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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000210_pilon:536708..540318- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_018284 ID=XLOC_018284|Name=XLOC_018284|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3611bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000210_pilon:536708..540318- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACTGAAGAGTTGAAAATGATTAAGTTAATTTTCTTGTTATGTTTGAATAT
TTATTGGGTGGAGACAAAAGAAGCAGTCTGTGAAGACTATATTGCTGGTG
ACGAATTCTGTGTGTGTCGTAAGTCAAATTGATTGTCCCATATACCTTAA
ACGGGAACAAGAAAGCCTAAGCGGCGTAAAGGCACAGCAGTGCTGGCACT
GCCAACATATTTTTTCGTTGCAGAATCGCCATACAACAGAAGCGAATTTT
TTCAATGTATAGACTCGAGTCGGGCGAACAATAAAGATTTATTAAGCTTT
TTTCTACTAATTAAGGAAAGAAAGGTTTGACCATATAAGTTGGAGGTATT
AATTATATGTGGTTTTTCCTTACGCATGCGCACAATAGAAAGTCAGATAG
TTCGATTATAGCCTGGAATCGTCGATTGATAATTGCGTTCATAGGCCCCG
ACAAAGTCAAATCTTTTCAACCAGTTGTGTTTTAAAGGCCCATTGCGCTG
CGCGCTGCGCCTGACGAAATTTTTACAACAGTTGCGAAGTTGTCATTCAT
GACAATTCCCGACTTAGTTTTTCCGGAATCCGTTTTTCCCGTATCAGTCA
AGATTTTTTTTGCTAGTGTTTTTTTCAGTGAGTGTGGCTGTAAACCAAGT
GGGCATTGAGTGGCTTGTTGAACTATTTTAAAGGTCCAGTTTAAACTCGC
CACAGAAATCGTCCTTTTAGCGTAAGCTAGCGTTGCTCACCAATTAAAGA
CTGTTGACTCACTCTAATTCGATCTTAAAAAGACCAAAAGTTATCGAATT
AGAGAAAGATTTGCAATTCCAAAAGTATTTTATACAAATTTTTAGCTGAG
GGGACCTATATTTAAGTTCGAGTTATAGAAAGATTCGAATAGTAGAGACT
CGAATAATTGACTGTATATTCTCAACCACTGATCATACTTTATCAGAGTA
TACTTTTAATTAGACGAACCTACTGTCAACACAAGGTTACTAAAAAGGGA
AATAATTAAATGTAGCATAAACTTGGAAATAGATTTTAGCGGGGCGGATA
GACGATGCTATCGTCCGTTTAAAGGTCAAGTAAACGCGGGAAAAAGTTCG
GGCGTCAGGGCGGTTTACGGGAAAAAAGTGGTGGTAGAGTTTTGGAACAT
CTCCGCCACTGCTTACTCCACCCGAATTTATCACGCCTCTCCTAAACTAT
TCCCTTTTTTAGTGATCTTGTGTAGACGTAAGCAGTGGCGGAGGTGTTTA
CAGTGTAAACTATTTGTTCCAAAATCTACCGCTACTATTTTTTTCCGTAG
ACTGCCTCCCACCGTGATGGTATATATTTCCCGTGTTTACTATCTCTCTA
ACGGATGATATTTAATTAAGGCTGGTCTCCACTTTCGCGTGAAATGGGCG
ACAGTTTTTTTCTTAACCTTTTTTGCCTGAAGAAAAGATTACGTCATAAA
AAAGTTTCGCGCGAACAAAAAAAAAGTTGAAGGAAGTTCTATTTTTTTCA
TCCGTTAGTCAATTTCGACCAATGGAATTGCTTATCATTTTTCAACCGAC
CAATGACCTCACAAAAACGTTAAAAAGTTTTCGCTGATGTCGCGCTAAAG
TGGAGACCGGCCTTTAGAGTATACTTTTATTCTGTTACTACATTCAATTT
TGTTTTCTTTTACAGACAATGGGTACATTTTCACTTATGTTCCCGAACCA
ACCAACGGAATAGCAGCGTTAGAAATGTGTAAGCCAGGATATTTGGCCAC
TATTCAAGATTTGTCTGATATACAAGTAATCAGTGATCTTCTAGCACGCA
