XLOC_018720 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_018720
Unique NameXLOC_018720
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000289_pilon:3975..23013+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_018720 ID=XLOC_018720|Name=XLOC_018720|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19039bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000289_pilon:3975..23013+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGAAAAGGGTTATCTTTTATACCACCCTTTTCTTGGTATTGATTTC ATCAAGCAGCCAATATGATGCTACTACAAAAGAACAAATCGAAACGACTT TGTCTAGTACCCAAACTGTCGTCGAAATTGTTGCAGAACGAAATAAAGAA TTAAAGGAAGCTGGAAAAGCAATTGGTACAATTGCCTCTGCAGTTGGTTC ACTTGCACCTTTCCTCGGTGCCGCTGGTGCCTTTCTGTCCATAATACTGG CTTTCTTACCAAAAGAAGATTCAGCAGAGttgaaattcatgaaaaaaggA TTTGCAGAGGTTAACAAAAAGCTGGATATCATTACCAATAAGTTGGATGG TATTGAAAGATCGATTGAATTTGAGGCGCAAAAGCAAGCTTATATAGATG CTGAAAACAAAATTAACTTCGGCTACAATCAACTGACCAAGTTTTATGAT GAAGTTATGAAAGTCGAATGTAAGAAGCAGGAGGAATGCGCTCGAGAAAG ACTTAAGATAGCTGaaaggtaaaattttttttgggtgtCAAATTGGCATT ATCTTTTATTTTACTTCCCCATTGTGCCACTAGAATTCCGTGGTAATGGC CAATTCCTCATACGCTAATGCAGACCACATTTTTTCGAAGTTCtactttt taaacattgaaaacGGACCTGTATTAAACCCTGTATTATGCAACCCCTCC CTTGTATCTCTACGCAACATTGTCAAACGATTGGCACTCGCTTCGCGCGA GTAAGGTTTTGAAGCACTTTTGCTTCTAAAGCCGCATTTACACCCGGCAA TTTTGTCGGTCGATTCTTTAACATTTTCCACGGAAgctcaatgcaatgac ttctaccgattttgaaaaatctgtgaATTGTTCACATATTTTGGCCCGAT TCTTGCCTGGATTTTACTTGGATTTTATGGTTGGTTTTTGGTGTCAATAT TCATCTACAAAATTTTAttcatcaaattaaatttttcattgatcAATTCT AAAAGTTTATtcatcaaatgaaaaattatattcgTCAAGTAAAACATTTT ATtcatcagaaatttttttcattcatctAAGAAAACAATTCATTAACATA TATGAAAGTTAGGTTCATGCTATTAGGTCTACATGTAATATAACAAATTG ATGACATTATTTTGCATATTACATAACAGTATAACATGATGATAGgctga ttttcaacgttttcgggcactttttgaaagtaacttttttattcaatcga gcataacttttgatctaataaaccaaatttaataaatgacccatcaaaat ctaagttaatctttcttctttacGATGAAAAAGGATtcgttctttcaaaa attttagatctcGGAAAAGTtcactttaaagagagaaactttttggtggc gcacccggtagcaGTATTACATAATAAGAATATCAATAATAGCATCTTGC CTGTCCATCTTCATCCCCATCATAGAGGCTCCCcaagcggtaactctgat cacgatatcaagCAATTTTTGGTCTTCAATTTGGATCAAGcatccttttg aaaaaagtccaaatcacgtcacgtagatctttcaaatcacgataacgttt tgacctctgatcacgtaatcaagaaaaaaaagttcaaatcaCGTAaatca cgctagaaaaaagTACCAAGAAACCATTAGAAAGCAAAGCAATTGAGTcc agggtcataaattcttgaaatctggaataaaatttggaattttggctaaa aattttggggaaaagtCTCTCTACTAAGTCAGTGTTATGTGAATTGAATG AATGAAATGTCTTTCTTTTTCGTtattgtttacaaaaagaaCGTGTAGTA ATGTAAAtgatggaattttttaatttatttttcgtattgaaaagtaaata tctaTTATTATGCCGAATAAATGATAAAACGCTTCTTCAtgtcttttata agcatacatctTGTAAAAAGAGCCATTTTAGCCTCAAATTTCACTCAAAG CTTGTCAGTATCGAAACTTTATATGGGAAAACCGATGGCGCTGAATACGA TGGCTTTATTAATAAATCTTCACAAGCGTTCTGACAGTTGTTGTAGCCAA AATAGCCCAGGAAATACGACATAAAATCATGCACATAACATACTAACATG CACgtctttttatgagaacaaattatataatatGAAGCGTCAAGGTCAAA ATTGTTTTAGATTATTGTTGTAAGAGCATTTTTAAGTGCATGACATTATA TTTCTGAGGTGGCAGGTAGTGAAAACTATGACTAGTTATAATATACTTTG GACGTAGAAGATTCGCTTCTCTAGCCCTTGATTATATTTCATATCATTTG AAGGAATTGTAATGCTTCATTTCAGATACATTAAAGATTTCAAACCTGTG GAAAGAGCCTTGTTTATGATATTGAAGAATTCATACCaaaaaaaCACATT TGCGAAACCGTTAGTGGAATTAATCAAATCGAAGTTTCAATGTAACGTTG AAAAGTTGAATGCATTTGCTGAAACCATATATCTTTTAGCAAGAAAAGGC CAACAGGTTAGATATCCCTTTTAATTTATTTAGTATTAGGTTCTGAAATT CAAATGCGGTCTTTGTTTTTAATGATAAGCAAAAATGGGAATAAAACATA GTGGATTTATTTACCGGAAAACGGGAATACCGTGTAAAATAAACTACAAA TCTCCGACATCCAAAATAGAGGGTGGCATTGTCTGCATGAAACCTTACAC