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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000319_pilon:305676..308665+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_020218 ID=XLOC_020218|Name=XLOC_020218|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2990bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000319_pilon:305676..308665+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATAGTGGCGTATCTGAAGTTAATACGAACAGTAAACGAATCAAAAC
AGACTTGCCCAGTGATAAATGGAAGCCACTGAAAGATGTGCAAAATATAA
TTAACCAAGATGGAGGGCCAACTAACAGCTTAAAAAGCAAACAAGCAAAA
GACAATCGTAATGCTGCTATCCATCGTCTAGATGAACAGTCTTCATTTGA
TGATGTCAAAAGTAtgttttttgttcataaatctttttgctgatttcatt
ttctctatttctttgtttgtcttttATTAACAAcgacaacaaaataaaaa
taaaggcatgaaaacattattttgaatAATAGAGAAGTGCAAAACGGGTA
TAATATTGGTGGCAAAGTTCTTTTCGTAGACTCACTTTTGATGTTAATTG
ACGTTTCCTCCAATGAAGATGTATTTAGTTCAGCGTGTTGCTTAAAGGTG
GATATTACTTATTGATAataatagactttttttaaagaggacgCCCTGTT
GAATAACTAAGTTTATTCTTTTCTTAATTTTAGCTTACATTGAATACTTG
TGTGAAACCCTGCCAGAATTAATGGAAGAAGCCATAATTGACAGCACTCC
AGAGTTTGTAGATCATCTAGCTAAAAAACTTAGGAAAGATTCTTCTCGAC
ATGCGTTTATCTTCAACAAAGATACTGCAGAACTGTTGTACGGTAAAAGT
GATCTCTCTCAGCGAGGATATAAACATTTACGTTCCATTCTTCTACGTAA
TAATGTACACATCCCCTCTTATGAAGTAATACGGAAGTATTGTAAAGATC
TCGAAGTTGGTGATATTAAATCTTTTAATCATGCAAACTCTGATTGTCCT
TGTATGGGTGTACATACAGATTTGATTGATACTTTACAGAGAATCTTTTC
TTCTGACCTGtataataaaatgaattttttaccagAAGAGAAGAACGAAG
CTCTTtgtgaatttttgaaatcaaaagatCCAATAATGTATCAGAAATTC
AACCCAAGAAATAAAACGATCCTTTTACGTGAAACTGGCGACAACTTTAG
AGGTGCTGCAAGATTTCCAACAGAGAAAACGTCTTTTTCGCtctttaatt
tactttccttTGCTAATAACCCGTATGGTCAATTCATATCAACATTATGG
CGTGGCTCAGAAAGTAGATCTATGCTGGATTCTCATGTTTCAAGTCATTG
CAAAGAATTAAAAGAAGCTGTGTTAAACGGAGTTGATATAATTATTAATG
AAGACATTGAACATTTTAATGTTGTAGTTTTCCTCATCGCAGACTTGTCT
TTCCTCAAGGATATAATTGGACACACTTCTCCAACATCAACTTATGGTTG
CTTTTTATGTAAATTACCACAAAAGGATTGGTTGAGTGATACATCAAAGG
AAGCtccagaaaaatctgtaaaagaAATGACAGTGAATGGGGTTAAAGAT
GTCGAAAATTTAGGAAAAAACCCTAACAAAGATTCTTAGATGTACAAAAA
TTTCCACTTGAAACACTTTGGACAATGGGTAATTTTTATAATTCtcttta
actttaaaaactttaaCTTTGTAAGAGTCAGAATACTTTAAGGATTTGCC
ttaaatccgcaaaattaagttctctccaaatttaattttatccgCCATCC
