|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000444_pilon:93779..101768+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_023186 ID=XLOC_023186|Name=XLOC_023186|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7990bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000444_pilon:93779..101768+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) acgaactttgtaaCAGACATAAGTGTAagaaccactgacctttatatatt
tGGTTTATTGTTCAACGATGAGAGAGATGATTGGAAAAAAGGTTATCATT
acaggggggcgtacgggatatcggtacatcggtattggcctttttttaga
tcggtaaatcggtattagaGGAAAAAATTGATCGGTAATCGGTATTTTAA
GACCATCTCGGTATCGGTAAAAGACCCTTTttatgtcggtatttcggtat
ttttggTCAACTATCGGTATCGACCACCTCCTTGGTATCGAAGATCATGA
GTCTCAGCCAGGGGTCTGCTTGACACATTTTCCTGTcgtgaatacagttg
acgctctctaaacgATCCATTTTGGCGGTTTTGGCAGGGGGCCACGCCTC
CCCAAGTGGAGTTTTGAACGCCCAACTCTTAAAATTACCCTTAATGGGCT
TTAACTTGCGCCCAAAGACCagaaataacttgaaaaatcatgaatttttt
tgctcCCTTCGCTCGCAATTAAGTTATAAGACGATTTTTGAAGGGAGATC
TAACTGTGCCCCACGACCAATTTGGTGaaaacaatattcaaaacaaaaac
tcacaATTTCTTTCTTGCTTCATTCGCACGCACTactttccttcaatttt
ttgatctagagatggtattaaatttatatctttatccgttactttctact
attcgacattctatcACTCGATAAGCTCCCATTTTCGATGAAAGTTCGAG
GTTCCTTGATGGTTTTCCGTtctcttattcaatttttagcatTACGCTaa
acttttggtcaaatttaagcTCTGTTTTGGAAACAATTTTGGCTCGCGTC
AAACACAGTTAACTTTTTCCACTGACTAATAGAGAAGCATGACCATGGTT
gtgttttttgttctttttttgtcaaaaattttgttcaatgTCATTATACT
GTAATTGGCTTTACTCAATCCATCTCGATGAGCAATGTCGCAATTTTTAC
TTggtcgcttcgctcgcatttcctaaatatttctaaaatgacctgaattt
taACCTTTGGTATACGAATGCAACCAAAAAATGGCAGAATAAGCATACAA
GGCGCCTTAagccaaaattctacttttgcctGCCCAACCTTGAtctaccc
accacgctactgtttggTAATCGTCATAGAGACTTTGGATGGTGACAAAC
CAAACCTTTATCGCccacacatacccagcacccatatttgcctaagtacc
ccctccgggagataagtacctgaaaaattgggaaaaattgatCGGTGTCG
GTATTTGAACGAAAAATttatcggtatatcggtaattgagagaaaaagtg
atcggtatatcggtattacgaaggcccgtacgccccccacattACATCCA
CGTCAAAGACGTCTTCCGAAAACATATTGTGGCACGTGAAAAAGAAAGAT
TAGAAAATGTGTAAGTTGTTCATTCTCTAAAATTGCTCGTCTAGTTGACG
GGGGCACCTTTTGCagacattgggcttttccagaaaaaaactgtaggtcc
atccctctgtggtTGGAAATGCtgcaaccccctggaattccaggtaATTt
taggtttaaacccctctggaattctgaattttagtaggatttaaaaagct
