|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000067_pilon:38912..45148- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_022813 ID=XLOC_022813|Name=XLOC_022813|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6237bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000067_pilon:38912..45148- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAAAAATGAACCTTGACAAAGAAAGCATCCTGGCCAATCTGGCTAATAT
TGAAAATCAAATTGGGCAGGTCAAGCAGCAACTTGGGTAAATTTTTAATT
AAATGGATTAAACTTCAAAATTTATTTTTTACAAACGACAACACAGTCAT
CTACAGCTTGCAGGGTATTGCAGAAATCGTTGAGATCTCAGGGGCAAATT
TTTGCTTCCATTGTTAGACCCTTTCCAGAAAGTTTCTGTTATATTAACAA
CACTCAGGGAAATCTCCAGGAAATCTCTCTCTGGGGGAAATATCCAGGCG
TAGTCAATCGAAGGACCCTGCCGACGCACCGGACATAACGAACACCGGAC
ACACGAAAGTCCAGTGTAAAATGATAATTTTTTTTACCACCGGACAATTT
CTACACCGGACTTAAGGAAGTCGGATGTCCGGTGTCGGAGAAGGATATTT
TTTCCCACCGGACAATCAAAACACCGGACATGACCAGTCCGGTGCGTCCG
GTGTTTCTTAATTTTTTGTTTCATAAATGTCCGGCGTTCAAAATTCCCTG
TATGCAACACCGGACTTATTGTATGCAACACCGGACTTATTGCGTCCGGT
ATAGCGAAAGGATACTTTTTGCCACCGGACAAATACACCGGACAGTCCGG
TGCGTCGGCAGGGTCCTTCAATCGACGACGTCGATTATCGATGTACTCGG
TAATAATCTATTTTCATCGACGGTAATCAGTATATAATCAATGTGTAATC
GTCCTTTTATCATCGATTAGTTATCGATTACCGTCGATTATCATCGATTA
TTACCGATTACCATCGATTGATCATTCCATACTAATCGATGATAATCCAG
AATTTTTATCCAGGGAAATGCCGTGGCCACAATGTTTTGCTTTAGTGAGA
TTGACCATTTTGTTGTTTAGATTTGAGCGGGCGAAATTTCTGTACAAACC
AAAATATGGCTTCGTTGGAATACCGGTTGAAACACTTGTGTCAATGGAAT
GTAACTTTTCGCGTCGATTAATCGTCGATTCGATTACGTATCGATTATTA
TCGATTATCATCGATTACCATCGAAATACTATCGATTATTTTTCCGCATC
GATTTCATCGATTGACTACGCCTGGAAATATATCCAGATGGTGTCAGTCG
AACGACTTCAAACAAAAATCGCAATCGAACCAATCGAACGTAATCGAACG
CGATCGAATAATTGCGATTCGATTGTCAAACGTAATCGAATCTCAATCCA
ATGGCCAATTCCTGGGTAATATTCGATTGTGTTCGATTGTGTTCGAGTAA
GGTTAGATTGGTTCGATTAATAGTTGACTATGTTTCATTGGTTCGATTGA
TTTTCAATTACATTCGATTAATATTCAATTTCGTTCGATTACAATAACGT
TCGATGAGTTTGATTGCGATTAAATTAAATTTGATCACTTCATTAGAGCT
TTTTAGTGTGGGCGGCCGAGAGCTTAAGTATCGTACGAAAGCAAATAAAA
TCTAAATCAATCGAGCATAATCGAACATAATAGAATACAATCGAACGTAA
TCGAAGCAATCAAACAGCAAATCCTAGGTAATATTTGATTACGATTCGAT
TGCGTTCGACAATGGAATTGCAATTATTCGATTGTGTTCGATTGCGTTCA
ATTGATTCGGCGTTGGATTCGTTCAATTGACACCGTCTGGATATATAGTT
GCAAATTCTGAAATCTTGTGTTGCTACCAAAAGAGGTATACAAAGATAAG
AAAAAGCATGAATTTGAAATGGGAGAATCTTCGGTCGAAACAATTGTTAA
