XLOC_019020 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_019020
Unique NameXLOC_019020
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000376_pilon:60472..70353-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_019020 ID=XLOC_019020|Name=XLOC_019020|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9882bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000376_pilon:60472..70353- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGGAGAAAAAAGAAGAAGCAATTGAAGCCATGGTGCTGGTATCCTTT TCATTTATATATAAGCGATTTAGATTATTTTTAAATGTCCAACAAGGCAG GAGAGGAGAAGAATTTTCATTACAATAAACACCATTTTTTAAGTTCAAAA TCTAGTCTAATTTCAGTGCTGGCTGAAGGGCAAGGGAGGAAATTTTAATC AGTCTGGTCATATATTGTGATGGTGGCAGTATATAGACTTAAACTACTCG TAGGACCCTGCCGACGCACCGGACTTAACGAACACCGGACACGCGAAAGT CCGGTGTAAAATGAGAATTTTTTTACCACCGGACAATCTCTACACCGGAC TTAAGAAAGTCGGATGTCCGGTGTCGGAGAAGGCTACTTTTTTTCCACCG GACAATCAAAACACCGGACATGACCAGTCCGGTGCGTCCGGTGTTTCTTA AGTTTTTGTTTCATAAATGTCCGGTGTCCAAAATTCCCTGTATGCAACAC CGGACTGACACCGGACTTATTGCGTCCGGTGAAGTGAAAGGATACTTTTT GCCACCAGACAAATACACCGGACTGTCCGGTGCGTCGGCAGGGTCCTCTA CTCGTATATCAAGATTACGGGATTTCAAATACTGGCCGATTTTACTTTTG TTTTGAGTGGTTTCATTTTCGATGATTTCAAGCCAACATCTTAGCAATGG GGTGCTTGCCCATAGTTACAGGGGTTTGTGCAAAAAACTAAACATAGAAA ATTTTCCAAATCCCCCATTTCAATTAATGCAAGGCGCGCGGCAATCACAA ATATCTTCATTTCGCGCATCCAAATTGGATCTAAAAAGTGAGTCGGTCGG TCGGTCGGTAGTAAAAATTTTCGGGTTTTCTTAAAATTGGTCTGTCAGTT AGTCACACTAGTTGGCCATAAATACTAAAATTATGAAAAATAGCTAGGAA 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AAATTTTTGAGCAAAGGAAACGTCATCAAAACAAAAAGTCCGACAAATTT ACCGACTCTCCGACTCAATTTTACTCAATTTTCAGGAGCCGGTCGGGCGA CGCGAAACAAAGATATTTGTGATTGATTGGCCAATGAAAAATGAAACTTT TCTATGTTTCACTTTTTTGCACGTCTATTCTTCAAAATGAAAATATTTAA GATTTTAAAAGTTCTTCTTTTATTAAATATTTTTTTACGGCACTTTGTTG ACAATCTAATAATCTTGCATCAAATTCCCGCTTTCTTCAGTAAATTGAAC ATGAGAAAAAACCTAAGCCACGGATCACGGATTGAAAGAAATATATGAAG GGTGGGATTTTACAGCCGCCCGTCGTGCAAGGCACTGAAAGGCCACGGGT GCCAAAAAGAAGGGCCGTTTGAAATGTGACAACCTCATTGGTGGAAATTT GATAAACAGCTGCAAAGGAGCGCTGAGAAGCAATCAGTAGAAGAGACCAC TTTCGTTTTTGTTGAGGATTTCTATAAAAACTTCTCTCAGGGATTACTTG TCAATGTGCATGTACACATGTGTTGTGTCAATTTGTCAGCATTGTATTGT TGTAAAGGAAAAGATAAAAGAGGTAAGACTAGCCTAGTTTCTAATCCTGA