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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000309_pilon:147406..151492+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_024980 ID=XLOC_024980|Name=XLOC_024980|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4087bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000309_pilon:147406..151492+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GATGAACTCTTCGAAACACATAATGCGAAAACTACTACGCTTAACAGTGA
GTTTGGGGGTGATCAACCTGTATATGACGGAGCAAGACTTACTGTATCCG
TCAGTATAATGCTTATCCTAACGTTTATCATGAGGTAATTTGCCCTAAAT
TCCTTGCTTATCAATTTCAAGTTATTATGGACTTGTTAACCGGTTTCTTT
TTTAAAGCGGGCTACACAGCTTTTTgtgcaatgcaattggttcttttcac
ATGACAACGGGCCTAAAACTTCCCAGAGTTGCCTGTCGTTAGGAAAAttt
attgtgacgtcactttttacAAGGAAAATGAACAGTGCGTTGACATCATA
TTCTTTTAATTTGTATTTCTGACGTCAggaattataaaatttttttatct
atcgcttgtttttttcgctttatttcgctattttttctAGATGAAAGCgc
taaaaatttaaaggaaacggttaacaaatacaataaacgaccgttttttt
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atagaccttttttcaaagaggacgtcctgttgaataattatgtagtccag
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taataaaaattatgcatggttttatcattgtttttctgctggactagata
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GATTTGGATTATATACATTATAAGATCAACTTTATCCTACCGGGAGTAAT
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AGTTAATTCgcagattttttgcaaaaataagagaaaatgttatttttcat
tatttttgtgtCAATTGCCTTGCCTACATTGGACTACAAGACAAAGATTG
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CTTTGCTGGATAATTTGCAATCCTTATTCAAatgtaagatttttttaaaa
ctaataTAGCCAATTTTTAGTAAGTATTATTTCACAGAACTATTGTTGTG
GTATACATACCTGAAAACACGAAAGTTAGtttccatgaaaattagttTGT
TAAAGTAGACATATTTGTTGAGAGAAttcttctttgaatttcttctatTT
GAAGATGGAAAGCTATAATCATGATATAGAGTTGTTGTTTGTTATTTTAG
GAcattaaaacatcaatttagaaatttttaagattcaaattcttgctaac
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GTGTATCTCTTTTCAAATCGTCCAAAATGGAAATATGGCCCATCTATTAC
ACAATTAACGAACTTCACCCAACATTACGGTAATGATCAAATTTTAGGGG
TAAAACTCCTAATATTCAATTGAAATGAAGGGCAAGTTTGTAACAAGACA
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AATGATCAAATTTTTGTGACATACTCTTTTTAAAGGTGCTTAGCCTTAAA
GataattttctttatgatatATAGACAAGGCAGATACTTTGTGCTGATAC
AGCAGATTTCGAGTCCCACAAGAACaagggaagaaaatttttgttttttt
tgtttcaaaaggctgagtaagcaaatgatagAAGATACATACAAACATTA
TCTTAAAGGCTTTCAGAACCTATTGAATCGTAAAAACCTGTTTGTTAGCa
gttttattttcaagttaTTATGAGACAATAAAAGCCTACGTCTAAAATCT
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tatatGTTCTGTTTTTAGATATCGAAGAAAGTATCGATTATTTGCTGGGC
TTTGGTTTTCAGACAAAAAAccaaacttcaaaacttttcttaAGCCATTT
GTTGAAGAATTAAAGGAATTTAGTACATCAGGTAAGTTTGtcactatttt
tctttgctatttttaaatttcaataggtctacatgcttttttttataagc
aagtgtatgccccttggtcaggctcgtgtatgcttaagttctcaaagcat
ccaggcttattatatgcttatgaatcatgcttataaTTCACCCCGAgtca
aattttattgaaatcttagaaattttgtaaaaattgtaaaaatttgttct