GAAAATGAGATCAATAGCACCCATTTTCAGGGATCCACTGAATGATTTGT TGTTGACATCTACCTTTAAGTTTCAGGATCCAGTTGTGACGTAATCAAAC ATTGCCCAAAAAAGTAACGAAAATTAACGAAAATGTAAATAATGACGTAA TGGTTTGACGACGtcataaatcataaaatgaCTATATCTTCAAAGGAAAA GGTTTATCATGTAATCGCCTCGgatgaaaaattcactaaaatgCTTGCGT CAACATTTGCAATATTTCTGAAAGTATCAATTTAATCTTAAAAGTATCAA GTTAATCTTTAAGATTTTTATAGCCATAACACTGCTTATAAGCATGGCTA TATGCCTCCAGACTGACATGACAATAAAAACTACAGGTAGATTGCCAtga aacaaagaagatttaagTATGCATATGTTACCCAAGACAATTACCATATC TTCAAAGATTATTTGTATCCTGGTTTGATCGCAGCATAAAAGTTTTCGGA TATTTTATATTGGTGGTACTGAATCTCAATGTTGGTCAAATTTAATGgtg gcaattttcctaggggcaTCTTTGAAATACGCCTTTGGTCAGTTTTGACA TGCGATTGATAAGATGTTTTTAAGTTACGTATTTTCCACCGTTATGGAAG AAAACGTTCGATTTTGAAATGTTGATTCCTTATGCAATCCGAACGTTTTC TTCCATAATGGTGGTAATTACTTAACTTAGCGCCCGGGACTTAGCGAAAT GTGAAAAACTTCTATACAGGATCTGAAGTTTTGCTGACTGGGGAAGTGTA ATCATGGTTTGCATCGATAGAGGAGAAATGGCTTATATACCAGTGCCAAG CAATCGTATTAGAAACAGGGGTGTAGatgttttctcaatttttttgcccT GTTCTACAGCCCATAAACTGCTTTAATCTCTACACCATTATTATTCCCGC ACGCTAATCTTGATGCACGATAACATTGTTTAAGAAAGAGACGACATCAT GCCACTTTTTAAATAATCCAATttacacaacgttctttcaacgttcatct aacttTCTtaatgtccatataacgttagatgaacgttgaaacagcgcttt gtgccagctgggaagtgTAATGAAACTGtccgttttttatgaaaaaaaga agaagcagTGGCGAATCTGAGGTAATTTATGATAAAGTCAGcgattaaaa actttgaaacctcCTACAGTGAGTCCGTaaaaaaagggaatagaaaatgg taaacaaaaaaatcatcatcgaCCGCGGAGCGGTTTATTCAGAGACGTTT TGTATGGTGAAAAATCTCGCATATTTGTGCGCGGTAATCCGTTCTCTAAA GTCACGGAAAGCTGACAAAATCAACAATCTTGTTTCTCTATCTTTGAAGT CTCTGAATAACACTCGCTCGGAAAAAGTAATTATCTTCCTTAGATTTCTA agacgagaaagaagaagactaGAAGAACGGATTTgcggtcaagcaaaaag aagcccTAAGAAGTTTTGGAAGCATATCCGGAACTCAATGAAGACCGAAT CGGGAAAAAGCTGGAATTTTACATAGCCGGCCCTTTACATACTATCATGG CCAAGTCCTTCGTAGAAAGTAAACTACCTGATGATTGGAAGACTGCACAT GTGTCCCCGatctacaagaaaggaaaaaagaaccttgcagaaaattacag gcccgtcagtttaacatcagttgcgtttagagtaatggaaagaatcctaa agaaacaaatagtggaacacctcacgaatgagaaattgctatcaaccaaa caacatgAGTTCATGGGTAAGTGACACAACTACTTCACTACTTAGACAAA TGTGCTGACTCGATATCCAATGATAAGGTTGTCGACGTAATCTATTTCGA CTTCGCAAAGGCATTTGACACCGTTCCACATCGCAGATTACTAAGAAAAC TCGAAGCGTATGATATCAGAGGAAGGGTACTTGGTTGAatgaaagcattt ttgtccgatcgttaccaatatgtgaaggtcaatggaaagttatctaagaa atgccaggtgcaaagtggtgtaccacaaggaagtgtcttaggtccactcc atttcgttatttacatcaatgatctagctgaagttaccaactcagaaatg ttcctctttgccgatgacacaaagctcgttgaagaaataaataacgctga agatgcaattagacttcagcacgatatcgaggcaatggaaaagtggtctg gTGACTGGTTGTTGAAAGTCCATCCTGACatgaattgaatttcgaagaac acatctacaccaagatcaagaaggctaaCTCGATCGTTGCATTGATTAAC AGAAGCTTCGAATTCCTTTCTCCCGAGATGCTCCGCgcacttttcattgc atttgtgagacctcaccttgagtacgcgcaagctgtttggtctccacggc tgatcaaacactctgatgcaattgaaagtgtccaacgtagggccacaaga cttgtcggtggttatagaaaccattcatatgaagaacgtttacaagtcat gAGCCTACCCAGCTTCAAGATCCGGCGTAAAATCGGGGACATggtggaag tatataaacatcttaatgtctacgataaatcttccctatgtcagaaactc gttcttcgaaatcgacctcgccgtaagcacaatctcgaattaaagaggaa tttcgctgaagacggcattagaggataccaaacgaattcactttactata ggagcattgatacttggaacggtttggcaaccaatgttgtaaatgcactg tccgtagggaaattcaaactagaattgacaaacgaatggaatgataagat ctataaattgtaaagatgtaagattgtttcatagaggtcaatagacctga gaaatacactactaaaaattaaattaaaaaaaaaaaaaaaattaatatgt CAATATAAGGCTCAATAAATCAAGATACAATATAGAGAGCTACAACATAA AAGAACAACATCAAGATAAAGGAAATACTACTTACTAAACACCTTGGTCC CATAAGCTCTAATGCAgtgaaatatatagaaatattatattttctttttc tgggCGTCTCTTCAGACTATAAGTATTACAATTCTGGTTTTCTGTTTCGA