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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000389_pilon:199750..203090- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_026523 ID=XLOC_026523|Name=XLOC_026523|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3341bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000389_pilon:199750..203090- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAACAAAAAAATGAATTCTGTTGCATTTTCTTTTTCTTCTTCAATTTCAA
TTTCAATTTTCGAAAAACGCGTCTGCAAAACATGAGGATAATACCAATAC
TTCCTCTCATTGGATATTTCTATCTTCTTGCATGGATTTGTCAAACTGCA
TGTGACCGAACAAAGGTTTGTTTTTGTTTGACTTATTAAATTACCAGCTT
GCACACAACATTGTTTCAACGTTCATTTAAAGTCTCCTGCCACCATACCT
CTAATAAGAACTGATTATGTTTTCAGACTGGCGAAGTACCGAAAAACAAC
CATGGCTTTAATCCAGCTGTTCTGATTGGTGAAAAAGGTAGATTCCCTTT
TTTTAATTACAAAATTAACTTTAAAGACGGAAAAGAAAGCCTTTCAGAGC
CTTTCCCCCTTCGGCGCAACGCGATCAATACAGTATTTTTAGAAATTCTT
TTATTCATTCTGCTTTGTCAGCATAGAGGCACGCTTCCTTTATTTATCAT
ATAAAAAAATATCTTTAAAGGGAAAACATTTTTAGAGGGAATTGGCAGAT
GACGAAAAATGATGTCACTCAGCTTGATGCTCAGCAGCTATGGAAGGTCA
GGGATGTAGCTTTCCATTGAATGTTAGGGTAGTCTTACCATTTACTGCGT
TCAAAAACTTACTTATGTGCTGTGACTGTTTTCTGCCCACCACGCAAAAG
CTCTAAAGGGATGGATGGAAACACATAAAAAACAATCTGACGAAAATGCT
ATCTCAAAATCGTAAGGACCGCGGACTTATGAGCTGGATTTTGATTTAGT
GTCAATTCCATTGTATACTTTATCTAAGTTAGTGCGTGGTAAGCACGGAG
CTCTGAGTGATTTTCCACACTTTTTTTTATATTTTTATACTTAGGCGAGA
CCAATTTAATTTGTTGTTCTACGGACAGATCGTTAGAAAAATATGGGTCG
GTCGGTCGGCAAAATAAGAATAAATTTTTCATTTATCAGGGTTGGTAAGG
TACCGAGAAAATTGTCCAAAAAGTATCTGGATCAAAAATTCAATTTGTTT
TTTATCTTCGATTAAGATCATAATAAAATTTTAGTGTATGGAATGCTTTT
TGTGATTTTTCAATTTCTTGAATTAATTTTCAGCTTTATTCAAGTTTAAT
TCTTACAAATAACTAGTGTGTAAAATATATTGTAGTGGAAATTCGATATT
ATTATTTTTTTGATTTTAGCAAAAATTGGGTCGGTCAGGAACAACAAACT
AAATTGGCCCAGGGGGGGGGGGTCTTGCAGTTACTCCTTGACACTATGTG
GAGTAACTGCAATTTTGGACATTTTCTACAGACACCACCACCCTTGCAGT
TATTCCATAGTGTACTAACTGATTTTACCCTCAAAATTGGTGTATACCAC
CCCCAAAAATGCCAAATTTGACAATTTTTTCACTAAAGTCTGTCCAGATA
TAATTGGCAGTGGAAACAAGAATGCCTGTAACTTTTGATAGTCAAATATA
ATTATGGAAATTTTTTTTGCTTGTTTTAGAGAGTCAAAGGTGCTGTATTT
GAATGTATTTTTGGTTGAAAAATTCACGATTTTTAGCGATTAAATTTGCG
ATTGCAAAAATTGAGCTTTTTTTCTACTTATGCTATAACGTTCATTTTTA
CACCAGTGGTAGTTCAACCTTAGGTTAAGAAGTTTGTAAAATTTCAAGGC
AAATAGAAAAGTCCTTCAGAAGATATGGGACCCGAAATACCCCTTGGTAG
CACTTTTCTGTGAAATATCAAATCTCCAACTTATTACTAAAAACGGGGGT
TATGTTATCTCTTTTGAACAGTGCAATTAAAAGTTGGAAAATGTTAAGTG
TTGGTGCATTGGTATCACTTATTATTTCGAAAAGAAGTGAAATCACAGTA
TAATTGTTTTTATTGAAAAGATAAGCATTAACTTATATTGCCTTTGTTAT
TTTTAAGTCTAAAGAACTTTGCTAATTCCCAAAACCCTAAACACAGTTTG
TCTATGAGGTCATTAAAGAGATCGTAAAATGTGTTATGATCGAAAAACTG
TTTTATCAATCATATCACTACCCCCGTTTTTAGTAATAAGTTGGAGATTT
GATATTTCACAGAAAAGTGCTACCAAGGGGTATTTCGGGTCCCATATCTT
CTGAAGGACTTTTCTGTTTGCCTTGAAATTTAAGAAACTTCTTAACTCAA
GGTTGAACTACCACTGGTGTAAAAATGAACGTTATAGCATAAGTAGAAAA
AAAGCTCAATTTTTGCAATCGCAAATTTAACCGCTTAAAATCGCGAATTT
TTCAACCGAAAATACATTCAAATATAGCGCTTTTGATTCTCTAAAACAAG
CAAAAAAAATTTCCATAATTATATTTAACTATCAAAAGTTACAGGCATTC
TTGTTTCCACTGCCAATTATATCTGGACAGACTTTAAATTCCTCATTTTT