AGTAAGACTCCTAGCTGACACATAACGTTGTTTCGACGTCAGTTTAACCA
TGTTTAAAATTCACAACGTCCATATAACGTTAAATGAACGTTGAAACAAC
GTTGTGTGTCAGCTTTGTAACGTTTGGACATGCTCCATTTTTCCCTATTT
TCAATCAAAAAATTTCAATTTTAGTCCAAATTACGAGAATTTACAACCCT
TTGATTATAGGGACTCGATTTTCGATATATCGTACTTTTGGGACTGAAAC
TGAATTGCTTATTTATGGTTTTATGCCCCTACTTTAAGAGACTTTTAAGA
ATTTAAAAAGGAACCTTTATAGCTCACAACCATTTACCCCCCTCCCCACG
GATATATTTTATTTTAATACAAAGTTACATTACTTTTCTACCAACAAACT
TTTCGTTTAATTTAATTTTTGTAAACGATTCAACACATTTGTATGATCGT
TCTATTATGTACAGTTTTTAACTTTCAGCAATGCTCCCGCGAGTGCAGAA
ATTTTCCTTGGTGGGCCAGTGAATCTTCCTCAATTGGGGGTTGGGATTTT
TAACGTTGATGCTACAATGACGAATCCTTCGATCCCGGATCCACAGGTAG
GGAATGTGGCTACCATCAGTGCTGGTGATTCACAATTTTCTGATCTCTCA
GAAGCCTTTGGTTTATTATCGTTGGGATATGTGTGCAAGTCTATTTATTA
TGATAATGGAAAGATTTTTTTCTCCACTTTGAATTCGTTCACTCGACGCG
ATGAAGCTGATTGTGGTGAGAATGGAAAACTGGTCACATTTGATCAACAT
TCTGCTAACAAAGTGACTAGAATCACCAAAGAACTCAGTTTGAAGTAAGT
TCTGCATTTTAAGTGTGCATGCGTACGTAAGTATTAATCATTATTCAAAA
CCTGCTGTTTTGGTGTGATGTGCAACTTTAGAAAATTTGATAGAACCTTT
GTGTCTTTTGAGCTTTTACCCAGTCGAAAATCAGGACTTCGTAAACTTTT
AAAAACACCCCGTGTATTTCACAATCTAAAAACAGTATTTAATAACCCCA
TTCAAAGCAAATTAACAGAAAAAAATTTCCTCGTTTTTTGATCGGCTAGT
TTATTACACTGTCAACAATTCTCACTTGGCAAGTTTATGTATTTGCCCTT
TTGAGGAAGGTAAAGTGACACATACGTAATCTTGGTATTTATAAAGTTAC
CCGTTGTCATCTTAAAGCTCTCCTGATTCACAAAAAATGGGTATTTATCA
TGGCACATGGCAGTTAAACTAAATGATTCAATGCTGGTCAAAATCAATAG
CATCAATTTCCGGGAAAACATTTCCCTGTGACCAAACTAAAACTTGCATA
GGAAGCATATTGCATAGGAGGTTGAAATACTACTAAAAACATGGAAAGAA
TATCAAAGGTTAAAAAAATATTTTTTGACTTTGTTTTTCAGAGCATTTGG
ATTTTCGGAAATCTTGTATCACATTGGAGCAACGTATGATGCAGAAACAA
TGGAATTGGCGTGGGATGATGGGACTCGCTCTACTGTCCGTAACTGGTGC
TCAAACCCTCCCTCCGTTGATAACCCTAATAACTTGGACCCAGTTCCTGA
TCAGTGTGTCGTGGTGACGTCAACTGGTTGTTGGGAGTTACAACGTTGTT
TCGCGGTGCTCCCAACTCCCCCGCTTGGTTTTATTTGTGACGCTGATCAG
AGAGGAATCGATTTAAGTGAGAGAAACCAGATGCTAACAATGGTCAAAGT
ATTACAAAAAAAGATCGCTGAAATAAAGGCTGGTTGTCAATCTTGTGCTA
AAAGACATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000210_pilon:536708..540318- >XLOC_018284 ID=XLOC_018284|Name=XLOC_018284|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1980bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000210_pilon:536708..540318- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACTGAAGAGTTGAAAATGATTAAGTTAATTTTCTTGTTATGTTTGAATAT