CATTGCAACTCTGTATTCactctacagggtgtccctaattaaagtatcga ctatgagtagaaagttttatgtgcgtgttcacaaaattgtattttaagct ctccctcttttttctttgtcattacgattaatttatacgttgtaactacc ttttgtaataagcctgtgtgatggagaacgttcttatattttagcgataa cacacacaaacttttctactctaTCGCATGTttaaactcgatactttaat tagggacaccctgtacagtgATCTTTGTTCATCTGAACGCTAAAGCAGAA ACAGAGCACAGAAAAAGGCACGCAAAGTCCCGTGGGACAGACGCTAGACA AAGAGAAACACACAAAGGAGAGCAAGCCTAAGGGAATACGTGTCACATAA TTACGTAATAATTAACAAACAAATAGACAATACACTGACGATCAAATTAA CATTAAATATACAAAACAACTGCTATTCGGCAGTTACAGTGTACAAATTC ATAAGTTTCATAAGATTTGACCGCGGTCGCCTCAGTGTgttacactgtga cctagtaaatcatcgaccgccggaggcggtttctttcatagtggtacgtt aatctcgttttgccttggctcattactttgtctaccatttactttcggtt tttttaactagattacccaggtgtttctcttttttttccttgaatgtctt ttatttggaattgaataatcgagacatgaaaaatgactatattgtaaacT GTTTTCAacgaataatctaaaatgtacttgatatgacatgtaggcgttaa taatgtacgcgcgcgctctttcgcgagcgtgatgcgtgatggaaggcggt cgtttcagtgtggtttacattcgcactgtgacctagttttaTATGGGATG TAATTAACGCGTGTTTATGTGTGTTCATAAAAGAGAGCGCCGTTCACAAA GTCGTTAAATTTGATGCTTTGAtgtttctgttttatgttctttattatta atcaagttgttgtaattatttttgttttcaattttccatttccttttttt ACGGACTCACtgtataaaaaaactttctgaGGGTGTCCCCTACTTGACTA AAATATGTTACTACTAGGTTGTTGTCACCTATCACAAACTGACTGGTTCC AAAACAAGCATTGTGACTGCAGTGCAAGAATGGCTGGATATGGTCTACTC GCTCCGTGCTAAAGTAtacaaagaaaagaataaaTGTTATAAACAAATCT CAACTTATATGGCAAGTGATATCGCTGATCCTGAATATCAAAATGGAAAA CACGTTGATGCATTTAAAAGATTGAATCGCATTATAAAGAACAAGTATGC GTGGATAGGATGGGTAAGTGAAAAAGTCGAAAAacttttataaacctttt tgaGAGGGAGTAAAATAATTAGGTCCAGCAAtttttttATAGGGAAAAGA CTGACGTCACAAGCATCAATATTTGACGTTAATTTTCTTCAGTTAGGTTG AGAAATCGACCATATCCGTTTAAAAGTCCTCTATAtcgtttttcgagagc tttccaatggtataaGTGATTTTGTATTTTAGCGACTCTGAAATTTCGTC ACAATTTCGGGTCCCAAGGGCGTTTGCTTGTGACGTAAGTGTTTTCCCCA TAAAATAAAATAGCTGGACCTAATTAATTTACACCCTCTCAAAGAAGTTT CTAATTATACATTCTTCTTTcgaatgagcaaaaaaaattccactccGGAA ATTGTTGTCACGGGTCCTAAAGTATGACCCCCTACTAAAAGTTCAtgtaa aatgagaaaaacaataatagtcatttttgaatttcttttataGAACTTTC AAATATATAATGCAATTGAGGAAGACGAACAAGCTTTCAAAGTTTTCGAA GGATTTTCAAATGCTCCAGcaacaaaagagaaaagaaagcGAGTTATTAT AGCAACACCCGTTGATAAAAGAGGGACCTATTCTAAAGACATCATCAATT TGGTTCGATACGCCATTAAGAAGATCACAATAAATGCGAATGAttttttt GTAGTGGTAAGAGCGGTAAGTaattgaaagaaagaaataaaagaatCGAA ACCTTTCGAAAAATTTCCTCGTTTATTGAAATTCGAAATAAGTTTCTATG TCGGACGGACAAATCGATACTTTGCACCCCTGTGAAAATTGGCCCTTTTG ATTCAAAGACATATAACTCCAGGGGAAAGTTTCGCCTTAAgctatatttt aagaaaattgataagTGACTGATGGTTATggaattgaaaaatcaaaaatc tgtGACTCTTTcccaattttgattttaaaagcaaATGTCCGTCCGGCATA TAAACTACAAGTTTATCAAAATCGACAGTGTCATTGCTAAATTTGATTGT AGCACCAAAAACCCTGTAAAAAATACTAGAGAATAGTCCCTCCTCGTTTT CACATTTCTAAGAACTAGGGATGTTCATCATATCCTTGTCCTTTTACGAA ATGTCCGTCCGTCATAAAAACTCCAACAAAAAGATAGATGTTCaaaaaaa CCTGAAAGAGTATACGCGCTCTTGAGGGAGCTCAAATTGTATGTCATAGG TGTAAAAAGGTCAAGGGTATAACAAGAGTGACATATGTTTTGTTATGAAA ATCGTATTTTTGCAATTGCTTCTGTCCTTCGTGATGATACATTTTTATGT CCGACGGACATTgaagattttatcaattttgagCAAATTCTCCAAATTTT ACTTTTCTCTTCGTAATTTCCGTAtaacaatttataaaaaattaaaagtt gaaTTACAAAACTTTAAGTTTCATCTTTACAGAATCATCAGCTAtgaaaa aatgtataattaaAGGATTAAAAGATCCTAGTAATAGAAGTGATAGTAAT AATCAACTTTCAGAATGAGCGTAATGTTGGGTAATATTTTTCAGCAGTAT CAATCTATGCATGAAAATGAGTCACTATGCAAAATTTTAGGCTAAATGGT CCACTTGTGtttgttttatggatttttgaaatttttgaaattttgcggtT TACAAGAATATTGAGCTTTAGAGctgatgaaattgaaatttgtataaaaa taagatgcggcttaaaatatttttatacccCACCAAAACTcctgatattt ttttcatacctCAACCAAATTGAGGGAAAAAGTTTCATACCCCTTTTAAA