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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000018_pilon:1023847..1028372+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_024686 ID=XLOC_024686|Name=XLOC_024686|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4526bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000018_pilon:1023847..1028372+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACCAGAGTCAGTGGGATGGATGTTGGATTAATTGTTGTCAACAAACCATC
TGGTAAAGGCAAAGCTTCAATGCCAAGTAGGTACACCTTTTTAAACTgca
aataatttaaaatattagtAGTGACTCCTAAAAGTTAACATTTGATACTA
GGGaatcaaatcattttgatttgtaatttaattgaattaatcaaaatttc
caTCCTTTTCTTGATTAGTTCCATTAGTTCAATTTATTGTTTGATGACTT
TTGAGGGGATGTAGAAGAATTATGTAATTACGGAAATCTACTCTTTTACT
CTCagaaatattacaaaatattACCCGTATTTCTTCTGGAAATCTAGAAT
TTGTTTGGTTTGCAAATAGATCCAGGGATAACTGGTTAAGATGTAATGAG
TGTgaagaaaatttgtttcaacaattttgcaaaattagcaatttttcact
taaataattgaacattaaaaaatggcaacaaatttccttttcaaaatcTA
TGACACTGTGATCCTCTATTCCCTAGAATGAAAACTAACCTTGGTATGTC
TTTATATTGCCTACAGGAGACCTTGTGAACGGAGCTGGTCCAATCAGGAA
CTTATTGGAGATTCTCAAAGGTTCCATGGGGTCAAATTTCCCATCCACTG
TCGCTTCATTTGCTGCTGCTGCAATTGCAATGCATTTCTCAACAGTAAAG
TCAGTAAAGCAAGGTGTCCCAGTTCCAGCATTGGTAGGGGAACCTGGATC
AGGAAAATCAAGTATTGCTGTTTTGGCAATGGAAGCCATTGGTGTCCATA
CCGCTCATGAAAGTAAGttgttttcataaaatttgattttcagctCTTAC
TTTTTAGCAATGTATATTCCTCATTCCTTTTGAAATGCAAATGCAGAAAC
TCAAAGAAATAAGCCTTAAACCATAATGcttaaacgggggggggggtcaa
aataAACAGGtggtagaaaattttcaaattttaataaatgagGGTCTTAA
TAAGGTCCagaggttggaaaaaattaacaagcggggggggggggttaatc
AACGCCTGAGAGTAACACCCTAAGAGCCCAATTTTGAAAGACTGATTTTG
AAGTAAGTTAcacagttttttttatataagaattcttttataagaatcac
aaaactcaaattggcaaaattttgagaattttttaggAATAATGCTGAGc
cttgttcaaattttttttttcagtcaaaatttttgtttctttcctctttt
tcgcacatttaaaaaaaattatccttgctttctttttcaaatttaaaaat
catatgAGGCTCATTTCGATTTATGTAATCGTTATAAAATACTGTTCGAT
TTATGTTTAGATTGTACTTATAATGGAATGCTGAAAATACTTGAAAAAGA
TTGTATACCAATACTATGGGAAGATGTCGATCAGTTTAAAATATGTGAGC
AGATCTCgatgcaaattttcaatcaggTAATTAAAAGTCAATATGTCCAT
GAATAAGGAAATCTGAATAACATTATTTCATATGGCAATAATTTTAAGTT
CTTTAAAGAGAGATTTTTGGGATACAtttggtttcattttttgtacATGT
TGCAATTCTGTGTAATTGTGACTAAAAACTTAACAGCAAATTCTCGCTTT