TATAGGAGTTTTTAAAGTTTAGACTGGGTGGCATATCTTTTATTGCTTTC TGACCACCACGACGCTGCAAAGCTAAAGGGCGACGTCCATATATTCAAAG TCGCCACGCGACGCGTATGGGAAAAGGACCATTCCAGAATTTGTCTGTAA CAGGGGGTGGACGACACGGGATTTCTGAGGGCAAAAGTTTTCACCAAAAT TCGAAATTTCCAAGGCAAGAGAAGAAAATTTCCATTTCAAGGCAATTGAA TTAAAAAAGTCAAAAAAATGTGGAATTTCCGATGCATTTTGCAAAAGTAC ATGGATTTTCATCGGAATTTCCAACCACCACTGGAATAGAAAAATTATTT CCGAGGCTAGAAAAAATTAAAAAATGCACGTCATCCGACGTGGGGGTAAC AAAAATTTTCTGGAATGGTCCAAAGTTTTGTTTCCAGAGTCCTTGCAATA GTTTATTGTTCAACAAGAGGGAATGTTTGTAAACATAGAATTTTTTTTCA TAGCAGTTATTTGGGGGTCTGATTTAGGCAAGGCTGTCGGATTTAGGACC ATTCACGGTAGCTGTGGCATTGATGACCAAAATGAAATTCCGCTAAAAAA ATTCCAAGGAAAAAATCAAAGACCGCTTATCGTAGTAGCGCTCACTTCTT TGCTTTTTCCTTTAGCACGCTATCCAAAATCCTTTCCCTGAGCAATTTAG GGGTGGTTTCAGAGTATAACATTCTTGCCTTGGGAGTTTTAAAAACAAAG GCCGTTTAAAAGTTGTGATGGAATTCGGCCGTTGTAAACCAGACTTTACT TATCGATAAAATCGATTATCAATTAAAATCGATAGCTAATCGATAATTAA TGGATTGATTAAATATTGATTGAAAACGATAATCGATAGCTAATCGATAC TCACAATTTTGCAGCACTCAATTAAATTATCACCATAGATTTATAATCGA TAATATCGATTACAGTGTTAATAATTGATGATATCGATTAATATCAATAT AATCGATACCTCGACCCTATCGATTATTAATCGATAATGTGGATGAAACT TGGATCAATATTTATATAATTGATATAATCGATATCTTATGTCTGATAGA TATAATCGATACTCACAATTTTTTAGGCTCTGATTCTCTTTTACCACCAA AAACAATTTGGTATATATCAGTATATATAACTAAACAATATCCTCTACTT TAGGCTATATAACAATTTTGATTTTAGCGGGAATGAAAGCTTTGGAAAAA TTTTGGTCAAATCATGAAGACCGTTAAGGAGGTGGGTAGGTATGTTTTGA AAGTAACGGTCTTTTCCCGTTACGTGTGGGACTTTGAATATGGACGTCGC CCCTACTAAAGGCATGAGTGGTGAAGACATAACAATCTGATGACAAACAT GCGATCTCAAATTTTTAGTAAGGACCGCATTGATAATAGCGCAGAGGTGC CAACTCTCACGCATTGGGTGTGAGACTCGCGCATTTCCACATGGTTTCAC GCAATTTTTGAAAAGTTTGATTTCTCACGCATTTTGGATTTTTGAGAAAA ATTTTCCTGTTTTTCTGATTTTTGGAAAAAAGTTTTCCCGATTTCCTGAT TTTTGGAAAAATGTTTACCTGATTTTCCGATTTACGGAAAAAAAGTTTTT CTATTTTCTAGATTTTTGGAGAGATTTCCCAATTTCCGATTTAAAAAAAT CAGAAAAACTGGGCTAAGTTTACGGATTTTACTTCGAAATTTTTATCTCA CGCAAAATGAACATTTTAAGTTGGCAGGTCTGTAATAGGACTTGGGGAAT GACAAAAAAGTTGTGTGATTGTGTTTAAAAATAGGGCGCTGTATCAGGAA AATTTAGAGGTTTACCGTGCAAGAAAATTATGGCCAGCTGTGATCAGGTT AGCTTTAACAGTTAGGTGTTTAAAGATAAAAACGGCAATTATTGCTCTTT TCTCAGCAACTATTGCCGAAAACGTAATGATATGTAAAAACAAAATGTAA AAAGATCATCCTGTATCGATGTTGAAACACAACTAGGAGGAGAAAACAGA