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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000067_pilon:28001..30923- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_022811 ID=XLOC_022811|Name=XLOC_022811|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2923bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000067_pilon:28001..30923- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCAGGACGTCACAGATACTATGTAATTATTCAACTTTTTTTCGGTAG
CGTGTCTTAATCATATGTGACTGGATTATGATTACATTGTCTTTTTCACC
AGTCTCCTAAAATATCTTCAAATATTATACTAAGGTCAATGATAGTCCTG
GGATCAAGGTTGGTATAAACTTAATATCAACCAATGAGAAGCCTGAACTG
GTTAACTCATTAAGTGTCAATGGCATGGCTTCATATGATATCGGCCGATT
CCTAAACATAATGTCATCCTGTTTCTAAACCCGAAAAAAAACCATATCGA
GAAGCGACAAATTTTTCTTACTTGGGGCGTGATCGTGCATTTGAAGAAAT
CAAAAAATAAAATTTGAAATTACGGATTGATGGCATTTAATGGATTAACC
AAAATCAATTAACAATAAATCAGTGTATTCATTTATCATCTTATTATCTT
CAATTTTAGTTACAACCGAGTGGACTGAACGTTATCATTGAACACATTGA
GAAGATTTTCCATCAAATAAAGTCAATAATTAAAATGCCCGACGCAAGTA
TGGATGACTTAGAGGGTGTGTTTAGCACTTTATGCAGAACGGAAAGAATC
TTGACTGACTTGGAAACTCTATATAATGTGCGGGAGTTTTCTATAATCAA
TCGATGTATTTATAAGCTAAAGGATGAGCTTAAAATAGAAAAAATGGTAA
TTCAACCCGTGAAAGTTGTTCAAAAAGTACCACAAGAAATCGGACCTCCA
AAATACTTTATCCCTGTTGAAGTGCTTGAATATTATGTTGAAAACGGATT
TAAAAATGTTGATATTGCGAAGATGCTACATGTAAGCCTCAGTACTATTA
AAAGACGGCTTAGTGAAAACACTCTAAACAAAAAAGATAAGTTCAGCAAG
ATGACAGACGATGAACTTGATGTAGTGGTAAATGAAATTCTTGTGGATCA
TCCTAATACTGGTTACAAGAAGATGAGGGGTTTTCTGTTGGCACGAGGAT
TGATTCTCCAAGAACGTAGGGTACGAGAAGCGATGAGGAGAGTGGATCCT
GAGGGAGTAATAGTTCGGTCATTACAGTCAAGAGTAGTTTTAAGAAGAAA
ATATCGCGTCGCTGGTCCTCTGTCATTGTGGCACATGGATGGAAATCATA
AACTAATTAGGTAAGAATATCCAATATACTGTAATATAAAGTATTTGCTA
AAAGTGCACTCCTTGATTTAAATTTTCTGGACGTTTTTCTTTATTTTCAT
AAATTTGATTTTTTTGATCACTTTTCAACCTTGGTACAATAAGGCTTCGA
AATAATATGGAAAAGAGCATCACTGTTACACACGTTAGGGAATGTTTTAC
CGATAATGAATTGATACTGATATCATGTAGTGTTTTTAGTTACAGGATGG
TTATACACGGGTGTATTGATGGCTACTCTAGGCGTATTATTTACCTATCA
TGTGCTAACAATAATCAAGCTGCTACTGTATTGGAATTTTTCAAAAAAGC
TATCTGTATACACGGTCTTCCTTCAAGAGTTCGAGGTGATCACGGTGGTG
AAAACGTTGACGTTGCTCGTTTGATGTTAATGCATCCTTTACGTGGCCTT
GGGAGAGGCAGCTTTATTGCTTCCAAGAGTGTGCATAATCAGCGCATTGA
ACGCTTGTGGGTTGACGTTTATCACGGAGCTACTAAATTATTTCAGACAA
TTTTTCTCAGTTTAGAGAATACTGGAAATTTGAACTTGTCGTCTGAAATA
GATTTGTTTGCATTGCATTTTGTCTACATTACAAAAATCAATAAATCTTT
AAAAGCGTTTGTCAATGGTTGGAACCACCACCCACTAAGTACGGAAAACA
ACAAAACACCCAATCAACTGTGGATTTCTGGACTGCATAAAATTGCTGGT
ACAGGCTCAAAGATAGATGAAGAAATATGGGAACCAAAAACTGACGTAGG
