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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000083_pilon:1142540..1147207- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_019358 ID=XLOC_019358|Name=XLOC_019358|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4668bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:1142540..1147207- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAAATAAGAAGAGTGGGTCAAGCTATGGGTGCAGACAAAGGTATGATGAT
ACATTTTTTTGAATTTCGACTACACAGTCTTTATTTTTGCCTACATTATT
TTCAATTAAAATAAAATTTCAGCCGATCTCAGGTCAATAAAGAAAGATTC
TTCAAGATAATATTTTTTTAAATGATAATTTGTATTACCTTGATGTATGG
TGGAGCACTCTATCATCACGGTTATTATTGGGCTCTTCCAGGAAATGTCC
GGAGGATAAAGTGTCCGGGGGGTAGTGAAAAATCTACAAAATTTGCCTTG
TCAGGGGGTAAACTTGCATTGTTTGTGGGTAATTTTGCTCTGTTTGAGGG
TAATCTCAATTGTCCATGGGGTCAACTGATGCTTGTCCGGCCCGGGGTCA
AAAGTCACAATGTCCGGGGAGTAAATTTCCAAAAAATGTTATATCCTCCA
CCCCCCCCCCCCATATTCGAAATTTTTGCTGGAAAAGCCCATTGCAATTA
TTATTTCAAAAAAGACTTACAGTCGACTCTCTCTCATTCGATTTCCAAAA
GAAAAATAATATTTTCAAATTAGAGAAAAGTTCGAATTACATTGAGTACT
TTATAGCATTTTCTAGCTAAAGGAGCCGATTTTTTAGTTCGAATTGCAGA
AAAATTCGAACTACGAAATTTCGGATTAGAGAGAGAGTTGACTGTGTGTT
TGAAATCCCATTTCAGTCACCTATGGTTACGCAAAGATGGTAGCACACGA
AGGTTTCATCCTGAACATGAATTCTACAAACACAACAAAAACGAACTCTT
ACCAAGACTGTATCACGAATTGCATCAATGTGGATAATTGTTTCAGTATA
AATGTCAATCAAACAGACAATGGTGACATTGAGTGCCAGCTCCTGGAGAC
TGATCGATTTCGGAGCTCATCAAAATTTGTTCGTATGGAGACATCGACTC
ATTATGCTATTGAGGTAGTAAATTTAGCTACTTTAGGCGTACGAACTTTC
GCGAGCAGAAACTTTCGGTGGATATAAATGAAAATTTTAGAATAGAAATT
GCCTTAAAAGTGGAAAATACTTAAATCCGTTAAAGACGGCTGCTATTCGA
CTTCAAAAAGGCAGTAACAGGATAATAATATGCCGAAAATTTTATATTTA
TTACGATTTTGAGGTTTTATAGACTTTTTTGTGAGAATTTTTCGCGAGCA
TAAACTTTTGCGAGTTGCCCTGTTAAAAATTTTCAAAGACATTTACTTTC
GCGAAAATAAGGGCCAAAATTCGCAAAAATCGCAAAAGTTTCTGCTCGCG
AAAGTTTGTAGGCCTAAAGTATATCATAAATCATATTTAATTACCACTTT
CATAAACTCGAATGGATACAAAAGCGTGTAAAAACAATCGACAAAATACC
ACATATTTTTCGGCTAGTACTCTCGGGTACCTAATTTTTTGAAAATTTTC
CACCCAGGACATTCTTATTCCAACTTGCTCATTGAGTTTTGGGAAATCTT
TTTTGAAAGTTCCCTCTTTTGCCCTAATTCTGCTGTATTAGGCTCCTAGT
TAAAAATATCCAGCCAGGACATTTTTATTTTAACCCCCTCCCCCGCTTAC
TAAGTTTTGAGATTTTTTCCAACCCCCCTGCTTATTCCAAACCCCCCGGC
TATTAGCAGGTACCCGAGAGTAAATCTCTAATTTTCAGGAAAATTTCCCC
AACCCCGAATCAAGGTAAATCTTAGGCTGCTGGCATCTACTAACTGATTA
GTCTCCTTATAATATATGGTTTATACTACCTGGGGGTTTTGTAGAGGTCT
GCGATTCAATCAGACAAAGTAAACCTTTTAGAAATTTAGTCTCTGTTACG
CTAATTCTTTTATCAAAATTGGCTTAAAATCGTGTGGCTAAATTTAGACA
TCATTTCGTTATTTTTGGTCACGCCTTATAGAAATATCGAAAAAACGACT
CCCTTCTTTACATTCTTTTTGCCCAATTAAGAGGATCTTTTACAAAAATC
TTACATTATATTGAACCATGTCTTTCTTTCCTTGGGAAGGTACTTAGACG
