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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000159_pilon:146479..151321- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_021808 ID=XLOC_021808|Name=XLOC_021808|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4843bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000159_pilon:146479..151321- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AACTTGCTTTCCTATCCCGTAAGGAAAGAAAGTAGCTTTATTATAATTAC
CTCTTCACATTTTTTTACTCTTCACCTCCATATTGCAGATCTAAATAAAA
AAAGCAAAACTGAAAATATGGAAGCACCAACAATTTCACACGTCTATTCA
GCCATTGATACACTCTATCACTCTAGCCAAGTAGAAGGTAAAGAAGAAGC
TTCAAAATGGCTAGAGAAATTCCAAAAATCGGTATGTTGCACTTATATTG
TTATTCTTGCTTGGCTTACAGATTTTAAAGTTAATATTTTGATAGTCTCA
CTTGATTATGGTGGCCTACAGAGACATTATAGCGATATAATTAATTAGCT
GATCGAAAAACAGTAAAAAAGCTCAATTAAATTTGAATTTACTTTCATTG
AATAATCCACATCTTTGCCCTAATTATTGTCCTTCTCGGCCATGAAGTGA
TTTTTTTTCAATTCATTTTGAATTTAATTTAATTCAGTTGTATTCAGCTT
TTGTGTTGTATTCTAATCAGAAATTTACTTTATAGGATTTCTTAAATACT
TAATGTTGTTCTTGCTTTGCTTAAATTAAAGATTTAAAGTGAATATTTTG
ATAGTCTTATTTGACTCCTTATGAAATACACAAAACTTTTTAGTTGTATT
CAACTCTTGTGTTGTATTCTAATCCGAAATTAACTTTGTAGCATTTTTAA
GATTTAAAAATATTTTTTTCCATTTTATTACAGTTGTATGCTTGGGAAAT
TTGTGACCAACTTCTTCGAGAAAACCGTGATAAAGAGTCACAATATTTTG
CTGCACAAACAATGAAAACTAAAGTATTCTTTCTTTATAATATTTACAAA
AATTGTTTTTTATGATCTAATTCTTTGTGAACTTTATTATAATCTCTAGT
CTCTTTTGCAGCCAATCTTGGCTTAAAGTTGATTGGTCTAAAATTGACTT
TCAGAGATAAACCTTTATTGTAAAATCTCAGTTTTCTAAAAGGCATTTTG
GCTTAATTTAAAGTATTTCAGCCCTATCGCATGTTGGCCTAAGCTCATGA
AACGGCCTCTTTCAGAAATGAAGAAGAATGCTTTAAGTTTGTTACAAGCG
AGTTTTTATTTCGAGCTAATTGCTTATTATTAGTTGCTTTTATTTGTTTT
CACCACAGTTCATGTTTTTCTCTCTTTTTTATAGATTCAGCATCATTTCT
CTGAGCTACCTCAACAACAACATTTGGTTAGTTATTTTTATTTGTAACCA
ATATGCACAGACAAGGCTATTCAAACCTCGTAAAAGATGGCTAAGTTGCA
CCGCCACCATGCTTTTTTTACAGAAAGATGAAGAATGGTACTGTATGAAT
CTTTTTACCCACTTGTGATTTTGATTTCACCTTATTTTTCATTTTTCAGA
GTCTCAGAAACTCACTGATGCAGCATTTACTGCAGTATTCCCTTGCCTCA
CATGCAACATTAACTCAGGTTTGTGTTTAAATCAAATGCCATTATTTTTC
GAGTACAGCTGCAGGCTGCTGACCCATAGCCGCGTAGTGGTGTCAAAATT
TGAATCTCAAAAATATTAATCCCTATACTTAATTTTTTTGGTGGGTAAAA
TGGGTGAGGACTTGCCAATTTAGCAAACCGGAATTTTTCTGGTTTACAAA
AAGATTCCCTAATTTCCTGATTTTCTAATTGTGAAAAATCGAATTGTTGC
GATAAGCTTTATAGACTTGCAGCTCTGCCACATTTTCATCAGGTGATTGA
CAGCTAGGTGTCAAAAAAGCATTATTCCAGGGTGATGTGTGTCCGTATTT
TCTTGATAATTGGCTTCAAAATAGTGGCAGGGTTCCTCTTTTTCCTCAAA
GAAAAAGTTAGTACCAGGGGTGGTGGTACCTAGACAAATTTCAAACCAGG
TTTAAAAGGCTAATAAAGCTATTACCCTATGGGATGGTACCCTGTGAGAT
TACCCCCTGCCAAAATTATTAATATCCTACTGTTGTCCAGGAATCAAAGA
TATCAATTTATAAATGACACCTTGAAAACGGCCTTGGCCGAAACATTTTG
GAAATTTCTAGCATCTAATGGTATTTTTGTCTCGATCCTCCGTCCGATAT
AATTTATAATGACTTTACTTTCACTTTACTTTAGCAAAGTAGGGTATGAT
