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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000130_pilon:109948..111533- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_022707 ID=XLOC_022707|Name=XLOC_022707|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1586bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:109948..111533- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACTCCGCCGCCTGAACATGACGCTCCGCCGCCTGAACATGACGCTCCACC
GCCTGAACATGACGCTCCGCCGCCTGAACATGACGCTCCGCCGCCTGAAC
ATGACGCTCCGCTGCCTGAACAAGACATTTCTACGTCTCATCATGGCGCT
TCAACGTCTCATCATGGCGCTTCAACGTCTCATCATGGCGCTTCAACGTC
TCATCATGGCACTTCAACGTCTCATCATGGCGCTTCAACATCTCAACATG
GCGCTTCAACATCTCAACATGGCGCTTCAACGTCTCATCATGGCGCTTCA
ACATCTCATCATGGCGCTTCAACATCTCATCATGGCGCTTCAACATCTCA
ACATGGCGCTTCAACGTCTCATCATGGCGCTTCAACGTCTCATCATGGCA
CTTCAATGTCTCATCAAGGTGCTCCTACGTTTTATCATGGCGCTCCAACG
TTTCATCATGACGCTCCTACATCGCAACAAGGCGCTCCTACGTCTCACCA
AGGCGCTCCTTCGTATCATCAAGGTGCTCCTTCGTTTCATCAAGGCGCTC
CTTCGTTTCATCAAGGCGCTCCTTCGTTTCATCAAGGTGCTCCTACGTCT
CATCAAGGTGCTCCAATATATCATCAAGGCGCTCCAACTTCTCATCAAGG
TGCTCCAACATATCATCAAGGCGCTCCTACGTATCATCAAGGTGCTCCAA
CATATCACCAAGGTGCTCCTACGTCTCATCATGGCGCTTCTACGTCTCAT
CATGGCGCTCCTACATCTCATCATGGCGCTCCTACGTCTTATCAAGGTGC
TCCAATGTTTCATCAAGGTGCTCCAATGTTTCATCAAGGTGCTCCAATGT
TTCATCAAGGTGCTCCAATGTTTCATCAAGGTGCTCCTACGTCTCATCAA
GGCGCTCCTTCATCTCATCATGGCGCTCCAATGTATCATCATGGTGCTCC
AATGTTTCATCATGGCGCTCCTATGTCTCATCATGGCGCTCCTGCGTATC
ATCAAGGTGTTCCCATGTTGTATCAAAGCAATCCATGGTCCCATCATGGT
TGGTCACACACCTACCCTTTGACCTCACAACTCAACGCTCCAACGTCACC
CATCAATGGTCAGACTTCACCCATCAATGGTCAGACTTCACGTATCAATG
GTCAGACTTCACCCATCAATGGTCAGACTTCACCCATCAATGGTCAGACT
TCACCCATCAATGGTCAGACTTCACGTATCAATGGTCAGACTTCACGTAT
CAATGGTCAGACTTCACGTATCAATGGTCAGACTTCACGTATCAATGGTC
AGACTTCACCCATCAATGGTCAGACTTTACCCATCAATGGTCAGACTTTA
CCCATCAATGGTCAGACTTCACACATCAATGGTCATACTTCACACATCAA
TGGTCAGACTTCACACATCAATGGTCAGACTTCACCCATCAATGGTCAGA
CTTCACACATCAATGGTCAGACTTTACACATCAATGGTCAGAATTCACCC
ATCAATGGCCCGACTTCACCCATCAATGGCCCGACTTCACCCATCAATGG
TCAGACTTCACCCATCAATGGTCAGACTTCACACAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:109948..111533- >XLOC_022707 ID=XLOC_022707|Name=XLOC_022707|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3172bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:109948..111533- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACTCCGCCGCCTGAACATGACGCTCCGCCGCCTGAACATGACGCTCCACC
GCCTGAACATGACGCTCCGCCGCCTGAACATGACGCTCCGCCGCCTGAAC
ATGACGCTCCGCTGCCTGAACAAGACATTTCTACGTCTCATCATGGCGCT
TCAACGTCTCATCATGGCGCTTCAACGTCTCATCATGGCGCTTCAACGTC
TCATCATGGCACTTCAACGTCTCATCATGGCGCTTCAACATCTCAACATG
GCGCTTCAACATCTCAACATGGCGCTTCAACGTCTCATCATGGCGCTTCA
ACATCTCATCATGGCGCTTCAACATCTCATCATGGCGCTTCAACATCTCA
ACATGGCGCTTCAACGTCTCATCATGGCGCTTCAACGTCTCATCATGGCA
CTTCAATGTCTCATCAAGGTGCTCCTACGTTTTATCATGGCGCTCCAACG
TTTCATCATGACGCTCCTACATCGCAACAAGGCGCTCCTACGTCTCACCA
AGGCGCTCCTTCGTATCATCAAGGTGCTCCTTCGTTTCATCAAGGCGCTC
CTTCGTTTCATCAAGGCGCTCCTTCGTTTCATCAAGGTGCTCCTACGTCT