ACCCTTGTTGTAAGTTTGTTTACATATAACTCGATTTTGCTAGTCTGCAT TCTGACAGAAACCAGTTGAAAACAAAAATAAACGAGGCAAAGTGGGCCTA CTAATTGCAAGGGTGTCGAATACCACAATACAATAATAAAATAATAAAAT CAACTTTTCTTTCCAAAAACGGCAAAAATTGCCAAAACAGCAATTTTCAT TTAATTTTTTTACTTTCCTGCTGATTCAGCATGTTATCGATGAAAAAAGT AGTTTTCGGCAATAGTTGCCAAAAAGAGAAATAATTGCCGTTTTTATCTT AAACACCCAACTGATCAAGTCGCAAGCCTCCATAGTTTGGAAAGGGGTCT GATCCCCCCTTTTTGGCATTCCCCCCTTCTTGGCATCCCCCAACCTTTAA CCCAAGGGTTTTGGGCTAAATTTTTTATGGTAAAAAGGGAAGGGAAACAG TAAAGAAAAATTAAGTCTGGCAAATATAATACCACTTTTTTTGTGAAAAT AAAGAACTTCCTTTCATGCAGATCAAATTTCATAACATTGCTGGAAAATA ATCTACAATATTTGTAAGCCCCTCCCTTCTTAAACGATCGCCCCCTCCTT GCTATCCCCACTTTTTAATGAAAATTTCCAATCCCCCTTCTTCACTTTTT TGGAAGGTGTCATCCCCCCTTTAAGAAAGGGCCAGAACTATGGCCTCTAG AGGAAAGTGGTTGTAAAGATATTCAAATTTAATGTCAAAAATTTTTCTAA AAATTTCAAAAAGAAGGTTTAAACCATTGCTTCTAAAATAAGTTTCAAAA ATAAAGAAAAAATTCAAATTATGAAAAAGCTTTGAGGGTGCTGATTCCAG AATTTGAATGTTACCAAGCTTGAAAACACGCAGTTTTTACATAGTTTTTG CATTTTAAGGCAAAACTGTAAGCCCTGAAGATTCAAGAGTTTTTGGAGGT CTTCAAAATCCCCATCCAGTGTTATATTCTGCTGAAAAGCTAAGATCATG GGCATTCTTTCAGTAAAAACCGGAGCGCTTTAGCATAATTAAACACAGAA AAAAAGTAAGAAGGGTTCAAAGTTGAAGATCCCAAGACAATCAAATAAAA ATTTAAAATTTGTAAAGGAGTTTAGCAGGCACTCCACAGAACTCTCATGT TCCTCCACTCTGTTTGCATAGCAAAGTACATGAGTGTGATTAAATTTTTA GACTCTAAAATTTGAATATCTTCATATCCGCATATCAACAGAAAACTTAA AATAATAACTGTAAACTTATAATATCTTTACAAAGCTGTATGTTTATTTT TATACTTATGAATTCACAAGTTTTCCTTAACTGGGTCATTTATGGTTGAA AGGTATTGCAACAGGGATTTTGAGGAAGAAAAAGTTTTGATTCAACATCA AAAAGCAAAACATTTCAAATGTTTGGTTTGTCACAAGAAATTATATACAG GACCTGGTCTGGCCATTCACTTAATGCAGGTATTTTTCTGTAATCACTTT TTTAGTATTTTGTGAAAAAGCTTAGTTTTTACAAAATTTGTAAATTGACC TAACAGTCCTGAACAGTCCTATGAAAGCCTTATATTATCAAAATAAAACA ATCTGCCATAATTTGGAACTAGTATCTTAACTTGAACAATCACTAATTGT TTTGATGATATTTTGTTTAGGTGCATAAGGAGCCCATCACTGCTATTCCC AATTCACTACCACACAGAGGAGATATTGAAGTTGAAATTTACGGCATGGA GGGAATACCTGAAAAAGATATTGAGGAAAAACGAAAGCAAAACAGTAACA GTAAAAAAGCTGGTAAGTTAATATCCAGATACAAAACCCATAACATGGTG GTGTCCTTTTTTTCCTTTGCAAATCTAGAAAGTCAAGTTGGTATAGATAG CTGGGTATATTTCAGCAAATTGATGTTGTCAAGTTTATTTTGACTAATTT GTTTTTCAGTAGAGCGAGCACTAATCCGTTTTATTTTACACCTCTGTAAG TCTGTTTAAAAAGTGCAAACGATTTTAATTCTATCTGAGAAAGTAAGTTA TGTTCATTTTAATAAGTTATCCTGAGAAATTCTTTAGTTTACTTTTATTT