accccacggaattccagttattttagGCAGATTTTTTgcatctccctatg
gaattccgccacatatcaaaccttacccctttggaacggaaatggacctc
ctcaacagagggtatacggtttttttctagaaaagcccatTTCTTATTGC
TCATTATAACAACtttaaaaagcagaaaaaatcaaatcataaaaactgtt
tttattcctaattaaataacgttttagggtgttttgagggtgtaaaaatt
ttctttgtcaccCAAACGGTAGgagccattttttccaaaatatccGACCC
CCCACTCCAAATGGCTCGCTGAGGCCCATGTTCGATCTAGAAGGGATAAA
AAGTTTTAGAGAAGGATTTGATGATGAAAAGAAGTCGAAAATATGATTCA
AAACCTTATTAAACATCCCAGCTGGTAAACATCAGATATGTTATTTTCTC
TTTAACCTTATTGTTTTAGGTTATCAGACGGACCACCCATtcaaaccaaa
attttaaacttcATCAAAAGTAGAGCTTACGAGGTTAAGCCAGGTTTGTT
GAACAAGAATTTCTTACTGCCtttttttCCTGTCAAACCCGGTGTACAAA
CTGGTGTACTTCGAGATAACCtaatattttatcaaacataACTAATGTAG
AACAGACCATGATTGAATTATATTgggggaatcgaacctcagccGCCTGA
GCAGAAACCAGACACCAAAAGTCAATGTCAATGACCACAAGTCCCCTCAC
ATCTTCCTCAcatcacatggtatgggttgatgACCTGGGCGATGCAAAGC
TTCAGTCGTCACTTGCGTGCCAAGTGAGCCGATGCAATTgggggaatcga
acctcagccGCCTGAGCAGAAACCAAACAACTAACCAAAGGTCAatgtca
atgaccactataccacagtgCCTGTGGGTGGCTGTAGTGACTGTGTATAA
ATaataccgtgaagttgggtaacttttgcatcagtggaggctaacatgca
tagccctcaaagaAATGACCTGGCAGCCTCTGGCACTTGGCTGGTCATTA
TtaaaaatacaactacgcagctccgctcgcagctctactacTCTAccgtt
tttgttttgatttgactttgtatttcaatgaccagccaggtctttcattt
gagggctaagCATGTTAGTCTCCACTGATGCAAAAGTTACCCGATCCCCC
GATCTCCACATATATCATATAGAGTACTGTATATTATGTTGTatgaaaac
aaaaccaaatttcaatgataaaaTCTTACTTTAAAAAGATCAAATATTAC
ATGTGTAAATTTCTCTTAAAAGTAAAAGTCATACAAAAGTGCAATGATGG
TTAAAATCCATCCAAAAATCCATTCAACGATCAATCCAAATTAATCATGA
TTAAAGAATTCACTACTTTCGGTAccatttttgattaattttgtaGCCTG
TATTTCTTTACTCTCTTTTCGAAAGTAAAAGTATAGTTCGAGGCTAATGG
AAAGATCCTGTAAGGTGTTGTAAGTAATCCTACCAGCAATATAGAGTGAG
TGATTAGGTACAGGCTAAAACATTCCCGAGCAGGAGATCATATCAAATCA
ACGTATTATGTTAATTCGACAAAGAACGGATTTAACATTATATGTTAAAA
CGCTTAAAGAATTGCAATTTACATATTATGTTAAAACTGCCGTCGATTAT
AAGTTGTTTTATCACAGCCtttcattttgaaagatttctgaaTCTTTTGT
ACCCTAGACGGTCGCAATGGATAAAATCGATCATCGATGTCTAATTcatc
gattaatatcgattagctatcgattttaatcgattatcgattttatcgat
taCGACCGTCTTGCTTATAAACACCATTACTAAGGATGGACAAAAGCATT
ATCGAAtagaaatgattatttttactttttcaggctacttgatcaagcat
gctgtgttttggttgattttttcatttttgagtgTATTCTTCTTTGTTCC
GTTATTTTATGGTGGCCCTTCGTTCCTAATAACACTTATCAAAGGATACT