GAAATAGTTGCTTGGTAATGTGCAAACTTTAAGGGTCGGTTTTTTACTTT
TTTTAACCTTCTCATGTTACTCTAAGGATTACAAAACATCATAAAGTCGA
AATAAATCAGCCAAAAACCCGGTCGAAACATACCCGCCATTCTCAACCCC
TAATTTGTATCTATGGGATTTCAACATATACAACTTTTTTATAAAAACAA
ACTACCGGGTGCACCATAAAAAAGTTTCTCTCTTCATAACTAATTTTCTA
GAAATCTAAAAATTTTAAGATAATTATTCCTATTTTATTGGAAAGAAGAG
AGATAAACTTAAATTCATTAGACCAAAAGTTATGCTCGATTAAATAAAAA
AGTTACTTTTAGATTTTTAGAAAATTAGTTTTAAAGAGAGAACCTTTTTG
TGGCATTCTCGGTATATAAGAACATAATGCTTTGAAGGCCAAAATCTTAA
GAGCAAGCTAAGAACATTTTAAAGCTTTGCGGACTCTAAAACACTCGATT
TCTAAGAAAATGGACAAAAATGCTCACAAAATGGTGAAAATAAGAACATG
TTAGGCGAGACCAATTTAATTTGTTGTTCTACGGACAGATCGTTAGAAAA
ATATGGGTCGGTCGGTCGGTCGGTAAAATAAGAATAAATTTTTCATTTGT
CAGGGTTGGTAAAGTACCGAAAATGTTTTCCAAAAAGGATCAAAAATTCA
CTTTGTTTTTTATCTTCGATGAAGATCATAATAAAATTTTAGTGTATAGA
ATGCTTTTTATGATTTTTAAATTTCTTGAATTAGTTTTCAGCTTTATTCA
AGTTTAATTCTTACAAATAACTAGTGTGTAAAATATATTGTAGTGGAAAT
TCGATATTATTATTTTTTGATTTTAGCAAAAATAGGGTCGGTCGGGCCTG
TAGAACAACAAATTAAATTGGTCTCGCCTTAAGGGCTCTGACCATAGTCA
GAAAATAGATTTTAGTATCTGAACAAAAAAGTTATGTTTTAGATTCTTTA
ACACTTTTAATAAAGAATTGCCTTTATAAATTGCTTTTTAATCAAACCCC
TTAAGAGTAATTAAATAACTTAATTGCAAAAATGACGTTATGAACTTTAA
AAAGACGTTAATAATATGTTGCATCACCTTCTTTTATAAAAAGTGCTAAG
TTGTAATGGGTAATTAACCTTTTTTTCAAACTGTCCGCCAAGAATTGAAC
TATTTTAAATTTTGCGGAAAATTTTTCTAAAAAGATGTGTCAAAAGTTAT
GACTGTTTTTTAAGCAAAATCCAGATGAAAAATTGATGAAAAAGCACTAT
TTTGAAGATTTCGAGACAAAGAAGCATTTACAAAAATTTTCCGCAAAATT
TTTTATTGTTCGGTAAAAGATACACCATCTACTGCGAAAATTTTTTCAAA
ATGTTTTTTCTTCGCCGAAACTAAGCTCTTCAAAGTTGAAATACTCTTCC
TCGCAAAAGTCTTAATTTTCTTCTTCATCAAATTTTTTCAATGCAATTTT
TGAATTTTCAGATTCAGGAATAGTTTGTCTAACATAAAATGTATAACATG
TCATAGTTTTGTTGGTTACATCAGTCAGAAAACACATTTTAAACACGGCA
ATTATGAAAAATTCACTATGGTCAGAGCCCTTAAGAAGATTTTTAGGCTT
GAAACTCAAAAAGTTAAGAACATCCGAAAGCTTAAAAAACTTTGGATGTT
CTTATAAATAAAACGTGTATGCATTGCAATCTTTCACATATTTTCACTTC
AGCACGATTGTGAATGGAAAGAGACGTGTATAAATCCAAACAAAAAATGT
ATCCCGAATTATGAAGATGGAACTTTCGATTGTGTTTGTCCGGAGGGTTT
TGATGAAAATTGCATCAATAAAAGTAAGATTTTTGCTCGTTAAAAAAAGA
TCATCTTTACACGGATAATATACCATATAACAATTCTTTTGAAACCAATT
TCAAAAATGAAGATACAAAGCAGTGAAGTAGAAAAAATGAACAAGCACTA
AATTTTATTTTATGATGGCTGGCTGTATAAATTTAGTTTGGAAAATGTTT
CTAGATTGTTTCTGTTTAGTTTTAGTTTAATCTGTTCCAAAAGAAATGAA
AATCCGTACACTTTACTTTTGTCATTAAAACTCGTTGGAAAGATAATTTT
CGAAAATATACTTTAATATTGCTAATTAACTGGTAAAAAACATTTCATTC
TACAGATATTGCATTGCATAAAAACACAGTGATGTCCTCGGAATTGAATT
ATGAGAATGTAGCGTGGCGGGCGACTGACGGTAATTTTGGCGAGGGCTGT
ATATCCACTCACTCTGCACTCAACATGCCCACCGCTTGGCTAAGAATTGA
TCTAGGAGACTGGTACATAATCAGAATGATCATCATTCACAATAGAGATC
ACAGTAACGCTGGCGTCCGCGCTCGCCTCTCCAACACAGATATTTTCGTT