TCTAAATTTGATATCAAAATCATAGTATACCTTTTCAATCTTAAAATTTT
AAGATGCTCCCCTTTTACGAATTTAGAAAGATGCACGATAACTTTTAACT
CTGTTTAACTAACAATATGTAAGGACCTACTCTTTCAAAAACTAATATAC
TTTGGATTCGTCAATTTTAAGAATTGTCTGCATAGATAGATCGTCATACT
GGGCCAAGGAACCCCAACTAAAACTTTTCCTGGTACTTCAAGTAGTAAAT
TAATGAAATCTGGTAGAATTGGTTCATAAATGGCCCTTACGTAGAATTTT
CCCCTTTTTTAACTTGACAGGTTTTGGGTAGGGTTTGTCGGATGTCGGCA
TGCTGATCTTAGTTCGGCGAAAAAAACACCATTAAACGCAAAAAATTTTG
AAATGTTGCAAATAGTTGCAATAACAGATTCCTGAGCTATTTCATATGGC
CTTTTAACTCCTTCAATACAGTGGGAAACCTAAATTTTTTTTATTTTTTT
TCTAATAATGATGATGTTTCAAAAGCAAAAGCAAAACATGTCATATTTGA
GTTTGTTAGTTCTTTTCAAGAGCTATCTTTTTAGTGAGCCAATTTTAAAG
TTTTAAGGACCTAACAAAATTACCAGCTCGGAATAAGATTAATTCATTTT
TTTTTTGTTTTCGATAAAAACTTCAGGAAGAAGCAATGTATTATGGGATT
GATCGATCATCAAATGTTGATAATACTCGGCAAGAAGATGAATATAAGCA
TGTTTTTGTTCCATCAATTGAACCGAATGTTCCAGAGGACCTGATGATTG
TAATCAATAACAGTTTTGGCCCTTTAGTTGACAGCGATGCAGACGAAGAT
CATGGCGTATCAACGTATCTTCGGTTGCGTAATTTCTTGTATTCTTGTAT
ATCTGCGCTAAATTTAAGTAGGGTCTTTGTAAATTTTTGTAGAAATAAAG
CTAACGATAAGAAATTACTTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000067_pilon:28001..30923- >XLOC_022811 ID=XLOC_022811|Name=XLOC_022811|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3156bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000067_pilon:28001..30923- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCAGGACGTCACAGATACTATATGCCAGGACGTCACAGATACTATTT
ACAACCGAGTGGACTGAACGTTATCATTGAACACATTGAGAAGATTTTCC
ATCAAATAAAGTCAATAATTAAAATGCCCGACGCAAGTATGGATGACTTA
GAGGGTGTGTTTAGCACTTTATGCAGAACGGAAAGAATCTTGACTGACTT
GGAAACTCTATATAATGTGCGGGAGTTTTCTATAATCAATCGATGTATTT
ATAAGCTAAAGGATGAGCTTAAAATAGAAAAAATGGTAATTCAACCCGTG
AAAGTTGTTCAAAAAGTACCACAAGAAATCGGACCTCCAAAATACTTTAT
CCCTGTTGAAGTGCTTGAATATTATGTTGAAAACGGATTTAAAAATGTTG
ATATTGCGAAGATGCTACATGTAAGCCTCAGTACTATTAAAAGACGGCTT
AGTGAAAACACTCTAAACAAAAAAGATAAGTTCAGCAAGATGACAGACGA
TGAACTTGATGTAGTGGTAAATGAAATTCTTGTGGATCATCCTAATACTG
GTTACAAGAAGATGAGGGGTTTTCTGTTGGCACGAGGATTGATTCTCCAA
GAACGTAGGGTACGAGAAGCGATGAGGAGAGTGGATCCTGAGGGAGTAAT
AGTTCGGTCATTACAGTCAAGAGTAGTTTTAAGAAGAAAATATCGCGTCG
CTGGTCCTCTGTCATTGTGGCACATGGATGGAAATCATAAACTAATTAGT
TACAACCGAGTGGACTGAACGTTATCATTGAACACATTGAGAAGATTTTC
CATCAAATAAAGTCAATAATTAAAATGCCCGACGCAAGTATGGATGACTT
AGAGGGTGTGTTTAGCACTTTATGCAGAACGGAAAGAATCTTGACTGACT
TGGAAACTCTATATAATGTGCGGGAGTTTTCTATAATCAATCGATGTATT
TATAAGCTAAAGGATGAGCTTAAAATAGAAAAAATGGTAATTCAACCCGT
GAAAGTTGTTCAAAAAGTACCACAAGAAATCGGACCTCCAAAATACTTTA
TCCCTGTTGAAGTGCTTGAATATTATGTTGAAAACGGATTTAAAAATGTT
