|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000083_pilon:978221..980048- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_024794 ID=XLOC_024794|Name=XLOC_024794|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1828bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:978221..980048- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTGGAGGAATGCCAGGAAAGATTTTCATTGGCGGTATGCCTTATGC
CTTGTCAGAAGATGACTTGAAAGAAAAGTTTGAGAAATATGGTGTTGTTA
CTGATTGTAAGTTTTTTCTATTTTCCCTCTATCCCTTTCCTTCAATTCAA
GTTCTATTGAATTATCACATAATATATTCAATGCTTGGGTCAGAAAGATT
TTGGCTCGACAGTGTCAAATATTTAGCTGTTTGTGTTACTGATGAGGGCC
TAAAATAGCTCTAACGACAACTTTCTTATAGCTTTCATTGTAAGAGAGAA
GGAAGATGATCATGGGCTCAAGAAATCTAAAGGCTATGGTTTCATCACTT
ATGAAAACAAAGAATCTGCAGATGAAGCTATCAAAGCCATGCATGATTCA
GTAAGTTATTTTATCTGTTATTTATTTTGCAAAATGAAAATGGAATCTAA
AACCTAGAAAATTTCCAAACTCCAGCTGGAAATTTTAGACCCAAAACACT
ACCCCCCTCCACTATTCCCCAACAAAATTTATTGCCAATTTTAAAGATTT
TTTTTCAGCCCAAGTCCAGCCCAAATGTTAAGGGAGGATTTTCCTATTTT
TTATCTGTAATAATCTTTGATCAAGTAATTTAGTGATAATCACACTGTGG
GTTATTTTTCCTTATTTGATCCTTCAAAGAGAGCAATTGATTGTTAATTG
CATCCTGTAGAGAGCAGTCAATTGTTAATCACACTCTCGAAGAGGCGCCA
ATTTCTTTAAAATTGAGTTTTTGATAGAGCCTTTCCGGATGCAGCAAAAT
TGCACTCGTGCCTTTCCGAATGCAGCAAAATTGTACTCGTTATCATGTGA
TTGATTGTATATACTTAACTTATTACAGATGCTGGATGGTCGAAAAATCA
CTGTTAATTATGCAACCAAACCAGCCAACGCTGGTGGTCGTGGTGGTGGT
GGCAGAGGTGGAGGTAAAAAAATATCTGTTCATCTTATAAATAAAATTTT
ATTATTTGAGGTATTTTACAAAAGTTAACATTTAATTATCTATTATGCGC
TTCCACAATGGATGCTGCTGAGAAGCAAGTCTTAAATATATCCTTTGTAT
TTTTAGGCCGTGGTGGTTTTCAAAACGGTGGTGGACGAGGCGGTGGCCGT
GGTGGTTATGGAGGTGGTCGTGGTGGATATGGTGGTAATTCTGGTGGTTA
CCAACGAGGTGGATATGGCGGTAACTCCGGAGGTGGATATGGCGGTAACT
CCGGAGGTGGATATGGCGGTAACTCCGGTGGTGGTTATGGTGGTAACAGT
GGTAGTTACGGACAACAAAGTGGTGGTTATGGTGGTGGCCAGAGTGGCGG
ATATGGCAGTGGACAGCAATCTAGCTATGGAAGCCAGCAAAGTGGGGGGT
ATAACTCACAACCGTCAACTCAATCTTCAGGAGGACAGTATGGAAGTAGT
GGAGGCAGCTACAATTCTTCATCTCAAGCCCCTAGCTATAACCAGCAATC
TTCTGGCCAAAGCTATGGTAGCCAATCGAGTGGGGGACAAGGACAATCAC
AACAATATGGTAGCCAAAGTTATGGTAGTCAACAACAATCAGCGCCTGCC
TCGTCAGCATATAGTTCTTCAGGTTATGGACAACAACAACAAGCTGCACC
AGCCACTGGATATAGTGGTCAAAGCTACGGCCAGAGTGGTGGCAGTTATA
ATCAACAATCTAGTACAGGTTATGGCCAAGGTAGCACAGGTGGCTATTCA
CAACAATCCTCTTATGGAGGTTCTGCAGGTGCTGGCAGCTATGGGGGAAG
TGCTGGATCAGGTGGATATGGACAATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:978221..980048- >XLOC_024794 ID=XLOC_024794|Name=XLOC_024794|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2064bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:978221..980048- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTGGAGGAATGCCAGGAAAGATTTTCATTGGCGGTATGCCTTATGC