GATACCATTACAGGGTACGTCTTATTAACGACCGTTCAAGAGTTAAACAT
CTCAATCATTTTCCAAGTTTGTTAAAATATCTTTCATGCCTTGATTGAAG
AAAAAATTTTGTGATTTTTTTTGACTTTTGAAAAAAATGTTTTGAATCTT
TTTGCTTCCGGAATTTTTGAAAGCCTAAAATTTTAAGTGAAAAATGTGCT
CACTTAGTACACCATATCCTACCAAAATCGACAATTTTGGGCTTAGGCAC
CATCCATGTTACAGTTAGTCCACTGGTGGAGTAACTGTTTTCCTAAATTT
TGCTTTATATACCACCACGGTAGTAATTGTCATAGTGTTTATATAATAAC
TGCATGACCCCCCCCCCTGATTGGCCTCGCCTTATATGTTATAATTTCAG
AGAAAGAAGTAAAACGAAACATTCTTATTGCGATCGTACCAATTCTTTCA
CCCGAATGGAGCGTTCAACTGGATATGAGGTGGTACAACGAGACAATAAT
AAGCACAGATTCGAGGTACGCTTGCAGTATTTTACAATTGTCGGCTAATG
GTTTGGAATACGGTTACGGTGGCCGTGTCCCTTTTATTGCAATGGGTAAG
ACTTCTAAAAAGTTTGCAATATCGTCTGCTGTGAACGGAAACATCAATCA
TATAATACCGCCACCACCACCTACCGTTACTCTAAACAAAACGTACCACG
TCGAGGTTCAACAACGATATGTCAGTAATGGTAATTACAGATATTTCATC
ATGATTGATGGAGAAGAAATTTACAGTGTACTAAACACTGACGCTCGGCA
GTTTTACAATGTTCATGTGTATGCAGGAAACCCGTGGAATGACCCTTGCC
CTGTGTACATCAGTAATTTGAAATTAACAAACTTTTTGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000389_pilon:199750..203090- >XLOC_026523 ID=XLOC_026523|Name=XLOC_026523|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1434bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000389_pilon:199750..203090- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAACAAAAAAATGAATTCTGTTGCATTTTCTTTTTCTTCTTCAATTTCAA
TTTCAATTTTCGAAAAACGCGTCTGCAAAACATGAGGATAATACCAATAC
TTCCTCTCATTGGATATTTCTATCTTCTTGCATGGATTTGTCAAACTGCA
TGTGACCGAACAAAGAAACAAAAAAATGAATTCTGTTGCATTTTCTTTTT
CTTCTTCAATTTCAATTTCAATTTTCGAAAAACGCGTCTGCAAAACATGA
GGATAATACCAATACTTCCTCTCATTGGATATTTCTATCTTCTTGCATGG
ATTTGTCAAACTGCATGTGACCGAACAAAGACTGGCGAAGTACCGAAAAA
CAACCATGGCTTTAATCCAGCTGTTCTGATTGGTGAAAAAGACTGGCGAA
GTACCGAAAAACAACCATGGCTTTAATCCAGCTGTTCTGATTGGTGAAAA
AGAGAAAGAAGTAAAACGAAACATTCTTATTGCGATCGTACCAATTCTTT
CACCCGAATGGAGCGTTCAACTGGATATGAGGTGGTACAACGAGACAATA
ATAAGCACAGATTCGAGGTACGCTTGCAGTATTTTACAATTGTCGGCTAA
TGGTTTGGAATACGGTTACGGTGGCCGTGTCCCTTTTATTGCAATGGGTA
AGACTTCTAAAAAGTTTGCAATATCGTCTGCTGTGAACGGAAACATCAAT
CATATAATACCGCCACCACCACCTACCGTTACTCTAAACAAAACGTACCA
CGTCGAGGTTCAACAACGATATGTCAGTAATGGTAATTACAGATATTTCA
TCATGATTGATGGAGAAGAAATTTACAGTGTACTAAACACTGACGCTCGG
CAGTTTTACAATGTTCATGTGTATGCAGGAAACCCGTGGAATGACCCTTG
CCCTGTGTACATCAGTAATTTGAAATTAACAAACTTTTTGTAAAGAAAGA
AGTAAAACGAAACATTCTTATTGCGATCGTACCAATTCTTTCACCCGAAT
GGAGCGTTCAACTGGATATGAGGTGGTACAACGAGACAATAATAAGCACA
GATTCGAGGTACGCTTGCAGTATTTTACAATTGTCGGCTAATGGTTTGGA
ATACGGTTACGGTGGCCGTGTCCCTTTTATTGCAATGGGTAAGACTTCTA
AAAAGTTTGCAATATCGTCTGCTGTGAACGGAAACATCAATCATATAATA
CCGCCACCACCACCTACCGTTACTCTAAACAAAACGTACCACGTCGAGGT
TCAACAACGATATGTCAGTAATGGTAATTACAGATATTTCATCATGATTG
ATGGAGAAGAAATTTACAGTGTACTAAACACTGACGCTCGGCAGTTTTAC
AATGTTCATGTGTATGCAGGAAACCCGTGGAATGACCCTTGCCCTGTGTA
CATCAGTAATTTGAAATTAACAAACTTTTTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000389_pilon | genome | sc0000389_pilon:199750..203090 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 229-717:490 |
| Aaloc | 166-225:3066 |
| Aaloc | 1-165:3342 |
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