TCATATTTCTTTAAACCTCAAACTTATTATGTCTAATAAAATCAAAACAT ATACAAATATACCAATGGATTCGAAAAAAATGCAACTGACACCGGCACTT CGATACTTTTGCCTATCTTCTGCACTTGTGCATTTCAAGTCAAGCAAAAT ATTAGCATGCGCCCCAGCAAAAAACATTTACCAACACAACAAAGTTTTAA CTCATGCACAGCCCGGGGAGAGGGGTACTAGGTTTGCGATGTGACAGGTA TGTCGACCCTTTGAGAGACCGAATCGTTTTGGCGACCCTCTGAGAGACTA TTTCTCCAATTTTAGCTCAAAATTACCAGATTTTATGACTCTTTGAGGAA ATCGATTTTGATGTTTTGTTATTTTGGGACCCTTTCAGAGACTCGATTGC TGATTTATAGTTTTTTTACCCCTTTGAGAGACTTTCAAGGGTTTAAAAAA GGACCCTAATTGCTTGCACATACCTTGCACCCCTTTTGCCCAAGTACAGA ACACCCCCATGGTGTCCTCCAGGTTTTCAGGTCCCCCCATCTGGGGCTTA AAACTCGCATTTGGTCTTCTTCTCCCACCTGCCTTTTTTCCAGGGTTCCC TGTATTAGAAGAATATTTTTGTGACCAACGGATTCGCTATATTTTGCATA ATAACTTAACAAAAATAACAATTTCCTGCAATGAGCGCACAAATGCTGAA AATATAGACACATTTAATCATCTATTTGAAATAATATCTACCGTCTGCAA TTTCTACCCCCACTTCCCATAAAATTTCCTGAAATCCCCCATTTGCATTA GTCCCCCCATCAAAGTGAAAAACTCACTTCCCTCTCCAGGGCAAAAGTTG ATTCCCCCCATTTTCTTGATCCCATGCAACCCCCCCCCCCCCCGGATGCA CAGCCCTCGAATTTCAGAGAAATGTGCGTCTACACACAAGTGCTGCCTAA ATCTGCCTGAAATTTGACGTACTTTTGCAGACCTAGGACTGTTTTTTATC AACAATGAACTGCCGACCCTGACAATACTTGGCTTTGCTTTTAGGAGGTT GGCAAAGAATTGTTTGAATTTTTGGTTTTTGAGGGCATCTTAAAATTTAA ACTAATTAACTTCTTGTGATGGTAAAATTTGATTTCAATTTCTTTCATCA TAGATAGTGGCAGTGATGATGACTCAGCAGCAAAGAAAGCCAAGACAAGT GCTGCAACTCCACAGATGCCGGGAATGCCACCACACATGATGGGGATGAT GGGTATGATGGGTATGCCTCCTCCAGGGATGCCACCCTTCCCAATGCATG GTATGCCTGGGATGCCACCCATGCCTCCTGGTATGCCTCCACCACCAGGT AAAGACATTTCTTTGTGTCTTTGGTTGATGAGAATTTATTTCCTAGTGCT CAAACTTTTTCCGTCTCAGTGAAGTAAATAAGGCAGGTACGTTTTTGTTT TCTGATTTACCATCATTCTGATAGGATTTTTATGGACTGGCAGATGGAGA AAAAAATATTTCTGTTAACCAGAAGATAAAGTAATTGCCTAAAGAGGTAT TTCTGACTCAAAATTCTGTGTAATTCACCAAAATTTCAAGATTATGTGCT AAATTGCTATGTGAAATCCGTTTTCTGTCTCAAACGAAAAATCTTTATTT GACCACTGAATTTCAACCTGTTTTTATTTTGCACTTTATTTTATTTTACC TTTTATGTATTACTGTCTCCAACAACAATGGACACCAACTAGGTTCATTC GTTAATTTAATACCTCTTACGAGTACACTAAAGTAACATCTTCTTTTTCA GGCATGCCACCTCCGATGATGCCTGGGTAAAAATAAATTAATTTTGTATC TCCATTATATTCACCTAATGCATTCGTATCATCTTTGAAGTTTTTTTTTA ACATTAAGTTATTGAGTAGGGTTTTCAAGGCATTGTTGACTGAAGAGACC ATAAAACTTGTTCGAGTTAAGAAAACTTATTCGAGTTAAGAAAACATTCG AGTTATAGGTTTAAGTCAAGTTAAAGGTGTATTTAAATCTTTATACGGTA TCACATCCAAACTTATGTTCATTCTCCTGTGCTTTTTATACTATAGTATG TCTCCGATGATGCCTCCAATGTCACAAGGTGCACCTACCCCACCCTCTTC AACCGGATTCTCTGGTCAACCAAGACCTCTTTTCCCTGCTGCAGCTACTT CACAGGTGAGCCTTACTTTTTGGTCAGCCTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000376_pilon:60472..70353-

