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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000403_pilon:57921..64529+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_018804 ID=XLOC_018804|Name=XLOC_018804|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6609bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000403_pilon:57921..64529+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTCAGAAGCCTTCGAGTATGAGCAGAATGGAGAATTTTGATTGTTA
CCTCAAGAAGAGAGCTGCTGACACACAGCAGGCTAAATTGGTCAGCTTGG
AGGAATATCTCTTGATGGTTGAGTTTTTGAAAACTCGCCAGATAGTGGGT
TGCAGTCCAGCTGATGttcgaaacattcgaaagaaAATTAGGCGTAACaa
gatgattttaaaagaagaagatggaaaaGACATTATATTGATGTCGaaaa
aaaGGGATGATCGTCAGGTAAAGTCAATCTGTTCATAGCTTTTTTAACCA
AACCAAGTTAAATCCTAGTGTCaaaaaaaTGATTCTTGATACACTCTGCA
TAATAAATCTGCGTAATAAATAATAGAGTGTCAGAAAGTCTGCACTAATT
TTTCctcaatatttttttgctgGAGTATACAATAATTCAACCTGGTATCa
tctacaaaaaaaatattattcagTTTCTTTCTACTGCATTTCCTAATTTC
CTTTTGATGATAACTTCAtgtattgatttttgaattgaaCAAAACACAGA
CAGCTGTGTTGGTTAGAGATGAAATAATTTATTATGTTTCTACTATTATT
ATGATGttagtaatttgttattcaattaaCTATCGTGTTCTTCTAAATGT
TGATAAAGTGTGTTATTTGTGTTATAATAGTTTaggtttttcattttgaa
gttctgcatttccaaataattttttgcagggcccgcgccaccgggggggc
cggggggccatggcccccccacttttttgcaaagcaaaataaaaaaattc
tcctaacctaattatttttttcttttctgtgcgcgtgccaataaaaacat
tagaaccTTTCTAAATGGTCTAAAATAAGTCTAatttaaacaaacaaact
taacagttttctttcagaaaatcggaacaaaaaggaagctgttttagcca
aataagacaggtcaaaatcgaaaattttccggcccgtcgacgcaaaccat
ggttgcgcctccttagtcactatatttttgttggccccctcactttcaaa
atcgtggCGCGGGCCCTGTTTTGTCCTATTGGCTCAGGACCCAAACAATA
TTGTGAAGggaatttgattaaatttttgcttttgcttGATGGGGAGTTGA
AGAAAATGGATCACTTTAGAGTTTCAAGCTTTGATATTGAGTCATTTTGT
TTACGTATGcctttatttttattcttttgacaTGGGTCTGAGTTTTAAAG
TTATCTTTGTGGGTTGCAAAAACTAGGTTGATGGCAAATTTGacaagttt
tcatttttcttaagtTTTCAGCCAATAGCACTTTTCAAGATCCTCTTGTT
AATACTTCTTTTGAGTTCTGTGTGGAAGTTACAATGGGAAGCAGTGCATT
TCATAAAATATGTCAAGCTCactaaatttttaagaaatgcAGATCCAATC
AGTATAGACCTTTGCTAGGCCTGGTGTCTCATGCTGAGTATTTAATAACT
CCAGCATCAAAGCAATGATAATAACAAATGGTGAAAACTTATAACAATAA
TGCATTAATaagtcattgttttgatgctggagtttttattaTTCACCATG
CTTGTCCAGACGtaattcaatcaaaagttaaatcaccaaactaattgaac
tttgtcgaacttaatcgagcAAGTAAAGTTTAATTAAGTTTGACAAAACA
tgttaagttcgacaaagttcggcAACTAGAAATGCTTGACAATTTCAACA