GGTGAGTTCGAGCATTTTTACCCAGCTTTCACATAACGTTCTTTtcacgt
ttatctaatgttcacaacgtccatataacgtttgatgaacgttgaaacaa
cgttatgtgtcTGCTGGGTTCTACTCAGGTAGTTATgtctcaaaaatatg
aaaattaccataattttggAGAGAATCAGCCGGCGAAAAATGAGCAAACT
AATGATTTAATAAGAAGGGCACCATGACGAAGTTACCTTTAGCAAAACta
gatttatttgaaaaaacaagttttgctgacgtcatcaatttttgctTTTG
CGGTACCCATGGTACCCTTCGTATTAAGTCATTGGTTTGCTCATTTTCTA
CCGGCTAATGCTTTTCAAAATTATGGTAATGgttaatttcttttaaatat
gtttttgagacaGACCTAAGCTACTCatattcgggggggggggggtattt
aggAAAAACAGGTGACTTGTGTGCACGAGTCATAAGGGTACCCTTTAATA
CCTTagaagtccctcaaaggggagCAAACTCATAATTTATGCTCTCAAAG
GGTCGCTTTCGAGAATTGTGACCAACCGGAACTCAGCTAAGAAAGTGAGa
actttttttaccgtttttggAACCCTACAAAGGATTTTCCAAGAGGCTTT
AGTCGATTCCAAACAAATTTTCCTTTAGCATACCTGGTACCCAATTTTTC
TTTGGAAGGACGGGAGAAGTCCTTTAAAACAATATTTACTCCTGAGATGC
CCCTCATAATATAgacttttctagaaaaattgaattttttctcttttttt
tccaggCCATCAGTGATTGTGGCAGTAATAGCAGTGGTTGTTCAAAATGG
TTTGGCACGTGGATGTTTCTTACTCAGTAAAGAAAATGTCAGTGTTGATA
ATAGGTGATTTTTAGTTTATAAAGATTCTAAAAAAGCTAGAGATACATAT
ACTTGGTAAGTACTGAGTATTAGGGCTCACACGGCTTCTCAAATCTcctt
aaatgaaattttgtggaGAGGTTTGTTTTCATAGATAAAAAAGCTAAGAA
ATCTcctcaatttttacaaaaatataggaaaatctcctcaaaaattggaa
aatttctcCTTAAATCTCCTCAATTCTCCTCAAATCTCGAATTTTGAAAG
CCTGTGAGAACATTCAGAGATATAAATTGTGAGCCTGTAAGACTCAAGTA
TCGGTCTCAATAAACGTGTGCAAATAACCGTACTTTTCAAACAAACGCTA
TTGGTTGAAAGGAAAATCAAGCAAATCCATTGGTCTATCGTATAATCTGA
CGTAATGGTTGCCAAACACAGATGACACACATGACATGCATCCTAAATAT
agttatttgttcgaattacagagagattcgaataattgAAAGCAATTTTA
ACAGGGTTTTTCTTTGACGAagactggaaacaagttcgaattatagaagt
ttgGATAAACATAATCCTTATAAAACAACATTGGTCTGgaaagcttattg
ttttaactttttgttagctttttctttgttataatcaaaagatgaaaaat
cgatttgctcagttctTTGATCAAGTTGCCAAGTACTCCTCTTGAGATTG
GTGTaaaagatttaatcacatgatcaaaaagtgagcaaaacaaactaatt
tctcaacacaagttcaagtaagaaagaATGGAAAGAAACTAAAGTCTACC
AGActggggttttttatacggactatggtatAAACGAAAGTTTACCGTAA
GGTCCGAAATACTAATTTATCGTCTTTTTATTTTAGGCGTGGTTTCCACA
TTACGTCATACGTGCTCTTTTATTTCAACGTCTTTATTGGTATTGTGTCA
TGTTTACTACGCCTTGCTTATGGTGCCATCTTGGGTGTAGTCATGTTGTC
AAGGCTACAGAAAAGCACTCTACCAAGATCTTATGAACGAAGAGATCCAG
GTATATTGATAAGAAAGGCTCCGGAAGGCCCCAATAGGATGGGATTGACG
AAGGCACCCTCCTACCTTGCTCTTTGACTGGTCCCGTCACAACATTTAGC