gaTTTGGGAGCAGtgtagccgtggaatgtctttttttacttgacctcaaC
CAAACCATtttaaactgataaaaaatgacaacttgaaaaatatttcaggc
tgacacatatgcttatgttatgcatAGGAATTAtacaaatctgagccttc
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tcaaaaatttcatggggacttaatttcgcgggcggaactattgggtggca
atattttcacgattttgtgactctTACTTTGTCAAATcttgcatgttggt
tgttgtaatacacattatttgcacctctttgatgcaagtaatcattattc
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gatgaggccctcccttctaaattttcattgagacttaattttgcttaaaa
ttatACGTGGAAATAATAACTTTTCATCAGGAATTTATGTTTTATTCACC
CGGTCAAATATTCTGTTATATACATTTTTAGTACTAAACCCATTTTTAAA
ATCATGGGgcttacagagagtaatttgtTCAACAAATTAAATATATCCAC
AGcacagagaaaaaaaaaggCTGAAAAGCATTCATCACTTTGCTACAGTA
TTTGTTGAAAAGTGGTGTTGCAAAGCAGGTGTTGCACATGATGATGACAC
GCTTAGAGCTGCCTGTGGAAATTTAATGTTCTAATTATACCTCTCCCATC
TCTTTTCACAGGAAAACCGATAATGACAGAAAAAGGTGAGAAactgttaa
aagtttttcttttttctggtATCTTTGATGCACCTGCGAAAAGCATGTTC
CAGAATGTTGTACAATTCAATGGGTTATACGGCTGCTCTTACTGCTTGGA
ACCTGGAGAAACCTGTAAAGCTGGTAAAGGTCACGTTCATGCTTTTCCTT
TTAATTTTGACGAAAAATCAGGACATACTAAACTACGCTCTCATAACGAT
ACCATTAGTCATGCAAAGAAAGCCCAGAAAAGTATTATTGAGACCGGAAA
CATAGTTCCAGAAAAAGGTATGAAAGGATTGTCTTGGTCAATGAGCCTTC
CATGCTACAATGTTGTCAATGGTCTAGGTTTGGATTATCTCCATAATACG
CTTCTGGGTGTGgtgaaaatgataatgaaaTTGTGGTTCAACAAGAAGTA
CAAAAATATGCCTTGGTTCATCGGTAACCATGTTAATGAAGTCGATAAAT
GCATTGTACAACTGAGACTTCCTAACCTAATCAGCAGAATACCAAGAAAC
ATTGAAAAggatttcaaacattttaaagGTTCAGAATTTCGGACATTTTT
GTTATTCTATTCCGCTCCAATTTTATACAATTTTCTTCCAGATGAGTATT
TCCAGCACTATATTCTTTTGGTAGAATCAATTTATTTGTTGCTGAAAGAT
TCTATCTCCCCTATTGATCTTGAAAATGCAGATAAGATGTTGCGTCATTT
CTGCTGCAAAATTCCTAGATTGTATGGATACCGATAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000309_pilon:147406..151492+ >XLOC_024980 ID=XLOC_024980|Name=XLOC_024980|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3120bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000309_pilon:147406..151492+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GATGAACTCTTCGAAACACATAATGCGAAAACTACTACGCTTAACAGTGA
GTTTGGGGGTGATCAACCTGTATATGACGGAGCAAGACTTACTGTATCCG
TCAGTATAATGCTTATCCTAACGTTTATCATGAGGATGAACTCTTCGAAA
CACATAATGCGAAAACTACTACGCTTAACAGTGAGTTTGGGGGTGATCAA
CCTGTATATGACGGAGCAAGACTTACTGTATCCGTCAGTATAATGCTTAT
CCTAACGTTTATCATGAGACATCACCTCACTGGAGTAGCTGTTGAAGATT
TGATTGCACTTATTGAAGCTCATATGATTATACCAAATTTAAGTAAAACC
ACCATGAAGTTAATTCgcagattttttgcaaaaataagagaaaatgttat
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AAGATTGTGAAGTTTGTAAGAAGAAATCTAATGGAAATCCATACTTTGTT
GTTATCCCTTTGCTGGATAATTTGCAATCCTTATTCAAatACATCACCTC
ACTGGAGTAGCTGTTGAAGATTTGATTGCACTTATTGAAGCTCATATGAT
TATACCAAATTTAAGTAAAACCACCATGAAGTTAATTCgcagattttttg
caaaaataagagaaaatgttatttttcattatttttgtgtCAATTGCCTT
GCCTACATTGGACTACAAGACAAAGATTGTGAAGTTTGTAAGAAGAAATC
TAATGGAAATCCATACTTTGTTGTTATCCCTTTGCTGGATAATTTGCAAT