CccaaattaaatccctctAAAAAGCTTTtccggccatccgccaaattaaa
ttactGCCAAAATTTCCCCCAATAAGGTAACGTCAACTAGTTTTGATTAA
AAGATAAGTTTCGGTGATACATGAtttttttACGAAAACCATTTAAATCA
AGCAATATTGGCATGAATTTCTGCTTAAAATGTGCATTTTTCATTACAGG
CACCTGCATTGTTTGATGGTTTTATATTGGAGTTAATGCCGCCCTGTGGT
TTACATTTAATACTGGCCAATCACAGATATCTCTGGGGTTTCATGTACGA
CGTAGTCAATAAGCGAAAAATGGATCAGAATATCCCAGCTGCTCTCaaaa
aaaTTGGTTGCGGATATCTAGCCTATCAAATGGAACAATATTTTAACAGG
TATATAATATAGTATAACTCATATAACTTATATGAATAAGATCTAAGTCT
AAATCCTGTTCTTCATCTAAAGTCATTTctcctaccttaagggaataaat
taatgcaagAATAAACCAATGTGGAATTAATTAATGCGAATAACACAGTT
TTAGGAACAATTCACATTAATTAAtctcgcattaatttattcttacatta
gtttatttttttaaggtaatattttcctttttagcAAAAAGAAGTTCTAC
GATGGCTCAAAATCACTGAAAATGATTGGAAACGATTGTCGCTTGTTAGA
AGAAAATATAGATGCATTTTTGAACAGACAATCTGGTGAAACGTTGGAAA
GTCCATCAGCAAGGAAATTGAGACAAGTGTTGACTCTTTACAAGGATTTT
GGTGAACTTGCAAGGTATTTAATCTCTCTTAAAATAAGGTACATGACTTG
TAATATTGAATTGATGGGAAATGTTTGACAAGTGAATCATAGACTCTTTC
AAAACAATAtactttttttaatctttctaTTCAGGGACGTACGCAGCACC
ACCGGAGATGTTGAAAGAATAAAATCTTTTACAGCCCGTGCCGagagata
tttcaaaaagtttacatCAAATGCTTCTAACTCTATGCTACAAAGGCTTC
CTTATCTTCATTTGTTACGAATGCATATTGGAAAAATTATGGTAAAGCAC
TATGAACTGTTTGGTTGGTGTTATGGAGTTTAATGATGTAATGCTGGTGA
ACACCTAAACAAGGTCATTAAGACAGTTGAAATCACAGGAACAAATTTTg
atgcaaaaagatttttcgcaATTGTTCACTTTTTGCGATCTAAACAGTTA
ATTTTCACAAGCTCCatcatttcaaatgaaaaaagtgtgaaatGCTCGAA
ATGCAGTCAATATGGTCAcaataaaaagaacaaaatttgt Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000319_pilon:305676..308665+ >XLOC_020218 ID=XLOC_020218|Name=XLOC_020218|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4122bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000319_pilon:305676..308665+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATAGTGGCGTATCTGAAGTTAATACGAACAGTAAACGAATCAAAAC
AGACTTGCCCAGTGATAAATGGAAGCCACTGAAAGATGTGCAAAATATAA
TTAACCAAGATGGAGGGCCAACTAACAGCTTAAAAAGCAAACAAGCAAAA
GACAATCGTAATGCTGCTATCCATCGTCTAGATGAACAGTCTTCATTTGA
TGATGTCAAAAATGAATAGTGGCGTATCTGAAGTTAATACGAACAGTAAA
CGAATCAAAACAGACTTGCCCAGTGATAAATGGAAGCCACTGAAAGATGT
GCAAAATATAATTAACCAAGATGGAGGGCCAACTAACAGCTTAAAAAGCA
AACAAGCAAAAGACAATCGTAATGCTGCTATCCATCGTCTAGATGAACAG
