XLOC_029276 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_029276
Unique NameXLOC_029276
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000269_pilon:285918..297280-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_029276 ID=XLOC_029276|Name=XLOC_029276|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11363bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000269_pilon:285918..297280- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTCTGAGCTGTTACATTAGGTATTAGTTGGCATTTTTAGGGTTGGCTTAT GTGCTGTCCTGCTTTAAGACTTGAATATTTTTTAACCGTTTTTCTTGAAA TTGGTAGTTTAAGGTCTTAAGATACTTATGGGTTTAATTTGTGGCTGCAG GGTTTTCAATGGGCTTGAAATGTGGCTTCAATCAAAGCATATATGAAAAA AATTGTCAACTTTGAGCCGCAATTCTAGCCCAATGACCCAATAATTTTGG TTTCATTTTTGATATTTTGTGGATAAACCCTTTTGCTACGAGTTTCATCT GAAAAAAATGATTTTTACTCATTGAACAAATTTTTGGCTGCTGTTTTATC AACACAGTGTTTTTCTTGATTTGTGCCGCAATTTTGGCCCATTTTACAAA AAAAAATTTTTCAACCTACTTTAGACAGGGGGGGGGGTACAGCCACAGGG TACTAACCCATAGCCGGGTGGTGGTGTCTAATTTGGAAATTCAAAAAAGT TAGTACCCGGTACTAATTTTGGGGTGGGGTGGTATATCTCCAATTTTAAG TTAGTACCCGGTACCAATTTTAGGGTGGGGTGGGTATCATTTCAATTTTT CTTCAAGTACTCAGGCTCTGAATATGGTACATTTGTTTAATTTTTTGTCT TCAACTTTCAGGATTTTGATGAGAAAAGATTTCCTTGTTATGGCTTACAG TATCTGACAGTATTGAAAAGTTCCTCCTTCCAATTGAAGGTACTTTCCCT GCTTATCAAGTATGTAGGGAAGTTTGGAGGTTGTTAGTCTCAATAGTTTT CAGAAAGAAAGAACTGTTATGTTTCCATCAATTATTATTGTATTCAAATT CATGGGTACTTTCCCTACTTTCTAAGAGGAGAATTTTGTGACCACTAAGT TATACAAATATTGAAATAGCTAATGTAAAGAAACCTATTGTTCAAAATCA GTATTGTTTTAATTAGTGAGAAGGATAGTTCCTCTTTGATATCTCAAGTT AGAACGAGGTATATGTTTTTCATTGCCTTCTGATGAAAAGAATTACAAGC TGTCGCATCCAAAGTGATACAATCTGTCTTTTAAACAATAAAATTCTTAT CCAAACTGATGATTGTTTTTGTTAGAGGGGTTAGTTTATTTTAGTTTATT GCAGTTTATATTATACCCTATAGCTTATTTCTGTTTATATTTGTTTGTTT GTTTGTTTGTTTGTCTGTTTATGACAATTAAGACGGAGCCAGGTCAACTA AGCAAAGCCAACCAGAGCCAACAATGCAACTTTTTTCTATTTCAACTTCT TTCATAAGATTGACACAGTTTTGAATAATTTGAATAAACTATTGAAGAAG AAAATAAGGAAATCCATCCAATCCAAGCTTTCATACTATTCTTCAATTTC TATCAACTTGATTTTTACTTCTTCTGATAGATATATACTTTTATTGCCGT TATTACAGCTATATAATATTTTACTTTTGCCAAGGAATTTCGTTGTTTTA CCTTTGCAATTAAAAGTTGTGTTTGATTTAAAGAACTTTTTAGAGGATCT GAGTTAAAAATATGGTATATACAAGTCATAATAACAACAAAGAGCTGCTT