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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000360_pilon:211877..217290- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_025261.2 ID=XLOC_025261.2|Name=XLOC_025261.2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5414bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000360_pilon:211877..217290- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGAAAGATTATTTGGAGGGTGTTGGTGACACTCTTGATCTTGTGGTGAT
TGGTGGCTTCCATGGTAGTGGTAAACGAACTGGCAAATATGGCGGATTTT
TGTTAGCTTGTTATGATGAAGAGAATGAAGAATATCAATCAATTTGTAAG
GTGAGGAAAGATTTTCACTGTTTCCCTACTATTCGATATGCTCCATTATT
CGATGAAAATCCAATTCCCCTTGAAAATTGAATTAGAGAGCGTGAACTGT
ATTATAAAGAATACAGACACATCGTAAAAATTCCACGAAATATCGTAAAC
GTTCATTCGCCCATTTGTGGTGGAGGTCTGAGTTTGATTGTCAATATTGT
GCTACGGTTAATTTGGGAAATGAACGCCCATTCATCTAGGTCAACACATA
TTGGGTACGATAGCTCATGATAAAAGATATTCATTATTTCGTTTCCAGGC
TGGTACCGGTTTTTCAGATGACGATTTAGTGAAACACAACGAGTTCTTCA
AACCACACATCATTGAGAAACCAAAAGCTTATTACCGGTTTGGTGAAAGC
GTCAGACCAGATCATTGGTTCGATGCTGTCCAGGTAAATCCTTTTTTTGG
TTATTTAGGATATGTACCTCTGCAATGTCTTCTAACATTGCGTCATTTTT
ACAACACCTGATTGGTTGGTATAGATTGCATTCAAAAATAGAACCCCAAA
AAGTGAGGTTTTCAATCACAACCACTTTTTAGCCCACAGCGTTGACATTC
TTGTGGCTGCTGTGTAGTACAAAATTCCATAAAATGAGGAAATTGATGAG
CTTTCCAAAAATGTTGAGTGATTCAGTCTTGAAATATAGGATGGCAAAGT
GAGGGCAGGTTTTGTGGCTGTATGTCATGTGGCTCACTCAACAGGTTGGC
TTATATGTGCTGTCCTGCTGTAAAACTTCAATATTTTTTAACCGTTTTTC
TTGAAATTGGTAGTTTAAGGTCTGATAAAGATACTTATGGGTTTAATTTG
TGGCTGCAGGGTTTTCAATAGGCTTAAAATGTGGCTTCAATCATAATTCA
ATCACTAATTTATCAATTTACACATTCCAGGTTGGGTTTTGTTTTCGAAA
CATGAATATTTGCAAAGCCTAAAGCAAAACAAACACAATCTGACACAATA
CAGTGTTATTTTAAGAAAGAGTGTACATTTTGTGGCTGCAAATACCATTT
TTTGTAACTATAAACTTCTGAGCTGTTACATTAGGTATTAGTTGGCATTT
TTAGGGTTGGCTTATGTGCTGTCCTGCTTTAAGACTTGAATATTATTTAA
CCGTTTTTCTTGAAATTGGTAGTTTAAGGTCTTAAGATACTTATGGGTTT
AATTTGTGGCTGCAGGGTTTTCAATGGGCTTGAAATGTGGCTTCAATCAA
AGCATATATGAAAAAAAATCGTCAACTTTGAGCCGCAATTCTAGCCCAAT
GACCCAATAATTTTGGTTCCATTTTTGATATTTTGTGGATAAACCCTTTT
GCTACGAGTTTCATCTGAAAAAAATGATTTTTACTCATTTAACAAATTTG
TGGCTGCTGTTTTATCAGCAGAGTGTTTTTCTTGATTTGTGCCGCAATTT
TGGCCCATTTTACAACAAAATCTTTTTCAACCTACTTCAACTACTACTCT
TTTTTTTTGCTGTTTTTGAAAACCTCACACAATTTTTGAATGCCATCTAT
AGTTGAATCTTTCTAATTCGATCTTCATGGGACCAAAAATTTTCTTTGAA
TAAGAAAAAGATTTGAATTACAGAGAGTAATTTTCCAGCTGCAGGGCCCA
ATATCTAGTTCGAATTACAGAGAGATTCGAATAACAGAGGTTCGAATTAG
AGTGAGTTGACTGTAGTAGCTTAAAGGTTTTGTTTTTAAATAAGAGTGAT
ATCGTTTGCTTGCTCATCGATTATAATTCACAAGCTTTCTCCCATTGGAT
TGACACGCATGTGGAGCAAGATTGGTCAGAAAGAGGAAAAGAAAAACATT
TTTTTTGCTTATATCAGCATAATATAACAATAGATAGACACTGTCCTGAT
ATGAAATATGTGTCTGATATGAAACGGGAACCCTTATGTCAAAATAAAAC