TCTTCATTTGATGATGTCAAAAATAataatagactttttttaaagaggac
gCCCTGTTGAATAACTAAGTTTATTCTTTTCTTAATTTTAGCTTACATTG
AATACTTGTGTGAAACCCTGCCAGAATTAATGGAAGAAGCCATAATTGAC
AGCACTCCAGAGTTTGTAGATCATCTAGCTAAAAAACTTAGGAAAGATTC
TTCTCGACATGCGTTTATCTTCAACAAAGATACTGCAGAACTGTTGTACG
GTAAAAGTGATCTCTCTCAGCGAGGATATAAACATTTACGTTCCATTCTT
CTACGTAATAATGTACACATCCCCTCTTATGAAGTAATACGGAAGTATTG
TAAAGATCTCGAAGTTGGTGATATTAAATCTTTTAATCATGCAAACTCTG
ATTGTCCTTGTATGGGTGTACATACAGATTTGATTGATACTTTACAGAGA
ATCTTTTCTTCTGACCTGtataataaaatgaattttttaccagAAGAGAA
GAACGAAGCTCTTtgtgaatttttgaaatcaaaagatCCAATAATGTATC
AGAAATTCAACCCAAGAAATAAAACGATCCTTTTACGTGAAACTGGCGAC
AACTTTAGAGGTGCTGCAAGATTTCCAACAGAGAAAACGTCTTTTTCGCt
ctttaatttactttccttTGCTAATAACCCGTATGGTCAATTCATATCAA
CATTATGGCGTGGCTCAGAAAGTAGATCTATGCTGGATTCTCATGTTTCA
AGTCATTGCAAAGAATTAAAAGAAGCTGTGTTAAACGGAGTTGATATAAT
TATTAATGAAGACATTGAACATTTTAATGTTGTAGTTTTCCTCATCGCAG
ACTTGTCTTTCCTCAAGGATATAATTGGACACACTTCTCCAACATCAACT
TATGGTTGCTTTTTATGTAAATTACCACAAAAGGATTGGTTGAGTGATAC
ATCAAAGGAAGCtccagaaaaatctgtaaaagaAATGACAGTGAATGGGG
TTAAAGATGTCGAAAATTTAGGAAAAAACCCTAACAAAGATTCTTAGATG
TACAAAAATTTCCACTTGAAACACTTTGGACAATGGATAataatagactt
tttttaaagaggacgCCCTGTTGAATAACTAAGTTTATTCTTTTCTTAAT
TTTAGCTTACATTGAATACTTGTGTGAAACCCTGCCAGAATTAATGGAAG
AAGCCATAATTGACAGCACTCCAGAGTTTGTAGATCATCTAGCTAAAAAA
CTTAGGAAAGATTCTTCTCGACATGCGTTTATCTTCAACAAAGATACTGC
AGAACTGTTGTACGGTAAAAGTGATCTCTCTCAGCGAGGATATAAACATT
TACGTTCCATTCTTCTACGTAATAATGTACACATCCCCTCTTATGAAGTA
ATACGGAAGTATTGTAAAGATCTCGAAGTTGGTGATATTAAATCTTTTAA
TCATGCAAACTCTGATTGTCCTTGTATGGGTGTACATACAGATTTGATTG
ATACTTTACAGAGAATCTTTTCTTCTGACCTGtataataaaatgaatttt
ttaccagAAGAGAAGAACGAAGCTCTTtgtgaatttttgaaatcaaaaga
tCCAATAATGTATCAGAAATTCAACCCAAGAAATAAAACGATCCTTTTAC
GTGAAACTGGCGACAACTTTAGAGGTGCTGCAAGATTTCCAACAGAGAAA
ACGTCTTTTTCGCtctttaatttactttccttTGCTAATAACCCGTATGG
TCAATTCATATCAACATTATGGCGTGGCTCAGAAAGTAGATCTATGCTGG
ATTCTCATGTTTCAAGTCATTGCAAAGAATTAAAAGAAGCTGTGTTAAAC
GGAGTTGATATAATTATTAATGAAGACATTGAACATTTTAATGTTGTAGT
TTTCCTCATCGCAGACTTGTCTTTCCTCAAGGATATAATTGGACACACTT
CTCCAACATCAACTTATGGTTGCTTTTTATGTAAATTACCACAAAAGGAT
TGGTTGAGTGATACATCAAAGGAAGCtccagaaaaatctgtaaaagaAAT