AGATAAATTTTATTTAATAAAATAGACCAGGGGATGTCAATCAACCGTTC
GATCGCCAATCTAACCAATCAAATAATTAATCGAACCCAATCGATTGATT
GCTTTTCGATTAATAAAATTGATCAAACACTAATCAAATTCTAGTTGAAT
CCAAAAAACATGTGAAATTCGATTGGTTTGGATTGGCTTTGACCAGTTTG
ATTAACGTTCAATCAGTTTCGATTAACGTTCAATCAGCTTCGGTTAACGT
TCAATCGACTTCGATTAGCTTGCGATCAGCTTCAATTAACATTCAATCAG
CTTTGATTTTTTAATGTTCGATCAAATTCGATTTTTTGATCAACTTTGAT
TTATCTTCGATTAACTGTGGATTAACGCACGTACGATCAACTTCGACATT
ACATAAAAAAAGTTTAAATTTTTGTTGGGGCTAAATTTGGAAGATCTTTT
GTAACATCACCCATCACCACGAAATTCCCTTCCTCCAAAAATAGTTCCAC
AAAGAATGTTTACTTTATCATTCAATAGAATACTATATTCCTCATCAGTT
GATTGGTGGCTTGACTTTTTAGCCATCGATTTTAGTCTTTGAGCAGATCC
TGAATCCATATACGGGATGATATACAGTCAATCACAAGAGGACCTAAAGT
TAAAATCTTTTTAAAAAATGACAAATCCTTGAGGAGATATAACCCGTAAA
GTTGACAATATTTTTTCACTTATTTTGGATTATAAGCCTATGTTGAAAAC
TTGTATTAAAGGGATTCCTGCATAAAAAATGAAAGTTAATCCATGTAGAG
CTATCATGAAAAGCATTTGGAAAATTCAAGTCAATGTTGTCTTAACAGTG
ATTCTATCCTTAGATATTGACATCCAAAGTTCCAAATTCAAGACATCTGT
CCTCTGTGGAAGCCATATTGAATTGAAAATTTCAAAGTTTGATTTCAAGC
TCTTTGGCATTCTTAATCCTTATTAGGTTAGGATTGAGGACTGGTTTGCT
TTGACAAAGTCTTATTTTTTATGCTGGAATCCCTTTAATGTCAATTGATT
TAAGTTCTTAAACTGTTGCACAATCTAATCAAGATGACGTCACAATTTGC
AGATTCTCTGCGGGAGTTACTTTATGAACAATGTAGACAGGCAGCTGATG
ACATCAAAAAAAGTGAATAAGTGAAAATTCGAGGGACAAATATTGAGTAC
TTATTTTGAAATCTTTATAGTTTAGAGAGTCAGAAAAATTTACTCGGCGT
GTTTAAAAATCTTTACCGGACGTGTCCGAGAATAATATATTAATTGATGA
CGTCACAAGCAAAAGTGAAAAATTGATGTTGCAAAATTTCAAAGTTATAT
ATACCATTCGAAGCGTTTTTTGATGTAGATTTCAAATCACATCAATCTTA
ATAAGTATAAATTTGAATATGAAAAGTTATCGAGGTCCGTAGCTCTTCTA
TGACGTCATTTTTGAAAAAATGCCTCATTTTATAAGGAATTACGATCTCA
ATTTTCTTGAGTTAGGCTGAGAAATCGAATATACCCGTTTAATTGTCTTC
TATATAGTTTTTGACGAGCTTTCGAATGGTGTAAATTGTTTTTCGATTTG
ATGACGTTAAAATTTGACATTTTTAGGGGGTGAGAGGGTCATGATTGACC
AAAATCACATGTCAAATTTAAGTCATAACTTTTGAAATCTAAATTTTCAC
CTATTGAGACTGATGTGATTTAGAATCTAGATCGAAAAATGCGTCGAATG
GTATATATATCATTATTATATGCTGAAATCAAATTTTCACTTTTGGTGGT
GACGTCATCATTTGACAAATTATTACCGGACATGTCCGTTAAATAAATTT
TCGGACGCCGAGTAAAATTTTTAGGATCAGTAGATATATGGGAACAAGAA
AAATCAACTCGACGTTTGTCCCAAAGTCGTCCAGATTTTAGATGTCGTCA
GCTGCCTGTCTAATGAACTTGGGCTGGGTGCATCCCCAGAATTTTTTTTA
TCGGCTATATCAAATCATATCAGAGGGGATGCGGGCAGAAGTTCATTGTC
CAAGCATGCCTAGCAGAATAGGCCTTTTAAAACGCAACTGGTCGAAAAGA