TTATGACCCTGAAACTTTTTTTGTTTCCTCGCAATTCTAATAAACCTGTC
TTGATAACCCTGTTCGCACGAAACAATTATATAGATCTTTAACATCCATC
TAACACTAGATTGCCGTTTACGCAACTTTTTGTGTCACCTGCGTATTAAC
ATGTTTGAAACAGACAGCCAATTATTACTATGTAACAGAGTGTATCTCAC
GTTTATCGCTTCATAGTACACTCTATGCGCATTGCCTATTTGATAAAAAA
ATTCCCGTACGGAAACCTCTGCTGTCGGTTTGAAAAATCTCAAATCAGTA
AAGACAATGACCCTCTACGGCAATGAATTTTGAAATTAGCCTTAGATACT
GGGTCTGTGTACAGACAGCCAATGTATGTGTACCAAGCAGAAGAGTGTTT
TGTGTTAACAGTTTTATTTTCCTTTAAATCTTCCAGCTGTGTATAGCCCT
TGCTGATCTATCCATTCAGTCACCGCAATGGGAAAATCCTGTCTCTGACC
TTATCAAAATGTAAGTGAGCTTTTTTTTGGTTCTCTATATGTTTTCGATT
TGTTTAATACTTGGGCTTTCTAGGAATATCAGTCAGAAAGAGTGCTATAA
AGGGTTATTCCATTAAATTTCCATACAGGGGGGGGGGATTTGAACGAACA
TTTTCAAGGCAAAAAGAGATTCTTAGAAATGGTGGATACCCCCTGGAAAG
TGATAAGATTTTCGAAAGAATCCTTGGAAAAATTAATTTCCTACCTTAAA
AGTGAGGGTGGACGAACTATAATCTGTCTTTTACCCTGGAAATTTTAGAA
TAACCTGGAAAAATGAAAAAATACTCATTTATACCCCCTGGAAACTCTTC
TCCGATTAATACTTCCTGGAAATGTTCGTCCACCTGATTGTATGGATACA
ATGGAATGGCCCAATTTTATAGGTATCTAGTATTATTTTACCTTATATCA
AACCTTTGCTTATCTTACATTTTTTATTCCAGATTTTCTACAAAGCTTGA
ACATTTCTCTGTGTTATTGGAAGTGTTAATGCTGATGCCAGAAGAGGTAA
TGTAAATGTAGCTTTAAAAAGGTTATCCGAAAAAAATTACAATGAATCTT
TTGAATAACAATGTAATCTCAGCCTCATTATATCTCTATCCTCCAGTCAG
AAATTAAAACTGCTTATTTTTGGATGAGGAAGGCCTGGAACTGCTATAGT
GTAGAATATGCAATTTTGATTTGACTATTTATGATTGGATGGATTTTACA
ACGACATTTAACAATAATACGCTAGCAAAGTAGAATTGGTAAGTAGAGTA
TTGGTAATTATATCTACAATCGGTGACGAAATACTTGGCACAAAAAGGAA
ATCCACCTGGCACTGATTGTCTGAGAAACTGAAAAATGCCAAATTCTGAT
CAGCGGGGGGTCTTATTGCTAAGTTTTAATCAATCTTTCGGGCTCAAAAT
CCCCTTTTCATCAATTTTAGGGGCTAAAACTTGAAAAAAAGTCAAAATTT
TCTGAAATTTGCACGTTTTTGACTTTTCGTAAATTGGACCTTTTCAAAAA
GTTAAATATTTCACAAAAAGTGATTTTGGTCAGCAGCAAACGCTTCAAAA
TGGTAAATTAGCCAAAAGTGCCAATATGTTATGGCACTGATTGTAGAAGA
TTTACACCACATTTTATGTTTCTATTTTTCTAAGGTCGAGAACGAATATC
TTCACATTGGGAAAAACAGAAGAGAAGAAGTCGTTGTGAAATATCAACGA
TGTTCGCATGAAGTTCTTGATCTGATGGTACGCTCTCTCCCCAGCTCTTT
GATGCTTTCTTCAAGTATTTTTAGTTGCTGTTCTAAAGATACACAGATTT
TAAAGACTGTTATTCTTTCTCATGTTTTCCCAAATCAATAAATGGCCATC
AAAGACTCCCGAGAACACCCTCTAGTTGAACTATTTTTAAGAAGATTTCC
CTTGATATGGCTAGTTTTCTCAGTTTCTAAATAAGTACAAAGATAGAACT
AGTGTATATACCTTTTTCACCTTTGCGAAGATGGTTCTTGCGGTTAGTTG
TTGAGATATGTTGTTCATCTTTGGAAACTGTAAATTAAAGAATCACCATG
ATAAATTCTTCAGACGCCCTGAACAAAATATTCCATTTTGAAACTACCAC
CATGATAAAATATTGGCTCAATTTCGGTCAATCTGCTAATTTTTAAAATG
ACTATGGAAATGCTTTTGCTAATCTAATTTTGAATCTAAACATAATTTTC
AAAATTTCGGGATACTAAGAACATCATTCAGAAACTTTTCTTGAAGAAAA
ATCGTCTAGGGTACTACATTTTACAACTTTATAGCTTTTTTTTTTAAGTT
TCAATCACTTTGTTCATTTCCAGCTAAAATGCCACGAGGTTTGCCCTTCA
GACGATAGAACACAGTGCAAGGTTCGTTTTTTTTATCACCTCTTTCAAAC
TCATATCAATATATTTCTTCAGAGAATGTTTTTAATTCTAATCTAGACAG
AATAACGCATGTGTAACAATTATTTATTGTTTTTTAGCTTTACCAATGTT
TTGGAACTTGGTTGACACTTGGATCATTCCCTGCCCAAGTTGTTGTTGAA
