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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000049_pilon:1111139..1112364+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_027230 ID=XLOC_027230|Name=XLOC_027230|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1226bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:1111139..1112364+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCTTCAACGTCTCATCATGGCACTTCAATGTCTCATCAAGGTGCTCCTAC
GTTTAATCATGGCGCTCCAACGTTTCATCATGACGCTCCTACGTCTCATC
AAGGCGCTCCTTCGTTTCATCAAGGCGCTCCTTCGTTTCATCAAGGCGCT
CCTTCGTTTCATCAAGGCGCTCCTACGTCTCATCAAGGTGCTCCAATATA
TCATCAAGGCGCTCCAACTTCTCATCAAGGTGCTCCAACATATCATCAAG
GCGCTCCAACATATCATCAAGGTGCTCCTGCGTATCATCAAGGTGCTCCA
ACATATCATCAAGGTGCTCCTACGTCTCATCATGGCGCTTCTACGTCTCA
TCATGGCGCTCCTACGTCTCATCAAGGTGCTCCAATGTTTCATCAAGGTG
CTCCAATGTATCATCAAGGTGCTCCAATGTTTCATCAAGGTGCTCCAATG
TTTCATCAAGGTGCTCCTACGTCTCATCAAGGCGCTCCTTCATCTCATCA
TGGCGCTCCAATGTATCATCATGGTGCTCCAATGTTTCATCATGGCGCTC
CTATGTCTCATCATGGCGCTCCTGCGTATCATCAAGGTGTTCCCATGTTG
TATCAAAGCAATCCATGGTCCCATCATGGTTGGTCACACACCTACCCTTT
GACCTCACAACTCAACGCTCCAACGTCACCCATCAATGGTCAGACCTCAc
ccatcaatggtcagacttcacccatcaatggtcagacttcacccatcaat
ggtcagacttcacccatcaatggtcagacttcacccatcaatggtcagac
ttcacatatcaatggtcagacttcacatatcaatggtcagacttcacgta
tcaatggtcagacttcacgtatcaatggtcagacttcacccatcaatggt
cagacttcacgtatcaatggtcagacttcacgtatcaatggtcagacttc
acgtatcaatggtcagacttcacgtatcaatggtcagacttcacgtatca
atggtcagacttcacacatcaatggtcagacttcacacatcaatggtcag
acttcacacatcaatggtcagacttcacacatcaatggtcagacttcaca
cATCAATGGTCCGACTTCACCCATCAATGGCCCGACTTCACCCATCAATG
GCCCGACTTCACCCATCAATGGCCCGACTTCAcccatcaatggtcagact
tcacacATCACTCCTGTTTTGGTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000049_pilon:1111139..1112364+ >XLOC_027230 ID=XLOC_027230|Name=XLOC_027230|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2116bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:1111139..1112364+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCTTCAACGTCTCATCATGGCACTTCAATGTCTCATCAAGGTGCTCCTAC
GTTTAATCATGGCGCTCCAACGTTTCATCATGACGCTCCTACGTCTCATC
AAGGCGCTCCTTCGTTTCATCAAGGCTTCAACGTCTCATCATGGCACTTC
AATGTCTCATCAAGGTGCTCCTACGTTTAATCATGGCGCTCCAACGTTTC
ATCATGACGCTCCTACGTCTCATCAAGGCGCTCCTTCGTTTCATCAAGGT
GCTCCAACATATCATCAAGGTGCTCCTACGTCTCATCATGGCGCTTCTAC
GTCTCATCATGGCGCTCCTACGTCTCATCAAGGTGCTCCAATGTTTCATC
AAGGTGCTCCAATGTATCATCAAGGTGCTCCAATGTTTCATCAAGGTGCT
CCAATGTTTCATCAAGGTGCTCCTACGTCTCATCAAGGCGCTCCTTCATC
TCATCATGGCGCTCCAATGTATCATCATGGTGCTCCAATGTTTCATCATG
GCGCTCCTATGTCTCATCATGGCGCTCCTGCGTATCATCAAGGTGTTCCC
ATGTTGTATCAAAGCAATCCATGGTCCCATCATGGTTGGTCACACACCTA
CCCTTTGACCTCACAACTCAACGCTCCAACGTCACCCATCAATGGTCAGA
CCTCAcccatcaatggtcagacttcacccatcaatggtcagacttcaccc
atcaatggtcagacttcacccatcaatggtcagacttcacccatcaatgg
tcagacttcacatatcaatggtcagacttcacatatcaatggtcagactt
cacgtatcaatggtcagacttcacgtatcaatggtcagacttcacccatc
aatggtcagacttcacgtatcaatggtcagacttcacgtatcaatggtca
gacttcacgtatcaatggtcagacttcacgtatcaatggtcagacttcac
gtatcaatggtcagacttcacacatcaatggtcagacttcacacatcaat
ggtcagacttcacacatcaatggtcagacttcacacatcaatggtcagac
ttcacacATCAATGGTCCGACTTCACCCATCAATGGCCCGACTTCACCCA
TCAATGGCCCGACTTCACCCATCAATGGCCCGACTTCAcccatcaatggt
cagacttcacacATCACTCCTGTTTTGGTTAAGTGCTCCAACATATCATC
AAGGTGCTCCTACGTCTCATCATGGCGCTTCTACGTCTCATCATGGCGCT
CCTACGTCTCATCAAGGTGCTCCAATGTTTCATCAAGGTGCTCCAATGTA
TCATCAAGGTGCTCCAATGTTTCATCAAGGTGCTCCAATGTTTCATCAAG
GTGCTCCTACGTCTCATCAAGGCGCTCCTTCATCTCATCATGGCGCTCCA
ATGTATCATCATGGTGCTCCAATGTTTCATCATGGCGCTCCTATGTCTCA
TCATGGCGCTCCTGCGTATCATCAAGGTGTTCCCATGTTGTATCAAAGCA
ATCCATGGTCCCATCATGGTTGGTCACACACCTACCCTTTGACCTCACAA
CTCAACGCTCCAACGTCACCCATCAATGGTCAGACCTCAcccatcaatgg
tcagacttcacccatcaatggtcagacttcacccatcaatggtcagactt
cacccatcaatggtcagacttcacccatcaatggtcagacttcacatatc
aatggtcagacttcacatatcaatggtcagacttcacgtatcaatggtca
gacttcacgtatcaatggtcagacttcacccatcaatggtcagacttcac
gtatcaatggtcagacttcacgtatcaatggtcagacttcacgtatcaat
ggtcagacttcacgtatcaatggtcagacttcacgtatcaatggtcagac
ttcacacatcaatggtcagacttcacacatcaatggtcagacttcacaca
tcaatggtcagacttcacacatcaatggtcagacttcacacATCAATGGT
CCGACTTCACCCATCAATGGCCCGACTTCACCCATCAATGGCCCGACTTC
ACCCATCAATGGCCCGACTTCAcccatcaatggtcagacttcacacATCA
CTCCTGTTTTGGTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000049_pilon | genome | sc0000049_pilon:1111139..1112364 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 937-1053:1110 |
| Aaloc | 127-936:295 |
| Aaloc | 1-123:1 |
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