CTTGTCAGAAGATGACTTGAAAGAAAAGTTTGAGAAATATGGTGTTGTTA
CTGATTATGTCTGGAGGAATGCCAGGAAAGATTTTCATTGGCGGTATGCC
TTATGCCTTGTCAGAAGATGACTTGAAAGAAAAGTTTGAGAAATATGGTG
TTGTTACTGATTCTTTCATTGTAAGAGAGAAGGAAGATGATCATGGGCTC
AAGAAATCTAAAGGCTATGGTTTCATCACTTATGAAAACAAAGAATCTGC
AGATGAAGCTATCAAAGCCATGCATGATTCACTTTCATTGTAAGAGAGAA
GGAAGATGATCATGGGCTCAAGAAATCTAAAGGCTATGGTTTCATCACTT
ATGAAAACAAAGAATCTGCAGATGAAGCTATCAAAGCCATGCATGATTCA
ATGCTGGATGGTCGAAAAATCACTGTTAATTATGCAACCAAACCAGCCAA
CGCTGGTGGTCGTGGTGGTGGTGGCAGAGGTGGAGATGCTGGATGGTCGA
AAAATCACTGTTAATTATGCAACCAAACCAGCCAACGCTGGTGGTCGTGG
TGGTGGTGGCAGAGGTGGAGGCCGTGGTGGTTTTCAAAACGGTGGTGGAC
GAGGCGGTGGCCGTGGTGGTTATGGAGGTGGTCGTGGTGGATATGGTGGT
AATTCTGGTGGTTACCAACGAGGTGGATATGGCGGTAACTCCGGAGGTGG
ATATGGCGGTAACTCCGGAGGTGGATATGGCGGTAACTCCGGTGGTGGTT
ATGGTGGTAACAGTGGTAGTTACGGACAACAAAGTGGTGGTTATGGTGGT
GGCCAGAGTGGCGGATATGGCAGTGGACAGCAATCTAGCTATGGAAGCCA
GCAAAGTGGGGGGTATAACTCACAACCGTCAACTCAATCTTCAGGAGGAC
AGTATGGAAGTAGTGGAGGCAGCTACAATTCTTCATCTCAAGCCCCTAGC
TATAACCAGCAATCTTCTGGCCAAAGCTATGGTAGCCAATCGAGTGGGGG
ACAAGGACAATCACAACAATATGGTAGCCAAAGTTATGGTAGTCAACAAC
AATCAGCGCCTGCCTCGTCAGCATATAGTTCTTCAGGTTATGGACAACAA
CAACAAGCTGCACCAGCCACTGGATATAGTGGTCAAAGCTACGGCCAGAG
TGGTGGCAGTTATAATCAACAATCTAGTACAGGTTATGGCCAAGGTAGCA
CAGGTGGCTATTCACAACAATCCTCTTATGGAGGTTCTGCAGGTGCTGGC
AGCTATGGGGGAAGTGCTGGATCAGGTGGATATGGACAATGAGCCGTGGT
GGTTTTCAAAACGGTGGTGGACGAGGCGGTGGCCGTGGTGGTTATGGAGG
TGGTCGTGGTGGATATGGTGGTAATTCTGGTGGTTACCAACGAGGTGGAT
ATGGCGGTAACTCCGGAGGTGGATATGGCGGTAACTCCGGAGGTGGATAT
GGCGGTAACTCCGGTGGTGGTTATGGTGGTAACAGTGGTAGTTACGGACA
ACAAAGTGGTGGTTATGGTGGTGGCCAGAGTGGCGGATATGGCAGTGGAC
AGCAATCTAGCTATGGAAGCCAGCAAAGTGGGGGGTATAACTCACAACCG
TCAACTCAATCTTCAGGAGGACAGTATGGAAGTAGTGGAGGCAGCTACAA
TTCTTCATCTCAAGCCCCTAGCTATAACCAGCAATCTTCTGGCCAAAGCT
ATGGTAGCCAATCGAGTGGGGGACAAGGACAATCACAACAATATGGTAGC
CAAAGTTATGGTAGTCAACAACAATCAGCGCCTGCCTCGTCAGCATATAG
TTCTTCAGGTTATGGACAACAACAACAAGCTGCACCAGCCACTGGATATA
GTGGTCAAAGCTACGGCCAGAGTGGTGGCAGTTATAATCAACAATCTAGT
ACAGGTTATGGCCAAGGTAGCACAGGTGGCTATTCACAACAATCCTCTTA
TGGAGGTTCTGCAGGTGCTGGCAGCTATGGGGGAAGTGCTGGATCAGGTG
GATATGGACAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000083_pilon | genome | sc0000083_pilon:978221..980048 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 313-1032:721 |
| Aaloc | 226-309:951 |
| Aaloc | 109-225:1546 |
| Aaloc | 1-105:1829 |
|