TTTCTGGCTTTTGAAAGATTGGGACCATGCTTGGCAAGTTTTAAGGGTGG TGTCTCCTATTTTCCTTGGTAATTTTAAAGCCGGTACCCGGTACTAAAAA GGGGGTGGGGGTCCCTTTTTCCTTAAAAAAAAGTAAGTACCCGGTACTAA AAGGGGGGTGGGGGTCCCTTTTTCCTTAAGAAAAAGTAAGTACCCGGTAC TAAAAAGGGGGTGGTGGTACCTAAGACAATTTTTCTTAAAAATCAGGTTA GTACCCTATGGGTTAGTACCCTGCGGCTGTACCCCCCCCCCCTGCTTTAG AACCAATATTGTGAAGTTTCGTTTGAAAACAGTTATTTTTAAAAAGATAT TCAAATTTCTTTTTTTTTGCTGTTTTTGAAAACCTCACACAATTTTTGAA TGCCATCTTTTATTTTTTTCTTATTTCCAATTTAATTATAATTTTATGCA AATTTTATATTCTATGAATAATTCTTTTACTATACTTAACTTTTCTCCTT TTTATTATTGTACTGTAAGAATTTTTGTTTCGTTCCTCTAATTAGTATAA TTTTTCGCGAAGATAGCACTTTCAGCTGGGATCTGGGAGTCTGGATTGAG GATGGGAATTTGGTGGTTAGGTGGGACCTGAATTTTTAGGTGGGACCTTG AGCCCCCTTGCACACTATGCCCAAGATTGTACAGCTATGGTGAAAATTTG AAGGAGATATAAAGACCCCCATGGTTCCACTTTATACTAAGGTTTTCTGA TTCTTAGGTGCATCTGCTTTTAAAATAAAAGAATGCTTAAAACACAGCTG ATTGGCTTAGGTTTTGAAACTCTCTATTGTTTCATCAATCCTCAGTGCAC AAGCAACCGTAACTTCTTGTAATGCCAACATACCGTGTCTAATTCCGTCA TAGCGACTCTGGTCTTTTAAAAAAAATGTTCATAAATAAAACCTCCTGAG TAAGCTGTTTGAAAATCACCCTAACTACTTTGCAGACCATGTGCACTGTT CTTGTTTTGAATATTGAATTTCTGAGGATACATTCCTTAACTTCGTGTAA TGTTGACGCATTTTGTCATAGCAAAAATCCCAACAGGAGTTTTACGCTCA AAAGAAATTTAAGTTGTCTAGATTCCATGGCCTAAAATCACAAAAACCAA AAAAAATGCTTTGAAGCTCGAAATCTCCTAAGGCCCCTACTGCCACATGG TTTTTGCTGTTTTGAAGAGCCTTCAGTATGTATTATCATTTTACGAAAGA AAATAATGTGGCAGTAAGACTTCGGGCAGAGTAAAATTGACTTTTTGCAC TACTTTCTCATTTTTTGGTAATTCATAATGGCGAAGGCTCTAGGTTTAAG TGACTTGGAAGGAGAGCTTGCCTAAGCATAAGCTTCTTTAGACCTGCAGA AGACTGAGAAAATAGGCTTTTTTAGCTTGTGTTTTGCTTAGGATTGCCCT TAATAACTGCATAGCAAGCTTTTTGCAGCCTTTGTTCCTCAAATTTTGTT CTATATTATATCAATGAAAAAAGCAAGTCTGCTGAAGCCTTCTATTGTGA GATGCTTCTTGAAATTGCCATCTCGTCATTCAATTACTCTCGGGTACCTA ATAGCCGGGGGGATTGGAATAAGTGAGGGGAGGTTGGAAAAAATCTCAAA ACTTAATAAGCGGGGGGGGTTGGAATAAAAATGTCCTGGGTGGAAAATTT TCGAAAAATTAATTAGCGGGGGGGAGGCTATTAGGTACCCGAGAGTAGTC GAATTTGGACCATAAAGCTGGGGAAAATAAGATTTTCGCAAAATTGTTTG TCGCAAAAAATAAATTCAGACAGATATCTGGAATTGAAAACCTATTGTTT TATTTGCGATAGGGCGAAAGAAATAAGTGATGAAAATGAAAACGTTTTCA TTCTATATTGTTTATTTTTTTTTTACATTAAAAAGAACAATAGATTCACT CAGCTTAAATGCCTGAATTTTTGTACTGCGTAACATCGTGAGTTTTCGAT TGTTTAGAAAGCCCTAGAGGTTGCTCCTTCAGGATACAAAAAATAATTCA CGAGTATATTTTTTTGGAAAGTTCAGGATTAGATTATTAGATTTTCCCTG