AAACTTCGTTCaatttgacaacaagaaatatTCAACAGAAATTGAATTGT
Caaaaaagttagaaaacaaaaaacaaattgttaataaaattttcttttca
ttagtACTTTTCAAgacatttaaattttaagtttcatgacgtcattaaaT
ATGATATGACGTCGTAAACCTAATTacttgaaaaagacaaaaaattattc
tttttagCTGGCATTTCTGAAATCTACATCTTAATATACTTCTTTTGACG
TGTAAATGACCATGTCAAAGGCCTcagatttttttctccaaacttATGTC
CTTTTTGGATATGCCATAAGTTACACAAGGGACCATGGTGATCTTTCTGG
GGAACTTTTAAAGAGatgagatgaaatttttgcacaaaaagtTACCTCAT
AACAAGTCAACagtagaagaaagaagtttttgatACATCCAACAGATCAT
AAGTTCCGAGACACTCCGAATTGAAAAAAGCtaggaaattgaaattttga
gagTAAGTGCTCTTATATGCTCTTCAaaggataaaaaaaaaagaaaattt
attctcaactttttgaaatttggtcaaaattgaaaattttagattgCCGT
GCACATCCCACTTACCAAAAGGTCTATTCAGCTTGTAATATTACTATCTG
TTTCTAcactgttttttattttgattatagTTATCAGAGCGATACGGTGC
ATATCGCAGATTTCTGCCGATAACTGAAATTCAAGATGTTATCATCGATT
TTGTACATCCCGATAAAGGCAAAATTGAAACATACTTAGAGGTATCAGAG
GTTTTATTTACTtagttttgtttgtaatttttatcgatattgaattaaaa
gaaacaaaattattatGAATTTTTACAGTAGCATTGCTGAGAAACATTTA
gcattaatttcaattttattaaaaggGAAACCCTTCATAGTCTTTAATTT
ATAATGATTTTACAACCAATACTGTTTCTGAGATAATTTCTTCTATTAAA
TGAGAAAATTTCTTCAATGTTTTTTATCTATTCGTTTTCAAATATTCTTC
ATATCATATTAAATAGGACTTCGTCTTTTATGGATGCTTGGAAGTAAAAG
TAAAGTATAAAGTGGAAAAATTAGATTtctcttgttttttattttagttg
aataaagacttttttatccCTCGGTCTGTGGTATCGGCATTTATTGATAT
TGTCGGCAGAACATTCCAAAAACCAATAAACTTGAAATTTATGGAATGTT
TAAAagtaagttgaaaaaatgttgataaatatTGGTATAAAATGAGTTAC
AGAGATGAGTACTTGTATATAAGTTTTGCTGATGAGTATTTGAATAGATT
TGTTTCTTTAAATGATTCATTTTTACTATGTTTTCGATTAGATATATGCA
ATGACCAATAAAAAGCAGCTTgtaatttataaatataaacaGATCACAGA
CAAAAAATAATCACTTTCATACGACATTATTATGCTTTTTATCTTTCAAG
ATCGATGTGATTAATGTGTCGTCTGCTGGCAAATTGGTACATTGTTACGA
TGTCCAAACAAACTTCTCATTTGCATTATTTAATACAAACTCGATAGATG
TGAATGAGATTGCAGAAGAAATATCTGAATCAGTTGTCAGTTTGTTTGGT
CTACCACAGACCATCATTTCAAACCTTCAGTGGAATTTGGTGGAAGTGCT
AAATGATATTTGGGCCTCCAAAATTTTTAATGGCGGTGTTCAGCCATCGG
GAGATTCATTGCTACCCTTCTTAAAAGAGAAAACTGAGAGAAGGAGCctt
caaaagattttgtgtGAGTattaagaatctttttttttgaattaatgaAG
ATTAGTCAAATTACACACCATTTTATTCAACATTGCCAGGGGTGAACTGC
ATAGAAAGGAAAAGTTTTGTAATTTATTTAGTTTCTTGATCTAGATAATT
AAGTATTTAAGGTCAATTTGGTTTTCTGTATTTGTGGTTTTAATTCGTTT
GAATTCTTTCAAGCATTGTTTTTAATTCATCCACTCAACTTTCATCATAA
AATTACAATCTATTGATTTGTAttctattttagtgaaattgaACACGACT