TTAGTGAAATagatttaagaaattttaaacaagattaaaggttttgtctt
taaccctattaaccccaaccttttttgatttttgtagccgCAGGGAGGGG
gtggggtagaatctaccaccctctaTTATTTCTTATCTAGAAGAGCTATT
TTAGcttggttttatgtcatgttccACAATAAAGTCAGAAAACCTAACCT
AGaaaacctatgaccctaaaaaattgcacaaattttcaagatgtttcaaa
attttttctccgagatatacacaaaagaacatcagcgtggtagattctac
ccccttGGGCTAATAGGTTTAAATAAGAGTgcaatcttttttatattgaa
ctGATatagatgtggagcaagattatagtgagaaagaggaaaagaaagac
attttttgcttatatcagcacaatacaACAATGGGGagaccatagtataa
gaaagccgcggctttcttatactatggggagacattgtcctgatatgaaa
catgtgtctgatatgaaacggcaACACGTaaaaaaaaaCCCTTTAATTTA
CTACTACAATGATACAAGATAAGTCCAATCTTGATTTCATCCttttttgg
gttattttgatgatataaaagtttttttccaagatttttacttttctgat
caattttatttgtataacttttATACAGGTTTCTTAGCATATCTTGGTTT
CCTCATGGTTGAGCATCAACACTCGAACCCTGTCCTTCATTGTTTCGTGC
GCATTTTACTTGGACACATCGATAAATCTCTTCAACAAGATGAGTTCACA
GTTGTCAGAGGAGGTAAGTAACATATAAATCCCTGTCTTacaaccccggt
ggaactttttacCTCAAAGGGGATAGATATTTCTATTGAAATACCAATAG
AGATAGAatctctattgttccaaggttaaaaaacccaaatgcaatttcta
aacattgaattttgaaaggatgaaatcaaaatcaatttcacagtgaggct
gaaattctatGGTATTTTTCCGCCagtgacaaaatttttgccaaattttc
cagtggggctaggGTTCGAgcgggtttgtgacacaggggtgtacacATGT
TTCACCCAGCATTTTTCACCCGAAAAAAGGTCACCTTTATAAACTTACAA
ACAAACACACTTTACTTTTAAAACTCGCCATTGGATTTGACAACGTAGgc
ttttaaatttcattttgttcatGATGGAAGACATCCAATAGTTCATCATT
TATATTATCCGTATGGTATGTTTCTgtaacaatgtttttttttctccaaa
aacgagttttaaaaattctttgatTCTTGGTTTCCGAAAATTTGGTTTCA
GTCAATATGTGTAAAGTAAAGCTAGATATTTTACTCCAAAAAATTCtaca
tttttagaaaccaaagtCTTACTGAAAACCTACGGTTCAGCTGACAACGC
AGAATGGGGTGCTAACGGGTGCCCATTATCAATTAATAAATCACGCCAAA
GAACCGCTCAAGACGTATCACGTAGTGCACAGATCCGCTGGCATCTTGCC
GTAATTCTAATACAAAATCCGTCGATACGTAGATACCGTGGACATTATAT
ACGTCGTCATATTCCCGTAAAACATCTTACGCGTGCTTTATTTATGCAGT
TTAACGCAGGGAAAGAGCTTGAAGGAGAATCAAATGTTGATATTGATAAT
GTGAGAGCGGCTGCTATTGGTTATCAATATCGCACAGACCTTTATAACAG
TGAATCACCAGAACTGACCACAAGTGAAAAGTTTAAACAATGGTTGCAAT
TCGAAAAGTTTTGTAAACATCATTGTAACGAGACAAGTGACGACGTGGAG
CCTGAGGAGAGTCTTCCGGAtactttaaaatataaagcgaatgagaattt
taagaaatttttacaATTCATGAAATTTAGGGAAAGATCAACTTCAAATG
TATCAAGTAACTCTTCAACAACGAGAGAACAAAAAGTTGAATCTTTAGAT