CTTTAATAGAACAAATTTTGAGAAAAGTTTTATCAATCCAGCCTGTGACA
AACCTGCAACAACTAAATCATCTCAGATTCCTTATGGCATCATGTTGAAA
TGCTTATCTTTTATAAGCGGAACAAGAACTCGAATCTCTTACCTAGAGCC
ACTTGCACCACAGTTTCTTAAACTGATGGACGTGATACAATCGTTTCGTG
AGCAAAATATTAGAATCTAAAAAAAAACGAACTAAAAGACTGGGTTCGAG
TTTGCCAGAATTTTAGAATTAAGACAAGACTGATTTTGATAAATTTCATG
TATTATTTAAAATAACCTAAGATTTTTAAGTTCTATTGTTTTTCACATCT
TTAAGGTTTGGGAAGTGCGAGCAGCCGATTTATCAATTTCACCCGTCCAC
AAAGCATCAGTCGGAATTGTAAGTCTAGCTTATAACCTTTCTCGTTGGAT
TTGTTGGACTTAGCGATGTAAAATACAGACCTGGCTAACCTGTCTCGGTG
TCGATTTGTTAAAGGTCTAGCCTGTCCCATCCTTACCACGGGCGATTTAA
GCTTTATTGAAAAATCTTGCCGTGTGTTGCGAAATAAAGTTTGTTAAAGG
TTGCTTGCTTGTTTTTCACCAGCAATTTTTCTGAATCCCCTCAATTGTTA
GGCCAGAATTAGAAAGACGTGGATTGTCTGTTAATGATGGGGTCGTTCAT
GAATAAATCGAACGTACTGCAAACTTGGTAATATTCTATCGATTTTGATA
TTTATAAAACTGTACGTTTAAAACTAGACCTGCATTTCAGAAGATTATGA
TTTGTTGGAATGAAAAACATGAAAGCTAATCTTCTCTAACTCTTCAGTTT
CTCAACAAAAAAAGGAATAGACAGAGAAGTTTTGTGGTTGACTTTCATTG
GCTATGAATTTTCCGAGTCTGTTTGTCATCTGAAGCCTTTGGTGAATTTG
TCACAATACTTACTTAAAGATTGCAGAACGAGATAGATTATATCGATGAT
TCATTTCTTGACTCACCGGTGTTCATGGTGGCCAATGCCTCTGGGAAACT
GGTTTTTAAAGTATTGTGGCTAAGATAATGCCCAAGACTGTTTGCGCTCT
CGTTTCAAAATTGAAAGCGATTCTTTTTGGAGTACATATCAAATGTGTAA
ATGTCGTTTGAAATAATTATTTATGTGAAAATGGGGATCGCAATGATTCT
TCTCCGGAAGAGTGATAAAATATATATCAAACTTATGAAAAAAACTGAGA
ATAATTCATTCGTGAATTACGTGAATTTTGAGTAATGTTCAAGCTCTATT
AATTCTTTTAGCTAGTAATTTAAAGAAATAATTTTGTGACGGAATCTTGT
CGGATTTTTTAAACCAATTTTGAAATACAGGCGGCAACGAAGCTCGCTTC
AAAGAAAGAATATAAGATAGACGTCCAGTCGTTGATATGTTCATGATGAT
TCTGATGGAAGAGCTGATAGCAACTGAATTTTATACTGGAGCTAATAGCT
CTTGTGATCCTGATGGAAGAGCTGATAGCAACTGAATTTTATGGTGGAGC
TAATAGCTCTGGTGATTCTGATGGAAGAGCTGATAGCAACTGAATTTTAT
ACTGGAGCTAATAGCTCTGGTGATCCTGATGGAAGAGCTGATAGCAACTG
AATTTTATGGTGGAGCTAATAGCTCTGGTGATCCTGATGGAAGAGCTGAT
AGCAACTGAATTTTATGTTTGAGCTAATAGCTCTGGTGATTCTGATGGAA
GAGCTGATAGCAACTGAATTTTATAATGGAGCTAATAGCTCTGGTGATCC
TGATGGAAGAGGTGATAGCAACTGAATTTTATGGTGGAGCTAATAGCTCT
GGTGATCCTGATGGAAGGGCTGATAGCAACTGAATGTTATGTTGGAGCTA
ATAGCTCTGGTGATCCTGATGGAAGAGCTGATAGCAAATGAATTTTATGG
TGGAGCTAATAGCTCTGGTGATCCTTATGGAAGAGCTGATAGCAACTGAA
TTTTATGGTGGAGCTATAAGCTCTGGTGATTCAGGGGGGGGGGTCGGTAC
TAAAATCTTAGCAAATGAATATGTTGATGTAATTGATAGCAAATATTACT
AATGATTTAAATAAAGTTTTTTTCATCTGTTAATAAAATTAAGAAACTAT
AAAGTTGAAAGTTCTAGTGGTAATTGGGCTGGTAATTGTGGCTGTTGGGC
TCGATGATTTCTTTTGGTCGAAGATTCTCGTTGTATTCTGATGACGGAGT
TGGTGCTATGGTGCCCTGAAATATAAACTTTTACTTTTGGCATGCTAGAA
TCGATTGTTTTATTATTTATCCAATGAAATAGTTGAAAGATCTTGTAATT
CAAACTGGTGGATCTTATTGACTGGATCTTTTACGTTTCAGGTTGATCCA
GTGAAAGGAATTTCACTCCGATTTCCCCGATTTTTACGAATTCGGGATGA
CAAAAAACCGGAAGAAGCTACGTCAGCCCAACAGGTTGGAATTTATGAAT