TCTTTTTATCGTTCAATTTCCGTCtttgaatgttgaaaaaagaacCCAAT
CAGAAATCATCATTTAATTCATTTTCTCTCTGACATTTTTAATTACAAGA
GTAAGaaaaaatacatctaaaaacataaaaaaaacaaaagaaaatgaaat
tataacCTGTAAATCTCTGTAAAAACTTTATCTCTCCACTGCTAAGTTTT
TGATCATACAATTACAATAgtaatttaagaacatttggtATTTTCAGGGC
AAGAAAGTCACAGCAGTAAGTTCGGGAAATCCACCGAAGTCTCTTCCCAT
AATAACCAGCAATGGATTTCTCAAAGATGCGCCATCTGAGATGAATGTTA
AAAGGTAAGGATCATTTGTAATAGTTTCTCTTTGACTGAATTTTGATTAC
TTTTTTAATGCAGAGTAGTAAAAAACACTGCtaatttgtttttgtatatt
ataCAATGTTGCAAGTAACTCAAAAAATTGCCAggtcatttcattttttt
atgaatgtcATATCAATAGTTCAATCAATAGTTCTCTGGGCTCTTTCGGC
TAATCAGGGTTTGTGAAAAGAGGATGGCAAATGAGCTAATTAATCATtat
aaatacaaagaaaaactatcaaatctctttcaaattgaattattttgtgT
GTTTATAGCATTGGGCACATAAAAGTAAGTAGTTCATGATACATTTGAAA
GTGCAAATCTAATGATTTCAACACATTTAAAATAGGACGATGAAGTGTCA
CATCTCTTGGGAGTACGTAATTATTCCACTTCCACTTtagatacgagttt
tgatttgattgtttgaagtttttgaagaaaaaaatttcttctttaaaatg
gcaataaagtTAAGTCCAGCCTTACATGATTCTTTTGGAGGAAGTCAGAC
TTCTGAGTTTATTTATCAATTTCTGTTTTATAGATTGATTGGAAGAATGG
TTATTATACCATTTCAAAAAGTAGTCTCAAAAATTGAAAGCGTGCAAAGT
TTACTGGAGTTCGAGTCGATGCTCCTGTCAAATAAACACATCGCAACCAA
TTGTTTCAGCTATTTTCTGCAGCTGAAGAACCATATTGCTGATTTCAGCT
TGAACAAAACAGATTTCACACTGCTTAATGATATTTTGCTGGACGATTAT
GAAAACCATCAAGCTGACCAACGGACAATTAAGAACTACAATTGTCTAAT
GTTTCTAATGAAAAAAGTGAGTTTGAATTGCAATTTTTCTCTTGTATGCA
GttgatataattttcaagcactgttTTACCACTGTTATTGGGTGAtaaaa
aactcaattttgtgTGTGTGAGGAGATTCTTTGTTTACTGAAAAATACCG
GAAAAGAGTGTATGTAACACTACAATCAGAATTCACCGGTTCTCAGACCA
CCATGAAAACTTCTCAAAATTTCaactgatttttgccaaaatcctaggga
tattctcaacttcagttgagctagtaTCTGACTAAATATGTATGTCTGTC
TGAAAAACTTTTGGGCAGCTTGGAGACCTCAAAAATAatctgatttggct
gaaattttgcacatttgttccttgggtgaatacctggggctgttttttcc
atgttttaaaaaattttcatttttgaggcCTGGTGACGAGTTTTCGCCGC
ACCAAAACACGAAGCTTAAACTTTCAGTCCCaaaaaaaaaTAGTTATTAG
CATATTTTAAAGAATACTGAAATTATATGTGTCTTAcaaagtttacaatt
gggcttccaaataatttgaaagatactgaagttgagcctaAACAATAGTT
TTgacgtttaaaacacaaactattgtaattgtaattttttatttagatcC
TGGAAGATAGTGGCTGTACCAATGAAGAAATATCATCGATCCTCAAAAGC
TTCTTTGACCAAGCCATCCAAGCACATGACCCGGAGGCACATGGGTTTGG
AAACGAAATTGAAATGAAAGGCAAAGAAGCACTGACAAATAAATTAACTG
AAGCATGCACCTCTCCAACAGTAAGTACTACttgtaaaaaaagtcaaaac