GttcaaaaaatgatcaaaagtgTAACTGAAGTCAGTATTATTGAtgataa
tgatgaaaataaagaaacgaatgctgaatcagcagataATCCAAATGTTG
TCCATGTATCACCGAAGAGAGAGAAAGGGGAGCAAAGAAACACATGTGAG
CTAAATATCGAAATGGAAGAAGTTCATATAAATGAAGGTGTAGACAAAAC
cgataaaaagacacaaaataaACTCGATGCTTGGGTATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000444_pilon:93779..101768+ >XLOC_023186 ID=XLOC_023186|Name=XLOC_023186|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3180bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000444_pilon:93779..101768+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) acgaactttgtaaCAGACATAAGTGTAagaaccactgacctttatatatt tGGTTTATTGTTCAACGATGAGAGAGATGATTGGAAAAAAGGTTATCATT acagacgaactttgtaaCAGACATAAGTGTAagaaccactgacctttata tatttGGTTTATTGTTCAACGATGAGAGAGATGATTGGAAAAAAGGTTAT CATTacagCCACGTCAAAGACGTCTTCCGAAAACATATTGTGGCACGTGA AAAAGAAAGATTAGAAAATGTCCACGTCAAAGACGTCTTCCGAAAACATA TTGTGGCACGTGAAAAAGAAAGATTAGAAAATGTGTTATCAGACGGACCA CCCATtcaaaccaaaattttaaacttcATCAAAAGTAGAGCTTACGAGGT TAAGCCAGGTTATCAGACGGACCACCCATtcaaaccaaaattttaaactt cATCAAAAGTAGAGCTTACGAGGTTAAGCCAGgctacttgatcaagcatg ctgtgttttggttgattttttcatttttgagtgTATTCTTCTTTGTTCCG TTATTTTATGGTGGCCCTTCGTTCCTAATAACACTTATCAAAGGATACTG gctacttgatcaagcatgctgtgttttggttgattttttcatttttgagt gTATTCTTCTTTGTTCCGTTATTTTATGGTGGCCCTTCGTTCCTAATAAC ACTTATCAAAGGATACTGgCCATCAGTGATTGTGGCAGTAATAGCAGTGG TTGTTCAAAATGGTTTGGCACGTGGATGTTTCTTACTCAGTAAAGAAAAT GTCAGTGTTGATAATAGgCCATCAGTGATTGTGGCAGTAATAGCAGTGGT TGTTCAAAATGGTTTGGCACGTGGATGTTTCTTACTCAGTAAAGAAAATG TCAGTGTTGATAATAGGCGTGGTTTCCACATTACGTCATACGTGCTCTTT TATTTCAACGTCTTTATTGGTATTGTGTCATGTTTACTACGCCTTGCTTA TGGTGCCATCTTGGGTGTAGTCATGTTGTCAAGGCTACAGAAAAGCACTC TACCAAGATCTTATGAACGAAGAGATCCAGGCGTGGTTTCCACATTACGT CATACGTGCTCTTTTATTTCAACGTCTTTATTGGTATTGTGTCATGTTTA CTACGCCTTGCTTATGGTGCCATCTTGGGTGTAGTCATGTTGTCAAGGCT ACAGAAAAGCACTCTACCAAGATCTTATGAACGAAGAGATCCAGGTTTCT TAGCATATCTTGGTTTCCTCATGGTTGAGCATCAACACTCGAACCCTGTC CTTCATTGTTTCGTGCGCATTTTACTTGGACACATCGATAAATCTCTTCA ACAAGATGAGTTCACAGTTGTCAGAGGAGGTTTCTTAGCATATCTTGGTT TCCTCATGGTTGAGCATCAACACTCGAACCCTGTCCTTCATTGTTTCGTG CGCATTTTACTTGGACACATCGATAAATCTCTTCAACAAGATGAGTTCAC