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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000188_pilon:249040..253838+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_025073 ID=XLOC_025073|Name=XLOC_025073|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4799bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000188_pilon:249040..253838+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGACATAATCAAACTACCAAACGAAATCATCGAATACCTTATAACTTT
CTTGAGTTTAAAGGATACAAAGAATGTTATGATGGCGTCAAAGTTGATGC
ATGATTTAGGTTTACCCCATCTTTGGCGGAAACCAAGGTTCACCAGAAAG
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TCTCATTCTGCATACAAAGACATTGCTGCTTTCAGAAGAGGTATATTTTG
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AATCATCATGAGACATACGCATCTATTTATAATACAGATCGTTTATGGAC
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CGTTCGGTTGTTTACAATTCACCAAAAATAACATTAAACAGTTTCTCAAT
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AATATGAGAGCTCAAACCTCATTTATTTTGTACCTATATTGAGAGAAATG
CTTTGGTGTCTGGAAGAATTCCATTTCACTGACTGTGAACATACAGATCA
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caactttcacaacaaactaacttcaattttgcccgcACATTTGCACAAAT
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tgtggttggatatgaactggttagctttaacgtaaaaatttaaacctgaa
gcaaaatttactgattgatgattgaatttcccttggcgttttaaaaatgc
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TGAAAACgttgaaatttttgctgtgaatttggacattttcttccacatgc
gtttaaaacgtggaaaacttttggttgtgaatttgtacattttcttccac
gtgcgtttaaaacgtggaaactttttgctgtgaatttggacattttcttc
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tttcttcaatgtgcgtttgaaacgtggaaaacttttggttgtgaatttgg
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taaaaaaatgtttagaaaaatgAGATGATCGGATAATTAAAAACTACTAA
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CCTCTAGGCGTCTCCGGCAAAAATCGGCGTTAAATCTACTTTTTTCcgtt
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ACCTCAGTCATAGTGAGTTTGAAATAGAGGACGGAAAAGTGTTTGATACA
GTTGAAACTTTAACGAAATTCAAATCATTGGAACGTCTTGATATTGATTG
TCACTGGTCGTGTTATGAGCTCACGTTAGATGAATTCGCACTTTTCCAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000188_pilon:249040..253838+ >XLOC_025073 ID=XLOC_025073|Name=XLOC_025073|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2074bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000188_pilon:249040..253838+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGACATAATCAAACTACCAAACGAAATCATCGAATACCTTATAACTTT
CTTGAGTTTAAAGGATACAAAGAATGTTATGATGGCGTCAAAGTTGATGC
ATGATTTAGGTTTACCCCATCTTTGGCGGAAACCAAGGTTCACCAGAAAG
ATTCAACCGAAACAAAAGTATATCAACTTCATCAAAAAGTTTCCGATTGA
AGAAATACATACGAGTGATTTGGAAttggattttggatttttactAATGC
CGTGGAATATTTTTCCAAGACTTAAATTGATTCATGTTGATCACGAAGAA
GACGAAGGCTTATATCGATGCCAAGATTTTGACTTCACATACTTGAAACC
TCTCATTCTGCATACAAAGACATTGCTGCTTTCAGAAGAGGTATATTTTG
AACAATTAGTTCACTTGTTAAAGTCAGGCAATGTTGCAGCATTATTGATC
AATCATCATGAGACATACGCATCTATTTATAATACAGATCGTTTATGGAC
GCTTGACCAATTGAAAATAGTTTCATCTCTAGTTTGCATTAAAGAAATAT
CGTTCGGTTGTTTACAATTCACCAAAAATAACATTAAACAGTTTCTCAAT
TTTATTGCCAGTCTAAAAGGGTGCAGGTTGCTTGTTCCTTTTGTGATTGA
AGGGGACGAAACACAATATCTACTAACTCCAGAAGTTTATCTATTATGAA
CTCATTGAATTTACGAGTTGTTGAGATAGCTACTAACGCCTTAGACACTG
AATATGAGAGCTCAAACCTCATTTATTTTGTACCTATATTGAGAGAAATG
CTTTGGTGTCTGGAAGAATTCCATTTCACTGACTGTGAACATACAGATCA
GACCCCGATGGATttATGGACATAATCAAACTACCAAACGAAATCATCGA
ATACCTTATAACTTTCTTGAGTTTAAAGGATACAAAGAATGTTATGATGG
CGTCAAAGTTGATGCATGATTTAGGTTTACCCCATCTTTGGCGGAAACCA
AGGTTCACCAGAAAGATTCAACCGAAACAAAAGTATATCAACTTCATCAA
AAAGTTTCCGATTGAAGAAATACATACGAGTGATTTGGAAttggattttg
gatttttactAATGCCGTGGAATATTTTTCCAAGACTTAAATTGATTCAT
GTTGATCACGAAGAAGACGAAGGCTTATATCGATGCCAAGATTTTGACTT
CACATACTTGAAACCTCTCATTCTGCATACAAAGACATTGCTGCTTTCAG
AAGAGGTATATTTTGAACAATTAGTTCACTTGTTAAAGTCAGGCAATGTT
GCAGCATTATTGATCAATCATCATGAGACATACGCATCTATTTATAATAC
AGATCGTTTATGGACGCTTGACCAATTGAAAATAGTTTCATCTCTAGTTT
GCATTAAAGAAATATCGTTCGGTTGTTTACAATTCACCAAAAATAACATT
AAACAGTTTCTCAATTTTATTGCCAGTCTAAAAGGGTGCAGGTTGCTTGT
TCCTTTTGTGATTGAAGGGGACGAAACACAATATCTACTAACTCCAGAAG
TTTATCTATTATGAACTCATTGAATTTACGAGTTGTTGAGATAGCTACTA
ACGCCTTAGACACTGAATATGAGAGCTCAAACCTCATTTATTTTGTACCT
ATATTGAGAGAAATGCTTTGGTGTCTGGAAGAATTCCATTTCACTGACTG
TGAACATACAGATCAGACCCCGATGGATttatttaCGGACTTTCCGGTCA
AATACCTCAGTCATAGTGAGTTTGAAATAGAGGACGGAAAAGTGTTTGAT
ACAGTTGAAACTTTAACGAAATTCAAATCATTGGAACGTCTTGATATTGA
TTGTCACTGGTCGTGTTATGAGCTCACGTTAGATGAATTCGCACTTTTCC
AAatttaCGGACTTTCCGGTCAAATACCTCAGTCATAGTGAGTTTGAAAT
AGAGGACGGAAAAGTGTTTGATACAGTTGAAACTTTAACGAAATTCAAAT
CATTGGAACGTCTTGATATTGATTGTCACTGGTCGTGTTATGAGCTCACG
TTAGATGAATTCGCACTTTTCCAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000188_pilon | genome | sc0000188_pilon:249040..253838 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 868-1038:4629 |
| Aaloc | 688-864:687 |
| Aaloc | 1-684:1 |
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