aattGTTCACAGGAATGCTTGTTTTTAATTAATCACATTGTGTCAAAAGT
TTGATTGTTTAGTGTCATGACACATGGTTTGCATGTTTTACTAGTACTta
tttatgtccctttaacccTATTTGGCACATCCccctgtaaatttattttt
aaggttttgaatTGCTGCTATTGTCTTAAAGTTTCAGAAGTTATATTTAG
cctcatttttaaaaataatttttgtcaacCCACATTTggtgaattttaaa
aattaaacccAATTTTACAAGGTAAAAGGCtggctttttttgaaaactag
aatCTCTGATATCTTTCCAACCAATAAAGAAACAGTTGAATTTTCTCAAT
ATTATAGCATTATTCCCTCCCCCATTATTTTTTGCACATGTCaaaaaaaT
GTGTTGGTTTCTTATGAAATAAGTTTTGGTATCCTTGTGACTTGTCCGCG
TATTTTactattgtttccatttttttgtatttatatctgaataatttttt
ttatcggGTTGCTTATTCATTGTTTATTTTAGAAGTTTCCATGGTTGCGC
ATTAGTGCGCGCAACTGTTCTTCATGTGGAGAGGTGCTCATGTTTAACTA
CACGAAGATTTGTGAGGGGCTAAGCAATCAAACTCACAAAAGTGTGAAGA
AATTTATTGCCCAAAATGGGTGCATGAGGCGTACTCTGAAGTACTGGGTG
GATGGTAAGCAAAAGCCGTGCTTCCATATCAAATTGGCTTCAATAGATGA
TGATATTgtcacaaaaattaaaagtaaGCTATGGTTTGAATTGTTAcgtt
ttattacttttttgagaatttttcag Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000018_pilon:1023847..1028372+ >XLOC_024686 ID=XLOC_024686|Name=XLOC_024686|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2592bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000018_pilon:1023847..1028372+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACCAGAGTCAGTGGGATGGATGTTGGATTAATTGTTGTCAACAAACCATC
TGGTAAAGGCAAAGCTTCAATGCCAAACCAGAGTCAGTGGGATGGATGTT
GGATTAATTGTTGTCAACAAACCATCTGGTAAAGGCAAAGCTTCAATGCC
AAGAGACCTTGTGAACGGAGCTGGTCCAATCAGGAACTTATTGGAGATTC
TCAAAGGTTCCATGGGGTCAAATTTCCCATCCACTGTCGCTTCATTTGCT
GCTGCTGCAATTGCAATGCATTTCTCAACAGTAAAGTCAGTAAAGCAAGG
TGTCCCAGTTCCAGCATTGGTAGGGGAACCTGGATCAGGAAAATCAAGTA
TTGCTGTTTTGGCAATGGAAGCCATTGGTGTCCATACCGCTCATGAAAGA
GACCTTGTGAACGGAGCTGGTCCAATCAGGAACTTATTGGAGATTCTCAA
AGGTTCCATGGGGTCAAATTTCCCATCCACTGTCGCTTCATTTGCTGCTG
CTGCAATTGCAATGCATTTCTCAACAGTAAAGTCAGTAAAGCAAGGTGTC
CCAGTTCCAGCATTGGTAGGGGAACCTGGATCAGGAAAATCAAGTATTGC
TGTTTTGGCAATGGAAGCCATTGGTGTCCATACCGCTCATGAAAATTGTA
CTTATAATGGAATGCTGAAAATACTTGAAAAAGATTGTATACCAATACTA
TGGGAAGATGTCGATCAGTTTAAAATATGTGAGCAGATCTCgatgcaaat
tttcaatcagATTGTACTTATAATGGAATGCTGAAAATACTTGAAAAAGA
TTGTATACCAATACTATGGGAAGATGTCGATCAGTTTAAAATATGTGAGC
AGATCTCgatgcaaattttcaatcagGGCAAGAAAGTCACAGCAGTAAGT