GTTTATGGGTACAAAAGGTCTAAGAAAAACTTAAAAATAATGAATGAAAA ATGAAATTTTCGAAACAACTTTAGATTAGCCGCGTGATTAAAAATGTTTT AACTTATTATTTATAGGGAAACGAAACAATTAAATCCCAAAAACATGCGA TTTTATGTATATTTTGGTATTTCAGGGTTTGAAAACAGCACCGAAAGACA TTACTGGTGAAACCTAAATTATATTATTTCTAATTATCATCTACTCAAGG GTTCGAAATAACCGTTTAACATCAGACATTTTCTGAACCAAATTGCTTCT GGTCTGGCCAAAAATCATAGTTTTTAATCTAAAGCAAGACTGGTCTGGTC CACTCGAAATTTTTACTACTATTTCATTATCAGAATATGACCATATAAGA TACTTTAGATGGGATAGCTTTTATGTGTGGTAAAGAAAGAAGAGTGAGAT AGGGACACTAAAATAAACATTTTCAGCCATGCTGAATTCTATCTGTCAAA CTGCTACTTTTGGGATTCTGCCCAAGTTTCTCACCTCTTAGATACTACTG CTACCTTGACCAGACTGGCTACCTTGTTTCAATGAGCTATTCATCTGAGC TAAGTTGGCGTCGACTGAGGATCAAACCCTAAACCCAAAACCCTTGGATT GTAGTGCAAATGATCTACCTTCTTGTCAAAAAGTCTAGATTGGTATAATC AACATGCCTGATGAAAGTTTTCCTTTTAACTCTAATTTTGTAGGTTGCAC TCGATAAAGAGTATGCCATATCAATGCTGGATTTACACAAACAAGCATCA AGGACTGAAGATATTGTCGGATGGTAAGGCCATTCGTTATAAGATAATTT ACAATGTCCGTCTGTATGTTTCTTCACACTGGCAATAAGATTTTCGACGT TAGAATTTGAACAGTTTTCCAACACTTCAACTTCGAGGGGGTCGTTTCGG CAACTGAGATTATATTTAAACTTTATGAATTTCTTTTTGTAGGTTTGCTA CAAGTGACGACGTTACAGACCATTCTACATTGATTCACGAGTATTATTCC ATTGCTACTGATAATCCAATTCACTTCACTGTTGACACACAAATGAAAAA CGGTAGAATGGCTATGAAAGCTTACGTCAGGTACATAGTTTGAATTTGAC TCTTTTTTTAGTATGGAGCTTTCCTCTAATAACGCGGGCATCATAATAGT GAGAGCCACTATGTTCTGAAAACATCCTTGCAGTGCACAGACTTGATAGA AGCAAACTAACTTTTTTAAATAAGATCACAAAAATGAGTGGTGAGAAAGT TTTGACCATTCTGCTAGTTCCAATGTGACGTTATCACCTTTGCTGGGGCT TGAAAATGAAAGTAAAAATTAGAAGCTCAAATGAAAGATATCCAAGGATT CCAAAAAAGATCATAAAATATATATCTGAAATCGATATTTGAGAAGCTAT TAAAGAAAATAGCCCAAAAATGTCATAGATGACGTCATCGATGTTTTTTT CAAACAAAAACATTATTTATAAGAATGCCCACGATTAAGAATGGTTCAAT TTTCAACGAAACTGGTTTTGGTAGCCGGAACTTTCTTAAAATCGCCGGGA AAATGATTTTTCTTAGATCACTAAGAAACCGTCCGCTCGTCCGCTCTTTG TTCGCGATCTTTCCATTATCGCTTTAAACTACAGTCGACTTTCCATAACT TGAACCTCCACTCGATTATCTCTATAAACTCGAACGCTTTTTCCGGTCTC TTGAGGAGATTCTTAGGCTATTCTCTATAACTCGAATTTCCGTAACTCGA ACAATTACTCAAAAATCTTTCGATTGGGTAGGAAATAAGAAATCTAGGTT TCCCATCCATTTTTCACAAGAGGAACACTTTTATACCGTTTTTAAATAGT TTTGCTTTTGTTTTCTACCTTTTATACATTGAACTCAACTAAGTTAGTTT AACATGCTGAGTTTGAATCGAGTTTCTGCAACCCTAGCGGTGTTGCTTTT GTTTATTCCCAAAACTTCGATTTCCAAAAAATCCTTTCATATGGGGCTCC