTACCGATTAGCCCCAATC
AGAGGCGTTTCAGATCCAACACAATCGAAGTTTAACACCAAGTCCCATTG
GTGTACCGATTAGCCCCAATCAGAGGCGTTTCAGAAGAAGCCTCAGTCCA
AGCAACCTCCGACCCAGTATCCTTTCGTCCAAAAGAAAATAAGAAGCCTC
AGTCCAAGCAACCTCCGACCCAGTATCCTTTCGTCCAAAAGAAAATTGGA
TCCAGACGATGATTCCATGGGATCACCGGCTAAACGATCTTCACATTTCT
ACCCTCCGCCATCCAGTCTAAACACACACCAGTTGAATAGTCATAGTATT
TCGTCATGTTCTTCGCCCGATCATCCATCAGACTCGAATTCAAATCACTG
CTCGTGTGACGAAGATTCTGGGTCTGAACCTGCTTTCATAGCTCACTCTC
ATTCTTCCTCAACGTCACATACGCCGGTTTCCAATCCCTTATCATGTGAT
ACGCGGACCGGCTTTGCGTTTGTGAAACCGCGCTACGTAGCGCCGCAATC
TCCGTTAGCGGCTGGTCATAATTCGCACCCTCCACCGTCGAGTCATGAAG
TACGAAAATCGACCCTGGGACCGAGTAGTTATACGTTCGCGCCGGTTAAA
GAGAGAAGTTAATGGATCCAGACGATGATTCCATGGGATCACCGGCTAAA
CGATCTTCACATTTCTACCCTCCGCCATCCAGTCTAAACACACACCAGTT
GAATAGTCATAGTATTTCGTCATGTTCTTCGCCCGATCATCCATCAGACT
CGAATTCAAATCACTGCTCGTGTGACGAAGATTCTGGGTCTGAACCTGCT
TTCATAGCTCACTCTCATTCTTCCTCAACGTCACATACGCCGGTTTCCAA
TCCCTTATCATGTGATACGCGGACCGGCTTTGCGTTTGTGAAACCGCGCT
ACGTAGCGCCGCAATCTCCGTTAGCGGCTGGTCATAATTCGCACCCTCCA
CCGTCGAGTCATGAAGTACGAAAATCGACCCTGGGACCGAGTAGTTATAC
GTTCGCGCCGGTTAAAGAGAGAAGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_029280XLOC_029280-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000269_pilongenomesc0000269_pilon:173171..187072 -
Properties
Property NameValue
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