GAAGAAAATGGCAGAATCTCCCCATACGAGCAGGCTTTGGCAAGGAAACC
TTGTGTCCCAGGTacgaaatatttaaaataagtTATTGCTCTTGCATGAC
GCCATTCTCCCAACCCAGAACTCTATTTTATTATTTACCTGCCAATCGAT
CTAGTTCTGAGAAGAAGATAATCAAATGAACTgtattttttatgaaagaa
aataGAGAAAATGTTGAATcatatcaattattattttgaacAGTGTGGCA
CACATAATTAGTTAAATGTCATAGATTGACCTTcaattttgttcaaatta
ttCTATTCAAAAAGATCTTCCTTGCTACTTTCAATCTTTATCCTAAATTT
TCATTCaacgttttctttttaattttcagccAGCTTGTATGGAACACCCC
AAGACGGAGGCCAAACAATGAACGATACCCTTAATGCTAGGTGAAGGAAA
TAATCTATATCAGTCTTAAAATAGTGTAATTCCGTTTATATTCGTCAAGA
ATTGGTTTGTTTATACAATACTAGCAGTTTGACACTTTAAAAAAGTACTA
ACAAACATTATTTTAATTGTTTGCATGATTTCATTTCAGTGATCTTGAAG
ATGAAGATGGTATCGACGACGATGTTTTTGCTGTTGCACTGAATTCAACA
GCATATCACGGTAAGATGACGAAAACGTATTTTAATAGGAAAATTTATGT
TTAGCTTAGAATTCCCTCCTTTTAGATGTAGAATCTGATATATattgata
attaaaaaaatttgttactatcttcaaaagatttcagggcAAACTTTGAT
CAAAAGTATTTCTTcacatttctttattttaggTGTTGAATGTAGAAGGT
TGGTGGATGTCCAATTTCGAGATGGTAACAGGTTATCCTCGATAGCGTCT
GCCACCACCAACCAAACAACGCGAAACATCGCCGGACAAGTTCTTCCACT
CCCAATTGTGAGCCTTCTCATATATTCATTTTATTAGTTACATTCCATTC
CTTAAGATCGGTTGCAATAAATGAGAAATGGATAAGCCGgtaaggctcgg
aaaatattgctAGCTTCAAGACTGACATTACAGACAAAACTGTGAGGGTT
TTTCAAAGGAAAGAATTCAACAAAACTGATTTATACTAGACTTAGGTGAG
GGTATTCTTTTCAAAGTAAAGGTTCTACAGAAGACAATCCTAGCTTCAAC
AAAACAAGAAATACAGCCTATTATGGCTTACTAATTCCTGTAAGATTAGG
TACAATTTATTTCACATTTCTAAGCACTGTGTGGATCTGATAGAATTTCG
AGCTTCAAATTACTGTATTTCCTTGTGTATTAGAGTAGGTGACTTGTTGT
AGCACACATTTGCCAGATGCTGTACCCGATATTATCAATTTTTCACCCAG
TTAACTTCAGTGCAATAccagtcaattttcaaatcttttcccTGACACTT
TTAGCCTGTAACGTCATCTTTTTGCGATAACCAATAACTTGCCCTACCTT
TTTCATTTACACCTAAACTTTTAAccttaactttttttaagtatGGAAAT
AGTCACTCAGAACTCTCAAAGATACTCAACTTTGCTATAAAATCCTATTT
CCCACTTACGTACAATTACCCTTTGAGTACAGTTTTGCGTTGAACTCCAC
TTTGATACTACATTTGAAAATACATGTACATGCCCATTCAGAAGCCAGTC
TGAGCTGTCTCCCAAAATCTTTAGATTCTCGATGAAGTGGTCGTAacctt
tttaggaaaattttacaaaatgacATTCAAAGCAGCCTTAACCCTTAACA
TTCTTAACTGACTATCATTTTCAGGTAAAATCCACTGAGGAAGTAGATGC
GAGGCTGCTCACTCTATGTGAGCAGGATATTTCAAGTAAAATCTCAAAAG
TATTAACTAAAAAGTAAGTATAGGATAggaatttttcaacattttctagt
tttcttgttttacatttaattttattcGAGAACTAGAATTAAAATGATTT
CGTTTAAGactctttaaaaaatactaaCAGGGCTGAGGTCTCCTTTCCTT
GATAATTTTGGAATCTCTATAATCATACCATTTTTAATAGTTTTGTCACG
AAGAAGATTGGAGAGGGGTCGTTTGGGGAAGTTTTCATGAAGGAAGAAAA