TCCTTTCCACCCCGGTATATGCTACACAGTGTAAAACAAAGAATTTGTAA TTCATAAAGAAACAAAGTTGCTCGAGTCAGACATTTGATAACCCTCTCTT AAAATTCAGGCTATTGAAGAATATTTATCGAAAGCTGGAGCTTTGAAAAT GGTACAATCAATTGTTGTGCTTGATCCTGATGTTTCCATTGATATTGAAG TTGATAGGTAATAAATTTGACTATATTActctattttgttatttttataa caTGGTAtctttttgccaattttcattaACCCTTCGTGCatcttcttatt ttttatatGCAGAGCATCTTGAGAGACTTTGCCACCTGCGCggttgatat tttacagaaaacaagcaatatgctgaatggacctacctgatgattaaagt tagatagcaatgcgaaaagaaaaatgaaaaaaatcagtcagaaaatatag cgtttagcgaaaatacacaacacaataaattcatcattgattgttgatgg ggggagagggaagggttgtagggaaataataaataggaagttctggtcgc aaaaatcagttttattgacaattgaatcatgcttgataatgagcattgtt atgaataatgtttttgtgtgaaaagcatagaaatataagtaaactaaacc ggaaaaatttttttctcaaaaatacaactcggccatgttttgagcattgc gaatacgcatctttctgcaaaaaatcagaaaaaaataaaaatgaaaattc gagaaaatatcaaaaaaccgatttttccgacatatttccagcattttcgg ccggaaaaatttttttttagaaaatcgggctctgtcacattttaggtatt gtcatattgcatcagtgtgcaaaatttcataaacaaacataaagtacagc tcgagaaattcaagaagtactgtctttccggcgaaaataggttgttccgg cgacttttaaattAGTTCCGGCTTcagaaatcaattttattgaaaattga aacatgcttaatggtgggcattgctattaataatgtttttgaatgaaaaa ataaccaattatatggaaaaagtccaatgaaaatccagaaaaacggcgat ttccggcatatttccagcattttcggccggaaaatatttttctcaagagT CGGACTAGGTCatcttttgggcattgttaatacgattctttgagcaaaaa atcagaaaaaactaatgataaaatctcgagaaaatgccaaaaacacagtt tttccggcatatttccggcattttcggcaggaattgaatttttttcgaaa atcgggctctgtcacaatttaggtattgacattttgcatcagtgtgcaaa atttcatgaaaaaatataaagtacagctcaagaaattcaagaaaaaccgt ttttccggcaaaaatcgactgttccggcgatttttagaaagttccggctt caaaaatcaattttattgaaaattgaaacatgcttaatggtgggcattgc tattaataatgtttttgaatgaaaaaaacaaccaattatatggaaaaaat ccaatgaaaatccagaaaaacggcgatttccggcatatttccggcatttt cggccggaaaaaaatttttctcaagaattggaCTAGcgcatgttttgggc attgttaatacgcatctttgagcaaaaaatctgaaaaaactaatgatgaa atctcgagaaaatcccaaaaaaccgctttttccgGGACATTTCCGGACCT Ggcgaccggaaaaatttttttttcgaaaatcggggtcctccacattttgg gtattgccattttacatcattgtgcaaaaaattagaaaaaactaatgagc cgatcccgagaaaagctggcaacagacgaacgaacggacggacgaacgga cgaacggacaagggttgatttaaaggactaccttaaggtaggtccaaaag gtTAGAGCggggggggTCCTATTTTTGGAGGTgtcaaaaattgatgacgt catcaggtgccAATGACGTCATCGCTAATCACAAAATTTTGTCAGAAGGT CAATCCGTGATTTAGTCACACTGCCCATATTAAGTctattaaaaattatt aaaaattttcgGTCAAGGTGGGCctatagccccccccccccaaagatGCA CGAAGGGTTAAGGGctctctgaccatagtcagaaaatcgGTTCCTTGACA CTTTAAACAAAAAACTGTCTTTATAATTCATTTGTTGTTCCTGTGAAGAA TAATTAAGAgcttaattacaaaaatgacgttgtgaactttaaaaagacgt tcagaaaatgttatattaccctcttttacaaaaaatgcttaCTAGTTTCA ATCGGCatattaacctttttgttttgaatttttcttagattgtccgcaaa gaattgaactttttgaaattttacggaaaattttctaaattgatgtacCA TGTTATGACGAttttttttCGAGAAAATCCGAtgaaaaattgggcaaaaa caactatttaaaagattttgagacaaggaagcttttacaaaaatgttcCT CGAATCCATTTTTAGCTTTGCTTAAAATACCATAAAACacaaaaatgctt tcaaaatattttttcttcgccgagaATAAGGTctacaaagttgaaatact ctccttttaaaaagtcttcattttcttcttcatcatttttttaattaaac ttTAAGATTTTTGGATGCAGGAATAATTgctctaacagaaaatgtataac atgccatagatTTGTTGGCTAAATCAagcagaaatttatatttttacatg gcaaatatcaaattttgtaaattcacTATAGTCAGAGTCCTTAATAAAgg tttagccaatctagaaaTATATTTTCGCGATCACACTACTGGCACTTCTT ACACGTCATAAAACAGTAGTGTGGTGGTAAACCCTAGGGGGGCAGCGACT TTTTTGCAGAGTGCAAAGGAGGGAGTGGGCGCTAAAGGCTCATCAATATT CGcgattcttactttttttcctCTTAGGCTTTCTTGGGTGCAGACAAGGt aaccatttttttttaattctaacaGGTTTAGTTCTTACATCAATGAGGTA TTTGCCTTCAAAAGTTCAGTGATGGATTTCCCGCACATCAAACGCCGTGT TGTTGTCATGTTAAAATCATCTGAAGCTGACAATACCTTCTGTAAAGAAA