TTCGACGTGGCCTGTGATTATCAATTGACGAGTCCAAGTTGAAAGCCAAA
TTATACCTTTGTACCTCTTTGCATGCGTAAGAAAAAAACACAAATGATTA
ATACATCCAAGTAATATGGTTAAATCTCTCCTTTTTAAGTGTGAGAGATA
CTTTTCTCAAAAGAATTATGAAAGGACCTACTGGAATTAACAAACCATAC
ATACCCCTTATCCTAATTTGCCTAAGTGCTCCCCAGAATACCAAATACAA
GATAATCACATATTCTTCTTTTTCTCACCTCAGTACACCTTCAACTACCC
TAACAACGTGAGTTGATTTTGTACACAGTCATGTGATATGTTTAGGAATT
TTTAAACTTGATTTTGTTTCTCTTGGATCAGAGAATTAGACAATTTCATC
TATTTTTACTGCTACCTTAAGGAAATAAATTAGTGTGTGAGAGTAAATTA
ATGCAGAATAAATTAATGTGAATCGACCCTTATTCACATCATTTAATTCA
GCATTTCCTAAAATTGTTTCATATGCATTAATAAATTCTGCATTATTTTG
CTATCATTTTGTATGAAAGAAATGTTTCATTTTCACTAATTTATTCCACA
AAACATAAATTTATCCGGCCTTATTTGCATTAATGAATTCTGCATTTTAA
TTTATTCCTGCATTAATCTATTCCCTTTATGCACTTTGATCGTATTTTTA
AAGAGTATCCATTATCTGGGTGAAATTTCTCTGATAAAAAACAAGTAAAT
TAATAGCACTTTGTTTGTATCAATTGTAATTTAATTATCCACTGAATGGA
ATTTTTCATTTTAGGTCGTCTGGAACATGTTCAATGTTGAACAACACTGC
TTCTTTTACACAGTGAGTCTAGAATGAAGAGCTTTTGTCAATGGTGCTTT
CCTCAGACTCAATTATTTCAAATTTCAAAAAAAGTCCTGGAACCCCTAAG
AAAAAGTATGCCTGTGTGGAAACTCAAAATTTGCAAAGCAACCCAATCTG
ATAGTGATTCTAAGAATGCCTGCTTAGGTTTAATTAAAGCTTCCGCAAGT
GGAACCATCAAAAAGATAACTATTAGAGTAAATAGCTGTCTTAGTATCTT
AAACTAGATTTGAATAAAATTCTTTAAGAATCACAGGTCATTTTTGATAA
TTATACATGTATAAATTATCTTCTTCTAGAGTATCAAATGTAACAATTCC
CGAACGTTCCTCCAACACTATGTCTCCTATTCCATTGTAAGTGTTATTAT
CTCATCTCCATTCCTCTATCGATGTATCTTGAGAAAACACGTCTCACTCC
ATTAGCGAATGCCATCTAATTTAATTTATCCTCATATCTTTCTTTAGCAT
TTCAGGCTGACCTTCCAGCGCAGCTCAGAAGTTAGAACTAACTTTATTAA
GTGTACAAAGGGTGGTGGTGTTACTAAATTCTTGCGGAAAAGTAGTTAGT
AGGCCTGGCACCACCCAAAAACAGCAGTTACTACACTGTGTAGTAGCTGT
TTTTAAAGCTTTTTTGTAATTTCTACTGTTTATTTAGGTATGATCAGAGT
CAAAGGGACAAGGTGCAAGAGCAAATGAAGTAAGCCCTGATACTTTGGGG
ACATTCAAAAACTATGTTTGCCAATAGCTGAACCCTTTTGGCCAGTTTGG
CAACAAACATACTTTTTGAATTAACCTAACAATGTTTTATGTGTTTTATA
AGCACATGATCATTTTCCCCCTTGCTCTTACTCAGACACACTCTGACTTA
CTTTGATCTTTGAGAACGAAATTTTTTAGGAAAAGAATTCTTTTTTCTTC
AGAATTTTTTGTTCCATGTTCTTATGATAGCCAGGTAGGTCCATAAAAGA
TTGCTTGTTAAAAGGTAAATAATTTGATTCTAATTCTAGGCACCTATTTC
CACAAATATCCAATGATCGTAAAAGGAAAAGAAACAACTTAGCTGTTGGT
CTGAATTCAAATCCATTCGTTAAAGACAGCTTCACCAGGGAGTACACATG
CCTCCCACTGGTCACTAGTGTCACAACTCCCTCAAGCCAAATGGCAATGA
CACTAGAGTACGCAGGTTTAGGAAAGAAGAAGATCACATTGCCAAGCAAC
GCTAATCATGCTGAAGTGGTAGCAAACATCCATTCAGCATACCCAAGATT