TTTCCTCTAAAAACCAACGGAAAGCCAGTGTGAAACAAGCTTCATGTTTT CAAGCTTACTTACCTCTATGCCATACATTATCTTTCCTTTTTCGTTCGAA CATTTTCATCTTCATTCAGCATTGTTTCTGACTATGTATCTCAGGTAGGT CCATTCAGCACGTTGCTTGTTATTTTTCAGTTCGACAATGGGGGTACCTG GAGGAACAACTGGTCTCATTTTCACTCCTATTCCACATCAATCAAATACG AAAAAGCTGAAGCTGTCAGGTTAGTTTCAAGTAATCATCCCATAGTGTGA CACCGCCTATTTTTGATCTAAACAACGGTAAAATCAAGCAATTAGCGGTT TCCATAACTGAGAAGCTACCTTGACCAATCCCATGCCGAGGGTAGGGTTC TTGTAGCAAGTCTTACTTCACTTGGGGTAAGGCCAACACAGCGCACCTGG TTGCAAAGACCTGTGGTTGACCCACTTATTGCAGAAGTGCTTACTGGTAA CTCCGACCGAAATCGGATAGAGAGCTGAGCTGGCTCTGGTCACGAGCTGT ATATACTGTAATATAGAGAGATAGATGATATAATATCACACCTGCGGGAA TCGAATCTGGGCCGTTCGCTTGGCGACACAGTGGCTAGGACCTGGGCCGA CCTGACGGTAATACAGGCTTCAGAATTGGGGTGGCTGTTCGATTCAATGT AAAGAATTTTGCAATTCATCTTTTTTTAATAGTGGAGACCTTCTCAAGAA TAAGGGTGGATCAAAGAGCCCAGCTGTTCTACAGAACGGTGTGCACCACG TATCACGGTATACAAATCACTTTAAAGCTCCTTTCTTCAAATTGACAATT TCTAATATCTATTCCAAAGCTTTTTAGTTTTTTTCGGTTGTGGCCTCTGG GGTAGCTTCTAACGTAAACTGCAGAAATGAAATTGAAATGAAATGAAATT AGAAATTAGAACGCGTTTCCATATTTTCTCGTAGATCAACAGATGTTTGG TTGACCGTCTAAAAGAAACTTTACAATACGTGAAAGAAGTCGTGGTGAGT GGTCATGTTCTAATTATTCAGTCGATGTTTTACATTAGAACCTCTTGACA AAAGCTCCCGTTCCAAAGGTGCGATTTTATTGGTTTAGCTTCATCACGCA CGAACAGTACCCCGTATGAAATCTCACTCTTTCGCATTCTTCTTTATAGA ATGGTGATAGAGTAGGGGATAACGAGATCGGACGAAAATTGATGTCAATC GTTGGTTCCGTTCCACAAATGGAAGCGTCGCAAGTCGAACAAATGATGAA TAATAATATGCAGGTTTGTGTGAATTATGTGAAATGTTGTTTGAAATGAC TTCTCGGAAGTCTCAGCTGCCTAATAAATGGATAGGTTGGGGAAAAATGG AGCGGGGGTACTCAGGGTTTGCTTTGTTTTGGTAGGCTGACGAATGAAAA AATTAACTCTGGCGATTTCTAGATTCTAGGCCGGCGAATTCTTAGCAAGC GCGGTGTATTAATTAGCGTAAATATGTACTTGATGCGGTGAACCGAACTT TTCGACGTTCTGCTATTCGATTCGCTCTATTATTCGATAACATTGAAAGC CAAGGTCAACATGAAGCACTCGTAAACGACGCTCTAAAATTCGAATTCAA TTCTTTAAAGAAAACTTGTAGGCAGTAGAGACTGCAGTCTGGCTGTCTGA GCTAATTTATTTTTCACATTTCACATTTTCAGGATCTGCTGATGGTATTA TACTTGTCCAGTCTAACGAAATCCCAACTTTCCGTTGGTAACAAACTCAA TAGCATCATGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000269_pilon:285918..297280-

>XLOC_029276 ID=XLOC_029276|Name=XLOC_029276|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1672bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000269_pilon:285918..297280- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCGTCGCAAAATACATGTGTGAAACAGGTTCTCATTCACCCAACTGC