TCTTTAATTTCTCCATCTCCATTTTTGTACGAACATCCAAAATTTTTGAA
GACTTCGGATGTTCTTAACTTTTTGAGATTTAAGCCAAAAACGTTCTTTA
AATGTTCCTAATTTTACCATTTTGTGAGTATTTTTGTGCAATTTCCTAAG
AAATTAGTTGTCTTAAAGCCCAACATTTTTGCCGTCGACGTTCTTATATA
GTTTGTTCTTATATAAGAAAACGTGTATTTTTTTATGGTATGAATTTGTC
GGCATAGTGGCGCGCCTTCTTCTAATATTATTTTTTATAAAGCTTTTTTC
ACATGCACGTAAAACTTTACTTAAGATGTAGAGAACGGGGAATTTCCCTA
CGCTTACGTAGTGTTTTAAGGTCTTAAGTAGAGTTTGCTTACATTCAAAA
CATTTTAAACGCAAGGAAAAGTCACTTAAGACCCTCTTACGGGACAGAAA
CTGTACGTAAGGCCGGGGAAATTCCCAAAAGACAGCCTTACGAACGATTT
ACCGTAAGGTCTACAGTAAAATTTTACGTGCATGTGAAAAAAGCTTTAAT
CAACAAAAACTGTACGTAAGGGCGGGTAAATTCCCAAAAGACAGCCTTAC
GAACGATTTACCGTAAGGTCTAAAGTAAGAGTTTACGTACATGTGAAAAA
AGCTTAACAAAAATTTATAAAAAAAGAATTTCTTTGTTTAGTTCGCATAA
ATCATTACCAAAAATCGTTTTCTTTCTTTCTAGGTTGCTCAATTTTACAA
CAGTCAAGAACAAATCAAGAACCAAACCTCTGATAATAAAGTCAACGAAG
AAGATTTTTACTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000360_pilon:211877..217290- >XLOC_025261.2 ID=XLOC_025261.2|Name=XLOC_025261.2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1044bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000360_pilon:211877..217290- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGAAAGATTATTTGGAGGGTGTTGGTGACACTCTTGATCTTGTGGTGAT
TGGTGGCTTCCATGGTAGTGGTAAACGAACTGGCAAATATGGCGGATTTT
TGTTAGCTTGTTATGATGAAGAGAATGAAGAATATCAATCAATTTGTAAG
AAGAAAGATTATTTGGAGGGTGTTGGTGACACTCTTGATCTTGTGGTGAT
TGGTGGCTTCCATGGTAGTGGTAAACGAACTGGCAAATATGGCGGATTTT
TGTTAGCTTGTTATGATGAAGAGAATGAAGAATATCAATCAATTTGTAAG
GCTGGTACCGGTTTTTCAGATGACGATTTAGTGAAACACAACGAGTTCTT
CAAACCACACATCATTGAGAAACCAAAAGCTTATTACCGGTTTGGTGAAA
GCGTCAGACCAGATCATTGGTTCGATGCTGTCCAGGCTGGTACCGGTTTT
TCAGATGACGATTTAGTGAAACACAACGAGTTCTTCAAACCACACATCAT
TGAGAAACCAAAAGCTTATTACCGGTTTGGTGAAAGCGTCAGACCAGATC
ATTGGTTCGATGCTGTCCAGGTTTGGGAAGTGCGAGCAGCCGATTTATCA
ATTTCACCCGTCCACAAAGCATCAGTCGGAATTGTTTGGGAAGTGCGAGC
AGCCGATTTATCAATTTCACCCGTCCACAAAGCATCAGTCGGAATTGTTG
ATCCAGTGAAAGGAATTTCACTCCGATTTCCCCGATTTTTACGAATTCGG
GATGACAAAAAACCGGAAGAAGCTACGTCAGCCCAACAGGTTGATCCAGT
GAAAGGAATTTCACTCCGATTTCCCCGATTTTTACGAATTCGGGATGACA
AAAAACCGGAAGAAGCTACGTCAGCCCAACAGGTTGCTCAATTTTACAAC
AGTCAAGAACAAATCAAGAACCAAACCTCTGATAATAAAGTCAACGAAGA
AGATTTTTACTGAGTTGCTCAATTTTACAACAGTCAAGAACAAATCAAGA
ACCAAACCTCTGATAATAAAGTCAACGAAGAAGATTTTTACTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000360_pilon | genome | sc0000360_pilon:211877..217290 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 442-522:82 |
| Aaloc | 349-441:924 |
| Aaloc | 286-348:2960 |
| Aaloc | 151-285:4967 |
| Aaloc | 1-150:5415 |
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