TGGGGAGAAAAGTGTAATAAAGgtaacttttgattttatttttccaaata
CATAATTTTGTACGTGAAAACTTTAAGGATTTTATGTctatttattcatt
tatataTTTAAGAAATTAGGCCCTGGGGCCCTTTTTCGCTACATGTAAAC
tataagtttgtttacattgtaGATTTTAGGTGTTATAAAACAGTTTATTC
ATTTCGACTTCACTTATACACTCATCAgcttgtatttttttgtatgcGTG
AGGCTTCTTTCTGATTAATAGTAAATAGAAATATCTCTTGACTGTATGTT
ATAGATTATACCAATTGGTTCGGAGGAAGGAAAGACGAAGAAAGAAGTGC
TCATAGCAGAGATTGCAATCAATAAgtaagaaattttcatctgttatAAT
GCTTTACTTCCACATATTTTACGACAAAGCTCAGAACCTTCTTTGggact
taaaaattaaaaaaaaacaaatttagtaACATTGCGTACGATGAATCGCT
ggaattgagaaaaaaacttatttatcaaataattaaaaactgtTCTGTTG
TGCCGTTTTatttcttgtagaaaaatgTCAAACTGGAATGGTTTTGTGAA
ACTGAAAGC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000403_pilon:57921..64529+ >XLOC_018804 ID=XLOC_018804|Name=XLOC_018804|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2832bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000403_pilon:57921..64529+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTCAGAAGCCTTCGAGTATGAGCAGAATGGAGAATTTTGATTGTTA
CCTCAAGAAGAGAGCTGCTGACACACAGCAGGCTAAATTGGTCAGCTTGG
AGGAATATCTCTTGATGGTTGAGTTTTTGAAAACTCGCCAGATAGTGGGT
TGCAGTCCAGCTGATGttcgaaacattcgaaagaaAATTAGGCGTAACaa
gatgattttaaaagaagaagatggaaaaGACATTATATTGATGTCGaaaa
aaaGGGATGATCGTCAGATGTCTCAGAAGCCTTCGAGTATGAGCAGAATG
GAGAATTTTGATTGTTACCTCAAGAAGAGAGCTGCTGACACACAGCAGGC
TAAATTGGTCAGCTTGGAGGAATATCTCTTGATGGTTGAGTTTTTGAAAA
CTCGCCAGATAGTGGGTTGCAGTCCAGCTGATGttcgaaacattcgaaag
aaAATTAGGCGTAACaagatgattttaaaagaagaagatggaaaaGACAT
TATATTGATGTCGaaaaaaaGGGATGATCGTCAGTTATCAGAGCGATACG
GTGCATATCGCAGATTTCTGCCGATAACTGAAATTCAAGATGTTATCATC
GATTTTGTACATCCCGATAAAGGCAAAATTGAAACATACTTAGAGTTATC
AGAGCGATACGGTGCATATCGCAGATTTCTGCCGATAACTGAAATTCAAG
ATGTTATCATCGATTTTGTACATCCCGATAAAGGCAAAATTGAAACATAC
TTAGAGttgaataaagacttttttatccCTCGGTCTGTGGTATCGGCATT
TATTGATATTGTCGGCAGAACATTCCAAAAACCAATAAACTTGAAATTTA
TGGAATGTTTAAAattgaataaagacttttttatccCTCGGTCTGTGGTA
TCGGCATTTATTGATATTGTCGGCAGAACATTCCAAAAACCAATAAACTT
GAAATTTATGGAATGTTTAAAaATCGATGTGATTAATGTGTCGTCTGCTG
GCAAATTGGTACATTGTTACGATGTCCAAACAAACTTCTCATTTGCATTA
TTTAATACAAACTCGATAGATGTGAATGAGATTGCAGAAGAAATATCTGA
ATCAGTTGTCAGTTTGTTTGGTCTACCACAGACCATCATTTCAAACCTTC
AGTGGAATTTGGTGGAAGTGCTAAATGATATTTGGGCCTCCAAAATTTTT