CATCAAGGTGCTCCAATATATCATCAAGGCGCTCCAACTTCTCATCAAGG
TGCTCCAACATATCATCAAGGCGCTCCTACGTATCATCAAGGTGCTCCAA
CATATCACCAAGGTGCTCCTACGTCTCATCATGGCGCTTCTACGTCTCAT
CATGGCGCTCCTACATCTCATCATGGCGCTCCTACGTCTTATCAAGGTGC
TCCAATGTTTCATCAAGGTGCTCCAATGTTTCATCAAGGTGCTCCAATGT
TTCATCAAGGTGCTCCAATGTTTCATCAAGGTGCTCCTACGTCTCATCAA
GGCGCTCCTTCATCTCATCATGGCGCTCCAATGTATCATCATGGTGCTCC
AATGTTTCATCATGGCGCTCCTATGTCTCATCATGGCGCTCCTGCGTATC
ATCAAGGTGTTCCCATGTTGTATCAAAGCAATCCATGGTCCCATCATGGT
TGGTCACACACCTACCCTTTGACCTCACAACTCAACGCTCCAACGTCACC
CATCAATGGTCAGACTTCACCCATCAATGGTCAGACTTCACGTATCAATG
GTCAGACTTCACCCATCAATGGTCAGACTTCACCCATCAATGGTCAGACT
TCACCCATCAATGGTCAGACTTCACGTATCAATGGTCAGACTTCACGTAT
CAATGGTCAGACTTCACGTATCAATGGTCAGACTTCACGTATCAATGGTC
AGACTTCACCCATCAATGGTCAGACTTTACCCATCAATGGTCAGACTTTA
CCCATCAATGGTCAGACTTCACACATCAATGGTCATACTTCACACATCAA
TGGTCAGACTTCACACATCAATGGTCAGACTTCACCCATCAATGGTCAGA
CTTCACACATCAATGGTCAGACTTTACACATCAATGGTCAGAATTCACCC
ATCAATGGCCCGACTTCACCCATCAATGGCCCGACTTCACCCATCAATGG
TCAGACTTCACCCATCAATGGTCAGACTTCACACATACTCCGCCGCCTGA
ACATGACGCTCCGCCGCCTGAACATGACGCTCCACCGCCTGAACATGACG
CTCCGCCGCCTGAACATGACGCTCCGCCGCCTGAACATGACGCTCCGCTG
CCTGAACAAGACATTTCTACGTCTCATCATGGCGCTTCAACGTCTCATCA
TGGCGCTTCAACGTCTCATCATGGCGCTTCAACGTCTCATCATGGCACTT
CAACGTCTCATCATGGCGCTTCAACATCTCAACATGGCGCTTCAACATCT
CAACATGGCGCTTCAACGTCTCATCATGGCGCTTCAACATCTCATCATGG
CGCTTCAACATCTCATCATGGCGCTTCAACATCTCAACATGGCGCTTCAA
CGTCTCATCATGGCGCTTCAACGTCTCATCATGGCACTTCAATGTCTCAT
CAAGGTGCTCCTACGTTTTATCATGGCGCTCCAACGTTTCATCATGACGC
TCCTACATCGCAACAAGGCGCTCCTACGTCTCACCAAGGCGCTCCTTCGT
ATCATCAAGGTGCTCCTTCGTTTCATCAAGGCGCTCCTTCGTTTCATCAA
GGCGCTCCTTCGTTTCATCAAGGTGCTCCTACGTCTCATCAAGGTGCTCC
AATATATCATCAAGGCGCTCCAACTTCTCATCAAGGTGCTCCAACATATC
ATCAAGGCGCTCCTACGTATCATCAAGGTGCTCCAACATATCACCAAGGT
GCTCCTACGTCTCATCATGGCGCTTCTACGTCTCATCATGGCGCTCCTAC
ATCTCATCATGGCGCTCCTACGTCTTATCAAGGTGCTCCAATGTTTCATC
AAGGTGCTCCAATGTTTCATCAAGGTGCTCCAATGTTTCATCAAGGTGCT
CCAATGTTTCATCAAGGTGCTCCTACGTCTCATCAAGGCGCTCCTTCATC
TCATCATGGCGCTCCAATGTATCATCATGGTGCTCCAATGTTTCATCATG
GCGCTCCTATGTCTCATCATGGCGCTCCTGCGTATCATCAAGGTGTTCCC
ATGTTGTATCAAAGCAATCCATGGTCCCATCATGGTTGGTCACACACCTA
CCCTTTGACCTCACAACTCAACGCTCCAACGTCACCCATCAATGGTCAGA
CTTCACCCATCAATGGTCAGACTTCACGTATCAATGGTCAGACTTCACCC
ATCAATGGTCAGACTTCACCCATCAATGGTCAGACTTCACCCATCAATGG
TCAGACTTCACGTATCAATGGTCAGACTTCACGTATCAATGGTCAGACTT
CACGTATCAATGGTCAGACTTCACGTATCAATGGTCAGACTTCACCCATC
AATGGTCAGACTTTACCCATCAATGGTCAGACTTTACCCATCAATGGTCA
GACTTCACACATCAATGGTCATACTTCACACATCAATGGTCAGACTTCAC
ACATCAATGGTCAGACTTCACCCATCAATGGTCAGACTTCACACATCAAT
GGTCAGACTTTACACATCAATGGTCAGAATTCACCCATCAATGGCCCGAC
TTCACCCATCAATGGCCCGACTTCACCCATCAATGGTCAGACTTCACCCA
TCAATGGTCAGACTTCACACAT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000130_pilon | genome | sc0000130_pilon:109948..111533 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1378-1590:214 |
| Aaloc | 1369-1377:225 |
| Aaloc | 1057-1365:534 |
| Aaloc | 1-1053:1587 |
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