ATTCTTGCCATGGAAAAAGCAAATGTGTTCAATTACCTTACACAAAATTG ACAGAATGTCAATGTGAAAGGTTATTCGATGGTACGCGCTGTGAGACTTA CTCTGATACCTCAATGAAATCGACACTTGATCTTCTGTTAACAACCTCTC TTCAAATACCATCGCTCACGGATGTTTATTTCGACATTAAAGATTTAAGA AAGTCATTCGAAAATGGTATTGAGAATGTCAACAAAGCCATTGCAAGATT AGGAAACGTATTAGAAAAATCGTATACTAAATTATCACAGCAACTTGGTA ATGAATTCAGATGGACAAATCTGAAAGTGACATACTCTTTGACAATCTCA AATGTTGAGCACTTTATTATTGAATTtacacaaaaaatcaaaaacaataa agACGAGAGAGTTAAGAAGCTAGCTGAACACATTTTAGAACCAGGCAAAA TCAAGAAATGGTTAAGGGATCTGAATCTATTATTTGTTGGCAACAAGAAC ATCATTCAGGACCATGAACCTTTGCCGGTTGTCATCATGAATCGAAACTT AGATGCATGTACGACACCATACAAGAAACGCGTGGACCATGTGTacgcac aattttcaatccttCAACAACAAGCTTACATGATGTGGGCTCAAGCGTTG TTTATTTTGGAGAAAGATACAACCGAAGTTATACAGTTGTATGCTCAAAC TGTTACGGAACAGGTATATTTTAATCGGTCTCAGTACTACCCATTTGAGC GCTTTTATTATTAGAGGCTAGCGGGAATTAATTAAAACAGAAATTCAATT TACCGATGCCGATACCTACccttgatgaaaaattttaaacctatttaatc ttttttctaacttttctaTTTTAGAGCCATTCAAAACTATTCTATTTTCT CGCTGCGATTCCTTAAATATTGCAATAATCTATCACACGCTCTTCCTATT gagtagactagagtctacacCTGACCCAATtttgctttctgataattttt gatgacgcacAGGGGATTCTGCAAGATgtaaccattttgaaaatttttca tagaaattcccatgaaacacaaaaacaatcaaagcttttaaaaattaaaa accaagaaaatataataataatgctatacaagttcacaggccaccgtgcg agcacatgggcctctatgaaccaaccgctctttgttcggtttacaatttt cttaaggtagagttttttcctagggctccccctgactttCAATTTGAAGT TTGCGTCCTTTATTGAAGTATTCATTTCTTGGGCTTTGatacaccactct ttgattgtcttcctttcaTTTTTCGTAAGATCTTCTGTCACCCGGAAGGG TAATCTTTCTTTTGTGATTGTTTttaacactgtatttttgtcttcttcgt ttgcaTTAATCGGACTTTtattggtcaattttcaatttttatgacgtcat aattaggtttttacggtttttcgcgaaaataaggaCGAAAgcaattaggt aacacccctacaggCAAACTACTTCATAATACCCTTCTTATTCAGTCATT GGTTTGATAATTTTCTTCCGGCTAATACTttccaaaaattatggtaattt ttttcacgttttagagacatgccataactgaCCTGAGTTTTCGTTTCATA AATTTTAGATTAACAAGCTGAAGGAGATTACTTGTGACTTCGTTATTCAA GATTCGATAAATGTTCAATGTACTGGCGGTTATTACGCACATCCCAGTTT GAAAATCACAAACCAATGTCGTCAAAACTACTATGTTTCTGGCCCTAAAA CAGCAACATGCAGTGACAAAACAAAATCGAAATGCTATTCGTGCTCTTGT AATAAAGAAGGGAGCAACCATCAAGGGTGTAGTGATCAAGATGGAGTTTG TTCATGTAAAACGATCACCGTAAACAAGCAGCAAAGAACGTACTATGGGA ATAAATGTCAAAACTTCAATTGTGTTTGGAGTGACTGGACATCTTGGAGC GAGTAAGTGTTTTATTTGATAGCCCTTTTTCGAGCTTCTTGTTGAACAAA TATAGGTATTCTTTCTTgccttctttttcaaaacatttttcgcCTGTTTT AAGAATATGTTTTGGAGTTTTCTGGTGGAATACACGGATTGTAAATTTTA CATCTCCGGGCTGGGACGTGTTATTTCAAGTTAGACGTTGTTGAAACAAA CTTGCTATCAAAATTTCAGTCGAATCATACATATAGTTTTCCGGTAGTTA AGTATTTTGTATGGTCAACACAGGAGGccgaaatgaaattttgcatacaA TCTTAGATTGTCATTACCTATTACTGgtggaaattgaaaatttcaagcta aaagATCTTGTAGAACCTGAGTTCCAGAGGGGTGATCAACGTGTATTCTA CAGACTGTtctgtaaaataataaataataacgTGACCAGCTGTTTTTTGG ACATAAATCAACTTTTTGCTTAATTTGAGTCATTGGAGTGATTTTCAGTC AAACACTCATTTTGGCATAAGATCCCCTATTTCAACGTTCGGTGGCCATA CCAAAATTATTCAAATCATCATCTCGTATTATATGTCTCCCATCACttca ctggtcaaaatttgaagtcaccAACACTTGTACAACTTAAGATCTCGAAG GGGGCCTCGGAcccccccccTAAATACTTCGCCTTTCAAAAATGAGATTA CGAGATAAACACTCGAAGGGttaatctttttcatttgttttaacaGACGC TTAAAAAATTGTGATCCTCGTCATGGAGAAATGCTATCTAGAACTCGCAC ACCAGCAAAAGACAAAATGGGCACTGGTGAGCCATGTCCAGGAAATTCCA AAGAATCTCAATCAGCCTATACAGGGTGTGGTCCGTTGGGGATGATCTAG ACGAGAAGAtacaaaaggccaataaaggaatctatatattaatacgctaa aacgtgtgtgtttacaacacTCTGTAAATAGTTTTCGAAATTCTagcaaa gctctacaaagcttcttcttatataaaggtcagtggttgaaCCATCGTCT TTTTGCACCATGAAGTTTTTCTACCattagactaactttgagacgccAAT ATACTATTTTCTATACAGGAAATttggatgggttaaaatcaaccttcttc