AGTAAATTGTTGAAACTGGCATTTGATACTCTGGTATGCGTAAACTTGAT
TTATCTTATTTTTTTACATAAACAATCAGAATTCATTCACTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000159_pilon:146479..151321- >XLOC_021808 ID=XLOC_021808|Name=XLOC_021808|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1734bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000159_pilon:146479..151321- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AACTTGCTTTCCTATCCCGTAAGGAAAGAAAGTAGCTTTATTATAATTAC
CTCTTCACATTTTTTTACTCTTCACCTCCATATTGCAGATCTAAATAAAA
AAAGCAAAACTGAAAATATGGAAGCACCAACAATTTCACACGTCTATTCA
GCCATTGATACACTCTATCACTCTAGCCAAGTAGAAGGTAAAGAAGAAGC
TTCAAAATGGCTAGAGAAATTCCAAAAATCGAACTTGCTTTCCTATCCCG
TAAGGAAAGAAAGTAGCTTTATTATAATTACCTCTTCACATTTTTTTACT
CTTCACCTCCATATTGCAGATCTAAATAAAAAAAGCAAAACTGAAAATAT
GGAAGCACCAACAATTTCACACGTCTATTCAGCCATTGATACACTCTATC
ACTCTAGCCAAGTAGAAGGTAAAGAAGAAGCTTCAAAATGGCTAGAGAAA
TTCCAAAAATCGTTGTATGCTTGGGAAATTTGTGACCAACTTCTTCGAGA
AAACCGTGATAAAGAGTCACAATATTTTGCTGCACAAACAATGAAAACTA
AATTGTATGCTTGGGAAATTTGTGACCAACTTCTTCGAGAAAACCGTGAT
AAAGAGTCACAATATTTTGCTGCACAAACAATGAAAACTAAAATTCAGCA
TCATTTCTCTGAGCTACCTCAACAACAACATTTGATTCAGCATCATTTCT
CTGAGCTACCTCAACAACAACATTTGAGTCTCAGAAACTCACTGATGCAG
CATTTACTGCAGTATTCCCTTGCCTCACATGCAACATTAACTCAGAGTCT
CAGAAACTCACTGATGCAGCATTTACTGCAGTATTCCCTTGCCTCACATG
CAACATTAACTCAGCTGTGTATAGCCCTTGCTGATCTATCCATTCAGTCA
CCGCAATGGGAAAATCCTGTCTCTGACCTTATCAAAATCTGTGTATAGCC
CTTGCTGATCTATCCATTCAGTCACCGCAATGGGAAAATCCTGTCTCTGA
CCTTATCAAAATATTTTCTACAAAGCTTGAACATTTCTCTGTGTTATTGG
AAGTGTTAATGCTGATGCCAGAAGAGATTTTCTACAAAGCTTGAACATTT
CTCTGTGTTATTGGAAGTGTTAATGCTGATGCCAGAAGAGGTCGAGAACG
AATATCTTCACATTGGGAAAAACAGAAGAGAAGAAGTCGTTGTGAAATAT
CAACGATGTTCGCATGAAGTTCTTGATCTGATGGTCGAGAACGAATATCT
TCACATTGGGAAAAACAGAAGAGAAGAAGTCGTTGTGAAATATCAACGAT
GTTCGCATGAAGTTCTTGATCTGATGCTAAAATGCCACGAGGTTTGCCCT
TCAGACGATAGAACACAGTGCAAGCTAAAATGCCACGAGGTTTGCCCTTC
AGACGATAGAACACAGTGCAAGCTTTACCAATGTTTTGGAACTTGGTTGA
CACTTGGATCATTCCCTGCCCAAGTTGTTGTTGAAAGTAAATTGTTGAAA
CTGGCATTTGATACTCTGGTATGCGTAAACTTGATTTATCTTATTTTTTT
ACATAAACAATCAGAATTCATTCACTAACTTTACCAATGTTTTGGAACTT
GGTTGACACTTGGATCATTCCCTGCCCAAGTTGTTGTTGAAAGTAAATTG
TTGAAACTGGCATTTGATACTCTGGTATGCGTAAACTTGATTTATCTTAT
TTTTTTACATAAACAATCAGAATTCATTCACTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000159_pilon | genome | sc0000159_pilon:146479..151321 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 712-867:157 |
| Aaloc | 664-711:321 |
| Aaloc | 571-663:1010 |
| Aaloc | 508-570:1711 |
| Aaloc | 433-504:2258 |
| Aaloc | 364-432:3445 |
| Aaloc | 322-363:3660 |
| Aaloc | 232-321:4111 |
| Aaloc | 1-231:4844 |
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