AATGGCGGTGTTCAGCCATCGGGAGATTCATTGCTACCCTTCTTAAAAGA
GAAAACTGAGAGAAGGAGCcttcaaaagattttgtATCGATGTGATTAAT
GTGTCGTCTGCTGGCAAATTGGTACATTGTTACGATGTCCAAACAAACTT
CTCATTTGCATTATTTAATACAAACTCGATAGATGTGAATGAGATTGCAG
AAGAAATATCTGAATCAGTTGTCAGTTTGTTTGGTCTACCACAGACCATC
ATTTCAAACCTTCAGTGGAATTTGGTGGAAGTGCTAAATGATATTTGGGC
CTCCAAAATTTTTAATGGCGGTGTTCAGCCATCGGGAGATTCATTGCTAC
CCTTCTTAAAAGAGAAAACTGAGAGAAGGAGCcttcaaaagattttgttg
aaattgaACACGACTGAAGAAAATGGCAGAATCTCCCCATACGAGCAGGC
TTTGGCAAGGAAACCTTGTGTCCCAGtgaaattgaACACGACTGAAGAAA
ATGGCAGAATCTCCCCATACGAGCAGGCTTTGGCAAGGAAACCTTGTGTC
CCAGccAGCTTGTATGGAACACCCCAAGACGGAGGCCAAACAATGAACGA
TACCCTTAATGCTAGccAGCTTGTATGGAACACCCCAAGACGGAGGCCAA
ACAATGAACGATACCCTTAATGCTAGTGATCTTGAAGATGAAGATGGTAT
CGACGACGATGTTTTTGCTGTTGCACTGAATTCAACAGCATATCACGTGA
TCTTGAAGATGAAGATGGTATCGACGACGATGTTTTTGCTGTTGCACTGA
ATTCAACAGCATATCACGgTGTTGAATGTAGAAGGTTGGTGGATGTCCAA
TTTCGAGATGGTAACAGGTTATCCTCGATAGCGTCTGCCACCACCAACCA
AACAACGCGAAACATCGCCGGACAAGTTCTTCCACTCCCAATTgTGTTGA
ATGTAGAAGGTTGGTGGATGTCCAATTTCGAGATGGTAACAGGTTATCCT
CGATAGCGTCTGCCACCACCAACCAAACAACGCGAAACATCGCCGGACAA
GTTCTTCCACTCCCAATTGTAAAATCCACTGAGGAAGTAGATGCGAGGCT
GCTCACTCTATGTGAGCAGGATATTTCAAGTAAAATCTCAAAAGTATTAA
CTAAAAAGTAAAATCCACTGAGGAAGTAGATGCGAGGCTGCTCACTCTAT
GTGAGCAGGATATTTCAAGTAAAATCTCAAAAGTATTAACTAAAAATTTT
GTCACGAAGAAGATTGGAGAGGGGTCGTTTGGGGAAGTTTTCATGAAGGA
AGAAAATGGGGAGAAAAGTGTAATAAAGTTTTGTCACGAAGAAGATTGGA
GAGGGGTCGTTTGGGGAAGTTTTCATGAAGGAAGAAAATGGGGAGAAAAG
TGTAATAAAGATTATACCAATTGGTTCGGAGGAAGGAAAGACGAAGAAAG
AAGTGCTCATAGCAGAGATTGCAATCAATAAATTATACCAATTGGTTCGG
AGGAAGGAAAGACGAAGAAAGAAGTGCTCATAGCAGAGATTGCAATCAAT
AAgaaaaatgTCAAACTGGAATGGTTTTGTGAAACTGAAAGCgaaaaatg
TCAAACTGGAATGGTTTTGTGAAACTGAAAGC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000403_pilon | genome | sc0000403_pilon:57921..64529 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1378-1416:6571 |
| Aaloc | 1306-1374:6305 |
| Aaloc | 1225-1305:5942 |
| Aaloc | 1135-1221:5675 |
| Aaloc | 1012-1134:4685 |
| Aaloc | 940-1008:4441 |
| Aaloc | 880-936:4232 |
| Aaloc | 802-876:3836 |
| Aaloc | 487-798:3251 |
| Aaloc | 379-486:2898 |
| Aaloc | 268-378:2431 |
| Aaloc | 1-267:1 |
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