TTATTGGGTGGAGACAAAAGAAGCAGTCTGTGAAGACTATATTGCTGGTG
ACGAATTCTGTGTGTGTCACTGAAGAGTTGAAAATGATTAAGTTAATTTT
CTTGTTATGTTTGAATATTTATTGGGTGGAGACAAAAGAAGCAGTCTGTG
AAGACTATATTGCTGGTGACGAATTCTGTGTGTGTCACAATGGGTACATT
TTCACTTATGTTCCCGAACCAACCAACGGAATAGCAGCGTTAGAAATGTG
TAAGCCAGGATATTTGGCCACTATTCAAGATTTGTCTGATATACAAGTAA
TCAGTGATCTTCTAGCACGCAAACAATGGGTACATTTTCACTTATGTTCC
CGAACCAACCAACGGAATAGCAGCGTTAGAAATGTGTAAGCCAGGATATT
TGGCCACTATTCAAGATTTGTCTGATATACAAGTAATCAGTGATCTTCTA
GCACGCAACAATGCTCCCGCGAGTGCAGAAATTTTCCTTGGTGGGCCAGT
GAATCTTCCTCAATTGGGGGTTGGGATTTTTAACGTTGATGCTACAATGA
CGAATCCTTCGATCCCGGATCCACAGGTAGGGAATGTGGCTACCATCAGT
GCTGGTGATTCACAATTTTCTGATCTCTCAGAAGCCTTTGGTTTATTATC
GTTGGGATATGTGTGCAAGTCTATTTATTATGATAATGGAAAGATTTTTT
TCTCCACTTTGAATTCGTTCACTCGACGCGATGAAGCTGATTGTGGTGAG
AATGGAAAACTGGTCACATTTGATCAACATTCTGCTAACAAAGTGACTAG
AATCACCAAAGAACTCAGTTTGAACAATGCTCCCGCGAGTGCAGAAATTT
TCCTTGGTGGGCCAGTGAATCTTCCTCAATTGGGGGTTGGGATTTTTAAC
GTTGATGCTACAATGACGAATCCTTCGATCCCGGATCCACAGGTAGGGAA
TGTGGCTACCATCAGTGCTGGTGATTCACAATTTTCTGATCTCTCAGAAG
CCTTTGGTTTATTATCGTTGGGATATGTGTGCAAGTCTATTTATTATGAT
AATGGAAAGATTTTTTTCTCCACTTTGAATTCGTTCACTCGACGCGATGA
AGCTGATTGTGGTGAGAATGGAAAACTGGTCACATTTGATCAACATTCTG
CTAACAAAGTGACTAGAATCACCAAAGAACTCAGTTTGAAAGCATTTGGA
TTTTCGGAAATCTTGTATCACATTGGAGCAACGTATGATGCAGAAACAAT
GGAATTGGCGTGGGATGATGGGACTCGCTCTACTGTCCGTAACTGGTGCT
CAAACCCTCCCTCCGTTGATAACCCTAATAACTTGGACCCAGTTCCTGAT
CAGTGTGTCGTGGTGACGTCAACTGGTTGTTGGGAGTTACAACGTTGTTT
CGCGGTGCTCCCAACTCCCCCGCTTGGTTTTATTTGTGACGCTGATCAGA
GAGGAATCGATTTAAGTGAGAGAAACCAGATGCTAACAATGGTCAAAGTA
TTACAAAAAAAGATCGCTGAAATAAAGGCTGGTTGTCAATCTTGTGCTAA
AAGACATTGAAGCATTTGGATTTTCGGAAATCTTGTATCACATTGGAGCA
ACGTATGATGCAGAAACAATGGAATTGGCGTGGGATGATGGGACTCGCTC
TACTGTCCGTAACTGGTGCTCAAACCCTCCCTCCGTTGATAACCCTAATA
ACTTGGACCCAGTTCCTGATCAGTGTGTCGTGGTGACGTCAACTGGTTGT
TGGGAGTTACAACGTTGTTTCGCGGTGCTCCCAACTCCCCCGCTTGGTTT
TATTTGTGACGCTGATCAGAGAGGAATCGATTTAAGTGAGAGAAACCAGA
TGCTAACAATGGTCAAAGTATTACAAAAAAAGATCGCTGAAATAAAGGCT
GGTTGTCAATCTTGTGCTAAAAGACATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000210_pilon | genome | sc0000210_pilon:536708..540318 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 622-990:370 |
| Aaloc | 256-618:1333 |
| Aaloc | 121-252:1945 |
| Aaloc | 1-117:3612 |
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