XLOC_018777 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_018777
Unique NameXLOC_018777
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000107_pilon:402063..411830+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_018777 ID=XLOC_018777|Name=XLOC_018777|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9768bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:402063..411830+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000107_pilon:402063..411830+

>XLOC_018777 ID=XLOC_018777|Name=XLOC_018777|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=804bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:402063..411830+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCAAATCTTTGTGCAGGGACAAGAAACTAATGTTTATGATGTCAGCCC
ATCAGTCTCTGTTGCTGATTTGAAAGAATTAATCGCCTTCAGAAGTGGTG
TACATGCTGAAAACCAAGTTTTGACATATGCTGGACGTGCCTTGGAAGAT
GAAAATGCCCTTTCAGCTTACGAACTTGCTGCTGAATCCACCATTTCTCT
TGGTCTCCGAATGCTTGGagATGCAAATCTTTGTGCAGGGACAAGAAACT
AATGTTTATGATGTCAGCCCATCAGTCTCTGTTGCTGATTTGAAAGAATT
AATCGCCTTCAGAAGTGGTGTACATGCTGAAAACCAAGTTTTGACATATG
CTGGACGTGCCTTGGAAGATGAAAATGCCCTTTCAGCTTACGAACTTGCT
GCTGAATCCACCATTTCTCTTGGTCTCCGAATGCTTGGagGTAAAGTCCA
CGGTTCCTTAGCTCGTGCTGGAAAAGTCAAGGGACAAACTCCAAAGGTAA
AGTCCACGGTTCCTTAGCTCGTGCTGGAAAAGTCAAGGGACAAACTCCAA
AGGTTGACGCACAAGAAAAGAAGAAGCCAAAGACCGGTCGTGCCAAGAGA
CGTCAACAATACAACTCCCGTTTCGTCAACGTTGTCGTTATCCCAGGACG
TAGACGTGGACCCAACTCCAATGCTTAAGTTGACGCACAAGAAAAGAAGA
AGCCAAAGACCGGTCGTGCCAAGAGACGTCAACAATACAACTCCCGTTTC
GTCAACGTTGTCGTTATCCCAGGACGTAGACGTGGACCCAACTCCAATGC
TTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_018777XLOC_018777-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000107_pilongenomesc0000107_pilon:402063..411830 +
Properties
Property NameValue
Aaloc277-402:9643
Aaloc223-276:8149
Aaloc1-219:1