XLOC_023387 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_023387
Unique NameXLOC_023387
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000380_pilon:34107..42718+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_023387 ID=XLOC_023387|Name=XLOC_023387|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8612bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000380_pilon:34107..42718+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTGGTATTGCATATCTTATGCAAGGATTATTACAATCAGACgaatcgaa aaaatttttcactgagGATGACAAACAGAGATTGGTATCGTATTGGAAAG GAACAACTACGAATTGTTTATCACAAGACAAAGATTACGCCGAAGCTCAA CGGCTTTTGAATCGCCTGATTACCATTGAGTTTACTACAATGGACGATGA TCAAACGTTACAGGATTATATGGATGATGGAGGTTAGTACAAAAAGTTCT GATTGGATAAGTTAGCCCTCAATAATGCATTAAGCATACAAAGAAAGCTa tgcgaccgtagtgcagtggtagagcatccggctacggtgcgtaAGTTTGT CGGTTCAACCTTCAGCCGGGTCACACCAAAGATtcctaaaatggtacttg atgcttcagcaattaagggctctgaccaatTCATAAGATCGAATACGCAG AAATggagataaaacttttgtttttagttCCTTGTCACTTTTAACGAAAA ATTGTCCTTAtaagttgtttctgaatttattctatcaagagtaattagTA ATTAATTACTTGCAAAAAttacgttatgaactttaaaaagacgttaatga atgttatattaccctcctttacaaaaagtgctaaatTTTAATGggtaacc tttttgtttcgatttttttaaagtgtctgcaaaagattgaagtatctaaa cattttctaaattgatgtttCAGAAGTTATGACTTTATTTGTgcgaaaaa tttggaaaaaaaaataggtcaaaagccactattttcaatattttgagaca aagaagcttttacaaaagatttccgaaaatctattgttagtttggttaaa gatgCCCCATCtagtgcaaaaaaattttcaaaatctttttcttcgcCTAA AATAAACTACTCAAAGTCGAAATACTTGTCTTCGCagatgtcttcatttt 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000380_pilon:34107..42718+

>XLOC_023387 ID=XLOC_023387|Name=XLOC_023387|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3216bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000380_pilon:34107..42718+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTGGTATTGCATATCTTATGCAAGGATTATTACAATCAGACgaatcgaa
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GGAGAATGATCAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_023387XLOC_023387-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000380_pilongenomesc0000380_pilon:34107..42718 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1261-1608:8265
Aaloc1036-1260:7228
Aaloc811-1032:6626
Aaloc661-807:5224
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Aaloc235-516:3014
Aaloc1-231:1