AGTTGTCAGAGGAGaaaccaaagtCTTACTGAAAACCTACGGTTCAGCTG ACAACGCAGAATGGGGTGCTAACGGGTGCCCATTATCAATTAATAAATCA CGCCAAAGAACCGCTCAAGACGTATCACGTAGTGCACAGATCCGCTGGCA TCTTGCCGTAATTCTAATACAAAATCCGTCGATACGTAGATACCGTGGAC ATTATATACGTCGTCATATTCCCGTAAAACATCTTACGCGTGCTTTATTT ATGCAGTTTAACGCAGGGAAAGAGCTTGAAGGAGAATCAAATGTTGATAT TGATAATGTGAGAGCGGCTGCTATTGGTTATCAATATCGCACAGACCTTT ATAACAGTGAATCACCAGAACTGACCACAAGTGAAAAGTTTAAACAATGG TTGCAATTCGAAAAGTTTTGTAAACATCATTGTAACGAGACAAGTGACGA CGTGGAGCCTGAGGAGAGTCTTCCGGAtactttaaaatataaagcgaatg agaattttaagaaatttttacaATTCATGAAATTTAGGGAAAGATCAACT TCAAATGTATCAAGTAACTCTTCAACAACGAGAGAACAAAAAGTTGAATC TTTAGATGttcaaaaaatgatcaaaagtgTAACTGAAGTCAGTATTATTG AtgataatgatgaaaataaagaaacgaatgctgaatcagcagataATCCA AATGTTGTCCATGTATCACCGAAGAGAGAGAAAGGGGAGCAAAGAAACAC ATGTGAGCTAAATATCGAAATGGAAGAAGTTCATATAAATGAAGGTGTAG ACAAAACcgataaaaagacacaaaataaACTCGATGCTTGGGTATGAaaa ccaaagtCTTACTGAAAACCTACGGTTCAGCTGACAACGCAGAATGGGGT GCTAACGGGTGCCCATTATCAATTAATAAATCACGCCAAAGAACCGCTCA AGACGTATCACGTAGTGCACAGATCCGCTGGCATCTTGCCGTAATTCTAA TACAAAATCCGTCGATACGTAGATACCGTGGACATTATATACGTCGTCAT ATTCCCGTAAAACATCTTACGCGTGCTTTATTTATGCAGTTTAACGCAGG GAAAGAGCTTGAAGGAGAATCAAATGTTGATATTGATAATGTGAGAGCGG CTGCTATTGGTTATCAATATCGCACAGACCTTTATAACAGTGAATCACCA GAACTGACCACAAGTGAAAAGTTTAAACAATGGTTGCAATTCGAAAAGTT TTGTAAACATCATTGTAACGAGACAAGTGACGACGTGGAGCCTGAGGAGA GTCTTCCGGAtactttaaaatataaagcgaatgagaattttaagaaattt ttacaATTCATGAAATTTAGGGAAAGATCAACTTCAAATGTATCAAGTAA CTCTTCAACAACGAGAGAACAAAAAGTTGAATCTTTAGATGttcaaaaaa tgatcaaaagtgTAACTGAAGTCAGTATTATTGAtgataatgatgaaaat aaagaaacgaatgctgaatcagcagataATCCAAATGTTGTCCATGTATC ACCGAAGAGAGAGAAAGGGGAGCAAAGAAACACATGTGAGCTAAATATCG AAATGGAAGAAGTTCATATAAATGAAGGTGTAGACAAAACcgataaaaag acacaaaataaACTCGATGCTTGGGTATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000444_pilon | genome | sc0000444_pilon:93779..101768 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 760-1590:7160 |
| Aaloc | 625-756:6431 |
| Aaloc | 460-621:5488 |
| Aaloc | 361-456:4507 |
| Aaloc | 244-357:3586 |
| Aaloc | 169-240:2121 |
| Aaloc | 106-165:1399 |
| Aaloc | 1-102:1 |
|