>XLOC_019020 ID=XLOC_019020|Name=XLOC_019020|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1332bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000376_pilon:60472..70353- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGGAGAAAAAAGAAGAAGCAATTGAAGCCATGGTGCTGATGGGGAGA
AAAAAGAAGAAGCAATTGAAGCCATGGTGCTGGTATTGCAACAGGGATTT
TGAGGAAGAAAAAGTTTTGATTCAACATCAAAAAGCAAAACATTTCAAAT
GTTTGGTTTGTCACAAGAAATTATATACAGGACCTGGTCTGGCCATTCAC
TTAATGCAGGTATTGCAACAGGGATTTTGAGGAAGAAAAAGTTTTGATTC
AACATCAAAAAGCAAAACATTTCAAATGTTTGGTTTGTCACAAGAAATTA
TATACAGGACCTGGTCTGGCCATTCACTTAATGCAGGTGCATAAGGAGCC
CATCACTGCTATTCCCAATTCACTACCACACAGAGGAGATATTGAAGTTG
AAATTTACGGCATGGAGGGAATACCTGAAAAAGATATTGAGGAAAAACGA
AAGCAAAACAGTAACAGTAAAAAAGCTGGTGCATAAGGAGCCCATCACTG
CTATTCCCAATTCACTACCACACAGAGGAGATATTGAAGTTGAAATTTAC
GGCATGGAGGGAATACCTGAAAAAGATATTGAGGAAAAACGAAAGCAAAA
CAGTAACAGTAAAAAAGCTGATAGTGGCAGTGATGATGACTCAGCAGCAA
AGAAAGCCAAGACAAGTGCTGCAACTCCACAGATGCCGGGAATGCCACCA
CACATGATGGGGATGATGGGTATGATGGGTATGCCTCCTCCAGGGATGCC
ACCCTTCCCAATGCATGGTATGCCTGGGATGCCACCCATGCCTCCTGGTA
TGCCTCCACCACCAGATAGTGGCAGTGATGATGACTCAGCAGCAAAGAAA
GCCAAGACAAGTGCTGCAACTCCACAGATGCCGGGAATGCCACCACACAT
GATGGGGATGATGGGTATGATGGGTATGCCTCCTCCAGGGATGCCACCCT
TCCCAATGCATGGTATGCCTGGGATGCCACCCATGCCTCCTGGTATGCCT
CCACCACCAGGCATGCCACCTCCGATGATGCCTGGGCATGCCACCTCCGA
TGATGCCTGGTATGTCTCCGATGATGCCTCCAATGTCACAAGGTGCACCT
ACCCCACCCTCTTCAACCGGATTCTCTGGTCAACCAAGACCTCTTTTCCC
TGCTGCAGCTACTTCACAGGTGAGCCTTACTTTTTGGTCAGCCTAATATG
TCTCCGATGATGCCTCCAATGTCACAAGGTGCACCTACCCCACCCTCTTC
AACCGGATTCTCTGGTCAACCAAGACCTCTTTTCCCTGCTGCAGCTACTT
CACAGGTGAGCCTTACTTTTTGGTCAGCCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_019020XLOC_019020-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000376_pilongenomesc0000376_pilon:60472..70353 -
Properties
Property NameValue
Aaloc532-666:136
Aaloc508-528:430
Aaloc313-504:1078
Aaloc169-309:2663
Aaloc43-168:2980
Aaloc1-39:9883