acaaatataatttttgcttttgattGAAGATTTCTTATTCAGATCAGata tgctctttaaaactttctgtttactatagcggctccctatcactttcaaa acttttcaaagtctttcaaagtcactttCGTATGTCCagccacgatggct agccaTGATTGCTAAAAAGATCGAAATTATAATTCTTCTAAGCCATTTAA TTAATTGTGGTTgaaaattgcaatgcaatgttatctttcATCTCCTTTTC TTCATTAAATGAAAATCGTATCATTATTTCGGCAGCTATCTTTCTTCCGG CTTTCTTCcttcagaaatttttttaccaccggaggaagcctaaagcttct gaggatggcattcatagcttcacgcataaggaagttgggtaaacatctca taattttgcgtgtttttcagtattttagttctgCTTAACGGTAgcttgtt ttatcatcatcaaaaagatttttccggagttattttgatctggttactca ttttgaaatgtcagttcgtctttttcttatccctggagaattaaatgaat ctaaggaaattcctttttctgggaaattccctttttataccacaagtagt tattaagctcTCTTCATAGGTGaaaacaagagccacaaagatgtggttaa atatttcctccaatagctcagagcatagattgtagtcgcagtcgaacccc acaAATTATCTtaaagccccaacttagtaacttagatttattaaagcctt tatattaagcaatatccgatgcaaaacaaaatataaccatattcctgcta aaatttgtcgttatttcatagacatgctcacagatgatataagtctaaaa acttgttaaaaaattgcatgcaaatgataaccattttaacacaaaaataa atgtattttattcaactaatattggtttttaccttcattaaggaaataaa atcttagatttacaagttgatattattctaagactcatctgattaagaaa gtgccaaaatatcttgagactgtctactaagggactaatatggaaatatg gtaatatgaatttgggagatatcgaaatatgttgtacacattagtttcaa atgaaaaacttccttgtcatcaatattttaaaccaccatattatacattc acaaataaaaagttgcttaaaaatggatctccttctttacagatttagat ttccagtgcataacatctgttacattagtattcatgtgataatataccaa attgtcaaccttgaaattgtcacatttagttacagtattgttaaatattt acaacactttccagcaaacttttttgtgaaatttgtgtcttgataaacta aactctatgaaatttgtatcattgatcgttaaatcacatcttggaacaat agagttcctctttgttcatattctcattatgtgcaacattatcattacat cattgccagcaagttacattgtattgtcagctttagaggtcgtcaaactt tgttgaatttgtaatcctggcacctaaatgtgaaaggaaagaaaaatcca aaatttcataatgagaaaaaatctctttacagtaatcaatgccaaatgtg tggtTATTCAGGGTTATTCGctgaaatctcccaaaaaaaaagactttaaa aaggTGAGACTCTGCTTGGTGGTTTGAActatgtttgccatgcatatata ctgagccattaaagaagtttacgggaacgtacaaaaaggaccacagggta cgtacaataagttacactgggaacatacaataaggttcacggggaaaata caataaggttcacggggaacatataataaggtacacgaggaacgtacaat aagatacactgggaccgtacaataaggttcacggggaacatacaataagg ttcacagggaacatacaataaagtacactgggaacgtacaataaggtaca cttggaacgtacaataaggtacactgggaacatacaataaggtacacggg aacataaaataaggttcacggggaacgtacaataaggtacaagggggacg tacaataaggtacaaggggaacgtacaataaggtatatacacggggaaca tacaataaggtactggggaacgtacaataaggtacatggggtacgtacaa taatgtatacggggaacggcacaataagatacactggaacgtacaataag gtacaaggggagcgtacaaaaaggtacccaggaacacacaaaaaggacca acagagagcgtacaaaaggtaccctgaaagcattcaaaaaggaccatggg tagtgtacaaaaaggaccacacaaaacgtaccaaaggatcccagagagcg cacaaaagatacaagggaggggagcatacaaaaaggtaaacaggGAGTAA AAGAGCATCTATTATGATCTAGCTTTCTTTTGAGCATCTggcatcaaggc taaaaatggggcactgagaagagtgcaagcttttccaagttttgaccatt aatatctagacaatatatacatgatggaaaccagaaaaaaatttatgctc accttcttctcaagataggaatggattggatttccatgtgtttcagcttc tttctcttcttctccttatgggaaaaacaataaattcagcacacatgaga gaaactcaggcagtcctctgagctttacacacaatcatttCTTATATTTA GTTTTTTCCCCGCTAAATCTTAGCGACGATTTTTAGTCATGTGACTGAAG AGCCTTTAcataatgtgcagcacgaataaagaaaacattaacatcgaaaa tggaagaagaaacggaaaaaggccgttttaacaaatattcccctatagta gggaaatatttaaaaattactctactcaaagtattcgaacagttaCTGTA TGTTGCTAAGGGGTTGCTAAACgtgtgtacattagtaaaataacatatga agagcagtatcttcagatttatacactttttataggaaaaattagtaagt catatgattctggctgggctgccCTTAAATTTATATcagtttttcagcct taaatgtcaatattaattaaaataacGTGACCAGCTGTTTTTTGGACATA AATCaactttttggtcaatttgagtCATTGGAGTGATTTTCAGTCAAACA CTCATTTTGGCATAAGATCCCCTATTTCAACGTTCGGTGGCCATACCAAA ATTGTTCAAATCATCATCTCGCATTATATGTCTCCCATCACttcactggt caaaatttgaagtcaccAACACTTGTTTGACTTAAGATCTCGAAGGGGGC CTCGGAcccccccTAAATGCTTCGCCTTTCAAAAATGAGATATACACTCG AAGGgttaatctttttcattttttttaacagaccctcaaaaagttgtgat tttgcTTATGGATTAATGCAATCTAGAACTCGCACACCAGCAAAAGACAA AATGGGCACAGGTGAGCCATGTGCAGGAAATTCCAAAGAATCTCAATCAT GCTTTAAAAAAGATCCAGAAGATCCGAGGAAAGATACGAAGAAATGCATC TCAGCCATTACAAGGTGTTTTGACCTGGAGtatttataa