CCTTATTCAAatataaagaatttttgaaagatttgagctacccaatttca
agaaagaagaagaatccTAAAAATATCGAAGACATCATTGATGGAGAGAT
TTACAAAAAGCATTTTGGTTTTGATGGCTTTTTACATGGTACACCCCAAG
CTtccaagaagaaagaaattcatATTTCGCTTCAATGTAACACCGATGGT
GTATCTCTTTTCAAATCGTCCAAAATGGAAATATGGCCCATCTATTACAC
AATTAACGAACTTCACCCAACATTACGataaagaatttttgaaagatttg
agctacccaatttcaagaaagaagaagaatccTAAAAATATCGAAGACAT
CATTGATGGAGAGATTTACAAAAAGCATTTTGGTTTTGATGGCTTTTTAC
ATGGTACACCCCAAGCTtccaagaagaaagaaattcatATTTCGCTTCAA
TGTAACACCGATGGTGTATCTCTTTTCAAATCGTCCAAAATGGAAATATG
GCCCATCTATTACACAATTAACGAACTTCACCCAACATTACGATATCGAA
GAAAGTATCGATTATTTGCTGGGCTTTGGTTTTCAGACAAAAAAccaaac
ttcaaaacttttcttaAGCCATTTGTTGAAGAATTAAAGGAATTTAGTAC
ATCAGATATCGAAGAAAGTATCGATTATTTGCTGGGCTTTGGTTTTCAGA
CAAAAAAccaaacttcaaaacttttcttaAGCCATTTGTTGAAGAATTAA
AGGAATTTAGTACATCAGGAAAACCGATAATGACAGAAAAAGGTGAGAAa
ctgttaaaagtttttcttttttctggtATCTTTGATGCACCTGCGAAAAG
CATGTTCCAGAATGTTGTACAATTCAATGGGTTATACGGCTGCTCTTACT
GCTTGGAACCTGGAGAAACCTGTAAAGCTGGTAAAGGTCACGTTCATGCT
TTTCCTTTTAATTTTGACGAAAAATCAGGACATACTAAACTACGCTCTCA
TAACGATACCATTAGTCATGCAAAGAAAGCCCAGAAAAGTATTATTGAGA
CCGGAAACATAGTTCCAGAAAAAGGTATGAAAGGATTGTCTTGGTCAATG
AGCCTTCCATGCTACAATGTTGTCAATGGTCTAGGTTTGGATTATCTCCA
TAATACGCTTCTGGGTGTGgtgaaaatgataatgaaaTTGTGGTTCAACA
AGAAGTACAAAAATATGCCTTGGTTCATCGGTAACCATGTTAATGAAGTC
GATAAATGCATTGTACAACTGAGACTTCCTAACCTAATCAGCAGAATACC
AAGAAACATTGAAAAggatttcaaacattttaaagGTTCAGAATTTCGGA
CATTTTTGTTATTCTATTCCGCTCCAATTTTATACAATTTTCTTCCAGAT
GAGTATTTCCAGCACTATATTCTTTTGGTAGAATCAATTTATTTGTTGCT
GAAAGATTCTATCTCCCCTATTGATCTTGAAAATGCAGATAAGATGTTGC
GTCATTTCTGCTGCAAAATTCCTAGATTGTATGGATACCGATATGAAAAC
CGATAATGACAGAAAAAGGTGAGAAactgttaaaagtttttcttttttct
ggtATCTTTGATGCACCTGCGAAAAGCATGTTCCAGAATGTTGTACAATT
CAATGGGTTATACGGCTGCTCTTACTGCTTGGAACCTGGAGAAACCTGTA
AAGCTGGTAAAGGTCACGTTCATGCTTTTCCTTTTAATTTTGACGAAAAA
TCAGGACATACTAAACTACGCTCTCATAACGATACCATTAGTCATGCAAA
GAAAGCCCAGAAAAGTATTATTGAGACCGGAAACATAGTTCCAGAAAAAG
GTATGAAAGGATTGTCTTGGTCAATGAGCCTTCCATGCTACAATGTTGTC
AATGGTCTAGGTTTGGATTATCTCCATAATACGCTTCTGGGTGTGgtgaa
aatgataatgaaaTTGTGGTTCAACAAGAAGTACAAAAATATGCCTTGGT
TCATCGGTAACCATGTTAATGAAGTCGATAAATGCATTGTACAACTGAGA
CTTCCTAACCTAATCAGCAGAATACCAAGAAACATTGAAAAggatttcaa
acattttaaagGTTCAGAATTTCGGACATTTTTGTTATTCTATTCCGCTC
CAATTTTATACAATTTTCTTCCAGATGAGTATTTCCAGCACTATATTCTT
TTGGTAGAATCAATTTATTTGTTGCTGAAAGATTCTATCTCCCCTATTGA
TCTTGAAAATGCAGATAAGATGTTGCGTCATTTCTGCTGCAAAATTCCTA
GATTGTATGGATACCGATAT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000309_pilon | genome | sc0000309_pilon:147406..151492 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 787-1560:3314 |
| Aaloc | 673-783:2220 |
| Aaloc | 409-669:1467 |
| Aaloc | 136-405:913 |
| Aaloc | 1-132:1 |
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