GACAGTGAATGGGGTTAAAGATGTCGAAAATTTAGGAAAAAACCCTAACA
AAGATTCTTAGATGTACAAAAATTTCCACTTGAAACACTTTGGACAATGG
GCACCTGCATTGTTTGATGGTTTTATATTGGAGTTAATGCCGCCCTGTGG
TTTACATTTAATACTGGCCAATCACAGATATCTCTGGGGTTTCATGTACG
ACGTAGTCAATAAGCGAAAAATGGATCAGAATATCCCAGCTGCTCTCaaa
aaaaTTGGTTGCGGATATCTAGCCTATCAAATGGAACAATATTTTAACAG
GCACCTGCATTGTTTGATGGTTTTATATTGGAGTTAATGCCGCCCTGTGG
TTTACATTTAATACTGGCCAATCACAGATATCTCTGGGGTTTCATGTACG
ACGTAGTCAATAAGCGAAAAATGGATCAGAATATCCCAGCTGCTCTCaaa
aaaaTTGGTTGCGGATATCTAGCCTATCAAATGGAACAATATTTTAACAG
cAAAAAGAAGTTCTACGATGGCTCAAAATCACTGAAAATGATTGGAAACG
ATTGTCGCTTGTTAGAAGAAAATATAGATGCATTTTTGAACAGACAATCT
GGTGAAACGTTGGAAAGTCCATCAGCAAGGAAATTGAGACAAGTGTTGAC
TCTTTACAAGGATTTTGGTGAACTTGCAAGcAAAAAGAAGTTCTACGATG
GCTCAAAATCACTGAAAATGATTGGAAACGATTGTCGCTTGTTAGAAGAA
AATATAGATGCATTTTTGAACAGACAATCTGGTGAAACGTTGGAAAGTCC
ATCAGCAAGGAAATTGAGACAAGTGTTGACTCTTTACAAGGATTTTGGTG
AACTTGCAAGGGACGTACGCAGCACCACCGGAGATGTTGAAAGAATAAAA
TCTTTTACAGCCCGTGCCGagagatatttcaaaaagtttacatCAAATGC
TTCTAACTCTATGCTACAAAGGCTTCCTTATCTTCATTTGTTACGAATGC
ATATTGGAAAAATTATGGTAAAGCACTATGAACTGTTTGGTTGGTGTTAT
GGAGTTTAATGATGTAATGCTGGTGAACACCTAAACAAGGTCATTAAGAC
AGTTGAAATCACAGGAACAAATTTTgatgcaaaaagatttttcgcaATTG
TTCACTTTTTGCGATCTAAACAGTTAATTTTCACAAGCTCCatcatttca
aatgaaaaaagtgtgaaatGCTCGAAATGCAGTCAATATGGTCAcaataa
aaagaacaaaatttgtGGACGTACGCAGCACCACCGGAGATGTTGAAAGA
ATAAAATCTTTTACAGCCCGTGCCGagagatatttcaaaaagtttacatC
AAATGCTTCTAACTCTATGCTACAAAGGCTTCCTTATCTTCATTTGTTAC
GAATGCATATTGGAAAAATTATGGTAAAGCACTATGAACTGTTTGGTTGG
TGTTATGGAGTTTAATGATGTAATGCTGGTGAACACCTAAACAAGGTCAT
TAAGACAGTTGAAATCACAGGAACAAATTTTgatgcaaaaagatttttcg
caATTGTTCACTTTTTGCGATCTAAACAGTTAATTTTCACAAGCTCCatc
atttcaaatgaaaaaagtgtgaaatGCTCGAAATGCAGTCAATATGGTCA
caataaaaagaacaaaatttgt
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000319_pilon | genome | sc0000319_pilon:305676..308665 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1669-2073:2586 |
| Aaloc | 1576-1665:2373 |
| Aaloc | 1477-1563:2286 |
| Aaloc | 1276-1473:1850 |
| Aaloc | 214-1275:467 |
| Aaloc | 1-210:1 |
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