AAAAGAATGTGGTTTTTTCACTATGCACAAAGCCAAGAGAGGAGGAAATT
GTCAACCCCTGCAAGACATGAATTTGGACTCGTATGACGTGAACTCGTTA
CGTAAAAAGTTTAAATCTAAATCGTTGATTTATTTACGTCCATTACAGAA
AAATCTAGATTTGTCATTGGTCACAAAAGAAGAGGTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000067_pilon:38912..45148- >XLOC_022813 ID=XLOC_022813|Name=XLOC_022813|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1362bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000067_pilon:38912..45148- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAAAAATGAACCTTGACAAAGAAAGCATCCTGGCCAATCTGGCTAATAT
TGAAAATCAAATTGGGCAGGTCAAGCAGCAACTTGGTTAAAAATGAACCT
TGACAAAGAAAGCATCCTGGCCAATCTGGCTAATATTGAAAATCAAATTG
GGCAGGTCAAGCAGCAACTTGGGTCGTCTGGAACATGTTCAATGTTGAAC
AACACTGCTTCTTTTACACAGTCGTCTGGAACATGTTCAATGTTGAACAA
CACTGCTTCTTTTACACAAGTATCAAATGTAACAATTCCCGAACGTTCCT
CCAACACTATGTCTCCTATTCCATTAGTATCAAATGTAACAATTCCCGAA
CGTTCCTCCAACACTATGTCTCCTATTCCATTGTATGATCAGAGTCAAAG
GGACAAGGTGCAAGAGCAAATGAAGTATGATCAGAGTCAAAGGGACAAGG
TGCAAGAGCAAATGAAGCACCTATTTCCACAAATATCCAATGATCGTAAA
AGGAAAAGAAACAACTTAGCTGTTGGTCTGAATTCAAATCCATTCGTTAA
AGACAGCTTCACCAGGGAGTACACATGCCTCCCACTGGTCACTAGTGTCA
CAACTCCCTCAAGCCAAATGGCAATGACACTAGAGTACGCAGGTTTAGGA
AAGAAGAAGATCACATTGCCAAGCAACGCTAATCATGCTGAAGTGGTAGC
AAACATCCATTCAGCATACCCAAGATTAAAAGAATGTGGTTTTTTCACTA
TGCACAAAGCCAAGAGAGGAGGAAATTGTCAACCCCTGCAAGACATGAAT
TTGGACTCGTATGACGTGAACTCGTTACGTAAAAAGTTTAAATCTAAATC
GTTGATTTATTTACGTCCATTACAGAAAAATCTAGATTTGTCATTGGTCA
CAAAAGAAGAGGTTGCACCTATTTCCACAAATATCCAATGATCGTAAAAG
GAAAAGAAACAACTTAGCTGTTGGTCTGAATTCAAATCCATTCGTTAAAG
ACAGCTTCACCAGGGAGTACACATGCCTCCCACTGGTCACTAGTGTCACA
ACTCCCTCAAGCCAAATGGCAATGACACTAGAGTACGCAGGTTTAGGAAA
GAAGAAGATCACATTGCCAAGCAACGCTAATCATGCTGAAGTGGTAGCAA
ACATCCATTCAGCATACCCAAGATTAAAAGAATGTGGTTTTTTCACTATG
CACAAAGCCAAGAGAGGAGGAAATTGTCAACCCCTGCAAGACATGAATTT
GGACTCGTATGACGTGAACTCGTTACGTAAAAAGTTTAAATCTAAATCGT
TGATTTATTTACGTCCATTACAGAAAAATCTAGATTTGTCATTGGTCACA
AAAGAAGAGGTT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000067_pilon | genome | sc0000067_pilon:38912..45148 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 235-681:448 |
| Aaloc | 193-231:800 |
| Aaloc | 136-189:1158 |
| Aaloc | 88-132:1523 |
| Aaloc | 1-84:6238 |
|