GATATTGCGAAGATGCTACATGTAAGCCTCAGTACTATTAAAAGACGGCT
TAGTGAAAACACTCTAAACAAAAAAGATAAGTTCAGCAAGATGACAGACG
ATGAACTTGATGTAGTGGTAAATGAAATTCTTGTGGATCATCCTAATACT
GGTTACAAGAAGATGAGGGGTTTTCTGTTGGCACGAGGATTGATTCTCCA
AGAACGTAGGGTACGAGAAGCGATGAGGAGAGTGGATCCTGAGGGAGTAA
TAGTTCGGTCATTACAGTCAAGAGTAGTTTTAAGAAGAAAATATCGCGTC
GCTGGTCCTCTGTCATTGTGGCACATGGATGGAAATCATAAACTAATTAG
TTACAGGATGGTTATACACGGGTGTATTGATGGCTACTCTAGGCGTATTA
TTTACCTATCATGTGCTAACAATAATCAAGCTGCTACTGTATTGGAATTT
TTCAAAAAAGCTATCTGTATACACGGTCTTCCTTCAAGAGTTCGAGGTGA
TCACGGTGGTGAAAACGTTGACGTTGCTCGTTTGATGTTAATGCATCCTT
TACGTGGCCTTGGGAGAGGCAGCTTTATTGCTTCCAAGAGTGTGCATAAT
CAGCGCATTGAACGCTTGTGGGTTGACGTTTATCACGGAGCTACTAAATT
ATTTCAGACAATTTTTCTCAGTTTAGAGAATACTGGAAATTTGAACTTGT
CGTCTGAAATAGATTTGTTTGCATTGCATTTTGTCTACATTACAAAAATC
AATAAATCTTTAAAAGCGTTTGTCAATGGTTGGAACCACCACCCACTAAG
TACGGAAAACAACAAAACACCCAATCAACTGTGGATTTCTGGACTGCATA
AAATTGCTGGTACAGGCTCAAAGATAGATGAAGAAATATGGGAACCAAAA
ACTGACTTACAGGATGGTTATACACGGGTGTATTGATGGCTACTCTAGGC
GTATTATTTACCTATCATGTGCTAACAATAATCAAGCTGCTACTGTATTG
GAATTTTTCAAAAAAGCTATCTGTATACACGGTCTTCCTTCAAGAGTTCG
AGGTGATCACGGTGGTGAAAACGTTGACGTTGCTCGTTTGATGTTAATGC
ATCCTTTACGTGGCCTTGGGAGAGGCAGCTTTATTGCTTCCAAGAGTGTG
CATAATCAGCGCATTGAACGCTTGTGGGTTGACGTTTATCACGGAGCTAC
TAAATTATTTCAGACAATTTTTCTCAGTTTAGAGAATACTGGAAATTTGA
ACTTGTCGTCTGAAATAGATTTGTTTGCATTGCATTTTGTCTACATTACA
AAAATCAATAAATCTTTAAAAGCGTTTGTCAATGGTTGGAACCACCACCC
ACTAAGTACGGAAAACAACAAAACACCCAATCAACTGTGGATTTCTGGAC
TGCATAAAATTGCTGGTACAGGCTCAAAGATAGATGAAGAAATATGGGAA
CCAAAAACTGACGAAGAAGCAATGTATTATGGGATTGATCGATCATCAAA
TGTTGATAATACTCGGCAAGAAGATGAATATAAGCATGTTTTTGTTCCAT
CAATTGAACCGAATGTTCCAGAGGACCTGATGATTGTAATCAATAACAGT
TTTGGCCCTTTAGTTGACAGCGATGCAGACGAAGATCATGGCGTATCAAC
GTATCTTCGGTTGCGTAATTTCTTGTATTCTTGTATATCTGCGCTAAATT
TAAGTAGGGTCTTTGTAAATTTTTGTAGAAATAAAGCTAACGATAAGAAA
TTACTTTAGGAAGAAGCAATGTATTATGGGATTGATCGATCATCAAATGT
TGATAATACTCGGCAAGAAGATGAATATAAGCATGTTTTTGTTCCATCAA
TTGAACCGAATGTTCCAGAGGACCTGATGATTGTAATCAATAACAGTTTT
GGCCCTTTAGTTGACAGCGATGCAGACGAAGATCATGGCGTATCAACGTA
TCTTCGGTTGCGTAATTTCTTGTATTCTTGTATATCTGCGCTAAATTTAA
GTAGGGTCTTTGTAAATTTTTGTAGAAATAAAGCTAACGATAAGAAATTA
CTTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000067_pilon | genome | sc0000067_pilon:28001..30923 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1282-1578:298 |
| Aaloc | 727-1281:1534 |
| Aaloc | 25-723:2465 |
| Aaloc | 1-24:2924 |
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