TACGACCAAAACCCAACTGATAATCGAAGATTCTGTGGTCACATTACTAA
TGGGGAAAAATTTGTTATTGAAATACCTTGTTCGGAGGTTGCTAAAGGTG
TCGAGCTATATCTAGAGGAGACAAGCGAACCACGAATTTTAAATGTATGT
GAGGTTATAGTTTATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000083_pilon:1142540..1147207- >XLOC_019358 ID=XLOC_019358|Name=XLOC_019358|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1644bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000083_pilon:1142540..1147207- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAAATAAGAAGAGTGGGTCAAGCTATGGGTGCAGACAAAGCAAATAAGAA
GAGTGGGTCAAGCTATGGGTGCAGACAAAGTCACCTATGGTTACGCAAAG
ATGGTAGCACACGAAGGTTTCATCCTGAACATGAATTCTACAAACACAAC
AAAAACGAACTCTTACCAAGACTGTATCACGAATTGCATCAATGTGGATA
ATTGTTTCAGTATAAATGTCAATCAAACAGACAATGGTGACATTGAGTGC
CAGCTCCTGGAGACTGATCGATTTCGGAGCTCATCAAAATTTGTTCGTAT
GGAGACATCGACTCATTATGCTATTGAGTCACCTATGGTTACGCAAAGAT
GGTAGCACACGAAGGTTTCATCCTGAACATGAATTCTACAAACACAACAA
AAACGAACTCTTACCAAGACTGTATCACGAATTGCATCAATGTGGATAAT
TGTTTCAGTATAAATGTCAATCAAACAGACAATGGTGACATTGAGTGCCA
GCTCCTGGAGACTGATCGATTTCGGAGCTCATCAAAATTTGTTCGTATGG
AGACATCGACTCATTATGCTATTGAGCACGATTGTGAATGGAAAGAGACG
TGTATAAATCCAAACAAAAAATGTATCCCGAATTATGAAGATGGAACTTT
CGATTGTGTTTGTCCGGAGGGTTTTGATGAAAATTGCATCAATAAAACAC
GATTGTGAATGGAAAGAGACGTGTATAAATCCAAACAAAAAATGTATCCC
GAATTATGAAGATGGAACTTTCGATTGTGTTTGTCCGGAGGGTTTTGATG
AAAATTGCATCAATAAAAATATTGCATTGCATAAAAACACAGTGATGTCC
TCGGAATTGAATTATGAGAATGTAGCGTGGCGGGCGACTGACGGTAATTT
TGGCGAGGGCTGTATATCCACTCACTCTGCACTCAACATGCCCACCGCTT
GGCTAAGAATTGATCTAGGAGACTGGTACATAATCAGAATGATCATCATT
CACAATAGAGATCACAGTAACGCTGGCGTCCGCGCTCGCCTCTCCAACAC
AGATATTTTCGTTTACGACCAAAACCCAACTGATAATCGAAGATTCTGTG
GTCACATTACTAATGGGGAAAAATTTGTTATTGAAATACCTTGTTCGGAG
GTTGCTAAAGGTGTCGAGCTATATCTAGAGGAGACAAGCGAACCACGAAT
TTTAAATGTATGTGAGGTTATAGTTTATTGAATATTGCATTGCATAAAAA
CACAGTGATGTCCTCGGAATTGAATTATGAGAATGTAGCGTGGCGGGCGA
CTGACGGTAATTTTGGCGAGGGCTGTATATCCACTCACTCTGCACTCAAC
ATGCCCACCGCTTGGCTAAGAATTGATCTAGGAGACTGGTACATAATCAG
AATGATCATCATTCACAATAGAGATCACAGTAACGCTGGCGTCCGCGCTC
GCCTCTCCAACACAGATATTTTCGTTTACGACCAAAACCCAACTGATAAT
CGAAGATTCTGTGGTCACATTACTAATGGGGAAAAATTTGTTATTGAAAT
ACCTTGTTCGGAGGTTGCTAAAGGTGTCGAGCTATATCTAGAGGAGACAA
GCGAACCACGAATTTTAAATGTATGTGAGGTTATAGTTTATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000083_pilon | genome | sc0000083_pilon:1142540..1147207 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 412-822:412 |
| Aaloc | 289-408:867 |
| Aaloc | 43-288:3951 |
| Aaloc | 1-39:4669 |
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