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000289_pilon:3975..23013+

>XLOC_018720 ID=XLOC_018720|Name=XLOC_018720|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5310bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000289_pilon:3975..23013+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGAAAAGGGTTATCTTTTATACCACCCTTTTCTTGGTATTGATTTC
ATCAAGCAGCCAATATGATGCTACTACAAAAGAACAAATCGAAACGACTT
TGTCTAGTACCCAAACTGTCGTCGAAATTGTTGCAGAACGAAATAAAGAA
TTAAAGGAAGCTGGAAAAGCAATTGGTACAATTGCCTCTGCAGTTGGTTC
ACTTGCACCTTTCCTCGGTGCCGCTGGTGCCTTTCTGTCCATAATACTGG
CTTTCTTACCAAAAGAAGATTCAGCAGAGttgaaattcatgaaaaaaggA
TTTGCAGAGGTTAACAAAAAGCTGGATATCATTACCAATAAGTTGGATGG
TATTGAAAGATCGATTGAATTTGAGGCGCAAAAGCAAGCTTATATAGATG
CTGAAAACAAAATTAACTTCGGCTACAATCAACTGACCAAGTTTTATGAT
GAAGTTATGAAAGTCGAATGTAAGAAGCAGGAGGAATGCGCTCGAGAAAG
ACTTAAGATAGCTGaaagATGGAGAAAAGGGTTATCTTTTATACCACCCT
TTTCTTGGTATTGATTTCATCAAGCAGCCAATATGATGCTACTACAAAAG
AACAAATCGAAACGACTTTGTCTAGTACCCAAACTGTCGTCGAAATTGTT
GCAGAACGAAATAAAGAATTAAAGGAAGCTGGAAAAGCAATTGGTACAAT
TGCCTCTGCAGTTGGTTCACTTGCACCTTTCCTCGGTGCCGCTGGTGCCT
TTCTGTCCATAATACTGGCTTTCTTACCAAAAGAAGATTCAGCAGAGttg
aaattcatgaaaaaaggATTTGCAGAGGTTAACAAAAAGCTGGATATCAT
TACCAATAAGTTGGATGGTATTGAAAGATCGATTGAATTTGAGGCGCAAA
AGCAAGCTTATATAGATGCTGAAAACAAAATTAACTTCGGCTACAATCAA
CTGACCAAGTTTTATGATGAAGTTATGAAAGTCGAATGTAAGAAGCAGGA
GGAATGCGCTCGAGAAAGACTTAAGATAGCTGaaagATACATTAAAGATT
TCAAACCTGTGGAAAGAGCCTTGTTTATGATATTGAAGAATTCATACCaa
aaaaaCACATTTGCGAAACCGTTAGTGGAATTAATCAAATCGAAGTTTCA
ATGTAACGTTGAAAAGTTGAATGCATTTGCTGAAACCATATATCTTTTAG
CAAGAAAAGGCCAACAGATACATTAAAGATTTCAAACCTGTGGAAAGAGC
CTTGTTTATGATATTGAAGAATTCATACCaaaaaaaCACATTTGCGAAAC
CGTTAGTGGAATTAATCAAATCGAAGTTTCAATGTAACGTTGAAAAGTTG
AATGCATTTGCTGAAACCATATATCTTTTAGCAAGAAAAGGCCAACAGGT
TGTTGTCACCTATCACAAACTGACTGGTTCCAAAACAAGCATTGTGACTG
CAGTGCAAGAATGGCTGGATATGGTCTACTCGCTCCGTGCTAAAGTAtac
aaagaaaagaataaaTGTTATAAACAAATCTCAACTTATATGGCAAGTGA
TATCGCTGATCCTGAATATCAAAATGGAAAACACGTTGATGCATTTAAAA
GATTGAATCGCATTATAAAGAACAAGTATGCGTGGATAGGATGGGTTGTT
GTCACCTATCACAAACTGACTGGTTCCAAAACAAGCATTGTGACTGCAGT
GCAAGAATGGCTGGATATGGTCTACTCGCTCCGTGCTAAAGTAtacaaag
aaaagaataaaTGTTATAAACAAATCTCAACTTATATGGCAAGTGATATC
GCTGATCCTGAATATCAAAATGGAAAACACGTTGATGCATTTAAAAGATT
GAATCGCATTATAAAGAACAAGTATGCGTGGATAGGATGGAACTTTCAAA
TATATAATGCAATTGAGGAAGACGAACAAGCTTTCAAAGTTTTCGAAGGA
TTTTCAAATGCTCCAGcaacaaaagagaaaagaaagcGAGTTATTATAGC
AACACCCGTTGATAAAAGAGGGACCTATTCTAAAGACATCATCAATTTGG
TTCGATACGCCATTAAGAAGATCACAATAAATGCGAATGAtttttttGTA
GTGGTAAGAGCGAACTTTCAAATATATAATGCAATTGAGGAAGACGAACA
AGCTTTCAAAGTTTTCGAAGGATTTTCAAATGCTCCAGcaacaaaagaga
aaagaaagcGAGTTATTATAGCAACACCCGTTGATAAAAGAGGGACCTAT
TCTAAAGACATCATCAATTTGGTTCGATACGCCATTAAGAAGATCACAAT
AAATGCGAATGAtttttttGTAGTGGTAAGAGCGGCTATTGAAGAATATT
TATCGAAAGCTGGAGCTTTGAAAATGGTACAATCAATTGTTGTGCTTGAT
CCTGATGTTTCCATTGATATTGAAGTTGATAGGCTATTGAAGAATATTTA
TCGAAAGCTGGAGCTTTGAAAATGGTACAATCAATTGTTGTGCTTGATCC