TCGGGAAATCCACCGAAGTCTCTTCCCATAATAACCAGCAATGGATTTCT
CAAAGATGCGCCATCTGAGATGAATGTTAAAAGGGCAAGAAAGTCACAGC
AGTAAGTTCGGGAAATCCACCGAAGTCTCTTCCCATAATAACCAGCAATG
GATTTCTCAAAGATGCGCCATCTGAGATGAATGTTAAAAGATTGATTGGA
AGAATGGTTATTATACCATTTCAAAAAGTAGTCTCAAAAATTGAAAGCGT
GCAAAGTTTACTGGAGTTCGAGTCGATGCTCCTGTCAAATAAACACATCG
CAACCAATTGTTTCAGCTATTTTCTGCAGCTGAAGAACCATATTGCTGAT
TTCAGCTTGAACAAAACAGATTTCACACTGCTTAATGATATTTTGCTGGA
CGATTATGAAAACCATCAAGCTGACCAACGGACAATTAAGAACTACAATT
GTCTAATGTTTCTAATGAAAAAAATTGATTGGAAGAATGGTTATTATACC
ATTTCAAAAAGTAGTCTCAAAAATTGAAAGCGTGCAAAGTTTACTGGAGT
TCGAGTCGATGCTCCTGTCAAATAAACACATCGCAACCAATTGTTTCAGC
TATTTTCTGCAGCTGAAGAACCATATTGCTGATTTCAGCTTGAACAAAAC
AGATTTCACACTGCTTAATGATATTTTGCTGGACGATTATGAAAACCATC
AAGCTGACCAACGGACAATTAAGAACTACAATTGTCTAATGTTTCTAATG
AAAAAAatcCTGGAAGATAGTGGCTGTACCAATGAAGAAATATCATCGAT
CCTCAAAAGCTTCTTTGACCAAGCCATCCAAGCACATGACCCGGAGGCAC
ATGGGTTTGGAAACGAAATTGAAATGAAAGGCAAAGAAGCACTGACAAAT
AAATTAACTGAAGCATGCACCTCTCCAACAatcCTGGAAGATAGTGGCTG
TACCAATGAAGAAATATCATCGATCCTCAAAAGCTTCTTTGACCAAGCCA
TCCAAGCACATGACCCGGAGGCACATGGGTTTGGAAACGAAATTGAAATG
AAAGGCAAAGAAGCACTGACAAATAAATTAACTGAAGCATGCACCTCTCC
AACAAAGTTTCCATGGTTGCGCATTAGTGCGCGCAACTGTTCTTCATGTG
GAGAGGTGCTCATGTTTAACTACACGAAGATTTGTGAGGGGCTAAGCAAT
CAAACTCACAAAAGTGTGAAGAAATTTATTGCCCAAAATGGGTGCATGAG
GCGTACTCTGAAGTACTGGGTGGATGGTAAGCAAAAGCCGTGCTTCCATA
TCAAATTGGCTTCAATAGATGATGATATTgtcacaaaaattaaaagtaaG
CTATGGTTTGAATTGTTAcgttttattacttttttgagaatttttcagAA
GTTTCCATGGTTGCGCATTAGTGCGCGCAACTGTTCTTCATGTGGAGAGG
TGCTCATGTTTAACTACACGAAGATTTGTGAGGGGCTAAGCAATCAAACT
CACAAAAGTGTGAAGAAATTTATTGCCCAAAATGGGTGCATGAGGCGTAC
TCTGAAGTACTGGGTGGATGGTAAGCAAAAGCCGTGCTTCCATATCAAAT
TGGCTTCAATAGATGATGATATTgtcacaaaaattaaaagtaaGCTATGG
TTTGAATTGTTAcgttttattacttttttgagaatttttcag
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000018_pilon | genome | sc0000018_pilon:1023847..1028372 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1003-1296:4233 |
| Aaloc | 829-1002:3497 |
| Aaloc | 547-828:2585 |
| Aaloc | 439-543:1898 |
| Aaloc | 325-438:1363 |
| Aaloc | 79-321:569 |
| Aaloc | 1-75:1 |
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