TTTATTCACGATAATCGATAGTTATGAAAGGAGAAACGAAGATGCAAAAA
GAGTAATTGGAACCCTCCTTGGTAGAGTCGAAAAAAATGGAGTTGTTGAA
GTTACAAACTGCTTCACAGTCCCTCACGTAGAAACACAAGATGAGATGGC
GTCGCAAAATACATGTGTGAAACAGGTTCTCATTCACCCAACTGCTTTAT
TCACGATAATCGATAGTTATGAAAGGAGAAACGAAGATGCAAAAAGAGTA
ATTGGAACCCTCCTTGGTAGAGTCGAAAAAAATGGAGTTGTTGAAGTTAC
AAACTGCTTCACAGTCCCTCACGTAGAAACACAAGATGAGGTTGCACTCG
ATAAAGAGTATGCCATATCAATGCTGGATTTACACAAACAAGCATCAAGG
ACTGAAGATATTGTCGGATGGTTGCACTCGATAAAGAGTATGCCATATCA
ATGCTGGATTTACACAAACAAGCATCAAGGACTGAAGATATTGTCGGATG
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ATTATTCCATTGCTACTGATAATCCAATTCACTTCACTGTTGACACACAA
ATGAAAAACGGTAGAATGGCTATGAAAGCTTACGTCAGGTTTGCTACAAG
TGACGACGTTACAGACCATTCTACATTGATTCACGAGTATTATTCCATTG
CTACTGATAATCCAATTCACTTCACTGTTGACACACAAATGAAAAACGGT
AGAATGGCTATGAAAGCTTACGTCAGTTCGACAATGGGGGTACCTGGAGG
AACAACTGGTCTCATTTTCACTCCTATTCCACATCAATCAAATACGAAAA
AGCTGAAGCTGTCAGTTCGACAATGGGGGTACCTGGAGGAACAACTGGTC
TCATTTTCACTCCTATTCCACATCAATCAAATACGAAAAAGCTGAAGCTG
TCAGTAGTGGAGACCTTCTCAAGAATAAGGGTGGATCAAAGAGCCCAGCT
GTTCTACAGAACGGTGTGCACCACGTATCACGGTATACAAATAGTGGAGA
CCTTCTCAAGAATAAGGGTGGATCAAAGAGCCCAGCTGTTCTACAGAACG
GTGTGCACCACGTATCACGGTATACAAAATGTTTGGTTGACCGTCTAAAA
GAAACTTTACAATACGTGAAAGAAGTCGTGATGTTTGGTTGACCGTCTAA
AAGAAACTTTACAATACGTGAAAGAAGTCGTGAATGGTGATAGAGTAGGG
GATAACGAGATCGGACGAAAATTGATGTCAATCGTTGGTTCCGTTCCACA
AATGGAAGCGTCGCAAGTCGAACAAATGATGAATAATAATATGCAGAATG
GTGATAGAGTAGGGGATAACGAGATCGGACGAAAATTGATGTCAATCGTT
GGTTCCGTTCCACAAATGGAAGCGTCGCAAGTCGAACAAATGATGAATAA
TAATATGCAGGATCTGCTGATGGTATTATACTTGTCCAGTCTAACGAAAT
CCCAACTTTCCGTTGGTAACAAACTCAATAGCATCATGTAAGATCTGCTG
ATGGTATTATACTTGTCCAGTCTAACGAAATCCCAACTTTCCGTTGGTAA
CAAACTCAATAGCATCATGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_029276XLOC_029276-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000269_pilongenomesc0000269_pilon:285918..297280 -
Properties
Property NameValue
Aaloc757-837:82
Aaloc643-756:615
Aaloc592-642:821
Aaloc505-588:1084
Aaloc478-501:1571
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Aaloc196-273:3121
Aaloc1-195:11364