TGATGTTTCCATTGATATTGAAGTTGATAGGTTTAGTTCTTACATCAATG
AGGTATTTGCCTTCAAAAGTTCAGTGATGGATTTCCCGCACATCAAACGC
CGTGTTGTTGTCATGTTAAAATCATCTGAAGCTGACAATACCTTCTGTAA
AGAAAATTCTTGCCATGGAAAAAGCAAATGTGTTCAATTACCTTACACAA
AATTGACAGAATGTCAATGTGAAAGGTTATTCGATGGTACGCGCTGTGAG
ACTTACTCTGATACCTCAATGAAATCGACACTTGATCTTCTGTTAACAAC
CTCTCTTCAAATACCATCGCTCACGGATGTTTATTTCGACATTAAAGATT
TAAGAAAGTCATTCGAAAATGGTATTGAGAATGTCAACAAAGCCATTGCA
AGATTAGGAAACGTATTAGAAAAATCGTATACTAAATTATCACAGCAACT
TGGTAATGAATTCAGATGGACAAATCTGAAAGTGACATACTCTTTGACAA
TCTCAAATGTTGAGCACTTTATTATTGAATTtacacaaaaaatcaaaaac
aataaagACGAGAGAGTTAAGAAGCTAGCTGAACACATTTTAGAACCAGG
CAAAATCAAGAAATGGTTAAGGGATCTGAATCTATTATTTGTTGGCAACA
AGAACATCATTCAGGACCATGAACCTTTGCCGGTTGTCATCATGAATCGA
AACTTAGATGCATGTACGACACCATACAAGAAACGCGTGGACCATGTGTa
cgcacaattttcaatccttCAACAACAAGCTTACATGATGTGGGCTCAAG
CGTTGTTTATTTTGGAGAAAGATACAACCGAAGTTATACAGTTGTATGCT
CAAACTGTTACGGAACAGGTTTAGTTCTTACATCAATGAGGTATTTGCCT
TCAAAAGTTCAGTGATGGATTTCCCGCACATCAAACGCCGTGTTGTTGTC
ATGTTAAAATCATCTGAAGCTGACAATACCTTCTGTAAAGAAAATTCTTG
CCATGGAAAAAGCAAATGTGTTCAATTACCTTACACAAAATTGACAGAAT
GTCAATGTGAAAGGTTATTCGATGGTACGCGCTGTGAGACTTACTCTGAT
ACCTCAATGAAATCGACACTTGATCTTCTGTTAACAACCTCTCTTCAAAT
ACCATCGCTCACGGATGTTTATTTCGACATTAAAGATTTAAGAAAGTCAT
TCGAAAATGGTATTGAGAATGTCAACAAAGCCATTGCAAGATTAGGAAAC
GTATTAGAAAAATCGTATACTAAATTATCACAGCAACTTGGTAATGAATT
CAGATGGACAAATCTGAAAGTGACATACTCTTTGACAATCTCAAATGTTG
AGCACTTTATTATTGAATTtacacaaaaaatcaaaaacaataaagACGAG
AGAGTTAAGAAGCTAGCTGAACACATTTTAGAACCAGGCAAAATCAAGAA
ATGGTTAAGGGATCTGAATCTATTATTTGTTGGCAACAAGAACATCATTC
AGGACCATGAACCTTTGCCGGTTGTCATCATGAATCGAAACTTAGATGCA
TGTACGACACCATACAAGAAACGCGTGGACCATGTGTacgcacaattttc
aatccttCAACAACAAGCTTACATGATGTGGGCTCAAGCGTTGTTTATTT
TGGAGAAAGATACAACCGAAGTTATACAGTTGTATGCTCAAACTGTTACG
GAACAGATTAACAAGCTGAAGGAGATTACTTGTGACTTCGTTATTCAAGA
TTCGATAAATGTTCAATGTACTGGCGGTTATTACGCACATCCCAGTTTGA
AAATCACAAACCAATGTCGTCAAAACTACTATGTTTCTGGCCCTAAAACA
GCAACATGCAGTGACAAAACAAAATCGAAATGCTATTCGTGCTCTTGTAA
TAAAGAAGGGAGCAACCATCAAGGGTGTAGTGATCAAGATGGAGTTTGTT
CATGTAAAACGATCACCGTAAACAAGCAGCAAAGAACGTACTATGGGAAT
AAATGTCAAAACTTCAATTGTGTTTGGAGTGACTGGACATCTTGGAGCGA
ATTAACAAGCTGAAGGAGATTACTTGTGACTTCGTTATTCAAGATTCGAT
AAATGTTCAATGTACTGGCGGTTATTACGCACATCCCAGTTTGAAAATCA
CAAACCAATGTCGTCAAAACTACTATGTTTCTGGCCCTAAAACAGCAACA
TGCAGTGACAAAACAAAATCGAAATGCTATTCGTGCTCTTGTAATAAAGA
AGGGAGCAACCATCAAGGGTGTAGTGATCAAGATGGAGTTTGTTCATGTA
AAACGATCACCGTAAACAAGCAGCAAAGAACGTACTATGGGAATAAATGT
CAAAACTTCAATTGTGTTTGGAGTGACTGGACATCTTGGAGCGAaccctc
aaaaagttgtgattttgcTTATGGATTAATGCAATCTAGAACTCGCACAC
CAGCAAAAGACAAAATGGGCACAGGTGAGCCATGTGCAGGAAATTCCAAA
GAATCTCAATCATGCTTTAAAAAAGATCCAGAAGATCCGAGGAAAGATAC
GAAGAAATGCATCTCAGCCATTACAAGGTGTTTTGACCTGGAGtatttat
aaaccctcaaaaagttgtgattttgcTTATGGATTAATGCAATCTAGAAC
TCGCACACCAGCAAAAGACAAAATGGGCACAGGTGAGCCATGTGCAGGAA
ATTCCAAAGAATCTCAATCATGCTTTAAAAAAGATCCAGAAGATCCGAGG
AAAGATACGAAGAAATGCATCTCAGCCATTACAAGGTGTTTTGACCTGGA
Gtatttataa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_018720XLOC_018720-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000289_pilongenomesc0000289_pilon:3975..23013 +
Properties
Property NameValue
Aaloc2449-2655:18833
Aaloc2104-2445:13959
Aaloc1267-2103:12177
Aaloc1168-1263:9210
Aaloc946-1167:7744
Aaloc700-945:7018
Aaloc520-699:2377
Aaloc1-516:1